Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-24. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:24Z : No. of bitstreams: 1 000840898.pdf: 3064925 bytes, checksum: 0f2210df4ef49e4de9b0eea0e8b112eb (MD5) / As infecções por MRSA podem ser consideradas um problema de saúde pública, com alta taxa de mortalidade. Desta maneira, com a ampla disseminação do MRSA é necessário adotar programas de vigilância que avaliem o perfil de sensibilidade dos isolados, além estimular o desenvolvimento tecnológico objetivando métodos mais rápidos e confiáveis que antecipem a escolha da terapêutica mais adequada propondo métodos de prevenção e vacinas para o avanço no controle da infecção hospitalar. Diante deste desafio este projeto tem como objetivo a caracterização de anticorpos monoclonais anti-MRSA obtidos por protocolos de imunização clássica e a obtenção de outros anticorpos com método de imunização subtrativa. Foram utilizados 10 camundongos Balb/C que receberam como tolerógeno proteínas de cepas de E.coli e MSSA associados a 100mg/kg/d de ciclofosfamida (CFM) em D1, D2,D3,D15, D16 e D17. Em D+31, 38, 45 e 54 foram feitas injeções de 50μg de proteínas da cepa de MRSA, anteriormente genotipada e confirmada a presença do gene mec A. Foram preparados extratos antigênicos por 3 métodos diferentes: fervura, morte à temperatura ambiente seguida de filtração 0,22μm e morte à temperatura ambiente e exposição ao banho ultrassônico. Pelo método de fervura obteve-se em média 5,31mg/mL enquanto que as técnica de morte a TA ambiente, filtrado ou submetido ao banho ultrassônico obtiveram em média uma concentração protéica duas vezes maior indicando a existência de proteínas termolábeis. Foi identificado uma taxa de mortalidade de 30% nos animais provavelmente associado ao uso da CFM. Foram realizadas 7 fusões celulares com a construção de 4.402 híbridos com uma taxa de eficiência de fusão de 2,42 vezes menor do que aquela obtida nos protocolos de imunização clássica. Dois hibridomas foram escolhidos para a clonagem pelo método de diluição limitante, cuja caracterização imunoquímica identifica... / The MRSA infections are considered a public health problem, with a high mortality rate. Thus, with the wide spread of MRSA it's necessary to embrace monitoring programs to evaluate the sensitivity profile of the isolates, as well as to stimulate technological development aiming faster and more reliable methods to anticipate the choice of the most appropriate therapy by proposing methods of prevention and vaccines to advance the control of hospital infections. Therefore, this study aims the characterization of anti-MRSA monoclonal antibodies obtained by classical immunization protocols and the obtaining of other antibodies with the subtractive immunization method. We used 10 Balb/C mice that received as tolerogen proteins of strains of E. coli and MSSA associated with 100mg/kg/d of cyclophosphamide (Cy) in D1, D2, D3, D 15, D16 and D17. On D+31, 38, 45 and 54 we made injections of 50 μg of the MRSA strain protein, previously genotyped and with confirmed presence of mec A. We prepared antigenic extracts by 3 different methods: boiling, death at ambient temperature followed by 0.22 μm filtration and death at ambient temperature and exposure to ultrasonic wash.The boiling method resulted on average 5.31mg/mL, whereas the technique of death at ambient temperature, filtered or exposed to ultrasonic wash culminated on average in a protein concentration two times higher, indicating the existence of heat labile proteins.We identified a mortality rate of 30% in the animals, which was probably associated with the use of Cy. We performed seven cellular fusions with the construction of 4.402 hybrids with a fusion efficiency rate of 2.42 times smaller than that obtained in protocols of classical immunization.We selected two hybridomas for cloning by the limiting dilution method, whose immunochemical characterization identifies bands of 30 and 50 kDa. The proteomic analysis of protein bands that was recognized by the two clones confirm that the ...

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:48:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3366.pdf: 568124 bytes, checksum: 9e26d00b61225a17b549727899debd6a (MD5) Previous issue date: 2010-11-26 / Tuberculosis (TB) remains a major challenge to the health sector, both by the high incidence of the disease and the emergence of resistant strains, making it a priority on the global agenda of Health. The aim of this study was to characterize the epidemiological profile of TB cases resistant at the Hospital Estadual Nestor Goulart Reis in Américo Brasiliense - SP. This is a retrospective, exploratory and descriptive study, which analyzed 55 adult patients of both sexes, with positive culture results for Mycobacterium tuberculosis that presented any antibiotic drug resistance and who were tested at the hospital between January 2005 to December 2008, comprising 10.9% of inpatients. All of them had pulmonary tuberculosis disease, 70.9% were men, at admission 69.1% were unemployed and 81.8% had one hospitalization. Among the associated comorbidities, alcoholism emerged with 43.6% and AIDS with 10.2%, over 70% were referred from primary care and specialty clinic; 32.7% were resistant to at least one drug and 54.5% TB were multiple drugs resistant. The treatment most used was the Scheme 1 in 31% of patients and Scheme 1R in 18,2%. It was observed fragility in the adequacy of the therapeutic scheme with the sensibility test, beyond the average time of 65 days to its return. Regarding the closure of cases, 23.6% were successfully cured and 12.7% died. It is concluded that the situation of TB drug-resistant in the study area deserves special attention considering that the cure rates are lower than recommended levels. It is suggested that the process of local work must be reassessed, particularly the flow of biological material, as well as a guarantee that such results subsidize the institution of drug therapy. / A Tuberculose (TB) continua sendo um grande desafio ao setor da saúde, tanto pela alta incidência da doença quanto pelo surgimento de cepas resistentes, o que a torna prioritária na agenda mundial da Saúde. O objetivo deste trabalho é caracterizar o perfil epidemiológico dos casos de TB resistente do Hospital Estadual Nestor Goulart Reis, de Américo Brasiliense SP. Trata-se de um estudo retrospectivo, exploratório e descritivo, onde foram analisados 55 pacientes adultos, de ambos os sexos, com resultados de cultura positiva para Mycobacterium tuberculosis, que apresentaram antibiograma com alguma resistência aos tuberculostáticos testados e que estiveram no hospital no período de janeiro de 2005 a dezembro de 2008, perfazendo 10,9% do total de internados. Todos apresentaram a forma pulmonar da doença, 70,9% eram homens e, no momento da internação, 69,1% estavam desempregados e 81,8% tiveram uma única internação. Dentre as comorbidades associadas destacou-se o alcoolismo, com 43,6% e a aids, com 10,2%; mais de 70% dos pacientes foram encaminhados da atenção básica e ambulatório de especialidades; 32,7% eram resistentes a ao menos uma droga e 54,5% eram TB multidrogarresistente. O tratamento mais utilizado foi o antigo esquema I em 31% dos pacientes e o esquema IR em 18,2%. Observou-se fragilidade na adequação do esquema terapêutico com o teste de sensibilidade, além de tempo médio de 65 dias para o retorno destes. Quanto ao encerramento dos casos, 23,6% evoluíram para cura e 12,7% foram a óbito. Conclui-se que a situação da TB resistente no local de estudo merece especial atenção tendo em vista que as taxas de cura estão abaixo do preconizado. Sugere-se que o processo de trabalho do local seja reavaliado, particularmente o fluxo do material biológico, bem como a garantia de que tais resultados subsidiem a instituição da terapêutica medicamentosa.

Made available in DSpace on 2016-07-01T13:10:27Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-13. Added 1 bitstream(s) on 2016-07-01T13:13:45Z : No. of bitstreams: 1 000866002.pdf: 1774918 bytes, checksum: 7a85fafd4477aa0f0f75ad8c323e976f (MD5) / Os tumores mamários constituem a neoplasia mais comum das cadelas, sendo que mais da metade são consideradas malignas e com muitos animais apresentando morte associada à doença. Estes tumores geralmente são tratados cirurgicamente por meio de mastectomia, porém os resultados frequentemente não são satisfatórios. Visto que novas abordagens terapêuticas são necessárias nos tumores mamários caninos, especialmente no que diz respeito ao tratamento adjuvante e à terapia alvo, o conhecimento acerca de possíveis componentes relacionados com a resistência à fármacos e que funcionem como possíveis alvos moleculares para a terapia deve ser garantido. Em vista disso, o objetivo da pesquisa descrita nesta tese foi caracterizar o papel da família de receptores do fator de crescimento epidermal (EGFR) e da superfamília de transportadores ligadores de ATP (ABC) nos tumores mamários caninos como biomarcadores do câncer e sua relação com o desfecho da doença para caracterizar sua patobiologia. Neste estudo, os receptores tirosina cinase EGFR/HER1, HER2, HER3 e HER4, assim como as proteínas da família ABC glicoproteína-P/MDR1, MRP1 e MRP2 foram avaliadas por meio de imunoistoquímica, sendo os resultados relacionados com características clinicopatológicas em 43 tumores. A expressão simultânea de todos os membros da família e a coexpressão de EGFR/HER1, HER2 e HER4 se mostraram associadas com um desfecho desfavorável para a doença. A expressão de glicoproteína-P e MRP1 se apresentaram relacionadas com características clinicopatológicas nos tumores estudados, ao passo que a expressão de MRP1 foi caracterizada como um indicador prognóstico independente nestes tumores. Em síntese, esta tese fornece novas informações acerca da expressão da família EGFR nos tumores mamários caninos e associa os transportadores ABC com um desfecho desfavorável para a doença, consequentemente sugerindo que eles também podem estar... / Mammary tumors comprise the most common neoplasms in female dogs with more than half with malignat characteristics. Such tumors are usually treated using surgical mastecty, but results are frequently not satisfying. Since new therapeutical approaches are needed in canine mammary tumors, especially regarding adjuvant therapy and targeted therapy, an understanding regarding possible cellular components related to drug resistance and that work as possible targets for therapy is straightforward to achieve. Accordingly, the aim of the research described in this thesis was to study the possible role of epidermal growth factor receptor family (EGFR) and ATP-binding cassete (ABC) superfamily members in canine mammary tumors as cancer biomarkers and its relation with disease outcome in order to better characterize their pathobiology looking forward the future improve in canine mammary cancer treatment. In this study, tyrosine kinase receptors EGFR/HER1, HER2, HER3, and HER4, as well ABC transporters P-glycoprotein/MDR1, MRP1, and MRP2 were immunohistochemically evaluated and results were related with clinicopathologic characteristics and overall survival in 43 tumors. Expression of all family members and simultaneous expression of EGFR/HER1, HER2, and HER4 were related with a poor disease outcome. P-glycoprotein and MRP1 expression showed to be related with clinicopathologic features and MRP1 was characterized as a independent prognostic indicator in such tumors. In summary, this thesis provides new information about EGFR family expression in canine mammary tumors and associates ABC transporters with a poor disease outcome, consequently suggesting that they may also be related to prognosis in patients with mammary cancer

Orientador: Noeme Souza Rocha / Orientador: Maria de Fátima Gartner / Coorientador: Rafael Malagoli Rocha / Coorientador: Deilson Elgui de Oliveira / Banca: Marcela Marcondes Pinto Rodrigues / Banca: Paulo Ricardo de Oliveira Bersano / Banca: Enio Ferreira / Banca: Gabriel D. Carvalho / Resumo: Os tumores mamários constituem a neoplasia mais comum das cadelas, sendo que mais da metade são consideradas malignas e com muitos animais apresentando morte associada à doença. Estes tumores geralmente são tratados cirurgicamente por meio de mastectomia, porém os resultados frequentemente não são satisfatórios. Visto que novas abordagens terapêuticas são necessárias nos tumores mamários caninos, especialmente no que diz respeito ao tratamento adjuvante e à terapia alvo, o conhecimento acerca de possíveis componentes relacionados com a resistência à fármacos e que funcionem como possíveis alvos moleculares para a terapia deve ser garantido. Em vista disso, o objetivo da pesquisa descrita nesta tese foi caracterizar o papel da família de receptores do fator de crescimento epidermal (EGFR) e da superfamília de transportadores ligadores de ATP (ABC) nos tumores mamários caninos como biomarcadores do câncer e sua relação com o desfecho da doença para caracterizar sua patobiologia. Neste estudo, os receptores tirosina cinase EGFR/HER1, HER2, HER3 e HER4, assim como as proteínas da família ABC glicoproteína-P/MDR1, MRP1 e MRP2 foram avaliadas por meio de imunoistoquímica, sendo os resultados relacionados com características clinicopatológicas em 43 tumores. A expressão simultânea de todos os membros da família e a coexpressão de EGFR/HER1, HER2 e HER4 se mostraram associadas com um desfecho desfavorável para a doença. A expressão de glicoproteína-P e MRP1 se apresentaram relacionadas com características clinicopatológicas nos tumores estudados, ao passo que a expressão de MRP1 foi caracterizada como um indicador prognóstico independente nestes tumores. Em síntese, esta tese fornece novas informações acerca da expressão da família EGFR nos tumores mamários caninos e associa os transportadores ABC com um desfecho desfavorável para a doença, consequentemente sugerindo que eles também podem estar... / Abstract: Mammary tumors comprise the most common neoplasms in female dogs with more than half with malignat characteristics. Such tumors are usually treated using surgical mastecty, but results are frequently not satisfying. Since new therapeutical approaches are needed in canine mammary tumors, especially regarding adjuvant therapy and targeted therapy, an understanding regarding possible cellular components related to drug resistance and that work as possible targets for therapy is straightforward to achieve. Accordingly, the aim of the research described in this thesis was to study the possible role of epidermal growth factor receptor family (EGFR) and ATP-binding cassete (ABC) superfamily members in canine mammary tumors as cancer biomarkers and its relation with disease outcome in order to better characterize their pathobiology looking forward the future improve in canine mammary cancer treatment. In this study, tyrosine kinase receptors EGFR/HER1, HER2, HER3, and HER4, as well ABC transporters P-glycoprotein/MDR1, MRP1, and MRP2 were immunohistochemically evaluated and results were related with clinicopathologic characteristics and overall survival in 43 tumors. Expression of all family members and simultaneous expression of EGFR/HER1, HER2, and HER4 were related with a poor disease outcome. P-glycoprotein and MRP1 expression showed to be related with clinicopathologic features and MRP1 was characterized as a independent prognostic indicator in such tumors. In summary, this thesis provides new information about EGFR family expression in canine mammary tumors and associates ABC transporters with a poor disease outcome, consequently suggesting that they may also be related to prognosis in patients with mammary cancer / Doutor

Orientador: Maria Luiza Moretti, Rogerio de Jesus Pedro / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-05T09:30:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Padoveze_MariaClara_D.pdf: 5321715 bytes, checksum: 9f035f988b4d968c0058fa69239476fb (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: Pacientes com HIV/Aids são potencialmente uma população de maior risco para aquisição de Infecções Hospitalares (IH) quando comparados a outros grupos de pacientes hospitalizados. Dados da literatura indicam que a infecção mais comum nestes pacientes é a Infecção da Corrente Sanguínea (ICS) e o principal agente etiológico é o Staphylococcus aureus. O presente estudo desenvolveu-se em duas fases. Na primeira fase foi realizada uma avaliação das IH ocorridas em pacientes HIV-positivos comparando com pacientes HIV-negativos internados na Enfermaria de Moléstias Infecciosas (MI) do Hospital das Clínicas (HC) da Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Na segunda fase foi realizada a pesquisa de colonização por S. aureus em pacientes HIV-positivos atendidos ambulatorialmente na Unidade de Pesquisa Clínica (UPC) da Disciplina de Moléstias Infecciosas da Faculdade de Ciências Médicas da UNICAMP. Foram coletadas três amostras de swab nasal em dias diferentes em pacientes sem história de internação prévia por até 2 anos antes do início do seguimento. As amostras de S. aureus obtidas da pesquisa de colonização nasal foram genotipadas utilizando-se a técnica de "Pulsed-Fiel Gel Electrophoresis" (PFGE). Potenciais fatores associados com a colonização nasal por S. aureus foram avaliados. Os resultados da Fase I revelaram que os pacientes HIV-positivos apresentaram maiores taxas de IH quando comparados com o grupo de controle. Os pacientes HIV-positivos foram submetidos a maior número de cateteres venosos centrais-dia e sondagens vesicais de demora-dia do que os pacientes HIVnegativos internados na mesma unidade. A localização topográfica mais freqüente foi a ICS e o principal agente etiológico identificado foi o S. aureus. A aquisição de S. aureus em pacientes HIV-positivos foi significantemente maior do que nos demais pacientes. Os resultados da Fase II demonstraram uma taxa de colonização nasal por S. aureus de 63,1% nos pacientes incluídos na pesquisa (70 em 111). Os padrões de colonização identificados foram: a) colonização ausente, com três amostras negativas (36%); b) colonização transitória, com apenas uma amostra positiva (25%) e c) colonização persistente, com duas ou três amostras positivas (39%). Utilizando técnica de PFGE, a colonização persistente foi subcategorizada em: c1) persistente simples, que apresenta o mesmo perfil genômico entre as amostras (24%); c2) persistente múltipla, que apresenta diferentes perfis genômicos entre as amostras (7%) e c3) persistente combinada, que apresenta duas amostras com perfil genômico idêntico e uma amostra com perfil genômico diferente (8%). O fator de risco associado com a colonização nasal por S. aureus foi a classificação clínica e laboratorial de Aids, segundo os critérios do Centers for Disease Control and Prevention (CDC). O uso de antimicrobianos no momento da coleta ou até 6 meses antes foi associado com resultados negativos para a pesquisa de S. aureus. Não foram identificados fatores especificamente associados com os diferentes tipos de Colonização identificados / Abstract: Patients with HIV/AIDS have potentially higher risk for Nosocomial Infection (NI) acquisition comparing other hospitalized groups of patients. In reviewing literature, the most common infection in these patients is the Blood Stream Infection (BSI) and the Staphylococcus aureus is the principal etiologic agent. The present study was developed in two phases. Phase I was developed at the Infectious Diseases Ward (IDW) in the Hospital das Clínicas (HC) from Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP) evaluating NI developed among patients who were HIV-positive and comparing to NI developed among patients who were HIV-negative. Phase II objective was to study the S. aureus nasal colonization from HIV-positive outpatients without history of hospitalization within two years before the beginning of the follow-up of this study and was developed at the Unidade de Pesquisa Clínica (UPC) of de Infectious Diseases Department from UNICAMP. Three samples of nares swabs were collected in different days. The DNA profiles of the samples of S. aureus obtained from patients were analyzed by using Pulsed-Field Gel Electrophoresis (PFGE). Potential risk factors associated to the nasal colonization for S. aureus were accessed. Phase I results showed that HIV-positive patients had higher rates of NI than HIV-negative patients. The HIV-patients were more likely to have a central venous catheter or urinary catheter than HIV-negative patients cared for in the same ward. The most frequent NI site was the BSI and the S. aureus was the principal identified etiologic agent. HIV-positive patients were more likely to have S. aureus infection compared to the HIV-negative patients. Results from Phase II detected the presence of S. aureus nasal colonization in 70 of 111 enrolled HIV-patients (63,1%). Nasal colonization for S. aureus were classified as: a) absent: patients having three negative results, in 36% of the cases; b) transient: patients having one positive results, in 25% of the cases; and c) persistent: patients having two or three positive results, in 39% of the cases. By using PFGE, the last category were subdivided into: c1) simple persistent, patients having two or three positive samples with the same DNA profile, in 24% of cases; c2) multiple persistent, patients having positive samples with different profiles, in 7% of cases, and, c3) combined persistent, patients having two positive samples with the same profile and one positive sample with different profile, in 8% of cases. Clinical and laboratorial classification of AIDS, using Centers for Disease Control and Prevention (CDC) criteria, was identified as the risk factor for S. aureus nasal colonization. The antibiotics use at the moment of collection of nasal swab or 6 months before were associated with negative results for S. aureus. No specific risk factors were associated with different types of colonization / Doutorado / Ciencias Basicas / Doutor em Clínica Médica

Orientador: Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-04T11:07:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hofling_ChristianCruz_D.pdf: 21680576 bytes, checksum: d24a23695ef6089d59f1055b941a14a2 (MD5) Previous issue date: 2005 / Resumo: Isoniazida, rifampicina e pirazinamida têm sido usadas como a base do tratamento da tuberculose no Brasil e na maioria dos países do mundo. O fenômeno da resistência bacteriana aos agentes quimioterápicos tem sido descrito desde que seu uso foi instituído. No caso da tuberculose, houve aumento expressivo do número de cepas resistentes, principalmente na década de 1990, devido à desestruturação dos serviços de vigilância e controle da doença e, também, à pandemia da AIDS. A resistência a antimicrobianos em cepas de Mycobacterium tuberculosis resulta em aumento da morbi-mortalidade e maiores custos para o serviço de saúde. A mutação no códon 315 do gene katG, responsável pela codificação da enzima catalase-peroxidase em M. tuberculosis, é um dos mecanismos de resistência desta bactéria à isoniazida. Para caracterizar as bases genéticas da resistência a drogas em cepas de M. tuberculosis no estado de São Paulo, foram selecionadas para estudo 91 amostras resistentes e 4 sensíveis à isoniazida. Essas cepas foram obtidas de culturas enviadas ao Instituto Adolfo Lutz central, em São Paulo, para identificação e realização de teste de sensibilidade a drogas. Um total de 467 cepas foram recebidas no período de agosto de 1999 a setembro de 2000. A genotipagem, utilizando a técnica de RFLP, foi realizada para o estabelecimento de parentesco entre as cepas. Estudos com as técnicas de SSCP e seqüenciamento de fragmento contendo o códon 315, amplificado do gene katG, foram realizados para triagem e confirmação de mutações associadas à resistência à isoniazida. A associação de resistência à isoniazida e rifampicina foi encontrada em 74.8% das cepas testadas. Resistência à isoniazidalpirazinamida e isoniazidaletambutol foi encontrada em 33 e 9,9%, respectivamente. Resistência concomitante a todas as drogas consideradas de primeira linha para o tratamento da tuberculose (isoniazida, rifampicina e pirazinamida) foi encontrada em 13,1 % das cepas. A genotipagem mostrou padrão heterogêneo de bandas, com formação de oito agrupamentos com apenas dua~ amostras cada. A substituição AGC~ACC (Serina~Tirosina) foi a mutação mais encontrada (48%). Não foram encontradas mutações em 39,5% das cepas resistentes estudadas e nos restantes 12,5% foram detectadas outras mutações. Conclui-se que no estado de São Paulo a resistência à rifampicina é freqüente entre as cepas resistentes à isoniazida. A resistência às três principais drogas para o tratamento da tuberculose também ocorreu em alta freqüência. A substituição AGC-.ACC foi a mutação mais encontrada, porém uma grande parte das cepas resistentes não apresentavam tais mutações. Pelos dados levantados, podemos também inferir que o fenômeno da resistência do M. tuberculosis a drogas não é, em São Paulo, uma conseqüência de disseminação clonal das cepas, mas casos isolados, provavelmente secundários a irregularidades no tratamento. Este trabalho, quando do seu início, foi um dos primeiros a endereçar a questão das bases genéticas para resistência a drogas em M. tuberculosis no Brasil, e estudos mais sistemáticos e abrangentes são necessários para melhor compreensão desta dinâmica em nosso meio / Abstract: Isoniazid, rifampin and pirazinamide have been used as the Standard treatment for tuberculosis in Brazil and most countries around the world. Antimicrobial resistance has been described since its use was instituted. As for tuberculosis, there has been an expressive rise in multidrug resistant strains in the decade of 1990, due mainly to the dismantling of tuberculosis vigilance programs and the AIDS pandemics. Antimicrobial resistance among Mycobacterium tuberculosis strains result in increase in morbidity and mortality and cost for health care. Mutations in codon 315 of the katG gene, responsible for coding catalaseperoxidase in M tuberculosis. has been associated as one of the key mechanisms of resistance of this bacteria to isoniazid. In Brazil, studies towards the molecular mechanisms involved in this process are still on its beginning. To characterize the genetic basis of M tuberculosis drug resistance in the state of São Paulo, 91 isoniazid resistant and 4 isoniazid sensitive strains were selected for study. These strains were drawn from samples (462 strains) sent to the Instituto Adolfo Lutz central laboratory in São Paulo for identification and drug susceptibility tests. The study period was from august 1999 through september 2000. Genotyping of mycobacterium was performed using RFLP technique. SSCP study and sequencing of the amplified fragment of katG gene that contained codon 315 were performed to screen and check for mutations conferring resistance to isoniazid. Concomitant resistance to isoniazid and rifampin was foud in 74,8% of strains tested. Resistance to both isoniazid/rifampin and isoniazid/ethambutol was found in 33 and 9,9%, respectively. Concomitant resistance to all drugs considered as first line treatment of tuberculosis (isoniazid, rifampin and pirazinamid) was found in 23,1% of strains. Genotypic studies revealed a heterogeneous band pattern, with formation of 8 clusters with only two specimens each. The most prevalent substitution was AGC-+ACC (Ser-+Thr), found in 48% of strains. No mutation was noted in 39,5% of resistant strains studied, and the remaining 12,5% habored other I .5S frequent mutations. In conclusion, resistance to rifampin is a frequent event among isoniazid resistant strains collected in Sao Paulo, Brazil. Resistance to the three front drugs used for the treatment of tuberculosis also occurred in high frequency. The AGC-+ACC substitution was the most frequent mutation found, a1thougha high percentage of strains did not carry any mutation / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Orientadores: Mariangela Ribeiro Resende, Maria Luiza Moretti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-14T14:58:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferrari_MichelaDeLuca_M.pdf: 2800534 bytes, checksum: 6c0f0dc17633a5c05f98eaf42e330cb7 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: Os objetivos do presente estudo foram estimar a prevalência de resistência do M. tuberculosis aos fármacos de primeira linha entre pacientes com tuberculose diagnosticados no Hospital de Clínicas da Unicamp e avaliar o desempenho do método de microdiluição em placa com [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)- 2,5diphenyl-tetrazolium bromide] (MTT) comparado ao Bactec MGIT 960®. No período foram notificados 360 casos de tuberculose. Destes 211 casos apresentaram cultura positiva para Mycobacterium sp, sendo incluídos 105 casos, nos quais foi identificado o M. tuberculosis. Dentre estes pacientes a apresentação pulmonar da TB ocorreu em 64,8% e co-infecção pelo HIV em 37,1%. A prevalência de resistência a qualquer fármaco foi de 6,7%; multidrogarresistência (RMP e INH) e resistência a INH e SM foram detectadas em 1%, em 3,8% e em 3,8% dos casos, respectivamente. Todos os isolados foram susceptíveis ao EMB. A resistência primária foi encontrada em quatro casos e resistência adquirida em três. Houve associação entre tratamento prévio e resistência (p=0,0181), as demais variáveis estudadas não foram associadas. Dentre os 119 isolados de M. tuberculosis incluídos para a avaliação do desempenho do MTT, ocorreu concordância de 100% para INH e EMB entre os métodos MTT e Bactec MGIT960®, de 99% para RMP (sensibilidade: 90%), enquanto que para SM houve concordância inferior aquela apresentada pelos outros fármacos (95,2%; sensibilidade: 90,9%). A prevalência de resistência entre os casos novos atendidos no Hospital de Clínicas da Unicamp no período de estudo foi de 3,8% para isoniazida, 1% para rifampicina, 3,8% para etambutol e 1% multidrogarresistente. Resistência a qualquer fármaco foi observada em 6,7% dos casos. O método colorimétrico com MTT apresentou bom desempenho e representa uma alternativa acurada, simples e de reduzidos custos, viável e sustentável para locais e países com limitados recursos. / Abstract: This cross-sectional, hospital-based study conducted between January 2006 and March 2008 sought to estimate the resistance of M. tuberculosis to first-line drugs among patients with tuberculosis confirmed by culture at a Brazilian hospital and evaluate the performance of the [3-(4,5-dimethylthiazol-2-yl)-2,5-diphenyl-tetrazolium bromide] (MTT) microplate assay in comparison to the Bactec MGIT 960. During the study period were reported to the surveillance system 360 tuberculosis cases, 211 out of these were confirmed by positive culture for Mycobacterium sp and 105 out of these had M. tuberculosis isolated on culture and were included to the prevalence study. Pulmonary involvement was present in 64.8% of cases and HIV co-infection was found in 37.1%. The prevalence of M. tuberculosis resistance was 6.7%; multidrug-resistance [rifampin (RMP) and isoniazid (INH)] and resistance to INH and streptomycin (SM) were detected in 1%, in 3.8% and in 3.8% of cases, respectively. All isolates were susceptible to ethambutol (EMB). The resistance was primary in four cases and acquired in three cases. Previous treatment was associated with resistance (p=0.0181). Among 119 isolates of M. tuberculosis included to the MMTT performance evaluation, there was 100% observed agreement for INH and EMB between the MTT and Bactec MGIT 960¿ methods. For RMP, the observed agreement was 99% (sensitivity: 90%), and for SM, the level of agreement was lower (95.2%; sensibility 90.9%) than those of the other drugs. The prevalence of M. tuberculosis resistance among the new cases during the study period was 6.7%; multidrug-resistance and resistance to INH and streptomycin (SM) were detected in 1%, in 3.8% and in 3.8% of cases, respectively. The colorimetric method with tetrazolium (MTT) represents an accurate, simple and low cost alternative that is both viable and sustainable for settings with limited resources. / Mestrado / Ciencias Basicas / Mestre em Clinica Medica

Orientador: Luiz Augusto do Amaral / Coorientador: Renato Pariz Maluta / Banca: Karina Paes Bürger / Banca: Maria Izabel Merino de Medeiros / Resumo: Os queijos elaborados a partir de leite cru são muito consumidos no Brasil. No entanto, sua elaboração realizada por pessoas não capacitadas pode resultar em sua contaminação por vários micro-organismos, incluindo Escherichia coli, afetando a qualidade microbiológica do queijo e representando risco potencial para a saúde dos consumidores. Assim, o objetivo deste trabalho foi avaliar as características fenotípicas e genotípicas de estirpes de Escherichia coli isoladas em amostras de queijos elaborados a partir de leite não pasteurizado em três cidades, para avaliar o possível risco potencial deste tipo de queijo para a população humana. Para tanto, 83 queijos foram coletados em cada um dos três diferentes municípios, Uberaba / Minas Gerais (30), Ribeirão Preto / São Paulo (22) e Aracajú / Sergipe (31) no ano de 2010. Os isolados foram cultivados em ágar EMB e, no ano de 2012, analisados o grupo filogenético por PCR, o sorogrupo O por aglutinação, a resistência antimicrobiana por difusão em disco, a presença de genes de resistência antimicrobiana por PCR, e campo pulsado por eletroforese em gel. O número de amostras positivas para E. coli foi maior na cidade de Aracaju (90,32%) e os isolados de E. coli da cidade de Uberaba demonstraram alta resistência antimicrobiana (92,30%). A maior parte dos isolados pertencia ao grupo filogenético A (54,4%) e B1 (44,3%). A resistência aos antimicrobianos foi moderada, sendo que a maior prevalência foi do município de Uberaba (56,7%). Houve isolados com genes de resistência a antimicrobianos, sendo que o gene tetB foi o gene mais comumente encontrado. Os sorotipos mais observados foram O4, O18 e O23, importantes como causadores de doenças extra intestinais, como meningite e infecção do trato urinário. Clones de E. coli foram encontrados em amostras de queijos na... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The cheeses made from raw milk is widely consumed in Brazil. However, preparation is performed by people not trained and can result in contamination by various micro-organisms, including Escherichia coli, affecting the microbiological quality of cheese and representing potential risk to consumer health. The objective of this study was to assess the phenotypic and genotypic characteristics of Escherichia coli strains isolated in samples of cheeses made from unpasteurized milk in three cities, to assess the possible risk potential of this type of cheese for the human population. For this, 83 cheeses were collected in each of three different municipalities, Uberaba / Minas Gerais (30), Ribeirão Preto / São Paulo (22) and Aracaju / Sergipe (31) in 2010. The isolates were cultured on agar and EMB, and in 2012, analyzed the phylogenetic group by PCR, serogroup by agglutination, antimicrobial resistance by disk diffusion, the presence of antimicrobial resistance genes by PCR and pulsed field by gel electrophoresis. The number of samples positive for E. coli was higher in the city of Aracaju (90.32%) and E. coli isolated from Uberaba demonstrated high antimicrobial resistance (92.30%). Most isolates belonging to the phylogenetic group A (54.4%) and B1 (44.3%). Antimicrobial resistance was moderate, and the highest prevalence was at Uberaba (56.7%). There were isolates with antimicrobial resistance genes, and the gene tetB was the gene most commonly found. The serotypes most frequently observed were O4, O18 and O23, important as disease causing extra bowel, such as meningitis and urinary tract infection. E. coli clones were found in samples of cheeses in the same city and in different cities and there was also a high genetic variability, indicating that this type of food can be contaminated at different points during the... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Mara Correa Lelles Nogueira / Banca: Beatriz Meurer Moreira / Banca: Marina Baquerizo Martinez / Banca: Suzana Margareth Ajeji Lobo / Banca: Fátima Pereira de Souza / Resumo: O gênero Acinetobacter compreende bacilos Gram-negativos ubíquos na natureza e suas principais espécies, A. calcoaceticus, A. baumannii, A. pittii e A. nosocomialis, foram agrupadas no complexo Acinetobacter baumannii-Acinetobacter calcoaceticus (complexo ACB) por apresentarem alta similaridade genética e por serem de difícil diferenciação por métodos bioquímicos. As infecções mais causadas pelo complexo ACB são pneumonias e bacteremias e, para o tratamento destas, são muito utilizados os beta-lactâmicos, aminoglicosídeos e polimixinas. Entretanto, a resistência aos beta-lactâmicos e aminoglicosídeos tem aumentado em Acinetobacter spp., principalmente, devido à produção de enzimas chamadas beta-lactamases e enzimas modificadoras de aminoglicosídeos (EMAs). Neste contexto, os objetivos do estudo foram avaliar o perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos, investigar genes de carbapenemases (blaOXA-23like, blaOXA-51like, blaOXA-58like, blaOXA24-40like, blaOXA-143like, blaOXA-48like, blaKPC, blaGES,blaVIM, blaIMPe blaSPM), e de EMAs [aac(3)-Ia, aac(3')-II, aaac(6')-Ih, aph(3')-VI, ant(2')-Ia, aph(3')-Ia e aac(6')-Ib] por PCR e determinar a similaridade genéticados isolados de A. baumannii por REP-PCR. Cem isolados do complexo ACB resistentes aos carbapenêmicos provenientes de pacientes admitidos em unidades de terapia intensiva (UTIs) do Hospital de Base de São José do Rio Preto (HB) foram encaminhados ao laboratório de Microbiologia da Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), onde foram realizadas a extração de DNA, a identificação da espécie, a investigação dos genes e a tipagem molecular por REP-PCR. Todos os isolados apresentaram fenótipo de multirresistência e foram identificados como pertencentes à espécie A. baumannii. Os genes blaOXA-23like e blaOXA-51like foram detectados em 100% dos isolados, e, em todos, ISAba1 estava localizado "upstream" ao gene blaOXA-23like... / Abstract: The Acinetobacter genus comprises ubiquitous Gram-negative bacilli and its main species, A. calcoaceticus, A. baumannii, A. pittii and A. nosocomialis were grouped in the the Acinetobacter baumannii - Acinetobacter calcoaceticus Complex (ACB Complex) due to their high genetic similarity and for their difficult differentiation by biochemical methods. Most infections caused by ACB complex are pneumonia and bacteremias, and, to treat these, beta-lactams, aminoglycosides and polymyxins are widely used. Nevertheless, beta-lactams and aminoglycosides resistance has been increasing in Acinetobacter spp., mainly, due to the enzymes production called beta-lactamases and aminoglycosides modifying enzymes (AMEs). Thus, the study objectives were to evaluate the antimicrobial susceptibility profile, investigate the carbapenemases gene (blaOXA-23like, blaOXA-51like, blaOXA-58like, blaOXA24-40like, blaOXA-143like, blaOXA-48like, blaKPC, blaGES, blaVIM, blaIMPand blaSPM), the AMEs genes [aac(3)-Ia, aac(3)-II, aac(6')-Ih, aph(3')-VI, ant(2')-Ia, aph(3')-Ia and aac(6')-Ib], and to determine the genetic similarity by REP-PCR. One hundred carbapenem resistant isolates of ACB complex were sent to the Microbiology Laboratory of the Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto, where DNA extraction, species identification, PCRs and molecular typing by REP-PCR were carried out. All of the isolates showed multidrug resistance phenotype and were identified as A. baumannii. The genes blaOXA-23like and blaOXA-51like were present in 100% of the isolates andISAba1 was "upstream" to the blaOXA-23likegene. The AMES genes detected were aph(3')-VI (55%), aac(6')-Ib (46%), aac(3)-Ia (30%) and aph(3')-Ia (24%). The REP-PCR typing generated five groups (A, B, C, D and E) with 20 clusters. Of these, many were endemic clusters, because they were isolated during all the collection period and in all the HB's ICUs. Furthermore, the horizontal transmission ... / Doutor

Orientador: Maria Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Banca: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Elisabeth Loshchagin Pizzollitto / Banca: Elisa Yoko Hirooka / Bnaca: Tereza Cristina Rocha Moreira de Oliveira / Resumo: Staphylococcus aureus juntamente com outras espécies de estafilococos coagulase-negativa são importantes patógenos responsáveis por infecções nosocomiais associadas ao uso de dispositivos implantáveis. O fator mais importante na patogênese de infecções estafilocócicas associadas a estes dispositivos é a habilidade do patógeno de formar biofilme, que confere proteção contra o sistema imunológico do hospedeiro e da ação de antimicrobianos, sendo o Polissacarídeo de Adesão Intercelular (PIA) codificado pelo operon icaADBC o principal componente do biofilme estafilocócico. Esse estudo objetivou estudar a estrutura do biofilme de diferentes espécies de Staphylococcus, avaliar a antibioticoterapia utilizada para tratamento dessas infecções em células livres e em biofilme e alternativas para prevenção da formação de biofilme. Foram estudadas 200 amostras de Staphylococcus spp. sendo 50 da espécie S. aureus e 150 do grupo dos estafilococos coagulase-negativa (ECN), incluindo 50 amostras de S. epidermidis, 20 S. haemolyticus, 20 S. warneri, 20 S. hominis, 20 S. lugdunensis e 20 amostras de S. saprophyticus isoladas de pacientes do Hospital das Clínicas (HC) da Faculdade de Medicina de Botucatu (FMB). As amostras foram submetidas à pesquisa dos genes icaADBC pela reação em cadeia da polimerase (PCR) e à expressão pela técnica de Transcriptase Reversa-PCR (RT-PCR). A produção de biofilme foi verificada através dos métodos fenotípicos de aderência ao tubo de borossilicato e na placa de poliestireno. A determinação da concentração inibitória mínima em células planctônicas e em biofilme foi testada para as drogas oxacilina, vancomicina, eritromicina, gentamicina, linezolida e sulfametoxazol-trimetropim pelo método de microdiluição em caldo. O teste do peptídeo (RIP) na prevenção da formação de biofilme foi realizado com cultura de bactérias em TSB glicose 2% com pontas de cateteres e ... / Abstract: Staphylococcus aureus, together with other coagulase-negative staphylococci (CoNS), is an important pathogen that causes nosocomial infections associated with the use of implantable devices. The most important factor in the pathogenesis of staphylococcal infections associated with these devices is the ability of the pathogen to form a biofilm, which protects bacteria against the host immune system and against the action of antimicrobial drugs. The main component of staphylococcal biofilms is polysaccharide intercellular adhesin (PIA), which is encoded by the icaADBC operon. The objectives of this study were to investigate the structure of biofilms of different Staphylococcus species, to evaluate the effect of antibiotics used to treat these infections on planktonic and biofilm cels, and to identify alternatives for the prevention of biofilm formation. A total of 200 Staphylococcus spp., including 50 S. aureus and 150 CoNS strains (50 S. epidermidis, 20 S. haemolyticus, 20 S. warneri, 20 S. hominis, 20 S. lugdunensis and 20 S. saprophyticus), isolated from patients seen at the University Hospital of the Botucatu School of Medicine (HC-FMB), were studied. The presence of the icaADBC genes was investigated by the polymerase chain reaction (PCR) and their expression was determined by reverse transcriptase-PCR (RT-PCR). Biofilm formation was evaluated using the phenotypic method of adherence to borosilicate tubes and polystyrene plates. The minimum inhibitory concentration (MIC) of oxacillin, vancomycin, erythromycin, gentamicin, linezolid and sulfamethoxazole-trimethoprim for planktonic and biofilm cells was determined by the broth microdilution method. The effect of RNA-inhibiting peptide (RIP) on the prevention of biofilm formation was tested using bacterial cultures grown in TSB-2% glucose containing catheter tips and visualization by scanning electron microscopy and on polystyrene plates. The icaA gene was detected by PCR in 97 (48.5%) ... / Doutor