Made available in DSpace on 2016-06-07T17:12:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-03-26. Added 1 bitstream(s) on 2016-06-07T17:16:48Z : No. of bitstreams: 1 000860540_20170301.pdf: 1598939 bytes, checksum: 19fe3827e42ea08f4993ad34d78beeba (MD5) Bitstreams deleted on 2017-03-03T11:01:34Z: 000860540_20170301.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2017-03-03T11:02:42Z : No. of bitstreams: 1 000860540.pdf: 3479165 bytes, checksum: 0a33b095097bfa94ed765c6c15a71d75 (MD5) / A remodelação cardíaca (RC) é um processo tempo dependente que promove alterações celulares e moleculares que se manifestam clinicamente através de alterações no tamanho, forma e função do coração após a agressão, sendo a insuficiência cardíaca (IC) o estágio final deste processo. A IC caracteriza-se por uma incapacidade do coração de bombear sangue de acordo com as necessidades metabólicas teciduais, ou pode fazê-lo adequadamente à custa da elevação da pressão de enchimento ventricular. Isso é decorrente, em parte, pela presença da hipertrofia dos cardiomiócitos e fibrose, que diminuem a atividade propulsora do coração. O treinamento físico aeróbico é considerado uma conduta proposta e aceita para minimizar as alterações cardíacas na IC. No entanto, pouco é sabido sobre os efeitos do treinamento sobre os aspectos morfológicos e moleculares no músculo cardíaco durante a transição entre a disfunção cardíaca e a IC. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações morfológicas e moleculares do coração e o efeito do treinamento aeróbico durante a transição da disfunção cardíaca para a IC no modelo de estenose aórtica em ratos. Foram utilizados 52 ratos Wistar machos (90 a 100g) com 21 dias de vida. Os animais foram divididos em 6 grupos (Sham 18, EAo 18, Sham 28, ShamTR, EAo 28 e EAoTR) e após 18 semanas da cirurgia de indução da estenose aórtica (EAo) supravalvar, quando os animais apresentavam disfunção cardíaca, diagnosticada por ecocardiograma, parte dos animais de dois grupos (Sham 18 e EAo 18) foram eutanasiados e o ventrículo esquerdo coletado para as análises histoquímica e molecular. O restante foram submetidos a uma programa de treinamento aeróbico em esteira com intensidade relativa ao limiar de lactato e tempo progressivo (EAoTR e ShamTR) ou não (Sham 28 e EAo 28). Após 28 semanas, os animais dos grupos EAo 28, Sham 28, ShamTR e EAoTR foram submetidos à análise... / Cardiac remodeling (CR) is a time-dependent process that promotes cellular and molecular changes manifested clinically by changes in size, shape and function after injury, and heart failure (HF), the final stage of the process. HF is characterized by an inability of the heart to pump blood tissue in accordance with the metabolic needs, or to do so at the expense of adequately elevated ventricular filling pressure. This is due, in part, by the presence of cardiomyocyte hypertrophy and fibrosis, which decrease the driving activity of the heart. Aerobic exercise training is considered a conduct proposed and accepted to minimize cardiac changes in HF. However, little is known about the effects of training on morphological and molecular aspects in the heart muscle from cardiac dysfunction to HF. The objective of this study was to evaluate the morphological and molecular changes of the heart and the effect of aerobic training from cardiac dysfunction to HF in aortic stenosis model in rats. Fifty two male Wistar rats were used (90 to 100 g) with 21 days of life. The animals were divided into 6 groups (Sham 18, AS 18, Sham 28, Sham-ET, AS 28 and AS-ET) and after 18 weeks of induction of aortic stenosis surgery (AS) supravalvar, when the animals had cardiac dysfunction diagnosed by echocardiogram the animals of both groups (Sham 18 and AS 18) were euthanized and the left ventricle collected for immunohistochemistry and molecular analysis. The remaining animals were subjected to an aerobic training program on a treadmill with relative intensity to the lactate threshold and progressive time (AS-ET and Sham-ET) or not (Sham 28 and AS 28). After 28 weeks, the animals of the AS 28, Sham 28, Sham-ET and AS-ET underwent echocardiography, euthanized and the left ventricle collected for immunohistochemistry and molecular analysis. The picrosirius red staining was used to analyze the morphology and quantification of extracellular matrix collagen. The ...

Orientador: Alvimar José da Costa / Coorientador: Antônio Sérgio Ferraudo / Banca: Kátia Denise Saraiva Bresciani / Banca: Gilson Pereira de Oliveira / Banca: Claudio Alessandro Massamitsu Sakamoto / Banca: Welber Daniel Zanetti Lopes / Resumo: A criptosporidiose é uma enfermidade de veiculação hídrica, possui como agravante a dificuldade de prevenção da contaminação ambiental e ausência de medidas terapêuticas eficazes. Com acentuada importância na bovinocultura, ocasiona inflamação e atrofia das vilosidades intestinais resultando em perda da superfície de absorção. O presente estudo teve como objetivo caracterizar molecularmente a infecção por Cryptosporidium spp. em bezerros do Município de Formiga, região Centroeste de Minas Gerais. Um total de 300 amostras de fezes de bezerros holandeses, nelore e sem raça definida, foram avaliadas pela técnica de coloração contraste negativo de verde malaquita e por meio da reação de nested-PCR para amplificação de fragmentos de DNA da subunidade 18S do gene do RNA ribossômico. Ocorrência de 5,33% (16/300) pelo verde malaquita e 4,66% (14/300) pela PCR foram observadas, sendo que por meio da caracterização molecular foram identificadas as espécies Cryptosporidium andersoni e Cryptosporidium ryanae. Os bezerros infectados apresentavam baixa eliminação de oocistos de Cryptosporidium spp. Não houve sendo que não houve relação da positividade com todas as variáveis estudadas. No sequenciamento foi encontrado as espécies de C. andersoni e C. ryanae, inclusive parasitando bezerros em faixas etárias, não relatadas na literatura. Estas duas espécies de Cryptosporidium, caracterizados molecularmente (Nested-PCR), no presente estudo, são descritas pela primeira vez parasitando bovinos do estado de Minas Gerais, Brasil / Abstract: Cryptosporidiosis is a waterborne disease, has as aggravating the difficulty of preventing environmental contamination and the absence of effective therapeutic measures. With pronounced importance to the cattle, causes villous atrophy and inflammation resulting in loss of intestinal absorption surface. The present study aimed to characterize molecularly infection by Cryptosporidium spp. calves in the City of Formiga, Midwest region of Minas Gerais. A total of 300 stool samples from Holstein calves, and Nelore breed were evaluated by negative contrast staining of malachite green and through the reaction of nested-PCR for amplification of DNA fragments of the 18S subunit of the RNA gene ribosomal. Occurrence of 5.33% (16/300) for malachite green and 4.66% (14/300) were observed by PCR, and by molecular characterization were identified species Cryptosporidium andersoni and Cryptosporidium ryanae. Calves infected had lower elimination of Cryptosporidium spp. There was no positive relationship with all the variables. Sequencing were found in the species C. andersoni and C. ryanae, including parasitizing calves in age, not reported in the literature. These two species of Cryptosporidium, molecularly characterized (nested PCR), the present study describes for the first time parasitizing cattle in the state of Minas Gerais, Brazil / Doutor

Orientador: Maeli Dal Pai / Coorientador: Robson Francisco Carvalho / Banca: Márcia Gallacci / Banca: Francis Lopes Pacagnelli / Resumo: A remodelação cardíaca (RC) é um processo tempo dependente que promove alterações celulares e moleculares que se manifestam clinicamente através de alterações no tamanho, forma e função do coração após a agressão, sendo a insuficiência cardíaca (IC) o estágio final deste processo. A IC caracteriza-se por uma incapacidade do coração de bombear sangue de acordo com as necessidades metabólicas teciduais, ou pode fazê-lo adequadamente à custa da elevação da pressão de enchimento ventricular. Isso é decorrente, em parte, pela presença da hipertrofia dos cardiomiócitos e fibrose, que diminuem a atividade propulsora do coração. O treinamento físico aeróbico é considerado uma conduta proposta e aceita para minimizar as alterações cardíacas na IC. No entanto, pouco é sabido sobre os efeitos do treinamento sobre os aspectos morfológicos e moleculares no músculo cardíaco durante a transição entre a disfunção cardíaca e a IC. O objetivo deste trabalho foi avaliar as alterações morfológicas e moleculares do coração e o efeito do treinamento aeróbico durante a transição da disfunção cardíaca para a IC no modelo de estenose aórtica em ratos. Foram utilizados 52 ratos Wistar machos (90 a 100g) com 21 dias de vida. Os animais foram divididos em 6 grupos (Sham 18, EAo 18, Sham 28, ShamTR, EAo 28 e EAoTR) e após 18 semanas da cirurgia de indução da estenose aórtica (EAo) supravalvar, quando os animais apresentavam disfunção cardíaca, diagnosticada por ecocardiograma, parte dos animais de dois grupos (Sham 18 e EAo 18) foram eutanasiados e o ventrículo esquerdo coletado para as análises histoquímica e molecular. O restante foram submetidos a uma programa de treinamento aeróbico em esteira com intensidade relativa ao limiar de lactato e tempo progressivo (EAoTR e ShamTR) ou não (Sham 28 e EAo 28). Após 28 semanas, os animais dos grupos EAo 28, Sham 28, ShamTR e EAoTR foram submetidos à análise... / Abstract: Cardiac remodeling (CR) is a time-dependent process that promotes cellular and molecular changes manifested clinically by changes in size, shape and function after injury, and heart failure (HF), the final stage of the process. HF is characterized by an inability of the heart to pump blood tissue in accordance with the metabolic needs, or to do so at the expense of adequately elevated ventricular filling pressure. This is due, in part, by the presence of cardiomyocyte hypertrophy and fibrosis, which decrease the driving activity of the heart. Aerobic exercise training is considered a conduct proposed and accepted to minimize cardiac changes in HF. However, little is known about the effects of training on morphological and molecular aspects in the heart muscle from cardiac dysfunction to HF. The objective of this study was to evaluate the morphological and molecular changes of the heart and the effect of aerobic training from cardiac dysfunction to HF in aortic stenosis model in rats. Fifty two male Wistar rats were used (90 to 100 g) with 21 days of life. The animals were divided into 6 groups (Sham 18, AS 18, Sham 28, Sham-ET, AS 28 and AS-ET) and after 18 weeks of induction of aortic stenosis surgery (AS) supravalvar, when the animals had cardiac dysfunction diagnosed by echocardiogram the animals of both groups (Sham 18 and AS 18) were euthanized and the left ventricle collected for immunohistochemistry and molecular analysis. The remaining animals were subjected to an aerobic training program on a treadmill with relative intensity to the lactate threshold and progressive time (AS-ET and Sham-ET) or not (Sham 28 and AS 28). After 28 weeks, the animals of the AS 28, Sham 28, Sham-ET and AS-ET underwent echocardiography, euthanized and the left ventricle collected for immunohistochemistry and molecular analysis. The picrosirius red staining was used to analyze the morphology and quantification of extracellular matrix collagen. The ... / Mestre

Orientador: Maria Tercília Vilela de Azeredo Oliveira / Banca: Hermione Elly Melara de Campos Bicudo / Banca: Carlos Roberto Ceron / Banca: Luiz Carlos de Mattos / Banca: Aline Rimoldi Ribeiro / Resumo: Os triatomíneos pertencem à ordem Heteroptera, família Reduviidae e subfamília Triatominae. Atualmente, são admitidas 150 espécies, agrupadas em seis tribos e 18 gêneros. O subcomplexo Brasiliensis foi proposto, inicialmente por Lucena, em, 1970, contendo nove espécies, a saber: Triatoma brasiliensis; T. juazeirensis; T. melânica; T melanocephala; T. petrochiae; T. lenti; T. sherlocki; T. tibiamaculata e T. vitticeps. A partir de dados citotaxonômicos, foi proposta a exclusão das espécies T. melanocephala, T. vitticeps e T. tibiamaculata por apresentarem fragmentação do cromossomo sexual X e, com isso, serem proximamente relacionados aos triatomíneos da América do Norte. Com base em dados moleculares, foi sugerido, portanto, que esse subcomplexo compreende as seguintes espécies: T. brasiliensis, T. juazeirensis, T. melanica, T. sherlocki e a subespécie T. b. macromelasoma. No entanto, os estudos não incluíram T. lenti e T. petrochiae. Com base em análises citogenéticas, foi proposto que T. lenti seja um membro do subcomplexo Brasiliensis. Visando esclarecer as dúvidas relacionadas à posição das espécies T. lenti e T. petrochiae dentro desse subcomplexo, o presente trabalho teve como objetivo analisar, por meio do Domínio D2 (região 28S DNAr) e do gene mitocondrial ND1 a relação filogenética dos táxons que compõem o subcomplexo Brasiliensis. A partir das análises geradas com o domínio nuclear D2, concluímos que não foi possível confirmar a relação filogenética entre os membros do subcomplexo Brasiliensis, visto que, as sequencias obtidas apresentaram apenas dois sítios polimórficos em 567 pb, demonstrando que esse domínio não é um marcador molecular adequado para essas espécies, devido ao seu alto grau de conservação. Todavia, os resultados obtidos para o gene mitocondrial ND1 corroboraram os dados citotaxonômicos que consideram a espécie T. lenti como membro do subcomplexo Brasiliensis,... / Abstract: Triatomines belong to the order Heteroptera, family Reduviidae and subfamily Triatominae. Currently, they admitted 150 species, grouped into two tribes and 18 genera. Brasiliensis subcomplex was proposed initially by Lucena, in 1970, containing nine species: Triatoma brasiliensis; T. juazeirensis; T. melânica; T melanocephala; T. petrochiae; T. lenti; T. sherlocki; T. tibiamaculata and T. vitticeps. From data citotaxonomicals, it was proposed the exclusion of species T. melanocephala, T. vitticeps and T. tibiamaculata by present fragmentation of sex chromosome X and, therefore, are closely related to triatomines North America. Based on molecular data, it was suggested therefore that comprises the subcomplex species: T. brasiliensis, T. juazeirensis, T. melanica, T. sherlocki and subspecie T. b. macromelasoma. However, the studies didn't include T. lenti and T. petrochiae. Based on cytogenetic analysis, it was proposed that T. lenti be a member of Brasiliensis subcomplex. Aiming to answer questions related to the position of the species T. lenti and T. petrochiae within this subcomplex, this study aimed to analyze, through the Domain D2 (region 28S RNAr) and mitochondrial gene ND1 the phylogenetic relationship of the taxa that comprise the subcomplex Brasiliensis. From the analysis generated with domain D2, we concluded that it was not possible to confirm the phylogenetic relationship among the members of Brasiliensis subcomplex, since the obtained sequences showed only two polymorphic sites in 567 bp, indicating that this domain is not a marker molecular suitable for these species, due to its high degree of conservation. However, the results obtained from the mitochondrial gene ND1 corroborate cytotaxonomic data that consider the species T. lenti as Brasiliensis subcomplex member, evidenced by the high support in the branches generated by phylogeny (89% bootstrap). In the topology it was also observed that T. petrochiae be the brother ... / Doutor

Describe los eventos relacionados con la evolución molecular del VIH-1 en sujetos peruanos TS y NTS infectados de Lima y Callao. Materiales y métodos. Se realizó el análisis molecular del VIH a partir de 93 sujetos infectados, 61 fueron trabajadoras y trabajadores sexuales (TS) y 32 militares no trabajadores sexuales (NTS). Se extrajo el ADN proviral de toda la población, el cual fue sometido a PCR para la amplificación de los genes gag, env, y pol de VIH-1. Los productos fueron purificados, secuenciados y analizados. Los productos de PCR de env fueron analizados mediante ensayo de movilidad de heterodúplex (HMA) y luego clonados y secuenciados en vectores plasmídicos para la identificación de variantes genéticas virales por medio de análisis filogenético. Las secuencias fueron analizadas usando herramientas de bioinformática para la identificación de subtipos genéticos, recombinación, mutaciones en regiones conservadas, mutaciones de resistencia a los antirretrovirales (ARV), hipermutación y tropismo. Para el análisis estadístico de frecuencias, riesgo absoluto (RO) e índice de asociación se usó el programa SPSS versión 21. Se demostró que todas las muestras analizadas fueron subtipo B con evidencia de recombinación entre diferentes subtipos, siendo la forma B/D la más frecuente (28%). Se hallaron dieciocho casos de infecciones mixtas y 66% de virus con tropismo R5. Los virus restantes con tropismo X4 fueron más frecuentes en pacientes con CD4 < 200 células/mL. Asimismo, se hallaron mutaciones no conservadas en la región de MHR, principalmente en TS, incluyendo un caso de hipermutación. También se halló un índice de 24% de resistencia frente a los ARV. Dentro de ello, se encontró evidencia de resistencia primaria (17%) la cual estuvo asociada con el ejercicio del trabajo sexual (p = 0.04) y con la presencia de infecciones mixtas (p = 0.01). Se demuestra que la evolución molecular del VIH sigue trayectorias diferentes entre TS y NTS, siendo la presencia de algunos factores de riesgo como infecciones mixtas y el ejercicio del trabajo sexual determinantes en este proceso. / Tesis

Orientador: Licio Augusto Velloso / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas. Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-07-26T23:18:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rocha_EduardoMelani_D.pdf: 3720932 bytes, checksum: c01b00052a61b99bdf9da344920c7519 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: As células da superficie ocular assim como os tecidos das glândulas salivares e lacrimais respondem à insulina quando em cultura, e podem softer modulação no seu ritmo de proliferação quando expostas a este hormônio. Os objetivos do presente estudo foram: (1) investigar a presença da insulina no filme lacrimal; (2) identificar o receptor de insulina, bem como os elementos participantes da via de sinalização intracelular da insulina nestes tecidos; (3) conhecer os efeitos de diabetes mellitus, envelhecimento e gênero sobre as etapas iniciais da sinalização da insulina em glândulas lacrimais e salivares de ratos. A presença de insulina na lágrima foi avaliada por radioimunoensaio enquanto que a identificação dos elementos envolvidos na transmissão do sinal insulínico e a resposta celular ao hormônio foram avaliados através de imunohistoquímica, imunoprecipitação e "imunoblotting". A insulina foi identificada em lágrima humana, havendo aparente relação com níveis circulatórios do hormônio. Demonstrou-se que: o receptor de insulina e o IGFIR estão presentes na cómea e na conjuntiva humana, e também que o RI, IRS-l, IRS-2, Shc, IGF-IR e STAT-l estão presentes em glândulas lacrimais e salivares de ratos; a fosforilação insulino-induzida do receptor de insulina foi significativamente menor em glândula lacrimal de ratos diabéticos, senis e do gênero feminino se comparados a seus respectivos grupos-controle; a fosforilação do receptor de insulina foi significativamente menor em glândulas salivares de ratos velhos e do gênero feminino do que em seus respectivos grupos-controle. O presente estudo traz evidências da ação da insulina sobre glândulas lacrimais e salivares, e na superficie ocular, bem como indícios de que o dia,betes mellitus, o envelhecimento e o gênero influenciam a transmissão do sinal da insuIIDa em glândulas lacrimais e salivares / Abstract: Insulin plays a major role in lacrimal and salivary gland function and may also regula te growth, metabolism and gene expression in those tissues and in ocular surface cells as well. In addition, cells isolated ITom the ocular surface and ITom exocrine glands depend on insulin for optimal survival in culture. The objectives of the present study were to investiga te the presence of insulin in tears as well as the expression and functional, status of the insulin receptor and elements participating in the insulin signaling pathway in ocular surface, salivary and lacrimal glands. Insulin was detected by radioimmunoassay in tear fi1m of humans and apparently correlates with plasma insulin. Immunoperoxidase technique was used to localize insulin and IGF-I receptors in human comea and conjunctiva and rat lacrimal and salivary glands. The insulin-induced phosphorylation in a time- and dosedependent fashion was observed for insulin receptors IGF-IR, IRS-l, IRS-2, Shc and STAT1, as evaluated by mmunoprecipitation and immunoblotting procedures. The insulin receptor phosphorylation in response to insulin was lower in lacrimal glands of diabetic, senile and female rats as compared to controIs. In salivary glands, similar findings were also observed in senile and female rats as compared to the controIs. There was also a significantly lower phosphorylation of ST A T -1 in response to insulin in lacrimal glands of diabetic rats and salivary glands of senile rats, compared to their respective controIs. The present study suggests that insulin, by acting through elements of its signaling pathwày may directly participate in the modulation of cellgrowth and survival in the ocular surface and lacrimal and salivary glands, and that insulin signaling in such sites may be influensed by diabetes mellitus, aging and gender / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Orientadores: Irani Quagio Grassiotto, Daniela Calcagnotto / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T14:34:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santana_JulioCesardeOliveira_D.pdf: 22975611 bytes, checksum: d02baacf927c5c48bc5cc9f97db90deb (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A superfamília Erythrinoidea é uma das oito famílias que compõem a ordem Characiformes e foi proposta como um grupo monofilético para abrigar as famílias neotropicais Ctenoluciidae, Erythrinidae e Lebiasinidae, e a família africana Hepsetidae. Após a proposição da superfamília, estudos filogenéticos recentes com base em caracteres morfológicos, como osteologia e morfologia de partes moles, e caracteres moleculares tem refutado a ideia de monofiletismo do grupo. Além disso, diferentes autores divergem quanto às relações suprafamiliares de Erythrinoidea. Além dos caracteres tradicionais, o emprego dos caracteres oriundos da análise da ultraestrutura da ontogenia dos espermatozoides e sua forma final tem sido uma importante fonte na complementação dos estudos filogenéticos. O estudo apresentado teve como objetivo realizar uma análise filogenética para testar a monofiletismo de Erythrinoidea e verificar os padrões de relacionamento suprafamiliares em Characiformes, e testar o posicionamento filogenético da família Crenuchidae, supostamente relacionada à superfamília. As análises filogenéticas foram realizadas com base em dados moleculares e dados morfológicos independentemente, e de maneira conjunta (evidência total) através do método de Parcimônia. A ultraestrutura da espermiogênese e dos espermatozoides dos gêneros incluídos em Erythrinoidea, mais a família Crenuchidae e outras possivelmente relacionadas, foram descritos e codificados em uma matriz de dados. Nas três análises realizadas a superfamília Erythrinoidea não é recuperada como monofilética. A família Crenuchidae posiciona-se na base da subordem Characoidei e não está estreitamente relacionada à Erythrinoidea. As análises com dados moleculares e de evidência total apresentaram uma topologia muito semelhante ao nível mais inclusivo e os valores de suporte dos principais clados apresentaram-se maiores na evidência total, mostrando a influência positiva da inserção dos caracteres da morfologia das células espermáticas nas análises filogenéticas / Abstract: The superfamily Erythrinoidea is one of eight superfamilies within the order Characiformes and was proposed to include a monophyletic group composed of the Neotropical fish families Ctenoluciidae, Erythrinidae and Lebiasinidae, and African family Hepsetidae. Current phylogenetic studies based on morphological data, such as osteology and morphology of soft structures, and molecular data have refuted the hypothesis of monophyly of this group. In addition, the suprafamilial relationships in Erythrinoidea have diverged among the authors. In combination with more traditional characters, the analyses of the ultrastructure of sperm ontogeny and its final shape have become an interesting source of characters to complement phylogenetic studies. The goal of this study was to perform a phylogenetic analysis to test the monophyly of the Erythrinoidea and to assess the phylogenetic position of the family Crenuchidae, a group supposed to be closely related to the superfamily. The phylogenetic analyses were performed using molecular and morphological data separately, and in a combined approach (total evidence) through the Parsimony method. The ultrastructure of the spermiogenesis and the sperm shape of Erythrinoidea genera, plus the family Crenuchidae and other species possibly related to the superfamily were described and coded in a matrix data. In all three analyses Erythrinoidea was not recovered as monophyletic. The family Crenuchidae was placed in a basal position within the suborder Characoidei in molecular and total evidence analysis, and was not closely related to the Erythrinoidea. The analyses using only molecular data and total evidence showed a very similar topology for the more inclusive relationship levels. The support values were higher for the total evidence tree when compared to the one resulting of only molecular data possibly pointing to a positive influence of the combination of the spermatic cell data in phylogenetic analyses / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural

Orientador: Renato Goldenberg / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-23T02:40:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caddah_MayaraKrasinski_D.pdf: 44109301 bytes, checksum: 6f87fe47d630845de374495c24f66a41 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: Miconia é um é um dos maiores gêneros de angiospermas. Tradicionalmente, tem sido considerado complexo e mal circumscrito, assim como outros gêneros aparentados. Estudos filogenéticos recentes, baseados em marcadores moleculares, têm atestado a natureza polifilética de Miconia e suas onze seções. Neste trabalho, é apresentado um estudo filogenético-molecular aprofundado de um dos grupos naturais encontrados em estudos anteriores, o "subclado Miconia discolor", do "clado Miconia IV". Para tanto, foram utilizados sequências de quatro marcadores plastidias (psaI-accD; psnK-L; atpF-H; trnS-G) e dois nucleares (ITS e ETS). Os resultados obtidos permitiram esclarecer o relacionamento interno e externo do grupo. Por meio da otimização de caracteres morfológicos e biogeográficos, são sugeridas hipóteses evolutivas, como a evolução de inflorescências glomeruladas e pseudantos a partir de inflorescências com ramos escorpióides amplos, e a irradiação da diversidade na Floresta Atlântica a partir de poucas colonizações. Os resultados também permitiram a primeira proposição moderna de classificação ingra-genérica para Miconia, através da formalização e circunscrição de novos táxons: Miconia sect. Discolor, e subseções Albicans, Chrysophylla, Discolor e Multispicata, subordinadas à nova seção. Adicionalmente, uma revisão taxonômica é apresentada para a recém proposta subseção Discolor, incluindo descrições, ilustrações, imagens de Microscopia Eletrônica de Varredura, comentários, e uma chave dicotômica de identificação para as espécies. A subseção é composta 32 espécies, das quais três são novas. Trinta e dois nomes heterotípicos foram sinonimizados, e 39 lectotipificações foram propostas. A subseção pode ser reconhecida por apresentar as folhas densamente cobertas por tricomas ramificados na face abaxial (nunca formando um indumento aracnóide), inflorescências geralmente glomeruladas, raramente curtamente scorpióides, lobos do cálice caducos no fruto, e uma distribuição restrita ao sudeste da América do Sul, ocorrendo na Floresta Atlântica e no Cerrado / Abstract: Miconia is one of the biggest genera in angiosperms. It has been traditionally considered very complex and badly circumscribed, and other close genera as well. Phylogenetic studies based on molecular markers have been confirming the polyphily of Miconia and its eleven sections. Here I present a deeper molecular and phylogenetic study of a natural group found out in older studies, the "Miconia discolor subclade", from the "Miconia IV clade". I used sequences of four plastid (psaI-accD; psnK-L; atpF-H; trnS-G) and two nuclear markers (ITS and ETS). The results clarified the inner and outer relationship of that group. Evolutionary hypotheses are suggested by the optimization of morphological and biogeographical charcaters. For example, the evolution of glomerulate inflorescences and pseudanthia from inflorescences of wide, scorpioid branches, and the diversification of the genus in the Atlantic Forest from few colonizations. Additionally, the results allowed the first modern infra-generic rearrangement by the proposition and circumscription of new taxa: Miconia sect. Discolor, with the subsections Albicans, Chrysophylla, Discolor and Multispicata. A revision of the new Miconia subsect. Discolor is presented, with descriptions, illustrations, Scanning Electron Microscopy images, comments, and a taxonomic key for species. The subsection has 32 species and three of them are new. I synonymized 32 heterotypic names proposed 39 lectotipifications. The subsection can be recognized by the abaxial leaf surface usually densely covered by branched trichomes (never forming a cobweb indument), inflorescences usually glomerulate, rarely shortly scorpioid, calyx lobes caducous in fruit, and a distribution restricted to the southeast of South America, in the Atlantic Forest and Cerrado / Doutorado / Biologia Vegetal / Doutora em Biologia Vegetal

Orientador: Shirlei Maira Recco Pimentel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-14T11:03:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Egito_GabrielToselliBarbosaTabosado_M.pdf: 537508 bytes, checksum: e9fd34e6de85068aa05990a955acff88 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Dendropsophus minutus está amplamente distribuído ao Leste dos Andes, na América do Sul e possui uma grande diversidade acústica e morfológica, o que sugere que possa haver mais de uma espécie sob esse nome. Sua coloração dorsal pode ser classificada em dois padrões principais, hourglass e bivittata. No presente estudo, 14 parâmetros morfométricos e seqüências de DNA com 357 pares de bases do gene citocromo b mitocondrial foram analisados objetivando um melhor entendimento acerca da variação de D. minutus no Brasil. Tanto os resultados moleculares quanto os fenotípicos revelaram a presença de uma alta estruturação da diversidade dessa espécie, mostrando que a divergência entre populações é, geralmente, proporcional à distância geográfica, exceto no estado de São Paulo, sudeste do Brasil. Nessa região, a Serra do Mar está aparentemente agindo como uma barreira geográfica para o fluxo gênico, isolando duas linhagens. A primeira, formada pelas populações da Mata Atlântica, tem padrão hourglass de coloração dorsal. A segunda, do interior de São Paulo, assim como a população do Rio Grande do Sul, possui padrão bivittata de coloração dorsal. Esses resultados corroboram a hipótese de que o táxon D. minutus contém duas linhagens crípticas. Apesar disso, uma amostragem maior se faz necessária, bem como um melhor estudo de caracteres para defini-las como espécies ou não. / Abstract: In despite of its complex reproductive behavior, Dendropsophus minutus has a large distribution at East of Andes, South America and show high acoustic and morphologic diversity, suggesting that possibly more than one species may exist under this name. Its dorsum coloration has basically two main patterns, hourglass or bivittata. Here, 14 morphometric parameters and partial mitochondrial cytochrome b gene sequences (357 base pairs) were analyzed aiming to understand more about Brazilian D. minutus variation. Both molecular and morphologic results agree with a high structuration of this species diversity, showing population divergence generally proportional to their geographic distance, except in São Paulo State, southeastern Brazil. At this region, Serra do Mar high mountains are apparently acting as a barrier for dispersion, isolating two lineages. The first of them, formed by populations from Atlantic Rainforest domain, has an hourglass dorsum pattern, whereas the second, comprising inner São Paulo State populations gathered with D. minutus from Rio Grande do Sul (South Brazil), shows bivittata dorsum coloration pattern. These results corroborate the hypothesis that D. minutus could comprise more than one species, revealing two cryptic lineages. However, these lineages should not be defined as different species before sampling enlargement to the present study. / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Biologia Celular e Estrutural

Dormancy is one of the most important adaptive mechanisms developed by perennial plants, in order to survive the low temperatures of autumn and winter in temperate climates. The study of the genes regulated during dormancy release is crucial to understand the process, with the final objective of the development of new varieties with a better adaptation to certain environments; in particular in the Mediterranean area. The general aim of this work is to understand the molecular and physiological mechanisms underlying the maintenance and release of seasonal dormancy in peach. The first part of this work is focused on the identification of peach genes related to dormancy release by suppression subtractive hybridization (SSH) and microarray hybridization. A significant number of genes identified in this work were homologous to ABA and drought related genes from other species. Our data contribute to highlight a prominent role of ABA in dormancy processes and also uncover elements of the ABA and drought regulatory response in peach, as an ABA-INSENSITIVE5 (ABI5) binding protein (AFP)-like, a dehydration-responsive element (DRE)-binding protein (DREB2C)-like, a calcium-binding annexin, and several genes regulated by stress signalling pathways. Other identified genes were also evaluated to assess the chilling requirement of cultivars by analysis of expression showing a very good correlation between the expression pattern of DAM5, together with other transcripts (BD396, DB247, SB280 and PpB63) and the chilling requirements values of five different varieties ('Big Top', 'Catherina', 'Fergold', 'Maruja' and 'Springlady') measured following Utah and Dynamic models. Furthermore, a study of chromatin modifications associated to dormancy release in the DAM6 gene is presented. A ChIP analysis of DAM6 promoter and structural gene revealed chromatin modification events similar to those observed in vernalization of Arabidopsis and cereals. / Leida, CA. (2012). Molecular aspects of dormancy in peach (Prunus persica [L.] Batsch.) [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/15864 / Palancia