Orientador: João Carlos Pinheiro Ferreira / Resumo: O uso do sêmen refrigerado proporciona maiores taxas de prenhez se comparado ao do sêmen congelado. Essa diferença parece estar relacionada às lesões mais severas das membranas espermáticas desencadeadas pelo processo de congelação. Por sua habilidade de se ligar às proteínas ligadoras de espermatozoides e ao íon cálcio, o caseinato de sódio vem sendo estudado como uma substância capaz de inibir a capacitação espermática precoce, uma importante causa de diminuição da taxa de prenhez quando do uso de sêmen congelado. O primeiro objetivo deste estudo foi avaliar a possibilidade de um diluente comercial a base de gema de ovo, destinado à congelação de sêmen bovino, ser empregado para a criopreservação de sêmen bubalino; o segundo objetivo foi investigar o efeito do uso desse diluente, suplementado com caseinato de sódio, na criopreservação de espermatozoides bubalinos, por meio da avaliação dos espermatozoides, por citometria de fluxo, e da cinética espermática, empregando-se o sistema CASA. Na primeira parte do estudo, quando comparados os resultados das avaliações da cinética espermática e integridade das membranas plasmática e acrossomal, observou-se que o processo de congelação seminal promoveu mais danos celulares que o processo de refrigeração. Na segunda parte do estudo, não foram observados efeitos da adição do caseinato de sódio ao diluente a base de gema de ovo. A partir dos resultados do presente estudo foi possível concluir que o diluente a base de gema de ovo testad... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The use of cooled semen results in higher pregnancy rates compared than the use of frozen semen. This result seems to be related to the more severe damages triggered by the freezing process, when compared to those observed during the refrigeration. Due to its ability to bind to sperm-binding proteins and calcium ions, sodium caseinate has been studied as a ubstance capable to prevent early sperm capacitation, a major cause of decreased pregnancy rate after using frozen semen. The first objective of this study was to evaluate if a commercial egg yolk diluent developed for freezing bovine semen could be used for buffalo semen cryopreservation; the second objective was to investigate the effect of this diluent, added with sodium caseinate, during the procedures of buffalo sperm cryopreservation, using flow cytometry and computer-assisted sperm analysis. In the first part of the study, comparing the results of spermatic kinetics and plasma and acrosomal membranes integrity, it was observed that the freezing process resulted in more cell damage than the cooling process. In the second part of the study, no effects of the addition of sodium caseinate to the egg yolk diluent were observed. From the results of the present study it was possible to conclude that the egg yolk-based diluent was suitable for buffalo semen cryopreservation and that the addition of sodium caseinate did not decrease the deleterious effects related to seminal cryopreservation. / Mestre

Orientador: Maria Elisabete Jorge Amaral / Banca: Herminone Elly Melara de Campos Bicudo / Banca: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Eliana Morielle Versute / Banca: Artur Luiza da Costa da Silva / Resumo: O cromossomo 1 do genoma bubalino (BBU1), o maior cromossomo do cariótipo do búfalo de rio, é um cromossomo submetacêntrico que possui homologia com os cromossomos 1 e 27 do genoma bovino. Neste trabalho, apresentamos o primeiro mapa RH para este cromossomo, construído por meio da utilização de um painel de células somáticas híbridas irradiadas búfalo-roedor, denominado BBURH5000. O mapa consistiu em 69 marcadores derivados dos cromossomos bovinos BTA1 e BTA27, incluindo 48 genes codificantes, 17 microssatélites e quatro ESTs distribuídos em dois grupos de ligação. A freqüência de retenção observada entre os marcadores variou de 17.8% a 52.2%. A ordem dos marcadores dentro dos grupos de ligação foi, em sua maioria, idêntica a ordem encontrada nos mapas RH e de seqüência do genoma bovino. A análise comparativa do mapa RH obtido para BBU1 com o genoma humano revelou oito blocos homólogos de sintenia entre BBU1 e segmentos correspondentes dos cromossomos humanos 3, 4, 8 e 21, sendo a maioria deles rearranjados quanto à ordem dos genes e orientação dos blocos. Os blocos de sintenia também foram comparados com os genomas de outras espécies de mamíferos, como boi, chimpanzé, cachorro e cavalo. Considerando a inexistência de mapas de ligação para o búfalo de rio, o mapa RH obtido neste estudo fornece dados essenciais para os estudos comparativos deste cromossomo com qualquer outra espécie de mamífero. / Abstract: The largest chromosome in the river buffalo karyotype, BBU1, is a submetacentric chromosome with reported homology between BBU1q and bovine chromosome 1 and between BBU1p and BTA27. We present the first radiation hybrid map of this chromosome containing 69 cattle derived markers including 48 coding genes, 17 microsatellites and four ESTs distributed in two linkage groups. The RH map was constructed based on the analysis of a recently developed river buffalo-hamster whole genome radiation hybrid panel (BBURH5000). The retention frequency of individual markers across the panel ranged from 17.8% to 52.2%. With few exceptions, the order of markers within linkage groups is identical to the order established for corresponding cattle sequence and RH maps. Comparative analysis between BBU1-RH5000 and the human genome revealed eight homologous synteny blocks corresponding to HSA3q, HSA4q, HSA8p and HSA21q. Most of the blocks showed rearrangements in the gene order and in the orientation of the synteny blocks. The synteny blocks were also compared with other mammalian genomes, such as bovine, chimpanzee, dog and horse. Considering that a genetic linkage map does not exist for river buffalo, the radiation hybrid map generated in this study provides valuable data for comparative mapping of BBU1 chromosome. / Doutor

Orientador: Maria Elisabete Jorge Amaral / Coorientador: Nedenia Bonvino Stafuzza / Banca: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Banca: Luciane Madureira de Almeida / Resumo: No presente estudo, cinco novos genes codificantes de proteínas foram selecionados para o mapeamento do cromossomo 6 bubalino (BBU6). Os novos genes (muc1, ppp1r7, psmd4, tshb e gtf2b) foram testados com a tecnologia de PCR resultando em produtos de PCR adequados ao mapeamento utilizando-se um painel de células somáticas híbridas irradiadas, denominado BBURH5000. Os resultados obtidos mostraram uma freqüência de retenção (FR) do produto de PCR de cada gene nas diferentes linhagens do painel com variação de 13,3% (gtf2b) a 26,6% (psmd4). A análise comparativa entre os mapas RH do BBU6 e a sequência do cromossomo 3 bovino permitiu indicar a localização dos novos genes no cromossomo 6 bubalino / Abstract: In this study, five new protein coding genes were select for mapping buffalo chromosome 6. The new genes (muc1, ppp1r7, psmd4, tshb and gtf2b) were tested using PCR technology resulting in PCR products suitable for mapping using a radiation hybrid panel (BBURH5000). The retention frequency of the PCR products in each hybrid cell line of the panel showed the percentage from 13,3% (gtf2b) to 26,6% (psmd4). Comparative analysis between the buffalo chromosome 6 RH map and the sequence from bovine chromosome 3 allowed to assign the location of the new genes on buffalo chromosome 6 / Mestre

Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Rúsbel Raúl Aspilcueta Borquis / Banca: Guilherme Costa Venturini / Banca: Nedenia Bonvino Stafuzza / Resumo: A identificação de genes que influenciam características de produção e composição do leite tem sido o foco de vários estudos nos últimos anos, como o caso do gene candidato DGAT1, reconhecidamente envolvido com o conteúdo de gordura no leite sendo de grande interesse para o melhoramento de rebanhos leiteiros. Outro gene importante, o A2M, apresenta associação aos processos celulares do sistema imune, como a contagem de células somáticas (CCS), diretamente ligada à qualidade do leite e saúde dos animais. Nesse contexto, objetivou-se verificar a existência de polimorfismos em regiões específicas dos dois genes descritos e possíveis associações na produção de leite e seus constituintes em bubalinos. Para tanto, um grupo de animais formado inicialmente por 200 búfalas foi avaliado. Amostras de folículos pilosos dos referidos animais foram utilizadas para extração de DNA. Mediante PCR, foram amplificados fragmentos que, posteriormente, foram analisados através do sequenciamento. Foram identificados SNPs, avaliadas as frequências alélicas e genotípicas, foi realizado o teste de desequilíbrio de ligação e também, análises de variância dos efeitos dos SNPs. Foram identificados ao todo seis SNPs, sendo que apenas três encontravam-se em região codificante, dois no éxon 17 do gene DGAT1 (SNP 162G/A e 164C/T) e um no éxon 29 do gene A2M (SNP 241A/G). O SNP 164C/T apresentou associação com as características porcentagem de gordura e porcentagem de proteína no leite em nível de 5% de significância, já o SNP 241A/G além de apresentar associação com as mesmas características, apresentou também com a característica produção de gordura. Diante desses resultados, supõe-se a relação dos SNPs encontrados e identificados nas regiões codificantes do DNA com características de composição e qualidade do leite, podendo, estes SNPs serem utilizados como marcadores ... / Abstract: The search for genes that affect milk yield and composition traits has been the aim of many studies in recent years, as the case of candidate gene DGAT1, admittedly involved with the fat content in milk being of great interest to breeders of dairy herds. Another important gene, A2M, has association with cellular processes of the immune system, such as somatic cell count (SCC), directly linked to milk quality and animal health. The aim of the present study was to verify the existence of polymorphisms in this two genes and their effects in composition and milk yield traits in breed buffaloes (Bubalus bubalis). The sample was constituted by 200 buffaloes cows. Hair were used for the extraction of DNA. After PCR, the samples were analyzed by sequencing techniques. Were found six SNPs, but only three in the coding region, two in exon 17 of the DGAT1 gene (SNP 162G/A and 164C/T) and one in exon 29 of the gene A2M (SNP 241A/G ). The SNP 164C/T was associated with the characteristics fat percentage and protein percentage in milk at 5% significance, since the SNP 241A/G besides having association with the same characteristics, also presented with the characteristic fat production. Before addition, is supposed there may be some relation of this SNPs and characteristics of composition from milk like, production and percents of fat and protein in to the milk. Therefore, it can be completed these SNPs can be used as moleculars markers in MAS in buffaloes / Mestre

Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Fernando Sebástian Baldi Rey / Coorientador: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Vera Fernanda Martins Hossepian de Lima / Banca: Manoel Victor Franco Lemos / Banca: Simone Eliza Facioni Guimarães / Banca: André Luís Ferreira Lima / Resumo: Características reprodutivas em fêmeas e machos possuem grande participação econômica em sistemas produtivos de grandes ruminantes. A busca por mutações putativo-causais em genes candidatos pode ajudar a melhorar a acurácia de predição de valores genômicos quando inseridas em chips de baixa densidade a um menor custo. Assim, o objetivo desse estudo foi identificar mutações em genes candidatos e anomalia cromossômica associadas à fertilidade de fêmeas e machos de bovinos de corte e bubalinos. As técnicas laboratoriais utilizadas para identificar os genótipos dos animais foram PCR-sequenciamento, qPCR e sondas Taqman. O gene JY-1 apresentou um indel interespecífico que causa alteração do quadro de leitura de aminoácidos para bovinos e bubalinos, podendo estar associado a diferenças reprodutivas entre as duas espécies. Os genes JY-1 e NCOA2 tiveram polimorfismos significativos para as características de probabilidade de prenhez precoce, dias para o parto e idade ao primeiro parto em vacas da raça Nelore. Observou-se que a anomalia do cromossomo Y está em baixíssima frequência em população de vacas Brahman e não está associada à fertilidade. Por fim, os genes LOC100138021, CENPI, TAF7L, CYLC1, TEX11, AR, UXT, PLAG1 e SPACA5 tiveram SNPs significativos para características de produção normal de espermatozoides e circunferência escrotal em bovinos Composto Tropical e Brahman. Assim, encontraram-se potenciais SNPs para a confecção de chips de baixa densidade para características de fertilidade em bovinos / Abstract: Reproductive and andrological traits have an important participation in the profitability of ruminants production systems. The search for putative causative mutations in candidate genes may increase the accuracy of genomic values predictions when inserted in low density chips at a lower cost. So, the aim of this study was to identify mutations in candidate genes and a chromossomal anomaly associated to fertility in cattle and buffaloes males and females. The laboratorial techniques used to identify were PCR-sequencing, qPCR and Taqman probes. The JY-1 gene presented an interspecific indel that causes alteration on the frameshift in the aminoacids comparing cattle and buffaloes that might be associated to reproductive differences between the two species. The genes JY-1 and NCOA2 had significant polymorphisms for precocity at 16 months, days to calving and age at first calving in Nelore cows. The Y anomaly was detected in a low frequency in the Brahman cow population and it is not associated to the fertility. The genes LOC100138021, CENPI, TAF7L, CYLC1, TEX11, AR, UXT, PLAG1 and SPACA5 had SNPs associated with production of normal sperm and scrotal circumference in Tropical Composite and Brahman cattle. So, putative SNPs to customize low density chips were found to fertility traits in cattle / Doutor

Orientador: Humberto Tonhati / Coorientador: Gregório Miguel Ferreira de Camargo / Coorientador: Naudin Alejandro Hurtado Lugo / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: Considerando a importância das doenças que afetam o desempenho produtivo dos animais na indústria leiteira em todo o mundo é necessário implementar ferramentas moleculares que auxiliem na identificação e controle destas doenças. Quando ocorre alguma infecção em um organismo superior, existe aumento do número de células de defesa e o sistema imune inato proporciona uma linha de defesa contra os patógenos. Os "Toll Like Receptors" (TLR) são proteínas da membrana que desempenham um papel chave na imunidade, reconhecendo patógenos e, posteriormente, ativando as respostas. O presente estudo foi realizado para identificar SNPs no gene TLR4 bubalino e analisar suas associações com características de importância produtiva, incluindo a contagem de células somáticas (CCS). Foram utilizadas amostras de DNA de 130 búfalas da raça Murrah. A região codificante do gene TLR4 foi amplificada através de reações de PCR e posteriormente sequenciada. Os polimorfismos encontrados tiveram suas frequências alélicas e genotípicas calculadas e verificadas quanto ao equilíbrio de Hardy-Weinberg, além de serem utilizados para os estudos de associação. Foram identificados 13 polimorfismos do tipo SNP para as regiões sequenciadas do gene TLR4, sendo que a maioria encontra-se em região codificante. Encontrou-se associação significativa, com porcentagem de gordura dos Snps g514>C/T (P=0,0040) e g536>A/T (P=0,0035). As associações para CCS demostrou-se altamente significantes (p=<0,001) para todos os Snps (g... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Molecular markers might be developed to investigate genetic variants associated to the disease and assist selection process in order to identify resistant animals. When the mammary gland is infected, there is an increase in the defense cells, also called somatic cells. It is a defense line of the immune system against pathogens. The "tool like receptors" TLR are membrane proteins that have an important role in the immunity, recognizing pathogens and activating adequate responses. The present study aimed to investigate the association of TLR4 gene SNPs with productive characteristics and SCC in buffaloes. The DNA was extracted from hair follicules of 130 Murrah buffaloes. The fragments were amplified by Polymerase Chain Reaction (PCR) and sequenced. Thirteen SNPs were found. Allelic and genotypic frequencies were calculated as well as the adhesion to Hardy-Weinberg equilibrium and the linkage disequilibrium (r2) and the association to the characteristic. For SCC was tested methodology linear generalized mixed model, assuming Poisson distribution. Bonferroni correction was applied for the number of SNPs. Thirteen SNP polymorphisms were identified in coding region of the TLR4 (g322>G/A, g514>C/T, g536>A/T, g8338>A/C, g8341>A/G, g8342>T/G, g8343>G/A, g8345>A/G, g8413>A/G, g8428>G/A, g8438>A/C, g8578>G/T, g8582>A/C). The SNPs g514>C/T and g536>A/T had significant association whit %G. All the SNPs were associated (p=0.001) whit the CCS. Other authors also reported the association of TRL4 SNPs to the trait. The results show that the SNPs of TLR4 gene can be used as molecular markers in buffaloes / Mestre

Orientador: André Mendes Jorge / Banca: Paulo Roberto de Lima Meirelles / Banca: Cristiana Andrighetto / Resumo: Objetivou-se com esse estudo avaliar o método de suplementação de 20 bovinos [(Nelore; 10 + 1 mês de idade e 220 + 33kg de peso vivo (PV) iniciais] e 20 bubalinos [Murrah; 10 + 1 mês de idade e 206 + 29kg (PV) iniciais] recriados em pasto de Urochloa brizantha cv. Xaraés, suplementados (0,6% PV) ou não (controle). Foram realizadas pesagens dos animais no início do estudo (0d) e nos dias 28, 56 e 84, para o cálculo do ganho de peso (GP), ganho médio diário (GMD), e coletas de amostras de sangue para determinação da glicose plasmática. Medidas da altura de garupa (AG), escore de condição corporal (ECC), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS; 12a costela) e espessura de gordura da garupa (EGG) foram determinadas no início (0d) e no final (84d) do estudo. Foi realizada avaliação do comportamento ingestivo (tempo no cocho, ruminação, ócio e ingestão de água) considerando o tempo dispendido com cada evento. Custos dos diferentes tratamentos foram calculados. Não houve interação entre espécie e tratamento. Os bovinos apresentaram valores superiores (P < 0,01) de PV0d, PV28d, PV56d, PV84d, GPtotal, GMD28d, GMD56d, GMD84d, GMDtotal, AG0d, AG84d, AOL84d (P = 0,04), custo total/cabeça (P = 0,03) e lucro/cabeça/ha, quando comparados aos bubalinos. Enquanto que maiores valores (P < 0,01) de ECC0d, ECC84d, EGS0d, EGS84d, EGG0d, EGG84d, tempo de permanência no cocho, quantidade de água ingerida (P < 0,01), e consumo percentual de suplemento foram atribuídos aos bubalinos. Foi detectado efeito do tratamento (P < 0,01) para as características de PV0d, PV28d, PV56d, PV84d, GPtotal, GMD28d, GMD56d, GMD84d, GMDtotal, ECC84d, AOL84d, custo total/cabeça, ganho/@, receita/cabeça, para as quais os animais suplementados apresentaram maiores valores quando comparados aos animais controle. Conclui-se que o grupo genético bovino se destacou quanto aos ganhos de ... / Abstract: The objective of this study was evaluate the supplementation method of 20 beef cattle [Nelore; 10 + 1 month of age and 220 + 33kg body weight (BW)] and 20 buffaloes [Murrah water buffalo, 10 + 1 month of age and 206 + 29kg body weight (BW)] growing in (Urochloa brizantha cv. Xaraés) receiving supplementation (0.6% BW), or not (control). Animals were divided in two treatment groups (n = 10 animals of each genetic group for each treatment). Body weight were conducted at the beginning of the experiment (0d) and 28, 56 and 84 day, to determining weight gain (WG), average daily gain (ADG), and blood samples for determination of glucose. Hip height measurements (HH), body condition score (BCS), rib eye area (REA), backfat thickness - 12th rib (BF), rump fat thickness (RFT) were determined at the beginning (0d) and the end (84d) of the study. The evaluation of feeding behavior was conducted (trough time, rumination, idleness and water intake) considering the time spent on each event. Cost of different treatments was calculated. There was no interaction between species and treatment.The beef cattle had higher values (P <0.01) of BW0d, BW28d, BW56d, BW84d, WGtotal, ADG28d, ADG56d, ADG84d, ADGtotal, HH0d, HH84d, REA84d (P = 0.04), total cost/head (P = 0.03) and income/head/ha when compared to buffaloes. Buffaloes had higher values (P < 0.01) of BCS0d, BCS84d, BF0d, BF84d, RFT0d, RFT84d, length of stay in the trough, water intake, and percentage supplement intake compared to beef cattle. Effect of treatment was detected (P < 0.01) for BW0d, BW28d, BW56d, BW84d, WGtotal, ADG28d, ADG56d, ADG84d, ADGtotal, BCS84d, REA84d, total cost/head, gain/@, income/head where supplemented animals showed higher values when compared to control animals. In conclusion, bovine genetic group excelled for weight gains while consuming a smaller proportion of ... / Mestre

Resumo: Este estudo buscou determinar através da utilização dos isótopos estáveis do carbono a fase em que o bezerro já está apto para ser desmamado e capaz de consumir alimentos sólidos. Para isso foram coletadas ao longo do período experimental amostras de fezes e sangue, para monitorar o comportamento do turnover do carbono em quatro bezerros bubalinos que recebiam dieta C3 em cocho privativo durante amamentação e leite proveniente de búfalas que se alimentavam de pasto C4. As análises isotópicas foram realizadas no Centro de Isótopos Estáveis do Instituto de Biociências da UNESP, campus de Botucatu. Para mensurar o turnover do carbono nos tecidos em determinado intervalo de tempo, foi utilizado o método sigmoidal de regressão de Boltzmann ou a função exponencial do tempo. Os resultados isotópicos das amostras dos animais que foram submetidos à análise por meio do modelo de Boltzmann ou equação exponencial evidenciaram a dinâmica de consumo do grupo durante os primeiros dias de vida. A meia-vida nas fezes do animal 1091 foi de 224,8 dias e no animal 1093 foi de apenas 61,2 dias, no sangue apenas no animal 1093 foi possível determinar a meia-vida, que foi de 125,6 dias e no plasma sangüíneo a meiavida do animal 1091 foi de 63,8 dias, no animal 1093 foi de 88 dias e no animal 1094 foi de 53,3 dias. Portanto, pode-se concluir que fezes não podem ser consideradas marcadores de digesta confiáveis para as condições deste estudo, apenas como indicadores de consumo. Plasma e sangue total foram eficientes em determinar o tempo de desmame para bubalinos Murrah. / Abstract : This study it searched to determine through the use of stable isotopes of carbon the phase where the year-old calf already is apt to be weaned and capable to consume solid foods. For this samples of blood and faeces had been collected throughout the experimental period, to monitor the behavior of turnover of carbon in four buffaloes year-old calves that received privative C3 diet during breast-feeding and milk proceeding from buffalos that if they fed of C4 grass. The isotopic analyses had been carried through in the Steady Isotope Center of the Institute of Biociências of the UNESP, campus of Botucatu. To measure turnover of carbon in fabrics in determined time interval, the sigmoid method of regression of Boltzmann or the exponential function of the time was used. The isotopic results of the samples of the animals that had been submitted to the analysis by means of the model of Boltzmann or exponential equation had evidenced the dynamics of consumption of the group during the first days of life. The stocking-life in faeces of animal 1091 was of 224,8 days and in animal 1093 it was of only 61,2 days, in the blood only in animal 1093 was possible to determine the stocking-life, that was of 125,6 days and in the plasma sanguine the stocking-life of animal 1091 was of 63,8 days, in animal 1093 it was of 88 days and in animal 1094 it was of 53,3 days. Therefore, it can be concluded that faeces cannot be considered true markers of digestibility for the conditions of this study, as only indicating of consumption... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Carlos Ducatti / Coorientador: André Mendes Jorge / Banca: Fabiana Ribeiro Caldara / Banca: Cyntia Ludovico Martins / Banca: Ciniro Costa / Banca: Alfredo Sampaio Carrijo / Doutor

Made available in DSpace on 2015-10-06T13:02:51Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-07-24. Added 1 bitstream(s) on 2015-10-06T13:19:25Z : No. of bitstreams: 1 000848614.pdf: 504190 bytes, checksum: 0005cac0b4ade1c82e250c93225a0aac (MD5) / Características reprodutivas em fêmeas e machos possuem grande participação econômica em sistemas produtivos de grandes ruminantes. A busca por mutações putativo-causais em genes candidatos pode ajudar a melhorar a acurácia de predição de valores genômicos quando inseridas em chips de baixa densidade a um menor custo. Assim, o objetivo desse estudo foi identificar mutações em genes candidatos e anomalia cromossômica associadas à fertilidade de fêmeas e machos de bovinos de corte e bubalinos. As técnicas laboratoriais utilizadas para identificar os genótipos dos animais foram PCR-sequenciamento, qPCR e sondas Taqman. O gene JY-1 apresentou um indel interespecífico que causa alteração do quadro de leitura de aminoácidos para bovinos e bubalinos, podendo estar associado a diferenças reprodutivas entre as duas espécies. Os genes JY-1 e NCOA2 tiveram polimorfismos significativos para as características de probabilidade de prenhez precoce, dias para o parto e idade ao primeiro parto em vacas da raça Nelore. Observou-se que a anomalia do cromossomo Y está em baixíssima frequência em população de vacas Brahman e não está associada à fertilidade. Por fim, os genes LOC100138021, CENPI, TAF7L, CYLC1, TEX11, AR, UXT, PLAG1 e SPACA5 tiveram SNPs significativos para características de produção normal de espermatozoides e circunferência escrotal em bovinos Composto Tropical e Brahman. Assim, encontraram-se potenciais SNPs para a confecção de chips de baixa densidade para características de fertilidade em bovinos / Reproductive and andrological traits have an important participation in the profitability of ruminants production systems. The search for putative causative mutations in candidate genes may increase the accuracy of genomic values predictions when inserted in low density chips at a lower cost. So, the aim of this study was to identify mutations in candidate genes and a chromossomal anomaly associated to fertility in cattle and buffaloes males and females. The laboratorial techniques used to identify were PCR-sequencing, qPCR and Taqman probes. The JY-1 gene presented an interspecific indel that causes alteration on the frameshift in the aminoacids comparing cattle and buffaloes that might be associated to reproductive differences between the two species. The genes JY-1 and NCOA2 had significant polymorphisms for precocity at 16 months, days to calving and age at first calving in Nelore cows. The Y anomaly was detected in a low frequency in the Brahman cow population and it is not associated to the fertility. The genes LOC100138021, CENPI, TAF7L, CYLC1, TEX11, AR, UXT, PLAG1 and SPACA5 had SNPs associated with production of normal sperm and scrotal circumference in Tropical Composite and Brahman cattle. So, putative SNPs to customize low density chips were found to fertility traits in cattle

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:23:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:30:02Z : No. of bitstreams: 1 000853088.pdf: 364929 bytes, checksum: 2b04105cefb597c55d2cf56272e18e71 (MD5) / Objetivou-se com esse estudo avaliar o método de suplementação de 20 bovinos [(Nelore; 10 + 1 mês de idade e 220 + 33kg de peso vivo (PV) iniciais] e 20 bubalinos [Murrah; 10 + 1 mês de idade e 206 + 29kg (PV) iniciais] recriados em pasto de Urochloa brizantha cv. Xaraés, suplementados (0,6% PV) ou não (controle). Foram realizadas pesagens dos animais no início do estudo (0d) e nos dias 28, 56 e 84, para o cálculo do ganho de peso (GP), ganho médio diário (GMD), e coletas de amostras de sangue para determinação da glicose plasmática. Medidas da altura de garupa (AG), escore de condição corporal (ECC), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS; 12a costela) e espessura de gordura da garupa (EGG) foram determinadas no início (0d) e no final (84d) do estudo. Foi realizada avaliação do comportamento ingestivo (tempo no cocho, ruminação, ócio e ingestão de água) considerando o tempo dispendido com cada evento. Custos dos diferentes tratamentos foram calculados. Não houve interação entre espécie e tratamento. Os bovinos apresentaram valores superiores (P < 0,01) de PV0d, PV28d, PV56d, PV84d, GPtotal, GMD28d, GMD56d, GMD84d, GMDtotal, AG0d, AG84d, AOL84d (P = 0,04), custo total/cabeça (P = 0,03) e lucro/cabeça/ha, quando comparados aos bubalinos. Enquanto que maiores valores (P < 0,01) de ECC0d, ECC84d, EGS0d, EGS84d, EGG0d, EGG84d, tempo de permanência no cocho, quantidade de água ingerida (P < 0,01), e consumo percentual de suplemento foram atribuídos aos bubalinos. Foi detectado efeito do tratamento (P < 0,01) para as características de PV0d, PV28d, PV56d, PV84d, GPtotal, GMD28d, GMD56d, GMD84d, GMDtotal, ECC84d, AOL84d, custo total/cabeça, ganho/@, receita/cabeça, para as quais os animais suplementados apresentaram maiores valores quando comparados aos animais controle. Conclui-se que o grupo genético bovino se destacou quanto aos ganhos de ... / The objective of this study was evaluate the supplementation method of 20 beef cattle [Nelore; 10 + 1 month of age and 220 + 33kg body weight (BW)] and 20 buffaloes [Murrah water buffalo, 10 + 1 month of age and 206 + 29kg body weight (BW)] growing in (Urochloa brizantha cv. Xaraés) receiving supplementation (0.6% BW), or not (control). Animals were divided in two treatment groups (n = 10 animals of each genetic group for each treatment). Body weight were conducted at the beginning of the experiment (0d) and 28, 56 and 84 day, to determining weight gain (WG), average daily gain (ADG), and blood samples for determination of glucose. Hip height measurements (HH), body condition score (BCS), rib eye area (REA), backfat thickness - 12th rib (BF), rump fat thickness (RFT) were determined at the beginning (0d) and the end (84d) of the study. The evaluation of feeding behavior was conducted (trough time, rumination, idleness and water intake) considering the time spent on each event. Cost of different treatments was calculated. There was no interaction between species and treatment.The beef cattle had higher values (P <0.01) of BW0d, BW28d, BW56d, BW84d, WGtotal, ADG28d, ADG56d, ADG84d, ADGtotal, HH0d, HH84d, REA84d (P = 0.04), total cost/head (P = 0.03) and income/head/ha when compared to buffaloes. Buffaloes had higher values (P < 0.01) of BCS0d, BCS84d, BF0d, BF84d, RFT0d, RFT84d, length of stay in the trough, water intake, and percentage supplement intake compared to beef cattle. Effect of treatment was detected (P < 0.01) for BW0d, BW28d, BW56d, BW84d, WGtotal, ADG28d, ADG56d, ADG84d, ADGtotal, BCS84d, REA84d, total cost/head, gain/@, income/head where supplemented animals showed higher values when compared to control animals. In conclusion, bovine genetic group excelled for weight gains while consuming a smaller proportion of ...