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Germinação de Jatropha curcas L. sob envelhecimento / salinidade e desenvolvimento do pacote para análise de dados de germinação - GerminaR

ISLA, Flavio Lozano 09 February 2017 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-06-07T15:08:12Z No. of bitstreams: 1 Flavio Lozano Isla.pdf: 3329440 bytes, checksum: a6e8fbfec93ad5b48a03b5f99a867efa (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-07T15:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Flavio Lozano Isla.pdf: 3329440 bytes, checksum: a6e8fbfec93ad5b48a03b5f99a867efa (MD5) Previous issue date: 2017-02-09 / Jatropha curcas L. is a crop with good qualities for biofuel production. It is widely known for its drought resistance characteristics and ability to grow in degraded soils and with low fertility. However, there are few works, studding the conservation of the species to the seed storage conditions and germination under saline conditions. In addition, there is a great difficulty in processing the germination variables, which are highly complex. For this reason, this work had three objectives: (i) generation of a package in the statistical software R for data analysis and graphical presentation of the main variables of seed germination; (ii) evaluate if it is possible to stabilize the loss of seed germinability through the storage reducing the water in the atmosphere; (iii) to evaluate the germinative responses and the initial development of five genotypes of J. curcas from different geographic regions of Brazil in the presence of different concentrations of NaCl. In Chapter 1, a R package was developed and called "GerminaR", which has four main functions, (a) calculation of eleven germination variables;(b) temporal evaluation of germination; (c) graphic expression of results and (d) interactive application "GerminaQuant for R". The software is available both in the installable version for PC, through the R and in the online version for use in any mobile device, without the need of installing the software, and prior knowledge of programming by the user. In Chapter 2, two experiments were carried out, the first one being the study of the maintenance of the viability and biochemical properties caused by the natural aging during the storage of the seeds of Jatropha curcas L. for a period of up to 12 months. The results show that the reduction of moisture in the interstice of the seeds allowed to stabilize the germinability and maintain it viable, besides conserving the oil content until the sixth month, in a similar way were registered with other biochemical characteristics of the seeds, a fact corroborated by the drastic reduction in the respiratory rate and the osmotic potential of the seeds. In the second experiment, five different genotypes of J. curcas and five concentrations of NaCl (0, 50, 75, 100 and 150 mM L-1) were tested in the irrigation water. The data showed that the addition of NaCl had negative effects on most parameters of germination and initial development of seedlings. At the concentration of 150 mM there was only 4% of germination; and the plants had difficult to develop. The mean germination time increased linearly with increasing salt concentrations. In the control treatment, the germination started on the third day, delayed effect in four days on average in the treatment of 150 mM. Although the germination was evaluated up to 150 mM, the biometric and biomass parameters were computed only up to 100 mM. Among these parameters, leaf dry weight, leaf area per plant and total leaf area as well plant height were the main characteristics negatively influenced by salinity. According to the multivariate analyzes, genotypes 114, 171 and 183 were shown to be potentially tolerant while the 218 and 133 sensitive genotypes, result that can be corroborated by the different studied parameters. / Jatropha curcas L. é uma espécie cujo cultivo apresenta boas características para a produção de biocombustível. É amplamente conhecida pela capacidade de resistência à seca e pela habilidade de crescer em solos degradados e de baixa fertilidade. Entretanto, são escassos os estudos visando a adaptação da espécie à condições de estocagem das sementes e germinação em condições salinas. Além disso, há grande dificuldade de processar os dados das variáveis de germinação, as quais apresentam alta complexidade. Por esta razão, este trabalho teve três objetivos: (i) geração de um pacote no software estatístico R para análise de dados e apresentação gráfica das principais variáveis de germinação de sementes; (ii) avaliar se é possível evitar a perda da germinabilidade das sementes através do processamento com redução da umidade no interstício das sementes; (iii) avaliar as respostas germinativas, bem como o desenvolvimento inicial de cinco genótipos de J. curcas oriundos de diferentes regiões geográficas do Brasil em presença de diferentes concentrações de NaCl. No primeiro capítulo, desenvolveu-se um pacote para o software R chamado “GerminaR”, o qual conta com quatro funções principais, (i) cálculo de 11 variáveis de germinação; (ii) avaliação temporal da germinação; (iii) expressão gráfica dos resultados e (iv) aplicação interativa “GerminaQuant for R”. O software está sendo disponibilizado tanto na versão para PC, através do R quanto na versão online para uso em qualquer dispositivo móvel, sem a necessidade de instalação do software, dispensando o conhecimento prévio de programação por parte do usuário. No capítulo 2 foram realizados dois experimentos, sendo o primeiro o estudo da manutenção da viabilidade e propriedades bioquímicas causadas pelo envelhecimento natural durante a estocagem das sementes de Jatropha curcas L. por um período de até 12 meses. Os resultados mostram que a redução da umidade no interstício das sementes permitiu estabilizar a germinabilidade e manter as sementes viáveis, além de conservar o conteúdo de óleo até o sexto mês, de forma semelhante ao registrado com outras características bioquímicas das sementes, fato corroborado pela redução drástica da taxa respiratória e do potencial osmótico das sementes. No segundo experimento foram testados cinco genótipos de J. curcas e cinco concentrações de NaCl (0, 50, 75, 100 e 150 mM L-1) aplicado na água de irrigação. Os dados mostraram que a adição de NaCl teve efeitos negativos na maioria dos parâmetros de germinação e de desenvolvimento inicial de plântulas. Na concentração do 150 mM.L-1 houve apenas 4% de germinação; entretanto, as plantas não conseguiram se desenvolver. O tempo médio de germinação aumentou linearmente com o aumento das concentrações de sais. No tratamento controle, a germinação iniciou ao terceiro dia, efeito retardado em quatro dias em média a 150 mM.L-1. Embora a germinação fora avaliada até 150 mM.L-1, os parâmetros biométricos e de biomassa foram computados somente até 100 mM.L-1. Dentre estes parâmetros, o peso seco da folha, a área foliar por planta e área foliar total, bem como a altura da planta foram as principais características negativamente influenciadas pela salinidade. De acordo as análises multivariadas, os genótipos 114, 171 e 183 mostraram-se como potencialmente tolerantes enquanto os acessos 218 e 133 foram sensíveis, resultado que pode ser corroborado pelos distintos parâmetros estudados.
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Modelagem e análise de selos de fluxo aplicados a máquinas rotativas / Modeling and analysis of flow seals applied to rotating machinery

Brol, Keila Belquiz 02 November 2011 (has links)
Orientador: Katia Lucchesi Cavalca / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecânica / Made available in DSpace on 2018-08-17T18:45:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Brol_KeilaBelquiz_M.pdf: 7087689 bytes, checksum: b81e96d33b1146da143fae0859da2363 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: O desenvolvimento de modelos matemáticos que visam simular as características operacionais das máquinas rotativas é importante para representar uma variedade de fenômenos expressivos que se manifestam durante a operação, para tanto é necessário a modelagem dos componentes que caracterizam o comportamento dinâmico do sistema. Este trabalho tem por objetivo determinar os parâmetros físicos que integram os selos de fluxo de folga fixa e angular ao modelo global de sistemas rotativos. As rigidezes e os amortecimentos são obtidos através da solução de equações governantes para líquidos escoando em selos anulares pelo método clássico das perturbações de ordem máxima um e a solução da ordem zero permite demonstrar a variação da pressão e velocidade para as equações de ordem zero. Os resultados obtidos foram validados com os valores apresentados pela literatura. O resultado deste trabalho poderá ser aplicado na modelagem global de uma máquina rotativa, de modo a tornar a análise mais completa do conjunto girante / Abstract: The development of mathematical models designed to simulate operational characteristics is important to represent a wide variety of expressive phenomena that manifest during the operation, and therefore it is necessary the components modeling that characterize the system dynamic behavior. This study aims to determine the physical parameters that influence the flow seals to fixed angles and variables in the global rotating systems model. The stiffness and damping are obtained by solving the governing equations for fluid flowing in the annular seals using the classic perturbation method of maximal order one. The zero-order solution allows to demonstrate the pressure and speed variation to zero order. The results were validated with the similar tests reported in the literature. This work results are eligible to be applied to model a global rotating machine in order to make a more complete rotor analysis / Mestrado / Mecanica dos Sólidos e Projeto Mecanico / Mestre em Engenharia Mecânica
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Metodos estatisticos para seleção de genes diferencialmente expressos a partir de dados de arranjos de DNA : aplicação a analise da expressão genica induzida em cana-de-açucar por deficiencia de fosfato / Statistical methods for the selection of differentially expressed genes from DNA array data : application to the analysis of the gene expression induced in sugarcane by phosphate deficiency

Duarte, Rodrigo Drummond Couto 18 December 2006 (has links)
Orientador: Marcelo Menossi Teixeira, Aluisio de Souza Pinheiro / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-08T01:46:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Duarte_RodrigoDrummondCouto_D.pdf: 10481872 bytes, checksum: b2571c6b4e34ab56accd3eade31da7dd (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Arranjos de DNA são uma poderosa técnica de monitoramento da expressão gênica em larga escala. No entanto, a grande quantidade de dados gerados com esse tipo de experimento requer um tratamento estatístico adequado às suas características. Uma aplicação importante dos arranjos de DNA é a identificação de genes diferencialmente expressos em diferentes amostras de RNA. Essa seleção demanda testes estatísticos apurados, capazes de distinguir, entre o grande número de genes usualmente presentes nos arranjos, aqueles cuja expressão é significativamente diferenciada. Neste trabalho nós desenvolvemos algoritmos para a análise estatística dos dados provenientes de arranjos de DNA, eficientes em lidar com os problemas usuais nesse tipo de dados, como o número limitado de réplicas. Aplicados a dados simulados, os algoritmos desenvolvidos mostraram-se competitivos com outros métodos de análises descritos na literatura, superando-os em algumas situações. A aplicação desses algoritmos foi também demonstrada em um experimento voltado à identificação de genes de cana-deaçúcar diferencialmente expressos em resposta a deficiência de fosfato. O fósforo é um macronutriente essencial, captado pelas plantas principalmente na forma de fosfato inorgânico (Pi). A deficiência de fosfato é freqüente na natureza, especialmente nos solos ácidos das regiões tropicais e subtropicais. Devido a grande importância econômica da cana-de-açúcar, a identificação de genes diferencialmente expressos em resposta à deficiência de fosfato nesta espécie é de grande interesse científico e agronômico. Algoritmos de agrupamento foram também aplicados aos dados de expressão obtidos no experimento, identificando padrões de expressão gênica nos diferentes estágios da resposta da cana a esse estresse e proporcionando assim uma caracterização adicional da mesma. Futuramente, os resultados desse trabalho podem conduzir ao desenvolvimento de linhagens de cana-de-açúcar com melhor desempenho em solos pobres de fosfato, o que seria de extremo interesse agronômico / Abstract: DNA arrays are a powerful technique for monitoring gene expression in large scale. However, the great amount of data generated by this kind of experiment requires a statistical treatment adequate to its characteristics. An important application of DNA arrays is the identification of differentially expressed genes in different RNA samples. This selection demands refined statistical tests, able of distinguish among the great number of genes usually present in the arrays those which expression is significantly different. In this work, we have developed algorithms for the analysis of DNA array data, efficient in handling the usual problems in this kind of data, as the limited number of replicates. When applied to data simulations the developed algorithms showed to be competitive with other methods of analysis described in the literature and widely used, overperforming them in some situations. The application of these algorithms was also demonstrated in an experiment devoted to the identification of sugarcane genes differentially expressed in response to phosphate deficiency. Phosphorous is an essential macronutrient, absorbed by plants mostly in the form of inorganic phosphate (Pi). The phosphate deficiency is frequent in the nature, especially in the acid soils of tropical and subtropical areas. Because of the great economical importance of sugarcane, the identification of genes that are differentially expressed in response to phosphate deficiency in this species is of great scientific and agronomic interest. Clustering algorithms were also applied to the expression data obtained in the experiment, identifying patterns of gene expression in the different stages of the sugarcane response to the stress, thus providing an additional characterization of it. In the future, the results of this work can lead to the development of sugarcane cultivars that have better performance in phosphate deficient soils, what would be of great agronomic interest / Doutorado / Bioinformatica / Doutor em Genetica e Biologia Molecular
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Aprendizado de métricas utilizando uma função de distância parametrizada e o algoritmo K-means com aplicação na solução de problemas de classificação

Fagundes, Felipe Leite 31 August 2017 (has links)
Submitted by Geandra Rodrigues (geandrar@gmail.com) on 2017-12-20T16:43:33Z No. of bitstreams: 1 felipeleitefagundes.pdf: 505347 bytes, checksum: 828890d64eac8d09b9c56eb30e6505df (MD5) / Rejected by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br), reason: Favor corrigir Métricas e Função no título para minúsculas on 2017-12-21T11:00:24Z (GMT) / Submitted by Geandra Rodrigues (geandrar@gmail.com) on 2017-12-21T11:56:28Z No. of bitstreams: 1 felipeleitefagundes.pdf: 505347 bytes, checksum: 828890d64eac8d09b9c56eb30e6505df (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-12-22T12:00:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 felipeleitefagundes.pdf: 505347 bytes, checksum: 828890d64eac8d09b9c56eb30e6505df (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-22T12:00:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 felipeleitefagundes.pdf: 505347 bytes, checksum: 828890d64eac8d09b9c56eb30e6505df (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / A utilização de diferentes métricas em algoritmos de aprendizado de máquinas pode mudar completamente os resultados de análises realizadas em bases de dados. Variar as maneiras de medir distâncias ou similaridades dos dados pode gerar reflexos para a captura de informações dessas bases e, com isso, influenciar diretamente a tomada de decisões. Neste sentido, métodos de aprendizagem de métricas têm sido abordados e aplicados em diversos ramos das pesquisas que manipulam bases de dados, com a finalidade de encontrar métricas mais adequadas para soluções de problemas de análise de cluster, classificação, mineração de dados, dentre outros relacionados ao reconhecimento de padrões de dados. O método de aprendizado de métricas utilizado como base deste trabalho foi originalmente formulado como um problema de otimização, com o objetivo de minimizar um conjunto parametrizado de distâncias de Mahalanobis. No método original é necessário estabelecer uma lista com pares de vetores similares ou dissimilares, que possibilitam a correção dos parâmetros para medição das distâncias. Já neste trabalho é proposto um novo método, que não necessita da comparação par a par entre vetores, mas apenas da comparação de distâncias de cada vetor do conjunto de treinamento com dois centroides: o definido pelo algoritmo Seeded k-means e o definido por um especialista como sendo um centroide esperado. A distância entre o vetor e os dois centroides é usada como fator global de correção dos parâmetros para medição das distâncias. Os novos parâmetros para medição de distâncias alteram a forma como os vetores são agrupados, melhorando sensivelmente os resultados em relação à métrica Euclideana. A maior contribuição deste estudo foi a formulação de um método para aprendizado desses parâmetros que reduzisse a complexidade em tempo em relação a outros métodos de aprendizado propostos na literatura, denominado MAP – Método de Aprendizado de Parâmetros. O MAP demonstrou melhoras significativas para problemas de classificação em diversas bases de dados do UCI Machine Learning Repository com métricas aprendidas em conjuntos de treinamento. / The use of different metrics in machine learning algorithms is able to change the results of analyzes carried out in databases. By varying how to measure distances or data similarities we can generate reflexes for information capture, which can influence the decision-making. In this sense, metric learning methods have been approached and applied in several branches of the research in the world, in order to find better metrics for problems of cluster analysis, classification, data mining, among others related data pattern recognition. The metric learning method used as the basis of this work was ori-ginally formulated as an optimization problem, in order to minimize a parameter set of Mahalanobis distances. In the original method, it is necessary to define a list of similar or dissimilar vectors pairs, which allow the correction of the distance measurement pa-rameters. In this work, a new method is proposed, which does not require the pairwise comparison, but only the distance comparison from each vector of a training set to two points: one defined by the Seeded k-means and other defined by an expert as being an expected centroid. The distance between the vector and the two centroids is used as correction factor of the parameters for measuring distances. The new learned parame-ters for distances measurement can change the clusters improving the results compared to the Euclidean metric. The major contribution of this study was the formulation of a method to learn these parameters that reduces the complexity in time if compared to other methods proposed in the literature. The proposal of PLM – Parameter Learning Method – have been demonstrated significant improvements in classification problems for several UCI Machine Learning Repository databases.
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Apreçamento de ativos com assimetria e curtose: um teste de comomentos com dados em painel / Asset pricing with skewness and kurtosis: testing co-moments with panel data

Francisco Henrique Figueiredo de Castro Junior 17 July 2008 (has links)
Ao longo dos anos, desde a concepção do CAPM, o modelo vem passando por um rigoroso escrutínio por parte da comunidade científica e dos agentes de mercado interessados na sua utilização prática. Evidências tanto a favor quanto contra a sua adequação foram surgindo. Várias foram as causas levantadas para o fraco desempenho do CAPM: omissão de variáveis no modelo, variação no tempo da medida de risco (β) ou, ainda, a ausência de outros momentos tais como assimetria e curtose. Esta pesquisa teve como objetivo a investigação empírica da relação entre momentos sistêmicos (covariância, coassimetria e cocurtose) e a taxa de retorno de ativos financeiros negociados no mercado brasileiro. Foi utilizada uma amostra de 179 empresas brasileiras regularmente negociadas na Bovespa entre os anos de 2003 e 2007. Para o teste do modelo de apreçamento, foi utilizado um procedimento em duas etapas. Na primeira, os comomentos de cada ativo foram estimados usando-se dados longitudinais de taxas de retorno. Os coeficientes estimados foram, então, utilizados em uma segunda etapa, na qual uma regressão com dados em painel buscou determinar a relação entre o prêmio pelo risco dos ativos e os comomentos estimados na primeira etapa. Foram estimados modelos com dados agrupados, efeitos aleatórios e efeitos fixos. A determinação do modelo mais adequado foi feita por meio de testes de especificação. Os dados mostraram evidências de que a distribuição de probabilidade das taxas de retorno da maioria das empresas não segue uma distribuição normal, e que tanto a covariância como a cocurtose são fatores de risco relevantes em modelos de apreçamento, mesmo controlados por fatores como: tamanho, alavancagem, liquidez, relação entre preço de mercado e preço contábil e relação entre valor de mercado e valor contábil. / Since the development of the CAPM, the model has been tested with a rigorous scrutiny by academic community and market practitioners who are interested in its practical utilization. Evidence for and against the adequacy of the model has arisen. Various reasons for the failure of the CAPM were raised: omission of variables, time-varying risk factors (β), or the absence of other moments like skewness and kurtosis. This research aimed at empirical investigation of the relationship between systematic moments (covariance, coskewness and cokurtosis) and the rate of return of financial assets traded in the Brazilian market. The sample consisted of 179 stocks regularly traded at Bovespa from 2003 to 2007. The test of the pricing model was run in a two-pass procedure. In the first pass, the comoments for every stock were estimated using a longitudinal series of rates of returns. The estimated coeficients were then used in the second pass, in a panel data regression that intended to establish a relationship between the risk premium and the comoments estimated in the first pass. Panel data models with pooled data, random effects and fixed effects were estimated. The adequacy of each model was tested by specification procedures. Data showed evidence that the rates of return were not normally distributed, and that covariance and cokurtosis were significant risk factors in pricing models, even after controlling for factors like: size, leverage, liquidity, price-earning ratio and
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Estratégias para individualização de resultados em testes de desempenho / Strategies for individualization of results in performance tests

Reis, Rafael Alkmin, 1986- 12 May 2011 (has links)
Orientador: René Brenzikofer / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Educação Física / Made available in DSpace on 2018-08-19T14:14:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Reis_RafaelAlkmin_M.pdf: 4170723 bytes, checksum: b21d7df72c921ce8f36ccde4b0292c16 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A avaliação física é um elemento importante e rotineiramente presente durante o planejamento de um período de treinamento. O objetivo deste trabalho é aplicar diferentes estratégias para a individualização de resultados em testes físicos, aplicados a grandes amostras e em atletas de alto nível. Nos anos de 2009 e 2010 duas turmas, de aproximadamente 500 alunos cada, da Escola Preparatória de Cadetes do Exército (EsPCEx) foram estudadas. Toda esta amostra foi avaliada em três momentos durante ano, fevereiro, maio ou junho e outubro. Foram realizados em cada um destes períodos testes físicos para diferentes capacidades biomotoras, como força, velocidade e resistência, além da composição corporal. O volume de dados gerados é grande, tendo em vista o número de avaliações aplicadas e a quantidade de sujeitos avaliados. Neste sentido, a primeira etapa deste trabalho consistiu no desenvolvimento de um software para Microsoft Windows, capaz de facilitar a visualização e gerenciamento destas informações. Na EsPCEx, para que o aluno se forme, índices mínimos de desempenho são exigidos nas provas de aptidão física aplicadas ao final do ano. Um segundo objetivo deste estudo é elaborar um modelo de previsão de desempenho, para o teste de corrida em 3000 metros realizado em outubro (T3000out). Para tal será utilizada a metodologia de regressão linear múltipla. O modelo foi quantificado utilizando os dados provenientes da turma de 2009. O modelo estabelecido foi: T3000out(min)=1,03*T3000fev+0,59*Dif_JF_3000+12,56, R2=0,71e RMSE=0,46; onde T3000fev é o tempo mensurado na avaliação de fevereiro e Dif_JF_3000 é a diferença entre os resultados do mês de junho e fevereiro, ambas padronizadas. Considerando a hipótese de que as turmas de 2009 e 2010 são estatisticamente semelhantes, o modelo foi aplicado aos resultados da turma de 2010 para testar o poder de previsão de seus resultados. A comparação entre os resultados preditos pelo modelo e os resultados medidos em outubro de 2010, permitiu identificar, já no mês de maio, 96,5% dos alunos em risco de reprovação. Já no último capítulo desta dissertação, apresentamos os resultados de um experimento que avaliou o efeito de três semanas de férias no desempenho de atletas de alto nível. Será discutido o tratamento estatístico de dados em amostras com características heterogêneas e a interpretação / Abstract: Physical tests are important and routinely present during the planning of a training period. The objective of this work is to apply different strategies for individualization of results in physical tests applied to large samples and high-level athletes. In the years 2009 and 2010 two groups of approximately 500 students each, of The Preparatory Army School (EsPCEx) were studied. The whole sample was evaluated three times during the year, in February, May or June and October. Were performed at each of these periods physical tests for different abilities such as strength, speed and endurance, and body composition. The volume of data generated is large, considering the number of tests applied and the number of subjects evaluated. In this sense, the first step of this work was to develop a software for Microsoft Windows, able to facilitate the visualization and management of this information. In EsPCEx, minimum levels of performance are required in the finals tests. A second objective of this study is to develop a model for prediction future performance in 3000 metters running race made in October (T3000out). For this we used the multiple linear regression method. The model was quantified using data from the 2009 sample. The established model was: T3000out (min) = 1.03 * T3000fev +0.59 * Dif_JF_3000 + 12.56, R2 = 0.71 and RMSE = 0.46, where T3000fev is the time measured in February and Dif_JF_3000 is the difference between the results of June and February, both standardized. Considering the hypothesis that the classes of 2009 and 2010 are statistically similar, the model was applied to the results of the 2010 sample to test the predictive power of their results. The comparison between the results predicted by the model and the results measured in October 2010, identified already in May, 96.5% of the students at risk of failure. In the last chapter of this thesis, we present the results of an experiment that evaluated the effect of three-week vacation in the performance of high level athletes. We will discuss the statistical treatment of data in samples with heterogeneous characteristics and interpretation of performance changes found / Mestrado / Biodinamica do Movimento Humano / Mestre em Educação Física
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Metanálise da Excreção Fecal e Urinária e da Eficiência de Utilização de Compostos Nitrogenados em Vacas Lactantes / Meta-analysis of Fecal and Urinary Excretion and Utilization Efficiency of Nitrogen Compounds in Lactating Cows

Vieira, Ítalo Stoupa 03 July 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-18T16:07:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1100891 bytes, checksum: 18978520d759dffce0de87efc4296c6e (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-18T16:07:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1100891 bytes, checksum: 18978520d759dffce0de87efc4296c6e (MD5) Previous issue date: 2015-07-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O nitrogênio presente em dejetos da pecuária leiteira pode contribuir para a poluição do ambiente através de amônia volatilizada para a atmosfera e nitrato lixiviado para as águas subterrâneas. Adicionalmente, a deposição de nitrogênio fecal e urinário no solo é fonte para a nitrificação microbiana e emissão do gás óxido nitroso, que é considerado um dos gases envolvidos no aquecimento global. A melhoria da eficiência de utilização de nitrogênio por animais domésticos diminui as perdas e a excreção de nitrogênio em fazendas. Portanto, é importante avaliar a eficiência de utilização do nitrogênio pelo animal, de forma a otimizar a produção e reduzir sua excreção, proporcionando ganhos econômicos e ambientais. A predição da excreção de N por vacas em lactação contribui com a melhoria dos inventários ambientais e são úteis para a avaliação da eficiência do sistema de produção. Neste estudo foram desenvolvidas equações de predição, obtidas pelo método da metanálise, que integram parâmetros nutricionais e de manejo para quantificar o nitrogênio excretado por vacas leiteiras. Foram coletados dados de teses, dissertações e artigos científicos publicados relacionados com perdas de compostos nitrogenados por vacas em lactação, e através destes dados, foram desenvolvidos os cálculos estatísticos para a elaboração de equações. A escolha das equações foi feita através dos critérios de avaliação AIC e BIC e a validação das mesmas foi realizada em banco de dados independente pela análise de CCC, MSEP e RMSEP. A excreção urinária de N foi melhor estimada na equação múltipla tendo como variáveis independentes o consumo diário de N e matéria seca. A excreção fecal de N e a excreção total de N foi melhor estimada através do consumo diário de N. A quantidade total de N excretada na urina e fezes de vacas lactantes apresentou relação linear positiva com a ingestão de N. A eficiência de N-leite diminuiu à medida que N- ingerido aumentou. / The nitrogen in dairy cattle manure can contribute to environmental pollution through volatilized ammonia to the atmosphere and nitrate leaching to groundwater. Additionally, deposition of urinary and fecal nitrogen in the soil is a source for microbial nitrification and emission of nitrous oxide gas, which is considered one of global warming gases involved. Improving the efficiency of nitrogen utilization by livestock reduces losses and nitrogen excretion in farms. Therefore, it is important to evaluate the efficiency of utilization of nitrogen by the animal in order to optimize production and reduce its excretion, providing economic and environmental gains. The prediction of N excretion by lactating cows contributes to the improvement of environmental inventories and are useful for evaluating the efficiency of the production system. This study developed prediction equations obtained by the method of meta-analysis, which integrate nutrition and management parameters to quantify the nitrogen excreted by dairy cows. Data were collected in theses, dissertations and published scientific papers related losses of nitrogen compounds for dairy cows, and through these data, statistical calculations to elaborate equations were developed. The choice of the equation was made through the evaluation criteria AIC and BIC and validation of the same was carried out in different database by CCC, MSEP and RMSEP analysis. Urinary N excretion was better estimated in multiple equation having as independent variables the daily consumption of nitrogen and dry matter. The fecal N excretion and total N excretion was better estimated by daily consumption of N. The total amount of N excreted in the urine and feces of lactating cows showed a positive linear relationship with the intake of N. The N-milk efficiency decreased as N-intake increased.
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Seleção e análise dos modelos PARAFAC e Tucker e gráfico triplot com aplicação em interação tripla / Selection and analysis of the PARAFAC and Tucker models and triplot graphic with application in triple interaction

Lúcio Borges de Araújo 16 July 2009 (has links)
O presente trabalho tem os seguintes objetivos: propor uma sistemática para o estudo e a interpretação da estabilidade e adaptabilidade fenotípica, através de duas técnicas de análise multiway (PARAFAC e Tucker3); propor a construção de um gráfico, denominado de Triplot, que possibilita avaliar as relç]oesoes entre os 3 modos (genótipos, locais e anos); implementar uma rotina computacional para a análise de dados, segundo os modelos multiway; implementar uma rotina computacional para a construção do Triplot. Os dados a serem uti- lizados são relativos a experimentos com 13 genótipos de feijão que foram conduzidos em 9 ex- perimentos distintos constituídos pelos anos agrícolas de 2000/2001, 2001/2002 e 2005/2006, pelos municípios de Dourados e Aquidauana, sendo que os experimentos foram instalados na época das águas (Dourados)e também na época da seca (Dourados e Aquidauana). Cada local é constituído de município e uma época de instalação. Os resultados indicaram que o gráfico triplot e joint plot, facilitam o entendimento da interação tripla e traz ao pesquisador informações mais reais sobre a interação tripla, do que a modelagem AMMI de duas entradas; o gráfico triplot, ajuda a identificar genótipos, locais e anos estáveis, dentro de um grande grupo de genótipos, locais e anos; de uma maneira geral recomenda-se, utilizar o triplot e o joint plot juntos, para obter melhores interpretações dos resultados; dentre os genótipos estudados, o genótipo 6 é o que menos contribui para a interação e o os genótipos 12, 9 e 5 são os que mais contribuem para a interação. / The present work has the following objectives: to propose a systematics for the study and the interpretation of the phenotypic stability and adaptability, through several multiway models (PARAFAC and Tucker3); to propose a graphic, called of Triplot, that it makes possible to evaluate the relations between the 3 ways (genotypes, locations and years); to implement a computational routine for the data analysis, according multiway models; to implement a computational routine for the construction of Triplot. The used data are relative the experiments with 13 genotypes of beans that had been lead in 9 experimental distinct ones constituted by agricultural years of 2000/2001, 2001/2002 and 2005/2006, by Dourados and Aquidauana cities, where the experiments had been installed at the time of waters (Dourados) and also at the time of dries (Dourados and Aquidauana). Each location is constituted of city and time of installation. The results indicated that the graphic triplot and joint plot, facilitate the agreement of triple interaction and bring to the researcher more real information about triple interaction, of what AMMI model of two way; the graphic triplot, helps to identify stabels genotypes, locations and years, inside of a great group of genotypes, location and years; in a general recommend to use triplot and joint plot together, to get better interpretations of the results; the genotype 6 is what less contributes for the triple interaction and genotypes 12, 9 and 5 are the that more contribute for the interaction.
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Visual analytics of topics in twitter in connection with political debates / Análise visual de tópicos no Twitter em conexão com debates políticos

Eder José de Carvalho 04 May 2017 (has links)
Social media channels such as Twitter and Facebook often contribute to disseminate initiatives that seek to inform and empower citizens concerned with government actions. On the other hand, certain actions and statements by governmental institutions, or parliament members and political journalists that appear on the conventional media tend to reverberate on the social media. This scenario produces a lot of textual data that can reveal relevant information on governmental actions and policies. Nonetheless, the target audience still lacks appropriate tools capable of supporting the acquisition, correlation and interpretation of potentially useful information embedded in such text sources. In this scenario, this work presents two system for the analysis of government and social media data. One of the systems introduces a new visualization, based on the river metaphor, for the analysis of the temporal evolution of topics in Twitter in connection with political debates. For this purpose, the problem was initially modeled as a clustering problem and a domain-independent text segmentation method was adapted to associate (by clustering) Twitter content with parliamentary speeches. Moreover, a version of the MONIC framework for cluster transition detection was employed to track the temporal evolution of debates (or clusters) and to produce a set of time-stamped clusters. The other system, named ATR-Vis, combines visualization techniques with active retrieval strategies to involve the user in the retrieval of Twitters posts related to political debates and associate them to the specific debate they refer to. The framework proposed introduces four active retrieval strategies that make use of the Twitters structural information increasing retrieval accuracy while minimizing user involvement by keeping the number of labeling requests to a minimum. Evaluations through use cases and quantitative experiments, as well as qualitative analysis conducted with three domain experts, illustrates the effectiveness of ATR-Vis in the retrieval of relevant tweets. For the evaluation, two Twitter datasets were collected, related to parliamentary debates being held in Brazil and Canada, and a dataset comprising a set of top news stories that received great media attention at the time. / Mídias sociais como o Twitter e o Facebook atuam, em diversas situações, como canais de iniciativas que buscam ampliar as ações de cidadania. Por outro lado, certas ações e manifestações na mídia convencional por parte de instituições governamentais, ou de jornalistas e políticos como deputados e senadores, tendem a repercutir nas mídias sociais. Como resultado, gerase uma enorme quantidade de dados em formato textual que podem ser muito informativos sobre ações e políticas governamentais. No entanto, o público-alvo continua carente de boas ferramentas que ajudem a levantar, correlacionar e interpretar as informações potencialmente úteis associadas a esses textos. Neste contexto, este trabalho apresenta dois sistemas orientados à análise de dados governamentais e de mídias sociais. Um dos sistemas introduz uma nova visualização, baseada na metáfora do rio, para análise temporal da evolução de tópicos no Twitter em conexão com debates políticos. Para tanto, o problema foi inicialmente modelado como um problema de clusterização e um método de segmentação de texto independente de domínio foi adaptado para associar (por clusterização) tweets com discursos parlamentares. Uma versão do algorimo MONIC para detecção de transições entre agrupamentos foi empregada para rastrear a evolução temporal de debates (ou agrupamentos) e produzir um conjunto de agrupamentos com informação de tempo. O outro sistema, chamado ATR-Vis, combina técnicas de visualização com estratégias de recuperação ativa para envolver o usuário na recuperação de tweets relacionados a debates políticos e associa-os ao debate correspondente. O arcabouço proposto introduz quatro estratégias de recuperação ativa que utilizam informação estrutural do Twitter melhorando a acurácia do processo de recuperação e simultaneamente minimizando o número de pedidos de rotulação apresentados ao usuário. Avaliações por meio de casos de uso e experimentos quantitativos, assim como uma análise qualitativa conduzida com três especialistas ilustram a efetividade do ATR-Vis na recuperação de tweets relevantes. Para a avaliação, foram coletados dois conjuntos de tweets relacionados a debates parlamentares ocorridos no Brasil e no Canadá, e outro formado por um conjunto de notícias que receberam grande atenção da mídia no período da coleta.
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Advanced techniques for graph analysis: a multimodal approach over planetary-scale data / Técnicas avançadas de análise de grafos: uma abordagem multimodal sobre dados em escala planetária

Gabriel Perri Gimenes 12 February 2015 (has links)
Applications such as electronic commerce, computer networks, social networks, and biology (protein interaction), to name a few, have led to the production of graph-like data in planetary scale { possibly with millions of nodes and billions of edges. These applications pose challenging problems when the task is to use their data to support decision making processes by means of non-obvious and potentially useful patterns. In order to process such data for pattern discover, researchers and practitioners have used distributed processing resources organized in computational clusters. However, building and managing such clusters can be complex, bringing technical and financial issues that can be prohibitive in a variety of scenarios. Alternatively, it is desirable to process large scale graphs using only one computational node. To do so, we developed processes and algorithms according to three different approaches, building up towards an analytical set capable of revealing patterns, comprehension, and to help with the decision making process over planetary-scale graphs. / Aplicações como comércio eletrônico, redes de computadores, redes sociais e biologia (interação proteica), entre outras, levaram a produção de dados que podem ser representados como grafos à escala planetária { podendo possuir milhões de nós e bilhões de arestas. Tais aplicações apresentam problemas desafiadores quando a tarefa consiste em usar as informações contidas nos grafos para auxiliar processos de tomada de decisão através da descoberta de padrões não triviais e potencialmente utéis. Para processar esses grafos em busca de padrões, tanto pesquisadores como a indústria tem usado recursos de processamento distribuído organizado em clusters computacionais. Entretanto, a construção e manutenção desses clusters pode ser complexa, trazendo tanto problemas técnicos como financeiros que podem ser proibitivos em diversos casos. Por isso, torna-se desejável a capacidade de se processar grafos em larga escala usando somente um nó computacional. Para isso, foram desenvolvidos processos e algoritmos seguindo três abordagens diferentes, visando a definição de um arcabouço de análise capaz de revelar padrões, compreensão e auxiliar na tomada de decisão sobre grafos em escala planetária.

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