Submitted by Gizele Lima (gizele.lima@inpa.gov.br) on 2016-09-13T13:52:03Z No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-13T13:52:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Edika Sabrina.pdf: 2355352 bytes, checksum: bd199f9d627c46955e2c63cfd52499f5 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-04-29 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas - FAPEAM / Cichlids have different morphological, ecological and behavioral adaptations, promoting their adaptation in different environments throughout evolution. This diversity is reflected in the composition of cytogenomics group, which shows disparity in karyotype formula and diploid number of phylogenetically related species. The differences in composition and structure variations of these species are directly related to the repetitive fraction of the genome, since they correspond to most of the genome, and promotes chromosomal rearrangement events that can be observed by fluorescent in situ hybridization technique. Chromosome physical mapping of neotropical amazonian cichlid limited to specific elements that are the main targets of cytogenetic studies, such as non-LTR retrotransposons Rex and ribosomal DNA family. However, other participants in the repetitive portion of the genome have not yet been mapped until this present study. In addition, studies in African cichlids, brother phylogenetic group of neotropical, indicate that repetitive genomic composition of these species is much broader. Thanks to the recent availability of genomic sequencing of males and females of Amazonian species Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare and Symphysodon discus, this study has identified, from a small fraction of the total genome of these species, other classes of repetitive elements in order to map them on chromosomes. The repetitive elements were identified as simple repeat and satellites DNA, and different classes of non-LTR retrotransposons LINE-like, LTR retrotransposons ERV-like and transposons Tc1-like. Moreover, it was possible to identify the proportion of each element in genomic sample used and relate the abundance of the number of copies of each element with the phylogeny of the host group, providing preliminary data on the participation of transposable throughout evolution. From this initial approach, the transposable elements more abundant were selected for use as probes in chromosomal physical mapping: retrotransposons non-LTR lines L2, RTE and Dong.R4 and transposons Tc1. The markings were conspicuous and widespread and not restricted to regions of heterochromatin. Some peculiarities were observed, such as retroelement L2 in Astronotus ocellatus, whose markings were mostly conspicuous in the centromeric and terminal regions, with the exception of chromosome pair 10 which showed strong marks scattered throughout the chromosome segment. Further investigation was conducted to identify possible variations of elements used as probes, the technique of in vivo cloning. In general, the sequences are relatively conserved, showing high degree of identity each other. Genomic data of transposable elements combined with its chromosomal mapping and their comparative nucleotide sequences provide preliminary data on the participation in the composition, organization and cytogenomics evolution of neotropical Amazonian cichlids. / Os ciclídeos apresentam diferentes adaptações morfológicas, ecológicas e comportamentais, promovendo sua adaptação em diversos ambientes ao longo da evolução. Essa diversidade é refletida na composição citogenômica do grupo, que apresenta disparidade na fórmula cariotípica e número diploide entre espécies próximas filogeneticamente. As diferenças na composição e estrutura cariotípica dessas espécies estão diretamente relacionadas à fração repetitiva do genoma, pois correspondem à maior parte, e favorecem eventos de rearranjo cromossômico, que podem ser observados pela técnica de hibridização fluorescente in situ. O mapeamento físico cromossômico de ciclídeos neotropicais amazônicos limita-se a elementos pontuais que são os principais alvos de estudos citogenéticos, como os retroelementos não-LTR da família Rex e DNAs ribossomais. Contudo, outros participantes da porção repetitiva do genoma ainda não foram mapeados até o presente estudo. Além disso, estudos em ciclídeos africanos, grupo filogenético irmão dos neotropicais, indicam que a composição genômica repetitiva dessas espécies é muito mais abrangente. Graças à recente disponibilidade do sequenciamento genômico de machos e fêmeas das espécies amazônicas Cichla vazzoleri, Astronotus ocellatus, Pterophyllum scalare e Symphysodon discus, o presente estudo identificou, a partir de uma pequena fração do genoma total destas espécies, outras classes de elementos repetitivos a fim de mapeá-los nos cromossomos. Os elementos repetitivos identificados foram repetições simples e DNA satélites, além de diferentes classes de retrotransposons não-LTRs do tipo LINE, retrotransposons LTRs do tipo ERV e transposons do tipo Tc1. Além disso, foi possível identificar a estimativa da proporção genômica e relacionar a abundância do número de cópias de cada elemento com a filogenia do grupo hospedeiro, fornecendo dados preliminares sobre a participação de transponíveis na evolução. A partir dessa abordagem inicial, foram selecionados os elementos transponíveis mais abundantes para serem utilizados como sondas no mapeamento físico cromossômico: retrotransposons não-LTRs lines L2, RTE e Dong.R4 e o transposon Tc1. As marcações foram conspícuas e dispersas e não se restringiram às regiões de heterocromatina. Algumas peculiaridades foram observadas, como a do retroelemento L2 em Astronotus ocellatus, cujas marcações foram majoritariamente conspícuas nas regiões centroméricas e terminais, com exceção do par cromossômico 10 que apresentou fortes marcações dispersas ao longo de todo o segmento cromossômico. Uma investigação adicional foi realizada a fim de identificar possíveis variações dos elementos utilizados como sondas, pela técnica de clonagem in vivo. De maneira geral, as sequências são relativamente conservadas, apresentando alto grau de identidade entre si. Dados genômicos dos elementos transponíveis combinado ao mapeamento cromossômico e análise comparativa de suas sequências nucleotídicas fornecem dados preliminares sobre a participação na composição, organização e evolução citogenômica de ciclídeos neotropicais amazônicos.

Doenças infecciosas veiculadas pela água são causa comum de enfermidades em seres humanos no mundo inteiro. Dentre os patógenos causadores destas doenças, os vírus merecem destaque, pois possuem a capacidade de sobreviver em ambientes aquáticos e de permanecer infectantes por meses. A avaliação da balneabilidade das águas brasileiras é monitorada através da densidade de coliformes termotolerantes (CT), classificando as águas de recreação em próprias ou impróprias. Este trabalho tem como objetivo detectar e quantificar genomas de Adenovirus (AdV) e Enterovirus (EV) em amostras de água das praias de Ipanema e do Lami em Porto Alegre – RS e avaliar as condições de balneabilidade através da quantificação de CT. A metodologia utilizada foi reação em cadeia da polimerase em tempo real (qPCR) para os vírus e o método de tubos múltiplos para quantificação de CT. Entre os meses de novembro de 2011 e abril de 2012, foram coletadas 36 amostras de água: 18 amostras de Ipanema e 18 da praia do Lami. Em 30 (83,3%) das 36 amostras coletadas foi detectada a presença de genomas virais. Genoma de AdV foi detectado em 28 (77,8%) amostras, enquanto de EV foi detectado apenas em 8 amostras (22,2%). Em contraste com as baixas concentrações de CT, a pesquisa de AdV e EV demonstrou alta positividade (83,3%), o que demonstra a baixa correlação entre os micro-organismos utilizados como marcadores fecais e a presença de genomas virais em amostras de água. / Waterborne diseases are a common cause of illness in humans worldwide. Among the pathogens causing these diseases, the viruses are noteworthy because they have the ability to survive in aquatic environments and remain infective for months. In Brazil the evaluation of recreational waters is made by monitoring the density of fecal coliform (FC), classifying recreational waters in appropriate or inappropriate. This work aims to detect and quantify genomes of Adenovirus (AdV) and Enterovirus (EV) in water samples from Ipanema and Lami beaches in Porto Alegre - RS and assess the conditions of bathing by quantifying FC. The methodology used was real time polymerase chain reaction (qPCR) for virus and multiple tube technique for FC. Between the months of November 2011 and April 2012 were collected 36 water samples: 18 samples in Ipanema and 18 in Lami. In 30 (83.3%) of the 36 samples the presence of viral genomes was detected. AdV genome was detected in 28 (77.8%) samples, while the EV was only detected in 8 samples (22.2%). In contrast to the low concentrations of FC, research of EV and AdV showed a high positivity (83.3%), which demonstrates the low correlation between micro-organisms used as fecal markers and the presence of viral genomes in water samples.

Made available in DSpace on 2018-08-01T23:19:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_10547_Dissertação Final de Mestrado - Eduardo Lorencetti Fornazier PDF.pdf: 1187755 bytes, checksum: 402fa3b0b773d18001775d39fa47a679 (MD5) Previous issue date: 2018-05-07 / A batata doce (Ipomoea batatas (L.) Lam.) é fonte de fibras, carboidratos, minerais, vitamina C e compostos fitoquímicos como carotenoides e compostos fenólicos. Existe diversas cultivares contendo carotenoides pró-vitamina A em concentrações variáveis, no entanto, a espécie de batata doce de polpa alaranjada, que possui as maiores concentrações, ainda é pouco utilizada e pode representar uma estratégia viável para combater a deficiência de vitamina A nos países em desenvolvimento. Foi desenvolvido através do projeto de biofortificação de alimentos, o germoplasma Beauregard, cujos teores de carotenoides são em média 100 vezes superiores em comparação as batatas doces convencionais de polpa branca. Após a cocção, sabe-se que o teor de carotenoides nos alimentos pode ser significativamente afetado, contudo podem ser utilizados diferentes métodos para o preparo da batata e alguns podem auxiliar na manutenção das características nutricionais. O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito de sete diferentes processos domésticos de cocção: fritura em óleo, fritura em panela elétrica do tipo air fryer, cozimento a vapor em panela elétrica do tipo panela de arroz, cozimento por imersão em água fervente, cozimento em panela de pressão, assamento em forno elétrico e preparo em forno de microondas, no teor de compostos fenólicos, e na atividade antioxidante nas batatas doces convencionais e biofortificadas e, na retenção real de &#946;-caroteno na batata doce biofortificada. Foi realizada a composição centesimal e análise instrumental de cor nas batatas doces in natura. Posteriormente, as batatas doces foram descascadas, lavadas e cortadas no formato de palito e coccionadas nos diversos processamentos. O delineamento experimental aplicado foi fatorial e foi realizada análise de variância e teste de Tukey (p<0,05) para comparar as médias dos compostos analisados entre os processamentos e entre os tipos de batatas. A batata doce biofortificada in natura apresentou concentrações superiores de fenóis totais e atividade antioxidante em relação à batata doce convencional. Os processos air fryer e fritura em óleo apresentaram os melhores resultados para compostos fenólicos. Os métodos fritura em óleo, forno elétrico, panela de pressão e air fryer foram os melhores processos na preservação da atividade antioxidante pelo método DPPH e air fryer, forno elétrico e microondas pelo método pelo ABTS. Os cozimentos em panela de pressão (103,26 %) e imersão em água quente (93,72 %) foram identificados como os melhores métodos de processamento doméstico para aumentar a retenção de &#946;-caroteno em batatas doces biofortificadas.

Orientador: Magali Leonel / Banca: Regina Marta Evangelista / Banca: Pedro de Magalhães Padilha / Banca: Luciana Francisco Fleuri / Banca: Ana Paula Cerino Coutinho / Resumo: O amido é o componente principal na maioria dos alimentos processados, atribuindo características únicas aos produtos. Para atender às várias demandas do mercado consumidor, muitas vezes os amidos necessitam ser modificados, e a tecnologia de extrusão é um dos processos disponíveis para a obtenção de amidos pré-gelatinizados. Comparado com os demais métodos de modificação, a extrusão é uma tecnologia limpa e versátil, tornando-se uma opção interessante para as indústrias. Diante do exposto, o presente estudo objetivou avaliar as características físico-químicas e tecnológicas dos amidos nativos de mandioca, batata-doce e mandioquinha-salsa, bem como, estudar o efeito da modificação por extrusão sobre as características desses amidos. Para o alcance desses objetivos, o trabalho foi divido em dois experimentos. No primeiro experimento os amidos nativos foram caracterizados e modificados sob condições fixas de configuração e processamento no extrusor (temperatura de extrusão a 90 °C, rotação da rosca a 230 rpm e umidade a 20 % (m/m)). No segundo experimento, após terem sido constatados os efeitos do processo de extrusão sobre as características dos amidos das três fontes, foi avaliado por meio de ensaios em delineamento central composto rotacional, o efeito da variação da temperatura de extrusão (65 a 115 ºC), rotação da rosca (205 a 255 rpm) e umidade (16 % a 24 % (m/m)) sobre as características dos amidos de mandioca e batata-doce. Os resultados mostraram efeito do processo de ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Starch is the main component in most processed foods giving unique characteristics to the products. To meet the various demands of the consumer market, starches often need to be modified, and extrusion technology is one of the processes available to obtain pregelatinised starches. Compared to other modification methods, extrusion is a clean and versatile technology, making it an interesting option for industries. The present study aimed to evaluate the physico-chemical and technological characteristics of cassava, sweet potato and Peruvian carrot starch without modification, as well as to study the effect of the extrusion process on the characteristics of these starches. To reach these objectives, the work was divided into two experiments. In the first experiment native starches were characterized and modified under fixed conditions of extruder configuration and processing (90ºC of extrusion temperature, 230 rpm of screw speed and 20 % (w/w) of moisture). Results showed significant effects of the extrusion process on the characteristics of the three analyzed starches, so, the second experiment was carried out in a central composite design rotational to evaluate the effect of extrusion temperature (65 to 115ºC), screw speed (205 to 255 rpm) and moisture (16 to 24 % (w/w)) on the characteristics of cassava and sweet potato starches. Results showed effect of the extrusion process on the characteristics of the starches and correlation with properties of each starch. Temperature was the factor of greater influence in the modification of the evaluated starches. Conditions of 22 % (w/w) moisture in the starches, 105 °C temperature in the extrusion zone and the screw speed of 215 rpm allow the production of fully gelatinized cassava and sweet potato starches, which may have various applications in the food sector... / Doutor

Na busca por matérias-primas alternativas à produção de etanol no Brasil, a batata-doce surge como opção promissora, principalmente no estado do Rio Grande do Sul, maior produtor nacional da raiz e que importa, em média, 98% do etanol hidratado combustível que consome. A viabilidade econômica da produção de etanol a partir da batata-doce passa pela necessidade de otimização do processo. Esta dissertação foca no pré-processamento da matéria-prima e na hidrólise do amido, duas etapas fundamentais para viabilizar economicamente o processo. São comparadas as produções de açúcares redutores de experiências de hidrólise enzimática conduzidas com a batata-doce in natura triturada e com farinhas preparadas através de seis diferentes métodos de secagem (liofilização, ar quente a 60°C, estufa a 60°C e a 105°C com convecção natural do ar, com microondas e solar). A mistura comercial de enzimas STARGEN 002 foi utilizada inicialmente na concentração de 68 μL/g farinha. Os resultados mostram um rendimento maior obtido nos ensaios com matéria-prima seca em comparação a in natura, independentemente do método de secagem empregado. São comparados os custos acrescentados ao processo devido à inclusão da etapa de secagem com o retorno financeiro em função do aumento da eficiência da etapa de hidrólise. A utilização de micro-ondas apresentou, em comparação às demais técnicas de desidratação, além da maior concentração de açúcares redutores, um balanço econômico promissor, sendo então, selecionada como pré-processamento para os próximos experimentos da pesquisa. Através de um planejamento experimental se verificou que na etapa de hidrólise enzimática, a utilização da Pectinase, enzima complementar ao processo, não trouxe benefícios estatisticamente significativos. Dentro do mesmo estudo, a conversão máxima de 93,9% do amido foi alcançada com concentração inicial de matéria-prima de 110 g/L e de STARGEN 002 igual a 7,5 μL/g farinha, com possibilidade de utilizar níveis ainda mais baixos de enzima e mais altos de farinha conforme análise das superfícies de respostas. Na sequência, o trabalho traz resultados do processo de hidrólise e fermentação simultâneas com pré-tratamento realizado por 2 horas a 52°C. É obtido o valor de 72,2% ± 1,6% de eficiência na etapa de fermentação com 140 g/L de matéria-prima e 3 μL de enzima por grama de farinha. A análise econômica, feita a partir dos resultados apresentados nessa pesquisa, resulta no custo de R$ 1,35 por litro de EHC. / In the search for alternative feedstocks for ethanol production in Brazil, the sweet potato emerges as a promising option, particularly in the state of Rio Grande do Sul, the main national producer of the root and has imported, on average, 98% hydrated ethanol fuel it consumes. To obtain the economic feasibility of ethanol from sweet potato the process optimization is necessary. This work focuses on the pre-processing of the raw material and the hydrolysis of starch, two fundamental steps to make the process economically viable. The reducing sugars production by the enzymatic hydrolysis experiments conducted with the fresh and triturated sweet potato is compared with the use of flour prepared by six different drying methods (lyophilization, hot air at 60°C, oven with air natural convection at 60°C and 105°C , microwave and solar). The commercial mixture of enzymes STARGEN 002 was initially used at a concentration of 68 μL/g flour. The results show a higher yield in tests of dry feedstock, regardless of the employed drying method. The added costs to the process due the inclusion of the drying step are compared with the financial return of this procedure. In comparison to other techniques of dehydration, the use of microwave resulted in the largest concentration of reducing sugars and a promising economic balance, so the microwave drying was selected as preprocessing for the next experiments of research. Through an experimental design, the use of Pectinase, a complementary enzyme of process, showed to be statistically insignificant in the enzymatic hydrolysis step. In the same study, the starch conversion of 93.9% was achieved with an initial concentration of 110 g/L of dried sweet potato and STARGEN 002 equal to 7.5 mL/g flour, with possibility to use lower levels of enzyme and higher of flour according to response surface analysis. Furthermore, are presented the results of simultaneous hydrolysis and fermentation with pretreatment process conducted for 2 hours at 52°C. The fermentation efficiency reached 72.2% ± 1.6% with 140 g/L of raw material and 3 mL of enzyme per gram of flour. The economic analysis, based on the results presented in this research, results in the cost of R$ 1.35 per liter of hydrated ethanol.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:35:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-03-14Bitstream added on 2014-06-13T21:08:00Z : No. of bitstreams: 1 rinconfilho_g_dr_rcla.pdf: 2989756 bytes, checksum: 1a42dacb7997cea4ab2edc011dd589b3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)

Orientador : Prof. Dr. Eduardo Luis Cupertino Ballester / Coorientador : Profª. Drª. Carolina Arruda de Oliveira Freire / Tese (doutorado) - Universidade Federal do Paraná, Setor de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Zoologia. Defesa: Curitiba, 02/02/2017 / Inclui referências : f. 332-38;47-50;68-76;93-101;103-111;116-119 / Area de concentração: Zoologia / Resumo: O objetivo do presente trabalho foi determinar o efeito de diferentes concentrações de amônia e nitrito sobre pós-larvas, juvenis e adultos do camarão-da-amazônia Macrobrachium amazonicum, durante 96 horas de exposição. Cada estágio de vida foram submetido a diferentes concentrações de amônia total (0, 5, 10, 20, 40 e 80 mg.L-1) e nitrito (0, 1, 2, 4, 8 e 16 mg.L-1). Brânquias de juvenis foram retiradas para realização da avaliação histopatológica. A concentração letal mediana (CL50-96h) de amônia (capítulo 1) foi calculada pelo modelo matemático Probit. A CL50-96h para pós-larvas, juvenis e adultos de M. amazonicum foi de 21,14; 21,65 e 36,59 mg.L-1 de amônia total, ou 0,67, 0,75 e 1,08 mg.L-1 de amônia não ionizada, respectivamente. Os níveis de segurança para a produção deste camarão foi de 0,06; 0,07 e 0,1 mg.L-1 para pós-larvas, juvenis e adultos, respectivamente. No teste de concentração letal mediana (CL50-96h) de nitrito (Capítulo 2), realizado pelo modelo matemático Weibull I, observou-se que a CL50-96h para pós larvas, juvenis e adultos de M. amazonicum foi de 1,49; 2,36 e 2,34 mg.L-1 de nitrito, respectivamente. Os níveis de segurança para produção foram de 0,1 mg L-1 a pós-larvas e 0,2 mg.L-1 nitrito para juvenis e adultos. Quando avaliamos as alterações em brânquias de juvenis de M. amazonicum submetidos a diferentes concentrações de amônia total e nitrito (Capítulo 3), observou-se que os danos às brânquias nos tratamentos com mortalidade de 100%, corresponderam à alta ocorrência de danos progressivos, regressivos, circulatórios e inflamação. Os demais tratamentos apresentaram, principalmente, inflamação e danos regressivos, aumentando sua ocorrência de acordo com o aumento da concentração. A análise histológica confirmou que quanto maiores as concentrações de amônia total e nitrito, maiores foram os danos causados à estrutura da brânquia. Na avaliação do processo osmótico (Capítulo 4), ao comparar as fases de vida para cada concentração de amônia total, observou-se que a ativadade da anidrase carbônica (AAC) foi maior para juvenis, estatisticamente diferente (p<0,05) de pós larvas. Para nitrito, a fase adulta apresentou maior atividade na concentração de 8 mg.L-1, sendo diferente (p<0,05) de pós larvas e juvenis. Os valores de ACC nas demais concentrações são semelhantes entre as fases de vida (p>0,05). Ao comparar as concentrações dos compostos em cada fase de vida, observou-se que camarões na fase adulta apresentaram maior AAC quando expostos a 5 mg.L-1 de amônia total, diferindo estatisticamente (p<0,05) da AAC em 20 e 40 mg.L-1 de amônia total. Quando submetidos ao nitrito, camarões adultos apresentaram maior AAC na concentração de 8 mg.L-1 e menor na concentração de 16 mg.L-1, sendo diferente estatisticamente (p<0,05) entre si. Nas demais fases a AAC foi semelhante (p>0,05) entre todas as concentrações, tanto para amônia total quanto para nitrito. Avaliando a osmolalidade da hemolinfa, observamos que nas concentrações de 0 e 5 mg.L-1 de amônia total, pós larvas apresentaram os maiores valores, sendo diferente estatisticamente das demais fases (p<0,05). Já para nitrito, pós larvas apresentaram os menores valores de osmolalidade, diferindo estatisticamente (p<0,05) de juvenis e adultos. Ao comparar as concentrações dos compostos em cada fase de vida, observamos que os maiores valores de osmolalidade são encontrados em pós larvas e juvenis nas concentrações de 5 e 10 mg.L-1 de amônia total, que apresentaram diferença estatística (p<0,05) em relação às menores concentrações osmóticas, observadas nas concentrações de 40 e 0 mg.L-1 de amônia total, respectivamente. Para nitrito, foi observada diferença (p<0,05) na fase de pós larvas, que apresentou maior valor de osmolalidade em 0 mg.L-1 e o menor em 2 mg.L-1 de nitrito. Portanto, Pós larvas de M. amazonicum tem menor capacidade de manter sua AAC quando submetida ao aumento da concentração de amônia total, bem como, menor capacidade de manter a concentração osmótica na hemolinfa quando submetido ao aumento na concentração de nitrito. Palavras chave: Camarão de água doce, Compostos nitrogenados, Toxicologia, Alteração branquial, Atividade enzimática / Abstract: The objective of the presente study was to determine the effect of different concentrations of ammonia and nitrite on post larvae, juveniles and adults of the Amazon river prawn Macrobrachium amazonicum, during 96 hours of exposure. Each life stage were submitted to different concentrations of total ammonia (0, 5, 10, 20, 40 and 80 mg.L-1) and nitrite (0, 1, 2, 4, 8 and 16 mg.L-1). Juvenile gills were removed for the histopathological evaluation. The median lethal concentration (LC50-96h) of ammonia (Chapter 1) was calculated by the mathematical model Probit. LC50-96h for post larvae, juveniles, and adults of M. amazonicum was of 21.14, 21.65 and 36.59 mg.L-1 of total ammonia or 0.67, 0.75 and 1.08 mg.L-1of non-ionized ammonia. Thus, from these results, safe levels for the production of this prawn are of 0.06, 0.07 and 0.1 mg.L-1 from post larvae, juveniles and adults, respectively. In the test of median lethal concentration (LC50-96h) of nitrite (Chapter 2), performed with the mathematical model Weibull I, it was observed that the LC50-96h for post larvae, juveniles and adults of M. amazonicum were of 1.49, 2.36 and 2.34 mg.L-1 of nitrite, respectively. Safe levels for the production were of 0.1 mg.L-1 to post larvae and 0.2 mg.L-1 of nitrite to juvenile and adults. When we evaluated the alterations in gills of juveniles of M. amazonicum submitted to different concentrations of total ammonia and nitrite (Chapter 3), it was observed that damage to gills in treatments with 100% mortality, corresponded to the high occurrence of progressive, regressive, circulatory, and inflammation damages. The other treatments had mainly inflammation and regressive damages, whose occurrence increased according to the increase in concentration. The histological analysis confirmed that the higher the total ammonia and nitrite concentrations, the larger the damages caused to the gill structure. In the evaluation of the osmotic process (Chapter 4), when comparing the life stages for each concentration of total ammonia, it was observed that the Activity of carbonic anhydrase (CAA) was lower for post larvae and higher for juveniles exposed to total ammonia, differing statistically (p<0.05) between them. For nitrite, the adult stage presented higher activity in the concentration of 8 mg.L-1, differing (p<0.05) from post larvae and juveniles. In the other concentrations, similar activity values were observed among the life stages (p>0.05). Comparing the concentrations of the compounds in each life stage, it is observed that adult prawns presented higher CAA when exposed to 5 mg.L- 1 of total ammonia, differing statistically (p<0.05) from CAA in 20 and 40 mg.L-1 of total ammonia, which presented the lowest values. When submitted to nitrite, adult prawn presented higher AAC at the concentration of 8 mg.L-1 and lower at the concentration of 16 mg.L-1, differing (p<0.05) from each other. In the other stages the AAC was similar (p>0.05) among all concentrations, to both total ammonia and nitrite. Evaluating the hemolymph osmolality, we observed that in the concentrations of 0 and 5 mg.L-1 of total ammonia, post larvae had the highest values. To nitrite, post larvae present the lowest values of osmolality, differing statistically from the other stages (p<0.05). Comparing the concentrations of the compounds at each life stage, it is observed that the highest values for post larvae and juveniles are observed in the concentrations of 5 and 10 mg.L-1 of total ammonia, which presented statistical difference (p<0.05) in relation to the lower concentrations, observed in the concentrations of 40 and 0 mg.L-1 of total ammonia, respectively. To nitrite, was observed difference (p<0.05) in the post larval stage, which has a higher osmolality value in 0 mg.L-1 and the lowest at 2 mg.L-1 nitrite. Therefore, post larvae of M. amazonicum have a lower capacity to maintain their CAA when submitted to an increase in total ammonia concentration. Pos larvae also has a lower ability to maintain the osmotic concentration in the hemolymph when submitted to an increase in nitrite concentration. Keywords: Freshwater prawn, Nitrogen compounds, Toxicology, Gill alteration, Enzymatic activity

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:30Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-01-15Bitstream added on 2014-06-13T20:40:29Z : No. of bitstreams: 1 makino_lc_dr_jabo.pdf: 1684591 bytes, checksum: c96f97cc47fc21cfbeedc2d7d920bac2 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O presente trabalho teve por objetivo descrever o aparelho digestório sob os pontos de vista estrutural, ultraestrutural e histoquímico de uma espécie de peixe de água doce: o curimba (Prochilodus lineatus) (Characidae, Prochilodontidae). Adicionalmente foi realizado um estudo da diversidade da microbiota intestinal do Prochilodus lineatus e do cascudo cinza (Pterygoplichthys anisitsi). Para os estudos morfológicos de anatomia, histologia, histoquímica e de microscopia eletrônica de varredura, foram utilizados 40 curimbas adultos. Para os estudos microbiológicos, além dos curimbas, foram coletados também exemplares adultos de cascudo cinza, no qual além dos métodos de cultura e análise tradicionais, que incluíram cultivos em meios aeróbios e anaeróbios facultativos, contagem de colônias e estudo da morfologia das mesmas pelo método de Gram, também englobou técnicas de observação da microbiota em microscopia eletrônica de varredura. Os dados numéricos obtidos tanto nos trabalhos morfológicos descritivos quanto nos microbiológicos foram submetidos à análise estatística pelo programa SAS versão 9.0. O trato digestório do curimba foi dividido em intestino cefálico, intestino anterior, intestino médio e intestino posterior, os quais foram constituídos histologicamente pelas camadas mucosa, submucosa, muscular e serosa. Células caliciformes foram observadas em toda a extensão do tubo intestinal. Ao longo do tubo digestivo detectou-se a presença de mucinas neutras, ácidas ou ambas. A vesícula biliar mostrou-se como um órgão sacular alongado, oco, de fundo cego e com paredes delgadas. O fígado apresentou-se trilobado e de consistência maciça, com coloração vermelho-acastanhado, com os hepatócitos organizados em placas duplas circundadas por sinusóides. Na contagem de bactérias intestinais totais foram encontrados valores que variaram... / The aim of this study was to describe the digestive tract of species of neotropical freshwater fish, the curimba (Prochilodus lineatus) (Characidae, Prochilodontidae) under the structural, ultrastructural and histochemical aspects. Additionally a research was made about the diversity of the intestinal microflora of Prochilodus lineatus and the gray armored catfish (Pterygoplichthys anisitsi). For morphological studies, which were subdivided into gross anatomy, histology, and histochemistry and also in scanning electron microscopy were used 40 fish. For microbiological researches, were used adult specimens of the gray armored catfish, where besides of traditional methods of culture and analysis that included culture in aerobic and facultative anaerobic conditions, counting of colonies and the study of colonies morphology by Gram and also to observation of gut microbiota by scanning electron microscopy were sampled 20 fish of each species, totaling 40 animals. The numerical data obtained in the descriptive morphological researches and in the microbiological studies were analyzed by statistical software SAS, version 9.0. The digestive tract of curimba was divided into cephalic gut, foregut, midgut and hindgut, which were made histologically by the following layers: mucosal, submucosal, muscular and serosa. Goblet cells were observed throughout the length of the intestinal tube. Neutral mucins and acid or both were detected along the digestive tract. The gallbladder was an elongated saccular body, hollow, blind background and with thin walls. The liver was trilobed and compacted red-brown mass, with hepatocytes arranged in double plates surrounded by sinusoids. The count of the total intestinal bacteria showed values that ranged between 103 e 104 cfu.mL-1 (colonyforming units). The morphotypes of gram positive microorganisms found most frequently were coccoid-shaped and rod-shaped bacteria... (Complete abstract click electronic access below)

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, 2008. / Submitted by Larissa Ferreira dos Angelos (ferreirangelos@gmail.com) on 2009-09-24T19:34:55Z No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-12-22T19:24:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-12-22T19:24:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_PedroPodistaUAquino.pdf: 1397318 bytes, checksum: d2f889b196470e404ab4b9070c65d413 (MD5) Previous issue date: 2008 / Os padrões de distribuição das comunidades biológicas aquáticas ao longo dos riachos são influenciados por diversas variáveis ambientais que operam em escalas espaciais e temporais. Buscando quantificar a contribuição dos gradientes ambientais, espaciais e temporais na estruturação da taxocenose íctica em regiões de cabeceira, o presente estudo amostrou córregos das sub-bacias do Bananal e Santa Maria/Torto na região hidrográfica do Alto Rio Paraná. Os pontos amostrados encontram-se em uma Unidade de Conservação de Proteção Integral no Distrito Federal (Parque Nacional de Brasília). Seus cursos d’água apresentam bom estado de preservação, evidenciados na integridade de suas características ambientais naturais e na manutenção dos componentes biológicos nativos. Foram coletadas 28 espécies, sendo 12 novas para a ciência. Astyanax sp. e Hyphessobrycon balbus foram as espécies com maior distribuição na área de estudo e Knodus moenkhausii apresentou a maior abundância (64,5% dos indivíduos). Trechos mais largos e com coberturas vegetais menos densas apresentaram maior número de indivíduos e espécies. Ao longo do curso d’água com o aumento do volume e complexidade dos hábitats maior foi a diversidade de peixes encontrada. Repartindo as variações para explicar a composição da taxocenose íctica, entre os gradientes (espacial, ambiental e temporal) e suas interações, foi possível observar forte influência da matriz de dados espaciais contribuindo com 67,4%. A altitude foi a variável espacial que melhor explicou a distribuição das espécies. A matriz dos dados ambientais explicou 38,9% da distribuição dos dados biológicos, sendo o componente ambiental estruturado espacialmente responsável por 31,5% dessa variação. Apesar de pronunciada sazonalidade das chuvas na região, não foi observada variação temporal na estruturação da taxocenose íctica para os córregos de cabeceira das sub-bacias estudadas. Características hidrogeológicas específicas da bacia agem localmente sobre processos de colonização, dispersão e extinção. O pequeno porte e a baixa mobilidade dos peixes isolam populações favorecendo processos de especiação. Os dados do presente trabalho mostram-se bastante valiosos como referência para a região e, assim, podem ser usados na implementação de políticas públicas com apelo a conservação de nascentes e pequenos mananciais. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Aquatic communities distribution patterns are influenced in streams by several environmental variables which operate in spatial and temporal scales. In this study, we sampled streams in the Bananal and Santa Maria/Torto sub-basins at Upper Paraná River. The aim of this study was to quantify the contribution of environmental, spatial and temporal gradients on fish assemblage structure at preserved headwaters. The sampled areas are placed at Brasília National Park (an Integral Protection Conservation Unit) in Federal District, central Brazil. Rivers and streams in this region are well preserved as view for the integrity of natural nvironmental of this area and the maintenance of native biological components. Twenty eight species of fish were collected which 12 are new to science. Astyanax sp. and Hyphessobrycon balbus showed larger distribution in the study area and Knodus moenkhausii was the most abundant (64.5% of individuals). Larger stretches with fewer canopy cover had a greater number of individuals and species. The highest diversity of fish was found along the streams with the increase of habitats volume and complexity. By partitioning the variation to explain the composition of fish assemblage among gradients (spatial, temporal and environmental) and their interactions, it was possible to verify a strong influence of the spatial data matrix, which contributed with 67.4%. Altitude was the main spatial variable for explaining the distribution of fish species. The environmental data matrix explained 38.9% of the biological data distribution, and the spatially structured environmental component was responsible for 31.5% of this distribution. Despite the pronounced rainfall seasonality in the region, temporal variation was not observed in the fish assemblage structure for headwater streams of these sub-basins. Specific hydro- geological characteristics of the basin act locally on colonization, dispersion and extinction processes. The small size and low mobility of isolate populations fishes are characteristics that work in favor of speciation processes. This study results are quite valuable as a reference for the Cerrado region, so as to further implementation of public policies that aim at conserving headwaters and small streams.

Submitted by Johnsson Rodrigo (r.johnsson@gmail.com) on 2013-09-06T11:34:26Z No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Approved for entry into archive by Alda Lima da Silva(sivalda@ufba.br) on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT) No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-12T17:14:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAFAEL_BURGER_DEFINITIVA.pdf: 15044237 bytes, checksum: 0f362f496b96376d871854e6176031d8 (MD5) / CNPq, FAPESB / A Bacia do Recôncavo Sul está localizada entre os rios Paraguaçu e de Contas, em área quase inteiramente contida na região Baixo Sul do Estado da Bahia. As principais drenagens desta bacia são Jaguaripe, Jequiriçá, Una e das Almas. A Bacia do Recôncavo Sul está inserida no bioma Mata Atlântica, ambiente caracterizado pelo seu alto grau de endemismo, alta diversidade biológica, elevados índices de ocupação humana e degradação ambiental. Análises da literatura e de coleções ictiológicas nacionais revelam que a ictiofauna de água doce da região é quase completamente desconhecida. O presente trabalho teve como objetivos realizar estudo taxonômico das espécies de peixes de água doce das drenagens da Bacia do Recôncavo Sul e examinar em maior detalhe as espécies do gênero Characidium encontradas. Foram realizadas cinco expedições de campo e o material coletado foi identificado até o menor nível taxonômico possível. Um total de 41 espécies de peixes foi registrado, pertencentes a 28 gêneros, 12 famílias e seis ordens (18 Characiformes, 13 Siluriformes, cinco Perciformes, duas Cyprinodontiformes, duas Gymnotiformes e uma Synbranchiformes). Foram encontradas quatro espécies reconhecidamente novas, além de nove possivelmente novas, três espécies consideradas, até o momento, como endêmicas da área de estudo, quatro exóticas e uma ameaçada de extinção. São apresentados comentários sobre problemas taxonômicos e distribuição de alguns táxons e uma chave de identificação para as espécies amostradas na área de estudo foi elaborada. A drenagem do rio das Almas é sugerida como de grandeimportância para conservação. Neste trabalho, duas espécies novas são descritas, ambas pertencentes ao gênero Characidium. / Salvador