Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-07-23T19:27:59Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Rodrigo de Queiroga Miranda.pdf: 15534572 bytes, checksum: 0c4a6a7a45a5c908c0ac32d4129e7e65 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-07-23T21:42:55Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Rodrigo de Queiroga Miranda.pdf: 15534572 bytes, checksum: 0c4a6a7a45a5c908c0ac32d4129e7e65 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-23T21:42:55Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Rodrigo de Queiroga Miranda.pdf: 15534572 bytes, checksum: 0c4a6a7a45a5c908c0ac32d4129e7e65 (MD5) Previous issue date: 2017-02-23 / CAPES / No Nordeste brasileiro, 75% de suas áreas são semiáridas, onde a vegetação dominante é a Caatinga, que contém mais de 1.000 espécies de plantas vasculares distribuídas como um mosaico. No entanto, sua biodiversidade contrasta com altos níveis de degradação, colocando a Caatinga entre os ecossistemas mais degradados, e modelar essas alterações a nível de bacia tem se tornado cada vez mais importante. Um dos modelos atuais mais utilizados no mundo é o SWAT (Soil and Water Assessment Tool). A tese ora apresentada, tem como objetivo elucidar a dinâmica espaço-temporal e o balanço hídrico em áreas de Caatinga utilizando o modelo SWAT. Para alcançar tal objetivo, este trabalho foi dividido em 4 capítulos, dos quais o primeiro trata da análise da dinâmica e distribuição espaço-temporal da Caatinga; o segundo e o terceiro capítulos realizam uma análise de confiabilidade nos dados de evapotranspiração (ET) e Índice de Área Foliar (IAF), que foram utilizados na calibração do modelo SWAT; e o quarto capítulo consiste na calibração e análise de dados do modelo SWAT. Os dados mostraram que a área relativa (RA) da Caatinga diminuiu de 90,25% para 60,98% ao longo de 38 anos, enquanto a fragmentação (PD) apresentou um viés crescente. Além disso, a distribuição espacial de ambos os índices tornou-se mais heterogênea e agrupou-se ao norte da área de estudo. Correlações com os produtos MOD16A2 e SAFER do sensor MODIS produziram valores de r² mensais = 0,92, 8-dias = 0,88 e diários = 0,85 com o algoritmo SAFER. Os dados mensais do MOD16A2 produziram um valor de r² = 0,82. Estimativas de IAF de torre e Accupar para os anos de 2011 a 2016 foram comparadas com MCD15A3/A2, e derivados do MOD09GA. (i) O MCD15A3/A2 apresentou r² na composição de 4 dias = 0,34 e 8-dias = 0,6; (ii) os derivados do MOD09GA: r² variando de 0,59 a 0,65; (iii) iterações utilizando todas as bandas do produto resultaram em três equações: duas com r² = 0,75, e uma com r² = 0,73. A calibração ocorreu a nível de ET e IAF Foram encontrados Nash para ET (0,61 e 0,63: calibração e validação) e LAI (0,67 e 0,78). A análise do balanço hídrico indicou que 85,03% da água da chuva é evapotranspirada contra 2,45% para escoamento superficial, 3,58% para percolação e 0.41% para fluxo de retorno. A compreensão do balanço hídrico, em especial em florestas nativas de regiões semiáridas, é fundamental para a resolução de muitos problemas relacionados à agricultura e ao planejamento municipal, uma vez que estas áreas naturalmente servem de tampão para o escoamento superficial, que está intimamente ligado a perda de safras inteiras e deslizamentos de terra em áreas residenciais. / In the Brazilian Northeast, 75% of all region is semi-arid, where the dominant vegetation is the Caatinga, which contains more than 1,000 species of vascular plants distributed as a mosaic. However, such biodiversity contrasts with high levels of degradation, placing the Caatinga among the most degraded ecosystems, and modeling these changes at basin level has become increasingly important. Currently one of the most accurate models is SWAT (Soil and Water Assessment Tool).The thesis presented here, aims to elucidate the spatial-temporal dynamics and water balance of the Caatinga, using SWAT with a minimum of possible parameters measured through direct determination. In order to reach this objective, this study was divided in 4 chapters, of which the first is related to the analysis of the spatial-temporal distribution of the Caatinga; The second and third chapters perform a reliability analysis on evapotranspiration (ET) and Leaf Area Index (LAI) data, which was used in the calibration process of SWAT; And finally, the fourth chapter is the calibration itself and data analysis of the SWAT model. The data showed that the relative area (RA) of Caatinga decreased from 90.25% to 60.98% over 38 years, while fragmentation (PD) presented a growing trend. In addition, the spatial distribution of both indexes became more heterogeneous and grouped at the north. Correlations with MOD16A2 and SAFER products of the MODIS sensor produced values of monthly r² values = 0.92, 8 days = 0.88 and daily = 0.85 for the SAFER algorithm. The monthly data of MOD16A2 yielded a value of r² = 0.82. Estimates of LAI from meteorological tower and Accupar for the years 2011 to 2016 were compared to MCD15A3/A2 products, and derivatives of MOD09GA. (i) MCD15A3/A2 presented r² in the composition of 4 days = 0.34 and 8 days = 0.6; (ii) derivatives of MOD09GA: r² ranging from 0.59 to 0.65; (iii) iterations using all bands resulted in three equations: two with r² = 0.75 and one with r² = 0.73. Calibration occurred at the level of evapotranspiration and Leaf Area Index. Nash-Sutcliffe values for ET (0.61 and 0.63: calibration and validation) and LAI (0.67 and 0.78) were found. The Caatinga water balance analysis showed surface runoff only when precipitation values exceeded 63 mm with a maximum of 20 mm. In the Caatinga, 85.03% of rainwater is evapotranspirated against 2.45% for surface runoff, 3.58% for percolation, and 0.41% for return flow. Understanding the water balance, especially in native forests in arid and semi-arid regions, is fundamental for solving many problems related to agriculture and municipal planning, since these areas naturally serve as a buffer for the surface runoff, which is intimately related to loss of entire harvests and landslides in residential areas.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2018-07-10T20:14:54Z No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-10T20:14:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 textocompleto.pdf: 660296 bytes, checksum: 3ddfa0bd00c9a41014d5aa9058baa8be (MD5) Previous issue date: 2018-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A utilização de informações de marcadores moleculares para identificação de indivíduos geneticamente superiores para características de interesse é uma as principais contribuições da genética molecular no melhoramento genético. Assim, em programas de melhoramento genético, é crescente o uso de marcadores moleculares dispostos em matrizes de alta densidade, que necessitam de controle de qualidade e uso de metodologias adequadas para realizar a predição dos valores genéticos. Diante do exposto este trabalho tem como objetivo apresentar o software Golias, que é um software livre destinado ao processamento de dados de marcadores SNPs de alta dimensão. O Golias é integrado com os ambientes de programação R e Julia, utilizando o poder de processamento da linguagem Júlia e de pacotes do R otimizados em código C. Todas as análises são realizadas sem fazer necessário que o usuário tenha qualquer conhecimento em programação. O software proposto dispõe de procedimentos para o controle de qualidade de SNPs como call rate, MAF, teste de equilíbrio de Hardy-Weinberg, descarte de variáveis via componentes principais, um procedimento para imputação de informações genotípicas perdidas e algumas técnicas de predição utilizando métodos bayesianos. O Golias está disponível em português; pode ser baixado da Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) e é compatível com sistema operacional Windows. / The use of molecular marker information to identify genetically superior individuals for traits of interest is one of the main contributions of genomic selection in breeding. Thus, in genetic breeding programs is increasing the use of molecular markers arranged in high density matrices which require quality control and the use of appropriate methodologies to predict genetic values. The work aims to present the Golias software that is a free software for processing data from high- size SNPs. Golias is integrated with the R and Julia programming environments, using the processing power of the Júlia language and R-optimized C-packets. All analyzes are performed without making it necessary for the user to have any programming knowledge. The proposed software has procedures for quality control of SNPs such as call rate, MAF, Hardy-Weinberg equilibrium test, variables discarding via principal components, a procedure for imputation of lost genotype information and some prediction techniques using Bayesian methods. Golias is available in Portuguese; can be downloaded from the Internet (https://www.dropbox.com/sh/ql92mzjed8735wq/AADfVadXY3oYM_3qe84Vb N-Ea?dl=0) and is compatible with Windows operating system.

Made available in DSpace on 2018-08-01T22:35:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11751_Dissertação THUANNY 2018-Final.pdf: 1995390 bytes, checksum: c743f103095c6fb75e2167c9b0057fe1 (MD5) Previous issue date: 2018-02-27 / A sapucaia (Lecythis pisonis Cambess.) é uma árvore da família Lecythidaceae, que produz castanhas comestíveis, saborosas e nutritivas, além de possuir potencial ornamental e madeireiro. Entretanto, seus recursos ainda são subutilizados, visto que é apreciado e conhecido apenas em comunidades locais. Objetivou-se com este trabalho, analisar a diversidade genética por meio de características juvenis e marcadores moleculares, o comportamento morfofisiológico e o status nutricional de castanhas de sapucaia. As sementes das 21 matrizes de sapucaia foram submetidas a avaliações biométricas, químicas e fisiológicas. As sementes também foram submetidas aos raios X para o estudo interno da semente e determinação da densidade. Para o status nutricional das castanhas, foi extraído o selênio, os macro (N, P, K, Ca, Mg e S) e micronutrientes (Fe, Zn, Cu e Mn). Analisaram-se a divergência fenotípica, por meio do heat map de 27 características, e a molecular, pelo marcador ISSR (Inter Simple Sequence Repeats), por meio de 96 primers, dos quais 13 foram selecionados para a caracterização das amostras em bulk das matrizes de sapucaia. As matrizes 5; 8 e 21 são as mais divergentes fenotipicamente, principalmente pela quantidade de potássio e fósforo na matriz 5, manganês na 8 e selênio na 21, entretanto, as demais também não apresentaram similaridade. As características que mais contribuíram para a divergência genética, em ordem decrescente, foram: o Se>TME>Germinação>Fe>Emergência. Dos 74 locos produzidos pelos 13 primers selecionados, 71 foram polimórficos, isto é 96,7% de polimorfismo, evidenciando alta divergência genética. Na diversidade genética das matrizes de sapucaia a porcentagem de polimorfismo encontrada nas 20 amostras é alta (96,7%). As castanhas das 21 matrizes de sapucaia não apresentaram níveis tóxicos de selênio, macro e micronutrientes. As matrizes 8 (175,4 µg g-1) e 20 (71,2 µg g-1) foram selecionadas pela quantidade de manganês e ferro nas castanhas, respectivamente. O teor de selênio nas castanhas de sapucaia variou de 0,10 (matriz 11) a 32,40 µg g-1 (matriz 21), sendo a matriz 21 selecionada por fornecer em média 225 µg de Se por castanha, com recomendação de consumo diário de ¼ de suas castanhas. Os valores de densidade obtidos pela análise de imagens de raios X foram em média 4% diferentes aos obtidos em laboratório. Esta nova metodologia possibilita a determinação da densidade de forma precisa e mais rápida à convencional. A região inferior ou do hilo e a região superior, locais onde ocorrem a protrusão da raiz primária e o hipocótilo, respectivamente, apresentam o tegumento interrupto, com densidade em torno de 0,2 g cm-3. A germinação da sapucaia é desuniforme, lenta e atinge no máximo 63%, com destaque para a matriz 11, com maior vigor.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-08-31T14:31:04Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 602062 bytes, checksum: 91584ea659213ec53e7d2c38ef94f83e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-31T14:31:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 602062 bytes, checksum: 91584ea659213ec53e7d2c38ef94f83e (MD5) Previous issue date: 2018-07-04 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A seleção simultânea de caracteres, integrada à seleção genômica ampla (GWS), tem se tornado uma estratégia de grande interesse para os programas de melhoramento de plantas. Neste sentido, os objetivos desse estudo foram: i) comparar a acurácia e eficiência de seleção do método Multivariate Partial Least Square (Mpls) em relação aos métodos univariados: Random Regression Best Linear Unbiased Predictor (RRblup), Bayesian Lasso (Blasso) e Univariate Partial Least Square (Upls); ii) verificar a eficiência da seleção direta e indireta na GWS; iii) elaborar e comparar diferentes estratégias multivariadas, via índices de seleção integrados à GWS, eficientes na identificação e seleção precoce de indivíduos geneticamente superiores, em diferentes características simultaneamente. Dez populações F 2 com 800 indivíduos foram simuladas considerando quatro características com diferentes herdabilidades. Na primeira etapa da pesquisa, os dados simulados foram submetidos às análises de GWS via RRblup, Blasso, Upls e Mpls. Quatro índices de seleção genômica foram elaborados pelo somatório dos efeitos dos marcadores obtidos para cada característica, ponderados pela sua respectiva variância residual, sendo elaborado um índice para cada metodologia avaliada. Na segunda etapa da pesquisa, os dados simulados foram submetidos as análises de GWS via RRblup e MPls. Foram elaboradas e comparadas diferentes estratégias de índices de seleção aplicados à GWS: i) ponderar os efeitos dos marcadores pela variância residual (elaborado na primeira etapa); ii) codificar e padronizar os efeitos dos marcadores; iii) aplicar média nos efeitos dos marcadores; iv) aplicar o índice de Mulamba e Mock (1978) nos valores genéticos genômicos; v) codificar e padronizar os valores fenotípicos, antes das análises de GWS. Além disso, na segunda etapa dessa pesquisa, foram considerados dois cenários de seleção. No primeiro cenário, foram selecionados os indivíduos com maiores valores fenotípicos, valores genéticos verdadeiros e valores genéticos genômicos para as quatro características avaliadas. Já no segundo cenário, foi considerado diferente sentido de seleção para uma das características simuladas. As comparações entre os métodos e os índices de seleção foram realizadas considerando o tempo de processamento, as acurácias de predição, os ganhos de seleção e os coeficientes de coincidência de seleção. Foi aplicado o índice de Mulamba e Mock (1978) nos valores fenotípicos e valores genéticos verdadeiros. Os métodos de seleção genômica foram mais eficientes que a seleção fenotípica. O método Mpls foi similar ao método Upls para as características de menores herdabilidades e foi menos eficiente quando comparado aos métodos RRblup e Blasso. A seleção direta e indireta baseada nos valores genéticos genômicos foi mais eficiente que a seleção fenotípica. Nenhuma das estratégias avaliadas foi eficiente considerando diferente sentido de seleção para uma das características simuladas. Os índices ponderados pela variância residual apresentaram alta eficiência para aplicação na GWS, no entanto tenderam a maximizar os ganhos para as características de maiores herdabilidades. As estratégias de aplicar índices, via RRblup, a partir da média dos efeitos dos marcadores, dos valores fenotípicos codificados e padronizados e da aplicação do índice de Mulamba e Mock nos valores genéticos genômicos, resultaram em altos ganhos de seleção e mais se aproximaram aos ganhos obtidos pelo índice de Mulamba e Mock aplicado aos valores genéticos verdadeiros. A estratégia de codificar e padronizar os efeitos dos marcadores proporcionou os menores ganhos genéticos totais. De modo geral, os índices de seleção genômica propostos, proporcionaram maior eficiência de seleção, quando comparados ao índice de seleção de Mulamba e Mock fenotípico. Esses resultados sugerem que as estratégias multivariadas, via índices de seleção integrados à GWS, são promissoras para aplicação em programas de melhoramento genético de plantas, visando a seleção precoce direta de várias características simultaneamente. / Simultaneous traits selection, integrated with genome wide selection (GWS), has become a strategy of great interest for plant breeding programs. In this sense, the objectives of this study were: i) to compare the accuracy and efficiency of the Multivariate Partial Least Square (Mpls) method in relation to univariate methods: Random Regression Best Linear Unbiased Predictor (RRblup), Bayesian Lasso (Blasso) and Univariate Partial Least Square (Upls); ii) verify the efficiency of direct and indirect selection in GWS; iii) to elaborate and compare different multivariate strategies, through selection indexes integrated to GWS, efficient in the identification and early selection of genetically superior individuals, in several traits simultaneously. Ten F 2 populations with 800 individuals were simulated considering four traits with different heritabilities. In the first research step, the simulated data were submitted to the GWS analysis via RRblup, Blasso, Upls and Mpls. Four GWS indexes were elaborated by the sum of the markers effects obtained for each trait, weighted by their respective residual variance, and was elaborated an index for each methodology. In the second research step, the simulated data were submitted to GWS analysis via RRblup and MPls. Different selection index strategies applied to GWS were elaborated and compared: i) to weigh the effects of the markers by the residual variance (elaborated in the first step); ii) to encode and standardize the effects of markers; iii) to apply average markers effects; iv) to apply the Mulamba and Mock index (1978) to genomic breeding values; v) to encode and standardize phenotypic values, before to GWS analysis. In addition, in the second research step, two scenarios selection were considered. In the first scenario, individuals with higher phenotypic values, genetic values and genomic breeding values were selected for the four traits evaluated. In the second scenario, a different sense of selection was considered for one of the simulated traits. The comparisons among the methods and the selection indexes were performed considering the processing time, the prediction accuracy, the selection gains and the selection coincidence coefficients. The Mulamba and Mock index was applied to the phenotypic values and genetic values. The GWS methods were more efficient than phenotypic selection. The Mpls method was similar to the Upls method for the smaller heritabilities traits and was less efficient when compared to the RRblup and Blasso methods. The direct and indirect selection based on genomic breeding values was more efficient than phenotypic selection. None of the evaluated strategies was efficient considering a different sense of selection for one of the simulated traits. The residual variance weighted indexes showed high application efficiency to GWS, but tended to maximize gains for the traits of higher heritabilities. The strategies of applying indexes, via RRblup, from the markers effects mean, the coded and standardized phenotypic values and the application of the Mulamba and Mock index on the genomic breeding values, resulted in high selection gains and more approached to the gains obtained by the Mulamba and Mock index applied to the genetic values. The coding and standardizing strategy of the effects of markers provided the lowest total genetic gains. In general, the genomic selection indexes, provided greater selection efficiency than Mulamba and Mock selection index phenotypic. These results suggest that multivariate strategies, via selection indexes integrated to the GWS, are promising for application in plant genetic improvement programs, aiming at the direct early selection of several traits simultaneously.

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2015-03-04T12:01:13Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Marquez Belo - 2014.pdf: 792588 bytes, checksum: 137adbb028109dde710c82a639c91180 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-03-04T12:35:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Marquez Belo - 2014.pdf: 792588 bytes, checksum: 137adbb028109dde710c82a639c91180 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-04T12:35:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Ana Paula Marquez Belo - 2014.pdf: 792588 bytes, checksum: 137adbb028109dde710c82a639c91180 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2014-02-27 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The objective of this work is to study the phenological development of the arboreal cashew fruit from Cerrado (Anacardium othonianum Rizz) to collect biometrics data related to the growth of cashew trees, selecting early plants, both analyse the progress of the antracnosis disease (Colletotrichum gloeosporioides) and the severity caused in the plants, with the intention of contributing to the domestication of the species, in order that the extrativism can be avoided and to preserve it into its natural habitat. The initial material of this research is present in an specific area in where there are exclusively plants from arborous cashew fruit, that belong to a germoplasm collection in the area of the Agronomy School of the Federal University of Goiás - EA/UFG, in Goiânia, GO, in the geographical coordinates 16º35'12” of South latitude, 49º21'14” of longitude the West of Greenwich, and 730 m of altitude, which the cultivation was carried out in January of 2011, totalizing 546 plants originating from 182 plants-mothers. There were monthly obtained results related to the total height, and to the stem circumference to 10,0 cm of height of all the plants. The meteorological data was obtained in the Evaporimetric Station of First Class in operation at EA/UFG. The phenophasis were studied of foliage, blooming and fructification of A othonianum, in the period between March of 2012 to September of 2013, and the observations are done monthly. The evaluations referring to the antracnosis were also done monthly, based on a notes scale of the disease severity, in 65 cashew trees selected in the experimental area. The plants, with 32 months after being planted, presented height varying from 4,0 cm to 380,0 cm and diameter of 1,5 mm stem to 94 mm. The leaves emission showed up with intensity in the months of March, April and May. The blooming did not present correlation with any connected climatic data, and had its peak in June. Only three plants had fruits during the study period. Progenies from UFG and from the city of São Miguel do Passa Quatro region showed precociousness and fruits production, being able to be indicated for a future genetic improvement. The antracnosis manifested itself in several levels along the study period, demonstrating it hardest in the months of February, March and April. The phenofasis of new leaves emission and flowers contribute significantly to the disease progress. / Este trabalho teve como objetivo estudar o desenvolvimento fenológico do caju arbóreo do Cerrado (Anacardium othonianum Rizz.), avaliar os dados biométricos referentes ao crescimento dos cajueiros, selecionar plantas precoces em relação a produção, além de analisar o progresso da antracnose (Colletotrichum gloeosporioides) e a severidade causada nas plantas, com o intuito de contribuir para a domesticação da espécie, a fim de se evitar o extrativismo e conservar a espécie em seu habitat natural. O material inicial desta pesquisa está presente em uma área constituída exclusivamente por plantas de caju arbóreo, pertencentes a uma coleção de germoplasma na área da Escola de Agronomia da Universidade Federal de Goiás - EA/UFG, em Goiânia, GO, nas coordenadas geográficas 16º35’12” de latitude Sul, 49º21’14” de longitude a Oeste de Greenwich, e 730 m de altitude, cujo plantio foi realizado em janeiro de 2011, totalizando 546 plantas provenientes de 182 plantas-mães. Mensalmente foram obtidos dados relativos à altura total, e à circunferência do caule a 10,0 cm de altura de todas as plantas. Os dados meteorológicos foram obtidos na Estação Evaporimétrica de Primeira Classe em operação na EA/UFG. Foram estudadas as fenofases de folhação, floração e frutificação do A. othonianum, no período de março de 2012 a setembro de 2013, sendo as observações realizadas mensalmente. As avaliações referentes à antracnose foram realizadas mensalmente, com base em uma escala de notas de severidade da doença, em 65 cajueiros selecionados na área experimental. As plantas, com 32 meses após o plantio apresentaram altura variando de 4,0 cm a 380,0 cm e diâmetro de caule de 1,5 mm a 94 mm. A emissão de folhas apresentou-se com intensidade nos meses de março, abril e maio. A floração não apresentou correlação com nenhum dos dados climáticos relacionados, e teve seu pico no mês de junho. Apenas três plantas produziram frutos durante o período de estudo. Progênies da UFG e da região de São Miguel do Passa Quatro se destacaram quando a precocidade e produção de frutos, podendo ser indicadas para um futuro melhoramento genético. A antracnose se manifestou em níveis variados de severidade ao longo do período de estudo, se demonstrando mais severa nos meses de fevereiro, março e abril. As fenofases de emissão de folhas novas e flores contribuem significativamente para o progresso da doença.

O Brasil é um dos maiores produtores e exportadores de carne bovina do planeta e com a expectativa de ser responsável por 45% do consumo mundial sendo que a maior parte de seu consumo ainda é local. Para se manter nesta posição e expandir suas vendas tanto no mercado interno como externo é importante que se garanta a qualidade do produto. Esta qualidade só é conseguida quando se consegue gerenciar todo o processo da cadeia produtiva, de forma a permitir o registro de todos os dados do animal na cadeia de produção. Tanto o governo através do SISBOV como grandes distribuidores possuem sistemas de gerenciamento que através de técnicas de rastreabilidade permitem ter este controle. A identificação do animal é ponto chave para a rastreabilidade que hoje é feita através de bottons, transponders, brincos entre outros. Todos estes métodos são invasivos e suscetíveis a perdas e adulterações. Esta dissertação mostra a viabilidade de inserir em sistemas de rastreabilidade existentes ou não a inclusão de identificação biométrica e usa como exemplo o focinho nasal do bovino. Para tanto desenvolveu-se programas para entrada de informações através de um celular com sistema operacional Android que em conjunto com programas desenvolvidos para rodarem na WEB pudessem cadastrar e confirmar a identidade do animal. Os testes mostraram a capacidade do aplicativo Android em localizar o espelho nasal e coletar o mesmo. Com os dados coletados foi possível armazenar as informações ou confirmar a identidade do animal por meio dos serviços do servidor. Mostrou-se desta forma viável a utilização deste tipo de identificação em sistemas de gerenciamento novos ou já existentes. / Brazil is one of the largest producers and exporters of beef in the world and with the expectation of being responsible for 45% of global consumption and the largest part of consumption is still locall. To stay in this position and to expand its sales both in domestic and foreign markets is important to ensure product quality. This quality is achieved only when you can manage the entire process of the production chain in order to allow the registration of all animal data in the production chain. The government through SISBOV and large distributors have been working with management systems through traceability techniques. Animal identification is key to the traceability and nowadays is made via bottoms, transponders, earrings among others. All these methods are invasive and susceptible to loss and tampering. This work shows the feasibility of entering into existing traceability systems or not the inclusion of biometric identification and uses as an example the nasal muzzle beef. For both developed programs to input information through a mobile phone with Android operating system in conjunction with programs designed to be web based solution could register and confirm the identity of the animal. All results was able to shown the system performance by showing that it was possible to store the information or confirm the identity of the animal through the server services. The methodology proposed could be useful in commercial applications focusing in bovine traceability.

Orientador: Helder Anibal Hermini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Mecanica / Made available in DSpace on 2018-08-12T11:02:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Velho_ThiagoRodriguesDias_M.pdf: 3732956 bytes, checksum: 0b07ab69f0d9bd506570add187760f7a (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: Como consequência da busca pela perfeição cinesiológica na tecnologia de realidade virtual em interfaces humanas, esses ambientes estão demandando cada vez mais dispositivos que tornem a interação homem-máquina a mais natural possível e isso inclui o desenvolvimento de tecnologias que relevem questões de anatomia e fisiologia, em função das tarefas que serão realizadas. Ante o exposto, nessa dissertação foi desenvolvido um dispositivo háptico de mão que será utilizado para interagir e/ou manipular objetos tridimensionais visando uma perfeita concatenação cinemática. Uma das principais características do funcionamento do protótipo está relacionada com o sistema mecânico, que é capaz de acompanhar toda a trajetória de extensão e flexão de um dedo antropomórfico. O dispositivo mecatrônico foi desenvolvido usando as tecnologias CAD e Prototipagem Rápida, sendo prototipada a partir do processo de sinterização a laser utilizando a composição de poliamida PA12, o que oferece ao produto final resistência adequada e também leveza / Abstract: As a consequence of the search of the kinesthesia perfection in the technology of human virtual interfaces, this environments are each time more in need for devices that is able to turn the human-machine interaction as most natural as possible and this includes the development of technologies that reveals questions of anatomy and physiology, in order to realize the tasks that they are going to. Based in that, in this dissertation it was developed a hand haptic device the will be used to interact and/or manipulate tridimensional objects focusing on a perfect cinematic concatenation. One of the main characteristics of the prototype functioning is related with the mechanic system, which is able to follow the entire extension and flexion trajectory made by one anthropomorphic hand finger. The device was developed using CAD and Rapid Prototyping technologies, being prototyped through laser sinterization process which uses the PA12 polyamide composition which offers to the final product adequate resistance and also lightness / Mestrado / Mecanica dos Sólidos e Projeto Mecanico / Mestre em Engenharia Mecânica

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-06-15T18:17:33Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1298965 bytes, checksum: 1311dc011ddeb43dcab8e236f7db6e5c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T18:17:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 1298965 bytes, checksum: 1311dc011ddeb43dcab8e236f7db6e5c (MD5) Previous issue date: 2018-01-15 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / As análises biométricas empregadas nos programas de melhoramento genético de espécies de Eucalyptus têm possibilitado a tomada de decisões por parte dos pesquisadores de forma acurada. Esses trabalhos vêm provendo relevantes informações sobre procedimentos e estratégias de melhoramento florestal. Levando em conta a necessidade de ampliação das informações acerca do entendimento de fenômenos biológicos impactantes na rotina de programas de melhoramento do eucalipto, esse estudo objetivou aplicar ferramentas biométricas para entendimento e resolução de problemas práticos, assim como propor novas estratégias para otimização de processos inerentes a esses programas. Dois diferentes experimentos clonais foram conduzidos na empresa CMPC Celulose Riograndense e um teste de progênies na empresa Cenibra. A partir do estudo do desempenho de clones de eucalipto em arranjos experimentais de parcela de planta única/single-tree-plot (PPU/STP) e parcelas quadradas/square plot (PQ/SP) realizados na CMPC Celulose Riograndense, foi possível constatar uma taxa de decréscimo de produtividade estimada para clones agressivos plantados em PPU em relação a PQ de 26%. Ademais, experimentos de eucalipto em PPU e PQ apresentam alta correspondência em termos de ordenamento genético. A partir da avaliação da habilidade competitiva de clones em PPU e PQ foram constatadas as seguintes classes de competição de clones: clones agressivos, homeostáticos e sensíveis à competição. Baseado nessas classes, foi proposto o plantio multiclonal otimizado, o qual propõe a combinação de clones agressivos e homeostáticos no plantio comercial, como uma forma de incrementar a produtividade média total do plantio. Avaliando-se o comportamento da interação genótipo por ambientes em testes clonais instalados na empresa CMPC Celulose Riograndense aos três e nove anos, constatou-se que o padrão de estratificação ambiental se modificou com o tempo para o caráter incremento médio anual (IMA, m 3 .ha -1 .ano -1 ). A causa da mudança da estratificação ao longo do tempo ocorreu devido ao caráter volumétrico em questão. Índices de seleção envolvendo caracteres de qualidade da madeira apresentam maior potencial de detecção de estratificação ambiental de forma precoce aos três anos. A estratificação em zonas de melhoramento se deu em virtude de similaridade de solos entre os ambientes avaliados. O uso de ferramentas biométricas possibilitou a otimização de seleção de um teste de progênies de famílias de irmãos completos de eucalipto instalados nas áreas da empresa Cenibra. Diversos cenários de montagem de pomares de sementes por mudas foram simulados. O cenário que maximizou os ganhos e minimizou a endogamia foi composto pelas sete melhores famílias com os melhores dez indivíduos em cada uma. Neste experimento constatou-se que os genótipos mais produtivos eram híbridos triplos, demonstrando a importância da busca pela heterose no melhoramento do eucalipto via cruzamento de genótipos superiores e divergentes geneticamente. Os resultados favoráveis em termos de ganho com seleção nas simulações dos cenários indicaram que, futuramente, este experimento poderá ser transformado em pomares de sementes por mudas. A correta utilização de ferramentas de Genética Quantitativa e Estatística permitiram a otimização dos programas de melhoramento do eucalipto propostos no presente trabalho, demonstrando a importância das análises biométricas na obtenção de resultados práticos, geração de novos conceitos e estratégias e tomadas de decisão acertadas pelo pesquisador. / Biometric analyzes used in the breeding programs of Eucalyptus species have allowed the researchers making decisions accurately. These works have provided relevant information on forest improvement procedures and strategies. Taking into account the need to expand information about the understanding of biological phenomena impacting the routine of eucalypt breeding programs, this study aimed to apply biometric tools to understand and solve practical problems, as well as to propose new strategies for optimization of inherent processes to these programs. Two different clonal experiments were conducted at CMPC Celulose Riograndense and a progeny test at Cenibra. From the study of the performance of eucalyptus clones in experimental arrangements of single-tree- plot (STP) and square plots (SP) performed at CMPC Celulose Riograndense, it was possible to observe an estimated rate of decrease of productivity for aggressive clones planted in STP of 26%. In addition, experiments of eucalyptus in STP and SP present high correspondence in terms of genetic ranking. From the evaluation of the competitive ability of clones in STP and SP, the following competition classes of clones were observed: aggressive, homeostatic and sensitive clones to competition. Based on these classes, it was proposed the optimized multiclonal plantation, which relies on the combination of aggressive and homeostatic clones in the commercial stand, as a way to increase the average total productivity of the plantation. Evaluating the behavior of genotype by environmental interaction in clonal tests installed at the company CMPC Celulose Riograndense at three and nine years, it was verified that the environmental stratification pattern changed over time for the mean annual increment (MAI, m 3 .ha -1 .year -1 ). The cause stratification changing of over time occurred because of the volumetric character in question. Selection indices involving wood quality characters present greater potential for detection of environmental stratification early at three years. The stratification in areas of improvement was due to the similarity of soils between the evaluated environments. The use of biometric tools enabled the selection optimization of a progeny test composed by full-sib families of Eucalyptus trees installed in the areas of Cenibra. Several scenarios for assembling seed orchards by seedlings were simulated. The chosen scenario maximized gains and minimized inbreeding by choosing seven best families with the best ten individuals in each. In this experiment it was verified that the most productive genotypes were three-way- cross hybrids, demonstrating the importance of heterosis search in the improvement of eucalyptus via crossing of superior and genetically divergent genotypes. The favorable results in terms of gain with selection in the simulations of the scenarios indicated that, in the future, this experiment could be transformed into seed orchards by seedlings. The correct use of Quantitative Genetics and Statistical Genetics tools allowed the optimization of Eucalyptus breeding programs proposed in the present study, demonstrating the importance of biometric analysis in obtaining practical results, generation of new concepts and strategies, and decision making made by the researcher.

Orientadores: Marcio Luiz de Andrade Netto, Max Henrique Machado Costa / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Eletrica e de Conputação / Made available in DSpace on 2018-07-25T09:55:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferreira_DenilsonPalhares_M.pdf: 7550296 bytes, checksum: d68b95111ae579d7db7db386562ffebf (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Apresenta-se, neste trabalho, um sistema de identificação de pessoas baseado em seus padrões de íris. Estruturalmente este sistema pode ser dividido em dois módulos: o módulo de extração de características, no qual os padrões de íris são decompostos em subbandas e o módulo de identificação, em os padrões são identificados por uma rede "neuro-fuzzy . No módulo responsável pela extração de características, um determinado padrão de íris é decomposto em 67 sub-bandas. Inicialmente, os filtros em quadratura bidimensionais (2D QMF) são aplicados sobre toda a imagem gerando quatro sub-bandas. Em seguida, escolhe-se a sub-banda de baixa freqüência nas duas direções (LL) e aplicam-se os filtros 2D QMF recursivamente sobre todas as sub-bandas até a obtenção de sub-bandas com (16x16) coeficientes. Neste ponto, a energia média de cada sub-banda é calculada e as sub-bandas são ordenadas em ordem decrescente de energia. A seguir, determinam-se quais sub-bandas serão utilizadas. Para tanto, aplica-se o procedimento descrito acima sobre um conjunto de dez padrões de íris diferentes e escolhem-se as 32 sub-bandas mais energéticas de cada padrão. Destas 320 sub-bandas, escolhem-se as 20 sub-bandas que apareceram com maior freqüência. Estas 20 sub-bandas de cada padrão são utilizadas para treinar a rede "neuro-fuzzy". Após treinada, a rede "neuro-fuzzy" é utilizada pelo módulo responsável pela identificação. O desempenho do sistema de identificação baseia-se nas taxas de aceitação de autênticos e de rejeição de impostores. Este trabalho apresenta resultados de simulações do sistema em que as taxas de aceitação de autênticos foram, em média, superiores a 90% e as taxas de aceitação de impostores inferiores a 10% / Abstract: In this work we develop a system that identifies a person by his or her iris pattern. Structurally this system can be divided in two modules: (1) the feature extraction one, performed via wavelet-based subband decomposition, and (2) the identification task module, performed by a neuro-fuzzy network. In the feature extraction module, an iris pattern is decomposed in 67 subbands. InitialIy,2D Quadrature Mirror Filters (2D QMF) are applied to the whole image and four subbands are generated. Then the low-low (LL) subband is further decomposed and the 2D QMF are applied recursively to all subbands until we obtain subbands with (16x16) coeficients. At this point, the energy of each subband is calculated and the subbands are ordered in decreasing mode. Then we determine which subbands should be applied to the identification module. To do so we use the procedure described above with a sample of ten different iris patterns. The 32 subbands with most energy are then chosen from each pattern. From this group of 320 subbands we choose the 20 subbands that occur most frequently. These 20 subbands of each iris pattern are then used to train the neuro-fuzzy network. After the training phase, the neuro-fuzzy network is used by the identification module. This work presents results of simulations of the algorithms and estimates of the authentic recognition rate and the imposter rejection rate. The estimated authentic recognition rates were, on average, above 90% and the imposter recognition rates below 10% / Mestrado / Automação / Mestre em Engenharia Elétrica

Orientador: Aida C. G. Verdugo Lazo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Matematica, Estatistica e Computação Cientifica / Made available in DSpace on 2018-07-23T18:33:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Matuda_NiveadaSilva_M.pdf: 3623854 bytes, checksum: 146f65b0f200872e091830629e681137 (MD5) Previous issue date: 1998 / Resumo: Não informado / Abstract: Not informed / Mestrado / Mestre em Estatística