Orientador: Claudio de Oliveira / Resumo: Trichomycteridae é uma das famílias mais diversa da superfamília Loricarioidea com aproximadamente 300 espécies válidas, incluídas em 41 gêneros e oito subfamílias, e amplamente distribuídas pelas drenagens da América do Sul e Central. Trichomycteridae é caracterizada morfologicamente pela presença de um sistema opercular altamente modificado, envolvendo os ossos operculares e pré-operculares, assim como pela variação no tamanho do corpo e padrões de coloração. Também apresentam uma ampla diversidade trófica incluindo espécies onívoras, insetívoras, lepidófagas e hematófagas. A monofilia da família e suas subfamílias são bem suportadas por caracteres morfológicos, exceto Trichomycterinae, a qual inclui Trichomycterus, um grupo não-monofilético, taxonomicamente complexo, com elevado número de espécies e desconhecida diversidade. Embora múltiplos estudos tenham focado nas relações supragenéricas com reduzida representatividade de espécies, ainda não existem estudos utilizando caracteres moleculares com ampla amostragem de Trichomycteridae. Neste contexto, o presente trabalho tem como objetivo principal estudar as relações filogenéticas de Trichomycteridae através da análise de sequências de DNA, usando duas aproximações: a análise multilocus, incluindo três genes mitocondriais e dois nucleares, e a implementação de análises filogenômicas usando 851 elementos ultraconservados do genoma (ultraconserved elements, UCEs). Com base na filogenia obtida, analisamos padrões de origem e ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Trichomycteridae is one of the most specious families in the superfamily Loricarioidea with approximately 300 valid species including 41 genera and eight subfamilies, widely distributed through the rivers in South and Central America. Trichomycteridae is characterized morphologically by the presence of a highly modified opercular system, involving the opercular and pre-opercular bones, as well as by variation in body size and coloration patterns. Trichomycterids also present a wide trophic diversity including omnivorous, insectivorous, lepidophagous and hematophagous species. The monophyly of the family and its subfamilies are well supported by morphological characters except Trichomycterinae, which includes Trichomycterus, a taxonomically complex non-monophyletic group with a high number of species and unknown diversity. Although, multiple studies have focused on suprageneric relationships with reduced species representativity, there are no studies using molecular characters with a large sample of Trichomycteridae. In this context, the main objective of this research is to study the phylogenetic relationships of Trichomycteridae through the analysis of DNA sequences using two approaches: multilocus analysis, including three mitochondrial and two nuclear genes, and the implementation of phylogenetic analyzes using 851 ultraconserved elements of the genome (ultraconserved elements, UCEs). Based on the phylogeny obtained, we analyzed patterns of origin and diversification, as w... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Submitted by LUZ ENEIDA OCHOA ORREGO null (luzeocho@gmail.com) on 2018-04-03T19:35:49Z No. of bitstreams: 1 Tesis_LuzOchoa_final.pdf: 49750474 bytes, checksum: 12fe06586f916de59876885a3701887f (MD5) / Approved for entry into archive by ROSANGELA APARECIDA LOBO null (rosangelalobo@btu.unesp.br) on 2018-04-03T19:54:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ochoaorrego_le_dr_bot.pdf: 49750474 bytes, checksum: 12fe06586f916de59876885a3701887f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-03T19:54:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ochoaorrego_le_dr_bot.pdf: 49750474 bytes, checksum: 12fe06586f916de59876885a3701887f (MD5) Previous issue date: 2018-03-02 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Trichomycteridae é uma das famílias mais diversa da superfamília Loricarioidea com aproximadamente 300 espécies válidas, incluídas em 41 gêneros e oito subfamílias, e amplamente distribuídas pelas drenagens da América do Sul e Central. Trichomycteridae é caracterizada morfologicamente pela presença de um sistema opercular altamente modificado, envolvendo os ossos operculares e pré-operculares, assim como pela variação no tamanho do corpo e padrões de coloração. Também apresentam uma ampla diversidade trófica incluindo espécies onívoras, insetívoras, lepidófagas e hematófagas. A monofilia da família e suas subfamílias são bem suportadas por caracteres morfológicos, exceto Trichomycterinae, a qual inclui Trichomycterus, um grupo não-monofilético, taxonomicamente complexo, com elevado número de espécies e desconhecida diversidade. Embora múltiplos estudos tenham focado nas relações supragenéricas com reduzida representatividade de espécies, ainda não existem estudos utilizando caracteres moleculares com ampla amostragem de Trichomycteridae. Neste contexto, o presente trabalho tem como objetivo principal estudar as relações filogenéticas de Trichomycteridae através da análise de sequências de DNA, usando duas aproximações: a análise multilocus, incluindo três genes mitocondriais e dois nucleares, e a implementação de análises filogenômicas usando 851 elementos ultraconservados do genoma (ultraconserved elements, UCEs). Com base na filogenia obtida, analisamos padrões de origem e diversificação, assim como sua correlação com a evolução do tamanho do corpo. Além disso, foram realizadas análises de biogeografia paramétrica para a reconstrução das áreas ancestrais. Os resultados obtidos pelas duas metodologias corroboram hipóteses morfológicas em relação à monofilia das subfamílias, exceto Glanapteryginae e Sarcoglanidinae, e revelam novas hipóteses de relacionamento dentro do clado Tridentinae-Stegophiliniae-Vandelliinae-Sarcoglanidinae-Glanapteryginae (TSVSG). As análises de divergência indicaram que a origem de Trichomyctreridae data do Cretaceo inferior com múltiplos eventos cladogenéticos ocorridos durante o final do Eoceno e inicio do Mioceno. A família apresenta uma alta heterogeneidade nas taxas de diversificação, com um shift evidente na origem da subfamília Trichomycterinae, o qual não está correlacionado com a evolução do tamanho do corpo. A reconstrução de áreas ancestrais indicou que o ancestral comum mais recente de Trichomycteridae esteve amplamente distribuído na região amazônica e drenagens costeiras do Atlântico Sul do Brasil. Diferentes processos geomorfológicos de dispersão e vicariância, principalmente associados com eventos de captura de cabeceira modelaram a distribuição atual dos membros de Trichomycteridae. / Trichomycteridae is one of the most specious families in the superfamily Loricarioidea with approximately 300 valid species including 41 genera and eight subfamilies, widely distributed through the rivers in South and Central America. Trichomycteridae is characterized morphologically by the presence of a highly modified opercular system, involving the opercular and pre-opercular bones, as well as by variation in body size and coloration patterns. Trichomycterids also present a wide trophic diversity including omnivorous, insectivorous, lepidophagous and hematophagous species. The monophyly of the family and its subfamilies are well supported by morphological characters except Trichomycterinae, which includes Trichomycterus, a taxonomically complex non-monophyletic group with a high number of species and unknown diversity. Although, multiple studies have focused on suprageneric relationships with reduced species representativity, there are no studies using molecular characters with a large sample of Trichomycteridae. In this context, the main objective of this research is to study the phylogenetic relationships of Trichomycteridae through the analysis of DNA sequences using two approaches: multilocus analysis, including three mitochondrial and two nuclear genes, and the implementation of phylogenetic analyzes using 851 ultraconserved elements of the genome (ultraconserved elements, UCEs). Based on the phylogeny obtained, we analyzed patterns of origin and diversification, as well as their correlation with the evolution of body size. In addition, analyzes of parametric biogeography were carried out for the reconstruction of the ancestral areas. The results obtained by the two methodologies corroborate morphological hypotheses supporting the monophyly of the subfamilies, except Glanapteryginae and Sarcoglanidinae, and reveal new hypotheses of relationship within the clade Tridentinae-Stegophiliniae-Vandelliinae-Sarcoglanidinae-Glanapteryginae (TSVSG). The analysis of divergence indicated that the origin of Trichomyctreridae dates from the lower Cretaceous with multiple cladogenetic events occurring during the late Eocene and early Miocene. The family shows a high heterogeneity in the rates of diversification, with an evident shift in the origin of the subfamily Trichomycterinae, which is not correlated with the evolution of body size. The reconstruction of ancestral areas indicated that the most recent common ancestor of Trichomycteridae was widely distributed in the Amazon region and coastal drains of the South Atlantic of Brazil. Different geomorphological processes of dispersal and vicariance mainly associated with river capture events modeled the current distribution of Trichomycteridae species / 2014/06853-8

Submitted by Dominick Jesus (dominickdejesus@hotmail.com) on 2016-01-28T19:03:31Z No. of bitstreams: 2 Tese_Frank Raynner Vasconcelos Ribeiro.pdf: 38284216 bytes, checksum: 180faa28dc3b2a015cca199ac9f1113a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-28T19:03:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_Frank Raynner Vasconcelos Ribeiro.pdf: 38284216 bytes, checksum: 180faa28dc3b2a015cca199ac9f1113a (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2011-08-18 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The catfish genus Ageneiosus is revised and a new hypothesis of phylogenetic relationships inter- and intra-generic is proposed. The taxonomic revision was based on the examination of available type specimens and analysis to the original descriptions. Taxonomic accuracy of the species was tested by morphometric, meristic and qualitative analyses of internal and external anatomy. Valid species were considered in the study of phylogenetic relationships. The phylogenetic analysis included 239 characters coded for 41 terminal taxa. Formerly with 12 species, the genus Ageneiosus comprises currently 19 species recognized herein as valid, some of which are widely distributed across large rivers in South America. Ageneiosus pardalis is the only trans-Andean species in the genus. Ageneiosus marmoratus is a junior synonym of Ageneiosus inermis. Ageneiosus dentatus and Ageneiosus rondoni are valid species and their names are removed from the synonymy of Ageneiosus ucayalensis and Ageneiosus brevis, respectively. Six new species are recognized. The parsimony analysis resulted in a single most parsimonious tree with 631 steps, consistency index 0.52 and retention index 0.85. The monophyly of Ageneiosus is corroborated and its diagnosis includes 10 synapomorphic characters unique between the Auchenipteridae. The genus is composed of two main clades: (1) clade comprising the majority of the species with large and not ossified swimbladder and (2) clade comprising Ageneiosus pardalis and the species with reduced and ossified swimbladder in large individuals. The ressurrection of Tympanopleura is proposed to accommodate the species of the first clade. According to the hypothesis presented here, the clade Ageneiosus-Tympanopleura is the sister-group of Tetranematichthys and the clade composed of these genera is the sister-group of (Entomocorus (Auchenipterus (Epapterus, Pseudepapterus))). A key for all nineteen valid species of Ageneiosus species is provided. / O gênero Ageneiosus é revisado e uma hipótese das relações filogenéticas inter- e intra-genérica é proposta. A revisão taxonômica contou com o exame do material tipo disponível e consulta às descrições originais. A validade das espécies foi testada por meio de comparações estatísticas das medidas e contagens e análises qualitativas dos caracteres de anatomia interna e externa. Espécies conclusivamente válidas foram consideradas no estudo de relações filogenéticas. A análise filogenética incluiu 239 caracteres codificados para 41 táxons terminais. Ageneiosus, até então reconhecido numa composição com 12 espécies, é composto por 19 espécies válidas, algumas das quais amplamente distribuídas por grandes rios da América do Sul. Ageneiosus pardalis é a única espécie trans-Andina no gênero. Ageneiosus marmoratus é um sinônimo júnior de Ageneiosus inermis. Ageneiosus dentatus e Ageneiosus rondoni são espécies válidas e seus nomes são retirados da sinonímia de Ageneiosus ucayalensis e Ageneiosus brevis, respectivamente. Seis espécies novas foram reconhecidas. A análise de parcimônia resultou em uma única árvore mais parcimoniosa com 631 passos, índice de consistência 0,52 e índice de retenção 0,85. A monofilia de Ageneiosus é corroborada e sua diagnose inclui 10 caracteres sinapomórficos exclusivos entre os Auchenipteridae. O gênero é composto por dois grandes clados: (1) composto pela maioria das espécies com bexiga natatória grande e não ossificada e (2) composto por Ageneiosus pardalis e pelas espécies com bexiga natatória reduzida e ossificada em indivíduos grandes. É proposta a revalidação do gênero Tympanopleura para o primeiro clado. O clado Ageneiosus- Tympanopleura é grupo-irmão de Tetranematichthys e o clado composto por esses gêneros é grupo-irmão de (Entomocorus, (Auchenipterus, (Epapterus, Pseudepapterus))). É apresentada uma chave para identificação de todas as dezenove espécies válidas de Ageneiosus.

Orientador: Reinaldo José da Silva / Resumo: Peixes da ordem Siluriformes, conhecidos como bagres ou catfishes, apresentam distribuição mundial com mais de 2.800 espécies reconhecidas. Aproximadamente 1.700 espécies são encontradas nas Américas, principalmente na região Neotropical. Apesar da alta diversidade dos siluriformes, bem como abundância e importância econômica, tanto como alimento e ornamental, o conhecimento sobre seus helmintos parasitos é fragmentado e escasso. Oito espécies de siluriformes (Pterodoras granulosus, Trachydoras paraguayensis, Pimelodella avanhandavae, Loricariichthys platymetopon, Pterygoplichthys ambrosettii, Rhinelepis aspera, Hemisorubim platyrhynchos e Sorubim lima) do rio Aguapeí, bacia do alto rio Paraná, município de Castilho, São Paulo, Brasil, foram investigados quanto a sua fauna de helmintos parasitos. Cinquenta e quatro taxa de helmintos parasitos foram encontrados: 25 monogenéticos, 15 digenéticos, 11 nematoides e três cestoides. Com base em novos dados moleculares (13 novas sequências de 28S rDNA de dactilogirídeos) e morfológicos, é proposta uma revisão da diagnose do gênero Demidospermus com descrição de uma espécie, também é proposto um novo gênero de dactilogirídeo com uma descrição de uma espécie, e discute-se sobre a questão do posicionamento de gênero de algumas outras espécies cujos dados moleculares estão disponíveis. O gênero Heteropriapulus é revisado, com descrição de cinco novas espécies de dactilogirídeos de loricarídeos, e ainda dados moleculares preliminares (seq... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Compostos butílicos de estanho (BTs) estão na lista dos contaminantes impactantes relacionados ao ambiente marinho. Sua ampla distribuição associada à elevada toxicidade faz com que o monitoramento desses compostos no ambiente costeiro seja de fundamental importância. A ocorrência de BTs foi verificada em sedimentos superficiais, material particulado em suspensão e nos tecidos (fígado e brânquias) de três espécies de bagres estuarinos: Cathorops spixii, Aspistor luniscutis e Genidens genidens; amostrados em 8 estuários da região sul e sudeste brasileira. As análises foram realizadas através de GC-PFPD, seguindo padrões de controle de qualidade analítico e onde foi constatada a ocorrência de efeito matriz sobre o sistema analítico a partir da quantificação das amostras de tecido. Dentre os estuários amostrados, verificou-se um maior impacto dos BTs sobre os sistemas estuarinos de Paranaguá e Itajaí, em decorrência da presença destes compostos em todos os compartimentos ambientais analisados. As três espécies investigadas puderam ser consideradas como biomonitoras da presença de BTs no ambiente, uma vez que são passíveis de assimilação destes compostos, mesmo em organismos amostrados em regiões distantes de potencias fontes de entrada. Os efeitos sobre a fisiologia de C. spixii amostrado em Paranaguá também foi investigada a partir do uso de biomarcadores no fígado desses organismos, constatando um impacto associado à presença destes contaminantes no sistema. / Butyltin compounds (BTs) are in the list of related contaminants striking marine environment. Their widespread distribution associated with high toxicity causes the monitoring of fundamental importance. The occurrence of BTs were checked through superficial sediments, suspended particulate matter and tissues (liver and gill) analysis on three estuarine catfishes: Cathorops spixii, Aspistor luniscutis e Genidens genidens; sampled in eight estuaries from Brazilian south and southeast coast. Analysis were carried by GC-PFPD, following quality control procedures, where was verified the presence of matrix effect over the system from tissues quantification. Among estuaries, the major impact was found in Paranaguá-PR and Itajaí-SC, due the presence of these compounds in all investigated compartments. These three catfish species have shown good biomonitors of BTs presence once were liable of uptake, even in groups sampled far from potential BTs sources. The effects over C. spixii physiology were also checked in Paranaguá from the use of biomarkers on liver of these organisms, noting the impact related with the presence of these compounds on the system.

Submitted by Mariana Ribeiro Thereza null (marianarthereza@gmail.com) on 2018-04-05T18:51:14Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Mariana final.pdf: 4940976 bytes, checksum: f4817dcbf57f64549bb4f78f0ab75cb5 (MD5) / Approved for entry into archive by Elza Mitiko Sato null (elzasato@ibilce.unesp.br) on 2018-04-05T19:09:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 thereza_mr_me_sjrp.pdf: 4954499 bytes, checksum: 330789302dc504e47f10756efd9c34e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-05T19:09:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 thereza_mr_me_sjrp.pdf: 4954499 bytes, checksum: 330789302dc504e47f10756efd9c34e7 (MD5) Previous issue date: 2018-03-09 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A bacia do rio Grande pertence a porção mais estudada com relação a ictiofauna da drenagem do rio Paraná, a bacia do Alto rio Paraná. Entretanto, isso não significa que a bacia foi amostrada e inventariada em sua totalidade. Além disso, nenhuma das pesquisas apresenta ferramentas adequadas para a identificação das espécies. Os Siluriformes, uma das seis ordens que compõem a ictiofauna da bacia do rio Grande, apresentam grande representatividade dentro da bacia, com cerca de 30% (podendo chegar a 35%) das espécies de peixes. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi a elaboração de um guia de identificação composto por chave de identificação, diagnoses e registro fotográficos das espécies de Siluriformes da bacia do rio Grande. Foram listadas 86 espécies válidas, um novo gênero e duas novas espécies para a bacia. As espécies pertencem à onze famílias, sendo Loricariidae a mais diversa, com 41% da riqueza de espécies. O material revisado de Siluriformes da bacia do rio Grande da coleção do Departamento de Zoologia de Botânica da UNESP de São José do Rio Preto foi amostrado principalmente nas drenagens do estado de São Paulo e em menor proporção nas drenagens de Minas Gerais. A curva de acumulação de espécies apresentou crescimento exponencial, indicando que apesar de extensivamente estudada, é possível que a bacia do rio Grande ainda apresente novas espécies a serem encontradas e descritas pela ciência. / The Grande River basin belongs to Alto Paraná River, which is the most studied portion of Paraná River basin regarding the icthyofauna. However, this does not indicates that the basin was fully sampled or inventoried. In addition, the researchers do not contain tools to identify the species. The Siluriformes, one of the six orders that is found in the Grande River basin, shows great representativeness with more than 30% (it may reach 35%) of the total of fish species. Our aim was to elaborate an identification guide composed by one identification key, diagnosis and photographic records of each Siluriformes species from the Grande River basin. We found 86 valid species, one new genera and two new species. The species belong to 11 families, whereas Loricariidae was the most diverse one with 41% of the total species richness. The revised material of Siluriformes from the Grande River basin of the fish collection of the Department of Zoology and Botany was mainly from the São Paulo State drainage and few records from Minas Gerais State drainages. The accumulation curve showed an exponential pattern, indicating that despite extensively studied, it is possible that Grande River basin still has new species to be found and described by science.

Tese (doutorado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2015. / Submitted by Fernanda Percia França (fernandafranca@bce.unb.br) on 2016-01-29T12:40:12Z No. of bitstreams: 1 2015_LucianaCristineVasquesVillela.pdf: 3463694 bytes, checksum: bb96f6b7920ac6f1631387c97ca1bd5e (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-02-01T20:45:55Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_LucianaCristineVasquesVillela.pdf: 3463694 bytes, checksum: bb96f6b7920ac6f1631387c97ca1bd5e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-01T20:45:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_LucianaCristineVasquesVillela.pdf: 3463694 bytes, checksum: bb96f6b7920ac6f1631387c97ca1bd5e (MD5) / A cachara do pantanal (Pseudoplatystoma reticulatum) é uma espécie de bagre neotropical nativa do Brasil historicamente importante para a pesca comercial e esportiva. A produção dos bagres e de seus híbridos em cativeiro apresentou uma taxa de crescimento de mais de 100% entre 2010 e 2011, chegando a 17.619 toneladas. A geração de híbridos com o pintado (P. corruscans) vem sendo amplamente utilizada pelo setor produtivo para obter peixes superiores para o cultivo, que apresentam vigor híbrido, além das características superiores de cada uma das espécies puras. Contudo, essa prática apresenta uma ameaça para o desenvolvimento sustentável da piscicultura dos surubins, já que os híbridos gerados são férteis e podem retrocruzar com populações selvagens e estoques puros de reprodutores mantidos em cativeiro. Ferramentas de vanguarda são necessárias para alavancar o desenvolvimento de tecnologias avançadas para a criação da cachara em cativeiro, como a detecção de introgressões interespecíficas, e métodos aprimorados de reprodução e de monitoramento e melhoramento genético de estoques de reprodutores. Inicialmente, um ensaio de minisequenciamento (SNaPshot©) foi desenvolvido e validado com base em marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) espécie-específicos disponíveis na literatura, derivados de dois genes mitocondrais (16S e COI) e quatro genes nucleares (RAG2, GLOB, 18S e EF1α). Adicionalmente, análises do transcriptoma de sete tecidos (músculo branco, músculo vermelho, hipófise, gônada, rim, fígado e brânquia) de cacharas e híbridos de cachara/pintado foram realizadas para caracterizar o transcriptoma da espécie e prospectar SNPs espécie-específicos. RNA extraído de cada um dos tecidos de 17 cacharas e nove híbridos foi combinado em quantidades equimolares e utilizado para gerar 16 bibliotecas de cDNA: uma biblioteca para cada tecido de cada espécie (n=14) e uma biblioteca contendo todos os tecidos para cada espécie (n=2); as quais foram sequenciadas com tecnologia Illumina com protocolos de sequenciamento de 100 e 300 pb de comprimento. Um total de 997.043.038 fragmentos sequenciados foram processados com os programas Trinity e BWA para montagem do transcriptoma das duas espécies (cachara e híbridos de pintado) e identificação de SNPs, respectivamente. A análise do transcriptoma da cachara revelou um total de 93.674 transcritos únicos, além de 37.917 transcritos tecido-específicos e 7.456 transcritos presentes em todos os tecidos analisados. Um total de 647.954 SNPs foram identificados nas sequências analisadas, sendo que 64 SNPs espécie-especificos foram identificados, satisfazendo critérios de espaçamento e posição nos transcritos analisados, os quais serão adequados para identificar introgressões da ordem de 1,65% entre genomas da cachara e do pintado. Adicionalmente, uma montagem do DNA mitocondrial da cachara foi produzida com base nas sequências de cDNA analisadas e sequências da região controle D-loop geradas com sequenciamento Sanger. O mitogenoma completo da cachara apresentou 16.576 pb de comprimento, e a mesma estrutura básica, ordem e organização gênica observada nos mitogenomas de outras espécies de vertebrados. As informações e conhecimentos gerados neste estudo serão disponibilizadas publicamente, e poderão ser empregadas no desenvolvimento de novos estudos em áreas como filogeografia, sistemática filogenética, genética de populações, conservação e melhoramento da cachara e de outros bagres tropicais. / Pantanal (Brazilian wetlands) cachara (Pseudoplatystoma reticulatum) is a Brazilian native neotropical catfish historically important for commercial and sport fisheries. Catfish and hybrids aquaculture production showed a growth rate over 100% between 2010 and 2011, reaching 17,619 tonnes. The hybrids generation with pintado (P. corruscans) has been widely used by growers to obtain superior fishes, with hybrid vigor, in addition to pure species superior characteristics. However, this practice is a menace to sustainable catfish aquaculture development hence the hybrids are fertile and can backcross with wild populations and pure broodstocks maintained in captivity. The use of cutting-edge tools is necessary to boost the advanced technologies development for cachara farming, like interspecific introgression detection, and improved bloodstock’s reproduction, monitoring and breeding methods. Initially a minisequencing assay (SNaPshot©) was developed and validated based on specie-specific SNP (Single Nucleotide Polymorphism) tracers available at literature, derived from two mitochondrial genes (16S and COI) and four nuclear genes (RAG2, GLOB, 18 S and EF1α). Additionally, transcriptome analysis of seven tissues (white muscle, red muscle, hypophysis, gonad, kidney, liver and gill) of cachara and hybrids of cachara/pintado were carried to characterize the transcriptome of the species and search for specie-specific SNPs. The RNA extracted from each tissue of 17 cachara and nine hybrids were combined in equimolar quantities and used to generate 16 cDNA libraries: one library, for each tissue of each specie (n=14) and a library containing all tissues of each specie (n=2), which were sequenced with Illumina technology with sequencing protocols of 100 and 300 pb in length. A total of 997,043,038 sequenced fragments were processed with Trinity and BWA programs to transcriptome assembly of two species (cachara and pintado hybrids) and SNPs identification, respectively. The transcriptome analysis of cachara revealed a total of 93,674 unique transcripts, in addition to 37,917 tissue-specific transcripts and 7,456 transcripts present in all analyzed tissues. A total of 647,954 SNPs were identified in the analyzed sequences, amongst them 64 specie-specific SNPs, satisfying spacing and position criteria in the studied transcripts which were suitable for introgression identification in the order of 1.65% between cachara and pintado genome. Besides, a mitochondrial DNA assembly were produced based on the analyzed cDNA and D-loop control region sequences using Sanger sequencing. The cachara complete metagenome showed 16,576 bp in length, and the same basic structure, order and gene organization observed in the metagenomes of other vertebrate species. The novel information and knowledge generated by this study will be public available and can be used in the development of new researches in filo geography, filogenetic systematics, population genetics, cachara and other tropical catfish conservation and breeding.

Compostos butílicos de estanho (BTs) estão na lista dos contaminantes impactantes relacionados ao ambiente marinho. Sua ampla distribuição associada à elevada toxicidade faz com que o monitoramento desses compostos no ambiente costeiro seja de fundamental importância. A ocorrência de BTs foi verificada em sedimentos superficiais, material particulado em suspensão e nos tecidos (fígado e brânquias) de três espécies de bagres estuarinos: Cathorops spixii, Aspistor luniscutis e Genidens genidens; amostrados em 8 estuários da região sul e sudeste brasileira. As análises foram realizadas através de GC-PFPD, seguindo padrões de controle de qualidade analítico e onde foi constatada a ocorrência de efeito matriz sobre o sistema analítico a partir da quantificação das amostras de tecido. Dentre os estuários amostrados, verificou-se um maior impacto dos BTs sobre os sistemas estuarinos de Paranaguá e Itajaí, em decorrência da presença destes compostos em todos os compartimentos ambientais analisados. As três espécies investigadas puderam ser consideradas como biomonitoras da presença de BTs no ambiente, uma vez que são passíveis de assimilação destes compostos, mesmo em organismos amostrados em regiões distantes de potencias fontes de entrada. Os efeitos sobre a fisiologia de C. spixii amostrado em Paranaguá também foi investigada a partir do uso de biomarcadores no fígado desses organismos, constatando um impacto associado à presença destes contaminantes no sistema. / Butyltin compounds (BTs) are in the list of related contaminants striking marine environment. Their widespread distribution associated with high toxicity causes the monitoring of fundamental importance. The occurrence of BTs were checked through superficial sediments, suspended particulate matter and tissues (liver and gill) analysis on three estuarine catfishes: Cathorops spixii, Aspistor luniscutis e Genidens genidens; sampled in eight estuaries from Brazilian south and southeast coast. Analysis were carried by GC-PFPD, following quality control procedures, where was verified the presence of matrix effect over the system from tissues quantification. Among estuaries, the major impact was found in Paranaguá-PR and Itajaí-SC, due the presence of these compounds in all investigated compartments. These three catfish species have shown good biomonitors of BTs presence once were liable of uptake, even in groups sampled far from potential BTs sources. The effects over C. spixii physiology were also checked in Paranaguá from the use of biomarkers on liver of these organisms, noting the impact related with the presence of these compounds on the system.

As populações de Heptapterus mustelinus do rio Uruguai, sistema da Laguna dos Patos e os rios dos sistemas costeiros do sul do Brasil e Uruguai foram revisados com dados morfológicos e moleculares. Duas novas espécies de Heptapterus foram reconhecidas. Heptapterus sp.n.A com distribuição restrita para o rio Pelotas na bacia do alto rio Uruguai. Heptapterus sp.n.B endêmica de tributários do rio Ibicuí na bacia do baixo rio Uruguai. As novas espécies distinguem-se do seu congênere mais próximo H. mustelinus pelo menor número de vértebras. Dados morfométricos e moleculares são congruentes no reconhecimento das duas espécies novas. / The populations of Heptapterus mustelinus from the Uruguay River, laguna dos Patos system and the coastal streams of southern Brazil were reviewed with morphological and molecular data. Two new species of Heptapterus were recognized. Heptapterus sp.n.A with a restricted distribution to rio Pelotas, in the upper Uruguay River basin. Heptapterus sp.n.B endemic to tributaries of rio Ibicuí, in the lower Uruguay River basin. The new species are distinguished from its closest congener H. mustelinus by the lower number of vertebrae. Morphometric and molecular data are congruent to recognize the two new species.

As populações de Heptapterus mustelinus do rio Uruguai, sistema da Laguna dos Patos e os rios dos sistemas costeiros do sul do Brasil e Uruguai foram revisados com dados morfológicos e moleculares. Duas novas espécies de Heptapterus foram reconhecidas. Heptapterus sp.n.A com distribuição restrita para o rio Pelotas na bacia do alto rio Uruguai. Heptapterus sp.n.B endêmica de tributários do rio Ibicuí na bacia do baixo rio Uruguai. As novas espécies distinguem-se do seu congênere mais próximo H. mustelinus pelo menor número de vértebras. Dados morfométricos e moleculares são congruentes no reconhecimento das duas espécies novas. / The populations of Heptapterus mustelinus from the Uruguay River, laguna dos Patos system and the coastal streams of southern Brazil were reviewed with morphological and molecular data. Two new species of Heptapterus were recognized. Heptapterus sp.n.A with a restricted distribution to rio Pelotas, in the upper Uruguay River basin. Heptapterus sp.n.B endemic to tributaries of rio Ibicuí, in the lower Uruguay River basin. The new species are distinguished from its closest congener H. mustelinus by the lower number of vertebrae. Morphometric and molecular data are congruent to recognize the two new species.