No description available.

Les éléments chimiques métalliques tels que Fe, Cu ou Zn sont présents en quantité infime dans le cerveau. Le rôle de ces métaux traces dans les fonctions neuronales, telles que la transmission synaptique et les processus de mémorisation, reste encore largement à élucider. En outre, une dyshoméostasie des métaux est retrouvée dans de nombreuses neuropathologies, telles que maladie d’Alzheimer, de Parkinson ou sclérose latérale amyotrophique. Les mécanismes d’interaction des métaux traces au niveau neuronal sont difficiles à décrire faute de méthodes analytiques possédant une résolution et une sensibilité adaptées pour en déterminer la distribution à l’échelle synaptique. La spectrométrie de fluorescence-X synchrotron (SXRF) est une méthode d’analyse chimique multi-élémentaire permettant de décrire la distribution quantitative de ces éléments à l’échelle subcellulaire avec une résolution nanométrique (40 nm avec la ligne ID16A du synchrotron ESRF) et une très haute sensibilité. Afin d’interpréter avec précision les résultats d’imagerie chimique, nous avons développé un protocole pour corréler l’imagerie nano-SXRF avec la microscopie super résolutive de déplétion par émission stimulée (STED) permettant ainsi la corrélation des distributions des métaux avec celle de protéines cibles en super résolution. Nous avons marqué les microtubules et l’actine-F de neurones primaires d’hippocampe de rat puis imagé le cytosquelette par microscopie STED avant de déterminer par spectrométrie SXRF les distributions des éléments P, S, Fe, Cu et Zn. Nous avons ainsi mis en évidence la colocalisation du Zn et des microtubules au niveau dendritique ainsi qu’une localisation du Cu essentiellement dans le cou des épines dendritiques riches en F-actine, et une distribution du Fe sous forme de points très localisés dans les dendrites. Ces résultats ont révélé le rôle essentiel du Zn dans l’architecture du cytosquelette des neurones d’hippocampe et la méthode d’imagerie corrélative développée ouvre de nouvelles perspectives pour l’étude des dyshoméostasies des métaux dans les maladies neurodégénératives. / Metallic chemical elements such as Fe, Cu or Zn are present in minute quantities in the brain. The role of these trace metals in neuronal functions such as synaptic transmission and memory processes remains largely unclear. Moreover, metal dyshomeostasis is found in many neuropathologies, such as Alzheimer’s disease, Parkinson’s or amyotrophic lateral sclerosis. The interaction mechanisms of trace metals at the neuronal level are difficult to describe because of the lack of analytical methods with appropriate resolution and sensitivity to determine metal distribution at the synaptic level. Synchrotron X-ray fluorescence spectrometry (SXRF) is a multielemental chemical analysis method for describing the quantitative distribution of these elements at the sub-cellular scale with a nanometric resolution (40 nm at ESRF beamline ID16A ) and a very high sensitivity. In order to accurately interpret chemical imaging results, we have developed a protocol to correlate nano-SXRF imaging with stimulated emission depletion super resolution microscopy (STED), allowing the correlation of metal distribution and that of target proteins in super resolution. We labeled microtubules and F-actin of primary rat hippocampal neurons and imaged the cytoskeleton by STED microscopy before determining the distributions of P, S, Fe, Cu and Zn by SXRF spectrometry. We evidenced the colocalization of Zn and microtubules at the dendritic level and a localization of Cu mainly in the neck of dendritic spines rich in F-actin, and a distribution of Fe in the form of very localized points in the dendrites. These results highlight the crucial role of Zn in cytoskeleton architecture of hippocampal neurons and the developed correlative imaging method opens new perspectives for the study of metal dyshomeostasis in neurodegenerative diseases.

An important step for the design of direction finding systems is the performance evaluation using numeric electromagnetic simulation tools. In this thesis, a method is presented for both modeling and simulation in a numeric electromagnetic simulation tool FEKO. The method relies on the data generated by FEKO. The data is then processed by correlative interferometer algorithm. This process is implemented in a MATLAB environment. Different types of antenna arrays including dipole, monopole and discone antennas are used. The antenna arrays are mounted on a UAV and SUV in order to see the platform effects. The direction finding performance is evaluated for different scenarios. It is shown that the presented approach is an effective tool for understanding the direction finding characteristic of antenna arrays.

The efficacy Biological wastewater treatment process is largely dependent on the formation of microbial flocs and settleability before the water is released into the environment. Settleability and flocculation are reliant upon stable physicochemical parameters. Extracellular polymeric substance constituents dictate physicochemical parameters of flocs. The fluctuation of these constituents within mixed microbial flocs is poorly studied. A novel aspect of this research was the use of CLSM data to get a semi- quantitative assessment of the constituents within mixed microbial flocs. Wastewater treatment flocs were characterized for eubacterial ecology, physicochemical properties, and they were visualized through correlative microscopy. It was observed that the microbial communities from the three sampling sites exhibited significant variability in numerous physicochemical properties. Overall, these results provide a first step to examine micro-localization of physicochemical properties, architecture and processes within flocs that may help better understand the causes of floc- related inefficiencies in biological wastewater treatment. / Canadian Hemophilia Society

Cette thèse porte sur la définition d'un schéma de recalage automatique en microscopie corrélative 2D et 3D, en particulier pour des images de microscopie optique et électronique (CLEM). Au cours des dernières années, la CLEM est devenue un outil d'investigation important et puissant dans le domaine de la bio-imagerie. En utilisant la CLEM, des informations complémentaires peuvent être collectées à partir d'un échantillon biologique. La superposition des différentes images microscopiques est généralement réalisée à l'aide de techniques impliquant une assistance manuelle à plusieurs étapes, ce qui est exigeant et prend beaucoup de temps pour les biologistes. Pour faciliter et diffuser le procédé de CLEM, notre travail de thèse est axé sur la création de méthodes de recalage automatique qui soient fiables, faciles à utiliser et qui ne nécessitent pas d'ajustement de paramètres ou de connaissances complexes. Le recalage CLEM doit faire face à de nombreux problèmes dus aux différences entre les images de microscopie électronique et optique et leur mode d'acquisition, tant en termes de résolution du pixel, de taille des images, de contenu, de champ de vision et d'apparence. Nous avons conçu des méthodes basées sur l'intensité des images pour aligner les images CLEM en 2D et 3D. Elles comprennent plusieurs étapes : représentation commune des images LM et EM à l'aide de la transformation LoG, pré-alignement exploitant des mesures de similarité à partir d'histogrammes avec une recherche exhaustive, et un recalage fin basé sur l'information mutuelle. De plus, nous avons défini une méthode de sélection robuste de modèles de mouvement, et un méthode de détection multi-échelle de spots, que nous avons exploitées dans le recalage CLEM 2D. Notre schéma de recalage automatisé pour la CLEM a été testé avec succès sur plusieurs ensembles de données CLEM réelles 2D et 3D. Les résultats ont été validés par des biologistes, offrant une excellente perspective sur l'utilité de nos développements. / This thesis is concerned with the definition of an automated registration framework for 2D and 3D correlative microscopy images, in particular for correlative light and electron microscopy (CLEM) images. In recent years, CLEM has become an important and powerful tool in the bioimaging field. By using CLEM, complementary information can be collected from a biological sample. An overlay of the different microscopy images is commonly achieved using techniques involving manual assistance at several steps, which is demanding and time consuming for biologists. To facilitate and disseminate the CLEM process for biologists, the thesis work is focused on creating automatic registration methods that are reliable, easy to use and do not require parameter tuning or complex knowledge. CLEM registration has to deal with many issues due to the differences between electron microscopy and light microscopy images and their acquisition, both in terms of pixel resolution, image size, content, field of view and appearance. We have designed intensity-based methods to align CLEM images in 2D and 3D. They involved a common representation of the LM and EM images using the LoG transform, a pre-alignment step exploiting histogram-based similarities within an exhaustive search, and a fine mutual information-based registration. In addition, we have defined a robust motion model selection method, and a multiscale spot detection method which were exploited in the 2D CLEM registration. Our automated CLEM registration framework was successfully tested on several real 2D and 3D CLEM datasets and the results were validated by biologists, offering an excellent perspective in the usefulness of our methods.

Electron backscatter diffraction is a method that is well described and commonly used for orientation image mapping, including grain size estimation. The use of this method for measuring elastic deformation and rotations caused by plastic deformations is not so well decribed. This diploma thesis first describes the typical EBSD system. The information regarding the standard coordinate systems, grain orientation notation and system calibration is then used to create an open-source software for mapping elastic deformations and rotations inside a single grain or a monocrystal. This software uses data acquired during standard EBSD mapping on a commercial system.

Tyrimo objektas – segetinė flora ekologinės gamybos ūkyje. Darbo tikslas – lauko tyrimais ištirti ekologinio gamybos ūkio segetinės floros gausumą varpinių javų bei daugiamečių žolių pasėliuose. Darbo metodai. Siekiant ištirti segetinės floros gausumą varpinių javų ir daugiamečių žolių pasėliuose, piktžolės buvo imamos iš 3 laukų: 1 – pirmų naudojimo metų dobilų ir motiejukų mišinys, 2 – avižų ir žirnių mišinys, 3 – antrų naudojimo metų daugiametės žolės (pašariniai motiejukai). 2010 metų gegužės mėnesį iš kiekvieno lauko buvo išskirta po 12 tyrimo laukelių (0,25 m2 ploto) keturiose vietose t.y. iš l m2, kiekvieno lauko pradžioje, viduryje ir pabaigoje. Išskirtuose laukeliuose piktžolės imamos tris kartus: vegetacijos pradžioje, viduryje ir pabaigoje. Piktžolės raunamos su šaknimis, nuo jų nupurtomos žemės, tą pačią dieną nustatoma kiekvieno laukelio piktžolių botaninė sudėtis ir žalioji masė. Toliau piktžolės džiovinamos saulės neapšviestoje patalpoje keletą dienų, joms išdžiūvus nustatoma orasausė masė. Darbo rezultatai. Tirtuose varpinių javų bei daugiamečių žolių pasėliuose per visą tyrimo laikotarpį buvo aptiktos 27 piktžolių rūšys: 19 trumpaamžių ir 18 ilgaamžių. Iš trumpaamžių piktžolių vyravo: daržinė žliūgė (Stellaria media) ir dirvinis garstukas (Sinapis arvensis), o iš ilgaamžių piktžolių vyravo: dirvinė usnis (Cirsium arvense) ir dirvinė pienė (Sonchus arvensis). Piktžolių skaičius buvo didžiausias avižų ir žirnių mišinio pasėlyje – vidutiniškai 349 vnt. m-2... [toliau žr. visą tekstą] / Research object – segetal flora in organic farming. The aim of the research – to perform field studies in order to investigate the abundance of segetal flora in cereal crops and perennial grasses at Agro ecological centre of Lithuanian University of Agriculture. Methods of the research. In order to investigate the abundance of segetal flora at cereal crops and perennial, weeds were taken from three fields: 1 – the first year use of clover and timothy, 2 – oats and peas mixture, 3 – the second year use of perennial grass (timothy). 2010 May has been divided 12 research fields (0,25 m2) in four areas namely on the 1 m2 at the beginning, middle and the end of each field. Weed were taken three times: at the beginning of vegetation, in the middle and the end. Weeds are eradicated with the roots, soil taken of, each field botanical structure and green mass are determined the same day. Then weeds are dried in dark room for several days, air-dried weight determined after this. The results of the research. Studying cereal crops and perennial grasses during the whole period were found in 27 species of weeds: 19 short and 18 long-living. Leading short-living weeds: common chickweed (Stellaria media) and wild mustard (Sinapis arvensis), dominating long-living weeds: ground thistle (Cirsium arvense), forage milk (Sonchus arvensis). Weed density was the highest in a mixture of oats and peas crop – an average of 349 unit m-2. The highest number of weeds was in the beginning of the field... [to full text]

<p>Рад је посвећен испитивању могућности, ефикасности, тешкоћа и ограничења примене корелацијско-интеграцијског методичког система у обради садржаја еколошког образовања. Прецизније речено, циљ рада је евалуација примене корелацијско-интеграцијског методичког система у обради еколошких садржаја, са аспекта припреме, реализације и ефеката у наставном процесу, посебно кад је реч о образовним постигнућима ученика у погледу нивоа, квалитета и ретенције усвојених наставних садржаја, затим са аспекта утврђивања предности и недостатака наведеног методичког система, као и мишљења о његовом значају од стране учесника васпитно-образовног процеса, првенствено ученика и наставника. Евалуација корелацијско-интеграцијског методичког система урађена је кроз неколико фаза: (а) праћење и вредновање припреме, организације и реализације експерименталног програма, (б) вредновање образовних постигнућа ученика, (в) сагледавање мишљења ученика и наставника о реализацији експерименталног програма. Како би се утврдило да ли постоји узрочно-последична веза између примене експерименталног програма и нивоа и квалитета знања ученика, коришћен је квази-експеримент са паралелним групама. Мерења која су урађена у три различита временска тренутка (иницијални тест, финални тест и ретест) омогућила су нам да<br />утврдимо напредак ученика у нивоу и квалитету знања, али и могућност ретенције знања ученика. Према резултатима нашег истраживања, експериментални програм који смо применили имао је ефекте на: (а) ниво знања и напредак ученика из области екологије; (б) квалитет знања и напредак ученика, пре свега, у домену примене стеченог знања; (в) веће задовољство и мотивацију ученика у наставном процесу и (г) позитивно мишљење о примени корелацијско-интеграцијског методичког система.</p> / <p>Rad je posvećen ispitivanju mogućnosti, efikasnosti, teškoća i ograničenja primene korelacijsko-integracijskog metodičkog sistema u obradi sadržaja ekološkog obrazovanja. Preciznije rečeno, cilj rada je evaluacija primene korelacijsko-integracijskog metodičkog sistema u obradi ekoloških sadržaja, sa aspekta pripreme, realizacije i efekata u nastavnom procesu, posebno kad je reč o obrazovnim postignućima učenika u pogledu nivoa, kvaliteta i retencije usvojenih nastavnih sadržaja, zatim sa aspekta utvrđivanja prednosti i nedostataka navedenog metodičkog sistema, kao i mišljenja o njegovom značaju od strane učesnika vaspitno-obrazovnog procesa, prvenstveno učenika i nastavnika. Evaluacija korelacijsko-integracijskog metodičkog sistema urađena je kroz nekoliko faza: (a) praćenje i vrednovanje pripreme, organizacije i realizacije eksperimentalnog programa, (b) vrednovanje obrazovnih postignuća učenika, (v) sagledavanje mišljenja učenika i nastavnika o realizaciji eksperimentalnog programa. Kako bi se utvrdilo da li postoji uzročno-posledična veza između primene eksperimentalnog programa i nivoa i kvaliteta znanja učenika, korišćen je kvazi-eksperiment sa paralelnim grupama. Merenja koja su urađena u tri različita vremenska trenutka (inicijalni test, finalni test i retest) omogućila su nam da<br />utvrdimo napredak učenika u nivou i kvalitetu znanja, ali i mogućnost retencije znanja učenika. Prema rezultatima našeg istraživanja, eksperimentalni program koji smo primenili imao je efekte na: (a) nivo znanja i napredak učenika iz oblasti ekologije; (b) kvalitet znanja i napredak učenika, pre svega, u domenu primene stečenog znanja; (v) veće zadovoljstvo i motivaciju učenika u nastavnom procesu i (g) pozitivno mišljenje o primeni korelacijsko-integracijskog metodičkog sistema.</p> / <p>The present study investigated the possibilities,<br />effectiveness, difficulties and limitations in<br />application of the correlative-integrative<br />approach in teaching ecological education. In<br />specific, the aim of this study was to evaluate<br />the correlative-integrative approach in teaching<br />ecological education. The evaluation of the<br />correlative-integrative approach was done in<br />three ways: (a) by following and evaluating<br />lesson preparation, organisation and realisation<br />of the experimental program; (b) by evaluating<br />student education achievements; and (c) by<br />interpreting students&rsquo; and teachers&rsquo; views on the<br />realisation of the experimental program. To<br />assess whether there is a cause-and-effect<br />relationship between the application of the<br />experimental program and a level and quality of<br />student knowledge we executed a pseudoexperiment<br />with paired groups. Data gathered at<br />three different testing periods (initial test, final<br />test and repeated test) allowed us to ascertain<br />student development in terms of level and<br />quality of knowledge, as well as retention of<br />knowledge. The empirical data obtained in this<br />study showed that the experimental program<br />was effect on: (a) the level of knowledge and<br />students&#39; progress in the field of ecology; (b) the<br />quality of knowledge and progress of students,<br />primarily in the domain of application of<br />acquired knowledge; (c) greater satisfaction and<br />motivation of students in the learning process<br />and (d) a positive opinion on the application of&nbsp;correlation and integration approach.</p>

Resumo: A pesquisa analisa os eventos deposicionais, esculturadores do relevo, na bacia do Ribeirão Entupido, Complexo Alcalino do Passa Quatro, Estado de São Paulo, a partir do estudo dos depósitos recentes da área. Além da análise geomorfológica na referida unidade espacial, a pesquisa buscou estabelecer a idade absoluta de deposição de algumas unidades sedimentares estruturadoras do relevo e os mecanismos envolvidos na sua gênese. Neste contexto, utilizou-se datações por Luminescência Opticamente Estimulada (LOE) e Termoluminescência (TL). Os depósitos sedimentares foram estudados a partir da abordagem morfoestratigráfica. O cruzamento de dados morfoesculturais e morfoestruturais e de datação absoluta permitiu estabelecer quais mecanismos, atuantes ao longo do último milhão de anos, comandaram a morfogênese na bacia em foco. A determinação da morfogênese permitiu definir a susceptibilidade do relevo às mudanças ambientais, inclusive às intervenções antrópicas. Os depósitos sedimentares apresentaram idades vinculadas ao Pleistoceno Superior (61.500 anos) e Holoceno (650 anos) representando, portanto, eventos diferenciados no desenvolvimento e localização deste ambientes. A complexidade da paisagem na bacia do Ribeirão Entupido envolve justamente esta interdigitação de materiais de idades diversas que compõem o mesmo ambiente de deposição, interferindo conjuntamente a tectônica e as condições climáticas, a priori, na espacialização dos depósitos e nas características dos sedimentos. / Abstract: This research of doctor's grade analyze the depositional and sculptural events, at stream Entupido basin, Passa Quatro Alkalin Complex, Estate of São Paulo, from the study of recent deposits.Beyond the geomorphologycal analysis at referred spacial unit, this research tried to establish the absolute age of some sedimentary units that structure the relief and the mechanism involved in its genesis. The dating method of Optically Stimulated Luminescence (OSL) Thermoluminescence (TL) was used in that context.The sedimentary deposits were studied by morphostratigraphic approach. The crossing of mophosculptural and moprostructural data and absoluting dating allow establish wich mechanism, acting through the last million years, commanded the morphogenesis process at the basin.The determination of morfogenesis allowed define the susceptilidy of relief to ambiental changes, including antropic intervention. The sedimentary deposits show ages linked at Up Pleistocene (61.500 years) and Holocene (650 years), showing, therefore, differenced events in development and localization of this environment.The landscape complexity in stream Entupido basin, involves precisely this interdigitation of materials and different ages that compose the same depositional environment, interfering jointly tectonic and climatic conditions, in prior, at specialization of deposits and sedimentary characteristics. / Orientador: Iandara Alves Mendes / Coorientador: Francisco Sérgio Bernardes Ladeira / Banca: Archimedes Perez Filho / Banca: Salvador Carpi Júnior / Banca: Cenira Maria Lupinacci da Cunha / Banca: Regina Célia de Oliveira / Possui 5 mapas anexos / Doutor

Darbo objektas – segetinė flora Kazliškių ekologinės gamybos ūkyje. Darbo tikslas – ištirti Kazliškių ekologinio ūkio žieminių kviečių lauko segetinės floros dinamiką priklausomai nuo sezoniškumo bei meteorologinių sąlygų. Darbo uždaviniai. • Nustatyti, kaip kinta segetinės floros kiekis žiemkenčių lauke priklausomai nuo sezoniškumo bei meteorologinių sąlygų. • Nustatyti piktžolių žaliosios ir orasausės masės kitimą žiemkenčių lauke priklausomai nuo sezoniškumo bei meteorologinių sąlygų. • Nustatyti piktžolių skaičiaus bei masės priklausomybę nuo hidroterminio koeficiento. Darbo metodai. Atliekant tyrimą iš žieminių kviečių lauko buvo išskirta 10 tyrimo laukelių po 0,25 m2, t.y. 2,5 m2. Tyrimo laukeliai pažymėti, kad butų galima sugrįžti į tą pačią vietą ir suskaičiuoti piktžoles prieš pjūtį. Atliekant tyrimą buvo suskaičiuotos išdygusios piktžolės, nustatyta piktžolių botaninė sudėtis ir nustatyta orasausė masė. Piktžolės buvo raunamos su šaknimis, nuo jų nupurtomos žemės, sudedamos į atskiras krūveles pagal tyrimo laukelio numerį. Tą pačią dieną suskaičiuojamas piktžolių kiekis, nustatoma kiekvieno laukelio piktžolių botaninė sudėtis ir pasveriama žalioji masė. Po to piktžolės buvo džiovinamos saulės neapšviestoje patalpoje keletą dienų, kol pasiekė orasausę masę. Darbo rezultatai. Nustatyta, kad tyrimo metu agrofitocenozėje vyravo šios piktžolės: pelkinė notra (Stachys palustris L.), paprastasis varputis (Agropyron repens L.), dirvinė usnis (Circium arvense L), trikertės... [toliau žr. visą tekstą] / The theme of thesis paper – is segetical flora of Kazliškiai ecological farm. The aim of thesis paper – is to analyze segetical flora dynamic of winter wheat of Kazliškiai ecological farm depending on meteorological and seasonal conditions. The tasks of thesis paper. • To define the variation of segetical flora of winter wheat depending on seasonal and meteorological conditions. • To analyze the variation of fresh and dried mass of winter wheat depending on seasonal and meteorological conditions. • To define the number of weed and mass dependence on hydrothermal coefficient. Work methods. During the research, every field was divided into small research fields (0.25x0.25). The research fields were marked so that it would be possible to find them as well as to calculate the weeds before the harvest. The botanical composition as well as air dry content was determined. The weeds were grubbed up with their roots, then the weeds were shaked to eliminate the soil, and finally the weeds were sorted to the separate heap according to the same day the botanical composition and green mass of weeds of every field was determined. Later the weeds were dried in a place not subjected to the direct sunlight for few days until the air – dry content was researched. Work results. During the research there dominated in agro phi to community these weeds: Agropyron repens L., Circium arvense L., Capsella bursa-pastoris L., Viola arvensis L., Tripleurospermum perforatum L., Taraxacum officinale L... [to full text]