Le genre Flavivirus regroupe plus de 70 espèces dont plusieurs sont des pathogènes humains de première importance responsables dans les formes les plus graves de manifestations hémorragiques ou d’encéphalites parfois mortelles. L’absence de traitements antiviraux spécifiques et l’augmentation croissante des flaviviroses, surtout dans les régions tropicales, justifient un effort de recherche et développement pour lutter contre ces maladies.Ce travail a abordé deux aspects de l’infection à flavivirus : un aspect épidémiologique et un aspect plus fondamental sur l’immunité innée et les contremesures flavivirales. L’étude épidémiologique a été menée en collaboration avec le CENETROP (Centro national de enfermedades tropicales) de Bolivie grâce à la contribution de l’IRD. De par l’analyse des différentes souches circulantes dans ce pays, elle a permis une meilleure compréhension de l’épidémiologie de la dengue et de la fièvre jaune et nous a fait prendre conscience de la variabilité génétique de ces virus. Devant le peu de données répertoriées en Bolivie, nos travaux serviront de référence pour comprendre les épidémies futures, peut-être améliorer les techniques de diagnostic et permettre le développement de stratégies de prévention adaptées et l’amélioration des politiques de lutte contre la fièvre jaune en Amérique du Sud. La cohabitation entre le virus et l’hôte immunocompétent est le résultat d’un équilibre subtil entre le taux de réplication virale et la clairance du système immunitaire pour garantir la survie des deux espèces. Chacun a évolué en développant des mécanismes de défenses contre l’autre. Notre second travail visait à analyser l’influence de la protéine flavivirale non structurale NS1 sur la réponse interféron de l’hôte. L’identification de stratégies virales d’évasion face à l’immunité de l’hôte et l’analyse de leurs fonctions dans l’infection virale permettrait de mieux comprendre le système immunitaire ainsi que l’interaction virus–hôte. Ceci aiderait au développement de nouvelles stratégies antivirales afin de traiter les pathologies associées à ces arbovirus. / The Flavivirus genus consists of sevevral human pathogens responsible for hemorragic syndrome or encephalitis. The absence of specific antiviral treatment and an increase in Flavivirus incidence has led to a greater research effort in fighting these diseases. The study takes an epidemiological and a fundamental approach in its analysis of the innate immune response to flavivirus infection as well as flaviviral adaptation to evade this response. The analysis of circulating strains in Bolivia has led to a better understanding of dengue and yellow fever and also an awareness of their genetic variability. Given the limited information available in Bolivia, our studies could be used as a reference to understand future epidemics, improve diagnostic methods and allow the development of prevention strategies to fight against yellow fever in south Africa. The relationship between virus and host results from a subtle balance between viral replication and immunity clearance allowing the survival of both species. Each one as developed defence mechanisms against the other. We also examined the role of the non structural protein NS1 in the interferon respons to Flaviviral infection. Knowledge on viral escape strategies from host immunity could help to develop antiviral treatment for these arbovirus diseases

Dans le domaine de la sécurisation des circuits intégrés, tel que les cartes à puce, les concepteurs de circuits sont contraints à innover, inlassablement, afin de trouver de nouvelles parades aux nouvelles attaques, notamment par canaux cachés. En effet, ces attaques, comme l'analyse des émissions électromagnétiques, permettent d'extraire des informations, contenues à l'intérieur des circuits, sensées être secrètes. Partant de ce constat, dans cette thèse, nous nous sommes focalisés sur l'étude et l'analyse électromagnétique et ce afin de quantifier les possibilités de ces attaques. Ce manuscrit est organisé de la manière qui suit. Dans un premier temps, une plateforme de mesures des émissions électromagnétiques temporelles, que nous avons développées, est présentée, ainsi que des résultats qui ont été obtenus, avec celle-ci, sur différents circuits. A partir de ces résultats, une synthèse des possibilités, relatives à la menace sécuritaire que constituent les analyses électromagnétiques est proposée ainsi que, des propositions de solutions, visant à réduire le rayonnement électromagnétique des circuits intégrés. Dans un second temps, nous nous sommes intéressés aux méthodes de simulation de ces émissions électromagnétiques. Un état de l'art, des outils de simulation existants aujourd'hui, nous a permis de mettre en évidence qu'aucun d'eux ne permet d'avoir une résolution suffisamment fine en termes d'émissions électromagnétiques. Afin de combler ce manque, un flot de simulation a été développé. Pour valider ce flot, une comparaison entre les résultats de mesure et les résultats de simulation a été effectuée. / In the area of secure integrated circuits, such as smart cards, circuit designers are always looking to innovate to find new countermeasures against attacks by the various side channels that exist today. Indeed, side channels attacks such as the analysis of electromagnetic emissions permit to extract secret information contained in circuits. Based on this observation, in this thesis, we focused on the study of electromagnetic analysis to observe the analysis possibilities. This manuscript is organized as follows. Initially, we presented a measurement system for electromagnetic emissions in time domain, and the results obtained on different circuits. From these results, a summary of opportunities, relating to the security threat, posed by electromagnetic analysis, is proposed as well as solutions proposals to reduce electromagnetic radiations of integrated circuits. In a second step, we are interested in the simulation of electromagnetic emissions. A state of the art of simulation tools which exist today, has allowed us to demonstrate that none of them allowed to have a fine enough resolution in terms of electromagnetic emissions. To fill this gap, a simulation tool has been developed and to validate this flow, a comparison between measurement results and simulation results was performed.

Ce travail constitue une étude sur la conception d'une architecture reconfigurable pour la<br />cryptographie. Divers aspects sont étudiés, tels que les principes de base de la cryptographie,<br />l'arithmétique modulaire, les attaques matériaux et les architectures reconfigurables. Des méthodes<br />originales pour contrecarrer les attaques par canaux cachés, notamment la DPA, sont proposés.<br />L'architecture proposée est efficace du point de vue de la performance et surtout est robuste contre<br />la DPA.

La sécurité de l'information repose étroitement sur les circuits intégrés (CI). Malheureusement, les CIs sont soumis à de nombreuses menaces telles que les attaques par canaux auxiliaires ou par injection de fautes. Ce travail se concentre sur les petites vulnérabilités et les contremesures liées à l’algorithme ECDSA. La motivation est qu’une source de vulnérabilité peut être utilisée dans différent scénario d’attaque. En corrigeant la vulnérabilité, les attaques existantes sont évitées mais également les attaques non découvertes ou non publiées utilisant la vulnérabilité en question. De plus, bien que le scalaire sur courbe elliptique soit au cœur de la sécurité de tous les schémas cryptographiques à base de courbe elliptique, l’ensemble du système a besoin d’être sécurisé. Une vulnérabilité concernant simplement quelques bits de secret peut suffire à récupérer la clef privée et donc doit être évité.L’ECDSA peut être implémenté de différentes façons, en logiciel ou via du matériel dédié ou un mix des deux. De nombreuses architectures différentes sont donc possibles pour implémenter un système à base d’ECDSA. Pour cette raison, ces travaux se concentrent principalement sur les contremesures algorithmiques. / Information security heavily relies on integrated circuits (ICs). Unfortunately, ICs face a lot of threats such as side channel or fault attacks. This work focuses on small vulnerabilities and countermeasures for the Elliptic Curve Digital Signature Algorithm (ECDSA). The motivation is that leakage sources may be used in different attack scenarios. By fixing the leakage, existing attacks are prevented but also undiscovered or non-disclosed attacks based on the leakage. Moreover, while the elliptic curve scalar algorithm is at the heart of the security of all elliptic curve related cryptographic schemes, all the ECDSA system needs security. A small leakage of few secret bits may conduct to fully disclose the private key and thus should be avoided.The ECDSA can be implemented in different flavors such as in a software that runs on a microcontroller or as a hardware self-contained block or also as a mix between software and hardware accelerator. Thus, a wide range of architectures is possible to implement an ECDSA system. For this reason, this work mainly focuses on algorithmic countermeasures as they allow being compliant with different kinds of implementations.

Les attaques par canaux cachés telles que les attaques par analyse de la consommation sont une menace pour la sécurité des circuits intégrés. Elles exploitent les fuites physiques émises par les circuits lors des calculs cryptographiques pour récupérer les informations secrètes qu'ils contiennent. De nombreuses contremesures, notamment matérielles, ont donc été proposées par la communauté dans le but de protéger les crypto-systèmes contre ce type d'attaques. Malgré leur efficacité, leur inconvénient majeur est leur surcoût important en surface, vitesse et consommation. Cette thèse a pour objectif de proposer des contremesures avec un faible coût au niveau matériel visant à réduire ces fuites et offrant un bon compromis entre sécurité et surcoûts. Pour cela, nous identifions tout d'abord les principales sources de fuites d'un crypto-système intégrant une architecture matérielle itérative d'un algorithme symétrique. Puis nous proposons plusieurs contremesures, à faible coût matériel, qui visent à réduire ces fuites. Enfin, nous évaluerons la robustesse de nos solutions face aux attaques par canaux cachés. / Side channel attacks such as power analysis attacks are a threat to the security of integrated circuits.They exploit the physical leakage of circuits during the cryptographic computations to retrieve the secret informations they contain. Many countermeasures, including hardware, have been proposed by the community in order to protect cryptosystems against such attacks. Despite their effectiveness, their major drawback is their significant additional cost in area, speed and consumption. This thesis aims at proposing low cost countermeasures able to reduce the leaks and offering a good compromise between security and costs. First we identify the main sources of leakage of a cryptographic system that integrates an iterative hardware architecture of a symetric algorithm. Then we propose several low cost countermeasures, which aim at reducing this leakage. Finally, we evaluate the robustness of our solutions against side channel attacks.

Dans cette thèse nous développons et améliorons des attaques de systèmes cryptographiques. Un nouvel algorithme de décomposition de signal appelé transformation de Hilbert-Huang a été adapté pour améliorer l’efficacité des attaques parcanaux auxiliaires. Cette technique permet de contrecarrer certaines contre-mesures telles que la permutation d’opérations ou l’ajout de bruit à la consommation de courant. La seconde contribution de ce travail est l’application de certaines distributions statistiques de poids de Hamming à l’attaque d’algorithmes de chiffrement par bloc tels que AES, DES ou LED. Ces distributions sont distinctes pour chaque valeur de sous-clef permettent donc de les utiliser comme modèles intrinsèques. Les poids de Hamming peuvent être découverts par des analyses de canaux auxiliaires sans que les clairs ni les chiffrés ne soient accessibles. Cette thèse montre que certaines contremesures peuvent parfois faciliter des attaques. Les contre-mesures contagieuses proposées pour RSA protègent contre les attaques par faute mais ce faisant et moyennant des calculs additionnels facilitent la découverte de la clef. Finalement, des contre-mesures à faible complexité calculatoire sont proposées. Elles sont basées sur le masquage antagoniste, c’est-à-dire, l’exécution d’une opération d’équilibrage sur des données sensibles pour masquer la consommation de courant. / The goal of the thesis is to develop and improve methods for defeating protected cryptosystems. A new signal decompositionalgorithm, called Hilbert Huang Transform, was adapted to increase the efficiency of side-channel attacks. This technique attempts to overcome hiding countermeasures, such as operation shuffling or the adding of noise to the power consumption. The second contribution of this work is the application of specific Hamming weight distributions of block cipher algorithms, including AES, DES, and LED. These distributions are distinct for each subkey value, thus they serve as intrinsic templates. Hamming weight data can be revealed by side-channel and fault attacks without plaintext and ciphertext. Therefore these distributions can be applied against implementations where plaintext and ciphertext are inaccessible. This thesis shows that some countermeasures serve for attacks. Certain infective RSA countermeasures should protect against single fault injection. However, additional computations facilitate key discovery. Finally, several lightweight countermeasures are proposed. The proposed countermeasures are based on the antagonist masking, which is an operation occurring when targeting data processing, to intelligently mask the overall power consumption.

Ce travail de thèse a pour cadre le projet Trusted Environment Execution eVAluation (TEEVA) (projet français FUI n°20 de Janvier 2016 à Décembre 2018) qui vise à évaluer deux solutions alternatives de sécurisation des plateformes mobiles, l’une est purement logicielle, la Whitebox Crypto, alors que l’autre intègre des éléments logiciels et matériels, le Trusted Environment Execution (TEE). Le TEE s’appuie sur la technologie TrustZone d’ARM disponible sur de nombreux chipsets du marché tels que des smartphones et tablettes Android. Cette thèse se concentre sur l’architecture TEE, l’objectif étant d’analyser les menaces potentielles liées aux infrastructures de test/debug classiquement intégrées dans les circuits pour contrôler la conformité fonctionnelle après fabrication.Le test est une étape indispensable dans la production d’un circuit intégré afin d’assurer fiabilité et qualité du produit final. En raison de l’extrême complexité des circuits intégrés actuels, les procédures de test ne peuvent pas reposer sur un simple contrôle des entrées primaires avec des patterns de test, puis sur l’observation des réponses de test produites sur les sorties primaires. Les infrastructures de test doivent être intégrées dans le matériel au moment du design, implémentant les techniques de Design-for-Testability (DfT). La technique DfT la plus commune est l’insertion de chaînes de scan. Les registres sont connectés en une ou plusieurs chaîne(s), appelé chaîne(s) de scan. Ainsi, un testeur peut contrôler et observer les états internes du circuit à travers les broches dédiées. Malheureusement, cette infrastructure de test peut aussi être utilisée pour extraire des informations sensibles stockées ou traitées dans le circuit, comme par exemple des données fortement corrélées à une clé secrète. Une attaque par scan consiste à récupérer la clé secrète d’un crypto-processeur grâce à l’observation de résultats partiellement encryptés.Des expérimentations ont été conduites sur la carte électronique de démonstration avec le TEE afin d’analyser sa sécurité contre une attaque par scan. Dans la carte électronique de démonstration, une contremesure est implémentée afin de protéger les données sensibles traitées et sauvegardées dans le TEE. Les accès de test sont déconnectés, protégeant contre les attaques exploitant les infrastructures de test, au dépend des possibilités de test, diagnostic et debug après mise en service du circuit. Les résultats d’expérience ont montré que les circuits intégrés basés sur la technologie TrustZone ont besoin d’implanter une contremesure qui protège les données extraites des chaînes de scan. Outre cette simple contremesure consistant à éviter l’accès aux chaînes de scan, des contremesures plus avancées ont été développées dans la littérature pour assurer la sécurité tout en préservant l’accès au test et au debug. Nous avons analysé un état de l’art des contremesures contre les attaques par scan. De cette étude, nous avons proposé une nouvelle contremesure qui préserve l’accès aux chaînes de scan tout en les protégeant, qui s’intègre facilement dans un système, et qui ne nécessite aucun redesign du circuit après insertion des chaînes de scan tout en préservant la testabilité du circuit. Notre solution est basée sur l’encryption du canal de test, elle assure la confidentialité des communications entre le circuit et le testeur tout en empêchant son utilisation par des utilisateurs non autorisés. Plusieurs architectures ont été étudiées, ce document rapporte également les avantages et les inconvénients des solutions envisagées en terme de sécurité et de performance. / This work is part of the Trusted Environment Execution eVAluation (TEEVA) project (French project FUI n°20 from January 2016 to December 2018) that aims to evaluate two alternative solutions for secure mobile platforms: a purely software one, the Whitebox Crypto, and a TEE solution, which integrates software and hardware components. The TEE relies on the ARM TrustZone technology available on many of the chipsets for the Android smartphones and tablets market. This thesis focuses on the TEE architecture. The goal is to analyze potential threats linked to the test/debug infrastructures classically embedded in hardware systems for functional conformity checking after manufacturing.Testing is a mandatory step in the integrated circuit production because it ensures the required quality and reliability of the devices. Because of the extreme complexity of nowadays integrated circuits, test procedures cannot rely on a simple control of primary inputs with test patterns, then observation of produced test responses on primary outputs. Test facilities must be embedded in the hardware at design time, implementing the so-called Design-for-Testability (DfT) techniques. The most popular DfT technique is the scan design. Thanks to this test-driven synthesis, registers are connected in one or several chain(s), the so-called scan chain(s). A tester can then control and observe the internal states of the circuit through dedicated scan pins and components. Unfortunately, this test infrastructure can also be used to extract sensitive information stored or processed in the chip, data strongly correlated to a secret key for instance. A scan attack consists in retrieving the secret key of a crypto-processor thanks to the observation of partially encrypted results.Experiments have been conducted during the project on the demonstrator board with the target TEE in order to analyze its security against a scan-based attack. In the demonstrator board, a countermeasure is implemented to ensure the security of the assets processed and saved in the TEE. The test accesses are disconnected preventing attacks exploiting test infrastructures but disabling the test interfaces for testing, diagnosis and debug purposes. The experimental results have shown that chips based on TrustZone technology need to implement a countermeasure to protect the data extracted from the scan chains. Besides the simple countermeasure consisting to avoid scan accesses, further countermeasures have been developed in the literature to ensure security while preserving test and debug facilities. State-of-the-art countermeasures against scan-based attacks have been analyzed. From this study, we investigate a new proposal in order to preserve the scan chain access while preventing attacks, and to provide a plug-and-play countermeasure that does not require any redesign of the scanned circuit while maintaining its testability. Our solution is based on the encryption of the test communication, it provides confidentiality of the communication between the circuit and the tester and prevents usage from unauthorized users. Several architectures have been investigated, this document also reports pros and cons of envisaged solutions in terms of security and performance.

Les applications grand public comme la téléphonie mobile ou les cartes bancaires manipulent des données confidentielles. A ce titre, les circuits qui les composent font de plus en plus l'objet d'attaques qui présentent des menaces pour la sécurité des données. Les concepteurs de systèmes sur puce (SoC) doivent donc proposer des solutions sécurisées, tout en limitant le coût et la complexité globale des applications. L’analyse des attaques existantes sur les circuits numériques nous a orienté vers celles se basant sur la tension d'alimentation, dans des nœuds technologiques avancés.Dans un premier temps, nous avons déterminé la signature électrique d’un circuit en phase de conception. Pour cela, un modèle électrique a été proposé, prenant en compte la consommation en courant et la capacité de la grille d'alimentation. L'extraction de ces paramètres ainsi que l'évaluation du modèle sont présentées. L’utilisation de ce modèle a permis de mesurer la vulnérabilité d’un circuit mais aussi d’évaluer quantitativement des contremesures, notamment celle utilisant des capacités de découplage. Ensuite, l’étude se consacre à l’injection de fautes par impulsions de tension d’alimentation. Les mécanismes d’injection de fautes sur des circuits numériques ont été étudiés. Dès lors, des solutions de détection d’attaques ont été proposées et évaluées à la fois en simulation et par des tests électriques sur circuit. Les résultats ont permis de confirmer les analyses théoriques et la méthodologie utilisée.Ce travail a ainsi montré la faisabilité de solutions à bas coût contre les attaques actives et passives en tension, utilisables dans le cadre d’un développement industriel de produits. / General use products as mobile phones or smartcards manipulate confidential data. As such, the circuits composing them are more and more prone to physical attacks, which involve a threat for their security. As a result, SoC designers have to develop efficient countermeasures without increasing overall cost and complexity of the final application. The analysis of existing attacks on digital circuits leads to consider power attacks, in advanced technology nodes.First of all, the power signature of a circuit was determined at design time. To do so, an electrical model was suggested based on the current consumption and the overall power grid capacitance. The methodology to extract these parameters, as well as the evaluation of the model are presented. This model allows designers to anticipate information leakage at design time and to quantify the protection of countermeasures, as the use of integrated decoupling capacitors. Then, the study was dedicated to power glitch attacks. The different fault injection mechanisms were analyzed in details. From then on, a set of detection circuits were suggested and evaluated at design time and on silicon by electrical tests. Both the theoretical analysis and the given methodology were confirmed by the test campaigns.This work demonstrated that the design of low-cost solutions against passive and active power attacks can be achieved, and used in a large scale product development.