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Développement de nouveaux outils informatiques de surveillance en temps réel des phénomènes anormaux basés sur les données de microbiologie clinique du laboratoire de la Timone / Implementation of new informatic tools for the real time surveilllance of abnormal events based on data from the Timone microbiology clinical laboratory

Abat, Cédric 12 October 2015 (has links)
Bien que considérées comme étant sous contrôle durant la seconde partie du 20ième siècle avec la découverte des antimicrobiens, les maladies infectieuses demeurent une menace bien réelle pour l’humanité. Quelque soit l’état de connaissance que nous avons sur ces maladies, toutes demeurent imprédictibles. Afin de lutter contre ce phénomène, de nombreuses stratégies de surveillance ont été développées amenant à la mise en place de divers outils informatiques de surveillance épidémiologique visant à détecter et identifier, le plus précocement possible, des événements anormaux. L’objectif initial de notre travail a consisté à mettre en place, au sein de l’Institut Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection et à partir du logiciel Microsoft Excel, deux nouveaux outils informatiques de surveillance épidémiologique visant à identifier, de façon hebdomadaire et automatisée, des événements anormaux sur la base des données de microbiologie clinique issues du laboratoire du Centre Hospitalo-Universitaire Timone à l’Assistance Publique- Hôpitaux de Marseille (AP-HM). Une fois cette étape achevée, nous avons par la suite travaillé au développement d’une structure de surveillance complète intégrant l’investigation et la validation des alarmes émises par les systèmes de surveillance créés, l’émission d’alertes à l’Agence Régionale de Santé (ARS) de la région Provence-Alpes Côte d’Azur (PACA), la valorisation des cas d’événements anormaux confirmés par des publications scientifiques, ainsi que la mise en place de rétro-informations et de bulletins épidémiologiques hebdomadaires visant à informer les acteurs locaux de la surveillance épidémiologique des maladies infectieuses. / Although considered under control in the second half of the 20th century with the discovery of antimicrobials, infectious diseases remain a serious threat to humanity. Regardless of the state of knowledge we possess on these diseases, all remained unpredictable. To fight this phenomenon, many monitoring strategies have been developed leading to the implementation of various epidemiological surveillance computer programs to detect and identify, as soon as possible, abnormal events including epidemic phenomena. The initial objective of our work was to implement, within the Hospitalo-Universitaire Méditerranée Infection and based on the Microsoft Excel software, two new automated computer-based programs for the weekly automated epidemiological surveillance of abnormal epidemic events using clinical microbiological data from the Timone teaching hospital of of Assistance Publique- Hôpitaux de Marseille (AP-HM). Once completed, we then worked to develop a comprehensive monitoring structure incorporating the investigation and the validation of alarms emitted by the established surveillance systems, the transmission of alerts to the Regional Health Agency (ARS) of the Provence-Alpes Côte d'Azur (PACA), the public dissemination of confirmed abnormal events by publishing scientific articles, and the implementation of feedback and weekly epidemiological bulletins to inform local infectious diseases epidemiological surveillance actors.
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Répertoire des bactéries identifiées par Maldi-Tof en Afrique de l'Ouest / Repertory of bacteria identified in West Africa by Maldi-Tof

Lo, Cheikh Ibrahima 07 December 2015 (has links)
Le répertoire des bactéries est mal connu en Afrique du fait des méthodes d’étude essentiellement basées sur des techniques de culture sur milieux simples associées à des tests biochimiques, ce qui ne permet pas son exploration. Il a néanmoins été récemment bouleversé par l’usage systématique de la spectrométrie de masse de type MALDI-TOF MS.Au cours de nos travaux de thèse de doctorat, nous avons utilisé deux types de spectromètres de masse: le MALDI-TOF Vitek MS, nouvellement installé à Dakar; le MALDI-TOF Microflex LT, installé à Marseille. Les résultats que nous avons obtenus ont montré, pour la première fois, que la technique du MALDI-TOF est efficace et tout à fait adaptée en Afrique pour le diagnostic spécifique de routine. Cette performance a conduit le laboratoire clinique de l’HPD à opter pour son utilisation à la place des traditionnelles techniques d’identification phénotypique telles que les galeries API. Nous avons également confirmé que le MALDI-TOF est un puissant outil d’identification des espèces bactériennes rarement impliquées dans les maladies infectieuses humaines. De plus, cet outil nous a permis de détecter sept nouvelles espèces de bactéries isolées pour la première fois chez l’homme. En Afrique, il faudrait donc multiplier l’installation de spectromètre de masse MALDI-TOF, ou mettre en place des réseaux autour de plateformes MALDI-TOF sous-régionales partagées entre plusieurs structures sanitaires et/ou de recherche. / The Africa bacteria repertory is unfamiliar because the available tools in this region are not allowed its best knowledge. In fact, bacteria are most often identified using culture techniques on simple media and biochemical tests which enable the identification of some common characters. These methods do not facilitate an exhaustive knowledge of the bacterial repertory; consequently they have recently been revolutionized by the systematic use of MALDI-TOF mass spectrometry (MS).In our thesis we used two mass spectrometers, respectively, MALDI-TOF Vitek MS currently installed at Dakar (Senegal) and MALDI-TOF Microflex LT installed in Marseille (France). In addition we have also confirmed that MALDI-TOF is a powerful tool for identifying bacterial species rarely involved in human infectious diseases. Thus in adopting the MALDI-TOF as a first-line tool in bacterial identification before Gram staining or other techniques of phenotypic identifications based on chemical characteristics, we discovered seven new species of bacteria isolated for first time in humans. Microbial identification using MALDI-TOF MS is currently feasible in Africa. Its performance and effectiveness in routine diagnosis of clinical microbiology laboratories have been proven. It is necessary either to increase the installation of MALDI-TOF, or establishing a network around a shared MALDI-TOF platform between several structures located in the same area, especially in the underdeveloped countries of Africa amortization of investment costs of the device, because it allowed reducing the time of reporting results and indirectly facilitating better care for patients.
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Quantification des mouvements de la mimique faciale par motion capture sur une population de volontaires sains / Quantification of facial movements by motion capture on healthy volunteers

Sarhan, François-Régis 14 June 2017 (has links)
La prise en charge des déficits moteurs de la mimique faciale est complexe et nécessite un suivi sur le long terme. Il existe de nombreuses techniques d’évaluation de la mimique faciale déficitaire avec des degrés variables de sensibilité. Cependant, la plupart de ces techniques sont manuelles et qualitatives (testing musculaire et scores cliniques). Elles conduisent donc à des mesures subjectives et peu reproductibles dans le temps. Ces techniques d’évaluation reposent en outre sur l’appréciation de l’évaluateur qui est une source importante de biais. Ainsi, l’apport d’un outil de mesure objectif pour quantifier un déficit et optimiser le suivi et la prise en charge médicale, chirurgicale et rééducative des patients apparait comme nécessaire. L’objectif de ce travail de thèse était donc de développer un outil quantitatif permettant d’évaluer les troubles de la mimique faciale. Dans cette perspective, nous avons mis en place un protocole d’analyse du mouvement par motion capture et avons réalisé des mesures sur une population de référence. Une étude descriptive utilisant un système de capture de mouvement en 3 dimensions a été réalisée sur des volontaires sains (n = 30) âgés de 20 à 30 ans. Le système de capture du mouvement était constitué de 17 caméras optoélectroniques T160 et de 2 caméras vidéo Bonita (Vicon™). Les mouvements étudiés étaient : la fermeture « simple » (non forcée) des paupières, la fermeture forcée des paupières, la protrusion labiale sur le son « o » [o], la protrusion labiale sur le son « pou » [pμ], et un sourire volontaire découvrant les dents. Lors de ces mouvements, nous avons enregistré et analysé le déplacement de 111 marqueurs réfléchissants de 1.5mm placés sur la face des sujets. Pour les cinq mouvements réalisés, nous avons obtenu des données quantitatives. Celles-ci nous ont permis d’identifier les zones d’action pour chacun des mouvements, de mesurer l’amplitude des déplacements et d’obtenir des données comparables dans le temps. Par ailleurs, le protocole mis en place a été évalué et sa réalisation est compatible avec une application clinique. L’analyse de la cinématique de la face est donc une technique appropriée à la clinique qui pourrait faciliter le diagnostic, le suivi et la rééducation des patients. Ce travail a permis de définir des mesures de référence qui constitueront la base d’un outil diagnostic, qu’il convient désormais de mettre en œuvre sur des patients. / The care of facial paralysis is often complex and therefore requires monitoring over the long term. There are many clinical severity scores with varying levels of sensitivity to assess the deficit of facial movement, but most of them are qualitative. The number of assessment methods is an obstacle to monitor patients and treatment evaluation. We need an objective measurement tool to provide reliable measures of resting asymmetry, symmetry of voluntary movement and synkinesis. The aim of this study is to determine if the 3D motion capture of the face is compatible with these clinical criteria. A descriptive study using a 3-dimensional (3D) motion capture system were performed on healthy volunteers (n=30) age from 20 to 30 years. The motion capture system consists of 17 optoelectronic cameras at a frequency of 100Hz. We captured the movements of the face on healthy volunteers. We obtained absolute values: 3D coordinates and relative displacements. These data were free of manual measurements, and the use of 3D motion capture does not impede the facial movement. The average time of capture was less than 10 minutes. The measurements are painless for subjects. Data are collected in a computer and can be easily exported. These results show the feasibility of 3D motion capture of facial movement. The protocol used here could be standardized to be routinely relevant. lt was used in an experimental study to follow up recovery of a facial transplantation. This technique could help to overcome the uncertainty caused by subjective assessment and optimize therapeutic choices.
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Effet d'un DVD éducatif pré-opératoire sur les connaissances et les conduites des parents en salle de réveil: une étude clinique randomisée

Chartrand, Julie January 2014 (has links)
Le but de la présente étude était d’évaluer l’effet d’un DVD éducatif pré-opératoire sur l’acquisition de connaissances, les conduites de participation et l’anxiété des parents présents en salle de réveil lors d’une chirurgie d’un jour de leur enfant. Cette étude visait également à évaluer le DVD en termes de l’anxiété des parents ainsi que de la détresse, de la douleur, des analgésiques et de la durée de la récupération post-opératoire des enfants. Suite à l’élaboration et à l’évaluation d’un DVD éducatif bilingue destiné aux parents, une étude clinique randomisée pré- et post-test avec groupe contrôle a été effectuée auprès d’un échantillon de convenance composé de 123 dyades parent-enfant francophones ou anglophones dont l’enfant, âgé de 3 à 10 ans, a subi une chirurgie d’un jour de type ORL ou dentaire dans un hôpital pédiatrique canadien. Les parents du groupe contrôle ont reçu la préparation habituelle (information verbale et écrite sur les procédures hospitalières fournies par une infirmière et visite virtuelle de chirurgie) et les parents du groupe expérimental ont visionné le DVD éducatif et effectué la préparation habituelle. Les parents et les enfants étaient observés en salle de réveil au moyen d’une caméra vidéo; la participation des parents et la détresse des enfants ont été mesurées à l’aide de grilles d’observation. Un questionnaire maison validé a été utilisé pour évaluer l’acquisition des connaissances des parents alors qu’une échelle visuelle analogue a servi aux parents pour rapporter leur anxiété avant, pendant et après leur séjour en salle de réveil. Les données relatives à la douleur post-opératoire des enfants, aux doses d’analgésiques post-opératoires administrés aux enfants et à la durée de la récupération post-opératoire des enfants ont été recueillies à partir du dossier médical des enfants. Des analyses statistiques du test-t, du chi-carré et des ANOVA à mesures répétées ont été effectuées auprès de 105 dyades afin de mesurer l’effet du DVD sur les variables reliées aux parents et aux enfants. iii Les parents du groupe expérimental ont acquis plus de connaissances et ont démontré plus de conduites de participation reliées au renforcement positif, à la distraction et à la relaxation que les parents du groupe contrôle. La douleur post-opératoire des enfants à l’unité de chirurgie d’un jour était significativement moins élevée chez les enfants du groupe expérimental que ceux du groupe contrôle. Il n’y a pas eu toutefois de différence significative entre les groupes en regard de l’anxiété des parents, de la détresse des enfants, des doses d’analgésiques post-opératoires administrés aux enfants et de la durée de la récupération post-opératoire des enfants. Grâce au DVD éducatif pré-opératoire, les parents peuvent adopter un plus grand nombre de conduites de renforcement positif, de distraction et de relaxation auprès de leur enfant en salle de réveil et contribuer à la diminution de la douleur post-opératoire de leur enfant. En plus du DVD, le personnel infirmier doit appuyer les parents par un soutien psychologique et physique afin d’atténuer les retombées négatives d’une chirurgie d’un jour sur l’enfant et ses parents.
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Evaluation clinique des dispositifs médicaux / Clinical evaluation of medical devices

Huot, Laure 20 December 2012 (has links)
Les dispositifs médicaux (DM) sont des produits de santé qui représentent un ensemblehétérogène de plus de 500 000 technologies, allant de la plus simple à la plus complexe.Contrairement au médicament, il n’existe pas de démarche formelle quant aux étapes dudéveloppement clinique des DM, notamment pour ceux les plus à risque.L’objectif de ce travail de thèse était de décrire les données cliniques disponibles en Francelorsqu’un DM accède au marché, et de proposer des solutions pour améliorer la quantité etla qualité des études cliniques réalisées. Pour cela, nous avons exploré deux voies :l’accompagnement des industriels pour la mise en place d’études cliniques qui répondentaux attentes des différents acteurs ; et l’utilisation de registres pour améliorer le niveau depreuve disponible, en générant des données cliniques complémentaires dès la diffusion.L’évaluation clinique des DM est complexe et difficile ; elle nécessite un apprentissage desindustriels et des interactions avec les autorités de santé. Toutefois, le niveau des donnéescliniques disponibles pour évaluer les DM doit et peut être amélioré, notamment par laspécialisation de méthodologistes et l’accompagnement des industriels par des plateformesproches du terrain clinique. / Medical devices are health products representing a heterogeneous set of more than 500 000technologies, from the simplest to the most complex ones. Unlike drugs, there is no formalframework for the stages of clinical development of medical devices, especially those with ahigher degree of risk.The objective of this thesis was to describe clinical data available in France when a medicaldevice is launched, and suggest some options to improve the quality and quantity of clinicalstudies performed. To this end, we explored two ways: supporting enterprises for theimplementation of clinical studies that meet the expectations of all stakeholders; and usingregistries to improve the level of available evidence by generating additional post-marketingclinical data.The clinical evaluation of medical devices is complex and difficult, and must go through thelearning of industrials and interactions with health authorities. However, the level of clinicalevidence should and can be improved, including the specialization of methodologists and theaccompaniment of enterprises through platforms close to the clinical field.
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Revue systématique de l’évaluation de la qualité et du contenu scientifique des guides de pratique

Désy, Francois 04 1900 (has links)
No description available.
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Modélisation ontologique des recommandations de pratique clinique pour une aide à la décision à niveaux d'abstraction variables / Ontological modeling of clinical practice guidelines to provide flexible decision support

Galopin, Alexandre 16 September 2015 (has links)
Conformément aux principes de la médecine factuelle, les guides de bonne pratique clinique (GBPC) sont élaborés dans un but d'amélioration de la qualité des soins. Pourtant, le suivi des recommandations par les médecins reste faible, même lorsqu'elles sont intégrées dans des systèmes informatisés d'aide à la décision. En effet, elles sont souvent critiquées pour leur manque de flexibilité, et leur incapacité à gérer la singularité des patients rencontrés en pratique clinique. En particulier, leur orientation monopathologique est en inadéquation avec la réalité de patients bien souvent polypathologiques. Nos travaux portent sur la proposition d'une méthode basée sur un raisonnement ontologique pour permettre la conciliation de GBPC pour la prise en charge flexible de patients polypathologiques au sein d'un système d'aide à la décision. Les bases de connaissances reposent sur des règles construites par formalisation des recommandations, dont les critères patients sont organisés par une ontologie du domaine, permettant de produire un graphe des profils cliniques structuré par généralisation. Le raisonnement ontologique permet une juste adaptation des connaissances aux niveaux d'abstraction variables de la description du patient. Cette méthode a été implémentée dans un système d'aide à la décision, appelé GO-DSS, et appliquée à la prise en charge de patients diabétiques et hypertendus, à partir des GBPC produits par la société VIDAL (VIDAL Recos). Le prototype et ses interfaces ont été évalués qualitativement par un échantillon d'utilisateurs comprenant à la fois des informaticiens avec des connaissances médicales et des médecins avec des compétences en informatique. / Clinical practice guidelines (CPGs) are elaborated according to evidence-based medicine principles in order to improve healthcare quality. However, even when they are integrated into clinical decision support systems, recommendations are poorly implemented by physicians. Indeed, CPGs are often criticized for their lack of flexibility, and their inability to handle the singularity of patients encountered in clinical practice. In particular, CPGs are usually elaborated for a single pathology whereas patients usually suffer from multiple pathologies and comorbidities. We have proposed a method based on an ontological reasoning to enable the reconciliation of single-pathology CPGs to support the flexible management of patients with multiple pathologies. Knowledge bases are made of decision rules that formalize the content of single-pathology CPGs. Patient criteria are organized by a domain ontology, which allows the generation of a generalization-ordered graph of clinical patient profiles. The ontological reasoning allows to reason at different levels of abstraction to process clinical cases described with different levels of completeness. This method has been implemented in a decision support system called GO-DSS, and applied to the management of patients suffering from both arterial hypertension and type 2 diabetes, on the basis of CPGs produced by the VIDAL company (VIDAL Recos). The prototype and its user interfaces have been qualitatively evaluated by a sample of users including both computer scientists with medical knowledge and physicians with computer skills.
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Clinical applications of the kT-points method to homogenise spin excitation in 3T MRI / Applications cliniques de la méthode des points kT pour homogénéiser l'excitation des spins en IRM à 3 teslas

Tomi-Tricot, Raphaël 26 September 2018 (has links)
L'imagerie par résonance magnétique (IRM) à haut champ offre un bénéfice certain en rapport signal-sur-bruit. De ce fait, les imageurs à 3T sont souvent utilisés en pratique clinique.Cependant, à haut champ, les images d'IRM sont entachées de pertes de signal et de contraste liées à la baisse de la longueur d’onde radiofréquence (RF) en deçà des dimensions de l'objet irradié. A 3T, où la longueur d'onde est de 30 cm environ dans les tissus humains, de tels artéfacts sont fréquents en imagerie abdominale, des seins ou encore des cuisses, ce qui peut expliquer la difficulté que rencontre l'IRM à haut champ à s'imposer comme référence dans les hôpitaux. Les imageurs 3T les plus récents disposent en général d'un système de transmission parallèle à deux canaux RF. Chaque canal peut en principe émettre des formes d'impulsion RF indépendantes. En pratique, sur la plupart des systèmes IRM cliniques, la méthode dite de shim RF statique est utilisée. Les différents canaux transmettent la même forme d’onde,en ajustant amplitude et phase de sorte à entraîner des motifs d’interférences pour contrer les inhomogénéités, mesurées au préalable sur le patient: cartes de champ RF et éventuellement de champ statique. Cette méthode fonctionne d’autant mieux qu’un grand nombre de canaux est disponible, mais montre ses limites lorsqu’il s’agit d’homogénéiser l’excitation sur un grand champ de vue. La méthode des points kT, développée à NeuroSpin pour l’IRM cérébrale à ultra-haut champ (7T) utilise une alternance d’impulsions RF rectangulaires et de gradients de champ statique pour moduler à dessein l’aimantation des spins et ainsi homogénéiser l’excitation malgré un champ RF inhomogène. Les impulsions ainsi créées sont d’autant plus efficaces qu’elles peuvent exploiter la transmission parallèle (huit canaux à 7T). Dans cette thèse, les points kT sont employés à 3T avec pour objectif d’en démontrer l’intérêt et l’applicabilité en routine clinique. Dans un premier temps, nous décrivons des modifications apportées à l’algorithme de conception de points kT et à la cartographie de champ statique permettant d’adapter la technique à l’imagerie du corps – foie, seins – où la présence des poumons et de la graisse entraîne des contraintes supplémentaires par rapport au cerveau.Dans un second temps, plusieurs études cliniques sont exposées. La première concerne l’IRM du sein en pondération T₂ sur un imageur à canal d’émission unique. Elle met en évidence que le mode d’émission par défaut fonctionne correctement et n’est que peu amélioré par les points kT. Une deuxième étude se penche sur l’imagerie dynamique du foie avec injection de produit de contraste, avec deux canaux. Des analyses quantitatives et qualitatives sont menées sur un grand nombre de patients pour comparer le shim RF statique avec les points kT. Ces derniers améliorent très nettement les images obtenues chez certains patients« difficiles », permettant ainsi d’offrir une qualité d’examen et de diagnostic plus homogène sur l’ensemble de la population. Enfin,une nouvelle technique est présentée, intitulée SmartPulse, qui s’appuie sur le concept d’impulsions universelles, développé à NeuroSpin pour l’imagerie du cerveau, et dont le principe est de concevoir des impulsions de type points kT qui, pour une application donnée, soient efficaces sur toute la population et permettent de se passer de calibration. En divisant la population en catégories pour lesquelles des impulsions différentes sont conçues,et en utilisant un algorithme de classification par apprentissage automatique, SmartPulse étend la portée des impulsions universelles au corps, et en particulier à l’abdomen, où la variabilité morphologique est importante. Par ces travaux de thèse, nous espérons donner un nouveau souffle à la gestion des inhomogénéités RF en routine clinique à 3T, et apporter des éléments permettant à terme de démocratiser l’imagerie des gros organes à ultra-haut champ. / High field magnetic resonance imaging (MRI) is often used in clinical practice, for the high signal-to-noise ratio it offers.However, at high field, the radiofrequency (RF) wavelength used for imaging is shorter, which can induce loss of signal and contrast when it is close to or shorter than the dimensions of the irradiated objects. At 3T, RF wavelength is about 30 cm in human tissues,and such artefacts are frequently observed in the abdomen, as well as in the thighs or in the breasts. This is certainly one of the main reasons why high field MRI has failed to establish itself as the gold standard in hospital, where 1.5T scanners are more frequent.Recent 3T scanners usually come with a two-RF-channel parallel transmission setup: in principle, each channel can transmit completely independent waveforms. However, this technology is not exploited fully in practice, as only the static RF shimming is implemented: a single waveform is used, with adjusted amplitude and phase on each channel. This allows to create interference patterns, calculated to counteract transmission inhomogeneities measured beforehand in the patient (RF and possibly static field).This method works best when many channels are available, but shows its limits when good homogeneity is expected over a large field of view. The kT-points method, developed at CEA-NeuroSpin for brain imaging at ultra-high field (7T) relies on a succession of short rectangular RF pulses interleaved with static gradient “blips” to modulate magnetisation at will, thus producing homogeneous excitation in spite of an imperfect RF field. Those composite pulses are even more effective as they can take advantage of parallel transmission (eight channels at 7T). In this thesis, the kT-points technique is applied at 3T. The objective is to demonstrate its usefulness and its compatibility with a clinical routine workflow. First, several changes made to the kT-points pulse design algorithm and to static field mapping in order to adapt them to body imaging (liver, breasts) are described. Indeed, the presence of lungs and fat add further constraints compared to the brain. Then, several clinical studies are detailed. The first one regards T₂-weighted breast MRI on a single-channel scanner. It shows that in that case the default transmit mode is satisfactory,and only slightly improved by kT-points. A second study focuses on T₁-weighted dynamic contrast-enhanced imaging of the liver,with two transmit channels. Static RF shimming and kT-points were compared on a large cohort. For some “difficult” patients,acquisitions were quantitatively and qualitatively better with kTpoints,which therefore offer a more uniform diagnostic quality among the population. Finally, a novel method is proposed:SmartPulse. It is based on the universal pulse concept, developed in NeuroSpin for brain imaging, whose principle is to design pulses (e.g. kT-points) for a given application, that homogenise excitation in the whole population, and not only for one subject.Thus, there is no more need for cumbersome mapping and inline pulse design. SmartPulse extends the range of universal pulses to body imaging, by adequately clustering the population, designing different pulses for each cluster, and applying a machine learning classifier to assign the most appropriate pulse to any new subject.Proof of concept was undertaken in abdominal imaging, whereinter-subject variability is considerable. We hope this thesis will give a new outlook on RF inhomogeneity handling in routine 3T MRI, and in the long run will help making body imaging moreaccessible at high and ultra-high field.
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Same-sex adoptive families: Parents' and children's experiences across the family life cycle

Messina, Roberta 26 June 2018 (has links) (PDF)
Il y a encore quelques années, être homosexuel, en couple et adopter un enfant relevait de l’utopie. Aujourd’hui, l’adoption par des couples homosexuels est devenue une réalité légale et une possibilité concrète dans plusieurs pays du monde.Pourtant, lorsqu’il faut placer les enfants dans des familles adoptives, l’orientation sexuelle des futurs parents demeure une question controversée qui divise l’opinion publique (Patterson, 2009). Souvent, le débat oppose « le droit de l’enfant », défendu par la Convention internationale des droits de l’enfant, et « le droit à l’enfant », réclamé par les homosexuels ou sympathisants (Herbrand 2006).Entre les débats socio-politiques, les controverses de nature idéologique et éthique, ces nouvelles familles, de plus en plus nombreuses, affirment haut et fort leur droit à « sortir de l’oubli » et s’engagent dans une bataille dont l’objectif est de normaliser leur contexte familial aux yeux de la société.Malgré l’expansion de l’adoption homoparentale, l’expérience de vie de ces nouvelles familles est à peine abordée dans la littérature scientifique actuelle. En effet, même si, ces quarante dernières années, de nombreuses recherches ont été consacrées à l’homoparentalité, très peu d’études se sont focalisées sur les familles ayant choisi l’adoption comme mode de filiation, surtout dans le contexte européen.L’objectif de la présente recherche était de combler ce vide dans la littérature, en analysant les expériences de la première génération de familles adoptives homoparentales résidant en Europe. Pour ce faire, nous avons donné la parole à 31 familles adoptives homoparentales, sur un total de 62 parents adoptifs (46 gays et 16 lesbiennes) et de 44 enfants adoptés (entre 3 et 18 ans) en Belgique, France et Espagne.Ces trois pays ont été choisis pour les éléments qu’ils partagent ou qui les opposent dans le contexte socio-politique des droits des minorités sexuelles et la procédure d’adoption. La Belgique et l’Espagne sont considérées aujourd’hui comme deux des pays les plus avant-gardistes et gay- friendly en Europe et dans le monde entier. De fait, ces deux pays ont été parmi les premiers à ouvrir l’adoption aux couples de même sexe(respectivement en 2006 et 2005). En revanche, la France n’a légiféré sur cette question qu’en 2013, après des débats longs et houleux qui ont suscité de nombreuses réactions.Etudier les familles homoparentales dans ces trois pays nous a permis d’avoir accès à des situations d’adoption différentes: en effet, tous les participants belges ont adopté des enfants en bas âge via une procédure d’adoption conjointe nationale, tandis que tous les participants français et la plupart des espagnols ont adopté des enfants à l’étranger et généralement plus âgés, via une procédure où seul l’un des deux partenaires adoptait légalement l’enfant.La théorie qui a orienté notre étude est celle du cycle de vie de la famille adoptive (Brodzinsky, Smith & Brodzinsky, 1998; Brodzinsky & Pinderhughes, 2002; Hajal & Rosenberg, 1991). S’inspirant du schéma « classique » du cycle de vie (Carter & McGoldrick, 1980) cette théorie identifie des phases clef à travers lesquelles la famille adoptive transite :la phase pré-adoption, durant laquelle le couple est souvent confronté à l’infertilité et décide d’entamer un parcours adoptif ;la procédure d’adoption, souvent vécue comme un moment de stress et d’incertitude; l’arrivée de l’enfant dans la famille, suivie du processus de « parentage » de l’enfant adopté, différent en fonction de l’âge de celui-ci (préscolaire, scolaire, ou adolescent). Selon cette conception, à chaque étape du cycle de vie, la famille adoptive est confrontée à de nouveaux défis et tâches développementales, qui sont à la fois similaires et différents de ceux vécus par des familles non-adoptives.Cette recherche avait pour but d’éclairer à la fois le vécu des homoparents adoptifs et des enfants adoptés au sein de ces nouvelles familles, en analysant leurs expériences en fonction de l’étape de leur cycle de vie.En ce qui concerne les parents, nous avons analysé trois moments clefs: le processus décisionnel, le parcours d'adoption et leurs expériences en tant qu’homoparents suite à l'arrivée de l'enfant dans la famille. Plus précisément, les questions suivantes ont guidé notre recherche :quel cheminement a été celui des homoparents avant de choisir l'adoption ?Quels sont les enjeux de la transition à l’homoparentalité adoptive ?Et quels sont les défis et les tâches parentales auxquels ils sont confrontés suite à l’adoption ?Concernant les enfants, nous avons analysé leur construction identitaire à différentes étapes de leur développement. Notre attention s’est portée sur les questions suivantes :quelle est l’expérience subjective de ces enfants ?Quelles sont les spécificités de leur construction identitaire à l’intersection de la situation adoptive et homoparentale ?Quelles sont leurs questions, leurs demandes tout au long de leur développement ?Ainsi, un intérêt particulier a été consacré à la thématique de la perte des parents de naissance et à l'exploration de dynamiques familiales au tour de cette issue. Plus précisément, nous avons analysé la communication familiale concernant la « double appartenance » des enfants (famille d’origine et famille adoptive) afin de répondre aux questions de recherche suivantes :comment ces familles gèrent- elles la perte des parents d’origine ?Quels sont les sentiments des homoparents et des enfants adoptés vis-à-vis des parents de naissance? Et comment cela impacte-t-il les dynamiques familiales ?Du point de vue méthodologique, nous avons conduit des entretiens semi-structurés et soumis les homoparents et leurs enfants à un test projectif graphique (La Double Lune, Greco 1999). L’entretien visait à approfondir les expériences des participants ;le test projectif, en permettant d’accéder à une dimension «plus inconsciente », a complété les informations obtenues. Cet instrument projectif s’est révélé particulièrement utile pour l’exploration des sentiments et des dynamiques relationnelles autour de la thématique de la perte de la famille d’origine.L’originalité de la présente recherche consiste dans le fait qu’elle est pionnière dans le contexte européen ainsi que dans le domaine psychologique. Notre étude a le mérite de fournir des réponses scientifiques à une question sociale de grande actualité, en recentrant les débats sur les principaux intéressés :les homoparents et leurs enfants. Leurs récits nous ouvrent la porte à un nouvel univers familial, dont les « points de repères » et les critères sont uniques et nouveaux. Les familles adoptives homoparentales sont des avant-gardistes de la société, des petits laboratoires de nouveaux mondes possibles. Ces familles anticipent et précèdent. Par leur exemple, elles accélèrent les changements de la société, elles poussent vers le futur.Les expériences des familles rapportées dans la présente thèse nous amèneront, page après page, à déconstruire nos propres préconceptions de la famille, du couple et de la filiation et à porter de « nouveaux regards » qui permettent de saisir l’incontestable richesse dont ces nouvelles géométries familiales sont dépositaires. Leurs témoignages nous permettront de concevoir une nouvelle manière de faire famille, mais aussi de « repenser » et « réinventer » le principe de l’adoption, sur base de leur expérience inédite. / Only a few years ago, being homosexual, in a relationship, and adopting a child was a utopia. Nowadays, same-sex adoption is a legal reality and a concrete possibility in many countries in the world. However, the right of gay and lesbian people to adopt a child remains a controversial issue that strongly divides public opinion. In the debate there are often those who defend “the right of the child” (according to the International Convention on the Rights of the Child) and those, these being sexual minorities and their sympathisers, who defend “the right to a child” (Herbrand 2006). Among socio-political debates, ideological and ethical controversies, these new families, who are becoming more and more numerous, claim, loud and clear, their right to "emerge from oblivion" and engage in a "battle" of which the objective is to normalise their family context in the eyes of society.Despite the progressive diffusion of same-sex adoption, the life experiences of these new families remain practically unexplored in scientific literature. In fact, even if in the last 40 years a great deal of research was dedicated to same-sex parenting, very few studies focused on families who chose adoption as a pathway to parenthood. Especially in the European context, there is a dearth of data on this topic. In order to fill this gap in literature, the present research aimed to analyse the experiences of the first generation of gay and lesbian adoptive families living in Europe. To this end, we gave the floor to 31 adoptive same-sex families, totalling 62 adoptive parents (46 gay men and 16 lesbians) and 44 adopted children (between 3 and 18 years old) living in Belgium, France and Spain.The choice for these three countries was motivated by the fact that they have a number of elements in common but also differ at some points as to the socio-political context of the rights of sexual minorities and the adoption process.Nowadays, Belgium and Spain are considered to be two of the most avant-garde and gay friendly countries both in Europe and worldwide. These two countries were among the first to open adoption to same-sex couples (respectively in 2006 and 2005). In turn, France legislated this aspect only in 2013, after long and controversial social debates. Studying same-sex families in these three countries enabled us to have access to varied adoption situations: in fact, all Belgian participants adopted infants through a joint national adoption procedure, while all the French and most of Spanish participants adopted generally older children abroad, through an international adoption procedure in which only one of the two partners legally adopted the child.Our study was oriented by the adoptive family cycle theory (Brodzinsky et al. 1998; Brodzinsky & Pinderhughes, 2002; Hajal & Rosenberg, 1991). Inspired by the classic theory of the family life cycle (Carter & McGoldrick, 1980), this theory identifies key phases through which the adoptive family transits: the pre-adoptive phase, during which the couple is often confronted with infertility and decides to start an adoption path; the adoption process, often experienced as a period of stress and uncertainty; the arrival of the child in the family, and the successive process of parenting the adopted child which changes according to the child’s age (infancy, preschool, school, or adolescence years). According to this theory, in each stage of the life cycle adoptive families encounter new challenges and developmental tasks, which are both similar and different from those experienced by non-adoptive families.This research aimed to study the experiences of both same-sex parents and the adopted children in these new families, by taking the stage of the family life cycle in which they were into account.On the side of the same-sex parents, we analysed three key moments: the decision-making process, the adoption procedure and their daily experiences as same-sex parents after the arrival of the child in the family.More precisely, the following questions guided our research: What is the personal journey of gay and lesbian people before choosing adoption? What are the main barriers encountered during the transition to same-sex adoptive parenthood? What are the main challenges and parental tasks they face after adoption? On the side of the adopted children, we were interested in exploring their identity construction process at different stages of their development. Our attention was focused on the following research questions: What is the personal experience of these children? What are the specificities of their identity construction at the intersection of their adoptive and family minority statuses? What are their questions and their developmental issues during their growing years?In addition, special attention was paid to the theme of the loss of birth parents and to the exploration of family dynamics surrounding this issue.We particularly studied the family communication concerning the double family connection of adopted children (family of origin and adoptive family), answering the following research questions: How do these families deal with the theme of the loss of the birth family? What are the feelings of same-sex parents and their adopted children towards the birth family? How does this element impact the family dynamics?From a methodological point of view, we conducted semi-structured interviews and applied a projective graphical test (the Double Moon Test, Greco, 1999) to both same-sex parents and their children. The purpose of the interviews was to explore the participants' experiences, while the projective test enriched the information obtained through the interviews, giving access to a more "unconscious" dimension. This projective instrument in particular, proved to be very useful for the exploration of feelings and relational dynamics connected with the theme of the loss of the birth family.The originality of this research is that it is pioneering in the European context as well as in the field of psychology. Our study has the merit of providing scientific answers to a very topical social question, by refocusing debates on the main stakeholders: gay and lesbian parents and their children. Their stories lead us into a new family universe whose distinguishing features and criteria are unique and new. Same-sex families are the avant-garde of society, small laboratories of possible new worlds. These families anticipate and precede. By their example, they accelerate changes in society, they push towards the future. The experiences of the families reported in this thesis will induce us, page after page, to deconstruct our own preconceptions of family, couples and filiation and bring about "a new perspective" that allows us to grasp the undeniable wealth for which these new family geometries are custodians. Their testimonies will allow us to imagine a new way of being a family, but also to "rethink" and "reinvent" the adoption clinic, based on their unique experience. / Doctorat en Sciences psychologiques et de l'éducation / info:eu-repo/semantics/nonPublished
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Etude des variants génétiques des déficits immuns primaires et des formes ethniques dans l’architecture génétique des maladies inflammatoires du tube digestif

Amininejad, Leila 21 November 2019 (has links) (PDF)
La majeure partie de l'héritabilité des maladies inflammatoires des intestins (MICI) comprenant essentiellement la maladie de Crohn (MC) et la rectocolite ulcéro-hémorragique (RCUH) reste manquante. A côté des formes classiques de MICI polygéniques, un nombre croissant de maladies rares monogéniques avec un syndrome d’immunodéficience primaire innée ou acquise (ou Primary Immune Deficiency (PID) disorders) et un tableau clinique de maladie inflammatoire gastro-intestinale semblable aux MICI ont été identifiées au cours de ces dernières années. Les gènes mutés au sein de ces PID pourraient contenir des variants rares associés aux MICI dont l'identification aurait échappé aux études d'association du génome (GWAS) et qui pourraient être détectés avec le séquençage à haut débit. Nous avons sélectionné 23 gènes candidats associés à dix maladies monogéniques avec manifestations gastro-intestinales inflammatoires ressemblant aux MICI et avons évalué la contribution éventuelle de ces gènes à la prédisposition héréditaire à développer une MC via d'une part une étude d'association sur base des données de génotypage de 17000 patients atteints de MC issus des GWAS de l'IIBDGC et d'autre part, via une étude de séquençage à haut débit au sein d'une cohorte de 2390 patients atteints de MC. Nous avons identifié 4 nouveaux variants du gène XIAP qui sont associés chez les patients porteurs de la mutation, à un défaut d'activation de la voie de NOD2 après stimulation par le muramyl dipeptide (MDP). En complément à l'étude des formes monogéniques de MICI, les formes non européennes peuvent également constituer une source de données à exploiter pour pallier à l'héritabilité manquante. En effet, la plupart des GWAS ont été effectuées au sein de populations d'origine européenne. Or en combinant plusieurs groupes ethniques, il est possible d'identifier de nouveaux loci de susceptibilité tel qu'on a pu l'observer dans la première étude trans-éthnique réalisée au sein de patients atteints de MICI. Très peu d'études génétiques ont été réalisées au sein de la population d'origine marocaine qui est la population non européenne la plus prépondérante en Belgique. Nous avons entrepris une étude d'association sur des puces de génotypage de type Immunochip au sein d'une population de 306 patients d'origine marocaine atteints de MICI, se focalisant sur les 163 variants communs de susceptibilité connus dans les MICI lorsque l'étude a été débutée. L'étude a identifié une association significative aux MICI pour dix loci notamment au sein des gènes tels que IL23R, JAK2, CARD9 ou CCR6. Ces associations sont nouvelles et n'ont pas été étudiées ou confirmées dans les précédentes études faites au sein de patients d'origine marocaine atteints de MICI. / Doctorat en Sciences médicales (Médecine) / info:eu-repo/semantics/nonPublished

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