Examina la diversidad y estructura genética de dos poblaciones de patos criollos, Cairina moschata, empleando el polimorfismo genético de 18 marcadores microsatélites. Los parámetros utilizados incluyen número de alelos (A), números efectivo de alelos (Ae) y promedio de heterocigosidad (He) de cada población. Los resultados muestran que 11 de los 18 loci de microsatélites son altamente polimórficos: APH07, APH09, APH13, APT004, APT21, APT25, APT29, AY295, CAUD001, CAUD022 y CMO211 (PIC> 0.025). El promedio de A (6.6), Ae (2.23) y He (0.3803) de las dos poblaciones de patos es moderado a bajo, lo que indica que el polimorfismo genético y la diversidad genética son moderados. La prueba de Hardy-Weinberg demuestra que las dos poblaciones en este estudio se encuentran en desequilibrio H-W. El resultado del análisis de estadísticos F y R muestra valores de 0.115 y 0.011, lo que indica la estructuración genética baja a moderada. La tasa de endogamia (FIS) dio resultados significativos, lo que demuestra la carencia de buenos programas de manejo de la especie. Los datos indican que el 60% de los loci microsatélites evaluados son eficaces para el análisis de la diversidad genética en poblaciones de patos criollos de la región norte del Perú. / Tesis

En el presente estudio se diseñó una técnica molecular alternativa para la identificación de Haemophilus paragallinarum, agente causal de la Coriza Infecciosa, basada en el polimorfismo en longitud de los fragmentos de restricción de los genes ribosómicos 16S amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (RFLP-PCR). Esta metodología fue propuesta debido a que las técnicas, HPG-1 y HPG-2, las cuales vienen siendo utilizadas en la identificación de este patógeno, mostraron baja sensibilidad y reacción cruzada con Escherichia coli, respectivamente. En la técnica HPG-2 se encontró dos productos de amplificación entre 450 y 500 pb confundiéndose con el producto de 500 pb que se obtiene con H. paragallinarum. Para la estandarización de la técnica molecular propuesta, se utilizaron las cepas de referencia ATCC 29545, B y C de H. paragallinarum, y como controles negativos a Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganismos con características morfológicas, bioquímicas y cuadros clínicos similares a H. paragallinarum; y E. coli, esta última, asociada en la Coriza Infecciosa complicada. Se utilizaron cebadores universales para amplificar los genes ribosómicos 16S con los que se obtuvo un fragmento de 1500 pb para todas las cepas, éstos fueron cortados con enzimas de restricción seleccionadas mediante el análisis de las secuencias de los genes ribosómicos 16S depositadas en el GenBank (banco de genes). Con el RFLP-PCR se obtuvo una mayor especificidad y sensibilidad ya que se identificaron perfiles genéticos específicos para H. paragallinarum y diferentes a los de O. rhinotracheale, Pasteurella spp y E. coli. La técnica diseñada fue utilizada en la identificación de 19 cepas aisladas de muestras clínicas de senos infraorbitarios y cornetes nasales de gallinas reproductoras, de postura y pollos de carne de diversas zonas del Perú obteniendo resultados reproducibles y demostrando la validez de esta técnica y su uso para una rápida identificación de microorganismos implicados en infecciones respiratorias en aves comerciales. Palabras claves: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Coriza Infecciosa, genes ribosómicos 16S, RFLP-PCR. / --- In the present study, a technical molecular alternative for the identification of Haemophilus paragallinarum, causal agent of the Infectious Coryza, based on the restriction fragments length polymorphism of the 16S ribosomal genes amplified by the chain reaction polymerase (RFLP-PCR) was designed. This methodology was proposed due to the fact that the HPG-1 and HPG-2 techniques, which have been used for the identification of this pathogen, showed low sensitivity and crossed reaction with Escherichia coli respectively. In the HPG-2 technique, two amplification products between 450 and 500 bp were obtained, similar with the 500 bp product obtained with H. paragallinarum. For the standardization of the proposed molecular technique, we used the ATCC 29545 reference strain and the B and C strains of H. paragallinarum, as well as Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganisms with similar morphological, biochemical characteristics and clinical signs to those of H. paragallinarum, and E. coli, bacterium associated in the complicated Infectious Coryza, as negative controls. Universal primers for amplifying the 16S ribosomal genes were used, obtaining a 1500 bp fragment for all strains which were cut by restriction enzymes selected by means of the analysis of sequences of the 16S ribosomal genes located in the Gene bank (bank of genes). With the RFLP-PCR a high specificity and sensibility were obtained since specific profiles for H. paragallinarum and different from those of O. rhinotracheale, Pasteurella spp. and E. coli were identified. The designed technique was used for the identification of 19 strains isolated from clinical samples of infraorbital sinus and nasal cornets of breeders and laying hens, and broiler chickens of diverse zones of Peru obtaining reproducible results and demonstrating the validity of this technique and its use for a rapid identification of microorganisms involved in respiratory infections in commercial birds. Key words: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Infectious Coryza, 16S ribosomal genes, RFLP-PCR. / Tesis

En el presente estudio se diseñó una técnica molecular alternativa para la identificación de Haemophilus paragallinarum, agente causal de la Coriza Infecciosa, basada en el polimorfismo en longitud de los fragmentos de restricción de los genes ribosómicos 16S amplificados por la reacción en cadena de la polimerasa (RFLP-PCR). Esta metodología fue propuesta debido a que las técnicas, HPG-1 y HPG-2, las cuales vienen siendo utilizadas en la identificación de este patógeno, mostraron baja sensibilidad y reacción cruzada con Escherichia coli, respectivamente. En la técnica HPG-2 se encontró dos productos de amplificación entre 450 y 500 pb confundiéndose con el producto de 500 pb que se obtiene con H. paragallinarum. Para la estandarización de la técnica molecular propuesta, se utilizaron las cepas de referencia ATCC 29545, B y C de H. paragallinarum, y como controles negativos a Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganismos con características morfológicas, bioquímicas y cuadros clínicos similares a H. paragallinarum; y E. coli, esta última, asociada en la Coriza Infecciosa complicada. Se utilizaron cebadores universales para amplificar los genes ribosómicos 16S con los que se obtuvo un fragmento de 1500 pb para todas las cepas, éstos fueron cortados con enzimas de restricción seleccionadas mediante el análisis de las secuencias de los genes ribosómicos 16S depositadas en el GenBank (banco de genes). Con el RFLP-PCR se obtuvo una mayor especificidad y sensibilidad ya que se identificaron perfiles genéticos específicos para H. paragallinarum y diferentes a los de O. rhinotracheale, Pasteurella spp y E. coli. La técnica diseñada fue utilizada en la identificación de 19 cepas aisladas de muestras clínicas de senos infraorbitarios y cornetes nasales de gallinas reproductoras, de postura y pollos de carne de diversas zonas del Perú obteniendo resultados reproducibles y demostrando la validez de esta técnica y su uso para una rápida identificación de microorganismos implicados en infecciones respiratorias en aves comerciales. Palabras claves: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Coriza Infecciosa, genes ribosómicos 16S, RFLP-PCR. / In the present study, a technical molecular alternative for the identification of Haemophilus paragallinarum, causal agent of the Infectious Coryza, based on the restriction fragments length polymorphism of the 16S ribosomal genes amplified by the chain reaction polymerase (RFLP-PCR) was designed. This methodology was proposed due to the fact that the HPG-1 and HPG-2 techniques, which have been used for the identification of this pathogen, showed low sensitivity and crossed reaction with Escherichia coli respectively. In the HPG-2 technique, two amplification products between 450 and 500 bp were obtained, similar with the 500 bp product obtained with H. paragallinarum. For the standardization of the proposed molecular technique, we used the ATCC 29545 reference strain and the B and C strains of H. paragallinarum, as well as Ornithobacterium rhinotracheale, Pasteurella spp., microorganisms with similar morphological, biochemical characteristics and clinical signs to those of H. paragallinarum, and E. coli, bacterium associated in the complicated Infectious Coryza, as negative controls. Universal primers for amplifying the 16S ribosomal genes were used, obtaining a 1500 bp fragment for all strains which were cut by restriction enzymes selected by means of the analysis of sequences of the 16S ribosomal genes located in the Gene bank (bank of genes). With the RFLP-PCR a high specificity and sensibility were obtained since specific profiles for H. paragallinarum and different from those of O. rhinotracheale, Pasteurella spp. and E. coli were identified. The designed technique was used for the identification of 19 strains isolated from clinical samples of infraorbital sinus and nasal cornets of breeders and laying hens, and broiler chickens of diverse zones of Peru obtaining reproducible results and demonstrating the validity of this technique and its use for a rapid identification of microorganisms involved in respiratory infections in commercial birds. Key words: Haemophilus paragallinarum, Ornithobacterium rhinotracheale, Infectious Coryza, 16S ribosomal genes, RFLP-PCR.

En el presente trabajo de tesis se analizaron 2775 muestras de suero de aves (Gallus gallus) recolectadas en el programa de Monitoreo Serológico realizado en el Perú por el Servicio Nacional de Sanidad Agraria (SENASA) desde el 27 de agosto del 2001 al 18 de enero del 2002. Las muestras fueron clasificadas de acuerdo al tipo de explotación en: Aves de Postura (n =299), Pollos de Carne (n =704), Aves de Crianza Casera (n =1200) y Aves de Riña (n =492). Para el análisis de resultados se diseño una tabla de interpretación, la cual con la intervención de un panel de expertos consistió en la estandarización de resultados serológicos de la prueba de inhibición de la hemoaglutinación (HI), para la enfermedad de Newcastle, de acuerdo a los títulos de anticuerpos obtenidos. El resultado del análisis del total de muestras analizadas dio una frecuencia de 4.7% de aves consideradas positivas las que presentaron títulos de anticuerpos compatibles a desafío de campo al virus de la ENC. El análisis por tipo de explotación dio una frecuencia de 11.71% para las aves de crianza tecnificada de postura y de 3.9% para las aves de crianza no tecnificada casera. El análisis de regresión logística multinomial muestra al grupo de aves de postura como factor de riesgo, asociado al titulo de anticuerpos de la prueba HI compatible con desafío al virus de la ENC. El presente estudio concluye que el virus de la ENC es endémico en las aves de crianza tecnificada para los departamentos de Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac y Puno, siendo en esta zona las aves de postura el principal factor de riesgo. / In the present thesis work has been analyzed 2775 samples of avian serum collected in the serologic screening of Peru done by El Servicio nacional de Sanidad Agraria (Senasa) from August 27 2001 to January 18 2002. The samples were classified according to the type of exploitation in: Layers (n =299) , broilers (n =704), in-house breeding (n =1200) and cock fight breeding (n =492). The analysis of the results was interpreted by the use of a chart of interpretation designed by a panel of experts, which consisted in the standardization of the serologist results of the inhibition of hemoaglutination test (HI), for the Newcastle disease (ND) according to the level of antibody titel obbteined. The result of the analysis of the total of samples analyzed gave a frequency of 4.7% of birds considered positives which presented tittles of antibodies compatibles to a field challenge of the ND virus. The analysis by type of exploitation gave a frequency of 11.71% for the layers and a 3.9% for the in-house breeding. The analysis of multinomial logistic regression shows that the group of layers as a risk factor, associated to the title of antibodies of the HI test compatible to a challenge of the ND virus. The present study concludes that the ND virus is endemic in the layers breeding for the de departments of Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac and Puno.

Actualmente, la gastronomía peruana se encuentra en un crecimiento exponencial, lo cual impulsa el incremento de restaurantes que se especializan en la comida nacional. El plato bandera del Perú es el pollo a la brasa ya que su aceptación es mayor que la del ceviche. Esta especialidad culinaria es servida en las pollerías; en las cuales, la buena atención, la rapidez del servicio y la calidad del pollo son los tres aspectos relevantes que marcan la diferencia. Por otro lado, con el desarrollo industrial y el avance tecnológico se ha desarrollado nuevos métodos, técnicas y máquinas, con los cuales se obtienen productos de mejor calidad a un menor tiempo, evitando así, un producto final que no alcance los niveles de calidad que exige el público. En el ámbito de la cocina, el uso de máquinas capaces de realizar tareas repetitivas y en tiempo real se desarrolló con el objetivo de facilitar los trabajos culinarios. Logrando una mejor calidad de los productos con menor esfuerzo y en menos tiempo, en comparación con la cocina tradicional. En la actualidad, se encuentran una gran variedad de sistemas para cortar, rebanar, cocinar y otras que son de tareas especializadas. Cocinar pollos a la brasa en un horno es una tarea compleja, a pesar que a simple vista es una actividad sencilla. Por ejemplo, introducir la barra de pollos, esperar que se cocinen, retirarlos y cortarlos en cuartos son las principales acciones. Sin embargo, dichas tareas deben estar controladas y monitoreadas por el cocinero de pollos a la brasa; quien, en muchas pollerías, también sirve los platos. Estas funciones adicionales hacen que el encargado, descuide el control de la cocción de pollos, por ende, la calidad de los pollos es baja y el tiempo que demora en atender a los comensales aumenta, generando incomodidad en los usuarios. El objetivo de esta tesis es diseñar un sistema mecatrónico que permita realizar los procesos mencionados, desde el ingreso de la barra con pollos hasta la salida de los pollos cocidos y cortados en cuartos. El sistema se ha considerado como una línea de producción dividido en cinco partes; el ingreso del pollo, la cocción del pollo, la salida del horno, el corte del pollo y la manipulación de carbón. El uso de sensores y motores en la línea de producción asegura un alto nivel de precisión y control del funcionamiento. / Tesis

En el presente trabajo de tesis se analizaron 2775 muestras de suero de aves (Gallus gallus) recolectadas en el programa de Monitoreo Serológico realizado en el Perú por el Servicio Nacional de Sanidad Agraria (SENASA) desde el 27 de agosto del 2001 al 18 de enero del 2002. Las muestras fueron clasificadas de acuerdo al tipo de explotación en: Aves de Postura (n =299), Pollos de Carne (n =704), Aves de Crianza Casera (n =1200) y Aves de Riña (n =492). Para el análisis de resultados se diseño una tabla de interpretación, la cual con la intervención de un panel de expertos consistió en la estandarización de resultados serológicos de la prueba de inhibición de la hemoaglutinación (HI), para la enfermedad de Newcastle, de acuerdo a los títulos de anticuerpos obtenidos. El resultado del análisis del total de muestras analizadas dio una frecuencia de 4.7% de aves consideradas positivas las que presentaron títulos de anticuerpos compatibles a desafío de campo al virus de la ENC. El análisis por tipo de explotación dio una frecuencia de 11.71% para las aves de crianza tecnificada de postura y de 3.9% para las aves de crianza no tecnificada casera. El análisis de regresión logística multinomial muestra al grupo de aves de postura como factor de riesgo, asociado al titulo de anticuerpos de la prueba HI compatible con desafío al virus de la ENC. El presente estudio concluye que el virus de la ENC es endémico en las aves de crianza tecnificada para los departamentos de Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac y Puno, siendo en esta zona las aves de postura el principal factor de riesgo. / In the present thesis work has been analyzed 2775 samples of avian serum collected in the serologic screening of Peru done by El Servicio nacional de Sanidad Agraria (Senasa) from August 27 2001 to January 18 2002. The samples were classified according to the type of exploitation in: Layers (n =299) , broilers (n =704), in-house breeding (n =1200) and cock fight breeding (n =492). The analysis of the results was interpreted by the use of a chart of interpretation designed by a panel of experts, which consisted in the standardization of the serologist results of the inhibition of hemoaglutination test (HI), for the Newcastle disease (ND) according to the level of antibody titel obbteined. The result of the analysis of the total of samples analyzed gave a frequency of 4.7% of birds considered positives which presented tittles of antibodies compatibles to a field challenge of the ND virus. The analysis by type of exploitation gave a frequency of 11.71% for the layers and a 3.9% for the in-house breeding. The analysis of multinomial logistic regression shows that the group of layers as a risk factor, associated to the title of antibodies of the HI test compatible to a challenge of the ND virus. The present study concludes that the ND virus is endemic in the layers breeding for the de departments of Ica, Arequipa, Moquegua, Tacna, Junín, Huancavelica, Ayacucho, Cuzco, Apurímac and Puno.

El presente plan estratégico está basado en el Modelo Secuencial de Planeación Estratégica de D’Alessio (2013), y ha sido desarrollado con el fin de elevar la competitividad del sector avícola cárnico en el Perú. Para ello, se hizo un profundo análisis in / Tesis

Elabora en concordancia con los resultados obtenidos en las diferentes granjas que hay en la costa Peruana de las empresas avícolas más reconocidas en el Perú, observando las diferentes realidades de los ambientes de trabajo desde Norte Chico (“Barranca”) hasta Sur Chico (“Nazca”) que se encuentran las diferentes granjas y ambientes de trabajo lugares muy inhóspitos que para la crianza de aves son las adecuadas. Se enfoca en la última etapa de la crianza de las aves para la distribución de 2 maneras diferentes en la distribución de dichas aves para el consumo, la primera en SACD (“saca para los centros de distribución”) estas aves serán repartidas a los clientes mayoristas que serán repartidos a su vez a los mercados de las diferentes partes del Perú. La segunda es Beneficio (“aves que serán beneficiadas en las plantas”), en este proceso se van a repartir las diferentes partes de la aves (“pollo y pavo”) que serán empaquetadas para la venta con la marcas de la empresa. / Tesis

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario. / Los sistemas productivos de traspatio (SPT) que mantienen aves y cerdos se encuentran ampliamente distribuidos en países en vías de desarrollo. Estas unidades productivas constituyen en muchos casos una fuente de ingresos importante, única o complementaria para muchos productores. Los objetivos de este trabajo fueron caracterizar los sistemas productivos de traspatio, además de describir la distribución espacial y determinar la existencia de patrones asociación espacial de los SPT y las poblaciones de aves y cerdos identificadas en ellos. Los datos fueron extraídos del VII Censo Agropecuario y Forestal 2007 considerándose como SPT a todas aquellas explotaciones que cumplieron con los siguientes dos criterios: mantener entre 1 a 100 aves y 1 a 50 cerdos. Se identificaron un total de 68.148 SPT correspondiente al 22.6% de las explotaciones presente en el país según el VII Censo agropecuario y forestal. El análisis de los datos estableció un predominio de productores de sexo masculino (31.9%), con edades igual o mayor a 45 años (75.8%) y nivel de estudio básico (70.9%). Más del 95% de los SPT fueron clasificados como explotaciones agropecuarias con actividad, superficie de 0 a 20 ha (72.9%), baja asistencia técnica (24%) y bajo número de gallineros caseros. El estudio de las variables: SPT, población de aves de traspatio y población de cerdos de traspatio se realizó mediante mapas temáticos, la medición de autocorrelación espacial global fue realizada por medio del Índice de Moran y la autocorrelación espacial local por método LISA. La exploración visual de los mapas temáticos determinaron que la distribución de los SPT, población de aves y población de cerdos de traspatio se concentró principalmente en la zona sur del país, seguida de la zona centro, zona norte y austral. El estadístico de Moran estableció que si existió asociación espacial global y local de las variables estudiadas. / Backyard production systems (BPS) that keep birds and swine livestock are broadly distributed in developing countries. In many cases, these production units represent an important source of incomes, sometimes the only one, and often complementary to several farmers. The main objectives of this research were to characterize BPS, describe the spatial distribution and determine the existence of spatial distribution patterns of BPS and the population of birds and swine found in them. A total of 68,148 BPS were identified, corresponding to the 22.6% of birds of the whole country, according to the VII Agriculture, Livestock and Forestry Census (2007). Data analysis established a prevalence of male poultry-swine farmers (31.9%), with ages equal or below 45 years old (75.8%) with a basic educational level (70.9%). Over 95% of the BPS were classified as agriculture and livestock farming with activity, with a farm size of 0 to 20 ha (72.9%), low technical support (24%) and low number of homemade henhouses. The study of the variables BPS, backyard poultry and swine population, was carried out through thematic mapping; the measuring of the global spatial autocorrelation was determined through the use of Moran¹s Index, and the local autocorrelation through the LISA method. The visual exploration of the thematic maps determined that the distribution of the BPS, backyard birds and swine population were concentrated mainly in the southern zone of the country, then the central zone, the northern zone, and finally the Austral zone. Moran’s statistical analysis determined the existence of a global and local association of the studied variables. / Financiamiento: Proyecto Fondecyt 11121389.

Memoria para optar al Título Profesional de Médico Veterinario / Durante muchos años, los antimicrobianos han sido un componente crucial en la terapia de enfermedades infecciosas bacterianas tanto en medicina humana como veterinaria. Sin embargo, con el paso del tiempo se ha observado la aparición de mecanismos de resistencia, pudiendo llevar al surgimiento de cepas bacterianas multiresistentes, lo que ha provocado una creciente preocupación a nivel mundial y la adopción de medidas que permitan disminuir el alarmante aumento de la resistencia. El objetivo de este trabajo fue realizar una vigilancia de la resistencia bacteriana frente a los antimicrobianos de uso más frecuente en aves de consumo humano, utilizando para ello a Escherichia coli y Enterococcus spp. como bacterias indicadoras y definir los niveles de resistencia y los perfiles de multiresistencia de las cepas aisladas, además de buscar la posible aparición de cepas resistentes a vancomicina en cepas de Enterococcus, el cual es un antimicrobiano de uso exclusivo en medicina humana. Para la evaluación de los niveles de resistencia, se utilizó el Método de Dilución en Placa para definir la Concentración Mínima Inhibitoria (MIC) de cada cepa bacteriana aislada. Se recolectaron un total de 110 muestras de heces de pollos broiler, gallinas de postura y pavos de engorda provenientes de la zona central de Chile, de las cuales se aislaron e identificaron 98 cepas de E. coli y 96 de Enterococcus spp. Los mayores niveles de resistencia se observaron frente a oxitetraciclina, alcanzando alrededor del 80% en ambos grupos de bacterias indicadoras y frente a fluoroquinolonas (enrofloxacino y ciprofloxacino) con alrededor de 77% de cepas de Enterococcus spp. No se encontraron cepas de Enterococcus resistentes a vancomicina. Sobre el 75% de las cepas de E. coli y sobre el 85% de las de Enterococcus spp. presentaron resistencia a 2 o más antimicrobianos. En el caso de E. coli, el perfil más frecuente (10%) fue enrofloxacino / ciprofloxacino / oxitetraciclina / estreptomicina / flumequina / ácido oxolínico / ácido nalidíxico. Para Enterococcus spp. el perfil más frecuente (25%) fue enrofloxacino / ciprofloxacino / oxitetraciclina / eritromicina. De estos resultados se concluye que los sistemas de producción de aves de consumo presentan elevados niveles de resistencia y multiresistencia, por lo que nuestro país no 7 queda exento del problema de resistencia bacteriana que se presenta también a nivel internacional. Se hace necesaria entonces la instauración de programas permanentes de vigilancia nacional de la resistencia bacteriana que permitan conocer los niveles de resistencia, siendo recomendable que la venta de antimicrobianos se realice a través de receta médica veterinaria para disminuir el uso masivo de estos fármacos