As populações de Heptapterus mustelinus do rio Uruguai, sistema da Laguna dos Patos e os rios dos sistemas costeiros do sul do Brasil e Uruguai foram revisados com dados morfológicos e moleculares. Duas novas espécies de Heptapterus foram reconhecidas. Heptapterus sp.n.A com distribuição restrita para o rio Pelotas na bacia do alto rio Uruguai. Heptapterus sp.n.B endêmica de tributários do rio Ibicuí na bacia do baixo rio Uruguai. As novas espécies distinguem-se do seu congênere mais próximo H. mustelinus pelo menor número de vértebras. Dados morfométricos e moleculares são congruentes no reconhecimento das duas espécies novas. / The populations of Heptapterus mustelinus from the Uruguay River, laguna dos Patos system and the coastal streams of southern Brazil were reviewed with morphological and molecular data. Two new species of Heptapterus were recognized. Heptapterus sp.n.A with a restricted distribution to rio Pelotas, in the upper Uruguay River basin. Heptapterus sp.n.B endemic to tributaries of rio Ibicuí, in the lower Uruguay River basin. The new species are distinguished from its closest congener H. mustelinus by the lower number of vertebrae. Morphometric and molecular data are congruent to recognize the two new species.

Submitted by Fabiana Gomes (fabianaaj63@gmail.com) on 2017-11-29T15:12:16Z No. of bitstreams: 1 TESE VERSÃO FINAL - ANTÔNIO FÁBIO LOPES DE SOUZA.pdf: 4840798 bytes, checksum: 911405a6c1cab987316e14d89a646e4f (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-29T15:51:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE VERSÃO FINAL - ANTÔNIO FÁBIO LOPES DE SOUZA.pdf: 4840798 bytes, checksum: 911405a6c1cab987316e14d89a646e4f (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-11-29T15:53:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TESE VERSÃO FINAL - ANTÔNIO FÁBIO LOPES DE SOUZA.pdf: 4840798 bytes, checksum: 911405a6c1cab987316e14d89a646e4f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-29T15:53:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TESE VERSÃO FINAL - ANTÔNIO FÁBIO LOPES DE SOUZA.pdf: 4840798 bytes, checksum: 911405a6c1cab987316e14d89a646e4f (MD5) Previous issue date: 2016-07-15 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As an excellent quality food, fish presents in its corporeal constitution a series of nutrients essential to the development and maintenance of the human organism physiology. Therefore, the present work evaluated the meat and residual yield, physicochemical composition and fatty acid composition in muscle tissue and viscera of fourteen species of siluriform fish in different seasonal cycles of the Amazon Basin. It should be noted that species belonging to this order have low acceptance for consumption in Amazonas State, with most of their production destined for export. The fish were collected in two seasonal periods (flood and dry) of the Amazonian rivers, at the landing ports of the municipalities of Manaus and Careiro da Várzea. The species dourada (Brachyplatystoma rousseauxii), filhote (Brachyplatystoma filamentosum), piracatinga (Calophysus macropterus), jandiá (Leiarius marmoratus), piramutaba (Brachyplatystoma vaillantii), jaú (Zungaro zungaro), pirarara (Phractocephalus hemioliopterus), piranambú (Pinirampus pirinampus), surubim (Pseudoplatystoma fasciatum), caparari (Pseudoplastystoma tigrinum), mapará (Hypophthalmus edentatus), babão (Brachyplatystoma platynema), zebra (Brachyplatystoma juruense), mandubé (Ageneiosus inermis) were processed to determinate yield and centesimal composition in Laboratório de Tecnologia do Pescado da UFAM. The determination of the fatty acids was performed with falc chromatography in UEM-PR’s Chemistry Laboratory. The samples weighed on average 1820 ± 45g (flood) and 1067 ± 39g (dry season). The preferential cuts for clean body, fillet with skin and skinless fillet presented percentages of yield that oscillated between 49.49 ± 2.78% and 76.72 ± 1.43%; 47.87 ± 2.38% and 81.75 ± 1.41%; 22.83 ± 2.31% and 62.03 ± 3.70% (for flood season) and 21.95 ± 1.52% and 49.41 ± 2.51%; 19.48 ± 1.98% and 55.55 ± 2.88% and 24.66 ± 1.59% and 41.55 ± 2.56% (for dry season), respectively. Centesimal composition of meat for all species studied presented percentages ranging from 56.39 ± 0.11% to 80.30 ± 0.19% for humidity; from 0.86 ± 0.01% to 1.21 ± 0.01% for ash; from 0.70 ± 0.10% to 26.29 ± 0.14% for total lipids; from 16.85 ± 0.40% to 20.34 ± 0.15% for protein; and from 0.04 ± 0.02% to 2.73 ± 0.59%, for nifext in the flood season. For the same period viscera presented (55.29 ± 0.53% to 82.47 ± 0.93%); (0.78 ± 0.03% to 1.47 ± 0.13%); (3.11 ± 0.16% to 26.23 ± 1.49%); (10.23 ± 0.62% to 23.56 ± 0.23%); (0.054 ± 0.034% to 27.731 ± 01.69%), respectively. During the dry season percentages ranged from (66.91 ± 0.21% to 81.63 ± 0.56%) for humidity; from 0.70 ± 0.01% to 1.14 ± 0.03%, for ash; from 0.98 ± 0.04% to 14.45 ± 0.39%, for lipids; from 13.24 ± 0.48% to 18.10% ± 0.36%, for protein and from 0.04 ± 0.03% to 2.28 ± 0.22%, for Nifext. In viscera (64.65 ± 0.42 to 82.33 ± 0.36%); (0.90 ± 0.05% to 1.84 ± 0.05%); (3.52 ± 0.11% to 20.91 ± 0.28%); (9.06 ± 4.17% to 20.55 ± 0.96%); (0.08 ± 0.05% to 4.68 ± 0.64%). The most abundant saturated fatty acids in fillets and viscera throughout the study period were 16: 0 (palmitic), 18: 0 (stearic) and 14: 0 (myristic). The monounsaturated were 18: 1n-9 (Oleic), 18: 1n-7 (vacnic) and 16: 1n-7 (palmitoleic). 18: 2n-6 (linoleic), 20: 4n-6 (arachidonic) and 22: 6n-3 (docosahexaenoic) polyunsaturated fatty acids were also abundant throughout the study period. The yield analysis showed good results on catfish species for the preferential cuts for consumption and potential of by - products to be submitted to technological processes of exploitation. The physico-chemical characterization of the muscle and viscera was consistent with studies already carried out for Amazonian fish evidencing this group of fish as excellent sources of nutrients. The percentages of quantified saturated, monounsaturated and polyunsaturated fatty acids were also in line with studies already carried out with freshwater fish. The essential polyunsaturated of omega 3 and 6 families were characterized as significant in muscle tissue of all species when they showed an n-6 / n-3 ratio of up to 1/3. Due to the significant results in its nutritional aspects it is suggested this group of fish for consumption by regional population as important sources of nutrients essential to human physiology. / Como alimento de excelente qualidade, o peixe apresenta em sua constituição corpórea uma série de nutrientes essenciais ao desenvolvimento e a manutenção da fisiologia do organismo humano. Em vista disso, o presente trabalho avaliou o rendimento cárneo e residual, a composição físico-química e a composição em ácidos graxos no tecido muscular e das vísceras de quatorze espécies de peixes siluriformes em diferentes ciclos sazonais da Bacia Amazônica. Deve-se ressaltar que as espécies pertencentes a esta ordem tem baixa aceitação para consumo no Estado do Amazonas, sendo a maior parte de sua produção destinada a exportação. Os peixes foram coletados em dois períodos sazonais (cheia e seca) dos rios amazônicos, nos portos de desembarque dos municípios de Manaus e do Careiro da Várzea. As espécies dourada (Brachyplatystoma rousseauxii), filhote (Brachyplatystoma filamentosum), piracatinga (Calophysus macropterus), jandiá (Leiarius marmoratus), piramutaba (Brachyplatystoma vaillantii), jaú (Zungaro zungaro), pirarara (Phractocephalus hemioliopterus), piranambú (Pinirampus pirinampus), surubim (Pseudoplatystoma fasciatum), caparari (Pseudoplastystoma tigrinum), mapará (Hypophthalmus edentatus), babão (Brachyplatystoma platynema), zebra (Brachyplatystoma juruense), mandubé (Ageneiosus inermis) foram processadas para cálculo de rendimento e determinação da composição centesimal no laboratório de tecnologia do pescado da UFAM. A determinação dos ácidos graxos foi realizada por cromatografia em falc no laboratório de química da UEM-PR. Os exemplares avaliados no período de cheia pesaram em média 1820±45g e na seca 1067±39g. Os cortes preferenciais para comercialização corpo limpo, filé com pele e filé sem pele apresentaram percentuais de rendimento que oscilaram na cheia entre 49,49±2,78% a 76,72±1,43%; 47,87±2,38% a 81,75±1,41%; 22,83±2,31% a 62,03±3,70% e na seca 21,95±1,52% a 49,41±2,51%; 19,48±1,98% a 55,55 ±2,88% e 24,66±1,59% a 41,55±2,56%, respectivamente. A composição centesimal do músculo para as quatorze espécies estudadas apresentou no período de cheia percentuais de umidade (56,39±0,11% a 80,30±0,19%); cinza (0,86±0,01% a 1,21±0,01%); lipídios totais (0,70±0,10% a 26,29±0,14%); proteína (16,85±0,40% a 20,34±0,15%); e nifext (0,04±0,02% a 2,73±0,59%). Para o mesmo período as vísceras apresentaram (55,29±0,53% a 82,47±0,93%); (0,78±0,03% a 1,47±0,13%); (3,11±0,16% a 26,23±1,49%); (10,23±0,62% a 23,56±0,23%); (0,054±0,034% a 27,731±01,69%). No período da seca os percentuais de umidade oscilaram entre (66,91±0,21% a 81,63±0,56%); cinza (0,70±0,01% a 1,14±0,03%); lipídios (0,98±0,04% a 14,451±0,39%); proteína (13,24±0,48% a 18,10%±0,36%); nifext (0,04±0,03% a 2,28±0,22%). Nas vísceras (64,65±0,42 a 82,33±0,36%); (0,90±0,05% a 1,84±0,05%); (3,52±0,11% a 20,91±0,28%); (9,06±4,17% a 20,55±0,96%); (0,08±0,05% a 4,68±0,64%). Os ácidos graxos saturados mais abundantes nos filés e nas vísceras em todo período de estudos foram o 16:0 (palmítico), o 18:0 (esteárico) e o 14:0 (mirístico). Os monoinsaturados foram 18:1n-9 (Oléico), o 18:1n-7 (vacênico) e o 16:1n-7 (palmitoléico). Os ácidos graxos poli-insaturados 18:2n-6 (linoleico), o 20:4n-6 (aracdônico) e o 22:6n-3 (docosahexaenóico) também foram abundantes em todo período de estudo. As análises de rendimento evidenciaram nas espécies de bagres bons resultados para os cortes preferenciais de consumo e potenciais de subprodutos a serem submetidos a processos tecnológicos de aproveitamento. A caracterização físico-química do músculo e das vísceras mostrou consonância com estudos já realizados para pescado amazônico evidenciando o grupo de peixes como excelentes fontes de nutrientes. Os percentuais de ácidos graxos saturados, monoinsaturados e poli-insaturados quantificados ficaram em consonância a estudos já realizados com peixes de água doce. Os poliinsaturados essenciais das famílias ômega 3 e 6 foram caracterizados como significativos no tecido muscular de todas as espécies quando evidenciaram uma relação de n-6/n-3 de até 1/3. Pelos significativos resultados em seus aspectos nutricionais sugere-se este grupo de peixes para consumo da população regional como importantes fontes de nutrientes essenciais a fisiologia humana.

Made available in DSpace on 2015-04-11T13:54:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 andre.pdf: 5607128 bytes, checksum: 17175736a2095384fe44e019d20dccf7 (MD5) Previous issue date: 2012-10-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The emergence of interdisciplinary themes has opened new possibilities for scientific approach to reality. In the Amazon, where the relations between society and nature are evident, interdisciplinarity is essential in order to grasp complex issues. The Environmental Science, which brings in its essence the interdisciplinary approach, is in process of construction in terms of theoretical and methodological procedures favoring innovative research. The issue of networks, Catfishes and its relationship with the cities is a matter interdisciplinary environmental science can give an alternative approach. In this sense the present study proposes an investigation summarized in the following question: How can environmental science contribute to the analysis of the problems of fisheries and conservation of stocks of catfish in the Amazon? A hypothesis is formulated: the integration of the studies of networks, market structure, cities and catfishes will develop elements that integrate conservation with responsible use (socially just and ecologically friendly) of fishery resources. To collect the data, we conducted field work between May 17 and July 15, 2011 in eleven cities in the Upper and Middle Solimões River in Amazonas state, Brazil, visiting a total of 47 floating strutures that commercialize and stock catfishes which corresponds to 92.16% of the total. Semi-structured interviews about infrastructure, labor relations, among other flows was realized. The main results were 1) the market network of Catfish has intrinsic relationship to urban network; 2) necessary to describe in detail the important level of network flows and consider its particularities, and 3 ) along these there are political, social and cultural links that establish an intricate network essencial for the understanding and conservation of Catfishes. The network comprises a reality whose complexity is reflected in the difficulty of translating it scientifically. The proposition of theoretical and methodological instruments (open interdisciplinary approach, juxtaposing objects and conceptual fragmentation of the object) consisted in an attempt to elucidate the object and decifring the results. This research is an interdisciplinary dialogue and represents an alternative integrated vision by which it has drawn the research on Catfishes and cities. / A emergência da questão interdisciplinar tem aberto novas possibilidades de abordagem científica da realidade. Na Amazônia, onde as relações entre sociedade e natureza são evidentes, esse contexto é propício para novas problematizações para questões de difícil apreensão. A Ciência Ambiental, que traz em sua essência a proposta interdisciplinar, encontra-se em processo de construção em termos teórico-metodológicos de forma favorável a pesquisas inovadoras. A questão da rede de comercialização de Bagres e sua relação com as cidades representa uma questão interdisciplinar ambiental que pode levantar elementos importantes para a questão ambiental na Amazônia com outro olhar. Nesse sentido o presente estudo se propõe a uma investigação que se sintetiza na seguinte pergunta: De que forma a ciência ambiental pode contribuir para a análise da problemática da pesca e da conservação dos estoques de bagres na Amazônia? Como hipótese tem-se que o estudo da rede de comercialização da pesca permitirá elaborar elementos que integrem conservação com uso responsável (socialmente justo e ecologicamente correto) dos recursos pesqueiros. Para a coleta dos dados, foi realizado um trabalho de campo entre os dias 17 de maio e 15 de julho em onze cidades do Alto e Médio Solimões visitando um total de 47 frigoríficos flutuantes o que corresponde a 92,16% para entrevistas semiestruturadas sobre a infraestrutura, relações de trabalho, fluxos entre outras. Os principais resultados deram conta de 1) ratificar que a rede de comercialização de Bagres tem relação intrínseca com a rere urbana da calha do Rio Solimões; 2) descrever em importante nível de detalhamento os fixos e os fluxos da rede considerando suas particularidades; e 3) apresentando os aspectos políticos, sociais e culturais que constituem a rede buscando a forma como isso ocorre. A rede compõe uma realidade cuja complexidade se traduz na dificuldade de traduzi-la deforma científica. A proposição de instrumentais teórico-metodológico (abordagem interdisciplinar aberta, justaposição de objetos e fragmentação conceitual do objeto) consistiu numa tentativa de elucidar o objeto e fora decisivos nos resultados obtidos. Essa pesquisa constitui um diálogo interdisciplinar e representa uma alternativa integrada na visão pelo qual se tem desenhado as pesquisas em Bagres e cidades.

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:57:47Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1346_1.pdf: 716357 bytes, checksum: 8ccb32c29d93af52d41dc29acb282980 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2008 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo desse estudo foi descrever a variação sazonal das espécies de bagres (biomassa e densidade) no estuário do Rio Goiana (NE/Brasil) em relação as variáveis espaço e tempo. Neste estudo, entre dezembro de 2005 e novembro de 2006, foram realizadas 216 amostragens no canal principal do Rio Goiana, totalizando uma área arrastada de 23 ha. Durante este período foram capturados no total 60518 peixes, pesando aproximadamente 600kg. As espécies pertencentes à Família Ariidae foram as mais abundante em número, 1600 ind.ha-1 (53%) e em peso, 18813 g.ha-1 (63%). A espécie Cathorops spixii foi a mais abundante em número, 1340 ind.ha-1 (44%) e em peso, 14203 g.ha-1 (48%). As variáveis, número de espécies de Ariídeos, densidade (média total) e biomassa (média total) apresentaram diferença significativa entre os fatores áreas do estuário e estação do ano. Além disso, houve interação entre esses dois fatores para as variáveis, densidade total, biomassa total e número de espécies, indicando que as áreas do estuário e as estações do ano influenciam na distribuição de Cathorops spixii, Cathorops agassizi e Sciades herzbergii no estuário do Rio Goiana. As maiores densidades ocorreram na porção intermediária do estuário durante o início da estação chuvosa (7394 ind.ha-1), enquanto que os maiores valores de biomassa ocorreram na porção superior do estuário durante o início da estação chuvosa (70292 g.ha-1). O maior número de espécies de Ariídeos foi encontrado na porção inferior do estuário durante o final da estação chuvosa (Cathorops spixii, Cathorops agassizi, Sciades herzbergii, Sciades proops, Aspistor parkeri e Aspistor luniscustis). Além disso, a densidade de Cathorops spixii apresentou diferença significativa entre as estações do ano e entre as áreas desse estuário, enquanto que a densidade de Cathorops agassizi apresentou diferenças significativas apenas para o fator estações do ano. A variável biomassa apresentou diferenças significativas para as espécies Cathorops spixii, Cathorops agassizi e Sciades herzbergii entre as estações do ano, e de Cathorops spixii e Cathorops agassizi entre as áreas do estuário. Além disso, a densidade e biomassa de Cathorops spixii e Cathorops agassizi apresentaram interação entre os fatores área e estação do ano. A biomassa de Sciades herzbergii apresentou interação apenas para o fator estação do ano. Isso indica que para essas espécies (densidade e biomassa) a variação sazonal influenciou sua distribuição nas diferentes áreas do estuário do Rio Goiana. Este ecossistema apresentou grande importância para a reprodução e recrutamento para as espécies de Ariídeos, que precisam das condições estuarinas para completar todo o seu ciclo de vida

A família de Siluriformes Neotropicais Cetopsidae possui cinco gêneros e 43 espécies válidas, com ampla distribuição nas regiões norte e central da América do Sul, tanto cis- como trans-andina. Cetopsidae é proposta como um grupo monofilético, suportado pela maioria dos estudos morfológicos e moleculares. Os estudos evolutivos sobre o sistema nervoso de bagres neotropicais são bastante escassos, apesar desse complexo apresentarimportantes modificações potencialmente informativas para estudos de inferência filogenética. Para testar a significância dos caracteres neuroanatômicos em filogenias, a morfologia externa das principais subdivisões encefálicas de Cetopsidae foi descrita, ilustrada e interpretada. Além disso, análises comparativas do desenvolvimento desse complexo foram realizadas em Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides com o intuito de estabelecer homologias e compreender suas modificações ontogenéticas. Os caracteres foram delimitados e testados separadamente em análises filogenéticas e posteriormente combinados com caracteres morfológicos e moleculares com diferentes métodos de análise. Para determinar o volume de cada região analisada, um modelo elipsoide foi utilizado. Amplas comparações baseadas no formato, posição relativa e volume das principais regiões encefálicas são apresentadas para a maioria das espécies representativas de todos os gêneros de Cetopsidae. As mesmas comparações também foram realizadas ao longo do desenvolvimento de Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides. Além disso, comparações com integrantes de outras famílias filogeneticamente relacionadas em Siluriformes forneceram um amplo contexto para um maior entendimento das principais modificações evolutivas que moldaram o encéfalo doscetopsídeos. Análises filogenéticas de todos os caracteres morfológicos foram primeiramente conduzidas em separado, e posteriormente em matrizes concatenadas sob o critério da Parcimônia. Análises Bayesianas com sequências alinhadas e concatenadas de três genes mitocondriais (COI, 16S e Cytb) foram implementadas. Por fim, análises filogenéticas com todos os dados combinados foram conduzidas sob os critérios da Parcimônia e Bayesiano. Padrões morfológicos distintos foram definidos para cada uma das duas principais subdivisões de Cetopsidae, as subfamílias Helogeninae e Cetopsinae. Poucas variações intraespecíficas na morfologia externa do encéfalo xii existem entre todas as espécies examinadas aqui. As modificações observadas ao longo do desenvolvimento do encéfalo de Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides foram utilizadas para a formulação correta de caracteres e seus estados. Todos os gêneros foram recuperados como grupos monofiléticos pelos caracteres neuroanatômicos.Mapeamentos filogenéticos revelaram alguns padrões morfológicos sugestivos com especializações alimentares e outras características de história de vida correlacionadas ao sistema nervoso central. Os caracteres morfológicos e moleculares se mostraram bastante congruentes nas hipóteses filogenéticas, comas incongruências restritas à tribo Cetopsini. Todas as análises recuperaram Helogeninae como grupo-irmão dos demais cetopsídeos, seguido por Cetopsidiini, Denticetopsini e Cetopsini como grupos-irmãos sucessivos.Os resultados obtidos no presente estudo suportam a ideia de que análises amplas e concatenadas de dados morfológicos e moleculares resultam em hipóteses de relacionamentos robustas e bem suportadas. Os caracteres neuroanatômicos são altamente informativos para inferências filogenéticas, que podem ser exploradospara uma maior compreensão da evolução de Otophysi. / The Neotropical South American catfish Cetopsidae is a family of Siluriformes that includes five genera and 43valid species distributed over a large portion of northern and central regions of South America, on both sides of the Andean cordilleras. The monophyly of the family is supported by several previous studies, based on both morphological and molecular characters. Despite the scarcity of evolutionary studies on the nervous system of neotropical catfishes, that complex shows great variation potentially informative for phylogenetic inference. In order to test the significance of neurological traits in a phylogenetic framework, the gross morphology of brain subdivisions in the catfish family Cetopsidae is described, illustrated and interpreted. In addition, comparative analyzes of the development of this complex were carried out in Helogenes marmoratus and Cetopsis gobioidesin order to establish homologies and ontogenetic transformations. Characters were delimited and tested separately in phylogenetic analyzes and later combined with other morphological and molecular characters with different methods of analysis. The volume of major brain subdivision was calculated by an ellipsoid model. A comprehensive comparison based on shape, relative position, and volume of the main brain subdivisions is presented for representative species of all genera and most available species in the family. The same comparisons were also made throughout the development of Helogenes marmoratus and Cetopsis gobioides. Comparisons with other phylogenetically related siluriform families provide a broader context for the understanding of the main evolutionary transformations which shaped the cetopsid brain. Phylogenetic analyzes of all morphological characters were first conducted separately, and later in matrices concatenated under the Parsimony criterion. Bayesian analyzes of three aligned and concatenated mitochondrial gene sequences (COI, 16S and Cytb) were implemented. Analyzes of all the data combined were conducted under both Parsimony and Bayesian criteria. Profoundly distinct morphological patterns are identified for each of the two main cetopsid subdivisions, subfamilies Helogeninae and Cetopsinae. Little intraspecific variation on major subdivisions of the brain exists in species examined herein. The modifications observed throughout the development of the brain inHelogenes marmoratus and Cetopsis gobioides were used for the correct delimitation xiv of characters and their states. The monophyly of all genera is supported by putative neuroanatomic characters. Phylogenetic mapping reveals recurrent morphological patterns suggestive of an association with specific feeding specializations and other life-history traits. Morphological and molecular characters were highly congruent in phylogenetic hypotheses, with inconsistencies restricted to the tribe Cetopsini. All analyzes recovered Helogeninae as thesister group toall remaining cetopsids, followed by Cetopsidiini, Denticetopsini and Cetopsini as successive sister groups. Results of the present study support the idea that large and concatenated analyzes of morphological and molecular characters result in robust well-supported hypotheses of relationships. Neuroanatomical characters are highly informative for phylogenetic inferenceand area promising field to be explored in understanding the evolution of Otophysi.

The diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes 1832 in the Rio Doce basin is investigated using conventional and modern morphology and DNA analyses. The work is presented in two Chapters. Chapter One, entitled Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy integratively analyzes specimens of the genus from the entire Rio Doce drainage and adjacent basins, both from available world-wide collections and from active sampling efforts. A combination of phenotypic and DNA (COI barcoding analysis) provides evidence for the existence of 14 species in the basin, 10 of which are new: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. . In addition, a lectotype is designated for T. immaculatus and the species is considered as a senior synonym of Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. Although remarkable, such increase in species number of Trichomycterus in a single drainage matches similar recent increments in some other Southeastern Brazilian basins, such as the Paraíba do Sul and Iguaçu. The kind of differentiation among species herein recognized varies, with some of them being well-differentiated in morphology but not in barcoding data, and others showing the opposite phenomenon. The geographical distribution of each of the 14 species is plotted in the Rio Doce basin. The wide geographical distribution of some species (T. alternatus and T. immaculatus) is explained against data from geomorphological processes and comparative information on their biology. Chapter two, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) focuses on the complex taxonomy, nomenclature and type material status of T. alternatus and T. zonatus. The type series of the two species are analyzed in detail, both in morphology and locality data. Osteological information was obtained with conventional and a new technique of radiographic stereo-triplets. Our new data elucidates their species distinctiveness, diagnostic characteristics, type localities and show that T. zonatus does not occur in the Rio Doce basin. / A diversidade do gênero Trichomycterus Valenciennes 1832 na bacia do Rio Doce é investigada utilizando métodos convencionais e modernos em análises morfológicas e moleculares. Os resultados desta dissertação são apresentados em dois capítulos. Capítulo um, intitulado Diversity of the genus Trichomycterus Valenciennes, 1832 (Siluriforms, Trichomycteridae) in the Rio Doce basin: a systematic study integrating phenotypes, DNA and classical taxonomy examinou espécimes pertencentes a este gênero encontrados no Rio Doce e em bacias adjacentes disponíveis em coleções nacionais e internacionais e coletados durante esta dissertação. O conjunto de dados obtidos através de análises morfológicas e moleculares (COI, DNA barcoding) revelou a existência de 14 espécies na bacia do Rio Doce, das quais 10 novas: T. alternatus Eigenmann, 1917; T. argos Lezama et al., 2012; T. astromycterus sp. nov.; T. barrocus sp. nov.; T. brucutu sp. nov.; T. brunoi Barbosa & Costa, 2010; T. immaculatus (Eigenmann & Eigenmann, 1889)] T. illuvies sp. nov.; T. melanopygius sp. nov.; T. ipatinguensis sp. nov.; T. pussilipygius sp. nov.; T. sordislutum sp. nov.; T. vinnulus sp. nov; and T. tantalus sp. nov. Além disso, é designado um lectótipo para T. immaculatus, espécie aqui proposta como sinônimo sênior de Trichomycterus pradensis Sarmento-Soares et al., 2005. O acentuado incremento em número de espécies de Trichomycterus para uma única bacia segue um padrão de crescimento em biodiversidade conhecida do gênero para outras drenagens do sudeste brasileiro a exemplo do rio Paraíba do Sul e Iguaçu. Os tipos de diferenciação detectada entre as espécies aqui tratadas variam, com algumas bem corroboradas morfologicamente, porém muito similares ou indiferenciáveis em análise de DNA barcoding, e outras apresentando o fenômeno oposto. As distribuições geográficas de cada uma das 14 espécies são mapeadas com base em todo o material examinado. A ampla distribuição geográfica de algumas espécies (T. alternatus and T. immaculatus) é explicada através de processos geomorfológicos e informações comparativas sobre suas biologias. O capítulo dois, The type specimens of Trichomycterus alternatus (Eigenmann, 1917) and T. zonatus (Eigenmann, 1918), with elements for future revisionary work (Teleostei, Siluriformes, Trichomycteridae) se concentra em esclarecer a complexa taxonomia, nomenclatura e o status do material tipo de T. alternatus e T. zonatus. As séries tipos das duas espécies foram minuciosamente analisadas tanto para morfologia como para suas respectivas localidades de proveniência. Informações osteológicas foram obtidas através de técnicas de radiografia convencionais e uma nova metodologia chamada stereo triplets. Os dados obtidos corroboram as respectivas espécies como distintas, e permitem uma avaliação precisa de seus respectivos caracteres diagnósticos e localidades tipo. Também se chegou à conclusão que T. zonatus não ocorre na bacia do Rio Doce.

A família de Siluriformes Neotropicais Cetopsidae possui cinco gêneros e 43 espécies válidas, com ampla distribuição nas regiões norte e central da América do Sul, tanto cis- como trans-andina. Cetopsidae é proposta como um grupo monofilético, suportado pela maioria dos estudos morfológicos e moleculares. Os estudos evolutivos sobre o sistema nervoso de bagres neotropicais são bastante escassos, apesar desse complexo apresentarimportantes modificações potencialmente informativas para estudos de inferência filogenética. Para testar a significância dos caracteres neuroanatômicos em filogenias, a morfologia externa das principais subdivisões encefálicas de Cetopsidae foi descrita, ilustrada e interpretada. Além disso, análises comparativas do desenvolvimento desse complexo foram realizadas em Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides com o intuito de estabelecer homologias e compreender suas modificações ontogenéticas. Os caracteres foram delimitados e testados separadamente em análises filogenéticas e posteriormente combinados com caracteres morfológicos e moleculares com diferentes métodos de análise. Para determinar o volume de cada região analisada, um modelo elipsoide foi utilizado. Amplas comparações baseadas no formato, posição relativa e volume das principais regiões encefálicas são apresentadas para a maioria das espécies representativas de todos os gêneros de Cetopsidae. As mesmas comparações também foram realizadas ao longo do desenvolvimento de Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides. Além disso, comparações com integrantes de outras famílias filogeneticamente relacionadas em Siluriformes forneceram um amplo contexto para um maior entendimento das principais modificações evolutivas que moldaram o encéfalo doscetopsídeos. Análises filogenéticas de todos os caracteres morfológicos foram primeiramente conduzidas em separado, e posteriormente em matrizes concatenadas sob o critério da Parcimônia. Análises Bayesianas com sequências alinhadas e concatenadas de três genes mitocondriais (COI, 16S e Cytb) foram implementadas. Por fim, análises filogenéticas com todos os dados combinados foram conduzidas sob os critérios da Parcimônia e Bayesiano. Padrões morfológicos distintos foram definidos para cada uma das duas principais subdivisões de Cetopsidae, as subfamílias Helogeninae e Cetopsinae. Poucas variações intraespecíficas na morfologia externa do encéfalo xii existem entre todas as espécies examinadas aqui. As modificações observadas ao longo do desenvolvimento do encéfalo de Helogenes marmoratus e Cetopsis gobioides foram utilizadas para a formulação correta de caracteres e seus estados. Todos os gêneros foram recuperados como grupos monofiléticos pelos caracteres neuroanatômicos.Mapeamentos filogenéticos revelaram alguns padrões morfológicos sugestivos com especializações alimentares e outras características de história de vida correlacionadas ao sistema nervoso central. Os caracteres morfológicos e moleculares se mostraram bastante congruentes nas hipóteses filogenéticas, comas incongruências restritas à tribo Cetopsini. Todas as análises recuperaram Helogeninae como grupo-irmão dos demais cetopsídeos, seguido por Cetopsidiini, Denticetopsini e Cetopsini como grupos-irmãos sucessivos.Os resultados obtidos no presente estudo suportam a ideia de que análises amplas e concatenadas de dados morfológicos e moleculares resultam em hipóteses de relacionamentos robustas e bem suportadas. Os caracteres neuroanatômicos são altamente informativos para inferências filogenéticas, que podem ser exploradospara uma maior compreensão da evolução de Otophysi. / The Neotropical South American catfish Cetopsidae is a family of Siluriformes that includes five genera and 43valid species distributed over a large portion of northern and central regions of South America, on both sides of the Andean cordilleras. The monophyly of the family is supported by several previous studies, based on both morphological and molecular characters. Despite the scarcity of evolutionary studies on the nervous system of neotropical catfishes, that complex shows great variation potentially informative for phylogenetic inference. In order to test the significance of neurological traits in a phylogenetic framework, the gross morphology of brain subdivisions in the catfish family Cetopsidae is described, illustrated and interpreted. In addition, comparative analyzes of the development of this complex were carried out in Helogenes marmoratus and Cetopsis gobioidesin order to establish homologies and ontogenetic transformations. Characters were delimited and tested separately in phylogenetic analyzes and later combined with other morphological and molecular characters with different methods of analysis. The volume of major brain subdivision was calculated by an ellipsoid model. A comprehensive comparison based on shape, relative position, and volume of the main brain subdivisions is presented for representative species of all genera and most available species in the family. The same comparisons were also made throughout the development of Helogenes marmoratus and Cetopsis gobioides. Comparisons with other phylogenetically related siluriform families provide a broader context for the understanding of the main evolutionary transformations which shaped the cetopsid brain. Phylogenetic analyzes of all morphological characters were first conducted separately, and later in matrices concatenated under the Parsimony criterion. Bayesian analyzes of three aligned and concatenated mitochondrial gene sequences (COI, 16S and Cytb) were implemented. Analyzes of all the data combined were conducted under both Parsimony and Bayesian criteria. Profoundly distinct morphological patterns are identified for each of the two main cetopsid subdivisions, subfamilies Helogeninae and Cetopsinae. Little intraspecific variation on major subdivisions of the brain exists in species examined herein. The modifications observed throughout the development of the brain inHelogenes marmoratus and Cetopsis gobioides were used for the correct delimitation xiv of characters and their states. The monophyly of all genera is supported by putative neuroanatomic characters. Phylogenetic mapping reveals recurrent morphological patterns suggestive of an association with specific feeding specializations and other life-history traits. Morphological and molecular characters were highly congruent in phylogenetic hypotheses, with inconsistencies restricted to the tribe Cetopsini. All analyzes recovered Helogeninae as thesister group toall remaining cetopsids, followed by Cetopsidiini, Denticetopsini and Cetopsini as successive sister groups. Results of the present study support the idea that large and concatenated analyzes of morphological and molecular characters result in robust well-supported hypotheses of relationships. Neuroanatomical characters are highly informative for phylogenetic inferenceand area promising field to be explored in understanding the evolution of Otophysi.

Orientador: Daniel Marcos Bonotto / Banca: Ivo Karmann / Banca: Francisco Yukio Hiodo / Banca: Carlos Renato Corso / Banca: Jairo Jiménez Rueda / Resumo: A produção de couro, principal matéria-prima para a confecção de calçados, traz grandes benefícios econômicos para a região de Franca (SP), que é um importante pólo industrial da cadeia produtiva de couro e considerada também como a "capital do calçado", contribuindo em grande parte para a comercialização e exportações de couros. A ânsia pela conquista de mercados e pelo lucro rápido tem provocado interesse governamental, especialmente devido às indústrias coureiras que utilizam como base o cromo no processamento do couro, gerando grandes quantidades de resíduos que, muitas vezes, são dispostos de forma inadequada, contribuindo para a deterioração rápida dos recursos hídricos e bióticos do meio ambiente. Neste sentido, o Ribeirão dos Bagres, na região de Franca, Estado de São Paulo, apresenta problemas de contaminação das águas e sedimentos por cromo e, possivelmente, outros metais pesados gerados pelas indústrias de couro localizadas dentro da cidade. O presente estudo objetivou avaliar a cronologia a partir da taxa de sedimentação no Ribeirão dos Bagres, usando o método do 210Pb, de maneira a acompanhar... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The production of leather, the main raw material for making shoes, bring major economic benefits to the region of Franca (SP), which is an important industrial hub in the chain production of leather and also considered as the "shoe capital", contributing largely to the marketing exports of leather. The lust for conquest of markets and quick profit has caused government interest, especially due to leather industries that use chromium as a base in leather processing, generating large amounts of waste that are often disposed of inappropriately contributing to the rapid deterioration of water resources and biotic environment. In this sense, Ribeirão dos Bagres, in the region of Franca, São Paulo, presents problems of contamination of waters and sediments by Chrome and possibly other heavy metals that are generated by the leather industries located within the city. The objective of the present study was to evaluate the chronology from the sedimentation rate in Ribeirão dos Bagres, using the 210Pb method in order to track historical... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:18Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-05-24Bitstream added on 2014-06-13T19:02:51Z : No. of bitstreams: 1 matamet_frm_dr_rcla_prot.pdf: 2790302 bytes, checksum: 583c84b5a28ee9716101bcaeb1d20ac6 (MD5) / A produção de couro, principal matéria-prima para a confecção de calçados, traz grandes benefícios econômicos para a região de Franca (SP), que é um importante pólo industrial da cadeia produtiva de couro e considerada também como a capital do calçado, contribuindo em grande parte para a comercialização e exportações de couros. A ânsia pela conquista de mercados e pelo lucro rápido tem provocado interesse governamental, especialmente devido às indústrias coureiras que utilizam como base o cromo no processamento do couro, gerando grandes quantidades de resíduos que, muitas vezes, são dispostos de forma inadequada, contribuindo para a deterioração rápida dos recursos hídricos e bióticos do meio ambiente. Neste sentido, o Ribeirão dos Bagres, na região de Franca, Estado de São Paulo, apresenta problemas de contaminação das águas e sedimentos por cromo e, possivelmente, outros metais pesados gerados pelas indústrias de couro localizadas dentro da cidade. O presente estudo objetivou avaliar a cronologia a partir da taxa de sedimentação no Ribeirão dos Bagres, usando o método do 210Pb, de maneira a acompanhar... / The production of leather, the main raw material for making shoes, bring major economic benefits to the region of Franca (SP), which is an important industrial hub in the chain production of leather and also considered as the shoe capital, contributing largely to the marketing exports of leather. The lust for conquest of markets and quick profit has caused government interest, especially due to leather industries that use chromium as a base in leather processing, generating large amounts of waste that are often disposed of inappropriately contributing to the rapid deterioration of water resources and biotic environment. In this sense, Ribeirão dos Bagres, in the region of Franca, São Paulo, presents problems of contamination of waters and sediments by Chrome and possibly other heavy metals that are generated by the leather industries located within the city. The objective of the present study was to evaluate the chronology from the sedimentation rate in Ribeirão dos Bagres, using the 210Pb method in order to track historical... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3030.pdf: 2014938 bytes, checksum: b6d8f7597811d1909e335b6facc588b7 (MD5) Previous issue date: 2010-03-26 / Universidade Federal de Minas Gerais / The catfishes of the Pseudoplatystoma genus are carnivore pimelodids, migratory and important for fisheries in all major river basins from South America. Only three species were recognized for the genus (P. corruscans, P. fasciatum and P. tigrinum), but a new revision raised to eight the number of species (P. fasciatum, P. punctifer, P. orinocoense, P. magdaleniatum, P. reticulatum, P. tigrinum, P. metaense and P. corruscans). Recently, Pseudoplatystoma was the subject of a molecular phylogeny study based on mitochondrial markers, where monophyletic clades where found for P. tigrinum, P. corruscans, P. reticulatum+P. punctifer+P. fasciatum and P. magdaleniatum. Despite these advances on the knowledge of the evolutionary history and systematics of the group, there are still questions to be answered. Thus, this study aimed a molecular phylogenetic analysis on Pseudoplatystoma to try to answer pendant questions about the systematics and taxonomy of the group, and propose a scenario for its diversification history in the geographic area of South America. In order to do this, we employed the mitochondrial Cytochrome b gene and introns from Rag1 and S7 genes, whose phylogenies were estimated by Maximum Likelihood using TREEFINDER software. Nodes were dated on BEAST software. It was shown that some Pseudoplatystoma species, resulting from the last revision of the genus, do not correspond to monophyletic groups or they were not significantly supported clades in all trees. The only monophyletic species in all markers were P. magdaleniatum and P. corruscans. Pseudoplatystoma orinocoense was a monophyletic lineage only on Cytochrome b. In light of these results, it is suggested that the old terminology P. fasciatum to be revalidated for the taxa here defined as P. fasciatum clade: P. punctifer (Amazon, Maranhão, Tocantins-Araguaia), P. reticulatum (Paraná-Paraguay) and P. fasciatum (Guyanas). Under the same rationale, P. tigrinum should be revalidated for Orinoco, given the paraphyletism of P. metaense. However, some cases of nonmonophyletic species in one or more markers may be due to incomplete lineage sorting, although this possibility needs to be investigated using other markers. The history of diversification of Pseudoplatystoma was the result of millions of years of evolution and and it was strongly influenced by the evolution of the South America geographical matrix. The biogeographic study allowed us to identify and date the important diversification events for the genus and relate them to the historical geomorphological and/or climate changes reported for South America, which would be the primary diversification causes for other freshwater fishes from the continent. / Os bagres do gênero Pseudoplatystoma são pimelodídeos carnívoros, migradores e de importância pesqueira em todas as grandes bacias hidrográficas da América do Sul. Apenas três espécies eram reconhecidas para o gênero (P. corruscans, P. fasciatum e P. tigrinum), mas uma nova revisão elevou para oito o número de espécies (P. fasciatum, P. punctifer, P. orinocoense, P. magdaleniatum, P. reticulatum, P. tigrinum, P. metaense e P. corruscans). Recentemente, Pseudoplatystoma foi alvo de um de estudo de filogenia molecular com marcadores mitocondriais, onde foram encontrados clados monofiléticos para P. tigrinum, P. corruscans, P. reticulatum+P. punctifer+P. fasciatum e P. magdaleniatum. Apesar desses avanços no conhecimento da história evolutiva e da sistemática do grupo, ainda restam questões a serem respondidas. Dessa forma, o presente estudo objetivou uma análise filogenética molecular em Pseudoplatystoma para tentar responder questões pendentes sobre a sistemática e taxonomia do grupo, bem como propor um cenário para sua história de diversificação no espaço geográfico da América do Sul. Para isso, foram empregados o gene mitocondrial do Citocromo b e íntrons dos genes Rag1 e S7, cujas filogenias foram estimadas por Máxima Verossimilhança no programa TREEFINDER. Os nós das filogenias foram datados no programa BEAST. Foi demonstrado que algumas espécies de Pseudoplatystoma, resultantes da última revisão do gênero, não correspondem a grupos monofiléticos ou não tiveram clados significativamente sustentados em todas as árvores. As únicas espécies monofiléticas em todos os marcadores foram P. magdaleniatum e P. corruscans. Pseudoplatystoma orinocoense só foi uma linhagem monofilética no Citocromo b. À luz desses resultados, sugere-se que a antiga terminologia P. fasciatum seja revalidada para os táxons do clado aqui definido como clado P. fasciatum: P. punctifer (Amazonas, Maranhão, Tocantins-Araguaia), P. reticulatum (Paraná-Paraguai) e P. fasciatum (Guianas). Sob a mesma racionalidade, P. tigrinum deveria ser revalidado para o Orinoco, dado o parafiletismo de P. metaense. Entretanto, alguns dos casos de espécies não-monofiléticas em um ou mais marcadores podem ser devidos à separação incompleta de linhagens, embora essa possibilidade necessite ser investigada com o uso de outros marcadores. A história da diversificação de Pseudoplatystoma foi resultado de milhões de anos de evolução e fortemente influenciada pela evolução da matriz geográfica Sul-Americana. O estudo biogeográfico nos permitiu identificar e datar os eventos de diversificação importantes para o gênero e relacioná-los às mudanças geomorfológicas e/ou climáticas históricas conhecidas para a América dos Sul, que seriam as causas primárias de diversificação de outros peixes de água doce do continente.