Submitted by Izabel Franco (izabel-franco@ufscar.br) on 2016-10-11T14:00:06Z No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-21T12:10:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Approved for entry into archive by Marina Freitas (marinapf@ufscar.br) on 2016-10-21T12:10:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-21T12:10:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseCCM.pdf: 2150950 bytes, checksum: ab2eb21dcb317d57d560b8c3e7d07ef2 (MD5) Previous issue date: 2016-06-21 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / The identification Selenastraceae family organism is performed by optical microscopy only on diacritic characteristics, what has been questioned from recent molecular studies. Conflicts between phylogenetic, morphologic and genetic results were found after analysis of a large number of species Selenastraceae, and misidentification and consequently error in the classification directly leads to that the underestimation of species from Selenastraceae family. An alternative to these errors in identification and classification would be avoided using a polyphasic taxonomic approach to this family, combining to morphology, genetics, physiology and chemotaxonomy. Therefore, the use of fatty acids found in microalgae as an alternative to contribute assist in identification can be feasible. Using this information, this study considered the fatty acids of sixteen strains of microalgae from Selenastraceae family and found specific fatty acids and may differentiate between strains of microalgae and has presented fatty acids indicators from the Selenastraceae families (C18:3ω3 and C18:4ω6), Scenedesmaceae (C18:2ω6, C18:1ω9, C16:2ω6) and Oocystaceae (C18:3ω6) and also genera Monoraphidium (C16:1ω9 and C16:3ω6), Coelastrum (C18:1ω9) and Nephrocytium (C18:3ω6). Among Selenastraceae was detected potential with fatty acids for the production of biofuels (C18:1ω9), to feeding to animals (C16:0) and polyunsaturated for human nutritional supplements (C18:3ω3, C18:2ω6 and C16:4ω3) according the growing stage of these organisms. / A identificação de organismos da família Selenastraceae feita através de microscopia óptica e baseada apenas em características diacríticas vem sendo questionada atualmente a partir de estudos moleculares. Conflitos entre os resultados filogenéticos, morfológicos e os genéticos foram constatados após análises de um grande número de espécies de Selenastraceae, sendo que os erros na identificação e, consequentemente, na classificação dessas espécies implicam diretamente na subestimação da família Selenastraceae. Uma alternativa para que estes fossem evitados seria a utilização de uma abordagem taxonômica polifásica para essa família, aliando morfologia, genética, fisiologia e quimiotaxonomia. Portanto, a utilização dos ácidos graxos presentes nessas microalgas como alternativa para auxiliar na identificação parece viável. Com base nessas informações, o presente trabalho analisou os ácidos graxos de dezesseis cepas de microalgas pertencentes à família Selenastraceae e encontrou ácidos graxos específicos e que podem diferenciar as cepas de microalgas e apresentou ácidos graxos indicadores das famílias Selenastraceae (C18:3ω3 e C18:4ω6), Scenedesmaceae (C18:2ω6, C18:1ω9, C16:2ω6) e Oocystaceae (C18:3ω6) e, também para os gêneros Monoraphidium (C16:1ω9 e C16:3ω6), Coelastrum (C18:1ω9) e Nephrocytium (C18:3ω6). Entre as Selenastraceae foram detectados também ácidos graxos com potencial para a produção de biocombustíveis (C18:1ω9), alimentação de animais (C16:0) e poli-insaturados para a suplementação nutricional humana (C18:3ω3, C18:2ω6 e C16:4ω3), de acordo com a fase de cultivo desses organismos.

Resumo: Redes de interação são usadas para representar qualquer tipo de relacionamento entre objetos discretos. Análise de redes tem sido utilizada para retratar a complexidade de sistemas em várias áreas da pesquisa. Fluxos de energia caracterizando relacionamento trófico entre espécies são interações (links) que também podem ser medidas entre espécies (nós) na rede. As vantagens de tratar interações entre espécies como uma rede não incluem apenas uma representação visual de sistemas ecológicos complexos, mas também representa um mecanismo formal de medir atributos das espécies, propriedades de sistemas inteiros e como eles variam no espaço e no tempo. Alguns atributos biológicos parecem ter influência sobre os padrões de interação em redes ecológicas, e.g. abundância das espécies, tipo e intimidade da interação. Até recentemente considerava-se que redes de interações antagonísticas (parasito-hospedeiro, predador-presa) são caracterizadas por alta modularidade e baixo aninhamento. Contudo, trabalhos sugerem que redes antagonísticas, assim como as mutualísticas, podem ser modulares e/ou aninhadas dependendo da intimidade da interação, ou seja, o grau de integração biológica entre os indivíduos que interagem. Parasitismo, que é a interação consumidor-recurso mais comum na natureza, pode ser visto como uma rede bipartida de interações de alta intimidade. A análise de redes tem sido extensivamente aplicada a interações mutualísticas, como entre plantas e seus polinizadores ou dispersores. Comparativamente, ainda existem poucos estudos de redes parasito-hospedeiro, embora parasitos constituam um componente fundamental de teias tróficas. Monogenoidea é uma classe de Platyhelmintes composta principalmente por ectoparasitos que vivem nas brânquias ou superfície corporal de peixes marinhos e dulcícolas. Esses parasitos possuem ciclo de vida monoxênico, i.e. completam seu ciclo de vida em uma única espécie hospedeira e podem ser capazes de colonizar hospedeiros a partir de um indivíduo. Os Monogenoidea também são conhecidos pela alta especificidade à espécie hospedeira, que não é necessariamente o resultado de coespeciação apenas, mas também de processos não vicariantes como troca de hospedeiro. O objetivo do primeiro capítulo deste trabalho é descrever padrões gerais de distribuição dos Monogenoidea que parasitam brânquias de peixes dulcícolas na Região Neotropical. A descrição de padrões gerais e únicos das interações parasitohospedeiro podem apontar associações que podem ser usadas como modelo para o estudo da importância relativa da história evolutiva e de fatores ecológicos recentes sobre as regras de montagem que atuam sobre as redes ecológicas. Este trabalho é baseado em um banco de dados das ocorrências de espécies de Monogenoidea em espécies de peixes hospedeiras. A partir do banco de dados, matrizes de interação foram criadas organizando as espécies em diferentes níveis taxonômicos. Somente parasitos de brânquias foram selecionados porque eles compõem o grupo melhor conhecido de monogenoideos na Região Neotropical. Para avaliar a estrutura das redes foram calculados aninhamento e modularidade para cada rede. Como estamos lidando com uma região biogeográfica, a distribuição espacial foi incluída ao modelo nulo uma vez que espécies que não co-ocorrem não têm chance de interagir. As interações entre as famílias de peixes e gêneros de parasitos foi caracterizada por ser modular, mas não aninhada e evidenciou a estruturação dos gêneros de parasitos entre as ordens de peixes. Por isso, a distribuição dos gêneros e espécies de parasitos entre as espécies hospedeiras foi analisada separadamente para cada uma das três maiores ordens de peixes (Perciformes, Siluriformes e Characiformes). Em geral, essas redes apresentaram baixa conectividade e organização em módulos, por vezes associados às famílias hospedeiras. A modularidade observada não foi decorrente da estruturação espacial das espécies nas bacias hidrográficas, uma vez que o grau de modularidade foi significativo mesmo quando comparado ao modelo nulo que inclui a distribuição espacial das espécies hospedeiras. A probabilidade de uma interação ocorrer depende da coocorrência das espécies que interagem em uma dada localidade na escala de tempo ecológico. Porém a história evolutiva dessas espécies deve ditar quais interações são possíveis. Apesar da maioria das espécies e gêneros de parasitos serem específicos a sua espécie hospedeira ou a um grupo filogeneticamente próximo de hospedeiros, alguns parasitos são mais generalistas. Os resultados desse capítulo evidenciam a influência da filogenia dos hospedeiros sobre a distribuição dos Monogenoidea que parasitam brânquias de peixes e também sustentam a influência esperada do tipo e intimidade da interação sobre a estrutura de redes parasito-hospedeiro. Além de olhar para a estrutura das redes, é de fundamental interesse para ecólogos entender os fatores que geram, mantêm e restringem as associações parasito-hospedeiro, com implicações para estudos de doenças emergentes, controle biológico, invasões biológicas e respostas a mudanças climáticas. Estudos filogenéticos têm encontrado evidências para dispersão entre hospedeiros relativamente distantes, podendo estar relacionada a eventos de diversificação, em diversos sistemas parasito-hospedeiro. Entre parasitos monogenoideos, acredita-se que a ocorrência nos hospedeiros não pode ser explicada somente pelo modelo de coespeciação, mas que trocas de hospedeiro e especiação simpátrica devem estar associadas à origem de vários clados. O segundo capítulo deste trabalho objetiva buscar os fatores que moldam os padrões gerais de compartilhamento de parasitos, usando análise de caminhos como uma forma de gerar hipóteses sobre a evolução das interações entre os Monogenoidea e os peixes que ocorrem nos rios da Região Neotropical. O compartilhamento de gêneros de parasitos pelas espécies de peixes foi obtido do mesmo banco de dados utilizado no primeiro capítulo. As variáveis explanatórias incluíram o relacionamento filogenético, preferências ambientais, características biológicas e a distribuição geográfica das espécies hospedeiras. Os dados foram analisados com todas as espécies e gêneros, para cada uma das três maiores ordens de hospedeiros e separando parasitos com distribuição restrita e ampla. De forma geral, a filogenia tem o maior efeito direto sobre o compartilhamento de parasitos. Contudo, os resultados variam de acordo com o grupo de peixes e entre parasitos família-específicos e generalistas. Os resultados reforçam a importância de incluir a história evolutiva em estudos de associações ecológicas, porém outros fatores precisam ser adicionados para explicar os padrões específicos de alguns grupos. Distribuição geográfica das espécies hospedeiras nas bacias dos rios é um fator muito importante que aumenta a chance de colonização de hospedeiros não relacionados filogeneticamente, especialmente para os parasitos generalistas. Finalmente, as preferências ecológicas e características biológicas são fatores adicionais fundamentais para se compreender as interações parasito-hospedeiro.

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Submitted by EMERSON LOLI GARCIA null (elgarcia@fca.unesp.br) on 2017-04-03T18:55:36Z No. of bitstreams: 1 Tese definitiva.pdf: 11158432 bytes, checksum: c748bbc47afc171f84f54b7033bbdb95 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-04-11T20:32:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 garcia_el_dr_bot.pdf: 11158432 bytes, checksum: c748bbc47afc171f84f54b7033bbdb95 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-11T20:32:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 garcia_el_dr_bot.pdf: 11158432 bytes, checksum: c748bbc47afc171f84f54b7033bbdb95 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O amido é o componente principal na maioria dos alimentos processados, atribuindo características únicas aos produtos. Para atender às várias demandas do mercado consumidor, muitas vezes os amidos necessitam ser modificados, e a tecnologia de extrusão é um dos processos disponíveis para a obtenção de amidos pré-gelatinizados. Comparado com os demais métodos de modificação, a extrusão é uma tecnologia limpa e versátil, tornando-se uma opção interessante para as indústrias. Diante do exposto, o presente estudo objetivou avaliar as características físico-químicas e tecnológicas dos amidos nativos de mandioca, batata-doce e mandioquinha-salsa, bem como, estudar o efeito da modificação por extrusão sobre as características desses amidos. Para o alcance desses objetivos, o trabalho foi divido em dois experimentos. No primeiro experimento os amidos nativos foram caracterizados e modificados sob condições fixas de configuração e processamento no extrusor (temperatura de extrusão a 90 °C, rotação da rosca a 230 rpm e umidade a 20 % (m/m)). No segundo experimento, após terem sido constatados os efeitos do processo de extrusão sobre as características dos amidos das três fontes, foi avaliado por meio de ensaios em delineamento central composto rotacional, o efeito da variação da temperatura de extrusão (65 a 115 ºC), rotação da rosca (205 a 255 rpm) e umidade (16 % a 24 % (m/m)) sobre as características dos amidos de mandioca e batata-doce. Os resultados mostraram efeito do processo de extrusão sobre as características dos amidos e correlação com as propriedades particulares de cada amido. Observando os parâmetros utilizados verificou-se que a temperatura é o fator de maior influência na modificação dos amidos avaliados. As condições de 22 % (m/m) de umidade dos amidos, 105 ºC de temperatura na zona de extrusão e a rotação da rosca em 215 rpm permitem a obtenção de amidos totalmente gelatinizados de mandioca e batata-doce, os quais podem ter aplicações diversas no setor alimentício. / Starch is the main component in most processed foods giving unique characteristics to the products. To meet the various demands of the consumer market, starches often need to be modified, and extrusion technology is one of the processes available to obtain pregelatinised starches. Compared to other modification methods, extrusion is a clean and versatile technology, making it an interesting option for industries. The present study aimed to evaluate the physico-chemical and technological characteristics of cassava, sweet potato and Peruvian carrot starch without modification, as well as to study the effect of the extrusion process on the characteristics of these starches. To reach these objectives, the work was divided into two experiments. In the first experiment native starches were characterized and modified under fixed conditions of extruder configuration and processing (90ºC of extrusion temperature, 230 rpm of screw speed and 20 % (w/w) of moisture). Results showed significant effects of the extrusion process on the characteristics of the three analyzed starches, so, the second experiment was carried out in a central composite design rotational to evaluate the effect of extrusion temperature (65 to 115ºC), screw speed (205 to 255 rpm) and moisture (16 to 24 % (w/w)) on the characteristics of cassava and sweet potato starches. Results showed effect of the extrusion process on the characteristics of the starches and correlation with properties of each starch. Temperature was the factor of greater influence in the modification of the evaluated starches. Conditions of 22 % (w/w) moisture in the starches, 105 °C temperature in the extrusion zone and the screw speed of 215 rpm allow the production of fully gelatinized cassava and sweet potato starches, which may have various applications in the food sector.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:13Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-02-24Bitstream added on 2014-06-13T21:00:34Z : No. of bitstreams: 1 davanso_tm_me_botib.pdf: 1534994 bytes, checksum: 04b1389988efb58bd1dab049208a8c7f (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A dinâmica populacional de Dilocarcinus pagei foi investigada enfocando os seguintes aspectos: maturidade sexual morfológica, maturidade gonadal, proporção sexual, período reprodutivo e recrutamento. Os animais foram coletados mensalmente, com a utilização de peneiras e/ou manualmente no período de outubro/05 a setembro/07, na represa da Usina Hidrelétrica de Furnas/Marimbondo, município de Icém, região noroeste do Estado de São Paulo (20°19’40,0”S e 49°10’18,1”N). A maturidade sexual morfológica foi calculada empregando-se o estudo do crescimento relativo e a maturidade gonadal por meio do LC50. A proporção sexual foi investigada tanto mensalmente como no número de indivíduos distribuídos por classes de tamanho (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). Para os períodos reprodutivo e de recrutamento, as fêmeas denominadas maduras (gônadas desenvolvidas, fêmeas ovígeras e com juvenis) e os juvenis foram analisados mensalmente e associados aos fatores ambientais monitorados. Um total de 1.000 indivíduos foram obtidos, sendo 567 machos e 433 fêmeas. Destas, 4 eram ovígeras (FO) e 35 portavam juvenis (FF). Dentre as relações biométricas utilizadas para determinação da maturidade sexual morfológica, a mais significativa para os machos foi entre a largura da carapaça (LC) e o comprimento do própodo do quelípodo (CP), enquanto que em fêmeas foi entre LC e a largura do abdome (LA). A partir destas, estimou-se o valor de 28,7mm para os machos e 24,2mm para as fêmeas. Os valores de LC50 (mm), apesar de próximos, mostraram um maior tamanho para as fêmeas, sendo 39,2mm para os machos e 39,9mm para as fêmeas. Esta diferença, provavelmente, está relacionada à uma estratégia reprodutiva das fêmeas em aumentar a quantidade de ovócitos maduros armazenados na cavidade cefalotorácica. A proporção sexual diferenciada para os meses e, para as classes de tamanho... / The population dynamics of Dilocarcinus pagei was investigated focusing the following aspects: morphological sexual maturity, gonadal maturity, sex ratio, reproductive and recruitment period. The animals were collected monthly, using seive and/or manually during the period from October 5 to September 7, in Furnas dam Furnas/Marimbondo Hydroelectric Plant, in the city of Icém, northwest region of the State of São Paulo (20°19’40,0”S e 49°10’18,1”N). Sexual and morphological maturity was calculated using the study of relative growth and gonadal maturity through the CW50. The sex ratio was investigated both monthly and in the number of individuals distributed by size classes (χ 2=2,261E-05; χ 2=2,26071E-05). For reproductive and recruitment periods, females denominated mature (developed gonadas, ovigerous females and with juveniles) and juveniles were analyzed monthly and associated to environmental factors. A total of 1.000 animals were collected, being 567 male and 433 female. Among females, 4 were ovigerous (OF) and 35 carried juveniles (FF). Among biometrical relationships used to determine the morphological sexual maturity, the most significant for the male was between the carapace length (CL) and the cheliped propodus length (CPL), while in the female was between CL and the abdomen length (AL). From these relationships, we estimated the value of 28,7mm for the male, and 24,2mm for the female. The CW50(mm) values, although near, demonstrated a larger size for the female, being 39,2mm for the male, and 39,9mm for the female. This difference probably is related to a reproductive strategy of the female to increase the quantity of mature oocytes storaged in the carapace cavity. The sexual proportion differentiated for months and for size classes can be related to differential growing, mortality index, food restriction, behavior differences, migration, and the usage... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:14Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-02-21Bitstream added on 2014-06-13T20:20:36Z : No. of bitstreams: 1 esteves_rl_me_botib.pdf: 1092521 bytes, checksum: 66f05c088bb3146b8ac613eaa29a45a4 (MD5) / O estudo da ictiofauna de riachos permite entender as interações entre as espécies, identificando as principais dimensões dos recursos ao longo das quais as espécies se segregam. No presente trabalho o objetivo foi conhecer a história natural das comunidades de peixes de dois riachos de cerrado, localizados na Estação Ecológica de Itirapina (EEc), Sudeste do Brasil, com ênfase na composição da ictiofauna e sua distribuição espacial. A ictiofauna destes riachos foi estudada em duas estações do ano, chuvosa (janeiro/2003, março e abril/2004) e seca (julho/2003, julho e setembro/2004), através de observações subaquáticas e coletas diurnas. A composição da ictiofauna dos dois riachos foi bastante semelhante, provavelmente devido a sua localização (mesma bacia, proximidade da foz na desembocadura na Represa do Lobo) e semelhanças nas características estruturais. Quanto à variação sazonal na abundância da ictiofauna, para os dois riachos foi coletado um maior número de indivíduos na estação seca, resultado provavelmente influenciado principalmente pelas melhores condições de trabalho encontradas durante esta estação. No Ribeirão Itaqueri e no Ribeirão do Lobo a maioria das espécies observadas esteve presente nos microhabitat tanto do leito quanto da margem. A menor oferta de microhabitat no Ribeirão Itaqueri pode ser relacionada com a ausência da mata ciliar e a existência de fortes ações antrópicas. Por outro lado, a maior heterogeneidade de microhabitat no Ribeirão do Lobo provavelmente está relacionada à presença da mata ciliar, o que torna o ambiente mais estável. Apesar das diferenças salientadas entre os dois riachos estudados, um com mata preservada e o outro margeado de capim, a maioria das espécies observadas utilizou a área marginal como local de abrigo ou forrageamento. Os conhecimentos adquiridos constituirão... / The study of ichthyofauna in streams allows us to understand the interaction amongst different species, identifying dimensions of resources in which the species segregate. This research s objective aims to discover the natural history of fish communities in two streams of savanna, located at the Estação Ecológica of Itirapina (EEc), Southeastern Brazil, with emphasis on the composition of ictiofauna and its space distribution. The ichthyofauna in these streams was studied in two different seasons of the year: wet (January/2003, March and April/2004) and dry (July/2003, July and September/2004). The method utilized was sub aquatic observations and diurnal samples. The fish fauna composition in both creeks was very similar, probably due to its location (same basin, proximity of the mouth into Represa do Lobo) and due to its structural similarities as well. In relation to the seasonal variation in abundance of ichthyofauna, both creeks had the largest number of individuals sampled during the dry season. This result was probably influenced mainly by better field work conditions during the dry season. In Ribeirão Itaqueri and Ribeirão do Lobo, the majority of observed species was present in microhabitats of the stream bed and of the shore as well. The lowest diversity of microhabitat in Ribeirao Itaqueri can be related to the absence of riparian vegetation and existence of strong antropic actions. In another hand, the highest heterogeneity of microhabitat in Ribeirão do Lobo is most likely related to the presence of riparian vegetation, which makes the habitat more stable. Although there are differences between the two streams in study, one with preserved forest and the other surrounded by a prairie, the majority of observed species utilized the surrounding vegetation as local shelter. Knowledge acquired in this study will compile an important... (Complete abstract click electronic access below)

Doenças infecciosas veiculadas pela água são causa comum de enfermidades em seres humanos no mundo inteiro. Dentre os patógenos causadores destas doenças, os vírus merecem destaque, pois possuem a capacidade de sobreviver em ambientes aquáticos e de permanecer infectantes por meses. A avaliação da balneabilidade das águas brasileiras é monitorada através da densidade de coliformes termotolerantes (CT), classificando as águas de recreação em próprias ou impróprias. Este trabalho tem como objetivo detectar e quantificar genomas de Adenovirus (AdV) e Enterovirus (EV) em amostras de água das praias de Ipanema e do Lami em Porto Alegre – RS e avaliar as condições de balneabilidade através da quantificação de CT. A metodologia utilizada foi reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) para os vírus e o método de tubos múltiplos para quantificação de CT. Entre os meses de novembro de 2011 e abril de 2012, foram coletadas 36 amostras de água: 18 amostras de Ipanema e 18 da praia do Lami. Em 30 (83,3%) das 36 amostras coletadas foi detectada a presença de genomas virais. Genoma de AdV foi detectado em 28 (77,8%) amostras, enquanto de EV foi detectado apenas em 8 amostras (22,2%). Em contraste com as baixas concentrações de CT, a pesquisa de AdV e EV demonstrou alta positividade (83,3%), o que demonstra a baixa correlação entre os micro-organismos utilizados como marcadores fecais e a presença de genomas virais em amostras de água. / Waterborne diseases are a common cause of illness in humans worldwide. Among the pathogens causing these diseases, the viruses are noteworthy because they have the ability to survive in aquatic environments and remain infective for months. In Brazil the evaluation of recreational waters is made by monitoring the density of fecal coliform (FC), classifying recreational waters in appropriate or inappropriate. This work aims to detect and quantify genomes of Adenovirus (AdV) and Enterovirus (EV) in water samples from Ipanema and Lami beaches in Porto Alegre - RS and assess the conditions of bathing by quantifying FC. The methodology used was real time polymerase chain reaction (qPCR) for virus and multiple tube technique for FC. Between the months of November 2011 and April 2012 were collected 36 water samples: 18 samples in Ipanema and 18 in Lami. In 30 (83.3%) of the 36 samples the presence of viral genomes was detected. AdV genome was detected in 28 (77.8%) samples, while the EV was only detected in 8 samples (22.2%). In contrast to the low concentrations of FC, research of EV and AdV showed a high positivity (83.3%), which demonstrates the low correlation between micro-organisms used as fecal markers and the presence of viral genomes in water samples.

Na busca por matérias-primas alternativas à produção de etanol no Brasil, a batata-doce surge como opção promissora, principalmente no estado do Rio Grande do Sul, maior produtor nacional da raiz e que importa, em média, 98% do etanol hidratado combustível que consome. A viabilidade econômica da produção de etanol a partir da batata-doce passa pela necessidade de otimização do processo. Esta dissertação foca no pré-processamento da matéria-prima e na hidrólise do amido, duas etapas fundamentais para viabilizar economicamente o processo. São comparadas as produções de açúcares redutores de experiências de hidrólise enzimática conduzidas com a batata-doce in natura triturada e com farinhas preparadas através de seis diferentes métodos de secagem (liofilização, ar quente a 60°C, estufa a 60°C e a 105°C com convecção natural do ar, com microondas e solar). A mistura comercial de enzimas STARGEN 002 foi utilizada inicialmente na concentração de 68 μL/g farinha. Os resultados mostram um rendimento maior obtido nos ensaios com matéria-prima seca em comparação a in natura, independentemente do método de secagem empregado. São comparados os custos acrescentados ao processo devido à inclusão da etapa de secagem com o retorno financeiro em função do aumento da eficiência da etapa de hidrólise. A utilização de micro-ondas apresentou, em comparação às demais técnicas de desidratação, além da maior concentração de açúcares redutores, um balanço econômico promissor, sendo então, selecionada como pré-processamento para os próximos experimentos da pesquisa. Através de um planejamento experimental se verificou que na etapa de hidrólise enzimática, a utilização da Pectinase, enzima complementar ao processo, não trouxe benefícios estatisticamente significativos. Dentro do mesmo estudo, a conversão máxima de 93,9% do amido foi alcançada com concentração inicial de matéria-prima de 110 g/L e de STARGEN 002 igual a 7,5 μL/g farinha, com possibilidade de utilizar níveis ainda mais baixos de enzima e mais altos de farinha conforme análise das superfícies de respostas. Na sequência, o trabalho traz resultados do processo de hidrólise e fermentação simultâneas com pré-tratamento realizado por 2 horas a 52°C. É obtido o valor de 72,2% ± 1,6% de eficiência na etapa de fermentação com 140 g/L de matéria-prima e 3 μL de enzima por grama de farinha. A análise econômica, feita a partir dos resultados apresentados nessa pesquisa, resulta no custo de R$ 1,35 por litro de EHC. / In the search for alternative feedstocks for ethanol production in Brazil, the sweet potato emerges as a promising option, particularly in the state of Rio Grande do Sul, the main national producer of the root and has imported, on average, 98% hydrated ethanol fuel it consumes. To obtain the economic feasibility of ethanol from sweet potato the process optimization is necessary. This work focuses on the pre-processing of the raw material and the hydrolysis of starch, two fundamental steps to make the process economically viable. The reducing sugars production by the enzymatic hydrolysis experiments conducted with the fresh and triturated sweet potato is compared with the use of flour prepared by six different drying methods (lyophilization, hot air at 60°C, oven with air natural convection at 60°C and 105°C , microwave and solar). The commercial mixture of enzymes STARGEN 002 was initially used at a concentration of 68 μL/g flour. The results show a higher yield in tests of dry feedstock, regardless of the employed drying method. The added costs to the process due the inclusion of the drying step are compared with the financial return of this procedure. In comparison to other techniques of dehydration, the use of microwave resulted in the largest concentration of reducing sugars and a promising economic balance, so the microwave drying was selected as preprocessing for the next experiments of research. Through an experimental design, the use of Pectinase, a complementary enzyme of process, showed to be statistically insignificant in the enzymatic hydrolysis step. In the same study, the starch conversion of 93.9% was achieved with an initial concentration of 110 g/L of dried sweet potato and STARGEN 002 equal to 7.5 mL/g flour, with possibility to use lower levels of enzyme and higher of flour according to response surface analysis. Furthermore, are presented the results of simultaneous hydrolysis and fermentation with pretreatment process conducted for 2 hours at 52°C. The fermentation efficiency reached 72.2% ± 1.6% with 140 g/L of raw material and 3 mL of enzyme per gram of flour. The economic analysis, based on the results presented in this research, results in the cost of R$ 1.35 per liter of hydrated ethanol.

Dissertação (mestrado) - Universidade de Brasília, Faculdade de Tecnologia, 2013. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2015-01-15T15:57:23Z No. of bitstreams: 1 2013_AnaPauladeSouza.pdf: 2981831 bytes, checksum: bc1f14daf189e028bb3bafbcc856a35c (MD5) / Approved for entry into archive by Ruthléa Nascimento(ruthleanascimento@bce.unb.br) on 2015-02-11T16:47:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_AnaPauladeSouza.pdf: 2981831 bytes, checksum: bc1f14daf189e028bb3bafbcc856a35c (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-11T16:47:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_AnaPauladeSouza.pdf: 2981831 bytes, checksum: bc1f14daf189e028bb3bafbcc856a35c (MD5) / O presente estudo teve como objetivo avaliar a aplicabilidade de índices de integridade biótica do fitoplanctôn para estimar a qualidade da água em reservatórios tropicais, empregando dados secundários oriundos do programa de monitoramento realizado pela Caesb nos lagos Paranoá e Descoberto, no Distrito Federal. Esses ambientes foram escolhidos pela sua importância para a população local, e também por possuírem um programa de monitoramento limnológico bem instituído. Os dados do monitoramento foram compilados num banco de dados, onde se buscou adequá-los para atendimento as métricas dos índices de integridade biótica. Os cinco índices estudados foram selecionados na literatura em função da compatibilidade com os dados disponíveis, e foram os seguintes: P-IBI-G - German Phytoplankton Index of Biotic Integrity (Wu et al., 2012); P-IBI-I - Phytoplankton Index of Biotic Integrity for Iraq (Maulood et al., 2011); Integrated Phytoplankton Index - IPI (Spatharis e Tsirtsis, 2010); PSI – Phyto-See-Index (Mischke et al., 2008) e Índice Q – Assemblage Index (Padisák et al., 2006). A aplicação dos índices no lago Paranoá foi feita com dados de cinco estações de monitoramento; na região central (estação C), a aplicação dos índices foi feita com dados de toda a coluna de água. A fim de verificar a capacidade dos índices em demonstrar alterações na qualidade da água, foram comparados dois períodos: de 1976 a 1998 e de 1999 a 2011. No lago Descoberto, a aplicação foi feita apenas na estação A, em toda a coluna de água com dados de 2004 a 2011, e teve o intuito de se avaliar comparativamente os resultados dos índices aplicados em dois ambientes distintos. Os resultados do lago Paranoá demostraram que no período de 1976 a 1998, todos os índices classificaram a água como “Ruim” ou “Insatisfatório”, corroborando que nesse período a qualidade da água estava comprometida, com sinais de eutrofização. A única exceção foi Q Index, que nas estações A1M e B1M apresentou resultado “Moderado” e na estação CSUP, “Bom”, pois apesar da alta densidade do grupo funcional SN (gêneros Cylindrospermopsis), foram registradas também densidades expressivas de espécies que caracterizam ambientes oligotróficos a mesotróficos. No período de 1999 a 2011, os índices P-IBI-G, P-IBI-I e IPI variaram de “Moderado” a “Insatisfatório”. Porém, os índices PSI e Q Index variaram de “Moderado” a “Excelente”; o Q Index apresentou melhores resultados, devido, principalmente, a diminuição da densidade do grupo SN. No lago Descoberto, o resultado foi semelhante: P-IBI-G, P-IBI-I e IPI variaram de “Moderado” a “Ruim”, enquanto os índices PSI e Q Index variaram de “Excelente” a “Bom”. As diferenças observadas podem ser atribuídas às abordagens adotadas no desenvolvimento de cada um. De forma geral os resultados demostraram que os índices evidenciaram diferenças entre ambientes distintos, bem como a evolução na qualidade da água ao longo do tempo, porém não foram eficientes em comprovar alterações dentro do mesmo corpo de água. Acredita-se que a adequação das notas de classificação e métricas componentes dos índices ao ambiente avaliado pode levar a maior sensibilidade dos índices em demonstrar a qualidade da água dos ambientes tropicais. _____________________________________________________________________________ ABSTRACT / The aim of this study was to evaluate the applicability of phytoplankton biotic integrity indexes to estimate water quality in tropical reservoirs. To calculate the indexes were applied secondary data from the monitoring program conducted monthly by Caesb (Company of Environmental Sanitation of Federal District) in Paranoá and Descoberto lakes. The lakes were chosen for their importance to the Federal District population and also because a well established limnological monitoring program. The data was compiled in a database and adapted to meet the metrics of the chosen biotic integrity indexes. The five indexes studied were selected based on their metrics compatibility to the available dataset. The indexes applied are P - IBI - G- German Phytoplankton Index of Biotic Integrity (Wu et al. , 2012. ) , P - IBI - I- Phytoplankton Index of Biotic Integrity for Iraq ; Integrated Phytoplankton Index - IPI ( Spatharis and Tsirtsis , 2010) ; ( Maulood et al , 2011); PSI - Phyto -See -Index (Mischke et al. , 2008. ) and Index Q - Assemblage Index ( Padisák et al. , 2006). In Lake Paranoá the indexes were applied in five monitoring stations divided according to tributaries influences and limnological characteristics. In order to verify the ability of the indexes to demonstrate changes in water quality, two periods were compared 1976-1998 and 1999-2011. In Descoberto’s lake the indexes were applied only at the more deep monitoring station with data from 2004 to 2011. The comparison between the two lakes intended to evaluate the results in two different environments. In Lake Paranoá, the period 1976-1998, the indexes classified the water as " Poor " or " Unsatisfactory ", emphasizing the eutrophication period. The exception was the Q Index, which classified the stations A1M and B1M as "Moderate" and CSUP station as "Good" because of the high densities of oligotrophic to mesotrophic species. In the period 1999 to 2011, the P - IBI - G, P - IBI - I and IPI varied from "Moderate" to "Unsatisfactory” at the same time as, PSI and Q Index varied from "Moderate" to "Excellent". The difference was probably due to the decrease in the SN group (Cylindrospermopsis cyanobacterial genera) density. The results for Descoberto’s lake was similar : P - IBI - G , P - IBI - I and IPI ranged from "Moderate" to "Poor" , while PSI and Q Index ranged from "Excellent" to "Good". The dissimilarity observed may be due to the singular method used to develop each index. Overall, the results were able to differentiate the two environments, as well as point to water quality improvement over time at Paranoá’s lake. Nevertheless the indexes were not effective in differentiate the water quality among the monitoring stations. The better adjustment of the classification weight’s and metrics to the water body conditions would probably lead to an increase of the index’s sensitivity to demonstrate the water quality in tropical environments.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2008. / Submitted by Thaíza da Silva Santos (thaiza28@hotmail.com) on 2011-02-08T16:35:38Z No. of bitstreams: 1 2008_MarianaSchneider.pdf: 1282667 bytes, checksum: b10257c75aff45d5df95d31ca6c1d2af (MD5) / Approved for entry into archive by Daniel Ribeiro(daniel@bce.unb.br) on 2011-02-09T22:48:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_MarianaSchneider.pdf: 1282667 bytes, checksum: b10257c75aff45d5df95d31ca6c1d2af (MD5) / Made available in DSpace on 2011-02-09T22:48:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_MarianaSchneider.pdf: 1282667 bytes, checksum: b10257c75aff45d5df95d31ca6c1d2af (MD5) / O presente estudo foi desenvolvido com o objetivo de determinar a composição e a estrutura trófica da comunidade de peixes da sub-bacia do Ribeirão Bananal pertencente a uma área bem preservada de Cerrado no Parque Nacional de Brasília. Além disso, devido a marcante sazonalidade deste bioma, buscou-se verificar a influência das variações ambientais na dieta das espécies. Em cada trecho de 30 m de extensão foram realizadas quatro amostragens, duas no período seco e duas no período chuvoso. Foram coletados 3597 indivíduos pertencentes a 20 espécies. Destas, nove são espécies novas. Foram analisados 1050 estômagos pertencentes às 13 espécies mais abundantes. No total, foram consumidos 36 itens alimentares sendo 24 autóctones, oito alóctones e quatro de origem indeterminada. A análise de escalonamento multidimensional não-métrico (NMDS), juntamente com os resultados dos gráficos de freqüência de ocorrência e abundância, agrupou as espécies em quatro guildas: detritívoros, onívoros (com tendência à herbivoria e invertivoria), invertívoros e piscívoros. Poucos pares de espécies demonstraram sobreposição alimentar e, quando houve sobreposição, esta foi principalmente registrada entre espécies de uma mesma guilda trófica. Cerca de 69% dos recursos consumidos pelos indivíduos foram de origem alóctone, o que evidencia a importância dos recursos advindos das matas de galeria. A contribuição de presas autóctones e alóctones na dieta diferiu, de acordo com a estação, para Aspidoras fuscoguttatus, Astyanax sp., Characidium sp., Hyphessobrycon balbus, Kolpotocheirodon theloura, Moenkhausia sp., Phalloceros caudimaculatus e Rivulus pictus. Apesar das características climáticas do bioma Cerrado, não houve influência significativa da variação sazonal na dieta. A ausência de variação sazonal e a predominância de itens alóctones na dieta provavelmente estão associadas à presença de matas ciliares, que atuam como zonas de amortecimento e zonas provedoras de recursos para a biota aquática. O presente estudo demonstra a importância de estudos em regiões íntegras para fornecer conhecimentos sobre a biologia das espécies e permitir o direcionamento de ações públicas para o manejo dos recursos aquáticos, para a recuperação de áreas degradadas e para a determinação de áreas prioritárias para a conservação. __________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The purpose of this study was determined the composition and the trophic structure of fish communities in the Ribeirão Bananal sub-basin, which belongs to a well preserved Cerrado area in the National Park of Brasília, Brazil. Furthermore, due to a marked sazonality in this biome, it was examined the influence of environmental variations on the fish species diets in the study area. Therefore, in a stretch of 30 m long, four samples – two in the dry season and two in the raining period – were taken. A total of 3597 individuals, belonging to 20 species, were collected. Nine of them were new species for the area. The study analyzed 1050 stomachs of the 13 more abundant species. The analysis showed that a total of 36 feeding items were consumed, 24 autochthonous, 8 alochthonous and four of indetermined origin. The non-metric multidimensional scaling (NMDS) analysis, together with the results of frequency occurrence and abundance graphics, permitted to group the species in four feeding guilds: detritivores, onivores (with tendency to herbivory and invertivory), invertivores and piscivores. Only a few pairs of species showed feeding overlap and when it occurred, it was mostly among species of the same trophic guild. Around 69% of resources consumed were from alochthonous origin, which proves the importance of the resources provided by riparian vegetation. The contribution of autochthonous and alochthonous items in the diet differed according to the season for Aspidoras fuscoguttatus, Astyanax sp., Characidium sp., Hyphessobrycon balbus, Kolpotocheirodon theloura, Moenkhausia sp., Phalloceros caudimaculatus e Rivulus pictus. Despite the Cerrado’s climatic characteristics, there was no significant influence of seasonal variation on the diet. The absence of seasonal variation and the prevail of alochthonous items in the diet probably are associate with the presence of riparian vegetation that act as a transition area and provide resources do the aquatic fauna. This work demonstrates the importance of studies in non-disturbed areas to provide information concerning the species biology and direct the public actions to the aquatic resources management, recuperation of damaged areas and determination of priority areas to conservation.