Orientadores: Gonçalo Amarante Guimarães Pereira, Lyndel W. Meinhardt / Dissertção (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T19:36:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cotomacci_Carolina_M.pdf: 1686245 bytes, checksum: 0c1ced68745955b067ac66ec4f710046 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A doença vassoura-de-bruxa em Theobroma cacao (cacaueiro), causada pelo fungo Crinipellis perniciosa, é uma das doenças de maior impacto econômico nos países produtores de cacau, sendo o Brasil um destes países. Esse fungo infecta os tecidos meristemáticos do cacaueiro em duas fases: parasítica e saprofítica. Pesquisas com outros fitopatógenos têm demonstrado que a mudança da fase parasítica para a saprofítica é regulada por genes do sistema mating type tornando este estudo extremamente importante para inferir estratégias de combate à doença. O presente trabalho teve por finalidade identificar os genes mating type de C. perniciosa através da análise dos dados gerados pelo seu projeto genoma. Para a identificação dos genes do sistema mating type (Hd1, Hd2, Rc e Fe) foram feitas buscas no banco de dados do genoma de C. perniciosa comparando seqüências similares àquelas codificadas pelos fungos basidiomicetos Coprinus cinereus, Coprinus bilanatus, Schizophyllum commune e Ustilago maydis, identificadas e disponibilizadas em rede. Foram identificados seis genes do sistema mating type de C. perniciosa. Um gene que codifica a proteína regulatória Hd1, um gene que codifica a proteína regulatória Hd2 e quatro genes que codificam as proteínas receptoras de ferormônio Rc1, Rc2, Rc3 e Rc4. Não foram identificados genes que codificam ferormônios. Portanto, concluímos que a organização molecular do sistema mating type de C. perniciosa é tetrapolar, contendo o locus HD bialélico e o locus FRF multialélico / Abstract: The witch's broom disease in Theobroma cacao, caused by mushroom Crinipellis perniciosa, is one of the diseases with the biggest economic impact in cocoa producing countries, and Brazil is one of them. The mushroom infects the meristematics tissues of the cocoa tree in two phases: parasitic and saprofitic. Research with other phytopathogens have demonstrated that the change from the parasitic to the saprophytic phase is regulated by genes of the mating type system, making this study extremely important to infer fighting strategies to this disease. This work's proposal is to identify mating type genes of C. perniciosa through the analysis of data generated by its genome project. The genes identification of the (Hd1, Hd2, Rc and Fe) mating type system was made by database search in the C. perniciosa genome comparing similar sequences with the ones codified by the basidiomycetes mushrooms Coprinus cinereus, Coprinus bilanatus, Schizophyllum commune and Ustilago maydis, identified and available in the internet. Six genes were identified in C. perniciosa mating type system. One gene that codifies the regulatory protein Hd1, another that codifies the regulatory protein Hd2 and four genes that codify the pheromone receptor proteins Rc1, Rc2, Rc3 and Rc4. Genes that codify pheromones were not identified. Therefore, we concluded that the molecular organization of C. perniciosa mating type system is tetrapolar, containing the bialelic HD locus and the multialelic FRF locus / Mestrado / Bioquimica / Mestre em Biologia Funcional e Molecular

Orientador: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Banca: Everlon Cid Rigobelo / Banca: Viviane Formice Vianna / Resumo: A soja destaca-se como a oleaginosa de maior importância no mundo, tendo em vista sua relevância nutricional e econômica. Devido ao aumento da área cultivada e, consequentemente da produtividade, o Brasil atualmente, é considerado o maior exportador de soja. No entanto, observa-se que a base genética da soja é restrita, devido à indisponibilidade de alelos capazes de enfrentar estresses bióticos e abióticos de forma totalmente eficiente. Desta forma, os programas de melhoramento visam aumentar a variabilidade genética para o desenvolvimento de cultivares mais produtivas e adaptadas. Estudos a respeito de novas fontes de germoplasma, como as Plant Introductions - PIs, tornam-se necessários para a identificação de características agronômicas de interesse para os melhoristas. Sendo assim, o presente trabalho possui como objetivo geral a avaliação do desempenho agronômico e a divergência genética de 93 acessos de soja, pertencentes a um painel de diversidade visando a obtenção de dados que possam ser utilizados no incremento de programas de melhoramento de soja brasileiros / Abstract: Soybean stands out as the most important oilseed in the world, given its nutritional and economic importance. Due to increased acreage and hence productivity, today, Brazil is the largest exporter of soybeans. However, it is observed that the genetic basis of soybean is restricted due to the unavailability of alleles able to cope with biotic and abiotic stresses fully efficiently. Thus, breeding programs aimed at increasing the genetic variability for the development of more productive and adapted cultivars. Studies regarding new sources of germplasm, such as Plant Introductions - PIs, become necessary for the identification of agronomic traits of interest to breeders. Therefore, the present work has as main objective the evaluation of agronomic performance and the genetic diversity of 93 accesses of soybean, belonging to a panel of diversity in order to obtain data that can be used in the growth of Brazilian soybean breeding programs / Mestre

Orientador: Luciana Rossini Pinto / Coorientador: Marcos Guimarães de Andrade Landell / Banca: Ana Lilia Alzate Marin / Banca: Dilermando Perecin / Resumo: A cana-de-açúcar figura mundialmente como uma importante cultura econômica, com grande participação no suprimento da demanda global por energia e açúcar. Bancos ativos de germoplasma são repositórios in vivo de variabilidade genética para os programas de melhoramento, estando diretamente relacionados ao sucesso do programa. Para uma gestão adequada e eficiente do banco é necessário conhecer a magnitude e distribuição da variabilidade genética dentro e entre os grupos de acessos das respectivas espécies que o compõe bem como identificar os acessos duplicados ou erroneamente identificados. Marcadores moleculares microssatélites são adequados para tal finalidade. O presente trabalho teve como objetivo principal avaliar a estrutura genética de um grupo de 593 genótipos, constituído por germoplasma básico e melhorado, disponíveis no banco de germoplasma do Programa Cana - IAC. Além disso, a magnitude da diferenciação genética entre as principais cultivares brasileiras e o germoplasma básico de cana-de-açúcar também foi investigada. Para tanto, 12 pares de primers SSR de alto poder discriminatório foram utilizados. A análise da estrutura genética separou os genótipos em dois grupos principais, um constituído por germoplasma básico e o outro por genótipos melhorados. A partição da variabilidade genética mostrou que 14,44% (P<0,001) da variabilidade total detectada pelos marcadores encontra-se entre estes dois grupos. Resultados semelhantes foram observados entre as principais cultiv... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sugarcane is a crop with worldwide economic importance due to its large participation in supplying the global demand for energy and sugar. Active germplasm banks are in vivo repositories of genetic variability for breeding programs, being directly related to their success. For its adequate management, a constant routine of surveillance and control over the accessions is required. Microsatellite (SSRs) molecular markers are suitable for this purpose. The present work aims to evaluate the genetic structure of a group of 593 individuals, composed by basic germplasm accessions and breeding genotypes, available within the germplasm bank of the Campinas Agronomic Institute (IAC) Sugarcane Genetic Breeding Program, based on these markers, with a focus on the comparison between the genetic diversity of Brazilian clones and cultivars (IAC, CTC, SP and RB) with accessions of diverse species, genera and exotic hybrids. In addition, the magnitude of the genetic differentiation between the main Brazilian cultivars and the basic sugarcane germplasm was also investigated. For this purpose, 12 pairs of SSR primers with high discriminatory power were used. The genetic variability present in the group is structured in a way where breeding materials differ from wild accessions, constituting two groups of individuals. Genetic variability among them is 14.44%, while 85.56% is present within them (P<0.001). Similar results were observed between the main Brazilian cultivars and the basic germplasm,... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T14:11:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278939.pdf: 5854561 bytes, checksum: 155cace8ba488d9bd568d8dbb4469431 (MD5) / Foram realizadas 1368 polinizações envolvendo 39 combinações híbridas. A espécie genitora foi Arachis gregoryi, acesso V 14957, que foi cruzada com diferentes espécies do genoma A, B, D, com espécies com 2n=2x=18, 2n=2x=40 e com a Secção Erectoides. Para todos os genitores e para os híbridos que produziram flores foi estimada a porcentagem de viabilidade do pólen. O conjunto de dados obtidos permite inferir que existe cruzabilidade entre A. gregoryi e várias espécies da secção Arachis associadas, em maior ou menor grau ao genoma B de A. hypogaea. Isto mostra o potencial para a inclusão em trabalhos de pré-melhoramento destinados à formação de linhagens a incorporar ao melhoramento genético do amendoim. Houve a formação de híbridos com espécies associadas ao genoma A de A. hypogaea, o que permite a produção de anfidiplóides sintéticos. Com A. hypogaea houve a formação de híbridos triplóides e, assim como com A. monticola, em alguns casos ocorreu aborto do embrião nos estágios iniciais de desenvolvimento. Devido do pouco desenvolvimento das plantas ainda não foi possível confirmar a hibridação com a espécie de 2n=2x=18. Foi estimada a diversidade alélica por marcadores moleculares microssatélites, com o objetivo de conhecer as relações de afinidade de 96 acessos pertencentes a 35 diferentes espécies. Houve a formação de nove grupos principais, ficando evidente a coesão dos acessos de A. gregoryi, e sua estreita associação com A. ipaënsis e A. valida, e, em menor grau, com A. magna, cujos acessos mostraram-se heterogêneos. O conjunto de espécies diplóides com 2n=20 e sem o par de cromossomos A, A. williamsii, A. batizocoi, A. krapovickasii, A. glandulifera, A. cruziana, A. benensis e A. vallsii situaram-se mais distantes do conjunto de acessos de A. gregoryi. Na hibridização in situ por fluorescência (FISH) foram analisados 12 acessos brasileiros de cinco espécies. Os acessos de A. gregoryi mostraram maior similaridade do que a espécie simpátrica A. magna que se mostrou mais heterogênea e, também a sua proximidade com A. ipaënsis, A. valida e A. williamsii. / In germplasm collections undertaken in Southern Brazil, accessions of Paspalum have been characterized and compared, according to distinct groups, that suggest the occurrence of distinct hybridizations in the origin of materials with distinct ploidy levels. Morphological features were surveyed for pentaploids supposed originated from interspecific natural crosses, which locate the accessions V14285, V14289 e V14860 closer to the Paspalum dilatatum #Torres# biotype (V14401) or to P. urvillei (V14392), with some features presenting intermediate values, such as the number of shoots, and the height of the first visible node. Unstained and dimorphic pollen grains were observed in all pentaploids of this group. As concerns pentaploid accessions supposedly originated from intraspecific natural hybridizations, intermediate values were found for morphological features. Concerning cytogenetic aspects, unbalanced cell division, dimorphic pollen, and low pollen viability estimates were observed in pentaploids. A heptaploid accession, for the first time reported from Brazil, has shown variable and abnormal meiotic behavior, forming diads, polyads, and normal tetrads. However, normal seed was developed, with germination above 50%.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-05-04T11:37:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2811528 bytes, checksum: 4991505eae55f570a52d7083c84d6347 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-04T11:37:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 2811528 bytes, checksum: 4991505eae55f570a52d7083c84d6347 (MD5) Previous issue date: 2002-08-12 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Realizaram-se a avaliação e descrição das características morfológicas e agronômicas de 36 acessos de taro, do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH/UFV), objetivando definir um padrão característico para cada acesso ou grupo de acessos, visando criar subsídios para programas de melhoramento genético com a cultura. O experimento foi conduzido na horta de pesquisas da Universidade Federal de Viçosa, no período de 19.09.2000 a 13.06.2001. Foi utilizado o delineamento de blocos casualizados, com 36 tratamentos (acessos) e cinco repetições. A parcela foi composta de quatro fileiras espaçadas de 1,0 x 0,5 m, com quatro metros de comprimento, totalizando 32 plantas; e a área, de 16,0 m2. Para as características morfológicas foram utilizados os descritores para o taro do International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI). Dentre as características avaliadas, as que mais contribuíram para a distinção entre os acessos pertencentes ao BGH/UFV foram: número máximo de folhas por planta, margem da lâmina foliar, modelo da nervura, cor do pecíolo (terços superior, intermediário e basal), cor do anel basal do pecíolo, cor da bainha foliar, comprimento do rizoma principal e peso médio de rizomas laterais. Já as características que menos contribuíram, por não apresentarem variação entre os acessos, foram: posição predominante da superfície do limbo foliar, cor da nervura principal, espessura da periderme do rizoma principal e uniformidade de cor das raízes. Com poucas exceções, os acessos de taro pertencentes ao BGH/UFV apresentaram crescimento vegetativo com o seguinte perfil: porte alto (superior a 100 cm), expansão horizontal da planta média (50 a 100 cm), número máximo de folhas por planta entre 4 e 5 e número de rebentos máximo por planta entre 1 e 5. A formação de inflorescência, tipo aplanada ou encapuchada, foi observada em 30,56% dos acessos. Os acessos com inflorescências do tipo aplanada, com maior exposição da espádice, podem favorecer a polinização cruzada pela ação de polinizadores, enquanto os com inflorescência do tipo encapuchada são passíveis de autopolinização. Ambos os tipos de inflorescências, aplanada e encapuchada, apresentaram constrição na espata entre as partes feminina e masculina, o que pode ter impedido a polinização e, conseqüentemente, a fecundação, contribuindo para a não- formação de sementes de maneira natural. Os acessos BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 e BGH 6308 apresentaram as maiores produtividades de rizomas comerciáveis, não diferindo do clone Japonês-BGH 5925 e superando o Chinês-BGH 5928, ambos cultivados comercialmente. Os componentes primários com maiores correlações positivas e significativas com a produtividade de rizomas comerciáveis foram peso médio de rizomas comerciáveis, número de rizomas comerciáveis por planta e produtividade de rizomas filho grande. Os acessos Japonês-BGH 5925, BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 e BGH 6308, com as maiores produtividades de rizomas comerciáveis, apresentaram rizomas de formato cilíndrico ou oblongo, que são comercialmente desejáveis. / A description of the morphological characteristics and yield of 36 accesses of taro was conducted at the Horticultural Germplasm Bank, owned by the Federal University of Viçosa, from 09.19.2000 to 06.13.2001, to define a characteristic standard for each access or group of accesses, aiming to create a basis for genetic breeding programs using this culture. A randomized block design was used, consisting of 36 treatments (accesses) and five replicates. The plot was composed by four rows 1.0 x 0.5 m spaced and 4 m long, totaling 32 plants in an area of 16.0 m2. International Plant Genetic Resources Institute (IPGRI) taro descriptors were utilized for the morphological characterization. Among the characteristics appraised, the ones that most contributed to distinguish among the BGH/UFV taro accesses were: maximum number of leaves per plant, margin of the leaf lamina, vein model, petiole color (thirds superior, intermediate and basal), color of the basal ring of the petiole, color of the leaf sheath, length of the main rhizome and fresh weight of lateral rhizomes. Conversely, following, the following characteristics contributed little, for they did not show variation between the accesses: predominant position of the leaf lamina, color of the main vein, thickness of the periderm of the main rhizome and uniformity of color of the roots. With a few exceptions, the BGH/UFV taro accesses had vegetative growing with the following profile: height superior to 100 cm, average horizontal expansion of the plant from 50 to 100 cm, maximum number of leaves per plant between 4 and 5, and maximum number of lateral stems per plant between 1 and 5. The formation of inflorescence, flat or encapsulated, was observed in 30.56% of the accesses. The accesses with flat inflorescence, with greater spadix exposure, may favor crossed pollination due to pollinator action, while the accesses with inflorescence of the encapsulated type (hooded) allow self pollination. Both inflorescence types presented a constriction in the spathe, between the male and female portions, what may prevent pollination and, consequently, the fecundation, contributing to the non- formation of seeds, in a natural way. The clones BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298 BGH 6307 and BGH 6308 had the highest rhizome commercial productivity, similarly to the clone Japanese-BGH 5925 and higher than the clone Chinese-BGH 5928, both cultivated commercially. The primary components with the highest positive and significant correlations with commercial rhizome productivity were average fresh weight of commercial rhizomes (0.6370), number of commercial rhizomes per plant (0.7133) and productivity of large offspring rhizomes (0.9107). The accesses Japanese-BGH 5925, BGH 5916, BGH 5917, BGH 6137, BGH 6298, BGH 6307 and BGH 6308, which had the highest commercial rhizome productivity, presented rhizome of cylindrical or oblong shapes, which are commercially desirable.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-12T18:18:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 896730 bytes, checksum: fa1cb8d5d773efa7ed1f192f02a3e0b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-12T18:18:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 896730 bytes, checksum: fa1cb8d5d773efa7ed1f192f02a3e0b1 (MD5) Previous issue date: 2003-12-05 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Os objetivos deste trabalho foram a obtenção de coleção núcleo, a partir da Coleção Ativa de Milho da Embrapa Milho e Sorgo, a avaliação de metodologias para obtenção de coleções núcleo de milho e a avaliação de sua adequação por meio de marcadores AFLP. Foi realizado levantamento da situação atual da coleção ativa, sendo considerados dados de passaporte, caracterização e avaliação dos acessos. As estratégias de amostragem foram baseadas em estratificação considerando, principalmente, a origem ecogeográfica e o tipo de grão, variando quanto à intensidade de amostragem, a forma de se determinar o número de acessos amostrados por extrato e no modo de identificar os acessos a serem amostrados nos extratos. A coleção núcleo adotada foi aquela com base em análise multivariada com intensidade de amostragem de 10% dos acessos. A partir das análises de dados moleculares (AFLP) foi verificada adequada representatividade da coleção núcleo adotada. / The objectives of this work were to obtain a nucleus collection from the Maize Active Collection of Maize and Sorghum Embrapa, to evaluate the methodologies available for obtaining maize nucleus collections and to assess its adequability by means of AFLP markers. The present situation of the active collection was assessed, considering passport, characterization and evaluation data of the accesses. The sampling strategies were based on stratification, considering mainly the ecogeographic origin, and grain type, varying in relation to sampling intensity, mode of determining the number of accesses sampled per extract and mode of identifying the accesses to be sampled in the extracts. The nucleus collection adopted was the one based on multivariate analysis with sampling intensity of 10% of the accesses. Based on the analyses of molecular data (AFLP), an adequate representativity of the nucleus collection adopted was verified. / Tese importada do Alexandria

Made available in DSpace on 2015-04-09T12:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-07-18Bitstream added on 2015-04-09T12:47:50Z : No. of bitstreams: 1 000817675.pdf: 435803 bytes, checksum: 9790ca90cd43e847593a2eb809ac5ab5 (MD5) / A soja destaca-se como a oleaginosa de maior importância no mundo, tendo em vista sua relevância nutricional e econômica. Devido ao aumento da área cultivada e, consequentemente da produtividade, o Brasil atualmente, é considerado o maior exportador de soja. No entanto, observa-se que a base genética da soja é restrita, devido à indisponibilidade de alelos capazes de enfrentar estresses bióticos e abióticos de forma totalmente eficiente. Desta forma, os programas de melhoramento visam aumentar a variabilidade genética para o desenvolvimento de cultivares mais produtivas e adaptadas. Estudos a respeito de novas fontes de germoplasma, como as Plant Introductions – PIs, tornam-se necessários para a identificação de características agronômicas de interesse para os melhoristas. Sendo assim, o presente trabalho possui como objetivo geral a avaliação do desempenho agronômico e a divergência genética de 93 acessos de soja, pertencentes a um painel de diversidade visando a obtenção de dados que possam ser utilizados no incremento de programas de melhoramento de soja brasileiros / Soybean stands out as the most important oilseed in the world, given its nutritional and economic importance. Due to increased acreage and hence productivity, today, Brazil is the largest exporter of soybeans. However, it is observed that the genetic basis of soybean is restricted due to the unavailability of alleles able to cope with biotic and abiotic stresses fully efficiently. Thus, breeding programs aimed at increasing the genetic variability for the development of more productive and adapted cultivars. Studies regarding new sources of germplasm, such as Plant Introductions - PIs, become necessary for the identification of agronomic traits of interest to breeders. Therefore, the present work has as main objective the evaluation of agronomic performance and the genetic diversity of 93 accesses of soybean, belonging to a panel of diversity in order to obtain data that can be used in the growth of Brazilian soybean breeding programs