Orientador: Luis Artur Loyola Chardulo / Coorientador: Rogério Abdallah Curi / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos Silva / Resumo: O objetivo deste estudo foi estimar as frequências dos polimorfismos nos genes DGAT1 (sequência de 18 nucleotídeos na região promotora - VNTR), ANK1 (novo polimorfismo identificado na região regulatória), TCAP (AY428575.1:g.346G>A) e MYOG (NW_001501985:g.511G>C) e associá-los a características relacionadas à qualidade de carne e carcaça em bovinos Nelore (Bos indicus). Foram utilizados 600 machos, terminados em confinamento com idade inferior a dois anos, com informações de desempenho e genealogia. Os animais foram abatidos em frigoríficos comerciais, onde foram obtidas amostras individuais do músculo Longissimus dorsi para extração do DNA e realização das análises fenotípicas da carne. A genotipagem foi realizada por meio da técnica da PCRRFLP, com exceção do VNTR do gene DGAT1 que foi apenas amplificado pela PCR. Por meio da análise do tamanho dos fragmentos em gel de agarose, foram determinados os genótipos dos indivíduos para o cálculo das frequências alélicas e genotípicas. O estudo de associação com o peso de carcaça quente, área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea, força de cisalhamento, perdas por cocção (perdas), coloração instrumental (L*, a*, b*), porcentagem de gordura intramuscular (GIM) e índice de fragmentação miofibrilar foi realizado por meio do procedimento GLM do SAS®. O alelo B do gene ANK1 foi associado ao aumento da coloração vermelha (a*) da carne (p<0,05). No gene DGAT1, os alelos 5R, 6R e 7R foram associados (p<0,05) ao aumento da GIM, à redução das perdas e ao aumento da AOL, respectivamente. O SNP do gene TCAP não foi polimórfico e os alelos do gene MYOG não foram associados a nenhuma das características testadas. Os resultados obtidos indicam que os genes DGAT1 e ANK1 podem ser utilizados na seleção de animais Nelore para qualidade de carne e carcaça / Abstract: The aim of this study was to estimate the polymorphism frequencies of the genes DGAT1 (sequence of 18 nucleotides at the promoter region - VNTR), ANK1 (new polymorphism identified at the regulatory region), TCAP (AY428575.1:g.346G>A) and MYOG (NW_001501985:g.511G>C) and associate them to carcass and meat quality in Nellore cattle (Bos indicus). It was used 600 males, finished at feedlot under two years old, with performance and genealogy information. Slaughter was carried out in commercial abattoir where individual samples were obtained from Longissimus dorsi for DNA extraction and meat analysis. Genotyping was performed by PCR-RFLP, with exception for the VNTR of gene DGAT1 that was only amplified by PCR. By analyzing the fragment size on the agarose gel, the genotypes of the animals were determined for calculation of allele and genotype frequencies. The associations study with hot carcass weight, ribeye area (REA), back fat thickness, shear force, cooking loss (CL), meat color (L*, a*, b*), percentage of intramuscular fat (IF) and myofibrillar fragmentation index was performed using the GLM procedure of SAS®. The allele B from ANK1 gene was associated to higher redness (a*) of meat (p<0.05). The alleles 5R, 6R and 7R from DGAT1 VNTR gene were associated (p<0.05) to increased IF, reduced CL and increased REA, respectively. The SNP of TCAP gene was not polymorphic and MYOG alleles were not associated to any of the tested characteristics. Results indicate that DGAT1 and ANK1 genes can be used in the selection of Nellore cattle for carcass and meat quality / Mestre

Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Coorientador: Taciana Vilella Savian / Banca: André Mendes Jorge / Banca: Cyntia Ludovico Martins / Banca: Sérgio Bertelli Pflanzer / Banca: Cristiana Andrighetto / Resumo: Com o objetivo de avaliar os efeitos da imunocastração sobre parâmetros de desempenho, 60 bovinos foram terminados por 90 dias em confinamento, sendo 30 Nelores e 30 cruzados (50% Nelores x 50% Aberdeen Angus) divididos uniforme e aleatoriamente em 3 condições sexuais (não castrados, castrados cirurgicamente e imunocastrados). Os pesos vivos, ganho médio de peso diário, consumo de matéria seca, conversão alimentar, consumo de matéria seca em relação ao peso vivo, ganho de peso médio diário e eficiência alimentar foram obtidos. A interação entre as condições sexuais e os grupos genéticos foi significativa para peso vivo ao início e ao final do confinamento, conversão alimentar e eficiência alimentar. Dentro do grupo genético dos cruzados, os animais imunocastrados apresentaram pesos vivos médios, obtidos ao início e ao final do confinamento, semelhantes aos dos animais não castrados e superiores aos dos animais castrados cirurgicamente. Por outro lado, os Nelore apresentaram pesos vivos médios, obtidos ao início e ao final do confinamento, semelhantes aos animais castrados cirurgicamente e inferiores aos animais não castrados. Não foram encontradas diferenças no consumo de matéria seca, e consumo de matéria seca em relação ao peso vivo entre as condições sexuais. Os animais não castrados demonstraram maiores valores de ganho de peso médio diário do que os castrados cirurgicamente e os imunocastrados, sendo que esses últimos apresentaram ganho de peso médio diário semelhantes. Não foram encontradas diferenças nos valores médios de ganho de peso médio diário e consumo de matéria seca em relação ao peso vivo entre animais Nelore e cruzados. Entretanto, os animais cruzados apresentaram maior consumo de matéria seca quando comparados aos animais Nelore... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: With the objective of evaluating the effects of immunocastration on performance parameters , 60 animals were terminated 90 days confinement , 30 and 30 crossed Nellore ( Nellore 50 % x 50 % Aberdeen Angus ) uniformly and randomly divided in 3 sexual conditions (not castrated surgically castrated and immunocastrated ) . The live weight , average daily gain , dry matter intake , feed conversion , dry matter intake relative to body weight , average daily weight gain and feed efficiency were obtained . The interaction between sexual conditions and genetic groups was significant for body weight at the beginning and end of the experiment , feed conversion and feed efficiency . Within the genetic group of Crusaders , the immunocastrated animals showed average live weights obtained at the beginning and end of the experiment , similar to those of uncastrated animals and superior to those of surgically castrated animals . On the other hand, Nellore present average live weights obtained at the beginning and end of the experiment , similar to surgically castrated and uncastrated animals inferior to animals . No differences in dry matter intake and dry matter intake in relation to body weight between sexual conditions were found . The uncastrated animals showed higher values ​​of average daily weight gain than surgically castrated and immunocastrated , while the latter showed similar average daily gain weight. No differences were found in mean average daily gain and dry matter intake in relation to body weight between Nellore and crossbred weight... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Roberto de Oliveira Roça / Coorientador: Marcelo Henrique Faria / Banca: Cyntia Ludovico Martins / Banca: Pedro Eduardo de Felício / Resumo: A qualidade da carne está diretamente ligada as exigências do consumidor, que considera dureza, amora, sabor, suculência e coloração. Desta forma o presente trabalho tem por objetivo verificar o efeito da imunocastração na composição centesimal, análise sensorial e perfil de ácidos graxos da carne de bovinos Nelore e cruzados ½Nelore x ½Aberdeen-Angus, 60 animais distribuídos em um delineamento em esquema fatorial 2 x 3, sendo grupos genéticos e condições sexuais, com castração cirúrgica, imunocastração e não castrados, totalizando 6 tratamentos com 10 animais . Os animais foram abatidos e as carcaças resfriadas. Após 24 horas, foram utilizadas amostras do M. longissimus thoracis da 11ª à 13ª costela da carcaça direita, embaladas a vácuo e congeladas. Entre as condições sexuais estudadas, não foram encontradas diferenças nos valores médios de proteína, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo apenas a umidade diferente. Entre os grupos genéticos, os valores médios da composição centesimal apresentaram diferença para umidade, extrato etéreo e resíduo mineral fixo, sendo a umidade elevada para a carne dos animais cruzados, o extrato etéreo e o resíduo mineral fixo com maiores teores para a carne dos animais Nelore. As variáveis, sabor, maciez, mastigabilidade e suculência apresentaram melhores valores para a carne de animais cruzados. No perfil de ácidos graxos, entre as condições sexuais, foram encontradas diferenças no ácido miristoléico (C14:1), no ω6 (ômega 6) e na proporção de ácidos graxos poliinsaturados/ácidos graxos saturados, com maiores resultados... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The quality of meat is directly linked to consumer demands, which considers hardness, blackberry, flavor, juiciness and color. Thus, the present study aims to determine the effect of immunocastration proximate composition, sensory analysis and fatty acid profile of meat from Nellore and is crossed Nellore x ½ Aberdeen-Angus, 60 animals were allotted to a factorial 2 x 3 with genetic conditions and sex groups, with surgical castration, immunocastration and unneutered, totaling 6 treatments with 10 animals. The animals were slaughtered and the carcasses chilled. After 24 hours, samples were used of M. longissimus thoracis from the 11th to the 13th rib on the right casting, vacuum packed and frozen. Between sexual conditions studied, no differences were found in mean values of protein, lipids and fixed mineral, with just different humidity. Among genetic groups, the mean values of centesimal composition showed differences for moisture, ether extract and fixed mineral residue, and high humidity for the meat of crossbred animals, ether extract and fixed mineral with higher levels for the meat of Nellore . Variables , taste, tenderness , juiciness and chewiness showed better values for beef and crossbred animals . In the fatty acid profile between sexual conditions , differences were found in myristoleic acid ( C14 : 1 ) , the ω6 ( omega 6 ) and the ratio of polyunsaturated / saturated fatty acids fatty acids with greater results found in the flesh of animals not castrated . Among genetic groups the results differed due to the influence of racial characteristics , with the best values in meat from Nellore , because the selection of forage taken by animals . The use of immunocastration proved effective in aspects related to composition , sensory analysis and meat fatty acid profile when compared with surgically... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Luis Artur Loyola Chardulo / Coorientador: Pedro de Magalhães Padilha / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Saulo da Luz e Silva / Resumo: O presente trabalho objetivou aprofundar os estudos sobre a qualidade da carne bovina em animais Nelore (Bos indicus). Foram utilizados 718 animais terminados em confinamento por 90 a 100 dias com idade entre 20 a 24 meses provenientes de rebanhos de quatro fazendas que integram os programas de melhoramento genético do grupo Conexão Delta G, PAINT e Nelore Qualitas. O abate dos animais ocorreu em frigoríficos comerciais colaboradores, as carcaças foram identificadas e resfriadas por um período de 24 a 48 horas. Após o resfriamento e estabelecimento pleno do rigor mortis foram colhidas amostras do músculo Longissimus dorsi com osso (espessura aproximada de 2,54 cm) entre a 9ª e 13ª costelas, da meia-carcaça esquerda de cada animal. As amostras coletadas entre a 12ª e 13ª costelas foram utilizadas para realização das análises físicas de qualidade, como a área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), índice de marmorização (IM), perdas por cozimento, coloração instrumental da carne e força de cisalhamento (FC). A partir do restante da carne, foram coletadas alíquotas para a realização das análises de índice de fragmentação miofibrilar (MFI) e lipídeos totais (LT). Após a realização das análises físico-químicas foi realizada a separação dos dados através de um modelo de seleção de dois grupos experimentais: (1) Grupo de carne macia (n=15) e (2) Grupo de carne dura (n=15), de forma a obter-se dois grupos contrastantes quanto à maciez através da FC. Após a separação dos grupos (n = 30) foi realizada a identificação e quantificação das isoformas de cadeia pesada de miosina (MyHC), troponina e desmina utilizando a eletroforese (SDS-PAGE) e fotodocumentação dos géis. O Valor médio encontrado para a AOL foi 72,8 cm2, como esperado para animais Bos indicus, os quais apresentaram FC e MFI médio de 5,7 kg e 32,0 demonstrando ... / Abstract: This study aimed to further study the quality of beef in Nellore cattle (Bos indicus). Were used 718 animals finished in feedlot for 90 to 100 days aged 20 to 24 months of herds of four farms that are part of the breeding programs of the grupo Conexão Delta G, PAINT and Nelore Qualitas. The slaughter of animals occurred in commercial refrigerators employees, carcasses were identified and cooled for a period of 24 to 48 hours. After cooling and full establishment of rigor mortis samples of Longissimus dorsi bone (approximate thickness of 2.54 cm) between the 9th and 13th ribs, the left half carcass of each animal were harvested. Samples collected between the 12th and 13th ribs were used to evaluate the physical quality, as the rib eye area (REA), fat thickness (SFT), an index of marbling (IM), cooking loss, staining instrumental meat and shear force (SF). From the rest of the meat, aliquots for analyzes of myofibrillar fragmentation index (MFI) and total lipids (TL) were collected. After the realization of physicochemical analyzes the separation of the data was performed using a selection model of two experimental groups: (1) Group of tender meat (n = 15) and (2) Group of tough meat (n = 15) so as to obtain two contrasting groups for softness by FC. After separation of the groups (30) the identification and quantification of isoforms of myosin heavy chain (MyHC), troponin and desmin was performed by electrophoresis (SDS -PAGE) gels and photo documentation. The average value found for the REA was 72.8 cm2, as expected for Bos indicus, which showed SF and average MFI of 5.73 kg and 32.03 showing correlation of high magnitude and significant between the two parameters (rp = -0.55; p<0.01). With respect to the Index Optical Density (IOD) measured for troponin and desmin was not found different contrasting results for both groups, contrary to what was observed for MyHC, particularly for isoform ... / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Banca: Danísio Prado Munari / Banca: Josineudson Augusto II de Vasconcelos e Silva / Banca: Arione Augusti Boligon / Banca: Fabyano Fonseca e Silva / Resumo: O Brasil destaca-se mundialmente como o maior exportador e o segundo maior produtor de carne bovina. Entretanto, o rebanho brasileiro é composto majoritariamente por animais de raças Zebuínas, que produzem carnes de menor qualidade sensorial, quando comparados com os animais de raças Taurinas. Apesar da importância dessas características para a cadeia produtiva, a seleção ainda é pouco praticada, uma vez que as mesmas são difíceis de serem medidas, dependendo do abate dos animais e, consequentemente, de realização de testes de progênie para avaliação dos touros, atrasando o processo seletivo. Desta forma, a seleção indireta por meio de características comumente empregadas nos programas de seleção apresenta-se como alternativa. Neste contexto, as avaliações visuais por escorestêm sido incluídas nos programas de melhoramento genético de bovinos de corte, com o objetivo de melhorar características de carcaça. Objetivou-se com o presente trabalho estudar os parâmetros genéticos para as características da carcaça e carne, bem como suas relações com mensurações de avaliação visual. Os dados são provenientes de animais da raça Nelore, machos e fêmeas, que pertencem a dois programas de melhoramento genético - DeltaGen e Paint. Os animais com registros de dados fenotípicos para as características da carcaça e carne foram somente machos, nascidos entre 2008 e 2010, criados em sistemas de pastejo e confinados apenas na fase de terminação, por período ao redor de 90 dias. Foram utilizados registros de 36.660, 36.550, 36.550 e 36.550 animais machos e fêmeas, respectivamente, para peso à desmama (PD), conformação ao sobreano (C), precocidade ao sobreano (P) e musculatura ao sobreano (M) e, para as características da carcaça e da carne foram utilizados 1.442, 1.441, 1.435, 1.533, 1.535, 1.535, 1.534, 1.533 e 1.522 para área de olho de lombo (AOL), peso ... / Abstract: Brazil is the largest beef exporter and the second beef producer in the world. However, the Brazilian cattle composite is mostly Bos indicus, which produces meat with less quality than Bos taurus. Despite the importance of carcass (CARC) and meat quality (MQ) traits for the beef production cycle, its selection is not applied. Genetic evaluation after harvest is expensive because it requires a long period of time for the trait to be evaluated and consequently, also requires a progeny test. Therefore, the indirect selection through the traits which are commonly applied on breeding programs is feasible. Within this context, the visual evaluation using scores has been used on breeding programs, aiming to improve the carcass traits. The objective of the present study was to evaluate the genetic parameters of CARC and MQ, as well as their genetic associations with visual scores in Nellore cattle. For CARC and MQ traits were used only males, from animals that were born between 2008 and 2010, raised on grazing system and kept around 90 days in feed lot system for finishing. Records of 36,600, 36,550, 36,550, 1,442, 1,441, 1,435, 1,533, 1,535, 1,535, 1,534, 1,533 and 1,522 for yearling conformation (C), yearling finishing precocity (P), yearling muscling (M), rib eye area (REA), hot carcass weight (HCW), fat thickness (FT), Warner - Bratzler shear force (SF), marbling score (MS), lightness (L*), redness (a*), yellowness (b*) and intramuscular lipid (IL), respectively, were used. The (co)variance components were estimated by the restricted maximum likelihood method using tri and multitrait animal model. For the visual scores the model included the genetic additive and residual random effects, the contemporary group (CG) as a fixed effect and age of the animal (linear and quadratic) as covariate. For CARC and MQ the model included the genetic additive effect and residual effect as random effects, and ... / Doutor

Orientador: Wignez Henrique / Banca: Américo Garcia da Silva Sobrinho / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Banca: Angélica Simone Cravo Pereira / Banca: Gabriela Aferri / Resumo: Objetivou-se avaliar as características físico-químicas, atividade enzimática, relações e índices de qualidade dos ácidos graxos do Longissimus e Triceps brachii de 35 novilhos Nelore alimentados com óleo de linhaça protegido durante 35, 70 ou 105 dias antes do abate, esse óleo na forma in natura ou sem adição de óleo durante 105 dias. O volumoso utilizado foi silagem de milho (40% da MS) e as dietas com adição de óleo eram isoenergéticas (76,0% NDT e 6,1% EE). Os animais foram confinados em baias individuais e abatidos com 522,71 ± 27,99 kg de peso corporal. A adição de óleo de linhaça na dieta determinou maiores (P<0,10) teores de ácidos graxos saturados e hipercolesterolêmicos, índices de trombogenicidade e aterogenicidade e menor atividade das enzimas Δ9 dessaturases na carne do que a dos animais que não receberam óleo. Por outro lado, aumentou a concentração do ácido linoleico conjugado e ω3, e reduziu a relação ω6:ω3 mas o óleo in natura foi mais eficiente do que a forma protegida. O aumento do tempo de fornecimento do óleo protegido reduziu (P<0,10) linearmente o teor de colesterol e a relação ω6:ω3, e aumentou os ácidos ω3 e linoleico conjugado. Quanto à comparação entre os músculos, o Longissimus obteve maior força de cisalhamento, menor porcentagem de perdas no cozimento, teor de colágeno total e oxidação lipídica comparado ao Triceps brachii. Maiores concentrações dos ácidos C14:0, C14:1, C16:0, C18:2 cis 9 trans 11, C18:3 ω6 e C20:0 foram encontradas no Longissimus. Entretanto, o músculo Triceps brachii acumulou maiores teores dos ácidos C17:1, C18:2 ω6, C18:3 ω3, C20:1 ω9, C20:3 ω6, C20:4 ω6, C20:5 ω3, C22:4 ω6, C22:6 ω3 e C24:1 ω9. Portanto, o músculo Triceps brachii apresentou maiores relações entre os ácidos graxos insaturados:saturados e poli-insaturados:saturados, e também foi observada maior atividade da enzima elongase do que no Longissimus. Acrescentar ... / Abstract: The objective was to evaluate the physics and chemical characteristics, enzymatic activity, fatty acids ratio and quality indexes of the Longissimus and the Triceps brachii of 35 Nellore steers fed protected linseed oil for 35 , 70 or 105 days before slaughter, in natura oil or without oil addition for 105 days. The roughage was corn silage (40% DM) and diets with added oil were isocaloric (76.1% TDN and 6.1% EE). The animals were confined in individual pens and slaughtered with 522.71 ± 27.99 kg of body weight. The diet addition of linseed oil resulted in increased (P<0.10) levels of saturated and hypercholesterolemic fatty acids, thrombogenicity and atherogenicity indices, and lower Δ9 desaturases enzymes activity on meat compared to the treatment with no oil; on the other hand, increased the concentration of conjugated linoleic acid and ω3 fatty acids, and the ratio ω6:ω3 reduced, but in natura linseed oil was more efficient than the protected form. Increasing the duration time of protected oil supplementation decreased (P<0.10) linearly the cholesterol content and the fatty acids ratio ω6:ω3, and increased conjugated linoleic acid and ω3. The comparison between muscles showed that the Longissimus had higher shear force, lower percentage of cooking losses, total collagen and lipid oxidation compared to Triceps brachii. Higher concentrations of the acids C14:0, C14:1, C16:0, C18:2 cis 9 trans 11, C18:3 ω6 and C20:0 were found on Longissimus, however, the Triceps brachii accumulated highest levels of C17:1, C18:2 ω6,C18:3 ω3, C20:1 ω9, C20:3 ω6, C20:4 ω6, C20:5 ω3 , C22:4 ω6, C22:6 ω3 and C24:1 ω9 acids, showing greater correlation between unsaturated:saturated and polyunsaturated:saturated fatty acid, and we also observed increased elongase activity on shoulder clod than sirloin. Beef incorporates the beneficial aspects for human health of linseed oil fed to fattening steers, even some quality indices were ... / Doutor

Orientador: Fernando Sebastián Baldi Rey / Coorientador: Angélica Simone Cravo Pereira / Coorientador: Guilherme Costa Venturini / Banca: Mauricio Mello de Alencar / Banca: José Bento Sterman Ferraz / Resumo: As características da carcaça e da carne são muito importantes, pois são elas que determinam o preço e o acesso a novos mercados. Há uma crescente preocupação quanto ao consumo excessivo de gorduras, bem como do tipo de gordura ou perfil de ácidos graxos na carne, e seu impacto sobre a saúde do consumidor. O melhoramento genético para as características de carcaça, carne e perfil de ácidos graxos não vem sendo praticado devido a dificuldades de mensuração e por ser dispendioso. O presente estudo teve como objetivo estudar as associações entre o perfil de ácidos graxos e as características de carcaça e carne em bovinos da raça Nelore. Foram utilizados dados de 1826 machos da raça Nelore terminados em confinamento, provenientes de fazendas que integram três programas de melhoramento genético. O grupo de contemporâneo foi formado por animais nascidos na mesma fazenda e safra, e do mesmo grupo de manejo ao sobreano. Para a determinação do perfil de ácidos graxos foi utilizado para a extração dos lipídeos o método Folch e para a metilação o método Kramer. As características de carcaça e carne foram obtidas através de amostras de 2,54 cm retiradas entre a 12ª e 13ª costelas da meia-carcaça esquerda. O modelo utilizado para a estimação dos componentes de (co)variâncias incluiu o efeito aleatório genético direto, o efeito fixo do GC, e a idade do animal ao abate como covariável (efeito linear). Os componentes de (co)variâncias e parâmetros genéticos foram estimados utilizando inferência Bayesiana, considerando um modelo animal linear em análise multicaracterística com seis características (AOL, EGS, PCQ, SF, Lip e mais um ácido graxo). Os ácidos graxos apresentaram herdabilidades moderadas a alta, variando de 0,32 a 0,82. As estimativas das correlações genéticas entre as caracteríscas de carcaça e carne com os ácidos graxos saturados foram de baixas a moderadas, em sua maioria negativa ... / Abstract: Carcass and meat traits are very important because they determine the price and access to new markets. There is growing concern about the excessive consumption of fats as well as the type of fat or fatty acid composition in meat, and its impact on consumer health. The genetic improvement for carcass traits, meat and fatty acid composition has not been practiced due to measurement difficulties and be expensive. The present study aimed to investigate the associations between fatty acid composition with carcass and meat traits in Nellore cattle. A total of 1,826 Nelore bulls, finished in feedlot, belong to farms that integrate three breeding programs were used. The contemporary group included animals born on the same farm and year, and the same management group at yearling. To determine the fatty acid composition, it was used the Folch method for lipid extraction and for methylation the Kramer method. The carcass and meat traits were obtained from samples of 2.54 cm withdrawn between the 12th and 13th ribs on the left side carcass. The model used to estimate the (co)variance and genetic parameters included the random direct genetic effect, the fixed effect of the GC, and the animal's age at slaughter as a covariate (linear effect). The (co)variances components and genetic parameters were estimated using Bayesian inference, considering a linear animal model in multi-trait analysis with six characteristics (AOL, EGS, PCQ, SF, Lip and another fatty acid). The fatty acids showed moderate to high heritability, ranging from 0.32 to 0.82. The genetic correlations between carcass and meat traits with saturated fatty acids were low to moderate, most of them negative, ranging from - 0.76 to 0.88, whereas with mono and polyunsaturated fatty acids were low in its most of the cases or close to zero, since the HPD estimate included the zero within the interval, varying from -0.86 to 0.74. Thus, the selection for carcass and meat traits can be used ... / Mestre

Orientador: Josineudson Augusto II de Vascocelos Silva / Banca: Joslaine Noely dos Santos Gonçalves Cyrillo / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Resumo: O Brasil tem papel de destaque no setor da agropecuária mundial, tendo o maior rebanho comercial do mundo, ocupando o posto de maior exportador de carne bovina na atualidade. O rebanho do país é formado majoritariamente por animais de raças zebuínas, sendo em sua maioria da raça Nelore. No entanto, a pecuária de corte nacional, em geral apresenta baixa produtividade e inconstância na qualidade do produto final, a carne. A busca por alternativas que possam melhorar a eficiência e a produtividade do sistema, aumentando a lucratividade e qualidade da carne produzida no país, é um dos desafios da pecuária brasileira. Portanto, avaliar a associação genética existente entre características que tem influência direta na produtividade da pecuária de corte nacional, pode contribuir para a melhoria do setor. Neste contexto, elucidar a associação genética existente entre a precocidade sexual de fêmeas e a deposição de gordura na raça Nelore, disponibilizando ferramentas para identificar animais (touros) que produzam novilhos que são precoces em acabamento de carcaça e novilhas precoces sexualmente, pode contribuir para encurtar o ciclo de produção da bovinocultura de corte e aumentar a lucratividade e produtividade do sistema. Desta forma, objetivou-se com o presente estudo, estimar as correlações genéticas de característica indicadora de precocidade sexual com características de qualidade de carne de bovinos Nelore, visando obter informações que possam ser incorporadas aos programas de melhoramento genético animal com finalidade de aumentar os índices de produtividade e qualidade da carne bovina produzida no país. Os dados utilizados no estudo são oriundo de três programas de melhoramento genético, DeltaGen, Paint e Nelore Qualitas. Para a característica de precocidade sexual, foram utilizados registros de 55.945 fêmeas com pesagem pós desmama, e nascidas no período de 1993 a 2012. Para obter os... / Abstract: Brazil has a world's prominent role in the agricultural sector, and the largest commercial herd in the world, occupying, nowadays, the position of largest beef exporter. The country's herd is mainly composed of Bos indicus breed, specially Nellore breed. However, it is known that, in general, Bos indicus breeds have low productivity index and produces meat of lower quality then Bos taurus. Seeking for alternatives that may improve the efficiency and productivity of the animals, increasing the profitability and the meat quality produced in the country, is the challenges of the Brazilian livestock. Therefore, assessing the genetic association between traits that have direct influence on the productivity may contribute to the improvement of the sector. Within this context, elucidating the genetic association between sexual precocity of females and fat deposition in Nellore, providing tools to identify animals (bulls) that produce calves that are early in carcass finishing and sexually precocious heifers, may contribute to short the production cycle of beef cattle and increase profitability and productivity of the system. Thus, the aim of the present study is to estimate the genetic correlations between sexual precocity trait and meat quality traits in Nelore cattle, in order to obtain informations that can be incorporated into animal breeding programs. For sexual precocity trait, all records of females that were born from 1993 to 2012 were used. For carcass and meat quality traits were used only males, born from 2008 to 2011, fed for finishing in a period of 90 days. Variance components were estimated by Bayesian inference using bull linear model for the EGS characteristics, MARM and LIP and non-linear sire model (threshold) to PREC. Two-trait analyzes were carried out, involving the PREC feature and one of the three characteristics, EGS, MARM or LIP. The heritability estimates obtained by bi-trait analyzes were 0.06, 0.03 and 0.05, for ... / Mestre

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Daniele Fernanda Jovino Gimenez / Banca: Maurício de Alvarenga Mudadu / Banca: Luciana Correia de Almeida Regitano / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Rogério Abdallah Curi / Resumo: Mais de 80% da carne bovina brasileira é proveniente de animais de origem zebuína. Este produto é considerado de baixa maciez e reduzido teor de gordura entremeada quando comparado à carne de animais de raças taurinas. Investir na melhoria das características organolépticas como marmoreio e maciez da carne torna-se importante do ponto de vista econômico, pois tratam-se de atributos muito apreciados pelo consumidor. A maciez pode ser medida por meio de análises sensoriais, índice de fragmentação miofibrilar ou força de cisalhamento. Nesse último, um aparelho é utilizado para medir a força necessária para o cisalhamento de uma seção transversal de carne e, quanto maior a força dispensada, menor é a maciez apresentada pelo corte de carne. Outra característica relacionada à qualidade da carne é o marmoreio, que pode ser analisada por meio de escala de graduação visual denominada Quality Grade. No entanto, estas metodologias só podem ser utilizadas após o abate do animal. As técnicas de análise do transcriptoma, como o RNA-Seq, permitem a identificação de genes cuja expressão está relacionada com o controle de características quantitativas e podem ser alternativas na busca pelo melhoramento destes atributos. Com isso, o objetivo deste trabalho foi identificar genes diferencialmente expressos utilizando a técnica RNA-Seq, em tecido muscular de bovinos da raça Nelore, visando contribuir para o conhecimento dos fatores genéticos que estão relacionados com a qualidade da carne. Para i... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: More than 80% of Brazilian beef comes from zebu animals. The Zebu meat show reduced marbling and is considered harder when compared to Taurine meat. The improvement of the organoleptic traits like marbling and meat tenderness is important from an economic point of view, because these attributes are highly appreciated by the consumer. The meat tenderness can be measured by sensory analysis, myofibril fragmentation index or by shear force. This method use an apparatus which measure the force required to shear a cross section of meat. The higher the strength dispensed, lower is the tenderness showed by the cut of meat. Another trait related to meat quality is marbling, which can be analyzed by Quality Grade visual graduation scale. However, these methods can only be performed after the animal was killed. The transcriptome analysis techniques, as RNA-Seq, are able to identify genes whose expression are related to quantitative traits control and can be used as alternative to help the improvement of these traits. Thus, the aim of this study was to identify differentially expressed genes using RNA-Seq, in Nelore cattle muscular tissue, to contribute to the knowledge of the genetic factors that are related to meat quality. We sequenced the mRNA of 40 samples divergently ranked to meat tenderness (20 with hard meat and 20 with tender meat) and sequenced the mRNA of 40 samples divergently ranked to marbling (20 with high and 20 with low marbling). These samples were chosen based on she... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientador: Daniel Gustavo Mansan Gordo / Banca: Arione Augusti Boligon / Banca: Fernando Sebastian Baldi Rey / Resumo: A análise de componentes principais (PCA) e análise de fatores (FA) são amplamen-te utilizadas no processamento de dados visando a redução da dimensionalidade. No entanto, poucos são os estudos que empregou estes métodos em um conjunto de características importantes em bovinos da raça nelore com a finalidade de mode-lar a estrutura de (co)variância dos dados. O objetivo deste estudo foi estimar pa-râmetros genéticos para as características de crescimento, carcaça e qualidade da carne em machos Nelore, utilizando diferentes modelos multi-características visando a redução da dimensionalidade dos dados. Um total de 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.213; 3.320 e 16.575 registros de peso da carcaça quente (PCQ), área de olho de lombo (AOL), espessura de gordura subcutânea (EGS), escore de marmorização (MARM), maciez, mensurada pela força de cisalhamento (SF), lipídios (LP) e peso ao sobreano (PS), respectivamente, foram usados. As análises foram realizadas por meio de cinco modelos: multi-característica padrão, três modelos de posto reduzido ajustando os primeiros três (PC3), quatro (PC4) e cinco (PC5) componentes princi-pais genéticos e um modelo utilizando análise de fatores com três (FA3) fatores. Os modelos foram comparados pelo Critério de Informação de Akaike (AIC) e Critério Bayesiano de Schwarz (BIC), levando em consideração o número de parâmetros. Foram considerados para todos os modelos os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual, e os efeitos fixos do grupo de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Principal component (PCA) and factor analysis (FA) are widely used in data processing to reduce dimensionality. However, few studies have used these methods in a set of important traits in Nelore cattle for the purpose of modeling the covariance structure data. The aim of this study was to estimate genetic parameters for growth, carcass and meat quality traits in Nellore males, using different multivariate models to reduce the dimensionality data. A total of 3.865; 4.121; 4.109; 4.188; 4.123 3.320 and 16.575 records, hot carcass weight (HCW), 12-13th rib eye area (REA), backfat thickness (BF), marbling score (MS), warner-wraztler wear force (WBSF), lipid content (LC), and weight at 550 days (W550), respectively, were used. The analyzes were performed using five models: standard multi-characteristic, three reduced-rank models, and adjusted the first three (PC3), four (PC4) and five (PC5) genetic main components, and a model using factor analysis with three (FA3) factors. The models were compared by the Akaike Information Criterion (AIC) and Schwarz Bayesian Criterion (BIC), taking into account the parameters number. The random effects of the direct and residual additive genetic and the fixed effects of the contemporaneous group and the linear effect of animal age on slaughter were considered as covariate, except for yearling weight. The analysis models of genetic factors and main components selected by both selection criteria were PC3 (BIC), PC4 (AIC) and FA3 (AIC and BIC), with 46, 50 and 53 parameters, respectively. However, the model that most approached the standard multi-characteristic model was PC4, and is therefore most appropriate due to the similarity of covariance estimates. Estimates of heritability ranged from 0.06 (LP) to 0.31 (AOL) with MV and 0.04 (LP) to 0.30 (AOL) with PC4. The highest est... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre