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Concordança: Nous procediments i aplicacionsCarrasco Jordan, Josep Lluís 08 July 2003 (has links)
L'objectiu de la tesi és analitzar els procediments per avaluar concordança entre mesures, centrant-se en el cas de dades quantitatives.Al primer capítol es presenta un resum dels mètodes que s'apliquen actualment per analitzar concordança i error de mesura.Al segon capítol s'analitza el coeficient de concordança en dos sentits: primer es compara amb el coeficient de correlació intraclasse i, posteriorment, s'estudia la seva aplicació en dades de recompte.Al capítol tres es presenta el model d'equació estructural com un procediment útil per avaluar bioequivalència.Finalment, en el quart capítol s'ha inclòs el resum de la tesi i les principals conclusions.
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Modelagem em análise de sobrevivencia com eventos recorrentes aplicada a dados da área médicaMota, Thiago Santos [UNESP] 04 February 2013 (has links) (PDF)
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000745597.pdf: 441942 bytes, checksum: 2fa4ddc3e6855f918b616ea4223e18f7 (MD5) / Esta dissertação teve como objetivo estudar os modelos marginais e condicionais utilizados em análise de sobrevivência multivariada e avaliar o efeito das covariáveis medidas no tempo, até a ocorrência de eventos cardiovasculares em pacientes prevalentes em tratamento dialítico no hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da UNESP – Campus de Botucatu, SP, com seguimento de 2008 a 2011. Como os dados tratam de eventos recorrentes do mesmo tipo, foram utilizados na modelagem os modelos marginais – AG (Andersen & Gill, 1982), PWP (Prentice et al., 1981) e WLW (Wei et al., 1989) – e os modelos condicionais – semiparamétricos com distribuições gama e lognormal para a variável de fragilidade. As covariáveis consideradas neste trabalho foram variáveis clínicas, nutricionais, laboratoriais e dialíticas. Foram consideradas em todos os modelos as covariáveis significativas ao nível de 5%, utilizando os critérios de seleção de covariáveis: backward, forward e stepwise. Apresentou-se também os valores do critério de AKAIKE (AIC), critério de AKAIKE corrigido (AICc) e o critério de informação de Bayes (BIC) para esses modelos. Foram discutidas outras questões importantes para selecionar o melhor modelo para o conjunto de dados, como a frequência de eventos e se a ocorrência de novos eventos é influenciada por eventos anteriores. A partir desses critérios, o modelo PWP foi o modelo selecionado para esses dados, e em seguida foi feita a análise de resíduos pelos resíduos de Shoenfeld e Martigale, o que mostrou que esse modelo se ajustou bem aos dados. Sendo esta análise feita no programa estatístico R Development Core Team (2012). Ao interpretar as covariáveis do modelo, observou-se a associação entre o quociente de massa extracelular corporal por massa celular corporal (MEC/MCC) com a ocorrência de eventos cardiovasculares em pacientes em diálise, sendo que tal exploração até o ... / The aim is to study the marginal and conditional models used in multivariate survival analysis and to evaluate the effect of the covariates measuared over time for ocurrence of recurrring cardiovascular events in patients under dialysis treatment from clinics hospital of the Medicine Faculty, UNESP - Botucatu, SP, with follow-up time from 2008 to 2011. As the data treat the recurring events of the same type, the marginals models – AG (Andersen & Gill, 1982), PWP (Prentice et al., 1981) and WLW (Wei et al., 1989) – and the conditionals models – frailty models with lognormal and gamma distributions – were used in the modeling. The covariates considered in this study were clinical, nutritional, laboratory and dialytic. The covariates were considered significant at 5% in all models using the covariates selection criteria: backward, forward and stepwise. It also presented the values of the criteria of AKAIKE (AIC), corrected criteria of AKAIKE and criteria of the Bayes (BIC) for these models. Other issues were discussed to select the best model for the data set, as frequency and the influence of previous events to the occurrence of new events. Based on these criteria, the PWP model was selected to model the data. Residual analysis was done by using the Shoenfeld and Martigale residuals, showed that this model fits the data well. All the results were obtained in R software (R Development Core Team, 2012). The results showed association between the quotient extracellular mass by body cell mass (MEC/MCC) covariate and the occurrence of cardiovascular events in dialysis patients such exploration such finding is new for multiple events per individual
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Desenvolvimento e aplicação de modelos matemáticos para o controle da Diaphorina citri via manejo integrado e estudo da influência da temperatura sobre a dinâmica populacional de Talitroides topitotum /Lima, Ernesto Augusto Bueno da Fonseca. January 2010 (has links)
Orientador: Cláudia Pio Ferreira / Banca: Helenice de Oliveira Florentino Silva / Banca: Wesley Augusto Conde Godoy / Resumo: A modelagem ecológica é uma ferramenta importante para a investigação de padrões de comportamento dinâmico em populações, interações tróficas e relações entre populações e meio ambiente, principalmente porque os padrões ecológicos que refletem tendências de oscilação populacional muitas vezes não são claramente visíveis sem instrumentos analíticos, como os modelos ecológicos. Dessa forma, a modelagem ecológica exerce um papel fundamental na descrição e entendimento de processos demográficos importantes para a dinâmica populacional. Os modelos ecológicos, além de tornarem possível a visualização de padrões ecológicos, podem também revelar padrões de persistência populacional nos diversos sistemas tróficos, incluindo as relações presa-predador ou hospedeiro-parasitóide. Um bom modelo deve ser simples sem que haja prejuízo de sua predição ou do entendimento do problema e parametrizável, com parâmetros que possam ser obtidos (pelo menos boa parte deles) a partir de dados de campo e/ou laboratoriais. Este trabalho tem como objetivos: (1) discutir o efeito da temperatura na dinâmica populacional do anfípode Talitroides topitotum e seu possível uso como biomonitor das atividades humanas nas florestas; (2) descrever a dinâmica populacional de Diaphorina citri e seu parasitóide Tamarixia radiata e analisar a aplicação de estratégias de Manejo Integrado de Pragas (MIP). Os dois problemas biológicos escolhidos são de grande importância e atuais, sendo que o primeiro estuda a persitência e abundância de uma população de anfípode através do estudo dos fatores que influênciam a evolução temporal desta espécie, com enfoque na importância da mesma como biomonitor e no aquecimento global, já que os parâmetros relacionados a biologia da espécie (taxas de mortalidade, recrutamento e desenvolvimento) dependem... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Ecological modeling is an important tool for investigating dynamic behavior patterns in populations, trophic interactions and interactions between population and habitat, mainly because ecological patterns that reflect trends in population oscillations are often not clearly without analytical tools such as ecological models. Thus, ecological modeling plays a fundamental role in the description and understanding of important demographic processes in population dynamics. The ecological models, besides making possible the visualization of ecological patterns, may also reveal patterns of population persistence in many trophic systems, including predator-prey relationships or host-parasitoid. A good model should be simple without compromising its prediction or understanding of the problem, with parameters that can be obtained (at least most of them) from field data or laboratory experiments. This work has the following objectives: (1) discuss the effect of temperature on the population dynamics of the amphipod Talitroides topitotum and, its possible use as biomonitor of human activities on forests, (2) describe population dynamics of Diaphorina citri and its parasitoids Tamarixia radiata and, discuss the implementation of strategies of Integrated Pest Management (IPM). The two problems studied here, are of great biological importance been the first one related to the study of persistence and abundance of an amphipod population through the analyse of the factors that influence the species temporal evolution, with emphasis on the importance of this species as biomonitor and in the global warming, since the parameters related to the species biology (mortality rate, recruitment wave, development rate) are temperature dependent; the second one is related to reduction of a pest population to acceptable levels by control mechanisms that combine the use of pesticides and biological control, with... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Uma abordagem probabilística do número de reprodução básica em modelos epidemiológicos com aplicação na ferrugem do eucalipto /Kodaira, Juliana Yukari. January 2011 (has links)
Orientador: José Raimundo de Souza Passos / Banca: Edson Luiz Furtado / Banca: Laécio Carvalho de Barros / Resumo: Na epidemiologia matemática, uma importante medida derivada do modelo determinístico associado à dinâmica de transmissão de uma doença infecciosa é o número esperado de infecções secundárias produzidas por um caso indexado em uma população completamente suscetível, conhecido como número de reprodução básica R0. Utilizando simulações de Monte Carlo, estudamos o efeito da incerteza sobre R0 em modelos compartimentos de transmissão de doenças, associando variáveis aleatórias uniformemente distribuídas a cada parâmetro constituinte de R0. Esta pertubação sobre os parâmetros corresponde à imprecisão intrínseca de seus valores na natureza. Neste trabalho também consideramos diferentes intervalos para as taxas de transmissão de doença com o intuito de avaliar seus efeitos dinâmicos. Aplicamos este método à modelagem da ferrugem do eucalipto, que é uma doença muito comum e severa em plantações de Eucalyptus spp. e outras mirtáceas, transmitida pelo fungo Puccinia psidii Winter. Hoje o eucalipto possui importância significativa tanto no mercado nacional quanto internacional e, portanto, iniciativas que auxiliem seu manejo integrado de doenças são imprescindíveis. Nossos resultados mostram que o método utilizado é eficiente, pois representa a influência das taxas de transmissão de doença no padrão da distribuição de probabilidade aproximada de R0, permitindo a obtenção das funções empíricas percentílicas complementares para os modelos considerados / Abstract: In mathematical epidemiology, an important measure derived from the deterministic model associated with the transmission dynamics of an infectious disease is the expected number of secondary infections produced by an indexed case in a completely susceptible population, known as the basic reproduction number R0. Using Monte Carlo simulations, we studied the effect of the uncertainty on R0 in compartmental disease transmission models, associating random variables uniformly distributed to each constituent parameter of R0. This perturbation on the parameters correspond to the intrinsic imprecision of their values in nature. In this work we also consider different ranges for the disease transmission rates in order to evaluate their dynamical effects. We apply this method to the eucalyptus rust, which is a very common and severe disease in plantations of Eucalyptus spp. and others Myrtaceae, transmitted by the fungus Puccinia psidii Winter. Today, eucalyptus has significant importance in both national and international market. Therefore, initiatives to help its integrated disease management are essential. Our results show that the method is efficient, since it represents the influence of the disease transmission rates in the approximated probability distribution pattern of R0, allowing us to obtain the empirical percentile complementary functions for the considered models / Mestre
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Modelagem em análise de sobrevivencia com eventos recorrentes aplicada a dados da área médica /Mota, Thiago Santos. January 2013 (has links)
Orientador: Liciana Vaz de Arruda Silveira / Banca: Lídia Raquel de Carvalho / Banca: Aline Araújo Antunes / Banca: Adriano Dias / Banca: Miriam Hamuri Tsunemi / Resumo: Esta dissertação teve como objetivo estudar os modelos marginais e condicionais utilizados em análise de sobrevivência multivariada e avaliar o efeito das covariáveis medidas no tempo, até a ocorrência de eventos cardiovasculares em pacientes prevalentes em tratamento dialítico no hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da UNESP - Campus de Botucatu, SP, com seguimento de 2008 a 2011. Como os dados tratam de eventos recorrentes do mesmo tipo, foram utilizados na modelagem os modelos marginais - AG (Andersen & Gill, 1982), PWP (Prentice et al., 1981) e WLW (Wei et al., 1989) - e os modelos condicionais - semiparamétricos com distribuições gama e lognormal para a variável de fragilidade. As covariáveis consideradas neste trabalho foram variáveis clínicas, nutricionais, laboratoriais e dialíticas. Foram consideradas em todos os modelos as covariáveis significativas ao nível de 5%, utilizando os critérios de seleção de covariáveis: backward, forward e stepwise. Apresentou-se também os valores do critério de AKAIKE (AIC), critério de AKAIKE corrigido (AICc) e o critério de informação de Bayes (BIC) para esses modelos. Foram discutidas outras questões importantes para selecionar o melhor modelo para o conjunto de dados, como a frequência de eventos e se a ocorrência de novos eventos é influenciada por eventos anteriores. A partir desses critérios, o modelo PWP foi o modelo selecionado para esses dados, e em seguida foi feita a análise de resíduos pelos resíduos de Shoenfeld e Martigale, o que mostrou que esse modelo se ajustou bem aos dados. Sendo esta análise feita no programa estatístico R Development Core Team (2012). Ao interpretar as covariáveis do modelo, observou-se a associação entre o quociente de massa extracelular corporal por massa celular corporal (MEC/MCC) com a ocorrência de eventos cardiovasculares em pacientes em diálise, sendo que tal exploração até o ... / Abstract: The aim is to study the marginal and conditional models used in multivariate survival analysis and to evaluate the effect of the covariates measuared over time for ocurrence of recurrring cardiovascular events in patients under dialysis treatment from clinics hospital of the Medicine Faculty, UNESP - Botucatu, SP, with follow-up time from 2008 to 2011. As the data treat the recurring events of the same type, the marginals models - AG (Andersen & Gill, 1982), PWP (Prentice et al., 1981) and WLW (Wei et al., 1989) - and the conditionals models - frailty models with lognormal and gamma distributions - were used in the modeling. The covariates considered in this study were clinical, nutritional, laboratory and dialytic. The covariates were considered significant at 5% in all models using the covariates selection criteria: backward, forward and stepwise. It also presented the values of the criteria of AKAIKE (AIC), corrected criteria of AKAIKE and criteria of the Bayes (BIC) for these models. Other issues were discussed to select the best model for the data set, as frequency and the influence of previous events to the occurrence of new events. Based on these criteria, the PWP model was selected to model the data. Residual analysis was done by using the Shoenfeld and Martigale residuals, showed that this model fits the data well. All the results were obtained in R software (R Development Core Team, 2012). The results showed association between the quotient extracellular mass by body cell mass (MEC/MCC) covariate and the occurrence of cardiovascular events in dialysis patients such exploration such finding is new for multiple events per individual / Mestre
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Aspectos ultrassonográficos, biometria e dopplerfluxometria ocular de primatas-Alouatta fusca (BUGIO RUIVO-Geoffroy Saint-Hilaire, 1812) /Souza, Livia Pasini de. January 2013 (has links)
Orientador: Luiz Carlos Vulcano / Banca: José Joaquim Titton Ranzani / Banca: Milton Kolber / Resumo: O Bugio Ruivo é um primata neotropical da espécie Alouatta fusca que vive hoje em pequenos fragmentos florestais isolados devido ao desmatamento e ao tráfego ilegal. Muitos animais desta espécie encontram-se hoje em recintos para entretenimento e pesquisa. As pesquisas têm gerado informações importantes e fundamentais para o conhecimento da anatomia e fisiologia destes animais. A ultrassonografia ocular experimental, em algumas espécies de primatas, já vem sendo estudada na medicina. Assim, o estudo ultrassonográfico ocular, nessa espécie, fornecerá uma fonte de parâmetros normais para rotina clínica e pesquisas futuras destes primatas. Para este estudo foram utilizados vinte bulbos oculares de dez primatas, cinco machos e cinco fêmeas, clinicamente sadios, com o objetivo de obter informações sobre aspectos ultrassonográficos normais das estruturas do bulbo ocular. O estudo para a obtenção dos valores da dopplerfluxometria da artéria oftálmica interna foi realizado com um total de 20 bulbos oculares, e os da artéria central da retina, em 18 bulbos oculares, devido à dificuldade de acessar esta artéria nestes animais. Foram avaliados os aspectos ultrassonográficos normais do bulbo ocular, os valores médios de mensurações da câmara anterior, lente, câmara vítrea e comprimento axial do bulbo ocular, bem como os valores médios dos parâmetros de dopplerfluxometria como índice de resistividade, índice de pulsatilidade, velocidade de pico sistólico e velocidade diastólica final do fluxo sanguíneo das artérias oftálmicas interna e central da retina. Estes parâmetros obtidos de normalidade servirão como base para estudos de doenças que provoquem alterações ultrassonográficas e vasculares do bulbo ocular, bem como no auxílio ao atendimento clínico oftalmológico de primatas desta espécie / Abstract: The Howler Monkey (Alouatta fusca) is a neotropical primate. They live in a small isolated forest fragments due to deforestation, and illegal traffic. Many animals of this species are in a venue for entertainment and research, so the collection of information is essential to provide knowledge about these animals. Experimental ocular ultrasonography in some primate species have been studied in medicine, so the ultrasound study of this species provide a source of data for future research and clinical practice of these primates. Twenty eyes of ten Alouatta fusca, five males and five females, clinically healthy were submitted for ocular ultrasonography in order to obtain information normal ultrasound parameters. One eyeball was removed from the study due to ophthalmic injury of anterior chamber. Doppler Study of ophthalmic artery was performed inside a total of 20 eyeballs, and the same study of central retinal artery was obtained with 18 eyes. Data of aspects of ocular ultrasound normal, average values of measurements of the anterior chamber, lens, vitreous and total length of the eyeball as well as average values of parameters such as Doppler resistivity index, pulsatility index, speed Peak Systolic and Diastolic end speed of blood flow inside arteries ophthalmic and central retina was obtained. This information will serve as the normal basis for studies of diseases that cause vascular and ocular changes as well as aid in the clinical care of this species / Mestre
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Detecção do mal-posicionamento rotacional de dedos em dispositivos de captura de impressões digitais multivista sem toque utilizando redes neurais artificiais / Rotational bad-positioning detection of fingers on touchless multiview fingerprint de vices using artificial neuralnetworksZaghetto, Cauê 25 April 2016 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, Departamento de Engenharia Mecânica, 2016. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2016-06-06T13:21:02Z
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2016_CaueZaghetto.pdf: 14491723 bytes, checksum: cb3b4c34391e97435c3414fd256d02ae (MD5) / Este trabalho apresenta um método baseado em Redes Neurais Artificiais que avalia o malposicionamento dos dedos devido à rotação em dispositivos de aquisição de impressões digitais multivista sem toque. O objetivo é determinar se o dedo está rotacionado ou não, uma vez que o adequado posicionamento do dedo é mandatório para garantir altas taxas de correspondência entre impressões digitais. Um conjunto de teste de 9000 imagens adquiridas foi utilizado para treinar, validar e testar um conjunto de classificadores baseados em redes neurais artificiais multicamadas. Até o momento, não existe um método definitivo que abordou o problema da qualidade de impressões digitais em dispositivos de captura que utilizem a tecnologia multivista sem toque, e a detecção da rotação de dedos apresentada neste trabalho é um dos passos que devem ser levados em conta se um futuro método automático para avaliação da qualidade de impressões digitais for considerado. Os resultados médios, mostram que: o classificador identifica corretamente o mal-posicionamento em aproximadamente 98,50% dos casos; e quando o mal-posicionamento é detectado, o ângulo de rotação é corretamente estimado em 95,25% dos casos. _______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / This work presents a method based on Artificial Neural Network that evaluates the rotational bad-positioning of fingers on touchless multiview fingerprinting devices. The objective is to determine whether the finger is rotated or not, since a proper positioning of the finger is mandatory for high fingerprint matching rates. A test set of 9000 acquired images has being used to train, validate and test a set of multilayer Artificial Neural Network classifiers. To our knowledge, there is no definitive method that addressed the problem of fingerprint quality on touchless multiview scanners. The proposed finger rotation detection here presented is one of the steps that must be taken into account if a future automatic image quality assessment method is to be considered. Average results show that: our classifier correctly identifies bad-positioning in approximately 98.50% of cases; and if bad-positioning is detected, the rotation angle is correctly estimated in 95.25% evaluations.
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Características agronômicas de genótipos de quinoa em diferentes altitudes e densidades de semeaduraAnchico Jojoa, Wilson 05 March 2018 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2018. / Submitted by Fabiana Santos (fabianacamargo@bce.unb.br) on 2018-09-28T22:17:50Z
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Previous issue date: 2018-10-08 / Fundação de Apoio a Pesquisa do Distrito Federal (FAP-DF). / O incremento da população humana tem demandado aumento na produção de alimentos em sistemas agrícolas ambientalmente sustentáveis. Os novos desafios requerem a seleção de cultivos que demandem menos insumos e, ao mesmo tempo, possam satisfazer a deficiência nutricional predominante em algumas regiões. Com o intuito de incrementar a produção de alimentos de qualidade, no contexto de mudança climática, a quinoa (Chenopodium quinoa Willd) tem se mostrado como alternativa a países que sofrem de insegurança alimentar. A quinoa é reconhecida não só por suas propriedades nutritivas e dietéticas, mas também por sua diversidade genética e capacidade de adaptação a diferentes condições agroambientais, bem como os benefícios culturais e socioeconómicos que tem sobre o ambiente produtivo. Este trabalho teve como objetivo: avaliar a biometria e comparar as características agronômicas de 15 genótipos de quinoa, em diferentes altitudes e densidades de plantio na Colômbia. Neste contexto, a área experimental para o ensaio foi dividida em dois locais entre 1100 e 1850 m de altitude. Utilizou-se desenho estatístico de blocos ao acaso com parcelas subdivididas. As parcelas foram compostas por onze genótipos selecionados procedentes do Brasil, e quatro genótipos comerciais, dois procedentes da Colômbia e dois procedentes do Equador. Cada parcela foi subdividida em duas distâncias de semeadura, uma de 0,6 m entre fileiras e 0,3 m entre plantas e a outra de 0,6 m entre fileiras e semeadura em sulco, com densidade de 25 plantas/m. Para analise dos dados utilizou-se o programa GENES. Segundo os resultados do experimento os requerimentos térmicos, características fenológicas e componentes de rendimento dos genótipos de quinoa evidenciaram adaptabilidade ao cultivo. A elevada variabilidade genotípica evidencia potencial no melhoramento genético para contornar limitações dos fatores abióticos que afetam o desenvolvimento da quinoa. / Population growth requires an increase in food production along with a move to environmentally sustainable agriculture. The new challenges require the selection of crops that require less inputs and, at the same time, can satisfy the nutritional deficiency prevalent in some regions. Faced with the challenge of increasing the production of quality food to feed the world population in the context of climate change, quinoa (Chenopodium quinoa Willd) is an alternative to food insecure countries. Quinoa is recognized not only for its nutritional and dietary properties, but also for its genetic diversity and adaptability to different agro-environmental conditions, as well as the cultural and socio-economic benefits it has on the local environment. The objective of this work was to evaluate the biometry and to compare the agronomic characteristics of 15 quinoa genotypes on different altitudes and densities in Colombia. In this context, the experimental area for the trial was divided into two sites between 1100 and 1850 m altitude. A statistical design of randomized blocks with subdivided plots was used. The plots were composed of eleven progenies selected from Brazil, and four commercial progenies, two from Colombia and two from Ecuador. Each plot was subdivided into two sowing distances, one of 0.6 m between rows and 0.3 m between plants and the other one of 0.6 m between rows and furrow seeding. The statistical tool for data analysis was the GENES program. According to the results of the experiment the thermal requirements, phenological characteristics and yield components of the quinoa genotypes evaluated showed potential and flexibility in the adaptability. High genotype variability was also found in the experiments, presenting a potential in the genetic improvement as an alternative in the limitations of the factors which affect the development of cultivars.
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Mangalarga Marchador : estudo morfométrico, cinemático e genético da marcha batida e da marcha picada /Fonseca, Mayara Goncalves January 2018 (has links)
Orientador: Guilherme de Camargo Ferraz / Coorientador: Amanda Piaia Silvatti / Banca: Adalgiza Souza Carneiro de Rezende / Banca: Rogerio Abdallah Curi / Banca: Fernanda Nascimento de Godoi / Banca: Paulo Aléscio Canola / Resumo: Considerando a importância nacional da raça Mangalarga Marchador (MM) e sua crescente internacionalização, estudos que avaliam diferentes aspectos de seus andamentos singulares, marcha batida (MB) e marcha picada (MP), são necessários. Os objetivos desse estudo foram descrever e comparar as variáveis cinemáticas (VCine) da MB e da MP e verificar associações entre as medidas morfométricas e as VCine de equinos da raça MM; avaliar a influência do alelo mutante do DMRT3 em homozigose (AA) ou heterozigose (AC) no padrão de movimento da MP; identificar, por meio de estudo amplo de associação do genoma (GWAS), polimorfismos de nucleotídeo único (SNPs) e regiões genômicas que contenham possíveis genes responsáveis pelo fenótipo da MB na raça MM. Para análise cinemática, dezoito câmeras optoeletrônicas (240 Hz) foram posicionadas para a aquisição dos dados tridimensionais de três marcadores retrorreflexivos fixados no casco. Determinou-se duração, comprimento, frequência e velocidade de cada passada; dissociação relativa diagonal de decolagem e de apoio; e distribuição do tempo da passada em cada tipo de apoio (quadrupedal, tríplice, bipedal, monopedal e suspensão). Quarenta e oito cavalos pertencentes aos dois grupos de andamentos distintos: MP com genótipo AA e AC do SNP 22999655C>A (n=20) e MB com genótipo CC (n=28) foram analisados por meio do Equine SNP70 BeadChip e em seguida realizado GWAS. Para caracterização cinemática dos andamentos, os dados foram submetidos à analise desc... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Considering the national significance of the Mangalarga Marchador (MM) breed and its increasing internationalization, studies that evaluate different aspects of their singular gaits, marcha batida (MB) and marcha picada (MP) are necessary. The objectives of this study were to describe and compare the kinematic variables (VCine) of MB and MP and to verify associations between the morphometric measurements and the VCine of MM horses; to evaluate the influence of the mutant allele of DMRT3 on homozygous (AA) or heterozygosis (AC) in the MP movement pattern; to identify, through genome-wide association study (GWAS), single nucleotide polymorphisms (SNPs) and genomic regions containing possible genes responsible for the phenotype of the MB in MM breed. For kinematic analysis, eighteen optoelectronic cameras (240 Hz) were positioned to acquire the three-dimensional data of three retroreflective markers fixed to the hooves. Duration, length, frequency and speed of each stride; diagonal advanced placement and lift-off and support phases (quadrupedal, tripedal, bipedal, Monopedal and suspension) were determined. Fortyeight horses belonging to the two gait groups, MP with AA and AC genotypes of the 22999655C>A SNP (n = 20) and MB with CC genotype (n = 28), were analyzed using the Equine SNP70 BeadChip and then performed GWAS. For kinematic characterization of the gaits, the data were submitted to descriptive analysis. For comparison between females and males, and for comparison between... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor
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Modelagem da função de incidência cumulativa na presença de riscos competitivos em análise de sobrevivência / Modeling the cumulative incidence function in the presence of competing risks in survival analysisTomaz, Flávia Sílvia Corrêa 12 December 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-03-22T16:23:15Z
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Previous issue date: 2017-12-12 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Minas Gerais / Riscos competitivos surgem em situações em que um indivíduo pode falhar devido à várias causas distintas. Na presença de riscos competitivos a estimação e/ou avaliação do efeito de covariáveis sobre a função de incidência cumulativa (subdistribuição) frequentemente é de interesse. Essa função quantifica a probabilidade de um indivíduo experimentar um evento específico, ou seja, falhar devido a uma determinada causa dentre um conjunto de causas de falha. A estimação não paramétrica da função de incidência, por vezes, é obtida por meio do complemento do estimador de Kaplan-Meier, embora esse procedimento não seja adequado e procedimento apropriado para este propósito esteja disponível. No que se refere a modelagem do efeito de covariáveis sobre a função de incidência, abordagens comumente difundidas baseiam-se ou no risco específico por causa ou no risco da subdistribuição. A primeira ignora a presença dos riscos competitivos, enquanto a segunda leva em consideração os riscos competitivos e frequentemente utiliza o modelo de Fine e Gray. Embora existam alternativas ao modelo de Fine e Gray, estas são pouco discutidas. Neste sentido, o objetivo deste trabalho foi avaliar a estimação da função de incidência cumulativa, bem como verificar como a censura e a relação entre proporção de eventos competitivos afetam a estimação dessa função. Ademais objetivou-se avaliar três modelos de regressão para a função de incidência (modelo de regressão com ligação logarítmica, modelo de regressão com ligação logit e modelo de Fine e Gray). Além de um conjunto de dados reais sobre lesões em cavalos foi utilizado também um estudo de simulação. Os resultados encontrados reforçam relatos encontrados na literatura, que apontam a superestimação da função de incidência cumulativa quando a mesma é estimada como complemento do estimador de Kaplan-Meier, bem como a não correspondência entre os efeitos das covariáveis estimados com base no risco específico por causa e o baseado no risco da subdistribuição. Por meio do estudo de simulação constatou-se que a percentagem de censura bem como a relação entre os eventos competitivos afeta a estimação da função de incidência cumulativa. Verificou-se também, que, em geral, o modelo de regressão com ligação logarítmica mostrou-se uma alternativa ao modelo de Fine e Gray. / Competing risks arise in situations where an individual may fail due to several different causes. In the presence of competing risks the estimation and / or evaluation of the effect of covariates on the cumulative incidence function (subdistribution) is often of interest. This function quantifies the probability of an individual experiencing a specific event, that is, failure due to a cause within a set of causes of failure. The non-parametric estimation of the incidence function is sometimes obtained through the complement of the Kaplan-Meier estimator, although this procedure is not adequate and an appropriate procedure for this purpose is available. With regard to modeling of the effect of covariates on the incidence function, commonly disseminated approaches are based either on the cause-specific hazard or at the subdistribution hazard. The former ignores the presence of competing risks, while the latter takes into account competing risks and often uses the Fine and Gray model. Although there are alternatives to the Fine and Gray model, these are little discussed. In this sense, the objective of this work was to evaluate the estimation of the cumulative incidence function, as well as to verify how the censorship and the relation between the proportion of competitive events affect the estimation of this function. In addition, we evaluated three regression models for the incidence function (regression model with log-link function, regression model with logit-link function and Fine and Gray model). In addition to a set of real data on injuries in horses was also used a simulation study. The results found reinforce reports found in the literature, which point to the overestimation of the cumulative incidence function when it is estimated to complement the Kaplan-Meier estimator, as well as the non match between the effects of covariates estimated based on the cause specific hazard and the of subdistribution hazard. By means of the simulation study it was verified that the percentage of censorship as well as the relation between the competitive events affects the estimation of the function of cumulative incidence. It was also found that, in general, the regression model with log-link function was an alternative to the Fine and Gray model.
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