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Estudo computacional da hidantoína na forma isolada e seus dímerosNADVORNY, Daniela 31 January 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A hidantoína é o ponto de partida na síntese de medicamentos com amplos
espectros farmacológicos. Diversos são os artigos encontrados na literatura a respeito de
seus derivados, porém ainda são poucos os que avaliam a molécula isolada e nenhum
foi localizado tratando da formação de agregados de hidantoína. Assim, neste trabalho
cálculos B3LYP/6-31++G(d,p) e MP2/6-31++G(d,p) foram utilizados para obtermos as
geometrias otimizadas da hidantoína e seus dímeros no estado fundamental. Também
foram investigados os espectros teóricos no infravermelho com o intuito de analisar os
deslocamentos dos picos devido à formação das ligações de hidrogênio bem como a
razão na intensidade dos dímeros em relação à molécula isolada. Além disso, foi
realizada uma análise energética dos complexos, com a devida correção das energias do
ponto zero (ZPE) e do erro de superposição do conjunto de base (BSSE). Um modelo de
previsão energética foi aplicado na tentativa de se prever energias para complexos
maiores
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Mesomorfismo no convencional en dímeros cristalino líquidos acodadosDarda, María Belén 29 December 2021 (has links)
Los dímeros cristalino líquidos curvados presentan un gran interés debido a la potencial
generación de nuevas mesofases no convencionales, donde a los factores tradicionales que
influencian el mesomorfismo como forma, tamaño y polaridad molecular se agrega la variable
conformacional, que origina fases quirales a partir de dímeros curvados aquirales. Estas
propiedades notables están relacionadas con la capacidad de los dímeros acodados aquirales
de quedar fijos, en estado condensado de las mesofases, en conformaciones curvadas-torcidas
quirales.
Durante este trabajo se sintetizaron y se analizó el comportamiento mesomórfico de tres
series de dímeros acodados con distintos grupos mesogénicos, que presentan una estructura
general de tipo apolar-polar-apolar-polar-apolar, haciendo incapié dentro de cada serie en el
efecto de aumentar el componente apolar sobre el mesomorfismo de estos dímeros con
segmentos semirígidos aromáticos como partes polares y cadenas alifáticas apolares como
espaciadores y cadenas terminales.
En la primera serie estudiada, con grupos estilbenos como mesógenos, se observó que
la disposición ortogonal dimérica daba lugar a una mesofase fluida SmCA ópticamente biaxial
que por elongación de las cadenas terminales producía una fase fluida SmA ortogonal, que es
no convencional en dímeros curvados. En la segunda serie con grupos
bifenilcarboxiloxibenceno se obtuvo evidencia térmica y estructural que sugiere que sus
transiciones SmC-SmA son no convencionales, posiblemente de tipo de Vries. Finalmente,
varios homólogos de la última serie estudiada de dímeros acodados, con grupos difenilimino
como mesógenos, forman estructuras laminares complejas denominadas conglomerados
oscuros. La serie estudiada aquí es la única, dentro de cuatro series estructuralmente
isoméricas, que presenta este comportamiento no convencional.
Es claro que los dímeros cristalino líquidos curvados si bien son una fuente de nuevas
mesofases no convencionales con potenciales aplicaciones tecnológicas, la naturaleza de
estas mesofases y sus relaciones estructura-propiedad todavía ofrecen muchos interrogantes. / Bent liquid crystalline dimers are of great interest due to the potential generation of new
unconventional mesophases, where to the traditional factors that influence mesomorphism,
such as shape, size, and molecular polarity, is added the conformational variable, which
originates chiral phases from achiral bent dimers. These remarkable properties are related to
the ability of the achiral bent dimers to remain fixed, in the condensed state of the mesophases,
in chiral twist-bent conformations.
During this work, we synthesized and analyzed the mesomorphic behavior of three series
of bent dimers with different mesogenic groups, which present a general apolar-polar-apolar polar-apolar type structure, emphasizing within each series the effect of increasing the apolar
component on the mesomorphism of these dimers with aromatic semirigid segments as polar
parts and apolar aliphatic chains as spacers and terminal chains.
In the first series studied, with stilbene groups as mesogens, it was observed that the
orthogonal dimeric arrangement gave rise to an optically biaxial SmCA fluid mesophase that by
elongation of the terminal chains produced an orthogonal SmA fluid phase, which is
unconventional in curved dimers. In the second series with biphenylcarboxyloxybenzene
groups, thermal and structural evidence was obtained suggesting that their SmC-SmA
transitions are unconventional, possibly of the de Vries type. Finally, several homologues of the
last studied series of layered dimers, with diphenylimino groups as mesogens, form complex
lamellar structures called dark conglomerates. The series studied here is the only one, within
four structurally isomeric series, to exhibit this unconventional behavior.
It is clear that while bent liquid crystalline dimers are a source of new unconventional
mesophases with potential technological applications, the nature of these mesophases and their
structure-property relationships still offer many questions.
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Avaliação das concentrações plasmáticas de dímero-d em vacas adultas e seus bezerros até 24 horas de idade / Maria Cecilia Borgo Murback. -Murback, Maria Cecilia Borgo. January 2015 (has links)
Resumo:Os dímeros-D constituem os menores fragmentos dos produtos de degradação da fibrina e são produzidos após a lise pela plasmina da ligação cruzada da fibrina. Desta forma, os objetivos deste estudo foram determinar as concentrações plasmáticas de dímero-D e fibrinogênio de bezerros recém-nascidos e em vacas pós-parto e comparar as concentrações plasmáticas deste marcador hemostático entre os dois grupos. Aumentos significativos nas concentrações plasmáticas de dímero-D estão ligadas a ocorrência processo inflamatórios (como peritonite, sepse), coagulação intravascular disseminada, trombose de veia cava como por exemplo. As concentrações plasmáticas de dímero-D e de fibrinogênio não foram diferentes entre vacas pós-parto e bezerros com até 24 horas de idade. Houve correlação positiva significativa entre as concentrações plasmáticas de fibrinogênio entre os dois grupos. Não houve correlação entre as concentrações plasmáticas de dímero-D entre os dois grupos. Sendo assim, foi possível estabelecer intervalos de referência para as concentrações plasmáticas de dímero-D em vacas pós-parto e em bezerros recém-nascidos. / Abstract:The D-dimers are the smallest fragments of fibrin degradation products and are produced by plasmin after lysis of fibrin cross-connection. Thus, the objectives of this study were to determine plasma concentrations of D-dimer and fibrinogen in newborn calves and postpartum cows and to compare plasma concentrations of this hemostatic marker between these two groups. Significant increases in plasma concentrations of D-dimers occur during inflammatory processes (such as peritonitis, sepsis), disseminated intravascular coagulation and vena cava thrombosis for example. Plasma concentrations of D-dimer and fibrinogen were not different between groups. There was a significant positive correlation between plasma fibrinogen concentrations between groups. There was no correlation between plasma D-dimer between groups. Therefore, it was possible to establish reference intervals for plasma concentrations of D-dimer in postpartum cows and their newborn calves. / Orientador:Juliana Regina Peiró / Banca:Lina Maria Wehrle Gomide / Banca:Raimundo Souza Lopes / Mestre
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Avaliação das concentrações plasmáticas de dímero-d em vacas adultas e seus bezerros até 24 horas de idade: Maria Cecilia Borgo Murback. -Murback, Maria Cecilia Borgo [UNESP] 07 February 2015 (has links) (PDF)
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000870494.pdf: 357411 bytes, checksum: 81c0f3a5e7fdf7f51bc9273bb80f7b8d (MD5) / The D-dimers are the smallest fragments of fibrin degradation products and are produced by plasmin after lysis of fibrin cross-connection. Thus, the objectives of this study were to determine plasma concentrations of D-dimer and fibrinogen in newborn calves and postpartum cows and to compare plasma concentrations of this hemostatic marker between these two groups. Significant increases in plasma concentrations of D-dimers occur during inflammatory processes (such as peritonitis, sepsis), disseminated intravascular coagulation and vena cava thrombosis for example. Plasma concentrations of D-dimer and fibrinogen were not different between groups. There was a significant positive correlation between plasma fibrinogen concentrations between groups. There was no correlation between plasma D-dimer between groups. Therefore, it was possible to establish reference intervals for plasma concentrations of D-dimer in postpartum cows and their newborn calves.
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Efeito do comprimento e da polaridade do espaçador entre cadeias do peptídeo Hylina-C na forma diméricaNicolás Lorenzón, Esteban [UNESP] 24 February 2011 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T19:49:48Z : No. of bitstreams: 1
nicolaslorenzon_e_me_araiq.pdf: 1141028 bytes, checksum: 6886093f73fd039fe1ed73b26a3d43dd (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Neste trabalho foi avaliado o efeito da dimerização e do comprimento/polaridade do espaçador utilizado na formação dos dímeros, na estrutura e atividade biológica do peptídeo antimicrobiano: Gly-Trp-Leu-Asp-Val-Ala-Lys-Lys-Ile-Gly-Lys-Ala-Ala-Phe-Asn-Val-Ala-Lys-Asn-Phe-Leu-CONH2. Nesse sentido, o monômero e três dímeros com diferentes espaçadores foram sintetizados pelo método de síntese de peptídeo em fase sólida (SPFS) utilizando uma combinação das químicas Fmoc e Boc. Análises por cromatografia de fase reversa e espectrometria de massas confirmaram o sucesso das sínteses e das purificações. Os ensaios de atividade antimicrobiana, em termos de CIM mostraram que a dimerização não aumentou a capacidade do peptídeo de inibir o crescimento de bactérias e fungos. No entanto, quando analisada a capacidade dos peptídeos de matar E. coli, um menor tempo para produzir o efeito inibitório foi observado para os dímeros. Adicionalmente, a atividade hemolítica dos peptídeos também foi avaliada, encontrando-se um aumento significativo, aproximadamente 40 vezes, para os dímeros em relação ao monômero. Com o objetivo de tentar explicar esses efeitos, o teste de proteção osmótica foi realizado. No entanto, o tamanho dos poros foi semelhante, o que não permite explicar as diferenças em termos desta variável. Conhecendo seus diâmetros, foi possível determinar que o poro é formado por 6 moléculas monoméricas ou 3 diméricas. Estudos de permeabilização mostraram que a porcentagem e a velocidade de liberação de carboxifluoresceína foram maiores para os dímeros quando comparados com o monômero, especialmente em vesículas contendo esfingomielina. Este ensaio também mostrou que a duplicação da concentração de monômeros não é suficiente para atingir a capacidade de permeabilização dos dímeros, confirmando que a proximidade das cadeias é um fator... / This work analyzed the effect of dimerization and the length/polarity of the spacer used in the formation of dimers, in the structure and biological activity of the antimicrobial peptide: Gly-Trp-Leu-Asp-Val-Ala-Lys-Lys-Ile-Gly-Lys-Ala-Ala-Phe-Asn-Val-Ala-Lys-Asn-Phe-Leu-CONH2. In this way, the monomer and three dimers (Lys-branched) with different spacer groups were synthesized by solid phase peptide synthesis methodology using a combination of Fmoc and Boc chemical approaches. Analysis by reverse phase chromatography and mass spectrometry confirmed the success of the synthesis and purifications. The antimicrobial activity assay, in terms of MICs showed that dimerization did not increase the ability of the peptides to inhibit the growth of bacteria and fungi. Nevertheless, when analyzing the peptides activity against E. coli in terms of kinetics, an increased velocity was observed for the dimers. The hemolytic activity of peptides was also evaluated, finding a very significant difference, approximately 40 times greater for dimers. Aiming to explain this difference, the osmotic protection test was performed, but the pore size was similar, which can not explain the differences in terms of this variable. Knowing the diameter of the pores, it was possible to determine that the pore is formed by six monomeric or three dimeric molecules. Additionally, permeabilization studies showed that the percentage and rate of carboxyfluorescein release were larger for the dimers compared with monomer, especially in vesicles containing sphingomyelin. This test also showed that the use of two times more monomer concentration´s is not sufficient to reach dimers permeabilization capacity, confirming that the proximity of the chains is an important factor in the activity of this peptide. Analysis by circular dichroism revealed that peptides in aqueous solution are in random coil, whereas... (Complete abstract click electronic access below)
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Relação entre as concentrações plasmáticas e peritoneais de dímeros-D e as variáveis clínicas e laboratoriais de equinos com síndrome cólicaCrescencio, Amanda Paulino. January 2017 (has links)
Orientador: Marcos Jun Watanabe / Coorientador: Carlos Alberto Husnni / Banca: Juliana de Moura Alonso / Banca: Paula Alessandra Di Filippo / Resumo: Nos equinos, os distúrbios gastrointestinais (GI) são as causas mais comuns de problemas de coagulação, podendo gerar complicações fatais. Atualmente, uma das ferramentas mais sensíveis para avaliação da hipercoagulabilidade e hiperfibrinólise em cavalos é a determinação das concentrações de dímeros-D. Dessa forma, objetivou-se relacionar as concentrações plasmáticas e peritoneais de dímeros-D com as variáveis clínicas (frequência cardíaca, frequência respiratória, cor das membranas mucosas, tempo de preenchimento capilar, temperatura retal, grau de dor e tempo de evolução do quadro) e laboratoriais (hematócrito, proteína plasmática total, plaquetas, fibrinogênio e leucócitos sanguíneos, além de proteína, fibrinogênio, células nucleadas, bactérias e glicose no líquido peritoneal) de equinos com síndrome cólica e com o diagnóstico e prognóstico desses casos. Foram utilizados 86 equinos com idade mediana de 6,5 anos e com peso mediano de 400 Kg. Os animais foram submetidos ao exame clínico e coleta de amostras de sangue e líquido peritoneal (LP) na admissão. As concentrações plasmáticas e peritoneais de dímeros-D foram avaliadas através de um ensaio semiquantitativo de aglutinação em látex. Apesar das concentrações plasmáticas e peritoneais de dímeros-D terem demonstrado um sentido biológico relacionado à gravidade dos casos de cólica na análise descritiva, isso não foi comprovado estatisticamente através da análise multivariada. Portanto, concluímos que a determinação das conc... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In horses, gastrointestinal (GI) disorders are the most common cause of coagulation problems, which can lead to fatal complications. One of the most sensitive tools for assessing hypercoagulability and hyperfibrinolysis in horses is the determination of D-dimer concentrations. The aim of this study was to correlate the plasma and peritoneal D-dimer concentrations with the clinical variables (heart rate, respiratory rate, mucous membranes color, capillary filling time, rectal temperature, pain degree, and time frame evolution) (hematocrit, total plasma protein, platelets, fibrinogen and blood leukocytes, as well as protein, fibrinogen, nucleated cells, bacteria and glucose in the peritoneal fluid) of horses with colic syndrome and with the diagnosis and prognosis of these cases. A total of 86 horses with a median age of 6.5 years and with a median weight of 400 kg were used. The animals were submitted to clinical examination and collection of blood and peritoneal fluid (LP) samples at admission. Plasma and peritoneal concentrations of D-dimers were evaluated by a semi-quantitative latex agglutination assay. Although plasma and peritoneal concentrations of D-dimers demonstrated a biological significance related to the severity of colic cases in the descriptive analysis, this was not statistically demonstrated through multivariate analysis. Therefore, we concluded that the determination of plasma and peritoneal concentrations of D-dimers using semi-quantitative latex agglutinati... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Modelos de dímeros em redes planas. Matriz de transferência e soluções por meio da representação de férmions / Dimer models on planar lattice. Transfer matrix and soutions by fermion representationGrande, Helder Luciani Casa 27 March 2009 (has links)
Resolvemos o modelo de d´meros em duas redes planas diferentes, a rede 4-8 e a rede hexagonal (favo de mel). Na rede 4-8 ocorre uma transição do tipo Ising (bidimensional); na rede hexagonal há uma transição conhecida como 3/2. Após a definição do modelo mostramos que o cálculo da função de partição pode ser formulado em termos do traço de uma matriz de transferência escrita numa representação de matrizes de Pauli. Usando a transformação de Jordan-Wigner, os operadores de Pauli são transformados em operadores de criação e aniquilação de férmions, e a matriz de transferência pode ser diagonalizada pela redução a um problema de férmions livres. Comparamos as soluções do modelo de dímeros na rede 4-8 e do modelo de Ising bidimensional; em particular, comparamos o comportamento do calor específico e analisamos o espectro da matriz de transferência. Verificamos que as nossas soluções concordam com resultados obtidos pelas técnicas combinatórias. Utilizamos a formulação da matriz de transferência para construir uma versão de tempo contínuo dos modelos de dímeros nas redes quadrada, 4-8 e hexagonal. Ao contrário do modelo de Ising, no caso dos dímeros essa aproximação de tempo contínuo altera a natureza do comportamento crítico. / We solve the dimer model on two different planar lattices, the 4-8 lattice and the honeycomb lattice. In the dimer model on the 4-8 lattice there is a phase transition of the (two-dimensional) Ising type; on the honeycomb lattice there is a phase transition known as 3/2. After defining the model we show that the calculation of the partition function can be formulated as the trace of a transfer matrix that is written in terms of Pauli matrices. Using the Jordan-Wigner transformation, the Pauli matrices give rise to fermion creation and annihilation operators, and the problem is reduced to the diagonalization of a system of free fermions. We compare the solutions of the dimer model on the 4-8 lattice and of the two-dimensional Ising model; in particular, we compare the behavior of the specific heat and we analyze the spectrum of the transfer matrix. These solutions agree with well-known results from combinatorial techniques. We then use the transfer matrix approach to obtain a continuum time formulation for the dimer models on the square, 4-8 an d honeycomb lattices. In contrast to the Ising case, for the dimer models this approximation changes the nature of critical behavior.
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Estudo teórico de diatômicas homo e heteronucleares de metais de transição / Theoretical studies of homo and heteronuclear diatomic moleculesGobbo, João Paulo 11 September 2009 (has links)
Neste trabalho, métodos ab initio multiconfiguracionais de alto nível com extenso conjunto base e inclusão de correções relativísticas foram empregados para estudar vários sistemas diatômicos contendo metais de transição. As abordagens de Teoria de Pertur- bação de Segunda Ordem Multiconfiguracional (CASPT2) ou sua versão Multi-State (MS-CASPT2), baseadas em funções de onda do tipo Complete-Active-Space Self- Consistent-Field (CASSCF) foram utilizadas, com o conjunto base do tipo Orbitais Naturais contraídas em ambiente relativístico (ANO - RCC) com qualidade quádrupla- , para se estudar esses sistemas. Em relação aos dímeros de metais de transição homonucleares (Re2, Tc2, Ta2, Mo2 e W2), caracterizamos seu estado fundamental e diversos estados excitados através das curvas de energia potencial, constantes espectroscópicas e ordens de ligação efetiva. Todos os dímeros estudados por nós apresentam multiplicidades de ligação acima de quatro. Para esses sistemas também estudamos os efeitos do desdobramento causado pelo acoplamento spin-órbita com o intuito de determinar inequivocadamente a simetria do estado fundamental e, também, de auxiliar na interpretação dos espectros experimentais, quando existentes. Sobre as diatômicas formadas pela junção de um átomo de metal de transição e um elemento do grupo principal, enfocamos principalmente os nitretos e os boretos de metais de transição (CoN, MnN, TcN e RhB). Da mesma maneira, os sistemas foram descritos em termos de suas curvas de energia potencial e constantes espectroscópicas e foram comparadas com outros resultados teóricos e experimentais. Todas as moléculas estudadas nessa parte são caracterizadas por ligações triplas, com um par de elétrons sobre o átomo não metálico e os elétrons restantes localizados sobre o metal, acoplados de diferentes formas / In this work, high level ab initio multiconfigurational methods with extensive basis set and inclusion of relativistic e¤ects were employed to study several diatomic systems containing transition metals. The Multiconfiguration Second Order Perturbation Theory (CASPT2) or its Multi-State version (MS-CASPT2) approaches, based on Complete- Active-Space Self-Consistent-Field (CASSCF), were employed, with the Atomic Natural Orbital contracted in a relativistic environment (ANO-RCC) with quadruple- quality, in order to study these systems. In relation to the homonuclear dimers of transition metals atoms (Re2, Tc2, Ta2, Mo2, and W2), we have characterized their ground state and several excited states through potential energy curves, spectroscopic constants and e¤ective bond orders. All dimers we studied have the multiplicity of the chemical bond above four. To these kind of systems, we have also studied the splitting caused by spin-orbit coupling with the the aim of determine the symmetry of the ground state and help in the interpretation of the experimental spectras. About the diatomic formed by joining of a transition metal atom and an atom of the main group, we have focused, mainly, the transition metal nitrites and borides (CoN, MnN, TcN, and RhB) In the same way, these systems were described in terms of their potential energy curves, spectroscopic constants and wavefunctions and we have com- pared to other theoretical and experimental results. All molecules studied in this part were characterized as triple bonded, with a pair of electrons on the nonmetalic center and the remaining electrons localized on the metal, coupled on di¤erent forms
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Reações de ciclo-oxidação de derivados nitrogenados do Lapachol - aminação alílica utilizando complexos de paládio (II) catalíticoFRANÇA, José Adonias Alves de 04 March 2010 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-15T12:17:00Z
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Jose Adonias Alves de Franca.pdf: 508331 bytes, checksum: 66575664ead63f245fd269c90a1457a0 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-15T12:17:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2010-03-04 / In the course of 1,4-naphthoquinone nucleus studies, was performed the palladium catalyzed allylic oxidation procedure to obtain a heterociclic ring containing nitrogen. Some new compounds were found during the course of these studies, including an improvement in the nor-lapachol condensation reaction between lausone and isobutyraldehyde. A new methodology was also developed to obtain naphthoquinone dimers, with the synthesis of four new entities. The compounds were tested as inhibitors on human topoisomese I I enzyme and in Artemia salina toxicity tests. / No decorrer dos estudos com núcleos 1,4-naftoquinonas, explorou-se uma metodologia para síntese de anel nitrogenado baseado em reações de oxidação alílica catalisada por paládio. Foi possível a obtenção de alguns compostos inéditos na literatura durante estes estudos, e a reação de obtenção do nor-lapachol através da condensação da lausona com isobutiraldeído foi significativamente melhorada. Desenvoveu-se uma nova metodologia para a formação de moléculas diméricas da naftoquinona, sendo 4 inéditas. Os compostos foram testados frente à enzima topoisomerase humana II e em testes de toxicidade utilizando Artemia salina.
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Associação entre os níveis de D-dímero, produtos de degradação da fibrina/fibrinogênio (PDF) e troponina cardíaca T na investigação dos distúrbios tromboembólicosMoresco, Rafael Noal January 2005 (has links)
Resumo não disponível
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