Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-06Bitstream added on 2014-06-13T19:25:17Z : No. of bitstreams: 1 berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf: 206641 bytes, checksum: 22c62228324e8fe9decc6bf29dfd355e (MD5) Bitstreams deleted on 2015-07-02T12:35:57Z: berneck_bm_dr_rcla_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-07-02T12:37:25Z : No. of bitstreams: 1 000726221_20300206.pdf: 188726 bytes, checksum: eedea7388fc1cbd09142a4a27ca8114c (MD5) / O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus... / Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80’s, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Julián Faivovich / Coorientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Mariana Lucio Lyra / Banca: Paulo Christiano de Anchietta Garcia / Banca: Helio Ricardo da Silva / Banca: Luciana Barreto Nascimento / Resumo: O gênero Aplastodiscus é composto por 15 espécies, principalmente florestais, que se distribuem na Mata Atlântica desde o estado de Alagoas ao Rio Grande do Sul, incluindo Goiás (DF), NE da Argentina e leste do Paraguai. Doze destas quinze espécies foram descritas há mais de 20 anos, as outras três foram descritas no início do século XXI. Nos últimos vinte anos muito material novo foi coletado e houve um incremento quantitativo e qualitativo nas coleções de Anfíbios do Brasil. Este novo material, agora disponível, permitiu observar a variação intra-específica de determinadas espécies e cunhar o projeto que culminou na presente tese de doutorado. Além disso, o conhecimento das relações filogenéticas de Aplastodiscus até o momento é parcial, pois não existem análises que integrem simultaneamente evidências moleculares e fenotípicas para todas as espécies. Foi realizada uma análise molecular para todo o material de tecido biológico obtido, onde investigamos principalmente os limites interespecíficos em Aplastodiscus e sua distribuição geográfica além de uma análise filogenética com base em dados moleculares e fenotípicos das espécies atualmente reconhecidas e das espécies propostas como novas pelo presente estudo. Para tanto, a partir de dados moleculares e fenotípicos fizemos uma busca heurística no programa TNT (Tree analysis using New Techology) atingindo 15 vezes a longitude mínima. Dentre todas espécies atualmente reconhecidas apenas Aplastodiscus musicus não pode ser incluída. O critério para determinação de novas espécies foi a monofilia e a presença de evidências fenotípicas que sustentassem a hipótese de uma nova espécie. As árvores mais parcimoniosas permitiram recuperar sete espécies ainda não descritas, além de sugerir a sinonímia entre A. callipygius e A. albosignatus... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Aplastodiscus includes 15 species from Atlantic Forest from State of Alagoas to Rio Grande do Sul, in Goiás (DF), NE of Argentina and East of Paraguai. Twelve of these species were described in the 80's, only three of them were described recently. Over the past twenty years, lots of fresh material were incorporated in zoological collections allowing a better understanding of the morphological variation of Aplastodiscus species. Furthermore, the knowledge of the phylogenetic relationships is partial, there is no available data that integrate molecular and phenotypic evidence for all species. In this thesis will be presented an analysis for all tissue material where we investigate the species limits in Aplastodiscus and the geographical distribuition of these species, and a phylogenetic analysis on basis in molecular and phenotypic data... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:22:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-02-28Bitstream added on 2014-06-13T20:49:32Z : No. of bitstreams: 1 sabbag_af_me_sjrp_parcial.pdf: 281729 bytes, checksum: e0a57c9718410973d302e0afd7b6dd4d (MD5) Bitstreams deleted on 2015-06-25T13:01:06Z: sabbag_af_me_sjrp_parcial.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-25T13:03:25Z : No. of bitstreams: 1 000713955_20160228.pdf: 262208 bytes, checksum: 2e947072f90441db7014c4cdf6133fde (MD5) Bitstreams deleted on 2016-02-29T12:16:26Z: 000713955_20160228.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-02-29T12:17:25Z : No. of bitstreams: 1 000713955.pdf: 1305705 bytes, checksum: 3e29a2bd15ec794b73a281cd78030871 (MD5) / A Mata Atlântica, uma formação florestal com alta diversidade e ameaçada por ação antrópica, é foco de interesse de vários estudos sobre diversificação de espécies. Este estudo teve como objetivo principal entender a história evolutiva das espécies de Thoropa grupo miliaris (Anura: Cycloramphidae), que inclui T. miliaris, T. taophora, T. saxatilis e T. megatympanum. Utilizei sequências de DNA mitocondrial dos fragmentos 16S, ND2 e COI de indivíduos das quatro espécies (N = 487), distribuídos em um total de 98 localidades. Realizei análises de agrupamento para os três fragmentos separados, e posteriormente realizei análises filogenéticas sob Inferência Bayesiana, Máxima Verossimilhança e Máxima Parcimônia com os fragmentos concatenados. Além disso, fiz redes de haplótipos com as sequências de 16S, e calculei diversidades genéticas, além das divergências genéticas intra e interclados. Por fim, estimei tempos de divergência por meio de análises coalescentes (t MRCA) e das divergências genéticas (dA ). Encontrei a diversidade genética distribuída em oito clados distintos. Thoropa saxatilis e T. megatympanum são grupos monofiléticos bem estruturados. A primeira localiza-se no nordeste do Rio Grande do Sul e sudeste de Santa Catarina, e a segunda ocorre na Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris inclui cinco grupos parafiléticos em relação à T. taophora, e ocorrem desde o sudeste da Bahia até o sudeste do Rio de Janeiro, e sobrepõem-se no centro-sul do Espírito Santo e centro-norte do Rio de Janeiro. Thoropa taophora inclui populações do extremo sudeste do estado do Rio de Janeiro e do litoral do estado de São Paulo. Alguns clados de Thoropa miliaris são bem estruturados, e os outros formam, juntamente com T. taophora, um agrupamento... / The Atlantic Forest, a forest formation with high diversity and threatened by human action, is the subject of interest of many studies on species diversification. This study is based on the evolutionary history of the Thoropa miliaris group (Anura: Cycloramphidae), which includes T. miliaris, T. taophora¸ T. saxatilis and T. megatympanum. I used sequences of mitochondrial DNA fragments of 16S, ND2 and COI from individuals of the four species (N = 487), distributed in 98 localities. I performed cluster analysis for the three separated fragments, and after that, phylogenetic analyzes with Bayesian Inference, Maximum Likelihood and Maximum Parsimony with the concatenated fragments. In addition, I made haplotype networks using the 16S fragment, and also calculated genetic diversity and genetic divergences within and between clades. Finally, I estimated times of divergence using coalescent analysis (t MRCA) and genetic divergence (dA ). I found the genetic diversity distributed in eight distinct clades. Thoropa saxatilis and T. megatympanum are monophyletic and structured groups. The first located in northeastern Rio Grande do Sul and southeast Santa Catarina and the second occurs at Serra do Espinhaço. Thoropa miliaris includes five paraphyletic groups that occur from southern Bahia to southern Rio de Janeiro, and these clades overlap in the center- south of the Espírito Santo and north-central Rio de Janeiro. Thoropa taophora includes populations from the extreme southeastern of the state of Rio de Janeiro, and the coast of the São Paulo state. Some clades of Thoropa miliaris are structured, and the others form, along with T. taophora, a group with low genetic diversity. Thoropa miliaris group possibly began its diversification in the Miocene (tempo de divergência: 8.5 to 3.7 My) and most recent common ancestors are from... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Luís Felipe de Toledo Ramos Pereira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T15:49:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_JuliaTolledo_M.pdf: 17254442 bytes, checksum: 38a8bae2fe25ecfb35c543984ef4a2aa (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A introdução de espécies exóticas de anfíbios é um fator que tem se mostrado preocupante por contribuir para o desequilíbrio de comunidades animais nativas. Estas espécies além de se alimentarem de espécies nativas, podem se multiplicar rapidamente devido à ausência de predadores e competidores, podem ainda transmitir doenças às espécies nativas e causar problemas devido à hibridização com espécies aparentadas. Rhinella jimi é um Bufonidae do grupo de R. marina que foi introduzido no arquipélago de Fernando de Noronha há, no máximo, 120 anos. Esta população apresenta alta prevalência de deformidades, sendo que quase 50 % dos indivíduos adultos apresentam alguma anomalia externa. Cerca de 20 % destes possuem problemas nos olhos, sendo alguns completamente cegos. O objetivo principal deste trabalho foi estudar aspectos da história natural e biologia reprodutiva da população de Rhinella jimi de Fernando de Noronha, considerando a alta prevalência de deformidades nesta população.No primeiro capítulo foi feita a descrição do estágio larval de Rhinella jimi, necessária para a avaliação de deformidades, realizada no segundo capítulo. O terceiro capítulo trata-se de um estudo da dieta desta população, baseado em dados de conteúdo estomacal complementados por análises de composição isotópica. No quarto capítulo foi feita uma investigação da forma com que os indivíduos cegos localizam e capturam as presas, bem como das possíveis consequências que os problemas de visão podem trazer para as condições físicas dos animais. No quinto capítulo foi realizado um estudo de reprodução, com descrição das vocalizações e dos comportamentos observados. Os resultados mostraram uma alta prevalência de deformidades entre os girinos, com mais da metade dos indivíduos deformados. As deformidades no estágio larval ocorrem principalmente no disco oral e estão ligadas a um menor tempo de forrageio e uma menor eficiência na aquisição de alimento. Apesar da ausência de presas no estômago de indivíduos cegos, o estudo de dieta dos adultos mostrou que estes têm a dieta mais parecida com a dos indivíduos caolhos (com apenas um olho funcional). Indivíduos caolhos e indivíduos sem deformidades (normais) apresentaram formigas como as principais presas, mas Diplopoda foi um grupo importante na dieta de caolhos, enquanto para os indivíduos normais Coleoptera se mostrou mais abundante. O comportamento alimentar diferiu entre indivíduos cegos (que caçam por espreita com base em estímulos táteis) e normais (que caçam ativamente baseados em estímulos visuais). Os problemas de visão também influenciam a massa corporal, com indivíduos cegos tendo menor massa. No estudo de reprodução observamos a ocorrência de dimorfismo sexual de tamanho (fêmeas maiores que os machos) e uma tendência ao maior esforço reprodutivo e número de ovos em indivíduos normais. Foram observadas duas estratégias reprodutivas adotadas pelos machos (tanto normais como cegos), a de vocalização e a de procura ativa por fêmeas. No geral, tanto girinos como adultos são prejudicados pelas deformações, e estas deficiências poderiam implicar em eliminação de indivíduos menos adaptados no âmbito da sua distribuição geográfica natural. No entanto, a população invasora e ilhada está conseguindo sobrevier e reproduzir com sucesso, mantendo altos níveis de deformidade / Abstract: The introduction of alien amphibian species has shown concern as it may contribute to the imbalance of native animal communities, causing environmental damage. These species feed on native species, breed rapidly due to the absence of predators and competitors, may also transmit diseases to native species and cause problems associated to hybridization with related species. Rhinella jimi is a Bufonidae of R. marina species group that was introduced in the archipelago of Fernando de Noronha near 120 years ago. This population presents a high prevalence of deformities, as almost 50% of adults have some external anomaly. About 20% of them present eye problems, some being completely blind. The main objective of this research was to study the natural history and reproductive biology of the population of Rhinella jimi from Fernando de Noronha, considering the high incidence of deformities among the individuals of this population. In the first chapter we described the tadpoles of R. jimi, necessary for the assessment of deformities evaluated in the second chapter. The third chapter was a study of the diet of this population, based on data from stomach contents complemented by isotopic composition analysis. In the fourth chapter we investigated the way that blind individuals locate and capture prey, as well as the possible consequences that vision problems may have on the physical conditions of animals. The fifth chapter is a study of reproduction, with descriptions of vocalizations and behaviors. The results showed a high prevalence of deformities among tadpoles, with more than half of them being deformed. Deformities in larval stage occur mainly in the oral disc and are connected to a shorter time foraging and a lower efficiency in the acquisition of food. Despite the absence of prey in the stomach of blind subjects, the study showed that these toads have a diet similar to the half blind individuals (with only one functional eye). Half blind individuals and individuals with no deformity (normal) had ants as the main prey, but Diplopoda was an important item in the diet of half blinds, while for normal individuals Coleoptera was more abundant. The feeding behavior differed between normal and blind individuals, with blind ones using tactile stimuli and a sit-and-wait foraging strategy, and normal ones using visual stimuli and active search foraging strategy. Vision problems also affect the body mass of the toads, as blind individuals had lower body mass. We observed the occurrence of sexual dimorphism in size, with females larger than males, and a trend of higher egg production and reproductive effort in normal individuals. We observed two reproductive strategies adopted by males, both blind and normal individuals, the vocalization and the active search for females. Deformed individuals (tadpoles and adults) present disadvantages in comparison to normal ones. In all cases half blind individuals presented intermediate patterns between normal and blind ones. The extent of disadvantages observed could imply in individual elimination in the natural range of this species. However, in the island the conditions may support their existence up to successful reproduction / Mestrado / Ecologia / Mestre em Ecologia

Orientador: Julián Faivovich / Coorientador: Banca: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Hélio Ricardo da Silva / Banca: Luciana Bolsoni Lourenço / Banca: Délio Baêta / Banca: Marco Rada / Resumo: A tribo Cophomantini inclui espécies de pererecas que dentre outras características, possuem um pré-polex ósseo e avantajado. Atualmente inclui cinco gêneros. Seu maior gênero em riqueza de espécies, e também um dos mais diversos da família Hylidae, o gênero Boana contem atualmente 92 táxons formalmente descritos. No entanto, até o presente aproximadamente 60% de sua diversidade taxonômica foi analisada em filogenias mais inclusivas. O gênero Boana é dividido em sete grupos de espécies. Muitas de suas espécies são associadas a estes grupos através de caracteres fenotípicos. Alguns destes grupos, todavia encontram-se pouco suportados molecularmente, e apesar de várias espécies agruparem-se por fenótipos, os agrupamentos filogenéticos carecem de sinapomorfias fenotípicas. Na presente tese, foram amostradas seqüências de 83 espécies de Boana, bem como de espécimes pertencentes ao gênero, porém de taxonomia indefinida, totalizando 256 terminais para o gênero. Inserimos seqüências de DNA representando fragmentos de até dez genes por terminal do nosso banco de dados. Recuperamos Boana liliae inserida em Myersiohyla, outro gênero de Cophomantini. A análise filogenética das 83 espécies de Boana resultou em uma melhoria para o suporte de muitos dos seus relacionamentos internos, mas curiosamente, apesar da densa amostragem taxonômica, muitos agrupamentos permanecem pouco suportados. Finalmente, fizemos um estudo comparativo do pré-polex na tribo Cophomantini. Investigamos o elemento e... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The tribe Cophomantini includes treefrog species which, among other traits, have an osseous and enlarged prepollex. Currently it includes five genera. The genus Boana is the most diverse of the tribe, and also one of the richest genera of Hylidae, including 92 formally described taxa. However, approximately 60% of its taxonomic diversity was analyzed in more inclusive phylogenies. The genus Boana is divided into seven groups of species. Many of its species are assigned to their respective groups through phenotypical characters. Some of those groups are still poorly supported molecularly. Even being many species assigned to their respective groups through phenotypes, many groupings remain without phenotypical synapomorphies. On the present thesis, we sampled sequences of 83 species of Boana, as well specimens of undetermined taxonomy, totalizing 256 terminals for the genus. Each terminal have sequences of up to ten gene fragments. We recovered Boana liliae nested within the genus Myersiohyla, also from the tribe Cophomantini. The phylogenetic analysis of the 83 species of Boana resulted in better supports for many of its internal relationships. Curiously, besides the dense taxonomic sampling, many groupings remain poorly supported. Finally, we made a comparative study of the prepollex within the tribe Cophomantini. We surveyed this element and osteological and myological structures associated, established homology hypothesis, and optimize the resulted characters on the most parsimonious tree previously recovered. The prepollex of species of this tribe have a considerable evolutionary plasticity, and its two basic morphologies evolved many times on the tribe Cophomantini / Doutor

Orientador: Célio Fernando Baptista Haddad / Banca: Cyntia Peralta de Almeida Prado / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Cinthia Aguirre Brasileiro / Banca: Mariana Morando / Resumo: Os processos de diversificação biológica na América do Sul têm sido foco de vários estudos nos últimos tempos; porém, nota-se um marcado viés para os biomas florestados como a Amazônia e a Mata Atlântica. Nesse contexto, o Chaco é um dos biomas que tem recebido menor atenção. Nesta tese apresentamos o primeiro esforço por entender quais eventos e processos têm sido responsáveis pela diversificação de anuros endêmicos deste bioma, incluindo Lepidobatrachus asper, Lepi. laevis, Lepi. llanensis e Leptodactylus bufonius. Para atingir esse objetivo utilizamos sequências de DNA mitocondrial e nuclear de uma ampla amostragem de cada uma das espécies. Nos primeiros dois capítulos investigamos a diversificação do gênero Lepidobatrachus, sendo que no primeiro deles nossos objetivos foram analisar a estrutura genética e delimitar um período de tempo de diversificação que nos permita associá-la com eventos históricos e assim gerar as primeiras hipóteses sobre diversificação de anuros no Chaco. A estrutura genética identificada corresponde à distribuição geográfica dos espécimes analisados, assim como também revela algumas quebras ao longo da paisagem. A principal dessas barreiras corresponde à área central do Chaco, que por sua extrema aridez poderia estar atuando como uma barreira climática para a dispersão desses animais. Por outro lado, a dinâmica histórica dos rios da região poderia ter influenciado na estrutura genética das espécies do gênero Lepidobatrachus. Sugerimos uma antiga e rápida radiação para este gênero, com introgressões marinhas e períodos de alta temperatura e aridez como os principais responsáveis por sua diversificação. No segundo capítulo, aprofundamos no estudo da estrutura genética usando frequência alélica. Investigamos a história demográfica e usamos modelos de isolamento com migração ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Diversification processes in South America have been the focus of several studies in recent times; however, with a marked bias towards the forested biomes such as the Amazon and the Atlantic Forest. In this context, the Chaco has been one of the biomes that have received less attention. In this thesis we present the first effort to understand the events and processes that have been responsible for the diversification of endemic frogs in this biome, including Lepidobatrachus asper, Lepi. laevis, Lepi.llanensis, and Leptodactylus bufonius. For this purpose we used DNA sequences, both mitochondrial and nuclear, of a large sample of each species. In the first two chapters we investigate the diversification of the genus Lepidobatrachus. In the first one, our goals were to assess genetic structure and to delimit a diversification timeframe, which allow us to do associations with historical events and, thereby, generate the first hypotheses about diversification within the Chaco. The identified genetic structure is concordant with the geographic distribution of sampled specimens as well as shows some breaks along the landscape. The most important of these breaks matches with the central area of the Chaco, which due to the extreme aridity may act as a climatic barrier for the dispersal of these animals. On the other hand, the historical dynamics of the rivers of this region has influenced the genetic structure of these species. We suggest an old and rapid radiation for Lepidobatrachus, with marine introgressions and periods of high temperature and aridity as the main responsible in the genus diversification. In the second chapter, we deepen the genetic structure using allele frequency, we investigated the demographic history and used isolation-with-migration models to test hypotheses proposed in the first chapter and to understand the processes that ... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Itamar Alves Martins / Coorientador: Christiane Strüssmann / Banca: Cynthia Peralta Almeida Prado / Banca: Diego Santana / Banca: Classius de Oliveira / Banca: Arif Cais / Resumo: A história taxonômica do gênero Pseudopaludicola é bastante intrigante e confusa, devido ao pequeno tamanho, semelhanças morfológicas, escassez de caracteres de diagnósticos, e a habitual ocorrência simpátrica ou mesmo sintópica das espécies. O gênero Pseudopaludicola Miranda Ribeiro, 1926 é atualmente constituído por 18 espécies válidas distribuídas em ambientes abertos que ocorrem em toda a América do Sul. A avaliação da riqueza no gênero Pseudopaludicola é particularmente difícil devido à conservada morfologia de suas espécies. Como apontado em trabalhos anteriores do gênero, precisa-se claramente de uma revisão taxonômica. Com base em observações de material depositado em museus há muitas espécies do gênero Pseudopaludicola não descritas. Estudos filogenéticos recentes propuseram alguns rearranjos taxonômicos em Pseudopaludicola. Portanto, apresento uma abordagem integrativa que reorganiza o atual agrupamento intragenérico na tentativa de esclarecer questões taxonômicas e dos padrões de distribuição das espécies pertencentes ao gênero Pseudopaludicola. Estas espécies são indicadoras de ambientes potenciais de conservação, com importantes atribuições para subsidiar políticas de gerenciamento ambiental para a conservação da diversidade biológica. O rearranjo taxonômico implica no reconhecimento de novos grupos de espécies de Pseudopaludicola, além da revalidação, sinonimização e descrição de novas espécies / Abstract: The taxonomic historic of the genus Pseudopaludicola is intriguing and confused, due to minute size, overall morphological similarities, scarcity of diagnostic characters, and usual sympatric or even syntopic occurrence of two or more species. The genus Pseudopaludicola Miranda Ribeiro, 1926 currently comprises 18 valid species distributed in open environments throughout South America. The assessment of the number of extant species in the genus Pseudopaludicola is particularly difficult due to their conservative morphology. However, based on observations of material deposited in museums, there are many species in the genus Pseudopaludicola still waiting to be described Therefore, it is clear that the genus needs a complete taxonomic review.. Recent phylogenetic studies have proposed some taxonomic rearrangements in Pseudopaludicola. Therefore, we presented an integrative approach that to taxonomic analysis (morphometric and bioacoustic) might help to rearrange current intrageneric grouping in an attempt to clarify taxonomic and distribution patterns issues of species of the genus Pseudopaludicola. These species are indicators of potential environmental conservation, with important assignments to support environmental management policies for the conservation of biological diversity. Taxonomic rearrangement implies the recognition of new groups of species Pseudopaludicola, beyond the revalidation, synonymization, and description of new species / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-05-21Bitstream added on 2014-06-13T19:01:03Z : No. of bitstreams: 1 campos_jrc_dr_rcla.pdf: 3693126 bytes, checksum: 956bd343abe9698615af7508045133b0 (MD5) / Até recentemente, a família Leptodactylidae era considerada polifilética, mas nenhum dos trabalhos realizados antes de 2006 resolveu essa polifilia. Nesse ano, quase que simultaneamente, duas grandes revisões foram publicadas, com base principalmente em sequenciamento gênico e sem considerar dados citogenéticos, resultando em filogenias que mudaram radicalmente a taxonomia e a sistemática de muitos grupos de anuros. Leptodactylidae foi uma das famílias que passou por grandes transformações, sendo os gêneros reduzidos de 57 para apenas quatro. Na presente Tese, foram analisados os cariótipos de nove espécies do gênero Leptodactylus e 19 representantes de famílias relacionadas à Leptodactylidae, cujos dados são apresentados em três partes. No primeiro capítulo são apresentados cariótipos com 2n=20, nos exemplares de Vitreorana eurygnatha e V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22, em Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho e I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus e L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri e P. moreirae (Leiuperidae); e 2n=26 para Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris e Zachaenus parvulus (Cycloramphidae), Flectonotus sp. e Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). São também descritos o padrão de Ag-RON e bandamento C para a grande maioria das espécies. Os dados cromossômicos aqui obtidos, juntamente com os disponíveis na literatura, foram avaliados à luz das árvores filogenéticas atuais, tendo sido observada grande concordância com as alterações propostas. O segundo capítulo trata dos cariótipos de três espécies de Leptodactylus que pertenciam ao gênero Adenomera, com 2n=24 em L. cf. marmoratus, 2n=23... / Until recently, the family Leptodactylidae was considered polyphyletic, but no paper published before 2006 clarify this question. In that year two extensive revisions were published, almost simultaneously, based mainly on gene sequencing with no contribution of cytogenetic data. These studies resulted in phylogenetic trees which have radically changed the taxonomy and systematic of several groups of frogs. Leptodactylidae was one of the families that suffered great modifications, and the number of genus was reduced from 57 to only 4. In this work, the karyotypes of 9 species of Leptodactylus and representatives of 19 families related to Leptodactylidae were analyzed, and the data are presented in three parts. The first chapter describes the karyotypes with 2n=20, in species of Vitreorana eurygnatha and V. uranoscopa (Centrolenidae); 2n=22 in Adelophryne baturitensis (Eleutherodactylidae), Brachycephalus ephippium, Ischnocnema guentheri, I. manezinho and I. parva (Brachycephalidae), Leptodactylus furnarius, L. fuscus, L. latrans, L. mystaceus, L. podicipinus and L. syphax (Leptodactylidae), Odontophrynus americanus (Cycloramphidae), Physalaemus barrioi, P. cuvieri and P. moreirae (Leiuperidae); and 2n=26 in Cycloramphus boraceiensis, C. brasiliensis, C. ryakonastes, Thoropa miliaris and Zachaenus parvulus (Cycloramphidae) Flectonotus sp. and Gastrotheca microdiscus (Hemiphractidae). The C band and Ag- RON patterns are described for the majority of the species. The chromosomal data obtained here, along with those available in the literature, were analyzed in the light of the current phylogenetic trees, and are in accordance to the proposed modifications. The second chapter reports the karyotypes of three Leptodactylus species belonging to the former genus Adenomera, with 2n=24 in L. cf. marmoratus, 2n=23 in Leptodactylus sp. (aff bokermanni), and 2n=26 in L. hylaedactylus, bearing different... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Douglas Silva (douglaslacerda1992@gmail.com) on 2018-11-06T15:44:11Z No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Approved for entry into archive by PPGZOOL Zoologia (ppgzoo.ufam@gmail.com) on 2018-11-06T16:10:20Z (GMT) No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-11-06T17:53:56Z (GMT) No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-06T17:53:56Z (GMT). No. of bitstreams: 3 DISSERTAÇÃO_Versão_Final_2018_DOUGLAS _LACERDA.pdf: 3480099 bytes, checksum: 2a587c6aeaf35e91ebde7e80d5b0e623 (MD5) Carta_Encaminhamento_Autodepósito.pdf: 74603 bytes, checksum: c67bfaec3359c3a309ebef049fb39e80 (MD5) Ata de defesa de dissertação_Douglas Lacerda.pdf: 364655 bytes, checksum: 7685cef32081758b8806d59a5cc435d6 (MD5) Previous issue date: 2018-09-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Allobates tinae is not a widely distributed species as previously suggested but a complex of cryptic species. In this study, we describe a new species of the Allobates tinae complex that inhabits the lowland dense rainforest of the northern Purus-Madeira Interfluve. We suggest that the distribution of A. tinae is restricted to the southern Purus-Madeira Interfluve and the species inhabits lowland open rainforest. The new species described herein can be easily distinguished by the following combination of morphological characters: small body size; absence of dark blotches or hourglass pattern on dorsum; throat, chest and belly yellow in males and females; when present, melanophores are scarce and founf only on the mandible; Finger III (Finger IV following Grant et al. 2017) uniform in width along phalanges; distal phalange of Finger III larger in males adult than in females; proximal phalange of Finger III larger than medial and distal phalanges in females; forearm shorter than arm. Tadpoles with emarginated buccal apparatus; three or four triangular papillae on corner of the anterior labium; one row of 12 or 14 short, triangular papillae on posterior labium; similar-sized papillae on posteromedial and posterolateral region of posterior labium. Advertisement call characterized by short trills composed by 5 ± 1 (3–7) notes that last 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s). Average silent interval between notes was 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), being shorter between the first pair of notes [0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] than between the last pair [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)]. Peak frequency was 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz); lower frequency was 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz); upper frequency was 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). The new species described in this study is the 20th species of Allobates from the Brazilian Amazonia. Phylogenetic results indicate that there are two candidate species awaiting formal description in the Allobates tinae species complex. / Allobates tinae não é uma espécie de ampla distribuição como sugerido previamente, mas sim um complexo de espécies semelhantes. Aqui descrevemos uma das quatro espécies do complexo Allobates tinae que ocorre na porção norte do interflúvio Purus-Madeira na floresta ombrófila densa. Sugerimos que Allobate tinae é uma espécie restrita a porção sul do interflúvio e que habita floresta ombrófila aberta. A nova espécie de Alloabtes descrita nesse estudo pode ser diferenciada facilmente pela combinação dos seguintes caracteres morfológicos: tamanho pequeno, dorso sem manchas ou desenhos de ampulheta; ventre, saco vocal e tórax amarelo em machos e fêmeas com escassos melanóforos, quando presentes concentrados na região da mandíbula; dedo III (IV segundo Grant et al. 2017) dos machos de largura uniforme ao longo de todas as falanges; falange distal dos machos mais larga que das fêmeas; dedo III das fêmeas de largura irregular; falange basal mais larga que as falanges medial e distal; antebraço mais curto que o braço. Girinos possuem disco oral emarginado; lábio anterior com 3 ou 4 papilas triangulares e curtas, presente nas margens laterais do lábio; lábio posterior inteiramente cercado por uma fileira de 12 ou 14 papilas triangulares, com tamanho semelhante na margem póstero-lateral e póstero-medial. Cantos de anúncio são compostos por 5 ± 1 (3–7) notas com duração média de 0.041 s ± 0.004 (0.029–0.054 s), intervalo silencioso entre notas é de 0.15 s ± 0.03 (0.10–0.23 s), sendo mais curto entre as duas primeiras notas [ 0.12 s ± 0.01 (0.10–0.15 s)] do que entre as duas últimas notas [0.19 s ± 0.02 (016–0.23 s)], com frequência de pico 5635 Hz ± 209 (5168–6008 Hz), a frequência baixa 5387 Hz ± 204 (4849–5817 Hz) e a frequência alta é de 5829 Hz ± 191 (5374–6206 Hz). A espécie descrita nesse estudo é a 20ª espécie do gênero descrita para a Amazônia brasileira. Resultados filogenéticos sugerem a existência de outras duas espécies candidatas no complexo A. tinae aguardando descrição formal. / O sistema está prático e fácil, sendo pertinente da forma com a qual está disponível. / O presente trabalho, evidência a grande importância de estudos envolvendo complexos crípticos de espécies e a grande substimativa da fauna de anuros nas terras baixas da Amazônia.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia Animal, 2015. / A tese de doutorado intitulada “Avaliação dos efeitos citotóxicos e antiproliferativos da secreção cutânea e de peptídeos bioativos do anuro Physalaemus nattereri (steindachner, 1863)” desenvolvida por Andréa Cruz e Carvalho sob a orientação da profa. Dra. Mariana S. Castro teve o apoio financeiro do CNPq (processos n°. 563972/2010-6, Edital MCT/CNPQ/FNDCT/FAPS/MEC/CAPES/PRÓ-CENTROOESTE nº 31/2010, n°. 302925/2012-0, Produtividade em Pesquisa - PQ – 2012 e n°. 407801-2013, Rede Centro-Oeste De Pós-Graduação , Pesquisa E Inovação - REDE PRÓ-CENTRO-OESTE), da FAPDF (processo n°. 193. 000.461/2011, Edital MCT/CNPQ/FNDCT/FAPS/MEC/CAPES/PRÓ-CENTRO-OESTE nº 31/2010), do CNPq por meio da concessão de bolsa de estudos (nível doutorado), da FINEP (CT-INFRA) E DA FUB-UNB. / As secreções cutâneas de anuros são fontes naturais de peptídeos antimicrobianos. A realização de novas pesquisas nessa área tem revelado que alguns peptídeos com atividade antimicrobiana também apresentam efeitos tóxicos sobre células tumorais. O objetivo do presente estudo foi investigar o potencial terapêutico da secreção cutânea de Physalaemus nattereri sobre células tumorais e determinar os mecanismos da ação citotóxica sobre céluluas de melanoma murino da linhagem B16F10. Nossos resultados demonstraram que a secreção bruta reduz a viabilidade de células B16F10, causando alterações na morfologia celular, (p.ex., arredondamento e encolhimento), ruptura da membrana plasmática, redução do potencial de membrana mitocondrial e parada do ciclo celular na fase S; tais mudanças em conjunto sugerem que as células tumorais morreram por apoptose. A secreção cutânea também foi submetida ao fracionamento cromatográfico empregando RP-HPLC e as frações eluídas foram avaliadas quanto à suas atividades antiproliferativas e antimicrobiana. Três frações ativas exibiram componentes de massa molecular compatíveis com peptídeos. Os três componentes majoritários presentes em tais frações foram purificados por RP-HPLC e analisados por MALDI-TOF/MS. Tais peptídeos mostraram-se ativos sobre bactérias e células tumorasi e foram identificados como pertencentes ao grupo das nattererinas, peptídeos antibacterianos previamente isolados desse animal por nosso grupo. Embora, o mecanismo específico envovlido na redução da viabilidade celular e citotoxicidade após o tratamento com essa secreção bruta ainda não seja conhecido, podemos supor que a atividade de moléculas, como peptídeos, presentes nessa secreção seja efetivos contra as células de melanoma murino (B16F10). Considerando-se a necessidade crescente por novas drogas anticâncer, o presente estudo fortemente reforça a validade do uso da secreção cutânea de P. nattereri como uma rica fonte de novas moléculas anticâncer, principalmente peptídeos. / Anuran secretions are rich natural sources of antimicrobial peptides. The emergence of new research in this area has shown that some peptides with antimicrobial activity also exert toxic effects against cancer cells. The aims of this study were to investigate the therapeutic potential of Physalaemus nattereri skin secretion against cancer cells, and to verify the mechanisms of its cytotoxic action on the murine melanoma cell line B16F10. Our results demonstrated that the crude secretion reduces the viability of B16F10 cells, causing changes in cell morphology (e.g., round shape and structure shrinkage), rupture of the plasma membrane, reduction in mitochondrial membrane potential, fragmentation of DNA, and cell cycle arrest in Sphase; together, these changes suggest that tumor cells die by apoptosis. This skin secretion was also submitted to chromatographic fractionation using RP-HPLC and the eluted fractions were assayed for antiproliferative and antibacterial activities. Three active fractions showed molecular masses components with a molecular range compatible to peptides. Thes major petidic components present on these fractions were purified by RP-HPLC and analysed by MALDI-TOF/MS. These peptides were active against bacteria and cancel cells, and were identified as nattererins, antibacterial peptides previously isolated from this animal by our group. Although, the specific mechanism causing the reduction in cell viability and cytotoxicity after treatment with the crude secretion is still unknown, we can consider that the activity of molecules, such as peptides, within the secretion is effective against murine melanoma (B16F10) tumor cells. Considering the growing need for new anticancer drugs, the present data strongly reinforce the validity of crude secretion of P. nattereri as a rich source of new anticancer molecules, mainly peptides.