Made available in DSpace on 2013-08-07T19:12:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 000439112-Texto+Completo-0.pdf: 538880 bytes, checksum: 671e168d7e9a8ca0457a6099c1cea1de (MD5) Previous issue date: 2012 / Successional processes present complex relationships between abiotic and biotic factors. These processes influence the structure and functioning of the community, as well as the ecosystem. The Subclass Peritrichia is one of the largest groups in the Phylum Ciliophora. They can occupy various types of water bodies. However, despite their great diversity and common occurrence, they are poorly studied. In the present work we performed a one year survey of peritrich ciliates colonizing glass slides in the Lake Guaiba located in southern Brazil. We analyzed the population dynamics of the species composing the community, and correlated it with environmental factors. A total of 35 morphospecies of Peritrichia were found, of which at least six are undescribed. Results showed that the group presents high diversity and a complex successional organization, with different responses to environmental factors and days of exposure of the traps. / Processos de sucessão apresentam relações complexas entre fatores abióticos e bióticos. Esses processos influenciam a estrutura e funcionamento da comunidade, bem como do ecossistema inteiro. Ciliados da subclasse Peritrichia constituem um dos grupos com o maior número de espécies. Peritríquios podem ocupar vários tipos de corpos d'água. No entanto, mesmo com grande diversidade e sendo de ocorrência comum, são pouco estudados. No presente trabalho, foi realizado um estudo de um ano com os ciliados peritríquios colonizando lâminas de vidro em um ponto de amostragem no Lago Guaíba, localizado no estado do Rio Grande do Sul, sul do Brasil. Neste período, foi analisada a dinâmica populacional das comunidades de peritríquios, correlacionando-a com fatores ambientais. Um total de 35 morfoespécies, além de pelo menos 6 novas espécies foram encontradas. Os resultados mostram que o grupo possui complexa organização sucessional, com diferentes respostas a fatores ambientais e tempo de exposição das armadilhas.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 439112.pdf: 538880 bytes, checksum: 671e168d7e9a8ca0457a6099c1cea1de (MD5) Previous issue date: 2012-02-27 / Successional processes present complex relationships between abiotic and biotic factors. These processes influence the structure and functioning of the community, as well as the ecosystem. The Subclass Peritrichia is one of the largest groups in the Phylum Ciliophora. They can occupy various types of water bodies. However, despite their great diversity and common occurrence, they are poorly studied. In the present work we performed a one year survey of peritrich ciliates colonizing glass slides in the Lake Guaiba located in southern Brazil. We analyzed the population dynamics of the species composing the community, and correlated it with environmental factors. A total of 35 morphospecies of Peritrichia were found, of which at least six are undescribed. Results showed that the group presents high diversity and a complex successional organization, with different responses to environmental factors and days of exposure of the traps. / Processos de sucess?o apresentam rela??es complexas entre fatores abi?ticos e bi?ticos. Esses processos influenciam a estrutura e funcionamento da comunidade, bem como do ecossistema inteiro. Ciliados da subclasse Peritrichia constituem um dos grupos com o maior n?mero de esp?cies. Peritr?quios podem ocupar v?rios tipos de corpos d'?gua. No entanto, mesmo com grande diversidade e sendo de ocorr?ncia comum, s?o pouco estudados. No presente trabalho, foi realizado um estudo de um ano com os ciliados peritr?quios colonizando l?minas de vidro em um ponto de amostragem no Lago Gua?ba, localizado no estado do Rio Grande do Sul, sul do Brasil. Neste per?odo, foi analisada a din?mica populacional das comunidades de peritr?quios, correlacionando-a com fatores ambientais. Um total de 35 morfoesp?cies, al?m de pelo menos 6 novas esp?cies foram encontradas. Os resultados mostram que o grupo possui complexa organiza??o sucessional, com diferentes respostas a fatores ambientais e tempo de exposi??o das armadilhas.

Submitted by Caroline Falcao (caroline.rfalcao@ufpe.br) on 2017-05-25T17:27:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertacao Alejandro.pdf: 2660688 bytes, checksum: 955f967f57cbed1266ae0f604a24c884 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-25T17:27:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) Dissertacao Alejandro.pdf: 2660688 bytes, checksum: 955f967f57cbed1266ae0f604a24c884 (MD5) Previous issue date: 2014-02-06 / A presente dissertação de mestrado é composta por três capítulos, cada um constituindo um artigo a ser submetido para publicação. O primeiro deles consiste de uma revisão do conhecimento que se tem a respeito dos ciliados tintinídeos de águas nordestinas brasileiras. Para isso se consultou trabalhos publicados ao longo das quatro ultimas décadas, e que possuíam alguma relação com os tintinídeos, mesmo não tendo esses ciliados como principal objeto de estudo. Assim foram levantadas todas as espécies de tintinídeos que já possuem registro de ocorrência publicado para a região Nordeste do Brasil. Além das fontes bibliográficas utilizadas, também foram realizadas análises de amostras coletadas em algumas regiões costeiras dos Estados da Paraíba, Pernambuco e Bahia, aumentando a lista de espécies registradas para a região. A partir da consulta dos trabalhos publicados, um total de 91 espécies de tintinídeos foi registrado em águas nordestinas do Brasil. Com a análise das amostras esse número aumentou para 111 espécies, pertencentes a 32 gêneros e 16 famílias. Neste primeiro capítulo é apresentada uma lista das espécies registradas, identificando as regiões nas quais elas ocorrem e os trabalhos utilizados como fonte bibliográfica. O segundo capítulo consiste de um trabalho desenvolvido a fim de se estudar a estrutura da comunidade dos tintinídeos em três áreas recifais na região de Abrolhos, no Estado da Bahia. Em cada área foram delimitados dois pontos de coleta, um sobre os recifes e outro a 1 km de distancia dos recifes. As coletas foram realizadas a cada 6 horas, ao longo de um período de 24 horas, totalizando 8 amostras por área e 3 dias de amostragens (um para cada área). Os tintinídeos foram coletados através de arrastos subsuperficiais de rede de plâncton (20 m de abertura de malha, 30 cm de diâmetro de boca e 2 m de comprimento). Três hipóteses foram testadas: i) a estrutura da comunidade dos tintinídeos varia entre os períodos diurno/noturno; ii) a estrutura da comunidade dos tintinídeos varia em uma escala espacial curta (diferentes pontos em uma mesma área recifal); e iii) a estrutura varia em uma escala espacial de grande extensão (entre as diferentes áreas recifais amostradas). Um total de 24 espécies foi encontrado, sendo todas de distribuição nerítica, típica de águas quentes e cosmopolitas. Apenas a hipótese relacionada com a variabilidade em uma maior escala espacial não foi rejeitada. Existem diferenças significativas entre essas áreas (ANOVA p = 0,017). A existência de duas comunidades distintas de tintinídeos ficou bem evidenciada através de análises de agrupamentos realizadas com amostras e espécies. Existe uma comunidade típica das áreas mais próximas à costa, composta basicamente por espécies de lorica aglutinante e de distribuição nerítica, e outra típica das áreas mais “oceânicas”, formadas basicamente por espécies de lorica hialina e de distribuição cosmopolita e de águas quentes. O grande fator influenciando a comunidade dos tintinídeos na região de Abrolhos é a distância em relação à costa. No terceiro capítulo se estudou a estrutura da comunidade dos tintinídeos na região de Tamandaré, no Estado de Pernambuco. As coletas foram realizadas em uma estação, a cada maré vazante, ao longo de um período de 26 dias. Dados de temperatura, salinidade, teor de clorofila-a e quantidade de material particulado em suspensão foram coletados. Os tintinídeos foram coletados através de arrastos horizontais subsuperficiais de rede de plâncton (20 m de malha). Com o desenvolvimento do estudo tentou se responder as seguintes perguntas: i) existe variação na comunidade dos tintinídeos em um curto intervalo de tempo (período diurno/noturno) na região de Tamandaré? ii) existe algum tipo de influência do ciclo lunar sobre a comunidade dos tintinídeos nessa região? iii) qual fator hidrológico possui mais influência sobre a comunidade desses ciliados? Um total de 20 espécies de tintinídeos foi identificado, sendo a maioria de distribuição nerítica e do gênero Tintinnopsis. A estrutura da comunidade dos tintinídeos não variou em uma escala de tempo curta. Foram detectadas diferenças significativas entre as amostras das diferentes fases do ciclo lunar (Kruskal-Wallis p = 0,005), com as espécies respondendo de diferentes formas. Tintinnopsis nana, T. schotti e T.nucula apresentaram as variações mais pronunciadas. O material particulado em suspensão foi o parâmetro hidrológico de maior influência sobre a comunidade dos tintinídeos, tendo sido encontrada correlação negativa. Por outro lado, foi encontrada correlação positiva entre o material particulado em suspensão e o teor de clorofila-a presente na água. Contudo, o aumento da clorofila-a está associado a uma resposta de organismos fitoplanctônicos a maior atenuação da luz na água e não a um aumento na produtividade. Dessa forma, existe aumento no teor de clorofila, sem que haja aumento na disponibilidade de alimento para os tintinídeos, podendo chegar a haver diminuição nessa disponibilidade, o que levaria a redução da comunidade desses ciliados. / The following master thesis is composed of three chapters; each one of them is a complete scientific paper which is going to be submitted for publication. The first one consists of a review of the knowledge related to the tintinnid ciliates in Brazilian northeastern waters. We consulted not only papers directly focused on the tintinnid ciliates, but also papers related to the microzooplankton, but that mentioned the tintinnids in the results. These papers were published during the last four decades. We assembled all the tintinnid species that had been registered in these papers, as well as worked with samples collected in some coastal regions in the State of Paraíba and Pernambuco, in addition to samples collected in the region of Abrolhos, in the State of Bahia. Through the published papers, we found a total of 91 registered tintinnid species in the northeastern region of Brazil. With the analysis of the samples, this number was raised to 111 species, belonging to 32 genera and 16 families. In this first chapter we present a list of the registered species, providing also the regions where they were found and the papers used as the bibliographical source. The second paper consists of a work developed in order to study the tintinnid community structure in the Abrolhos region, in the State of Bahia. Three reef areas in the Abrolhos region were sampled. In each area, we delimited two sampling points; one located directly above the coral reefs, and the other nearly 1 km away from the reefs. The samplings were performed in each 6 hours, during 24 hours, totalizing 8 samples per area, and three days of field work (one for each area). The tintinnids were collected through subsurface hauls of a plankton net (20 m mesh-size, 30 cm of mouth diameter, and two meters of length). Three hypotheses related to possible variations in the community structure of these ciliates were tested: i) the tintinnid community structure varies in a short temporal scale (between diurnal and nocturnal periods); ii) the community structure varies in a short spatial scale (between different points within a same area); and iii) the community structure varies in a broad spatial scale (between different sampled areas). A total of 24 species was found. All the species was of neritic, warm-water and cosmopolitan distribution. Only the hypothesis related to the variation in a broader spatial scale was not rejected. There are significant differences between the three studied areas (ANOVA p = 0,017). A continent-ocean gradient was highlighted by the clustering of the samples and species. There is a community typical of the areas closer to the coast, which is composed mainly by neritic species of agglutinated loricae, and other community typical of the “more oceanic” areas, which is composed mainly by warm-water and cosmopolitan species of hyaline loricae. The main factor influencing the tintinnid community in the Abrolhos region is the distance from the coast. In the third chapter we studied the tintinnid community structure in the Tamandaré region, Pernambuco State. The samplings were performed each 12 hours in a fixed point during 26 days. Temperature, salinity, chlorophyll-a content and the quantity of particulate material in suspension were evaluated. The tintinnids were collected through horizontal subsurface plankton net (20 m mesh width) hauls. We tried to answer the following questions in the present study: i) Is there any degree of variation in the tintinnid community in a temporal short scale (diurnal and nocturnal periods) in the region of Tamandaré? ii) Does the lunar cycle influence the tintinnid community in some way in this region? iii) Which is the main hydrologic parameter influencing the tintinnid community structure in the Tamandaré region? A total of 20 tintinnid species was identified. Most of them are of neritic distribution, and belongs to the genus Tintinnopsis. No variation in the tintinnid community under a temporal short scale was detected. We found significant differences in the tintinnid community structure in relation to different stages of the lunar cycle (Kruskal-Wallis p = 0,005). The species present different patterns of variation following the lunar cycle. Tintinnopsis nana, T. schotti and T. nucula displayed the most noticeable variations. We found a negative correlation between the tintinnid and the particulate material in suspension; it was the hydrologic parameter with the strongest effect on the tintinnid community. We also found a positive correlation between the particulate material in suspension and the chlorophyll-a content in the water. The increase in the chlorophyll-a content is associated with a response of the phytoplanktonic organisms to the increased light attenuation, and is not related with an increase in production. There is then an increase in chlorophyll-a content, without any increase in the food availability for the tintinnids; a reduction in the food availability is also possible, what could lead to the biomass reduction of the tintinnid community.

Dissertação(mestrado) - Universidade Federal do Rio Grande, Programa de Pós–Graduação em Oceanografia Biológica, Instituto de Oceanografia, 2011 / Submitted by Cristiane Gomides (cristiane_gomides@hotmail.com) on 2013-12-16T03:06:44Z No. of bitstreams: 1 Priscila da Fonseca Teixeira.pdf: 335923 bytes, checksum: 69841da63959745c00a7a0e8b7859194 (MD5) / Approved for entry into archive by Sabrina Andrade (sabrinabeatriz@ibest.com.br) on 2013-12-18T18:10:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Priscila da Fonseca Teixeira.pdf: 335923 bytes, checksum: 69841da63959745c00a7a0e8b7859194 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-12-18T18:10:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Priscila da Fonseca Teixeira.pdf: 335923 bytes, checksum: 69841da63959745c00a7a0e8b7859194 (MD5) Previous issue date: 2011 / Na aqüicultura, o sistema sem trocas de água é eficiente e sustentável, permite manejar o balanço entre carbono e nitrogênio, e o desenvolvimento de microorganismos que contribuem na boa qualidade da água, alimentação e sobrevivência do organismo alvo do cultivo. No presente estudo, a composição e densidade de fitoplâncton e protozooplâncton em conjunto com variáveis físico-químicas foram avaliados em viveiros de cultivo de camarão Litopenaeus vannamei (Boone) em sistema sem troca de água em dois tratamentos, com e sem a adição de melaço como fertilizante de carbono. As amostras de água foram coletadas por um período de 70 dias (janeiro a abril de 2009) e os tratamentos apresentaram diferença significativa para o teor dos nutrientes fosfato, silicato e clorofila <20 μm. A clorofila foi dominada pela fração <20μm (>80%) nos dois tratamentos e alcançou os maiores valores (~400 μg L-1) no final do experimento. No viveiro com melaço houve um maior crescimento de cianobactérias filamentosas (Pseudoanabaena spp. e Spirulina sp.), de diatomáceas especialmente Pleurosigma sp. e de ciliados, além da presença de Oxyrrhis marina Dujardin e de Anabaena sp.. No viveiro sem melaço os flagelados e dinoflagelados, especialmente Protoperidinium sp. e outros da ordem Peridiniales foram mais freqüentes e abundantes. Em ambos os tratamentos foi observada uma alta densidade de cianobactérias cocóides e de dinoflagelados (Gymnodiniales e Gyrodinium sp.). Apesar de não terem sido encontradas diferenças estatísticas entre os tratamentos, ficaram claras tendências distintas de composição e densidade do fitoplâncton e protozooplâncton entre os viveiros, indicando a influência da adição de melaço. / In aquaculture the zero water exchange system is efficient, sustainable, and allows the management to balance the carbon and nitrogen compounds through the development of microorganisms contributing to good water quality, feeding and survival of the target organism. In this study, the composition and density phytoplankton and protozooplâncton together with physical and chemical variables were evaluated in shrimp ponds (Litopenaeus vannamei Boone) without water exchange in two treatments with and without the addition of molasses as carbon fertilizer. Water samples were collected during 70 days (January- April 2009). The treatments differed significantly in dissolved inorganic phosphate, silicate and chlorophyll <20 μm. Chlorophyll, dominated by the fraction <20 μm (> 80%), reached the highest values (~400 μg L-1) at the end of the experiment in both treatments. In the pond with molasses, the filamentous cyanobacteria (Pseudoanabaena spp., Spirulina sp.), the diatom Pleurosigma sp. and ciliates reached highest density and the dinoflagellate Oxyrrhis marina Dujardin and the cyanobacteria Anabaena sp. were present. In the pond without molasses, flagellates, and dinoflagellates Protoperidinium sp. and other Peridiniales were more frequent and abundant. In both treatments coccoid cyanobacteria and dinoflagellates (Gyrodinium sp. and other Gymnodiniales) were abundant. Although the differences were not statistically significant, the composition and abundance of phytoplankton and protozooplankton differed over time in both treatments, indicating the influence of the molasses addition.

A associação simbiótica entre a diatomácea cêntrica Chaetoceros coarctatus e o ciliado peritríquio Vorticella oceanica é amplamente conhecida e registrada em diversos estudos, porém nunca havia sido analisada sob o ponto de vista de suas implicações para o movimento destes organismos. A fim de contribuir com novos dados acerca desta associação simbiótica, o presente trabalho analisou a relevância ecológica da simbiose entre Chaetoceros e Vorticella, por meio de um estudo comportamental do deslocamento destes organismos na coluna de água. As associações foram coletadas em águas costeiras de Ubatuba, São Paulo, onde sua ocorrência foi observada em elevada abundância, particularmente durante o verão. Utilizando técnicas de imagem de alta frequência em um sistema óptico tridimensional foi possível descrever os padrões de deslocamento desta associação e avaliar as implicações ecológicas deste comportamento. De acordo com as análises realizadas neste trabalho, pode-se sugerir que o comportamento de deslocamento realizado pela associação Chaetoceros-Vorticella na coluna de água resulta em vantagens tanto para o epibionte quanto para o hospedeiro. Em termos de submesoescala, este estudo sugere que o deslocamento realizado pela associação Chaetoceros-Vorticella pode contribuir para a formação de camadas finas, levando à formação de hotspots de atividade biogeoquímica e interações tróficas no ecossistema pelágico. / The symbiotic association between the centric diatom Chaetoceros coarctatus and the peritrich ciliate Vorticella oceanica is widely known and reported in several studies, but its implications for the movement of these organisms have never been analyzed. In order to contribute with new data about this symbiotic association, the present study investigated the ecological relevance of the Chaetoceros-Vorticella association by recording displacement parameters of these organisms in the water column. The associations were collected in coastal waters of Ubatuba, São Paulo, where their occurrence was observed in high abundance, particularly during the summer. Using high-resolution imaging techniques in a three dimensional optical system it was possible to describe the displacement patterns of this association and to provide initial insights about the ecological implications of this behavior. It is suggested that the displacement behavior performed by the Chaetoceros-Vorticella association in the water column is beneficial for both the epibiont and the host. In terms of submesoscale processes, this study indicates that the displacement carried out by the Chaetoceros-Vorticella association may contribute to the formation of thin layers, leading to the formation of hotspots of biogeochemical activity and trophic interactions in the pelagic ecosystem.

A associação simbiótica entre a diatomácea cêntrica Chaetoceros coarctatus e o ciliado peritríquio Vorticella oceanica é amplamente conhecida e registrada em diversos estudos, porém nunca havia sido analisada sob o ponto de vista de suas implicações para o movimento destes organismos. A fim de contribuir com novos dados acerca desta associação simbiótica, o presente trabalho analisou a relevância ecológica da simbiose entre Chaetoceros e Vorticella, por meio de um estudo comportamental do deslocamento destes organismos na coluna de água. As associações foram coletadas em águas costeiras de Ubatuba, São Paulo, onde sua ocorrência foi observada em elevada abundância, particularmente durante o verão. Utilizando técnicas de imagem de alta frequência em um sistema óptico tridimensional foi possível descrever os padrões de deslocamento desta associação e avaliar as implicações ecológicas deste comportamento. De acordo com as análises realizadas neste trabalho, pode-se sugerir que o comportamento de deslocamento realizado pela associação Chaetoceros-Vorticella na coluna de água resulta em vantagens tanto para o epibionte quanto para o hospedeiro. Em termos de submesoescala, este estudo sugere que o deslocamento realizado pela associação Chaetoceros-Vorticella pode contribuir para a formação de camadas finas, levando à formação de hotspots de atividade biogeoquímica e interações tróficas no ecossistema pelágico. / The symbiotic association between the centric diatom Chaetoceros coarctatus and the peritrich ciliate Vorticella oceanica is widely known and reported in several studies, but its implications for the movement of these organisms have never been analyzed. In order to contribute with new data about this symbiotic association, the present study investigated the ecological relevance of the Chaetoceros-Vorticella association by recording displacement parameters of these organisms in the water column. The associations were collected in coastal waters of Ubatuba, São Paulo, where their occurrence was observed in high abundance, particularly during the summer. Using high-resolution imaging techniques in a three dimensional optical system it was possible to describe the displacement patterns of this association and to provide initial insights about the ecological implications of this behavior. It is suggested that the displacement behavior performed by the Chaetoceros-Vorticella association in the water column is beneficial for both the epibiont and the host. In terms of submesoscale processes, this study indicates that the displacement carried out by the Chaetoceros-Vorticella association may contribute to the formation of thin layers, leading to the formation of hotspots of biogeochemical activity and trophic interactions in the pelagic ecosystem.

Submitted by Alberto Vieira (martins_vieira@ibest.com.br) on 2018-05-24T19:12:18Z No. of bitstreams: 1 278398.pdf: 10094959 bytes, checksum: ea3a2428e7112ce8768b351478638f49 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-24T19:12:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 278398.pdf: 10094959 bytes, checksum: ea3a2428e7112ce8768b351478638f49 (MD5) Previous issue date: 1998 / CEPEG / FAPERJ / CAPES / Na Lagoa de Piratininga localizada em Niterói, Estado do Rio de Janeiro, Brasil, as primeiras coletas indicaram forte presença de ciliados. Sendo localizada numa área de especulação imobiliária, a lagoa sofre com o lançamento de esgoto doméstico em suas águas e com o aterro de suas margens, acelerando seu processo de colmatação. O desenvolvimento das técnicas: Técnica do Protargol, Técnica de Chatton & Lwoof, Técnica do Prata a Seco e Microscopia Eletrônica de Varredura, permitiu a boa observação, a identificação e descrever a ciliatofauna própria de moitas de Typha dominguensis desta lagoa. A ciliatofauna é constituída por por... / First samplings at Piratininga lagoon, Niterói, Rio de J aneiro State, Brazil indicate strong presence of ciliares. Located in na area of real estate speculation, the lagoon suffers with domestic sewage disposal and earth embankments at its borders which speed up the silt filling process. Refined working procedures like the Protargol Technique, the Chatton & Lwoof Thechnique, the Silver Dry Technique and Scanning Electron Microscopy, permitted good observation, identification and description of the members of the ciliate fauna peculiar of the typha dominguensis association of the lagoon. The ciliate fauna is...

Submitted by isabela.moljf@hotmail.com (isabela.moljf@hotmail.com) on 2017-05-10T11:33:41Z No. of bitstreams: 1 robertojuniopedrosodias.pdf: 16324224 bytes, checksum: d89ac49f5783a9ad6211a6e7c47c0824 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-05-17T15:03:54Z (GMT) No. of bitstreams: 1 robertojuniopedrosodias.pdf: 16324224 bytes, checksum: d89ac49f5783a9ad6211a6e7c47c0824 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T15:03:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 robertojuniopedrosodias.pdf: 16324224 bytes, checksum: d89ac49f5783a9ad6211a6e7c47c0824 (MD5) Previous issue date: 2007-02-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / No presente trabalho, foram estudados os aspectos da taxonomia e morfologia dos protistas ciliados encontrados no córrego São Pedro (Juiz de Fora, MG), bem como o potencial destes microorganismos como indicadores da qualidade da água e ainda os aspectos ecológicos das relações epibióticas entre os ciliados e alguns macroinvertabrados bentônicos. A presente dissertação está dividida em sete capítulos. No capítulo 1, foi realizado o inventário dos ciliados encontrados em cinco estações amostrais do córrego, durante um ano de estudo, e foi observada a sucessão destes protistas em laboratório. Foram identificadas 42 espécies de ciliados e caracterizou-se morfologicamente Apoamphisiella sp. nov. (Spirotrichea, Amphisiellidae). No capítulo 2, foi descrito um doublet do tipo imagem espelhada em Gastrostyla setifera (Spirotrichea, Oxytrichidae), obtida de amostras de água e sedimento de uma estação amostral do córrego São Pedro. O capítulo 3 registra a presença de Neobursaridium gigas (Oligohymenophorea, Neobursaridiidae) no córrego e apresenta uma revisão dos aspectos morfológicos, ecológicos e da distribuição geográfica deste ciliado. No capítulo 4, verificou-se a influência da poluição orgânica sobre a composição e a distribuição da taxocenose de protistas ciliados ao longo do córrego, com o objetivo de avaliar a qualidade da água deste sistema lótico. Durante o estudo de um ano, em cinco estações amostrais ao longo do córrego, foram encontradas 39 espécies de protistas ciliados, das quais 32 estão incluídas no sistema sapróbio e são consideradas bioindicadoras. A composição e a distribuição da taxocenose de protistas ciliados variaram espacial e temporalmente. O índice sapróbio e o índice de valência sapróbia foram utilizados para avaliar a qualidade da água das cinco estações amostrais e demonstraram o alto grau de poluição das estações 4 e 5. Os dados obtidos confirmam que, em águas correntes, a poluição orgânica parece ser um fator determinante, capaz de influenciar a composição, a distribuição e a estrutura trófica da taxocenose de protozoários ciliados. Os capítulos seguintes versam sobre as associações epibióticas dos protistas ciliados com moluscos, oligoquetas e larvas de insetos. No capítulo 5, foram registradas sete espécies de ciliados sobre as conchas de Pomacea figulina, sendo seis pertencentes à subclasse Peritrichia: Carchesium polypinum, Vorticella microstoma, Vorticella campanula, Epistylis plicatilis, Epistylis sp., Opercullaria sp. e uma pertencente à subclasse Suctoria: Hypophrya fasciculata. Os resultados são discutidos em termos das vantagens e desvantagens desta relação para os protistas ciliados e dos aspectos ecológicos envolvidos nesta associação. No capítulo 6, foram investigados o sítio de localização e o padrão de distribuição espacial e temporal de protistas ciliados peritríquios do gênero Rhabdostyla colonizando oligoquetas límnicos tubificídeos da espécie Limnodrilus hoffmeisteri (Oligochaeta, Tubificidae) nas cinco estações amostrais do córrego, ao longo de 11 meses de coleta. O padrão de ocorrência dos epibiontes sobre os oligoquetas apresentou heterogeneidade espacial e temporal. Os resultados são discutidos em termos das possíveis causas da localização dos ciliados preferencialmente na região posterior dos oligoquetas e dos fatores relacionados ao padrão de distribuição espacial e temporal heterogêneo. E finalmente, o capítulo 7 relata a ocorrência de Rhabdostyla chironomi (Ciliophora, Peritrichia) sobre larvas de Chironomus decorus (Diptera, Chironomidae) no córrego e reporta, ainda, os fatores envolvidos na localização dos ciliados sobre os túbulos abdominais dos hospedeiros e a possível utilização desta relação como indicadora da qualidade da água. / In the present study, both taxonomy and morphology aspects of the ciliate protists found in São Pedro stream (Juiz de Fora-MG), as well as their potential as water quality indicators were studied together with the ecological aspects of the epibiotic relation between the ciliate and some benthic macroinvertebrates. The present dissertation is divided into seven chapters. In chapter 1, the survey of ciliate protists was obtained from samples of water and sediment from the stream, during a hole year, and the succession of these protists was observed in laboratory. Forty-two ciliate species were identified and Apoamphisiella sp. n. (Spirotrichea, Amphisiellidae) was morfologically characterized. In chapter 2, mirror-image doublet was described in Gastrostyla setifera (Spirotrichea, Oxytrichidae), obtained from samples of water and sediment at the São Pedro stream. The Chapter 3 registers the presence of Neobursaridium gigas Balech, 1941 (Oligohymenophorea, Neobursaridiidae) in the stream and presents a revision of the morphological aspects of this ciliate, as well as its ecological and geographical distribution. In chapter 4, the influence of the organic pollution on both the composition and the distribution of the taxocenose of ciliate protists along the stream had the aim of evaluating the water quality of this lotic system. During the one year study, 39 ciliate protist species were found, 32 of which were included in the saprobic system and their potencial as indicators are considered. The composition and the distribution of the taxocenose of ciliate protist varied both spatial and seasonally. The saprobic index and the valency methods were used to evaluate the water quality at the five stations and they demonstrated the high degree of pollution on stations 4 and 5. Our results confirm that the organic load in watercourses may be a dominating factor capable of influencing the composition, distribution and trophic structure of the taxocenose of ciliate protist. The following chapters consider the epibiotic ciliate protist associations to mollusks, oligochates and insect larvae. In chapter 5, seven ciliate species were registered on the shells of Pomacea figulina, six of which belonging to the subclass Peritrichia: Carchesium polypinum, Vorticella microstoma, Vorticella campanula, Epistylis plicatilis, Epistylis sp., Opercullaria sp. and one belonging to the subclass Suctoria: Hypophrya fasciculata. Results are discussed in terms of the advantages and disadvantages of this relationship from the ciliate protist point of view, together with the ecological aspects involved in this association. In chapter 6, location ranch and both spatial and temporal distribution patterns of Rhabdostyla peritrichids were found colonizing limnic oligochaetes Tubificidae of the species Limnodrilus hoffmeisteri in the five amostral stations, during 11 months of collection. The occurrence pattern of the epibionts on the oligochaetes was spatial and seasonally heterogeneous. Results are discussed in terms of the possible causes for the site preference of the ciliates in the posterior region of the oligochaetes and factors related to the heterogeneous pattern of space and temporal distribution. Finally, chapter 7 registers the occurrence of Rhabdostyla chironomi (Ciliophora, Peritrichia) on Chironomus decorus larvae (Diptera, Chironomidae) in the stream and still it moderates the factors involved in the location of the ciliates on the ventral tubules of its hosts and the possible usage of this relationship as indicative of the water quality.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2017-09-20T12:26:13Z No. of bitstreams: 1 francianecedrolavale.pdf: 8805942 bytes, checksum: 47ea510c699cff3c39f83d726954737a (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2017-09-22T15:11:47Z (GMT) No. of bitstreams: 1 francianecedrolavale.pdf: 8805942 bytes, checksum: 47ea510c699cff3c39f83d726954737a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-09-22T15:11:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 francianecedrolavale.pdf: 8805942 bytes, checksum: 47ea510c699cff3c39f83d726954737a (MD5) Previous issue date: 2016-02-12 / O presente estudo versa sobre taxonomia e morfologia de protozoários ciliados (Litostomatea, Trichostomatia) endossimbiontes de ruminantes domésticos no Brasil. O trabalho encontra-se dividido em quatro seções. A Seção 1 revisa os principais métodos em microscopia e biologia molecular utilizados no estudo taxonômico de protistas ciliados do rúmen. A Seção 2 apresenta um inventário de espécies de protozoários ciliados do rúmen de ovinos no Brasil, no qual foram inventariadas 28 espécies de ciliados, sendo que, Entodinium alces, Metadinium esalqum e Metadinium rotundatum foram observados pela primeira vez em ovinos e outras 12 espécies foram observadas pela primeira vez em ovinos no Brasil. Ainda, a sessão apresenta a redescrição da espécie Entodinium contractum com base na morfologia geral e descrição da infraciliatura oral; a Seção 3 faz a caracterização morfológica de seis morfotipos da espécie Diplodinium anisacanhum e breve revisão taxonômica do gênero Diplodinium. A caracterização morfológica e morfométrica dos morfotipos de D. anisacanthum demonstraram grande similiaridade entre os mesmos sugerindo que tais ciliados constituam uma única espécie dotada de polimorfismos. A breve revisão realizada destaca as incongruências taxonômicas existentes no gênero Diplodinium e aponta a necessidade de estudos recentes com os representantes deste gênero de modo a reformular a taxonomia do grupo. Por fim, a Seção 4 descreve uma nova espécie de ciliado ofrioscolecídeo, Diploplastron dehorityi e redescreve a espécie Diploplastron affine com base em dados morfológicos, morfométricos e detalhes da infraciliatura oral. A nova espécie difere em alguns aspectos da espécie D. affine. As placas esqueléticas em D. dehoryti não são justapostas e possuem formato recurvado. Ainda, a nova espécie possui o corpo em formato oval, diferindo do formato elíptico de D. affine. Além das semelhanças existentes entre a nova espécie e a espécie congênere, D. dehorityi possui grande similaridade morfológica com espécies pertencentes ao gênero Eremoplastron, diferindo apenas no número de placas esqueléticas. / This study is about taxonomy and morphology of endosymbiotic ciliated protozoa (Litostomatea, Trichostomatia) of Brazilian domestic ruminants. The work is divided into four sections. Section 1 reviews the main methods in microscopy and molecular biology used in the taxonomic study of rumen ciliates. Section 2 presents an inventory of species of ciliated protozoa Brazilian sheep, which were inventoried 28 species of ciliates, and, Entodinium alces, Metadinium esalqum and Metadinium rotundatum were first observed in sheep and other 12 species were first observed in Brazilian sheep. Still, the session shows the redescription of Entodinium contractum Kofoid & Christenson (Entodiniomorphida, Ophryosocolecidae) based on general morphology and description of oral infraciliature; Section 3 is the morphological characterization of a polymorphic species of ophryoscolecid ciliate Diplodinium anisacanhum da Cunha and a brief taxonomic revision of the genus Diplodinium Schuberg. The morphological and morphometric characterization of D. anisacanthum showed great similiarities among morphotypes suggesting that such ciliates constitute a single species endowed with polymorphism. A brief review conducted highlights the inconsistencies in the taxonomy of the genus Diplodinium and demonstrates the need for recent studies with representatives of the genus in order to improve the taxonomy of it. Finally, Section 4 describes a new species of ophryoscolecid ciliate Diploplastron dehorityi and redescribe the species Diploplastron affine (Dogiel & Fedorowa) based on morphological and morphometric characterization and details of oral infraciliature. The new species differs in some aspects of the species D. affine. The skeletal plates in D. dehorityi are not juxtaposed and have curved shape. Still, the new species has the oval body, differing from the elliptical body of D. affine. In addition to the similarities between the new species and congener species, D. dehorityi has great morphological similarity to species of the genus Eremoplastron, differing only in the number of skeletal plates.

This doctoral research project aims the study of finite element methods discretized in dynamic meshes in order to simulate fluid-solid interaction and multiphase flow phenomena, particularly flows involving phenomena that are most significant in microfluidic and biofluidic applications. The equations that model multiphase flow will be treated in an arbitrary Lagrangian-Eulerian framework, when required, with several types of boundary conditions at the interfaces, depending on the nature of the phases. The numerical challenges found in this application range from the correct representation of the interface between fluids, passing through geometric challenges in the maintainability of the computer mesh, to the challenges posed by microscales. Special attention is given to squimer models, by means of a general formulation of the swimming problem as well as the steps to transform a standard fluid-solid model to a squirming model. / Este projeto de pesquisa de doutorado visa o estudo de métodos de elementos finitos discretizados em malhas dinâmicas, com o objetivo de simular fenómenos de interação fluídoestrutura e escoamentos multifásicos, em especial escoamentos que envolvem aplicações em microfluídica e biofluídica. As equações que modelam escoamentos multifásicos serão tratadas em um referencial lagrangeano-euleriano arbitrário, quando requerido, com differentes tipos de condições de contorno nas interfaces, dependendo da natureza das fases. Os desafios numéricos impostos por esta aplicação vão desde a correta representação das interfaces, passando por desafios geométricos na manutenibilidade da malha computacional, até os desafios impostos pelas escalas microscópicas. Atenção especial é dada aos modelos de squimer, por meio de uma formulação geral do problema de natação, bem como os passos para transformar um modelo fluido-sólido padrão em um modelo de squirming.