A doen¸ca de Alzheimer ´e a mais comum das patologias neurodegenerativas afetando principalmente pessoas idosas e causando consider´avel impacto econˆomico em todos os pa´ıses. Atualmente n˜ao h´a cura para cessar seus efeitos na mem´oria fazendo do diagn´ostico precoce fundamental para eventuais interven¸c˜oes terapˆeuticas. Para tal, t´ecnicas de reconhecimento de padr˜oes podem ser utilizadas para diferenciar indiv´ıduos com o mal Alzheimer de indiv´ıduos saud´aveis. No entanto, aumentando o n´umero de diagn´osticos (classes) que definem est´agios intermedi ´arios da doen¸ca a capacidade de diferenciar classes de tais t´ecnicas ´e comprometida. Isto ocorre devido ao fato de que as medidas biol´ogicas, ou os biomarcadores, n˜ao s˜ao discriminantes o suficiente para lidar com classes al´em do caso extremo, de forma bin´aria, Alzheimer versus controle normal. Outro fator que dificulta o diagn´ostico ´e a distribui¸c˜ao de probabilidade das classes intermedi´arias serem altamente sobrepostas e com probabilidade a priori representando 60% dos dados. Neste trabalho vamos demonstrar a capacidade de melhorar a precis ˜ao do diagn´ostico utilizando classificadores e t´ecnicas de amostragem baseados em fun¸c˜oes de distˆancia. Abordagens bin´arias ou abordagens bin´arias adaptadas a problemas multiclasse s˜ao a regra na literatura de diferencia¸c˜ao das classes da doen¸ca de Alzheimer No presente momento existe apenas um ´unico artigo demonstrando a possibilidade de melhora nas medidas de classifica¸c˜ao com um tratamento de reamostragem das probabilidades a priori das classes de Alzheimer. Diferentemente do artigo citado que trabalha com classifica¸c˜ao bin´aria, aqui vamos usar uma abordagem de classifica¸c˜ao todos-contra-todos na avalia¸c˜ao de um problema multiclasse da doen¸ca de Alzheimer. Demonstramos que a taxa de classifica¸c˜ao do nosso classificador utilizando classes balanceadas e uma fun¸c˜ao de distˆancia apropriada ´e superior a classificadores populares. Este trabalho apresenta tamb´em duas novas estrat´egias de ajuste do desequil´ıbrio tendo como medida de similaridade a distˆancia entre os padr˜oes. A de subamostragem, denominada Nearmiss 4, que obteve maior redu¸c˜ao de sobreposi¸c˜ao entre as classes nas compara¸c˜oes entre algoritmos de amostragem, e outra de sobreamostragem, denominada SMOTE-borderline 3, uma vers˜ao multiclasse para a fam´ılia de algoritmos SMOTE que se destaca por ser naturalmente multiclasse ao contr´ario das abordagens bin´arias adaptadas para multiclasse tratadas neste texto. Finalmente, s˜ao comparadas t´ecnicas de sele¸c˜ao de caracter´ısticas para avaliar o poder discriminativo entre biomarcadores do mal de Alzheimer visando encontrar o subconjunto de biomarcadores que fornece a melhor taxa de classifica¸c˜ao. Usando tal abordagem foi poss´ıvel encontrar o biomarcador com maior capacidade discriminativa em um dado conjunto de biomarcadores. / Alzheimer’s disease is the most common neurodegenerative disorder affecting mainly elderly people and causing considerable economic impact in all countries. Currently, there is no cure to cease its effects in memory making early diagnosis fundamental for any therapeutic interventions. To this end, pattern recognition techniques can be used to differentiate individuals with Alzheimer’s from healthy individuals. However, increasing the number of diagnoses (classes) which define disease’s intermediate stages (e.g. mild cognitive impairment) the classes differentiation for such techniques is compromised. This is due to the fact that biological measures, or biomarkers, are not discriminant enough to deal with classes beyond the binary extreme case, Alzheimer’s versus normal control. Another factor that makes diagnosis difficult is the probability distribution of the intermediate classes being highly overlapping and with a priori probability representing 60 % of the data. In this work, we will demonstrate the ability to improve diagnostic accuracy using classifiers and sampling techniques based on distance functions. Binary approaches or binary approaches adapted to multiclass problems are ubiquitous in the literature of differentiating the classes of Alzheimer’s disease At present, there is only one article demonstrating the possibility of improvement in the classification measures using a sampling treatment to change a priori probabilities of the Alzheimer’s classes. Differently from the cited article working with binary classification, here we will use an all-versus-all classification approach to evaluating an Alzheimer’s disease multiclass problem. Also, is shown that classification rate of our classifier using balanced classes and an appropriate distance function is able to overcome popular classifiers choices. This work also presents two new strategies of imbalance adjustment, taking as a measure of similarity the distance between the patterns. The undersampling, called Nearmiss 4, obtained the greatest reduction in class overlapping comparing the sampling algorithms discussed, and another contribution is an oversampling, called SMOTE-borderline 3, a multiclass version for the family of SMOTE algorithms that stands out for being naturally multiclass unlike the binary approaches adapted for multiclass treated in this text. Finally, feature selection techniques are compared to evaluate the discriminative power between Alzheimer’s disease biomarkers in order to find the subset of biomarkers which provides the best classification rate. Using this approach it was possible to find the biomarker with the highest discriminative capacity in a given set of biomarkers.

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Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:38Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1574_1.pdf: 7630907 bytes, checksum: 55b2338ac2fdb58a567454116b0ae7ad (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Estudos de genômica e proteômica sobre fatores de risco associados à desordens neurodegenerativas requerem urgentemente proposições de abordagens complementares para integrar a grande quantidade de dados gerados. Neste trabalho foi proposto uma metodologia que envolve ferramentas de Bioinformática, no qual estudos de microarrays de expressão foram usados como a única origem de genes candidatos, para revelar variações novas, a partir de seqüências públicas de Expressed site tags (ESTs). Foram selecionados nove genes, sete de um estudo de tecido do hipocampo área Cornu Ammonis (CA1) e dois do tecido do lóbulo parietal inferior (IPL) ambos de pacientes com Doença de Alzhiemer (DA), a maioria desses genes está envolvido com o sistema imune, escolhidos neste trabalho por fazer parte de um das linhas de pesquisa do grupo. O CLCbio Workbench Combined® versão 3.6.2. foi inicialmente usado para construção do banco de dados de ESTs e recuperação dos arquivos de RNAm respectivamente a partir do Golden path of University of California Santa Cruz (UCSC) e National Center for Biotechnology Information (NCBI), na etapa seguinte foram realizados múltiplos alinhamentos e o algoritmo usado foi o Smith-Waterman. Um total de 479 seqüências de ESTs foram selecionadas depois da aplicação de parâmetros apropriados de estringência utilizados para minimizar erros de alinhamentos. A anotação revelou várias classes de variações, a maioria delas sendo deleções (415), mas também foram observadas transições (253), transversões (52), mutações sinônimas (48), não sinônimas (400) e Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) em Untranslated Regiões (UTRs) (50). Deleções são frequentemente associadas as principais síndromes genéticas com características dismórficas. No entanto, vários recentes trabalhos mostram que microdeleções comuns podem ser associadas com desordens neuropsiquiátricas como esquizofrenia, autismo e retardo mental, detectas em várias etnias através de experimentos de sequenciamento. A validação virtual confirmou que algumas dessas variações identificadas foram previamente anotadas e confirmadas em amostras de DNA, demonstrando que esse método é uma maneira viável para detectar variações genéticas que merecem ser exploradas futuramente em estudos de associação de fatores genéticos de risco para a DA

Submitted by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-05-04T18:55:27Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Lidier Roberta Moraes Nogueira.pdf: 1939872 bytes, checksum: 467be8ad8fc1df16ddcac861b4bae1d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-04T18:55:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO Lidier Roberta Moraes Nogueira.pdf: 1939872 bytes, checksum: 467be8ad8fc1df16ddcac861b4bae1d7 (MD5) Previous issue date: 2016-09-19 / Com o aumento da expectativa de vida, um grande número de indivíduos atinge uma idade crítica para o desenvolvimento de doenças neurodegenerativas causadoras de demências. Dentre elas encontra-se em destaque a Doença de Alzheimer, que é caracterizada por um quadro clínico de declínio progressivo e irreversível de algumas funções cognitivas e intelectuais. As anormalidades histopatológicas observadas no tecido cerebral obtido através de autopsias para o diagnóstico definitivo são: emaranhado neurofibrilares e placas senis encontrados em diversas regiões. O presente estudo comparou a presença de placas senis e emaranhados neurofibrilares com a imunohistoquímica e histologia convencional em cortes histológicos de hipocampo de portadores de Doença de Alzheimer, considerando também os aspectos clínicos e epidemiológicos. Foram analisados 53 preparações histológicas de hipocampo de indivíduos portadores da Doença de Alzheimer. Destes, apenas 34 seguiram para a produção de lâminas e posterior coloração. A idade média foi de 80,03±8,83, com um percentual de 76,5% do sexo feminino e 23,5% masculino. A reação imunohistoquímica com a proteína TAU mostrou uma maior capacidade de visualização das placas e emaranhados no hipocampo (p-valor <0,05) quando comparada com a coloração pelo método de prata e hematoxilina-eosina e a área CA1 do hipocampo foi a mais comprometida em diferentes faixas de idade. Sendo assim, este estudo mostra que a imunohistoquímica é mais sensível na identificação de placas senis e de emaranhados neurofibrilares. Sugerindo que a histologia convencional pode subestimar o diagnóstico de Doença de Alzheimer. / With increasing life expectancy of a large number of individuals can reach a critical age for the development of neurodegenerative diseases causing dementia such as Alzheimer's disease, which is characterized by a clinical picture of progressive and irreversible decline of some cognitive and intellectual functions. The histopathological abnormalities in brain tissue obtained at autopsy for definitive diagnosis are neurofibrillary tangle, and senile plaques found in various brain regions. To that end, this compared the presence of senile plaques and neurofibrillary tangles in tissue sections of hippocampi of Alzheimer's Disease patients with immunohistochemistry and conventional histology, evaluating clinical and epidemiological aspects. 53 patients were analyzed hippocampus blocks of Alzheimer's disease. Of these, only 34 followed for the production of plates and subsequent staining. The mean age was 80.03 (± 8.83), with a percentage of 76.5% female and 23.5% male. The immunohistochemical reaction with protein tau showed a greater ability in expression and visualization of plaques and tangles in the hippocampus (p <0.05) compared with silver staining method, and hematoxylin-eosin and CA1 area of the hippocampus was the most affected in different age groups. Thus, this study shows that immunohistochemistry is more sensitive in the identification of senile plaques and neurofibrillary tangles. Suggesting that conventional histology may underestimate the diagnosis of Alzheimer's disease.

Made available in DSpace on 2018-08-01T21:35:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_12342_Tese - Daniela Camporez.pdf: 1833396 bytes, checksum: 82e9b25850d00808ee295c7a2313f773 (MD5) Previous issue date: 2018-06-06 / A doença de Alzheimer (DA), é o tipo mais comum de demência relacionada a idade. É uma doença neurodegenerativa crônica, grave, progressiva, associada à perda de memória e cognição, que pode levar à morte. O maior fator de risco para o desenvolvimento da doença é a idade avançada, com uma complexa interação de fatores ambientais e genéticos que juntos podem aumentar a incidência da doença. Ainda que sua causa seja desconhecida, os fatores genéticos e o estresse oxidativo desempenham um papel importante na patogênese da DA. Neste estudo de associação nós investigamos se polimorfismos nos genes APOE (rs429358 e rs7412), FOXO3 (rs2802292), MTHFD1L (rs11754661), SERPINA3 (rs4934), SIRT1 (rs2273773) e SOD2 (rs4880) e fatores ambientais como: nível educacional, etnia e gênero estão associados com risco para a DA em uma amostra de 332 indivíduos idosos do sudeste brasileiro (109 pacientes com diagnóstico provável de DA e 223 controles - idosos saudáveis pareados por idade e gênero). Os polimorfismos genéticos foram analisados por meio da reação em cadeia da polimerase em tempo real (PCR-RT). Na nossa amostra o polimorfismo do gene APOE mostrou estar altamente associado com a doença, tendo os genótipos &#400;4&#400;4 e &#400;3&#400;3 demonstrado serem fator de risco e proteção, respectivamente. O genótipo GG do gene MTHFD1L mostrou estar associado com o aumento do risco de desenvolver a doença de Alzheimer. Já o genótipo GG e AG do gene SERPINA3 demonstraram ser fatores de proteção e risco, respectivamente. O genótipo TT e CT do gene SIRT1 também mostraram correlação com a doença. O nível educacional mostrou estar associado positivamente para os indivíduos do grupo controle que tiveram uma educação formal por mais de quatro anos. Os polimorfismos FOXO3 e SOD2 não demonstraram estar associados com a amostra e a doença em questão. Nossos resultados corroboram outras pesquisas, que demonstram que a etiologia da DA pode estar envolvida com alterações na via do folato, com o aumento do estresse oxidativo nas células do sistema nervoso central, além de apoiar a participação de proteínas formadoras das placas beta-amiloides na patologia da DA. Esses resultados podem ser úteis na busca de biomarcadores genéticos precoces capazes de identificar os sintomas do surgimento da demência, e fornecer novos dados para terapias no futuro, ajudando no entendimento deste distúrbio. Além disso, reforçam a hipótese de que diversos genes estão envolvidos na etiologia da DA, uma condição caracterizada também por instabilidade genômica e estresse oxidativo elevados, que podem contribuir significativamente para a degeneração neurológica observada nos pacientes.

Made available in DSpace on 2014-06-12T22:59:57Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2828_1.pdf: 948835 bytes, checksum: 21c53739f64b0fd210d9f8c0314d6bfd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A doença de Alzheimer é uma doença crônica degenerativa, considerada como a forma mais comum de demência na senilidade. Sua histopatologia é bem definida, com marcas características que incluem a presença de placas senis, novelos neurofibrilares, perda neuronal e gliose reativa em regiões específicas do cérebro, como o hipocampo. A gliose é um evento que ocorre no sistema nervoso central em conseqüência a qualquer dano tecidual, e pode ser definida como um crescimento anormal, por hiperplasia e/ou hipertrofia, de astrócitos, microglia, e, talvez numa extensão qualitativamente diferente, oligodendrócitos. Para um melhor entendimento do mecanismo da gliose reativa, realizou-se uma análise imuno-histoquímica no hipocampo, utilizando o marcador de proliferação celular Ki-67, e investigou-se a quantidade proporcional de neurônios e células gliais na mesma área em 16 necropsias de pacientes com a doença de Alzheimer e 5 controles sem demência. Não foi encontrada nenhuma célula Ki-67-positiva no hipocampo do cérebro com doença de Alzheimer. Um decréscimo no número de neurônios e oligodendrócitos e um aumento no número de astrócitos e microglia foram observados no hipocampo com a doença, em comparação com o grupo controle. Os resultados desse estudo sugerem que a gliose reativa que acontece na doença de Alzheimer não ocorre através de hiperplasia, mas de hipertrofia de astrócitos e microglia ou pela migração dessas células para a área de neurodegeneração, como uma resposta compensatória à morte neuronal

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:14:05Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo8493_1.pdf: 1122742 bytes, checksum: cc58935162d9381eb51a7b976ea34b46 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Introdução: Com o envelhecimento populacional cresce o número de problemas de saúde relacionados à pessoa idosa, com o aumento das doenças crônicas não transmissíveis, como as demências. A doença de Alzheimer é responsável por 55% de todos os casos de demência. É uma doença neurodegenerativa primária, de natureza crônica e progressiva e que compromete as funções cognitivas, principalmente a memória, produzindo um declínio no funcionamento intelectual do doente e interferindo em suas atividades de vida diária como: higienizar-se, vestir-se, alimentar-se e realizar atividades fisiológicas adequadamente, acarretando uma dependência direta de cuidadores. O cuidador é uma pessoa, da família ou não, que tem o papel de prestar cuidados à pessoa que apresenta dependência. Justificativa: A condição vivida pelo cuidador gera muitas situações de sobrecarga, que é a somatização do estresse emocional e físico, pois ele tem que executar diversas atividades como cuidar do doente, resolver os problemas relacionados ao tratamento, administrar problemas financeiros e legais, organizar e executar atividades diárias que o doente, às vezes, já não mais executa como dar banho, vestir, alimentar, administrar medicamentos e, além disto, lidar com comportamentos alterados do doente. Isto pode trazer ao cuidador comprometimento físico e da saúde mental, representando agravos para a saúde, problemas sociais e econômicos. Além disto, estes comportamentos gerados pela situação vivida pelo cuidador podem interferir na sua conduta frente à farmacoterapêutica do portador de Alzheimer e prejudicar a adesão a terapêutica e, consequentemente, a qualidade de vida do paciente. Objetivos: Conhecer o nível de sobrecarga (estresse) e sintomas psiquiátricos (ansiedade, depressão e somatização) presentes nos cuidadores, e verificar até que ponto a presença destes sintomas pode afetar a farmacoterapêutica do doente de Alzheimer. Métodos e técnicas: Trata-se de um estudo quantitativo. Estudo de caso do tipo transversal, descritivo observacional. Foi utilizado como instrumentos de avaliação questionários semi-estruturados e estruturados. A avaliação da presença de sintomas psiquiátricos nos cuidadores foi feita através do Self Report Questionare-20 (SRQ-20); A avaliação da presença de sobrecarga (estresse) nos cuidadores foi realizada através do Zarit Burden Interview e a avaliação da adesão ao tratamento foi feita pelo método indireto, através do teste de Morisky Medication Adherence Scale adaptado. O estudo foi realizado na cidade de Caruaru- Pernambuco, com 30 cuidadores primários, de ambos os sexos, dos pacientes cadastrados na Farmácia de Pernambuco Unidade Agreste, para recebimento dos medicamentos para tratamento da doença de Alzheimer padronizados no Componente Especializado da Assistência Farmacêutica. Foi utilizada técnica de amostragem. Resultados: Da amostra, 83,3% dos cuidadores eram do sexo feminino e 16,7% eram do sexo masculino; 83,3% dos cuidadores apresentaram algum grau de sobrecarga, destes 36,7% apresentaram sobrecarga moderada a severa; 86,7% dos cuidadores acham que não tem tempo para cuidar de si em virtude da atividade de cuidar do doente, 56,7% acham que estão frequentemente ou sempre sobrecarregados; 53,3% dos cuidadores apresentam sofrimento mental (depressão) e 93,3% destes cuidadores não recebem nenhum apoio psicológico e social. Em relação a adesão medicamentosa dos doentes de Alzheimer, 56,7% dos doentes apresentam baixa adesão à terapêutica. Conclusões: O presente estudo permitiu perceber forte presença de sintomas psiquiátricos nos cuidadores, como também elevados níveis de sobrecarga. Foi percebido que para uma adequada assistência à saúde, o cuidado deve ser integral, com o foco não apenas no paciente e muitos menos o fornecimento de medicamentos para tratar a patologia, deve ser observado todo contexto social em que o paciente está inserido. Medidas de ordem preventivas, com apoio social e emocional poderiam contribuir para a diminuição da sobrecarga e dos sintomas psiquiátricos nos cuidadores

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