Made available in DSpace on 2015-03-26T13:45:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 933167 bytes, checksum: ca9e74d4418395492daa526f1c88232c (MD5) Previous issue date: 2010-02-25 / Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerais / This work aims to study the Theory of Optimal Control its application to biological problems. We studied two models of optimal control: the first applied to biological invasions in a network of lakes and the second applied to the treatment of cancer through the use of drugs. The models that describe the dynamics of the problems considered are based on ordinary differential equations. The problems are placed in the form of an optimal control problem, where in the first we minimize the cost, which is composed of the added cost of preventing in the damage caused by invasion, and in the second we minimize the density of tumor cancer in end time of treatment and the effects (ills) caused by the drug during the treatment period. / Este trabalho tem como objetivo o estudo da Teoria do Controle Ótimo e sua aplicação a problemas biológicos. Estudamos dois modelos de controle ótimo: o primeiro aplicado a invasões biológicas em uma rede de lagos e o segundo aplicado ao tratamento de câncer através do uso de drogas. Os modelos que descrevem a dinâmica dos problemas considerados são baseados em equações diferenciais ordinárias. Os problemas são colocados no formato de um problema de controle ótimo, onde no primeiro minimizamos o custo, que é composto do custo de prevenção adicionado aos prejuízos causados pela invasão, e no segundo minimizamos a densidade do tumor de câncer no tempo final do tratamento e os efeitos (males) causados pela droga durante o tempo de tratamento.

Submitted by KARINE CUSTÓDIO GARCIA null (kak_garcia@hotmail.com) on 2016-12-21T11:55:53Z No. of bitstreams: 1 Dissertação repositorio.pdf: 3376488 bytes, checksum: 8bc9d4cb78c9af3b01d3dc21a7312a4d (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-12-22T12:00:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 garcia_kc_me_arafcf.pdf: 3376488 bytes, checksum: 8bc9d4cb78c9af3b01d3dc21a7312a4d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-22T12:00:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 garcia_kc_me_arafcf.pdf: 3376488 bytes, checksum: 8bc9d4cb78c9af3b01d3dc21a7312a4d (MD5) Previous issue date: 2016-10-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As infecções do trato urinário (ITU) são afecções comuns, que podem resultar em níveis significantes de morbidade. Os agentes etiológicos associados a ITU são bactérias Gram-negativas e Gram-positivas, além do fungo comensal Candida albicans. Além dos parâmetros clássicos associados à infecção, as ITU proporcionam o aumento na formação de espécies reativas de oxigênio e nitrogênio, o que também acarreta injúria tecidual, bem como, também ocorre um alto índice de micro-organismos resistentes aos fármacos disponíveis na clínica médica, o que demanda na prospecção por novas abordagens terapêuticas complementares. No Brasil, a espécie Eugenia brasiliensis Lam. é conhecida como “berry brasileira” ou grumixama, e existem poucos relatos na literatura demonstrando sua atividade biológica. Este fator associados à escassez de estudos sobre a espécie brasileira E. brasiliensis, despertou o interesse em novos estudos relacionados à sua ação sobre microrganismos relacionados a ITU e atividade antioxidante. Os extratos utilizados neste estudo foram obtidos a partir da polpa do fruto liofilizado de E. brasiliensis com diferentes solventes, com objetivo de obter dados de sua composição fitoquímica, avaliar suas atividades antioxidantes, antimicrobianas e citotóxicas. Foram utilizados como padrões para os ensaios de atividade antioxidante o ácido elágico, quercetina, ácido gálico, ácido cafeico e trolox. Na caracterização química dos extratos foram determinados, os teores de flavonoides totais, compostos fenólicos totais, antocianinas totais e açúcares totais e realizados testes de identificação para taninos; além disso, um perfil cromatográfico por CLAE-UV foi obtido. O extrato etanólico apresentou atividade antimicrobiana para cepas de Staphylococcus aureus, Staphylococcus saprophyticus e Candida albicans ATCC18804, enquanto o extrato aquoso demonstrou atividade antimicrobiana apenas frente ao S. aureus. Em relação à atividade antioxidante observou-se que os “padrões” ácido elágico, ácido gálico, ácido cafeico e quercetina foram mais eficientes do que as amostras para todos os ensaios, e entre os extratos de E. brasiliensis, o extrato etanólico demonstrou ter maior eficiência para a capturadas espécies reativas O2•-, ABTS•+, HOCl/OCl- e TauCl; enquanto que o extrato aquoso apresentou maior eficiência para o ensaio de clareamento da crocina na captura do radical ROO• e maior potencial redutor do íon férrico. Para o ensaio do NO•e H2O2 nenhum dos extratos apresentou atividade. Quanto ao potencial citotóxico, os extratos de E. brasiliensis não apresentaram citotoxicidade frente as linhagens celulares de origem não tumoral (macrófagos, linfócitos e células VERO). / The urinary tract infections (UTI) are common disorders, which may result in significant levels of morbidity. The etiological agents associated with UTI are Gram-negative and Gram-positive, plus commensal Candida albicans fungus. In addition to the classics associated with infection parameters, the ITU provide increased formation of reactive oxygen and nitrogen species, which also causes tissue damage, as well as a high rate of resistant microorganisms to drugs available in clinical practice, which requires the prospecting for new medicinal approaches. In Brazil, the specie Eugenia brasiliensis Lam. are known as “brazilian berry” or grumixama, and there are few reports in the literature demonstrating your biologic activity. This factor associated with the lack of studies on the brazilian specie E .brasiliensis stir up interest in new research related to the activities of microorganisms related to ITU and antioxidant activity. The extracts used in this study were obtained from the fruit pulp lyophilized of E. brasiliensis with different solvents in order to get data from their phytochemical composition, evaluate their antioxidant activity, antimicrobial and cytotoxicity. For the evaluation of antioxidant activity it was used like standards acid elagic, quercetina, acid gallic, acid cafeico and trolox. In the chemical characterization of the extracts were determined, the contents of total flavonoids, total phenolics, total anthocyanins and total sugars were determined and were performed to tannins; moreover, a profile by HPLC-UV chromatogram was obtained. The ethanol extract showed activity antimicrobial for the strains of Staphylococcus aureus, Staphylococcus saprophyticus and Candida albicans ATCC18804, while the aqueous extract only demonstrated activity antimicrobial for S. aureus. In relation to the antioxidant activity it is observed that the “standards” ellagic acid, gallic acid, caffeic acid and quercetin were more efficient and among extracts of E. brasiliensis ethanolic extract showed greater efficiency for capture of reactive species O2•-, ABTS•+, HOCl/OCl- and TauCl; while the aqueous extract was more efficient for crocina bleaching assay in capturing the radical ROO• and higher potential reducer of ferric ion. For the test of NO• and H2O2 none of the extracts showed activity. As to the cytotoxic potential, E. brasiliensis extracts showed no cytotoxicity on cell lines of non-tumor origin (macrophages, lymphocytes and VERO).

Made available in DSpace on 2016-12-12T20:12:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF14MA012.pdf: 153846 bytes, checksum: 6e6ab769e836a33b1705b21ae74f8eac (MD5) Previous issue date: 2014-04-30 / This dissertation aimed to evaluate the edge effect on tree species organization, in Araucaria Forest fragments, in Planalto Sul Catarinense region. Two manuscripts are presented, where in the first is analyzed i) the influence of edge distance on structure, diversity, richness and relative participation of regeneration guilds, in two fragments, located in the municipality of São José do Cerrito and Bom Jardim da Serra; and in the second ii) we tested the hypothesis that the edge represents a source of floristic-structural heterogeneity in the fragment located in the municipality of Lages. For each fragment, five 100x20 m transects were allocated perpendicular to the edge. Each transect was subdivided in 10 sub-plots, being the first five sub-plots (0-50 m) classified as edge sector and the last ones (50-100 m) as the interior sector. In each sub-plot, all living individual trees with circumference at breast height (cbh measured at 1,3 meters) ≥ 15,7 were measured (cbh and height) and identified. The species were classified according to the regeneration guilds as pioneer, light demanding climax and shadow tolerant climax. For the comparison of guilds between sectors, a proportion tests were performed. The analysis of horizontal structure was done through the Importance Value Index (IVI). The comparisons of abundance, basal area, three height, diversity (Shanon index), equability (Pielou índex) between the sectors were done through the t tests. The frequency of trees distribution in size classes in edge and interior sectors were analyzed by diametric and hypsometric histograms. Floristic-structural variations were verified in the second manuscript by plots ordination using Detrended Correspondence Analysis (DCA), with comparison between edge and interior through a Non-Parametric Multivariate ANOVA (NPMANOVA). In general, edge effects were different among fragments. In Bom Jardim da Serra remnant differences related to diversity were observed, in São José do Cerrito structural variations were observed, and in Lages a short floristic-structural gradient was noted, with variation in populations relative participation. Thus, we conclude that the edge effect on tree species communities of the studied Araucaria Forest fragments can not be generalized, which is indicative of its complex nature, due to the interaction with various factors such as the successional stage and surrounding matrix / A presente dissertação objetivou avaliar a influência do efeito de borda sobre a organização de comunidades de espécies arbóreas, em fragmentos de Floresta Ombrófila Mista, na região do Planalto Catarinense. São apresentados dois manuscritos, onde no primeiro é analisada i) a influência da borda sobre a estrutura, diversidade, riqueza e participação de guildas de regeneração em dois fragmentos, situados nos municípios de São José do Cerrito e Bom Jardim da Serra; e no segundo ii) testa-se a hipótese de que a borda representa uma fonte de heterogeneidade florístico-estrutural no fragmento localizado no município de Lages. Em cada um dos três fragmentos florestais analisados foram instaladas cinco transeções perpendiculares à borda, com a extensão de 100 m para o interior da floresta e a largura de 20 m. Cada transeção foi dividida em dez sub-parcelas de 10 x 20 m. Foi considerado como setor borda as cinco primeiras parcelas (0-50 m) de cada transecção e como setor interior as cinco últimas parcelas (50-100 m). Em cada parcela, todos os indivíduos arbóreos vivos com CAP (circunferência à altura do peito, medida a 1,30 m do solo) igual ou superior a 15,7 cm foram identificados e mensurados (diâmetro e altura). No primeiro capítulo, as espécies foram classificadas em guildas de regeneração definidas como pioneiras, clímax exigente de luz e clímax tolerante à sombra. Para comparação das guildas entre os setores, foi utilizado o teste de proporção. A análise da estrutura horizontal foi feita a partir do cálculo do Índice de Valor de Importância (IVI) para cada espécie. A comparação da abundância (densidade), área basal, diâmetro, altura média, riqueza, diversidade (Índice de Shannon) e equabilidade (Índice de Pielou) entre os setores foi realizada por meio do teste t. Para a análise da estrutura diamétrica e hipsométrica das comunidades dos diferentes setores, foram utilizados histogramas de frequência. Variações florístico-estruturais foram verificadas no segundo capítulo por meio da ordenação das parcelas utilizando-se a Análise de Correspondência Retificada (DCA), com comparações entre setores de borda e interior por meio da Análise de Variância Multivariada Não-Paramétrica (NPMANOVA). De forma geral, observou-se que a ação do efeito de borda foi diferenciada nos três fragmentos estudados. No remanescente de Bom Jardim da Serra foram encontradas diferenças relacionadas à diversidade, em São José do Cerrito foram encontradas diferenças estruturais entre borda e interior e em Lages foi encontrado um gradiente curto entre borda e interior, com variações na participação relativa das populações. Dessa maneira, conclui-se que o efeito de borda sobre os fragmentos de Floresta Ombrófila Mista estudados não pode ser generalizado, o que é um indicativo de sua natureza complexa, em função da interação com vários fatores, como, por exemplo, o estágio sucessional e matriz de entorno

Made available in DSpace on 2016-12-12T20:12:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGEF14MA012.pdf: 153846 bytes, checksum: 6e6ab769e836a33b1705b21ae74f8eac (MD5) Previous issue date: 2014-04-30 / This dissertation aimed to evaluate the edge effect on tree species organization, in Araucaria Forest fragments, in Planalto Sul Catarinense region. Two manuscripts are presented, where in the first is analyzed i) the influence of edge distance on structure, diversity, richness and relative participation of regeneration guilds, in two fragments, located in the municipality of São José do Cerrito and Bom Jardim da Serra; and in the second ii) we tested the hypothesis that the edge represents a source of floristic-structural heterogeneity in the fragment located in the municipality of Lages. For each fragment, five 100x20 m transects were allocated perpendicular to the edge. Each transect was subdivided in 10 sub-plots, being the first five sub-plots (0-50 m) classified as edge sector and the last ones (50-100 m) as the interior sector. In each sub-plot, all living individual trees with circumference at breast height (cbh measured at 1,3 meters) ≥ 15,7 were measured (cbh and height) and identified. The species were classified according to the regeneration guilds as pioneer, light demanding climax and shadow tolerant climax. For the comparison of guilds between sectors, a proportion tests were performed. The analysis of horizontal structure was done through the Importance Value Index (IVI). The comparisons of abundance, basal area, three height, diversity (Shanon index), equability (Pielou índex) between the sectors were done through the t tests. The frequency of trees distribution in size classes in edge and interior sectors were analyzed by diametric and hypsometric histograms. Floristic-structural variations were verified in the second manuscript by plots ordination using Detrended Correspondence Analysis (DCA), with comparison between edge and interior through a Non-Parametric Multivariate ANOVA (NPMANOVA). In general, edge effects were different among fragments. In Bom Jardim da Serra remnant differences 14 related to diversity were observed, in São José do Cerrito structural variations were observed, and in Lages a short floristic-structural gradient was noted, with variation in populations relative participation. Thus, we conclude that the edge effect on tree species communities of the studied Araucaria Forest fragments can not be generalized, which is indicative of its complex nature, due to the interaction with various factors such as the successional stage and surrounding matrix / A presente dissertação objetivou avaliar a influência do efeito de borda sobre a organização de comunidades de espécies arbóreas, em fragmentos de Floresta Ombrófila Mista, na região do Planalto Catarinense. São apresentados dois manuscritos, onde no primeiro é analisada i) a influência da borda sobre a estrutura, diversidade, riqueza e participação de guildas de regeneração em dois fragmentos, situados nos municípios de São José do Cerrito e Bom Jardim da Serra; e no segundo ii) testa-se a hipótese de que a borda representa uma fonte de heterogeneidade florístico-estrutural no fragmento localizado no município de Lages. Em cada um dos três fragmentos florestais analisados foram instaladas cinco transeções perpendiculares à borda, com a extensão de 100 m para o interior da floresta e a largura de 20 m. Cada transeção foi dividida em dez sub-parcelas de 10 x 20 m. Foi considerado como setor borda as cinco primeiras parcelas (0-50 m) de cada transecção e como setor interior as cinco últimas parcelas (50-100 m). Em cada parcela, todos os indivíduos arbóreos vivos com CAP (circunferência à altura do peito, medida a 1,30 m do solo) igual ou superior a 15,7 cm foram identificados e mensurados (diâmetro e altura). No primeiro capítulo, as espécies foram classificadas em guildas de regeneração definidas como pioneiras, clímax exigente de luz e clímax tolerante à sombra. Para comparação das guildas entre os setores, foi utilizado o teste de proporção. A análise da estrutura horizontal foi feita a partir do cálculo do Índice de Valor de Importância (IVI) para cada espécie. A comparação da abundância (densidade), área basal, diâmetro, altura média, riqueza, diversidade (Índice de Shannon) e equabilidade (Índice de Pielou) entre os setores foi realizada por meio do teste t. Para 12 a análise da estrutura diamétrica e hipsométrica das comunidades dos diferentes setores, foram utilizados histogramas de frequência. Variações florístico-estruturais foram verificadas no segundo capítulo por meio da ordenação das parcelas utilizando-se a Análise de Correspondência Retificada (DCA), com comparações entre setores de borda e interior por meio da Análise de Variância Multivariada Não-Paramétrica (NPMANOVA). De forma geral, observou-se que a ação do efeito de borda foi diferenciada nos três fragmentos estudados. No remanescente de Bom Jardim da Serra foram encontradas diferenças relacionadas à diversidade, em São José do Cerrito foram encontradas diferenças estruturais entre borda e interior e em Lages foi encontrado um gradiente curto entre borda e interior, com variações na participação relativa das populações. Dessa maneira, conclui-se que o efeito de borda sobre os fragmentos de Floresta Ombrófila Mista estudados não pode ser generalizado, o que é um indicativo de sua natureza complexa, em função da interação com vários fatores, como, por exemplo, o estágio sucessional e matriz de entorno

Submitted by MARÍLIA GABRIELA DE SANTANA COSTA null (mariliagabrielasc@hotmail.com) on 2017-06-01T19:21:17Z No. of bitstreams: 1 TESE_MARILIA_GABRIELA_SANTANA_COSTA.pdf: 4170522 bytes, checksum: 8ff9e42b797cdb58ebfce7e345bfe167 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-06-02T13:34:14Z (GMT) No. of bitstreams: 1 costa_mgs_dr_jabo.pdf: 4170522 bytes, checksum: 8ff9e42b797cdb58ebfce7e345bfe167 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T13:34:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 costa_mgs_dr_jabo.pdf: 4170522 bytes, checksum: 8ff9e42b797cdb58ebfce7e345bfe167 (MD5) Previous issue date: 2017-04-05 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A indústria de papel e celulose brasileira ocupa uma posição de destaque no mercado mundial. O Eucalyptus grandis é a espécie mais plantada pelo setor florestal e a principal fonte de matéria-prima para a indústria de papel e celulose. Contudo, seu crescimento em regiões de baixa temperatura é limitado. Contrariamente, a espécie Eucalyptus globulus apresenta melhor crescimento em baixas temperaturas, tornando-se cada vez mais interessante para a indústria nacional de papel e celulose. Tendo em vista que a temperatura é um modulador chave no metabolismo das plantas, uma análise global do proteoma foi realizada em plântulas cultivadas em temperaturas controladas, visando a identificação de proteínas diferencialmente reguladas entre as espécies e entre as diferentes condições de cultivo, detecção de vias metabólicas estimuladas pela temperatura e detecção de alterações no metabolismo antioxidante e de lignificação. A estratégia adotada permitiu a identificação de 3.111 proteínas caulinares, representando aproximadamente 9% do proteoma predito para a espécie modelo E. grandis. O perfil de expressão gênica, em termos de número de proteínas identificadas, corroborou com o padrão de densidade gênica para os cromossomos de Eucalyptus. Foram identificadas proteínas envolvidas em diversas vias metabólicas, com destaque para as vias relacionadas com o metabolismo energético, de aminoácidos e nucleotídeos, de lipídeos e carboidratos. Com relação às proteínas diferencialmente reguladas, 16 proteínas apresentaram alteração em sua abundância somente em E. grandis, 38 somente em E. globulus e 12 apresentaram alterações em ambas as espécies. Além disso, um total de 103 proteínas antioxidantes foram detectadas nos caules de ambas as espécies. O perfil de regulação frente ao estímulo térmico, revelou que as alterações nas proteínas antioxidantes são mais proeminentes quando as mudas de Eucalyptus foram expostas a altas temperaturas. Com relação à biossíntese de lignina, a nossa abordagem proteômica resultou na identificação de 27 das principais enzimas envolvidas neste metabolismo, corroborando com as predições de genes e o “toolbox” de lignificação proposto. A análise quantitativa revelou diferenças na abundância de isoformas específicas dependendo do estímulo térmico em que as plantas foram expostas; contudo, o tratamento a alta temperatura foi aquele que induziu mais diferenças entre os proteomas relacionados com a lignificação de E. globulus e de E. grandis. A partir dos resultados obtidos, conclui-se que o estímulo térmico promove alterações importantes no proteoma caulinar jovem de Eucalyptus, evidenciando aumento na atividade antioxidante em plantas expostas ao calor e expressão diferencial mais proeminente em plantas submetida ao frio. / The Brazilian pulp and paper industry occupies a prominent position in the world market. The Eucalyptus grandis is the most used species in the forest sector and the main source of raw material for Brazilian industry. However, its growth in low temperature regions is limited. In contrast, the Eucalyptus globulus species shows a better growth at low temperatures, for whom interest has increased within the national pulp and paper industry. Since temperature is a key modulator in plant metabolism, a global proteome analysis was performed on seedlings grown at controlled temperatures, aimed at the identification of differentially regulated proteins between the species and between the different culture conditions, detection of metabolic pathways stimulated by temperature and detection of alterations in antioxidant metabolism and lignification. The strategy used here allowed the identification of 3,111 stem proteins, representing approximately 9% of the predicted proteome of the E. grandis model species. The gene expression profile, in terms of the number of proteins identified, corroborated with the gene density pattern for the Eucalyptus chromosomes. Proteins involved in several metabolic pathways have been identified, especially the pathways related to energy metabolism, and metabolism of amino acids, nucleotides, lipids and carbohydrates. Regarding the differentially regulated proteins, 16 proteins showed alterations in their abundance only in E. grandis, 38 only in E. globulus and 12 presented alterations in both species. In addition, a total of 103 antioxidant proteins were detected in the stems of both species. The regulation profile upon thermal stimulus revealed that changes in antioxidant proteins are more prominent when Eucalyptus seedlings were exposed to high temperatures. Regarding the biosynthesis of lignin, our proteomic approach resulted in the identification of 27 of the main enzymes involved in this metabolism, corroborating with the gene predictions and the proposed lignin toolbox. Quantitative analysis revealed differences in the abundance of specific isoforms depending on the thermal stimulus to which the plants were exposed; however, the high temperature treatment was the one that induced more differences between the proteomes related to the lignification of E. globulus and E. grandis. The results demonstrate that thermal stimuli cause important alterations in the Eucalyptus stem proteome, evidenced by the increase in the antioxidant activity in plants exposed to heat and the most prominent differential expression in plants submitted to cold environments.

Submitted by Juliana Borba de Moraes Farinelli (jb.farinelli@gmail.com) on 2017-08-07T11:08:34Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Juliana_Borba_de_Moraes_Farinelli.pdf: 1908405 bytes, checksum: 206abe47eb22bfc7dd29bb491cd132b4 (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-08-10T19:42:34Z (GMT) No. of bitstreams: 1 farinelli_jbm_me_jabo.pdf: 1908405 bytes, checksum: 206abe47eb22bfc7dd29bb491cd132b4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-10T19:42:34Z (GMT). No. of bitstreams: 1 farinelli_jbm_me_jabo.pdf: 1908405 bytes, checksum: 206abe47eb22bfc7dd29bb491cd132b4 (MD5) Previous issue date: 2017-07-03 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A diversificação de culturas confere benefícios à propriedade rural quanto à redução do risco do negócio e aos proventos agronômicos no ambiente produtivo. Na atividade canavieira a diversificação de culturas pelo sistema de rotação ou sucessão agrícola ainda é um paradigma para o produtor rural, principalmente devido ao ciclo produtivo da cana-de-açúcar (Saccharum spp) distinto das culturas anuais que induzem o produtor a manter a cultura entre 4 a 6 anos para diluir o investimento da implantação. Por conseguinte o plantio de outra cultura é realizado nas áreas de reforma de canavial apenas ao final do ciclo da cana. Esta pesquisa questiona esse paradigma ao utilizar a teoria de opções reais para capturar o valor da flexibilidade gerencial em diversificar a produção como forma de minimizar o risco e aumentar os resultados do empreendimento rural utilizando a opção de troca entre as culturas de cana e soja, considerando um modelo polinomial combinando a volatilidade de mercado com a volatilidade da produtividade. Para tanto, tomou-se como base um experimento agrícola realizado ao longo de 7 anos, com diferentes sistemas de sucessão com cana, instalado e conduzido em uma propriedade rural na Região de Jaboticabal, São Paulo, Brasil. Diante dos resultados pode-se deferir que o sistema de sucessão soja/crotalária/soja/cana foi o que obteve melhor desempenho agronômico e econômico-financeiro e, a diversificação de culturas por meio da teoria do portfólio devolveu uma maior valorização a atividade, numa divisão de área em 44% de cana e 56% de soja. Esse perfil de área demonstrara viabilidade financeira pelo ponto de equilíbrio. A partir da teoria das opções reais, tomando como base os riscos agronômicos e de mercado em uma abordagem polinomial, verificou-se um maior retorno do investimento com a flexibilidade de substituição da cana com soja (Glycine max), quando alcançou o valor de R$ 1.601.952 em detrimento a R$ 1.229.88 quando não aplicado. A aplicação da opção troca de cultura foi possível logo no segundo corte da cana, um cenário totalmente novo para a realidade da região de Jaboticabal/SP. / Diversification of crops confers benefits to rural property in reducing business risk and agronomic revenues in the productive environment. In sugar cane crop diversification by the rotation system or agricultural succession is still a paradigm for the rural producer, mainly due to the productive cycle of sugarcane (Saccharum spp) distinct from the annual crops that induce the producer to maintain the crop Between 4 and 6 years to dilute the deployment investment. Consequently, the planting of another crop is carried out in the areas of sugar cane reforestation only at the end of the cane cycle. This research questions this paradigm when using the real options theory to capture the value of managerial flexibility in diversifying production as a way to minimize risk and increase the results of the rural enterprise using the exchange option between cane and soybean crops, considering A polynomial model combining market volatility and productivity volatility. For this, an agricultural experiment was carried out over 7 years, with different sugarcane succession systems, installed and conducted in a rural property in the Jaboticabal Region, São Paulo, Brazil. In view of the results, it can be inferred that the succession system soybean / crotalaria / soybean / cane was the one that obtained the best agronomic and economic-financial performance and, the diversification of cultures through the theory of the portfolio returned a greater value to the activity, in a Division of area in 44% of sugarcane and 56% of soybean. These area quantities demonstrated financial viability at the Point of Equilibrium. Based on the real options theory, based on the agronomic and market risks in a polynomial approach, there was a higher return on investment with the flexibility of substitution of cane with soybean (Glycine max) when it reached the value of R$ 1,601,952 instead of R$ 1,229.88 when not applied. The application of the culture exchange option was possible in the second sugarcane cut, a totally new scenario for the region of Jaboticabal / SP. / FAPESP: 2011/06491-0

Submitted by TATIANE SAMPAIO BITTENCOURT (dratatisampaio@gmail.com) on 2018-04-11T16:45:24Z No. of bitstreams: 1 Dissertação final - Tatiane Sampaio Bittencourt - UNESP.pdf: 2306748 bytes, checksum: 2c8b1dc80443dde5641b966081d8e34f (MD5) / Approved for entry into archive by Silvana Alvarez null (silvana@ict.unesp.br) on 2018-04-16T15:54:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bittencourt_ts_me_sjc.pdf: 2306748 bytes, checksum: 2c8b1dc80443dde5641b966081d8e34f (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-16T15:54:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bittencourt_ts_me_sjc.pdf: 2306748 bytes, checksum: 2c8b1dc80443dde5641b966081d8e34f (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / O objetivo deste estudo foi avaliar in vitro o comportamento biológico celular da N-Acetilcisteína (NAC), diante da estimulação ou não pelo LPS bacteriano. Foram utilizados fibroblastos do ligamento periodontal, que ficaram em contato por 48 horas com as substâncias testadas: NAC, Hidróxido de cálcio p.a. (HC), Lipopolissacarídeo de Escheria Coli (LPS), NAC + LPS e HC + LPS. Para os grupos NAC + LPS, HC + LPS e LPS, as células foram estimuladas com 2µg/mL de LPS por 24 horas, previamente aos tratamentos descritos. Foram realizados os testes biológicos de viabilidade celular (XTT), Espécies Reativas de Oxigênio (ROS), Elisa (para as citocinas IL-6, IL-8, IL-10, IL-1β e TNF-α) e Micronúcleo (MNT). Os dados foram analisados estatisticamente pela análise descritiva e pelos testes ANOVA e Kruskall Wallis, seguido do teste Dunn (p˂0.05) para os testes de XTT, ROS e MNT, e para o teste Elisa foi realizado cálculo das médias e desvio padrão. Os resultados obtidos mostraram que NAC teve um bom comportamento, frente à agressão provocada pelo LPS, quanto à produção de ROS. HC apresentou maior viabilidade celular que NAC, embora NAC não tenha apresentado citotoxicidade. Em relação à expressão das citocinas, NAC foi capaz de reduzir o potencial inflamatório do LPS quando da análise do TNF- α e IL-1β. NAC foi capaz de reduzir a genotoxicidade do LPS, como mostrado pelo teste MNT. Concluiu-se que NAC apresentou um comportamento biológico satisfatório, pela viabilidade celular dos fibroblastos, pela redução da geração de ROS e do potencial inflamatório provocado pelo LPS, e por reduzir a sua genotoxicidade. / The purpose of this study was to evaluate in vitro the action of N-Acetylcysteine (NAC) and calcium hydroxide (CH) on biological activity, either without or with LPS stimulation in periodontal ligament fibroblasts (PDLF) cells. PDLF were placed in contact with NAC, CH, NAC + LPS, LPS and CH + LPS for 48 hours. PDLF were stimulated by bacterial LPS for 24 hours in NAC + LPS, LPS and CH + LPS groups, before the substances described above are applied. The LPS and NAC effect on cell viability was measured using a XTT test. Reactive oxygen species (ROS) production was evaluated using ROS/superoxide detection kit. Inflammatory cytokines (IL-6, IL-8, IL-10, IL-1β and TNF-α) were evaluated by enzyme-linked immunosorbent (ELISA) assay. Genotoxicity was measured using micronucleus test (MNT). The means and standard deviation for all tests were calculated. Data were analyzed statistically by descriptive analysis, ANOVA and Kruskall Wallis tests, followed by Dunn test (p˂.05). CH was superior to NAC on cellular viability, although NAC was not cytotoxic. The results showed that NAC was able to reduce ROS production of LPS. NAC was able to reduce the inflammatory potential of LPS by decreasing the TNF-α and IL-1β release. NAC was able to reduce the genotoxicity of LPS. It was concluded that NAC showed a satisfactory biological activity, presenting a minimal effect on cell viability of PDLF cells and reducing ROS production and inflammatory potential provoked by LPS, and to decrease its genotoxicity.

Submitted by Valquíria Barbieri (kikibarbi@hotmail.com) on 2018-05-04T22:14:33Z No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Evaldo Oestreich Filho.pdf: 2713813 bytes, checksum: bf84148c7524af203433132e7a61a4b8 (MD5) / Approved for entry into archive by Jordan (jordanbiblio@gmail.com) on 2018-05-16T16:43:42Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Evaldo Oestreich Filho.pdf: 2713813 bytes, checksum: bf84148c7524af203433132e7a61a4b8 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-16T16:43:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DISS_2014_Evaldo Oestreich Filho.pdf: 2713813 bytes, checksum: bf84148c7524af203433132e7a61a4b8 (MD5) Previous issue date: 2014-02-20 / CAPES / O estudo foi desenvolvido no estado de Mato Grosso, em dois locais, sendo o primeiro localizado no município de Cuiabá, Mato Grosso, Brasil, denominada Área 1 e o segundo localizado no município de Chapada dos Guimarães denominado Área 2. O presente trabalho teve como objetivos caracterizar o estrato arbóreo das comunidades de cerrado estudadas; quanto a riqueza, a florística, a estrutura fitossociológica e diversidade; determinar a similaridade entre cerrados fragmentos estudados e compará-los quanto à florística, estrutura fitossociológica e diversidade. Para este estudo foram alocadas 30 parcelas na área 1 e 32 parcelas na área 2, todas com tamanhos 20 m x 20 m (400 m²), totalizando 12.000 m² e 12.800 m², respectivamente nas Áreas 1 e 2. A suficiência de amostragem foi obtida com base na análise da curva do coletor por meio do estimador não-paramétrico Jackknife, a diversidade através do índice de Shannon, a equabilidade através do índice de Simpson e a similaridade das áreas foi calculada por meio do índice de Sorensen. As espécies foram organizadas de acordo com as famílias reconhecidas pelo Angiosperm Phylogeny Group III. Foram encontradas nas áreas 1 e 2, um total de 3139 indivíduos arbóreos distribuídos em 82 espécies entre indivíduos com DAB ≥ 5 cm, sendo 8 espécies identificadas somente em nível de gênero. Essas espécies distribuem-se entre 57 gêneros, 31 famílias botânicas. As famílias mais bem representadas em número de espécies foram: Fabaceae, Myrtaceae, Vochysiaceae, Apocynaceae, Annonaceae e Bignoniaceae. As espécies Qualea parviflora e Kielmeyera coriacea estiveram presentes em todas as parcelas levantadas no fragmento de cerrado estudado no município de Cuiabá, e, portanto, obtiveram frequência absoluta de 100%. As espécies Couepia grandiflora, Davilla elliptica e Qualea grandiflora estiveram presentes em 93,75% de todas as parcelas levantadas na área pertencente à Chapada dos Guimarães. A diversidade e a equabilidade, respectivamente, pelo índice de Shannon e de Simpson, foram: 3,34 e 0,9520 na área 1; 3,56 e 0,9559 na área 2. A similaridade entre as áreas estudadas foi de 42% pelo índice de Sorensen. Os resultados encontrados confirmaram que as famílias Fabaceae, Myrtaceae e Vochysiaceae são as mais representativas floristicamente nos cerrados do Brasil Central. / The study was conducted in the state of Mato Grosso, in two places, the first located in the the municipality of Cuiaba , Mato Grosso, Brazil and called Area 1 and the second located in the municipality of Chapada dos Guimarães called Area 2. The objective of this study was to characterize the arboreal stratum of the communities of cerrado, as richness, floristic, phytosociological structure and diversity; determine the similarity between cerrado fragments studied and compare them with respect to floristic, phytosociological structure and diversity. For this study, 30 plots were allocated in Area 1 and 32 plots in Area 2, all of them with size 20 m x 20 m (400 m²), with total 12,000 m² and 12,800 m², respectively in areas 1 and 2. The sampling adequacy was obtained based on the analysis of the curve through nonparametric Jackknife estimator, the diversity was calculated using the Shannon index, the equability across the Simpson index and the similarity of the areas was calculated using the Sorensen index. The species were arranged according to families recognized by the Angiosperm Phylogeny Group III. Were found a total of 3139 individual trees belonging to 82 species among individuals with the diameter average the base (DAB) ≥ 5 cm, with only 8 species identified at genus. These species is distributed among 57 genera, 31 botanical families. The families that had the best representations in number of species were: Fabaceae, Myrtaceae, Vochysiaceae, Apocynaceae, Annonaceae and Bignoniaceae. The species Qualea parviflora and Kielmeyera coriacea were present in all plots raised in cerrado fragment in Cuiabá, so had absolute frequency of 100%. The species Couepia grandiflora, Davilla elliptica and Qualea grandiflora were present in 93.75% of all parcels raised in Chapada of Guimarães. The diversity and the equability, respectively, by Shannon and Simpson indexes, were: 3.34 and 0.9520 in Area 1; 3.56 and 0.9559 in Area 2. The similarity between study areas showed 42% similarity by Sorensen index. The results confirmed that the Fabaceae, Myrtaceae and Vochysiaceae families are the most representative flora in cerrado of central Brazil.

Fundação Carlos Chagas Filho de Amparo a Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Neste estudo, procuramos avaliar a composição e abundância de espécies de anfíbios e répteis em uma paisagem fragmentada de Mata Atlântica, no município de Cachoeiras de Macacu, Estado do Rio de Janeiro. Amostramos a herpetofauna da região na área contínua de floresta da Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA), em 12 fragmentos do entorno com tamanhos e graus de isolamento diferentes, e áreas de pasto (matriz). Utilizamos para amostragem destes animais as metodologias de buscas ativas visuais e armadilhas de interceptação e queda, além de encontros ocasionais. No total foram registradas 55 espécies de anfíbios anuros pertencentes a 12 famílias e entre os répteis foram registradas 26 espécies, sendo uma espécie de anfisbena, uma de jacaré, nove de lagartos e 15 de serpentes. Para os anfíbios, houve uma dominância de espécies da família Hylidae, que representaram mais da metade do total de espécies encontradas no estudo. Já entre os répteis, houve uma predominância de espécies de serpentes da família Dipsadidae. Considerando apenas os registros feitos pelas metodologias empregadas, a área contínua de floresta da REGUA possui uma riqueza de espécies de anfíbios (N = 30) e de lagartos (N = 4) menor do que o conjunto de fragmentos (N = 36 e N = 8), mas superior ao que foi encontrado na matriz (N = 25 e N = 1). Entretanto, para os anfíbios, mais de um terço das espécies (N = 11) que ocorreu na mata contínua não ocorreu nos fragmentos ou na matriz, o que sugere que estas espécies podem ser mais sensíveis a alterações do hábitat. A maior riqueza de espécies encontrada no conjunto de fragmentos pode ser parcialmente explicada pelo fato de muitas espécies tanto de anfíbios quanto de lagartos que são típicas de áreas abertas, terem sua ocorrência favorecida neste tipo de condição de ambiente relativamente menos fechado dos fragmentos. Quando avaliamos o efeito de métricas da paisagem, observamos diferentes respostas entre os anfíbios e os lagartos. Enquanto para os anfíbios houve uma tendência de fragmentos mais distantes terem uma menor riqueza de espécies e de modos reprodutivos associados a estas espécies, para os lagartos a área dos fragmentos parece ser uma importante variável na estruturação das comunidades. Entretanto, por particularidades das características fisiológicas e ecológicas de anfíbios e lagartos, é possível que outros fatores expliquem a distribuição diferenciada das espécies. De forma geral, as áreas de matriz amostradas pareceram ser hostis a espécies florestais tanto de anfíbios quanto de lagartos. Além disso, para anfíbios, a presença de ambientes reprodutivos pode ser fator crucial para a ocorrência de algumas espécies. De forma similar ao encontrado em outros estudos, para a manutenção da diversidade de anfíbios e lagartos na paisagem fragmentada tratada neste estudo é necessário preservar o grande bloco florestal e aumentar a conectividade deste com os fragmentos, o que poderia permitir a área contínua servir de área-fonte de dispersores para os remanescentes florestais. / In this study, we evaluated the composition and abundance of species of reptiles and amphibians in a fragmented landscape of Atlantic Forest in the municipality of Cachoeiras de Macacu, Rio de Janeiro State. We sampled the herpetofauna of the region in continuous forest area of Reserva Ecológica de Guapiaçu (REGUA) in 12 fragments with different sizes and degrees of isolation, and pasture areas (matrix). For sampling amphibians and reptiles we used visual encounter surveys and pitfall traps, supplemented with records obtained in occasional encounters. In total we recorded 55 amphibians species belonging to 12 families and 26 reptiles species, being one amphisbenian, an alligator, nine lizards and 15 snakes. For the amphibians, there was a dominance of species of the family Hylidae, which accounted for over half the total species found in the study. Among reptiles, there was a predominance of species of snakes family Dipsadidae. Considering only the records made by the methodologies employed, the area of continuous forest of REGUA has a species richness of amphibians (N = 30) and lizards (N = 4) lower than the set of fragments conjunctly (N = 36 and N = 8), but higher than that found in the matrix (N = 25 and N = 1). However, for the amphibians, more than a third of species (N = 11) that occurred in the continuous forest did not occur in fragments or in the matrix, suggesting that these species may be more sensitive to changes in habitat. The highest species richness found in the set of fragments can be partly explained by the fact that many species both amphibians and lizards that are typical of open areas, have favored the occurrence of this type of condition relatively less closed environment of the fragments. When we evaluated the effect of landscape metrics, we found different responses between amphibians and lizards. While there was a trend for more distant fragments to keep a lower amphibian species richness and reproductive modes associated with these species, for the lizards, the size of the remnant area seemed to be an important variable in structuring communities. However, by peculiarities of the physiological and ecological characteristics of amphibians and lizards, it is possible that other factors explain the differential distribution of species. In general, the matrix areas sampled appeared to be hostile to both forest species of amphibians and lizards. In addition to amphibians, the presence of reproductive environments can be a crucial factor for the occurrence of some species. As found in other studies, to keep the species diversity of amphibians and lizards in fragmented landscape studied here it is necessary to preserve the large forest block and to increase its connectivity with the surrounding fragments, which could allow the continuous forest area to serve as area-source to dispersers for the smaller remnants.

CHAPTER II: Introduction and Objectives: Metformin can act in muscle inhibiting the complex I of the electron transport chain and activating a signaling cascade for glut-4 translocation to the membrane cell. Our hypothesis is that this inhibition can decrease mitochondrial reactive oxigen species (ROS), minimizing cell damage caused by oxidative stress. Thus, the aim of this study was to evaluate the activity and expression of oxidative stress enzymes, total antioxidant status and lipid peroxidation in gastrocnemius muscle of rat with induced diabetic Mellitus and treated with metformin. Materials and Methods: The DM was induced in Wistar rats divided into four groups: untreated, treated with insulin, insulin plus metformin, and metformin. A non-diabetic group was used as control. The gastrocnemius muscle was collected and homogenized to evaluate the following parameters: superoxide dismutase (SOD) and catalase (activity and immunoblotting), glutathione peroxidase, glutathione reductase and glucose-6-phosphate dehydrogenase (activity), reduced glutathione, lipid peroxidation and total antioxidant capacity were measured. Results and conclusions: he group treated with metformin showed prevention in increased activity and expression of SOD and catalase, and kept the total antioxidant capacity and G6PDH activity when compared to the untreated group. These results seem to be related to lower lipid peroxidation. Therefore, this study suggest that metformin may is involved in the regulation of the oxidative stress in muscle cells decreasing lipid peroxidation which could improve glucose uptake. / CAPÍTULO II: Introdução e Objetivos: A metformina pode atuar no músculo inibindo o complexo I da cadeia de transporte de elétrons, ativando uma cascata de sinalização para translocação de GLUT-4 para membrana. Nossa hipótese é que esta inibição pode diminuir a produção de espécies reativas de oxigênio mitocondrial (ROS), minimizando os danos celulares causados pelo estresse oxidativo. Assim, o objetivo deste estudo foi avaliar a atividade e expressão de enzimas do estresse oxidativo, capacidade antioxidante total e peroxidação lipídica no músculo gastrocnêmio de ratos com diabetes mellitus induzida e tratados com insulina e/ou metformina. Materiais e Métodos: O DM foi induzido em ratos Wistar divididos em quatro grupos: não tratados, tratados com insulina, insulina e metformina, e metformina. O músculo gastrocnêmio foi coletado e homogeneizado para avaliar os seguintes parâmetros: superóxido dismutase (SOD) e catalase (atividade e expressão), glutationa-peroxidase, glutationa redutase e glicose-6-fosfato desidrogenase (atividade), glutationa reduzida, peroxidação lipídica e capacidade antioxidante. Resultados e conclusões: Os grupos tratados com metformina mostraram prevenção no aumento da atividade e expressão de SOD e catalase, bem como mantiveram a capacidade antioxidante total e atividade de G6PDH, quando comparado com o grupo não tratado. Esses resultados parecem estar relacionados com uma menor peroxidação lipídica. Portanto, este estudo sugere que a metformina pode está envolvida na regulação do estresse oxidativo nas células musculares diminuindo a peroxidação lipídica que poderia melhorar a captação de glicose. / Mestre em Genética e Bioquímica