Orientador: Aricio Xavier Linhares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituo de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T15:49:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_CarinaMarade_M.pdf: 1457552 bytes, checksum: 6cd38fc74da441a111a04348ee418d6d (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Devido ao aumento no número de mortes relacionadas ao abuso de drogas, o conhecimento da interferência destas substâncias sobre o desenvolvimento de certas espécies de insetos necrófagos torna-se de grande importância, especialmente quando a estimativa do intervalo pós-morte (IPM) usa como base a idade do inseto. Além disso, esta metodologia é uma valiosa alternativa para determinar a causa da morte, quando o corpo encontra-se em avançado estágio de decomposição. Assim, o presente estudo objetivou avaliar o efeito de diferentes concentrações de esteróides anabólico-androgênicos (EAA), comumente usados para aumento da massa muscular, sobre a taxa de desenvolvimento de Chrysomya putoria (Wiedemann), C. albiceps (Wiedemann) e C. megaacephala (Fabricius) (Diptera: Calliphoridae). Dois delineamentos experimentais foram feitos: um somente com a substância decanoato de nandrolona (Deca-Durabolin®) e outro associando decanoato aos ésteres de testosterona (Durateston®). Imaturos obtidos de colônias de moscas adultas estabelecidas em laboratório foram depositados em potes plásticos contendo dieta artificial para montagem dos grupos experimentais, sem (grupo controle) e com adição de esteróides. Cada tratamento foi repetido seis vezes. O ganho de massa foi registrado para grupos de 10 larvas, em intervalos de 12 h, até que atingissem o estágio de pupa. Além disso, foram medidos a viabilidade larval, a taxa e o intervalo de emergência. ANOVA de um critério e teste de comparações múltiplas de Duncan foram feitos para comparar o efeito dos EAA, associados ou não em diferentes e crescentes concentrações, sobre o desenvolvimento larval usando o ganho de massa como variável resposta. Diferenças significativas não foram observadas quanto ao tempo de desenvolvimento e intervalo de emergência para todas espécies tratadas, mas houve nítida heterogeneidade quanto às curvas de desenvolvimento, quando associados os dois EAA para C. putoria e C. albiceps. A viabilidade larval e a emergência de C. putoria foram significativamente afetadas pela associação de EAA, com valores inferiores aos apresentados pelo controle. Frente ao decanoato, C. putoria apresentou inicialmente maior ganho de massa, contudo, em idades mais avançadas, os imaturos expostos à droga obtiveram menor média de massa corpórea que o controle. Para C. albiceps a maior concentração de decanoato afetou negativamente o ganho de massa durante todo o desenvolvimento larval. A análise do ganho de massa, por hora, indicou diferenças significativas no período compreendido entre 36 e 84 h entre grupos controle e com adição de EAA associados, o que levaria a erro no cálculo do IPM, se esta condição não fosse considerada. / Abstract: Due to increase of deaths related to drug abuse, the knowledge of the interference of these substances on the development of certain necrophagous insects species can be very important, especially when the estimative of the postmortem interval (PMI) is based on insect age. Furthermore, they are valuable alternatives to determine the cause of death, when the body is in an advanced stage of decomposition. The present study aimed to evaluate the effect of different concentrations of anabolic-androgenic steroids (AAS), commonly used to increase muscle mass, on the developmental rate of Chrysomya putoria (Wiedemann), C. albiceps (Wiedemann) and C. megaacephala (Fabricius) (Diptera: Calliphoridae). Two experimental designs were made: one only with nandrolone decanoate (Deca-Durabolin®) and another with decanoate associated to ester of testosterone (Durateston®). Immatures obtained from adult flies colonies established in lab were placed in plastic vials containing an artificial rearing diet for assembly of experimental groups, without (control group) and with addition of steroids. Each treatment was replicated six times. The mass gain was recorded for groups of 10 larvae at 12h-intervals until they reached the pupal stage. In addition, we measured the larval viability, the rate and interval of emergency. ANOVA one way and Duncan's multiple comparison test were made to compare the effect of the EAA, associated or not in different and increased concentrations on the developmental larval using the mass gain as dependent variable. Significant differences were observed regarding the developmental time and interval of emergency for all threatened species, but there was a clear heterogeneity on the developmental curves for C. putoria and C. albiceps by the EAA association. The larval viability and the emergence rates of C. putoria were significantly affected by the EAA association, with rates lower than control group. Initially, C. putoria rearing in decanoate showed greater weight gain, however, at older ages, immatures obtained a lower average weight than control. For C. albiceps the highest concentration of decanoate negatively affected mass gain during the larval development. The mass gain analysis, per hour, indicated significant differences from 36 to 84 h between control and EAA groups, which could lead to incorrect estimation of the PMI, if this condition was not considered. / Mestrado / Mestre em Parasitologia

Submitted by Jorge Silva (jorgelmsilva@ufrrj.br) on 2017-07-11T18:28:41Z No. of bitstreams: 1 2012 - Renata da Silva Mello.pdf: 1215608 bytes, checksum: 4aa180e59be574ab4757238ec8087e62 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-11T18:28:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2012 - Renata da Silva Mello.pdf: 1215608 bytes, checksum: 4aa180e59be574ab4757238ec8087e62 (MD5) Previous issue date: 2012-03-20 / CAPES / Calliphorids are insects of medical-sanitary i and forensic entomology, contributing mainly to estimate the minimum post mortem interval. Therefore, studies on population dynamics under different abiotic conditions, as well as investigations on diperan control are very important. This study was divided into four chapters that approached the subject from different perspectives. The first two chapters are related to post-embryonic development of Chrysomya megacephala and Chrysomya albiceps submitted to different photoperiods (L0:D24, L12:D12, L16:D8, L24:D0). These species responded differently, however both species had a faster development for the different stages and their viabilities were higher in the 24h scotophase ( 24 hours of darkness) when compared to the other photoperiods. There was a trend for deceleration of the development as the photophase increased and it was evident for the larval stage of the both species. However, in C. albiceps was more pronouced for newly- larvae hatched to adult period, presenting a difference of up to four days between the shorter photophase (L0:D24) and the longer photophase (L24:D0). The total period of development of C. megacephala was shorter when the 24hscotophase was compared to the others. Therefore, it was possible to infer that the different photoperiods presented a circadian rhythm of emergence with distinct daily emergence rate, suggesting that this phenomenon was primarily regulated by an endogenous circadian clock, even if they presented modulations by photophases. In the third chapter, the aim was to investigate the biological aspects of Nasonia vitripennis (Pteromalidae) when the female explored hosts buried at different depths ranging from 0.0 to 5.0 cm at 0.5 cm intervals, for two periods of exposition: 24 and 48h. It was observed that two factors, period of exposition and pupation depths, caused differences in the parasitoid progeny and had a relation of dependence. For the group exposed for 48h, the pupae were parasitized only when buried up to 2.0 cm depth, however, for the group exposed for 72h, the parasitic capacity of parasitoids reached pupae buried up to 3.0 cm deep. The group exposed for 48h had a decreasing number of female emerged per pupae as the depth increased. This trend was not observed for the group exposed for 72h. The number of male emerged per pupae did not differ among the depths and periods of expositions. The sex deviation was higher for female for both exposure periods and for all depths. In the fourth chapter was the effect of a cornoside extracte from Parahancornia amapa (Apocynaceae) on post-embryonic development of Chrysomya putoria and progeny of N. vitripennis was investigated. The larval weigh and post-embryonic developmental period of C. putoria were not affected, with exception for the pupal development that was slower with the treatment with 5% cornosideo when compared to the control (distilled water). The newly-hatched larvae to adult period presented a viability of around 60 % for boths treatments. In relation to to the effect of the cornosideo on progeny of the parasitoids the following parameters were analysed: number of parasitoids emerged per pupae, sex ratio and developmental period. None of these were affected in comparison to the control group. The lack of effect of 5% cornoside on calliphorid flies may be a negative aspect when control is being concerned. However the lack of effect on the parasitoid, used as natural controllers of calliphoridas, is a / Califor?deos apresentam import?ncia m?dica-sanit?ria e tamb?m na entomologia forense, pois auxiliam a data??o do intervalo p?s-morte. Desta forma, estudos relativos ? din?mica populacional em diferentes condi??es abi?ticas, bem como investiga??es sobre m?todos de controle destes d?pteros s?o de suma import?ncia. O presente estudo foi dividido em quatro cap?tulos que abordaram o tema por diferentes perspectivas. Os dois primeiros cap?tulos foram relativos ao desenvolvimento de Chrysomya megacephala e Chrysomya albiceps submetidas a diferentes fotoper?odos (L0:E24, L12:E12, L16:E8, L24:E0). Estas esp?cies responderam distintamente, no entanto ambas as esp?cies submetidas ?s 24h de escotofase tiveram desenvolvimento mais acelerado em suas diferentes fases imaturas e as viabilidades foram maiores em rela??o aos demais fotoper?odos. Houve uma tend?ncia para desacelara??o do desenvolvimento ? medida que a fotofase foi aumentada, isto foi bem evidente para a fase larval em ambas as esp?cies. Embora, em C. albiceps foi mais pronunciado no per?odo de neolarva a adulto, havendo uma diferen?a de at? quatro dias entre a menor (L0:E24) e a maior fotofase (L24:E0). Em C. megacephala houve diferen?a somente quando o grupo submetido ?s 24h de escotofase foi comparado aos demais fotoper?odos, tendo o desenvolvimento mais acelerado. Foi poss?vel inferir que o ritmo de emerg?ncia teve periodicidade circadiana, embora com taxas di?rias de emerg?ncia distintas nos diferentes fotoper?odos. No terceiro cap?tulo objetivou-se investigar aspectos biol?gicos de Nasonia vitripennis (Pteromalidae) quando expostas aos hospedeiros enterrados em diferentes profundidades, variando de 0,0 a 5,0 cm, a cada 0,5 cm, por dois per?odos, 24h e 48h. Observou-se que a explora??o do pup?rio foi influenciada pelos dois fatores, tempo e profundidade, havendo uma rela??o de depend?ncia entre eles. Em 48h de exposi??o foram observados pup?rios parasitados somente at? a profundidade de 2,0 cm, por?m em 72h a capacidade parasit?ria foi at? 3,0 cm. Houve um decr?scimo do n?mero de f?meas emergidas por pupa com o aumento das profundidades em 48h, no entanto esta tend?ncia n?o foi observada em 72h. O n?mero de machos por pupa n?o diferenciou entre as profundidades e nem entre os dois tempos de exposi??o. Houve um desvio da raz?o sexual para f?meas em ambos os tempos de exposi??o e em todas as profundidades. No quarto cap?tulo foi investigada a a??o do cornos?deo, a fra??o metan?lica do l?tex de Parahancornia amapa (Apocynaceae), sobre o desenvolvimento de Chrysomya putoria e sobre a prog?nie de N. vitripennis. Foi observado que o peso larval e o tempo de desenvolvimento p?s-embrion?rio de C. putoria n?o foram alterados, com exce??o do per?odo pupal que foi mais lento no tratamento com cornos?deo a 5% quando comparado ao grupo controle (?gua destilada). A viabilidade de neolarva a adulto foi em torno de 60% para ambos os tratamentos. Quanto ? influ?ncia do cornos?deo sobre a prog?nie dos parasit?ides, o n?mero de parasit?ides, raz?o sexual e tempo de desenvolvimento n?o foram alterados quando comparados ao controle. P?de se dizer que o cornos?deo a 5% n?o exerceu efeito sobre os califor?deos, aspecto negativo para o controle, e nem tampouco em seus controladores naturais, aspecto positivo.

Orientador: Patricia Jacqueline Thyssen / Texto em português e inglês / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T17:11:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nassu_MarianaPrado_M.pdf: 4567544 bytes, checksum: 960ea243ca753828c2fce7d481fa59ff (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: A terapia larval (TL) consiste na aplicação de larvas estéreis de moscas necrófagas (Diptera) sobre lesões crônicas ou infectadas visando promover ou acelerar o processo de cicatrização. Para garantir segurança e sucesso, dois fatores tem de ser alcançados: a esterilidade das larvas que serão utilizadas e a confirmação de que a espécie, durante o seu processo de alimentação, consumirá apenas tecido necrosado. No presente estudo, pretendeu-se avaliar se a espécie Cochliomyia macellaria F. (Calliphoridae), de ampla distribuição em território brasileiro, pode ser uma excelente candidata para aplicação da TL, levando em conta seu comportamento e biologia. Foi avaliada a esterilização e a viabilidade pós-esterilização de larvas de C. macellaria em hipoclorito de sódio (NaClO) a 0,5% por um e por três minutos. Adicionalmente, lesões foram induzidas em ratos Wistar, para avaliar a qualidade e o tempo de cicatrização frente a diferentes tipos de tratamento. Para tanto, foram montados cinco grupos experimentais, sendo que em um deles os animais não foram submetidos a qualquer tipo de tratamento, e em outro foi feito desbridamento mecânico. Também foi avaliada qual a densidade larval (5, 15 ou 25 larvas/cm2) mais apropriada para obter melhor qualidade de cicatrização e, ao mesmo tempo, menor período de aplicação, visando adequar a TL a um atendimento do tipo ambulatorial, isto é, sem internação. O processo de cicatrização foi avaliado qualitativamente (a partir da mensuração de certos parâmetros associados às lesões) e quantitativamente (tempo). Fragmentos de pele foram coletados antes do tratamento e 12 h, 7 dias e 14 dias pós-tratamento, e processados para análise histológica. Em relação ao comportamento, foi observado que os imaturos de C. macellaria se alimentaram apenas de tecido necrosado. O uso de solução de NaClO a 0,5% por três minutos é o mais recomendado para obtenção de larvas estéreis com alta taxa de viabilidade. Não houve diferença significativa nos tempos de cicatrização entre os grupos experimentais. Contudo, foi observado que na relação de 25 larvas/cm2 houve um maior grau de vascularização nos tecidos, quando comparado aos demais tratamentos. Os mecanismos envolvidos nesse processo ainda são desconhecidos, mas concluiu-se que as larvas tem um importante papel na modulação da resposta imunológica do hospedeiro, sendo promissor o seu uso, provavelmente, em maiores densidades do que o preconizado na literatura / Abstract: Larval therapy (LT) is the application of sterile larvae of carrion flies (Diptera) on chronic or infected wounds to promote or accelerate the healing process. To ensure safety and success two aspects must be met: the sterility of the larvae and confirmation that the species consume only necrotic tissue during the feeding process. The present study intended to evaluate whether the species Cochliomyia macellaria F. (Calliphoridae), widely distributed in Brazil, could be a viable candidate for application of LT, taking into account their behavior and biology. Sterilization and post-sterilization viability of larvae of C. macellaria were evaluated after being treated with sodium hypochlorite (NaClO) at 0.5% during one and three minutes. Additionally, lesions were induced in Wistar rats to evaluate the healing quality and healing time against different types of treatment. For that, the rats were divided in five experimental groups, in one of them the animals were not subjected to any treatment and in another only mechanical debridement was performed. It was also evaluated which larval density (5, 15 or 25 maggots/cm2) is the most suitable for better quality of healing and at the same time, shorter period of application, in order to improve the LT to an outpatient care type, that is, without hospitalization. The healing process was assessed qualitatively (from the measurement of certain parameters associated with injuries) and quantitatively (time). Skin fragments were collected before treatment and 12 h, 7 days and 14 days post-treatment, and processed for histological analysis. Regarding the behavior, it was observed that immature C. macellaria fed only of necrotic tissue. The use of NaClO 0.5% solution for three minutes is the most recommended to obtain sterile larvae with high viability rate. There was no significant difference in healing times between the experimental groups. However, it was observed that in the group of 25 maggots/cm2 there was a higher degree of vascularization in tissues, as compared to other treatments. The mechanisms involved in this process are unknown, but it appears that the larvae have an important role in modulating the host immune response, and their use in higher density than that recommended in the literature is probably promising / Mestrado / Relações Antrópicas, Meio Ambiente e Parasitologia / Mestra em Biologia Animal

Orientador: Arício Xavier Linhares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-25T23:06:38Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferraz_DaniloRibeiro_M.pdf: 2070808 bytes, checksum: 257105fe3aaa84a8abe9acf46006298a (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Os insetos apresentam importância do ponto de vista forense, possibilitando coletar evidências e informações essenciais à justiça. Para o aprimoramento das aplicações da entomologia forense é de extrema importância que sejam realizados estudos relacionados a fisiologia, taxonomia, ecologia, comportamento e distribuição da entomofauna decompositora. Dentre os insetos necrófagos, califorídeos (Diptera) apresentam grande destaque, pois produtos de origem animal são substratos para oviposição e fonte de proteínas e carboidratos para adultos, além de constituir recurso alimentar para larvas de algumas espécies. Os califorídeos passam por diferentes fases de desenvolvimento ovariano sendo que, nos estágios intermediários de desenvolvimento, há intensa deposição de vitelo pelas células tróficas. Assim, com fim de contribuir para um maior entendimento fisiológico e comportamental da família, o presente estudo objetiva avaliar e comparar sua riqueza, observando o padrão de atratividade exercido sobre moscas varejeiras por três diferentes substratos de origem animal (frango, peixe e roedor), bem como os estágios de desenvolvimento ovariano no qual os espécimes coletados se encontravam. Ao todo foram coletados 12.332 espécimes, dos quais 1.432 pertenciam a Calliphoridae. As iscas de moela de frango foram mais atrativas a ordem Diptera, ao passo que a família Calliphoridae foi mais atraída por iscas de roedor. Neste trabalho, 803 fêmeas foram dissecadas, sendo que grande parte destas fêmeas encontravam-se em estágio de vitelogênese completa demostrando a importância da proteína animal como substratos para oviposição / Abstract: Insects are of great forensic importance because they can serve as evidence and provide essential information to justice. In order to improve the applications of forensic entomology, it is of great important to study the biology, ecology, physiology, taxonomy, behavior and distribution of insect fauna associated to decomposing animal matter. Among the scavenger insects, the calliphorids (Diptera) are very important, because many species utilize animal tissues as source of protein and for immature development. Baits of animal origin can act as substrat for oviposition and as source of proteins and carbohydrates for the adults and for larval development feeding .Ovaries of calliphorids undergo different ovarian development phases from the pre-viteloogenic stage to mature eggs. Intermediate phases are characterized by deposition of yolk by the nurse cells. Thus, this study, aimed to contribute to the understanding of the physiological and behavioral characteristics of species of calliphorids, presenting and comparing species richness, attractiveness patterns of three different baits of animal origin these flies (chicken gizzard, fish and rat) as well as the stages of ovarian development in which the collected specimens were found. In all, 12,332 specimens were collected, of which 1,432 belonged to Calliphoridae. The rodent bait was the most attractive to this family while chicken gizzard was more attractive to Diptera as a whole. In this work, 803 females were dissected. The majority of these were in the stage of mature egg, indicating the use of the substracts for oviposition, although this pattern changed depending on the species analyzed / Mestrado / Biodiversidade Animal / Mestre em Biologia Animal

Orientador: Arício Xavier Linhares / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-21T03:37:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rezende_Fabio_M.pdf: 2094464 bytes, checksum: d1870c6b30f983e3d34cc084165c6f12 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: O aumento no número de óbitos relacionados ao uso de drogas justifica o interesse por estudos entomotoxicológicos. Estes estudos devem focar a obtenção de dados diversos sobre a entomofauna necrófaga que contribuam para a formação de um banco de dados que auxilie em investigações criminais, principalmente quando a estimativa do intervalo pós-morte (IPM) é baseada na idade do inseto, visto que a mesma pode sofrer alteração quando uma dada substância interfere no ciclo de insetos que tenham se alimentado dos tecidos cadavéricos onde tais substâncias estão presentes. Assim, no presente estudo objetivou-se verificar o efeito de diferentes concentrações de Cloridrato de Metilfenidato isolado e associado ao Fenobarbital na taxa de desenvolvimento, sobrevivência e longevidade de imaturos de Chrysomya putoria (Wiedemann), Chrysomya albiceps (Wiedemann) e Chrysomya megacephala (Fabricius) (Diptera: Calliphoridae), quando acrescidos em dieta artificial oferecida como único substrato para seu desenvolvimento. Os imaturos foram obtidos a partir de colônias de moscas adultas mantidas em condições controladas de temperatura e umidade em laboratório. Foram feitas seis réplicas para cada grupo experimental, com 150 espécimes de cada espécie em questão, perfazendo um total de 900 larvas por espécie. Além disso, um grupo controle (sem adição da droga) foi mantido sob as mesmas condições de criação. Os imaturos foram pesados individualmente a cada 12h, sendo retirados 10 espécimes de cada grupo, desde as 12 horas após a eclosão até a pupariação. ANOVA de um fator foi realizada para comparar o efeito dos tratamentos no desenvolvimento dos imaturos, usando como resposta o ganho de massa larval. O teste de comparações múltiplas de Duncan também foi realizado para comparar as médias e apontar possíveis diferenças entre os grupos. As duas substâncias alteraram a taxa de desenvolvimento de todas as espécies estudadas, ampliando em até dois dias o tempo total de desenvolvimento dos imaturos. Desse modo seria recomendável que exames toxicológicos para a detecção de drogas em larvas fossem realizados invariavelmente para evitar erros quanto à estimativa do IPM, quando este for baseado no ciclo de desenvolvimento de insetos / Abstract: The increase on the number of deaths related to drug abuse justifies the interest in entomotoxicological studies. These studies are focused on obtaining data on the necrophagous insect fauna which contribute to the formation of a database to help in criminal investigations, especially when the estimate of the postmortem interval (PMI) is based on the age of immature necrophagous insect, since it can be altered when a given substance interferes with the larval development of insects that have fed on tissues containing this substance. The present study was aimed to evaluate the effect of different concentrations of methylphenidate hydrochloride isolated and associated with phenobarbital on the developmental rate, survival and longevity of immatures of Chrysomya putoria (Wiedemann), Chrysomya albiceps (Wiedemann) and Chrysomya megacephala (Fabricius ) (Diptera: Calliphoridae), reared in artificial diets with different concentrations of the drugs and offered as substrate for their development. The immatures were obtained from colonies of adult flies maintained under controlled temperature and humidity in the laboratory. Six replicates were performed for each experimental group, with 150 specimens of each species of blowfly, comprising a total of 900 larvae per group. In addition, a control group was maintained under the same conditions established for the other groups. Ten specimens of each group were removed and individually weighed every 12 hours, from 12 hours after hatching to pupariation. One-way ANOVA was performed to compare the effect of treatment on development of immatures, using larval weight as response variable. The Duncan Multiple Comparison Test was also performed to compare the means and to identify possible differences among the groups. The two substances were responsible for altering the rate of development of all species studied, retarding up to two days the total developmental time of the immatures. Thus, it is recommended that toxicological tests should be performed to detect drugs eventually present on larvae collected from corpses, in order to prevent errors in the estimation of IPM, when it is based on the developmental cycle of immature saprophagous insects / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Parasitologia

Indiana University-Purdue University Indianapolis (IUPUI) / The black blow fly, Phormia regina (Diptera: Calliphoridae), is a widely abundant fly autochthonous to North America. Like many other Calliphorids, P. regina plays a key role in several disciplines particularly in estimating post-mortem intervals (PMI). The aim of this work was to better understand the population genetic structure of this important ecological species using microsatellites from populations collected in the U.S. during 2008 and 2013. Additionally, it sought to determine the effect of limited genetic diversity on a quantitative trait throughout immature development; larval length, a measurement used to estimate specimen age. Observed heterozygosity was lower than expected at five of the six loci and ranged from 0.529-0.880 compared to expected heterozygosity that ranged from 0.512-0.980, this is indicative of either inbreeding or the presence of null alleles. Kinship coefficients indicate that individuals within each sample are not strongly related to one another; values for the wild-caught populations ranged from 0.033-0.171 and a high proportion of the genetic variation (30%) can be found among samples within regions. The population structure of this species does not correlate well to geography; populations are different to one another resulting from a lack of gene flow irrespective of geographic distance, thus inferring temporal distance plays a greater role on the genetic variation of P. regina. Among colonized samples, flies lost much of their genetic diversity, ≥67% of alleles per locus were lost, and population samples became increasingly more related; kinship coefficient values increased from 0.036 for the wild-caught individuals to 0.261 among the F10 specimens. Colonized larvae also became shorter in length following repeated inbreeding events, with the longest recorded specimen in F1 18.75 mm in length while the longest larva measured in F11 was 1.5 mm shorter at 17.25 mm. This could have major implications in forensic entomology, as the largest specimen is often assumed to be the oldest on the corpse and is subsequently used to estimate a postmortem interval. The reduction in length ultimately resulted in a greater proportion of individuals of a similar length; the range of data became reduced. Consequently, the major reduction in genetic diversity indicates that the loss in the spread of length distributions of the larvae may have a genetic influence or control. Therefore, this data highlights the importance when undertaking either genetic or development studies, particularly of blow flies such as Phormia regina, that collections of specimens and populations take place not only from more than one geographic location, but more importantly from more than one temporal event.

Orientador: Patrícia Jacqueline Thyssen / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-17T13:21:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Grella_MaiconDiego_M.pdf: 5100969 bytes, checksum: 37d1acc8cdeb7eba3791c8e14b39db4d (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: Muitos levantamentos faunísticos de dípteros que foram e têm sido realizados atualmente no Brasil são precários por relatarem a presença de espécimes até níveis taxonômicos superiores ao de espécie. Dentre uma série de dificuldades que contribuem para isso estão a ausência de chaves taxonômicas para certos grupos e a insuficiência na descrição de caracteres em algumas das chaves existentes. Assim, o avanço de quaisquer outros trabalhos que queiram investigar a biologia, ecologia ou dinâmica desses organismos na natureza ou em laboratório estará comprometido, já que não é possível associar tais estudos a categorias abstratas tal como 'morfotipos'. As chaves taxonômicas interativas, elaboradas com auxílio de programas computacionais, quando comparadas às convencionais podem ser extremamente vantajosas por apresentarem banco de imagens, glossário de termos técnicos, serem mais dinâmicas no processo de inserção de novos caracteres, além de permitirem ao usuário a seleção de qualquer caráter sem uma ordem pré-determinada, garantindo maior flexibilidade durante o processo de identificação. Para elaboração das chaves interativas usando a plataforma JAVA e software Lucid® foram levantados caracteres e estados de caracteres para 20 espécies de moscas (Diptera: Calliphoridae) registradas para o Brasil, quer sejam de importância médica, veterinária ou forense. A identificação de algumas espécies de califorídeos usando a plataforma computacional não foi significativamente mais rápida quando comparada a feita por meio das chaves dicotômicas tradicionais, porém o número de erros de diagnóstico foi menor entre os usuários de chaves interativas. De qualquer modo, a chave interativa ainda pode ser superior por apresentar opções tais como exclusão, seleção ou priorização de caracteres sem exigir que o usuário siga uma ordem específica ou pré-determinada. O desenvolvimento de quaisquer ferramentas que auxiliem na busca pela identificação de um organismo, principalmente entre estudantes e profissionais não taxonomistas, é ainda mais valioso por fornecer um melhor entendimento para o conhecimento da diversidade de determinados grupos e para a descoberta de espécies novas na natureza. O trabalho final encontra-se disponível e publicado na web / Abstract: Many of the dipteran faunistic surveys carried out in the past, and the ones being conducted at the present in Brazil are precarious, because they report on the presence of specimens at taxonomic levels higher than species. The reasons for that are the lack of taxonomic keys to certain groups, and insufficient descriptions of morphological characters in some of the extant keys. Thus, the success of any study that aims to investigate the biology, ecology, and dynamics of these organisms in nature or in laboratory will be damaged, because it is not possible to associate these studies with abstract categories such as 'morphotypes'. Interactive taxonomic keys, prepared with the aid of computer programs, can be extremely advantageous when compared to conventional keys, because they contain image banks, glossary of technical terms, are more dynamic in the process of adding new characters, and allow the selection of any character without a predetermined order, ensuring greater flexibility during the identification process. For the production of interactive keys using JAVA platform and Lucid¿ software, we determined characters and states of characters for 20 species of flies (Diptera: Calliphoridae) of medical, veterinary and forensic importance from Brazil. The identification process using a Java platform was not significantly faster when compared to that done by traditional dichotomous keys, but the number of diagnostic errors was lower among users of interactive keys. Anyway, the interactive key may be superior to present options such as deletion, selection or prioritization of characters without requiring the user to follow a specific or predetermined order. The development of any tools that can aid in the identification of an organism, especially for students and non-taxonomist professionals, is even more valuable by providing a better understanding on the diversity of certain groups and on the discovery of new species in nature. The final work will be available and posted on the web / Mestrado / Parasitologia / Mestre em Parasitologia

Orientadores: Ana Maria Lima de Azeredo-Espin, Nilson Ivo Tonin Zanchin / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-19T22:51:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marinho_MarcoAntonioTonus_D.pdf: 17816653 bytes, checksum: e915a871c22b7741c1be765f87c95ff5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: A superfamília Oestroidea (Diptera:Brachycera:Calyptratae), com +13.000 espécies descritas, compreende um dos grupos mais numerosos e ecologicamente diversos da ordem Diptera. O grupo possui grande interesse para atividades humanas por englobar espécies de importância médica, veterinária e forense, muitas das quais compõem a família Calliphoridae. Apesar do grande número de estudos disponíveis, as relações evolutivas no grupo, o qual é composto predominantemente por linhagens de rápida diversificação e radiação, ainda são controversas e pouco compreendidas, encorajando a caracterização de novos marcadores moleculares para análises de filogenia molecular. Neste contexto, esta tese foi desenvolvida e organizada em três capítulos descrevendo estudos genéticoevolutivos em espécies da superfamília Oestroidea, com ênfase em Calliphoridae. O primeiro capítulo trata da caracterização e avaliação do segundo espaçador transcrito interno (ITS2) do DNA ribossomal como um marcador molecular para análises filogenéticas em Calliphoridae, incorporando informações tanto da sequência primária quanto da estrutura secundária adquirida pela região. A análise do ITS2 revelou um padrão hierarquicamente organizado das distâncias genéticas nos níveis de espécies, gêneros e subfamílias, enquanto pouca variação intra-específica foi encontrada. As árvores inferidas recuperaram muitas das relações comumente aceitas entre os táxons amostrados, sendo que a inclusão da informação estrutural nas análises resultou na recuperação de topologias mais confiáveis. Sendo assim, o potencial da região ITS2 como um marcador molecular para análises evolutivas na família Calliphoridae foi confirmado e seu uso em análises de maior escala, incluindo marcadores de diferentes naturezas de evolução, encorajado. O segundo capítulo da tese descreve a caracterização in vitro da estrutura secundária adquirida pelo ITS2, através de padrões de digestão enzimática e análise dos fragmentos gerados, em espécies representantes das três superfamílias de Calyptratae: Glossina morsitans, Musca domestica e Cochliomyia hominivorax. A análise do padrão de fragmentos gerados pelas enzimas RNAse I, A, T1 e V1, quando mapeados na estrutura secundária predita in silico, corroborou muitos dos domínios inicialmente preditos pelo método computacional, ressaltando a importância e confiabilidade desses métodos na predição de estruturas secundárias. O terceiro capítulo da tese descreve análises de filogenia molecular na superfamília Oestroidea, com ênfase na amostragem de espécies de Calliphoridae, utilizando quatro marcadores moleculares, dois nucleares (ITS2 e 28S) e dois mitocondriais (COI e 16). As análises, que incluíram uma extensa avaliação dos efeitos de diferentes estratégias de particionamento dos dados em análises de inferência Bayesiana (por conformação estrutural e posição no códon), revelaram a existência de dois clados principais em Oestroidea: Tachinidae + Mesembrinellinae e Oestridae + Rhiniinae + Sarcophagidae + Calliphoridae (definida em senso estrito). O status de família recentemente atribuído à Rhiniinae foi encontrado, enquanto há também evidências para sugerir o mesmo para a subfamília Mesembrinellinae, como proposto anteriormente por outros autores. As diferentes estratégias de particionamento do conjunto de dados amostrados resultaram em diferenças discretas em termos de topologia, comprimentos de ramo e suporte geral das filogenias inferidas. Embora o resultado geral indique uma melhor resolução das análises quando do uso de combinações de partições e modelos mais complexas, as mesmas podem ocasionar também um aumento considerável na incerteza associada às análises / Abstract: The Oestroidea superfamily (Diptera: Brachycera: Calyptratae), with +13,000 described species, comprises one of the most numerous and ecologically diverse groups in the Diptera order. The group is actually of great interest for human activities since it includes species of medical, veterinary and forensic importance, most of them included in the Calliphoridae family. Despite the existence of several studies addressing the issue, evolutionary relationships in Oestroidea, a group mainly composed of rapidly diverged lineages, remains contentious and poorly understood, encouraging the characterization of new molecular markers for phylogenetic inference analyses. In this context, this thesis was developed and organized in three chapters describing genetic and evolutionary studies in species of the Oestroidea superfamily, with emphasis in Calliphoridae. The first chapter deals with the characterization and evaluation of the second internal transcribed spacer region (ITS2) of the ribosomal DNA cluster as a molecular marker for phylogenetic inference in Calliphoridae, including information of both primary sequence and secondary structure. The analyses revealed an hierarchically organized pattern of genetic distances in the specific, generic and subfamilial level, while little intraspecific variation was detected. Inferred trees were able to recover most of the commonly accepted relationships among the sampled taxa, with the consideration of structural information resulting in better supported topologies. Thereby, the potential of the ITS2 region as a molecular marker for phylogenetic inference in the Calliphoridae family was corroborated and its use in larger scale analyses, including other markers with different evolutionary patterns, encouraged. Chapter II describes the in vitro characterization of the secondary structure of the ITS2 region, through patterns of enzymatic digestion and analysis of the generated fragments, in representative species of the three superfamilies of the Calyptratae clade: Glossina morsitans, Musca domestica and Cochliomyia hominivorax. Analyses of the patterns of the fragments generated by enzymatic digestions with the RNAses I, A, T1 and V1, when mapped in the in silico predicted secondary structure, corroborated the folding of most of the domains predicted by computational methods, highlighting the importance and reliability of these methods in secondary structure prediction. Chapter III describes molecular phylogenetic analyses in the Oestroidea superfamily, with emphasis on the Calliphoridae family, using four different molecular markers, two nuclear (ITS2 and 28S) and two mitochondrial (COI and 16S) regions. The analyses, which included a comprehensive evaluation of the effects of different data partitioning strategies in a Bayesian framework (by structural conformation and codon position), revealed the existence of two main clades in Oestroidea: Tachinidae+Mesembrinellinae and Oestridae+Rhiniinae+Sarcophagidae+Calliphoridae (defined in a strict sense). The recently attributed family status to Rhiniinae was confirmed, and there are evidence to also suggest the same for Mesembrinellinae, as previously pointed out by other studies. The different data partitioning strategies used in the sampled dataset resulted in small differences in terms of inferred topologies, estimated branch lengths and average support. Although the overall results indicate a significant increase in phylogeny resolution when more complex and parameter-rich models / partitions combinations are used, they can also lead to an increased uncertainty in the phylogenetic estimation process / Doutorado / Genetica Animal e Evolução / Soutor em Genética e Biologia Molecular

Indiana University-Purdue University Indianapolis (IUPUI) / Phormia regina (Meigen), commonly known as the black blow fly is a dipteran that belongs to the family Calliphoridae. Calliphorids play an important role in various research fields including ecology, medical studies, veterinary and forensic sciences. P. regina, a non-model organism, is one of the most common forensically relevant insects in North America and is typically used to assist in estimating postmortem intervals (PMI). To better understand the roles P. regina plays in the numerous research fields, we re-constructed its genome using next generation sequencing technologies. The focus was on generating a reference genome through de novo assembly of high-throughput short read sequences. Following assembly, genetic markers were identified in the form of microsatellites and single nucleotide polymorphisms (SNPs) to aid in future population genetic surveys of P. regina. A total 530 million 100 bp paired-end reads were obtained from five pooled male and female P. regina flies using the Illumina HiSeq2000 sequencing platform. A 524 Mbp draft genome was assembled using both sexes with 11,037 predicted genes. The draft reference genome assembled from this study provides an important resource for investigating the genetic diversity that exists between and among blow fly species; and empowers the understanding of their genetic basis in terms of adaptations, population structure and evolution. The genomic tools will facilitate the analysis of genome-wide studies using modern genomic techniques to boost a refined understanding of the evolutionary processes underlying genomic evolution between blow flies and other insect species.