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Genotipagem dos isolados de Giardia duodenalis em famílias de pescadores da colônia de Porto Said, Botucatu, São Paulo /Arbex, Ana Paula Oliveira. January 2015 (has links)
Orientador: Semiramis Guimarâes Ferraz Viana / Banca: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Jose Ricardo Jensen / Resumo: As enteroparasitoses ainda persistem como problema de saúde pública, sobretudo nos países em desenvolvimento, onde o protozoário Giardia duodenalis (sin. Giardia intestinalis, Giardia lamblia) destaca-se como uma das causas mais frequentes de diarreia em crianças. Assim, no presente estudo investigou-se a prevalência de das infecções causadas por Giardia e outros parasitas intestinais e funcionários da Creche e Escola Municipal de Educlação Infantil (CEMEI) do distrito de Vitoriana, Botucatu-SP, incluindo-se também os familiares e cães das crianças cujos exames de fezes foram positivos para Giardia. Paralelamente, por meio de análise multilocular empregando os genes-alvo beta-giardina (bg), triose fosfato isomerase (tpi) e glutamato desiderogenase (gdh), caracterizou-se geneticamente os isolados de G. duodenalis detectados nessa população. Para isso, foram analisadas três amostras de fezes de 123 crianças (0 a 6 anos), 14 funcionários, 44 familiares e 20 cães. As amostras foram processadas por centrífugo-sedimentação e centrífugo-flutuação e examinadas em microscópio óptico. Parasitas intestinais foram identificados em 50 das 123 amostras de fezes de crianças (41,6%), e parasitismo por Giardia foi detectado em 21,9% das crianças (27/123). Das 27 famílias que tinham crianças parasitadas por Giardia, apenas 16 (44 indivíduos) forneceram amostras de fezes. Nestas, cistos de Giardia não foram detectados em nenhuma das amostras dos funcionários e dos cães examinadas. Com respeito ao parasitismo por Giardia nas crianças que frequentam a creche, as análises revelaram que as crianças mais jovens estão em maior risco de contrair a infecção por Giardia (OR = 0,69; IC95% = 00.49-0.97; p = 0,03). Além disso, verificou-se que o risco de infecção aumenta quanto maior for o número de indivíduos no domicílio (OR = 1,8; IC95% = 1,07-3,07; p = 0,03). Para a caracterização molecular dos isolados de Giardia, o DNA... / Abstract: The intestinal parasites persist as a public health problem, especially in developing countries, where the protozoan Giardia duodenalis (syn. Giardia intestinalis, Giardia lamblia) stands out as one of the most common causes of diarrhea in children. The present study was conducted to investigate the prevalence of Giardia and other intestinal parasites in children and workers of a daycare center of Vitoriana, a district of Botucatu municipality, São Paulo State, including also the household members and dogs of the children tested positive for Giardia. In addition, we proposed to investigate the genetic diversity of G. duodenalis infection in these population using three gene loci beta-giardin (bg), triose phosphate isomerase (tpi) and glutamate dehydrogenase (gdh). For this, three samples were analyzed from 123 children feces (0-6 years), 14 workers, 44 families members and 20 dogs. Samples were processed by centrifugal sedimentation and flotation and examined under a light microscope. Intestinal parasites were identified in 50 of 123 fecal samples from children (41.6%), and Giardia was the most frequent parasite detecte (21.9%). Out of the 27 families of children tested positive for Giardia, only 16 (44 individuals) provided stool samples. In these samples, cysts were detected in two samples. Focusing on Giardia infection among children attending day care, the analysis showed that younger children are at higher risk of acquiring Giardia infection (OR = 0.69; 95% CI = 00.49-0.97; p = 0.03). In addition, children living in families with a higher household density were more likely to be infected (OR = 1.8; 95% IC = 1.07-3.07; p = 0.03). DNA extracted from 186 stool samples (35 negative and 151 positive samples for microscopic examination) were amplified and the products sequenced generating 59 sequences as follow: 15 for bg, 25 for tpi and 19 for gdh. Out of the 29 isolates assessed, the sequencing analysis ... / Mestre
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Genotipagem dos isolados de Giardia duodenalis em famílias de pescadores da colônia de Porto Said, Botucatu, São PauloArbex, Ana Paula Oliveira [UNESP] 24 February 2015 (has links) (PDF)
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000848444.pdf: 1048998 bytes, checksum: b28bb1d076d5877b7947ca3acc33cbf2 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As enteroparasitoses ainda persistem como problema de saúde pública, sobretudo nos países em desenvolvimento, onde o protozoário Giardia duodenalis (sin. Giardia intestinalis, Giardia lamblia) destaca-se como uma das causas mais frequentes de diarreia em crianças. Assim, no presente estudo investigou-se a prevalência de das infecções causadas por Giardia e outros parasitas intestinais e funcionários da Creche e Escola Municipal de Educlação Infantil (CEMEI) do distrito de Vitoriana, Botucatu-SP, incluindo-se também os familiares e cães das crianças cujos exames de fezes foram positivos para Giardia. Paralelamente, por meio de análise multilocular empregando os genes-alvo beta-giardina (bg), triose fosfato isomerase (tpi) e glutamato desiderogenase (gdh), caracterizou-se geneticamente os isolados de G. duodenalis detectados nessa população. Para isso, foram analisadas três amostras de fezes de 123 crianças (0 a 6 anos), 14 funcionários, 44 familiares e 20 cães. As amostras foram processadas por centrífugo-sedimentação e centrífugo-flutuação e examinadas em microscópio óptico. Parasitas intestinais foram identificados em 50 das 123 amostras de fezes de crianças (41,6%), e parasitismo por Giardia foi detectado em 21,9% das crianças (27/123). Das 27 famílias que tinham crianças parasitadas por Giardia, apenas 16 (44 indivíduos) forneceram amostras de fezes. Nestas, cistos de Giardia não foram detectados em nenhuma das amostras dos funcionários e dos cães examinadas. Com respeito ao parasitismo por Giardia nas crianças que frequentam a creche, as análises revelaram que as crianças mais jovens estão em maior risco de contrair a infecção por Giardia (OR = 0,69; IC95% = 00.49-0.97; p = 0,03). Além disso, verificou-se que o risco de infecção aumenta quanto maior for o número de indivíduos no domicílio (OR = 1,8; IC95% = 1,07-3,07; p = 0,03). Para a caracterização molecular dos isolados de Giardia, o DNA... / The intestinal parasites persist as a public health problem, especially in developing countries, where the protozoan Giardia duodenalis (syn. Giardia intestinalis, Giardia lamblia) stands out as one of the most common causes of diarrhea in children. The present study was conducted to investigate the prevalence of Giardia and other intestinal parasites in children and workers of a daycare center of Vitoriana, a district of Botucatu municipality, São Paulo State, including also the household members and dogs of the children tested positive for Giardia. In addition, we proposed to investigate the genetic diversity of G. duodenalis infection in these population using three gene loci beta-giardin (bg), triose phosphate isomerase (tpi) and glutamate dehydrogenase (gdh). For this, three samples were analyzed from 123 children feces (0-6 years), 14 workers, 44 families members and 20 dogs. Samples were processed by centrifugal sedimentation and flotation and examined under a light microscope. Intestinal parasites were identified in 50 of 123 fecal samples from children (41.6%), and Giardia was the most frequent parasite detecte (21.9%). Out of the 27 families of children tested positive for Giardia, only 16 (44 individuals) provided stool samples. In these samples, cysts were detected in two samples. Focusing on Giardia infection among children attending day care, the analysis showed that younger children are at higher risk of acquiring Giardia infection (OR = 0.69; 95% CI = 00.49-0.97; p = 0.03). In addition, children living in families with a higher household density were more likely to be infected (OR = 1.8; 95% IC = 1.07-3.07; p = 0.03). DNA extracted from 186 stool samples (35 negative and 151 positive samples for microscopic examination) were amplified and the products sequenced generating 59 sequences as follow: 15 for bg, 25 for tpi and 19 for gdh. Out of the 29 isolates assessed, the sequencing analysis ... / FAPESP: 2011/52100-3
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Avaliação do perfil de mutações e resistência aos inibidores de transcriptase reversa e protease em pacientes pediátricos infectados pleo HIV-1 /Tonami, Camila Alves. January 2014 (has links)
Orientador: Rejane Maria Tommasini Grotto / Banca: Jaime Olbrich Neto / Banca: Paulo Inácio da Costa / Resumo: Apesar dos grandes avanços que conduziram a um declínio da infecção pelo HIV em crianças, a terapêutica antirretroviral vem sendo limitada pela emergência de resistência. Neste contexto, a finalidade deste estudo foi avaliar o perfil de mutações e resistência aos inibidores de transcriptase reversa análogos de nucleosídeos (ITRN) e não análogos de nucleosídeos (ITRNN) protease (IP) das variantes virais circulantes em pacientes pediátricos atendidos no Ambulatório de Imunologia Pediátrica da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP. Foram avaliados dezenove pacientes, sendo dezesseis com falha terapêutica e, três virgens de tratamento. RNA viral plasmático foi utilizado como fonte para genotipagem das regiões genômicas da transcriptase reversa (TR) e protease (PR) do HIV. Os resultados demonstraram prevalência do subtipo B (78,95%). As mutações de resistência aos ITRNs encontradas em maior frequência foram L214F (73,7%), M184V (42,1%), R211K (42,1%), M41L (31,5%), T215Y (31,5%), L210W (21%), V118I (21%). As mutações K103N e Y188L encontradas em 26,3% e 10,5% dos pacientes foram as mais freqüentes entre as mutações associadas ao uso dos ITRNNs. Quanto aos IPs as mutações mais frequentes foram M36I (63,1%), L63P (52,6%), E35D (47,3%), R41K (31,5%), I13V (31,5%), M46V (26,3%), L90M (26,3%), I93L (26,3%), V77I (26,3%), V82A (21,1%), I54V (21,1%). No que se relaciona ao perfil de resistência, 3TC, AZT, EFV e NVP foram os ITR com menor potencial de uso devido à resistência. Já os IPs apresentam grande potencial de utilização na população estudada, o que se justifica pela alta barreira genética destes medicamentos. Dos três pacientes não tratados, um apresentava resistência a EFV e NVP, sugerindo ocorrência de resistência transmitida. Novos estudos devem ser conduzidos a fim de avaliar o real significado destes achados / Abstract: Although great progresses lead a decline of the HIV infection in children, the antiretroviral therapy has found obstacles as the resistance emergency. In this context the goal of this study was evaluate to the profile of mutations and genotypic resistance to the Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NRTI), Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NNRTI) and Protease Inhibitors (PI) in children assisted in the Pediatric Immunology Ambulatory, Botucatu School of Medicine. Patients (19) were evaluated (16 with therapeutic failure and 3 naïve). Viral RNA was used as source to RT and PR genomic regions genotyping. Subtype B was the most frequent (78.95%) in thi study. The NRTI resistance mutations found were L214F (73.7%), M184V (42.1%), R211K (42.1%), M41L (31.5%), T215Y (31.5%), L210W (21%), V118I (21%). K103N and Y188L were found in 26.3% e 10.5% and we are associated with NNRTI use. About the PI the mutations most frequent were M36I (63.1%), L63P (52.6%), E35D (47.3%), R41K (31.5%), I13V (31.5%), M46V (26.3%), L90M (26.3%), I93L (26.3%), V77I (26.3%), V82A (21.1%), I54V (21.1%). The ARVs resistance analysis showed that 3TC, AZT, EFV and NVP have the lower potential for use due to resistance. PI presented great potential for use due to high genetic barrier. From three naïve patients one presented resistant viral variants to EFV and NVP, suggesting transmitted resistance. New studies should be performed to evaluate these findings / Mestre
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Ventilação oscilatória de alta frequência comparada com ventilação mecânica convencional associadas ao óxido nítrico inalatório : estudo randonizado e cruzado em crianças com insuficiência respiratória hipoxêmica aguda /Batista, Khristiani de Almeida. January 2013 (has links)
Orientador: José Roberto Fioretto / Banca: Eduardo Mekitariam filho / Banca: Marcelo Braciela Brandão / Banca: Mário ferreira Carpi / Banca: Regina Grigoli César / Resumo: Comparar os efeitos agudos do óxido nítrico inalatório (Noi) sobre a oxigenação durante ventilação oscilatória de alta frequência (VAF) e ventilação mecânica convencional (VMC) em crianças com insuficiência respiratória hipoxêmica aguda (IRHA). Crianças com IRHA, com idade entre 1 mês e 14 anos, em VMC com pressão expiratória final positiva (PEEP) maior ou igual a 10cmH2O foram aleatorizadas para VMC (GVMC, n=14) ou VAF (GVAF, n=14), em estudo randomizado e cruzado. Foram registrados índices de oxigenação e variáveis hemodinâmicas à inclusão (Tind), 1 hora após iniciar VMC (T0) e a cada 4h (T4...T24). A relação PaO2/FiO2 aumentou significantemente depois de 4 horas comparada com a inclusão em ambos os grupos [(GVMC- Tind: 111,95 ± 37 < T4h: 143,88 ± 47,5mmHg, p<0,05; GVAF- Tind: 123,76 ± 33 < T4h: 194,61 ± 62,42mmHg, p<0,05)], sem diferença estatística entre eles. Em T8h, a relação PaO2/FiO2 foi maior no GVAF comparado com GVMC (GVAF: 227,9 ± 80,7 > GVMC: 171,21 ± 52,9mmHg, p < 0,05). A FiO2 pode ser reduzida após 4h no GVAF ( GVAF- T4h: 0,53 ± 0,09 < Tind: 0,64 ± 0,2; P < 0,05), mas somente após 8 horas no GVMC. Comparando os grupos em T8h, observou-se que a diminuição da FiO2 foi maior para o GVAF (GVAF: 0,47 ± 0,06 < GVMC: 0,58 ± 0,1; p < 0,05). Tanto a VAF como VMC, associadas com a administração precoce de NOi, melhoram a oxigenação. A VAF possibilita redução da FiO2 e aumento da relação PaO2/FiO2 mais precoces quando comparada com VMC, em 8h. Entretanto, ao final de 24h de observação, não houve diferença significante na melhora clínica devido a aplicação da VAF associada com NOi quando comparada com VMC associada com o gás. Nossos resultados precisam ser confirmados por uma base mais ampla de casos em estudo randomizado / Abstract: To compare the acute oxygenation effects of high-frequency oscillatory ventilation (HFOV) plus inhaled nitric oxide (iNO) with conventional mechanical ventilation (CMV) plus iNO in acute hypoxemic respiratory failure (AHRF) children. Children with AHRF, aged between 1 month and 14 years under CMV with PEEP ≥ 10 cmH2O were randomly assigned to CMV (CMVG, n = 14) or HFOV (HFVG, n = 14) in a crossover design. Oxygenation indexes and hemodynamic variables were recorded at enrollment (Tind), 1 hr after CMV start (T0) and then every 4 hr (T4h, etc.). PaO2/FiO2 significantly increased after 4 hr compared to enrollment in both groups [(CMVG -Tind: 111.95 ± 37 < T4h: 143.88 ± 47.5 mmHg, p < 0.05; HFVG-Tind: 123.76 ± 33 < T4h:194.61± 62.42 mmHg, p < 0.05)] without statistical differences between groups. At T8h, PaO2/FiO2 was greater for HFVG compared with CMVG (HFVG: 227.9 ± 80.7 > CMVG: 171.21 ± 52.9 mmHg, p < 0.05). FiO2 could be significantly reduced after 4 hr for HFVG (HFVG-T4h: 0.53 ± 0.09 < Tind: 0.64 ± 0.2; P < 0.05) but only after 8 hr for CMVG. Comparing groups at T8h, it was observed that FiO2 decrease was greater for HFVG (HFVG: 0.47 ± 0.06 < CMVG: 0.58 ± 0.1; p < 0.05). CBoth ventilatory techniques with iNO improve oxygenation. HFOV causes earlier FiO2 reduction and increased PaO2/FiO2 ratio compared to CMV at 8 hr. However, at the end of the protocol, there was no significant difference and no clinical improvement derived from the application of both ventilatory strategies with iNO. It is not possible to say what would have happened if a different conventional ventilatory mode had been used, given the fact that our study has a limited number of patients included in each group / Doutor
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Ventilação oscilatória de alta frequência comparada com ventilação mecânica convencional associadas ao óxido nítrico inalatório: estudo randonizado e cruzado em crianças com insuficiência respiratória hipoxêmica agudaBatista, Khristiani de Almeida [UNESP] 25 September 2013 (has links) (PDF)
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000739125.pdf: 8253955 bytes, checksum: 0020aaeb461490f20e4ed55bb6a089f5 (MD5) / Comparar os efeitos agudos do óxido nítrico inalatório (Noi) sobre a oxigenação durante ventilação oscilatória de alta frequência (VAF) e ventilação mecânica convencional (VMC) em crianças com insuficiência respiratória hipoxêmica aguda (IRHA). Crianças com IRHA, com idade entre 1 mês e 14 anos, em VMC com pressão expiratória final positiva (PEEP) maior ou igual a 10cmH2O foram aleatorizadas para VMC (GVMC, n=14) ou VAF (GVAF, n=14), em estudo randomizado e cruzado. Foram registrados índices de oxigenação e variáveis hemodinâmicas à inclusão (Tind), 1 hora após iniciar VMC (T0) e a cada 4h (T4...T24). A relação PaO2/FiO2 aumentou significantemente depois de 4 horas comparada com a inclusão em ambos os grupos [(GVMC- Tind: 111,95 ± 37 < T4h: 143,88 ± 47,5mmHg, p<0,05; GVAF- Tind: 123,76 ± 33 < T4h: 194,61 ± 62,42mmHg, p<0,05)], sem diferença estatística entre eles. Em T8h, a relação PaO2/FiO2 foi maior no GVAF comparado com GVMC (GVAF: 227,9 ± 80,7 > GVMC: 171,21 ± 52,9mmHg, p < 0,05). A FiO2 pode ser reduzida após 4h no GVAF ( GVAF- T4h: 0,53 ± 0,09 < Tind: 0,64 ± 0,2; P < 0,05), mas somente após 8 horas no GVMC. Comparando os grupos em T8h, observou-se que a diminuição da FiO2 foi maior para o GVAF (GVAF: 0,47 ± 0,06 < GVMC: 0,58 ± 0,1; p < 0,05). Tanto a VAF como VMC, associadas com a administração precoce de NOi, melhoram a oxigenação. A VAF possibilita redução da FiO2 e aumento da relação PaO2/FiO2 mais precoces quando comparada com VMC, em 8h. Entretanto, ao final de 24h de observação, não houve diferença significante na melhora clínica devido a aplicação da VAF associada com NOi quando comparada com VMC associada com o gás. Nossos resultados precisam ser confirmados por uma base mais ampla de casos em estudo randomizado / To compare the acute oxygenation effects of high-frequency oscillatory ventilation (HFOV) plus inhaled nitric oxide (iNO) with conventional mechanical ventilation (CMV) plus iNO in acute hypoxemic respiratory failure (AHRF) children. Children with AHRF, aged between 1 month and 14 years under CMV with PEEP ≥ 10 cmH2O were randomly assigned to CMV (CMVG, n = 14) or HFOV (HFVG, n = 14) in a crossover design. Oxygenation indexes and hemodynamic variables were recorded at enrollment (Tind), 1 hr after CMV start (T0) and then every 4 hr (T4h, etc.). PaO2/FiO2 significantly increased after 4 hr compared to enrollment in both groups [(CMVG -Tind: 111.95 ± 37 < T4h: 143.88 ± 47.5 mmHg, p < 0.05; HFVG-Tind: 123.76 ± 33 < T4h:194.61± 62.42 mmHg, p < 0.05)] without statistical differences between groups. At T8h, PaO2/FiO2 was greater for HFVG compared with CMVG (HFVG: 227.9 ± 80.7 > CMVG: 171.21 ± 52.9 mmHg, p < 0.05). FiO2 could be significantly reduced after 4 hr for HFVG (HFVG-T4h: 0.53 ± 0.09 < Tind: 0.64 ± 0.2; P < 0.05) but only after 8 hr for CMVG. Comparing groups at T8h, it was observed that FiO2 decrease was greater for HFVG (HFVG: 0.47 ± 0.06 < CMVG: 0.58 ± 0.1; p < 0.05). CBoth ventilatory techniques with iNO improve oxygenation. HFOV causes earlier FiO2 reduction and increased PaO2/FiO2 ratio compared to CMV at 8 hr. However, at the end of the protocol, there was no significant difference and no clinical improvement derived from the application of both ventilatory strategies with iNO. It is not possible to say what would have happened if a different conventional ventilatory mode had been used, given the fact that our study has a limited number of patients included in each group
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Avaliação do perfil de mutações e resistência aos inibidores de transcriptase reversa e protease em pacientes pediátricos infectados pleo HIV-1Tonami, Camila Alves [UNESP] 27 February 2014 (has links) (PDF)
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000768414.pdf: 678249 bytes, checksum: f0428b1ea997431e198449d539145f7d (MD5) / Apesar dos grandes avanços que conduziram a um declínio da infecção pelo HIV em crianças, a terapêutica antirretroviral vem sendo limitada pela emergência de resistência. Neste contexto, a finalidade deste estudo foi avaliar o perfil de mutações e resistência aos inibidores de transcriptase reversa análogos de nucleosídeos (ITRN) e não análogos de nucleosídeos (ITRNN) protease (IP) das variantes virais circulantes em pacientes pediátricos atendidos no Ambulatório de Imunologia Pediátrica da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP. Foram avaliados dezenove pacientes, sendo dezesseis com falha terapêutica e, três virgens de tratamento. RNA viral plasmático foi utilizado como fonte para genotipagem das regiões genômicas da transcriptase reversa (TR) e protease (PR) do HIV. Os resultados demonstraram prevalência do subtipo B (78,95%). As mutações de resistência aos ITRNs encontradas em maior frequência foram L214F (73,7%), M184V (42,1%), R211K (42,1%), M41L (31,5%), T215Y (31,5%), L210W (21%), V118I (21%). As mutações K103N e Y188L encontradas em 26,3% e 10,5% dos pacientes foram as mais freqüentes entre as mutações associadas ao uso dos ITRNNs. Quanto aos IPs as mutações mais frequentes foram M36I (63,1%), L63P (52,6%), E35D (47,3%), R41K (31,5%), I13V (31,5%), M46V (26,3%), L90M (26,3%), I93L (26,3%), V77I (26,3%), V82A (21,1%), I54V (21,1%). No que se relaciona ao perfil de resistência, 3TC, AZT, EFV e NVP foram os ITR com menor potencial de uso devido à resistência. Já os IPs apresentam grande potencial de utilização na população estudada, o que se justifica pela alta barreira genética destes medicamentos. Dos três pacientes não tratados, um apresentava resistência a EFV e NVP, sugerindo ocorrência de resistência transmitida. Novos estudos devem ser conduzidos a fim de avaliar o real significado destes achados / Although great progresses lead a decline of the HIV infection in children, the antiretroviral therapy has found obstacles as the resistance emergency. In this context the goal of this study was evaluate to the profile of mutations and genotypic resistance to the Nucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NRTI), Nonnucleoside Reverse Transcriptase Inhibitors (NNRTI) and Protease Inhibitors (PI) in children assisted in the Pediatric Immunology Ambulatory, Botucatu School of Medicine. Patients (19) were evaluated (16 with therapeutic failure and 3 naïve). Viral RNA was used as source to RT and PR genomic regions genotyping. Subtype B was the most frequent (78.95%) in thi study. The NRTI resistance mutations found were L214F (73.7%), M184V (42.1%), R211K (42.1%), M41L (31.5%), T215Y (31.5%), L210W (21%), V118I (21%). K103N and Y188L were found in 26.3% e 10.5% and we are associated with NNRTI use. About the PI the mutations most frequent were M36I (63.1%), L63P (52.6%), E35D (47.3%), R41K (31.5%), I13V (31.5%), M46V (26.3%), L90M (26.3%), I93L (26.3%), V77I (26.3%), V82A (21.1%), I54V (21.1%). The ARVs resistance analysis showed that 3TC, AZT, EFV and NVP have the lower potential for use due to resistance. PI presented great potential for use due to high genetic barrier. From three naïve patients one presented resistant viral variants to EFV and NVP, suggesting transmitted resistance. New studies should be performed to evaluate these findings
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