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Anfíbios da Bacia do Rio Branco: preenchendo lacunas do conhecimento no norte da Amazônia

Azarak, Priscila Alencar, 92982445851 21 September 2018 (has links)
Submitted by Priscila Azarak (priscilazarak@hotmail.com) on 2018-11-23T12:36:47Z No. of bitstreams: 4 Tese_Priscila Azarak.pdf: 5265527 bytes, checksum: 9ef468a213bf6ff7c0d54430b3c0f225 (MD5) Ata de Defesa de Tese_Discente Priscila Alencar Azarak.pdf: 724256 bytes, checksum: 6056b126e2c68dc54645a6684a748b01 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 152003 bytes, checksum: 4ed216d6127242c14ee12a426a831dd1 (MD5) Autorização para divulgar.pdf: 17500 bytes, checksum: d30e94c038cbf77bbe0d715102a7968e (MD5) / Approved for entry into archive by PPGDivBio Diversidade Biológica (ppgdivbio@gmail.com) on 2018-11-23T17:18:34Z (GMT) No. of bitstreams: 4 Tese_Priscila Azarak.pdf: 5265527 bytes, checksum: 9ef468a213bf6ff7c0d54430b3c0f225 (MD5) Ata de Defesa de Tese_Discente Priscila Alencar Azarak.pdf: 724256 bytes, checksum: 6056b126e2c68dc54645a6684a748b01 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 152003 bytes, checksum: 4ed216d6127242c14ee12a426a831dd1 (MD5) Autorização para divulgar.pdf: 17500 bytes, checksum: d30e94c038cbf77bbe0d715102a7968e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-11-23T18:04:56Z (GMT) No. of bitstreams: 4 Tese_Priscila Azarak.pdf: 5265527 bytes, checksum: 9ef468a213bf6ff7c0d54430b3c0f225 (MD5) Ata de Defesa de Tese_Discente Priscila Alencar Azarak.pdf: 724256 bytes, checksum: 6056b126e2c68dc54645a6684a748b01 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 152003 bytes, checksum: 4ed216d6127242c14ee12a426a831dd1 (MD5) Autorização para divulgar.pdf: 17500 bytes, checksum: d30e94c038cbf77bbe0d715102a7968e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-23T18:04:56Z (GMT). No. of bitstreams: 4 Tese_Priscila Azarak.pdf: 5265527 bytes, checksum: 9ef468a213bf6ff7c0d54430b3c0f225 (MD5) Ata de Defesa de Tese_Discente Priscila Alencar Azarak.pdf: 724256 bytes, checksum: 6056b126e2c68dc54645a6684a748b01 (MD5) CartaEncaminhamentoAutodepósito.pdf: 152003 bytes, checksum: 4ed216d6127242c14ee12a426a831dd1 (MD5) Autorização para divulgar.pdf: 17500 bytes, checksum: d30e94c038cbf77bbe0d715102a7968e (MD5) Previous issue date: 2018-09-21 / The Neotropical region is the area which houses the largest quantity of species in the world, the Amazon being the South America biome with the greatest anuran species diversity. The Branco River basin, in the extreme north of the Amazon, represents a gap in the knowledge on the amazon amphibians. This thesis aimed: (1) To carry out a inventory of amphibians of the areas on the influence of the Branco River basin, including the records present in the literature, and to discuss the regional distribution of the species; and (2) To investigate the presence of cryptic lineages within the anurofauna of the Branco River basin, using the amphibian DNA barcodes tools. In this study 43 localities were sampled along the Branco River basin, covering differnt environments. We recorded 47 amphibian species belonging to two orders, 19 genera and 8 families, which together with other 21 species recorded in the literature, totalized 68 species of amphibians for that basin. Three species are new records to the region: Boana calcarata, Dendropsophus leucophyllatus and Osteocephalus leprieuri. The analysis of similarity (ANOSIM) showed that the upper and lower Branco River basin present significative differences in their species composition. The 16S rRNA mitochondrial DNA and four algoritims of delimitation (mPTP, locMin, bGMYC, GMYC) were used to investigate the presence of cryptic species in the anurofauna of that region. It was identified 41 morphological species, of that 10 have lineages restricted to the Branco River basin. / A região Neotropical é a área que abriga a maior quantidade de espécies do mundo, sendo a Amazônia o bioma sulamericano com a maior diversidade de espécies desse grupo de vertebrados. A bacia do rio Branco, situada no extremo norte da Amazônia, constitui uma lacuna no conhecimento da fauna de anfíbios amazônicos. Esta tese teve como objetivo: (1) Realizar um inventário dos anfíbios das áreas de influência da bacia do rio Branco, incluindo os registros da literatura e discutir a distribuição regional das espécies e (2) Investigar a presença de linhagens crípticas dentro da anurofauna da bacia do rio Branco, utilizando a ferramenta do DNA Barcode. Neste estudo foram amostrados 43 pontos de coletas ao longo da bacia do rio Branco, abrangendo diferentes ambientes. Foram registradas 47 espécies de anfíbios pertencentes a duas ordens, 19 gêneros e 8 famílias, que somadas a outras 21 espécies registradas na literatura, totalizam 68 espécies de anfíbios para esta bacia. Três espécies são novos registros para a região: Boana calcarata, Dendropsophus leucophyllatus e Osteocephalus leprieurii. A análise de similaridade ANOSIM mostrou que as porções alta e baixa da bacia do rio Branco apresentaram diferenças significativas na composição de espécies. Foi utilizado o gene mitocondrial 16S rRNA e quatro algoritmos de delimitação (mPTP, locMin, bGMYC, GMYC) para investigar a presença de espécies crípticas na anurofauna da região. Foram identificadas morfologicamente 41 espécies, das quais 10 apresentaram linhagens restritas à bacia do rio Branco.
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Influência do Pacu (Piaractus mesopotamicus, HOLMBERG, 1887) e do fluxo contínuo de água nas características limnológicas de viveiros de piscicultura / The influence of Pacu (Piaractus mesopotamicus Holmberg, 1887) and continuous water flow on limnological characteristics of fishponds

Eler, Márcia Noélia 31 January 1996 (has links)
Realizou-se, no Centro de Pesquisa e Treinamento em Aquicultura - CEPTA/IBAMA, em Pirassununga/SP, entre 28 de junho e 12 de agosto de 1991, um experimento com o objetivo de avaliar a influência de juvenis de Pacu (Piaractus mesopotamicus, HOLMBERG, 1887) nas características limnológicas da água. Avaliou-se também o impacto do fluxo contínuo de água nas comunidades planctônicas e na qualidade de água do viveiro. O experimento foi conduzido em dois viveiros retangulares escavados, com área útil de 350 m2, 1% de declividade, com abastecimento de água individual feito através de canaletas de concreto a céu aberto. A água de abastecimento foi proveniente da represa Velha (área de 5ha.), alimentada pelo córrego da Barrinha. Os viveiros foram abastecidos com um volume de 277 m3 de água, atingindo uma profundidade máxima de 1,2 m. Esses viveiros foram tratados com 50 g/m2 de calcário dolomítico e 200 g/m2 de esterco fresco de bovino, sendo que um serviu como controle e o outro foi povoado com pacu. No viveiro com Pacu foi feito arraçoamento diário com 1050 g de ração comercial. As amostras de água dos viveiros foram coletadas no período de 28 de junho a 12 de agosto de 1991, em intervalos que variaram de 2 a 3 dias. Foram monitoradas as seguintes variáveis limnológicas: temperatura, pH, transparência da água, material em suspensão, alcalinidade, dureza, condutividade elétrica, oxigênio dissolvido, nitrito, nitrato, amônia, fosfato total, fosfato dissolvido, fósforo inorgânico, silicato reativo, fitoplâncton, produção primária do fitoplâncton, clorofila a, zooplâncton e conteúdo estomacal dos juvenis de Pacu. A presença do Pacu no viveiro afetou a qualidade da água, elevando as concentrações de nutrientes e contribuindo para a diminuição das concentrações de oxigênio dissolvido. Com isto, a produção primária bruta foi, em média, mais elevada no viveiro com Pacu do que no controle. O fluxo contínuo de entrada e saída de água também afetou a qualidade da água dos viveiros, principalmente em relação à concentração de oxigênio dissolvido. O sinergismo entre o fluxo de água e a presença do Pacu contribuiu para que houvesse uma pertubação nas comunidades planctônicas em desenvolvimento nos viveiros. A comunidade do fitoplâncton esteve dominada pelas clorofíceas, principalmente pelas desmidiáceas. A densidade do fitoplâncton foi mais elevada no viveiro com Pacu. Durante todo o experimento, os cladóceros foram bem sucedidos em ambos os viveiros, o que não aconteceu com os rotíferos e nem com os copépodos. A alta densidade populacional dos cladóceros provavelmente deve ter influenciado na densidade de rotíferos no viveiro com Pacu, pois as duas populações mostraram relação inversa. Os copépodos contribuíram com uma espécie filtradora, sendo que as demais eram capturadoras. Os Cyclopoida foram mais abundantes no viveiro com Pacu. Na análise do conteúdo estomacal foram encontrados os seguintes itens alimentares: ração, sementes, gramas, plâncton, animais bentônicos e detritos. Os itens do plâncton mais freqüentes foram: zooplâncton (ovos de copépodos, ovos de rotíferos, larvas de chironomideo e restos de zooplâncton parcialmente digeridos) e fitoplâncton (Eunotia hexasghliphis e Scenedesmus quadricauda). / An experiment to evaluate the influence of young forms of Pacu (Piaractus mesopotamicus HOLMBERG, 1887) on limnological characteristics of water was conducted at Centro de Pesquisa e Treinamento em Aquicultura - CEPTA/IBAMA, located in Pirassununga, SP, Southeastern Brazil, from 06/28 until 08/12/1991. The impact of continuous water flow on the planktonic communities and water quality was also evaluated. The experiment was performed in two fishponds with 350 m2, 1.2 m of depth and 1% of declivity. Water supply came from open channels from Represa Velha (50.000 m2), that was supplied from Barrinha stream. The fishponds received 277 m3 of water, 50 g/m2 of dolomitic calcareous and 200 g/m2 of fresh manure. One fishpond was kept as a control and the other received young forms of Pacu that were fed daily with 1050 g of commercial feed. Samplings were carrired out from June, 28 to August, 12 at two or three days of intervals. Temperature, pH, water transparency, suspended materials, alkalinity, hardness, electrical conductivity, dissolved oxygen, nitrites, nitrates, ammonia, total phosphate, dissolved phosphate, inorganic phosphorus, reactive silicate, phytoplankton, primary production of phytoplankton, chlorophyll a, zooplankton and stomach contents analysis of young forms of Pacu were obtained as limnological variables. The presence of Pacu in the fishponds affected water quality by increasing nutrients concentration and contributing to the decrease of dissolved oxygen. Thus the primary production was higher in this system than in the control. The continuous incoming and outcoming water flow affected water quality on fishponds, mainly in relation to concentration of dissolved oxygen. Synergistic effect between water flow and presence of Pacu contributed to changes in the developing planktonic communities in the fishponds. The planktonic communities were dominated by Chlorophyta, mainly desmids. The phytoplankton density differed between the two fishponds, being higher in the one with Pacu. During the experiment, the Cladocera was successful in both fishponds, but this did not occur with Rotifera and Copepoda. The success of Cladocera probably controlled the density of Rotifera in the water. One of Copepoda was a filtering specie and the others were predators. The Cyclopoida was more abundant in the fishpond with Pacu than in the control. Stomachal content analysis showed: ration, seeds, grass, plankton, bentonic animals and detritus. The most frequent items of plankton were zooplankton (eggs of Copepoda, eggs of Rotifera, Chironomideo larvae and zooplankton partially digested) and phytoplankton (Eunotia hexaghliphis and Scenedesmus quadricauda).
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Caracterização das assembléias de peixes da bacia do rio Corumbataí (SP) / The fish assemblage characterization of the Corumbataí river basin

Cetra, Mauricio 27 May 2003 (has links)
A bacia do rio Piracicaba tem recebido atenção especial das autoridades municipais, pois possui grandes problemas de aproveitamento de seus recursos hídricos. A bacia do rio Corumbataí, um dos principais afluentes da margem direita do rio Piracicaba, é regionalmente importante, não só porque ainda possui águas de boa qualidade, mas também por apresentar elementos raros na paisagem do interior do estado. Esta tese teve o objetivo de caracterizar as assembléias de peixes na bacia do rio Corumbataí e fornecer ferramentas para avaliação de seu status ambiental. Foram escolhidos 4 rios principais com 3 pontos de coleta em cada um. Foram realizadas coletas no período de março a junho e setembro a dezembro de 2001, totalizando 24 coletas. Os dados bióticos foram avaliados através de medidas de diversidade. Para testar a hipótese de variação espaço-temporal da assembléia de peixes foi aplicado o modelo linear ANCOVA onde a variável resposta foi a riqueza de espécies; o fator foi ordem do rio; sendo utilizadas 2 covariáveis ambientais: temperatura e número de indivíduos, revelando uma variação espaço-temporal e padrões reconhecidos no meio acadêmico: relação espécie-área e conceito de rio contínuo. Técnicas multivariadas foram aplicadas para determinar a correlação entre a riqueza e a paisagem no entorno do ponto de coleta, revelando que existem mais espécies em locais com maior cobertura vegetal e mata ciliar preservada. Algumas espécies de peixes se mostraram bons indicadores ambientais: Hypostomus strigaticeps, Hoplosternum littorale e Salminus hilarii; por outro lado o Astyanax altiparanae não se mostrou um bom indicador / The Piracicaba river basin has received special attention from local authorities because it has presented a lot of problems about the misutilization of its hydric resources. The Corumbataí river basin, one of the major streams of the right side of the Piracicaba river, is regionally important, not only because it still has good water quality but also because it has unique elements inside the landscape of São Paulo state. This thesis aims to characterize the fish assemblage of the Corumbataí river basin and provide tools to assess the present environmental status of the basin. It has been chosen 4 major streams with 3 unit samples in each one of the streams. The samples were carried out from March to June and from September to December in the year of 2001, making up a total of 24 samples. The biotic data were assessed using diversity measurement. An ANCOVA was used to test the hypothesis of time-space variation of the fish assemblage, where the dependent variable was the species richness; the factor was the stream order and 2 environmental co-variates were used: temperature and number of individuals, thus revealing both time-space variation and some patterns which are recognized academically: species-area relationship and river continuum concept (RCC). Multivariate techniques were used to determine the correlation between richness and the landscape characteristics in the sampling unit, revealing that there is a greater number of species along the sites with a larger riparian zone. Some fish species have showed to be a good indicator: Hypostomus strigaticeps, Hoplosternum littorale and Salminus hilarii; on the other hand Astyanax altiparanae has not showed to be a good indicator species
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Estudo da vegetação arbórea da Praça dos Girassóis, Palmas-TO

Panta, Maxwell Viana 28 March 2017 (has links)
As praças podem ser definidas como espaços urbanos livres utilizados como locais públicos, as quais devem ser priorizadas dentro do planejamento urbano, de modo a assumir seu papel de área verde, tornando local de convivência e alcançando sua função socioambiental. A gestão e manejo dessas áreas dependem diretamente do seu conhecimento fitossociológico detalhado. Partindo disto, este trabalho objetivou-se estudar a composição florística da Praça dos Girassóis na cidade de Palmas – TO. Realizou-se o inventário de todas as árvores presentes na Praça dos Girassóis, considerando todos os indivíduos arbóreos com CAP (circunferência a altura do peito, 1,30 m do solo) igual ou superior a 20 cm foram identificados quanto à família botânica, nome científico, nome popular, origem (nativo ou exótico) bem como estado fitossanitário, endemismo e ameaça de extinção. Após a coleta de dados, calculou-se o índice de diversidade proposto por Shannon-Weiner (H’), riqueza proposto por Odum (d) e o cálculo de uniformidade proposto por Pielou (J). Foram identiticados 1514 exemplares arbóreos, pertencentes a 29 famílias botânicas, 75 gêneros e 89 espécies, destas, 20 são exóticas e 69 nativas. A espécie mais abundante foi a Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, com relação a origem 78% das espécies foram classificadas como nativas, sendo 56 espécies (62,92%) pertencentes ao domínio fitogeográfico Cerrado e 34 (38,20%) de ocorrência confirmada no Tocantins. O endemismo foi confirmado em 16 espécies (18%), sendo a Parkia platycephala Benth. com maior número de indivíduos (146). Dentre as espécies encontradas, duas aparecem como ameaçadas de extinção: Paubrasilia echinata (Lam.) E. Gagnon, H.C. Lima & G.P. Lewis e Swietenia macrophylla King. Conclui-se que a Praça dos Girassóis apresenta bons índices de diversidade: (H’=4,95) (D’=0,95), riqueza (d=27,67), uniformidade (J=0,76) e fitossanidade (93,20% das árvores saudáveis), além de possuir forte identidade do domínio fitogeográfico em que está inserida. / Squares can be defined as free urban spaces used as public places, which should be prioritized within urban planning, in order to assume its role as a green area, becoming a place of coexistence and reaching its socio-environmental function. The management and management of these areas depend directly on their detailed phytosociological knowledge. From this, the objective of this work was to study the floristic composition of the Square of the Sunflowers in the city of Palmas - TO. The inventory of all the trees present in the Square of the Sunflowers, considering all the arboreal individuals with CAP (chest height circumference, 1,30 m of the soil) equal to or greater than 20 cm were identified for the botanical family, name Scientific name, popular name, origin (native or exotic) as well as phytosanitary status, endemism and threat of extinction. After the data collection, we calculated the diversity index proposed by Shannon-Weiner (H '), the wealth proposed by Odum (d) and the uniformity calculation proposed by Pielou (J). 1514 arboreal specimens were identified, belonging to 29 botanical families, 75 genera and 89 species, of which 20 are exotic and 69 are native. The most abundant species were Handroanthus heptaphyllus (Vell.) Mattos, 78% of the species were classified as native, 56 species (62.92%) belonging to the Cerrado phytogeographic domain and 34 (38.20%) Occurrence confirmed in Tocantins. Endemism was confirmed in 16 species (18%), with Parkia platycephala Benth. with greater number of individuals (146). Among the species found, two appear to be endangered: Paubrasilia echinata (Lam.) E. Gagnon, H.C. Lima & G.P. Lewis and Swietenia macrophylla King. It is concluded that the Square of Sunflowers presents good diversity indexes: (H '= 4.95) (D' = 0.95), richness (d = 27.67), uniformity (J = 0.76) and phytosanitary (93.20% of healthy trees), besides having a strong identity of the phytogeographic domain in which it is inserted.
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Filogenia da tribo Attacobiini Roewer, 1955 (Araneae, Corinnidae, Corinninae)

PEREIRA FILHO, José Moisés Batista 02 April 2015 (has links)
Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-06T16:55:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-06T16:57:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-06T16:57:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) Previous issue date: 2015-04-02 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A cladistic analysis of tribe Attacobiini (Corinnidae, Corinninae) with 17 taxa and 109 characters is presented. The outgroup is composed by four species (Castianeira aff rubicunda ACR; Xeropigo cotijuba; Septentrinna yucatan and Falconina gracilis) all of them represented by males and females. The ingroup is represented by 13 Attacobiini species, seven of which represented by both sexes (Attacobius TOC; A. attarum; A. verhaaghi; A. lamellatus; A. uiriri; A. blakei and A. carranca), three represented only by females (A. luederwaldti; A. nigripes and A. kitae) and three represented only by males (Ecitocobius comissator; Attacobius PAR and A. tucurui). Regarding to terminals, the present data matrix represent an increase of two species in relation to a previous analysis of the Tribe. The availability of data was improved by adding character states on genitalic features for three terminals, of which the counterpart sex was unknown at the time in which that previous analysis was made (males of A. verhaagui and females of A. blakei and A. uiriri). Furthermore, several characters used in the previous analysis were re-interpreted and some new characters were proposed. A single tree was obtained under equal weights. Attacobinni and Attacobius were retrieved as monophyletic groups but the groups of species of Attacobius depicted here are considerably different from those recognized in the previous analysis. The exact solution under equal weights and all characters running unordered resulted in a fully resolved, single most parsimonious tree. As in the previous analysis, the bettersupported clades were Attacobiini and Attacobius. However, the groups of Attacobius species recovered here are considerably different from the ones recovered previously, with the exception of an apical clade composed by A. nigripes, A. kitae, A. attarum and A. luederwaldti, which was recognized in both analyses as the best supported group within the genus.
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Identificação de gêneros arbóreos de Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae do Estado de São Paulo utilizando o marcador molecular rbcL / Identification of Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae São Paulo State\'s tree genera using the molecular marker rbcL

Barroso, Renata Moreira 28 July 2017 (has links)
O Brasil, como país detentor da maior biodiversidade mundial de plantas, possui um importante papel no desenvolvimento de pesquisas que auxiliem ou viabilizem a identificação de sua diversidade vegetal, como o estudo de marcadores moleculares adequados a esta tarefa. Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae são as famílias mais importantes da Flora Brasileira por apresentarem grande diversidade de gêneros e espécies e serem consideradas de difícil identificação pela taxonomia tradicional. Tendo em vista o potencial do rbcL na identificação molecular de plantas, este trabalho propôs estudar a eficiência deste marcador em identificar gêneros e espécies das três principais famílias de árvores da Flora do Estado de São Paulo. Foi criado um banco de sequências de rbcL contendo 160 espécies, o qual foi testado quanto sua eficiência de identificação através de um teste cego contendo as sequências inteiras (maior que 400 pares de base) e as sequências de tamanho reduzido em 300, 200 e 100 pb. O teste cego também foi realizado no banco de sequências mundial Boldsystems. Para a análise dos resultados foi utilizado o programa BLAST que busca similaridades entre as sequências. Os resultados evidenciaram a viabilidade do método ao mostrar que o rbcL identificou 100% dos gêneros arbóreos de Fabaceae e Myrtaceae, porém não podemos dizer o mesmo para identificar gêneros de Lauraceae e nem em nível específico para qualquer uma das famílias, já o teste de identificação com as sequências reduzidas mostrou que a sequência de rbcL da espécie a ser analisada deve conter mais que 400 pares de base para não comprometer a correta identificação de gênero. / Brazil, as the country with the greatest biodiversity in the world, has an important role in the development of research to help or enables the identification of its plant diversity, such as the study of suitable molecular markers for this task. Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae are the most important families of the Brazilian Flora because they present a large diversity of genera and species and are considered difficult to identify by the traditional taxonomy. Considering the potential of rbcL in the molecular identification of plants, this work aims to study the efficiency of this marker in identifying genera and species of the three main tree families of São Paulo State\'s Flora. A rbcL sequence Bank containing 160 tree species was created in order to test its efficiency through a blind test with whole and reduced sequences using the BLAST program that searches for similarities between sequences. The blind identification test was also performed using the Boldsystems database. The results showed that the rbcL can´t be indicated to identify Lauraceae tree genera, but can be indicated to successfully identify tree genera of Fabaceae and Myrtaceae. The test identification with reduced sequences showed that the analized specie must have at least 400pb to not compromise the correct genera identification.
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Composição, riqueza e abundância de espécies de anfíbios na região do médio rio Xingú

LIMA, Amanda André January 2009 (has links)
Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-09-17T16:45:34Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaAbundancia.pdf: 2307117 bytes, checksum: 8e17aa09c5a397e9c96c23508389ee2d (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-09-19T12:46:06Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaAbundancia.pdf: 2307117 bytes, checksum: 8e17aa09c5a397e9c96c23508389ee2d (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-19T12:46:06Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_ComposicaoRiquezaAbundancia.pdf: 2307117 bytes, checksum: 8e17aa09c5a397e9c96c23508389ee2d (MD5) Previous issue date: 2009 / Este estudo teve como objetivo inventariar a fauna de anfíbios nos diferentes hábitats da região do Médio Rio Xingu. Para tanto, foram selecionadas seis localidades, sendo as amostragens realizadas em três incursões, entre novembro de 2007 e março de 2008, totalizando 48 dias. Foram identificados seis tipos de hábitats na região amostrada: floresta de terra-firme, floresta sazonalmente alagável (várzea), margem do rio, “pedral”, lagoa e área alterada. Para a coleta de dados foram utilizadas duas metodologias: armadilhas de interceptação e queda e procura ativa. As armadilhas foram instaladas apenas nas áreas de floresta de terra-firme, enquanto a procura ativa foi empregada em todos os tipos de hábitats identificados. As amostragens resultaram no registro de 56 espécies de anfíbios e outras oito espécies foram identificadas e registradas em estudos anteriores na área. A diversidade e riqueza de espécies foram maiores na localidade Caracol, onde predominou a floresta de terra-firme, e menor na localidade Ilha Grande, dominada por floresta sazonalmente alagável. Foram registrados nove modos reprodutivos na área de estudo, sendo todos observados na floresta de terra-firme e apenas três nos “pedrais”, o que parece refletir a baixa heterogeneidade ambiental dessa área. Para comparar as localidades estudadas foram realizadas duas análises de similaridade, uma para cada metodologia de coleta utilizada. A análise de similaridade dos dados de procura ativa apontou maior semelhança na composição das espécies entre as áreas de floresta de terra-firme do que entre os outros hábitats. A análise de agrupamento realizada entre a composição de espécies obtida nesse estudo e outros levantamentos realizados na Amazônia agrupou esta área com outra também localizada no Médio Xingu. / This study aimed to identify the amphibian fauna of different habitats in the region of the Middle Rio Xingu. We selected six sites, with samples taken from three breaths, between November 2007 and March 2008, totaling 48 days. We identified six types of habitats in the region: terra-firme forest, seasonally flooded forest (lowland), banks of the river, "pedral”, pond area and area with antropic disturbance. For data collection were used two field sampling methods: pitfall traps with drift fences and visual surveys. The traps were installed only in areas of terra-firme forest, while visual survey was employed in all types of habitats identified. The sampling resulted in the record of 56 species of amphibians and eight species were identified and recorded in previous studies in the area. Species diversity and richness were higher in Caracol site, where the predominance of the terra-firme forest was observed, and lower in the Ilha Grande, which is dominated by seasonally flooded forest. Nine reproductive modes were recorded in the study area, all found in the terra-firme forest and only three in the "pedral" which may reflect the low environment heterogeneity of this area. Two tests of similarity were performed to compare study sites, one for each method of collection. Similarity analysis of the data from visual surveys showed more similarity for species composition between areas of terra-firme forest than the other habitats. Cluster analysis between this study and other surveys conducted in the Amazon grouped the study area to another area also located in the Middle Xingu.
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Distribuição e deslocamento altitudinais de aves na Mata Atlântica, com ênfase em beija-flores. / Distribution and altitudinal movements of birds in the Brazilian Atlantic Forest, with emphasis in hummingbirds

Luciana Barçante Ferreira 03 July 2013 (has links)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A distribuição da biodiversidade está associada aos fatores espaciais, ambientais e biológicos. Esses fatores influenciam a dinâmica das comunidades biológicas, gerando diferenças na distribuição e na abundância de espécies em escalas local e regional, além de criarem variações nos processos populacionais e nos deslocamentos dos animais. Um exemplo é a variação na distribuição e estrutura das comunidades de aves em gradientes altitudinais. Entretanto, não há um consenso sobre o padrão de distribuição da biodiversidade nesses gradientes, sendo reconhecidos quatro padrões de distribuição altitudinal de aves. Nesse contexto, a presente tese teve como objetivo geral estudar algumas das respostas ecológicas das aves à altitude. No primeiro capítulo, avaliamos o conhecimento sobre as migrações altitudinais de aves por meio por meio de uma revisão da literatura científica. Encontramos 84 estudos, a maioria na região Neotropical. Nesses estudos, constatamos 380 espécies de aves que realizam essas migrações, sendo insetívoros e nectarívoros os principais grupos tróficos envolvidos. Esses estudos também mostram que fatores bióticos e abióticos podem interagir para explicar as migrações altitudinais. Os deslocamentos para altitudes mais elevadas podem ser explicados principalmente pela disponibilidade de recursos e o menor risco de predação. Enquanto que os deslocamentos para baixas altitudes podem se relacionar, principalmente, às limitadas oportunidades de forrageamento e à competição. No segundo capítulo analisamos a distribuição regional de beija-flores na Mata Atlântica, por meio do uso de mapas de distribuição de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. Encontramos variações na composição das espécies de beija-flores em relação à altitude, mas, um conjunto de fatores pode explicar essas variações na composição. Nossos resultados mostraram que além da variaçãovariação altitudinal, variação altitudinal, variação altitudinal, variação altitudinal, o efeito do componente espacial (latitude e longitude) e das variáveis ambientais correlacionadas a ele foram importantes na distribuição das aves nas áreas nas áreas estudadas. No terceiro capítulo, estudamos, estudamos a distribuição altitudinal das aves (e de beija-flores) de sub-bosque em cinco altitudes na Reserva Ecológica de Guapiaçu (170 e 370 m) contígua ao Parque Estadual dos Três Picos (570, 770 e 1.000 m), no estado do Rio de Janeiro. Coletamos dados bimestralmente (julho/2010 a junho/2011) e mensalmente (agosto/2011 a julho/2012). Utilizamos o método de captura-marcação-recaptura com dez redes de neblina (12 x 2,5 m, malha de 32 mm) expostas no sub-bosque por sete horas/dia em cada ponto amostral por campanha. Observamos também os beija-flores no sub-bosque, mensalmente, em transecções lineares (400 m de extensão). Capturamos 95 espécies de aves (53% endêmicas de Mata Atlântica), incluindo 10 espécies de beija-flores (oito endêmicos). Detectamos a maior riqueza em 770 m e a menor em 170 m de altitude. Não encontramos relação entre a riqueza das aves e a altitude. Entretanto, encontramos diferenças na composição, riqueza, abundância e na organização trófica das aves nas cinco altitudes amostradas, sendo 170 m, frequentemente, diferente das demais altitudes. Para os beija-flores amostrados com as duas metodologias (captura e observação; 13 espécies), não encontramos diferenças na composição e riqueza nas cinco altitudes. A diversidade e os elevados endemismos registrados na área ressaltam a importância da região para as aves da Mata Atlântica e para preservação dessas no estado do Rio de Janeiro. / Biodiversity distribution is associated to spatial, environmental and biological factors. These factors influence the biological communities dynamics, generating differences in species distribution and abundance, both locally and regionally, and also creating variation in population processes and in animal movements. Variation in the distribution and structure of bird communities in altitudinal gradients is an example, but, there is no consensus about the pattern of altitudinal distribution for birds, and four different patterns are recognized. In this context, the present thesis intended to evaluate the ecological responses of birds to altitude. In the first chapter, we reviewed the literature to evaluate the state of the art about birds altitudinal movements/migrations. We found 84 studies, most conducted in the Neotropics. In these studies, authors reported 380 species of birds performing some kind of altitudinal migration, with insectivores and nectarivores the main trophic guilds involved. The studies also showed that there is a set of interacting biotic and abiotic factors that can explain altitudinal migration. Movement to higher altitudes can be explained mainly by resource availability and low predation risk, while migration to lower altitudes appears to be related to competition and limited foraging opportunities. In the second chapter, we analyzed the regional distribution of hummingbirds in the Brazilian Atlantic Forest, using distribution maps and information available in the literature. We found variation in hummingbird species composition in relation to altitude, but a set of factors could probably explain this variation. Our results showed that in addition to the altitudinal effect, the spatial component (latitude and longitude) related to environmental variables were also important to evaluate the birds distributions. In the third chapter, we investigated the altitudinal distribution of birds (and hummingbirds) in five altitudes in the Ecological Reserve of Guapiaçu (170 and 370 m) contiguous to the Três Picos State Park (570, 770 and 1000 m), Rio de Janeiro state. Data were collected bimonthly (July/2010 to June/2011) and monthly (August/2011 to July/2012), using a capture-marking-recapture method with mist-nets (12 x 2.5 m, 32 mm mesh) opened in the undergrowth for 7 hours/day in each sampling point. We also collected data on hummingbirds monthly using linear transects (400 m long). We captured 95 bird species (53% endemic to the Atlantic Forest), including 10 hummingbird species (8 endemic). The highest species richness was found at the altitude of 770 m and the lowest species richness was found at the altitude of 170 m. We did not find a relationship between altitude and bird richness. However, we found differences in the composition, richness, abundance and in the trophic organization of birds in the five altitudes, with the altitude of 170 m being different from the others in most cases. For hummingbirds sampled with both methods (captured with mist-nets and observed; 13 species), we did not find differences in the composition and in the richness in all five studied altitudes. Diversity and the higher endemism recorded for the area emphasize the importance of the region for the conservation of the Atlantic Forest birds in Rio de Janeiro state.
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Perturbação hidrológica, estabilidade e diversidade de macroinvertebrados em uma zona úmida (lagoas intermitentes) do semi-árido brasileiro.

Silva-Filho, Manoel Inácio 26 March 2004 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TeseMISF.pdf: 3645555 bytes, checksum: 649d313f53ba46c06f47ca3a81094250 (MD5) Previous issue date: 2004-03-26 / Financiadora de Estudos e Projetos / Intermittent shallow lakes are a kind of wetland of great importance in the Brazilian semiarid area, being characterized by hydrological extremes of flood and drought. These shallow lakes are good model for ecological study because they have discrete boundaries, and are subject to disturbance processes such as drying. The goal of this study was to analyse, in according to the conceptual mark of natural disturbances and ecological stability, the diversity and stability of the macroinvertebrates in three Brazilian semi-arid intermittent lakes during two hydrological cycles. In this study, I also compare the diversity of the macroinvertebrate communities to the hydrological disturbance; analyse the degree of resilience and resistance of the community to the drought, as well as, the relationship between diversity and stability in the community studied. Furthermore, I accomplished the inventory of the fauna of macroinvertebrates of 33 intermittent shallow lakes widespread in the Paraibano semi-arid. The results of this study suggest that (i) flooding and drought are the main disturbance agents in these shallow lakes, which are events of great importance to explain the model of macroinvertebrates succession; (ii) in the lakes studied I did not determined the pattern of macroinvertebrate diversities, because a peculiar pattern of diversity seemed to occur in each hydrological cycle; (iii) the species richness was relatively high and the number of individuals small; (iv) the macroinvertebrate populations varied substantially during the hydrological cycle due to variation of the water level and the impacts of the drought; (v) the resistance and resilience of the macroinvertebrate communities to drought demonstrated to be relatively high; and (vi) the variability of the total biomass of macroinvertebrate communities was lower in the lake that exhibited high species richness, while the variability of the abundance of the populations in each species was lower in the lakes with larger species richness of macroinvertebrates. / As lagoas intermitentes são um tipo de zona úmida de grande importância na região semi-árida brasileira, sendo caracterizadas por extremos hidrológicos de cheia e de seca. Estas lagoas representam excelentes modelos para estudos ecológicos, pois apresentam limites bem distintos e estão sujeitas a processos de perturbação hidrológica. O objetivo principal deste estudo foi analisar, dentro do marco conceitual de perturbações naturais e estabilidade ecológica, a diversidade e a estabilidade dos macroinvertebrados em três lagoas intermitentes do semi-árido paraibano durante dois ciclos hidrológicos. Neste estudo também foi comparado o padrão da diversidade da comunidade de macroinvertebrados frente à perturbação hidrológica; analisado o grau de resiliência e de resistência da comunidade frente à seca, assim como, a relação entre diversidade e estabilidade das comunidades estudadas. Além disso, foi realizado o inventário da fauna de macroinvertebrados de 33 lagoas intermitentes espalhadas pelo semi-árido paraibano. Os resultados deste estudo sugerem que (i) a cheia e a seca são os principais agentes de perturbação nestas lagoas, sendo estes eventos de grande importância para explicar o modelo de sucessão dos macroinvertebrados; (ii) não foi determinado o padrão de diversidade dos macroinvertebrados, pois parece ter havido um modelo peculiar de diversidade em cada ciclo hidrológico; (iii) a riqueza de espécies foi relativamente alta, entretanto o número de indivíduos foi baixo; (iv) as populações de macroinvertebrados variam substancialmente durante o ciclo hidrológico em função da variação do nível de água e dos impactos da seca; (v) a resistência e a resiliência da comunidade de macroinvertebrados frente à seca demonstraram ser relativamente altas; e (vi) a variabilidade da biomassa total da comunidade de macroinvertebrados foi menor na lagoa que apresentou maior riqueza, enquanto que a variabilidade da abundância das populações em cada espécie foi menor nas lagoas com maior riqueza de macroinvertebrados.
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Distribuição e deslocamento altitudinais de aves na Mata Atlântica, com ênfase em beija-flores. / Distribution and altitudinal movements of birds in the Brazilian Atlantic Forest, with emphasis in hummingbirds

Luciana Barçante Ferreira 03 July 2013 (has links)
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A distribuição da biodiversidade está associada aos fatores espaciais, ambientais e biológicos. Esses fatores influenciam a dinâmica das comunidades biológicas, gerando diferenças na distribuição e na abundância de espécies em escalas local e regional, além de criarem variações nos processos populacionais e nos deslocamentos dos animais. Um exemplo é a variação na distribuição e estrutura das comunidades de aves em gradientes altitudinais. Entretanto, não há um consenso sobre o padrão de distribuição da biodiversidade nesses gradientes, sendo reconhecidos quatro padrões de distribuição altitudinal de aves. Nesse contexto, a presente tese teve como objetivo geral estudar algumas das respostas ecológicas das aves à altitude. No primeiro capítulo, avaliamos o conhecimento sobre as migrações altitudinais de aves por meio por meio de uma revisão da literatura científica. Encontramos 84 estudos, a maioria na região Neotropical. Nesses estudos, constatamos 380 espécies de aves que realizam essas migrações, sendo insetívoros e nectarívoros os principais grupos tróficos envolvidos. Esses estudos também mostram que fatores bióticos e abióticos podem interagir para explicar as migrações altitudinais. Os deslocamentos para altitudes mais elevadas podem ser explicados principalmente pela disponibilidade de recursos e o menor risco de predação. Enquanto que os deslocamentos para baixas altitudes podem se relacionar, principalmente, às limitadas oportunidades de forrageamento e à competição. No segundo capítulo analisamos a distribuição regional de beija-flores na Mata Atlântica, por meio do uso de mapas de distribuição de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. de mapas distribuição e informações disponíveis na literatura. Encontramos variações na composição das espécies de beija-flores em relação à altitude, mas, um conjunto de fatores pode explicar essas variações na composição. Nossos resultados mostraram que além da variaçãovariação altitudinal, variação altitudinal, variação altitudinal, variação altitudinal, o efeito do componente espacial (latitude e longitude) e das variáveis ambientais correlacionadas a ele foram importantes na distribuição das aves nas áreas nas áreas estudadas. No terceiro capítulo, estudamos, estudamos a distribuição altitudinal das aves (e de beija-flores) de sub-bosque em cinco altitudes na Reserva Ecológica de Guapiaçu (170 e 370 m) contígua ao Parque Estadual dos Três Picos (570, 770 e 1.000 m), no estado do Rio de Janeiro. Coletamos dados bimestralmente (julho/2010 a junho/2011) e mensalmente (agosto/2011 a julho/2012). Utilizamos o método de captura-marcação-recaptura com dez redes de neblina (12 x 2,5 m, malha de 32 mm) expostas no sub-bosque por sete horas/dia em cada ponto amostral por campanha. Observamos também os beija-flores no sub-bosque, mensalmente, em transecções lineares (400 m de extensão). Capturamos 95 espécies de aves (53% endêmicas de Mata Atlântica), incluindo 10 espécies de beija-flores (oito endêmicos). Detectamos a maior riqueza em 770 m e a menor em 170 m de altitude. Não encontramos relação entre a riqueza das aves e a altitude. Entretanto, encontramos diferenças na composição, riqueza, abundância e na organização trófica das aves nas cinco altitudes amostradas, sendo 170 m, frequentemente, diferente das demais altitudes. Para os beija-flores amostrados com as duas metodologias (captura e observação; 13 espécies), não encontramos diferenças na composição e riqueza nas cinco altitudes. A diversidade e os elevados endemismos registrados na área ressaltam a importância da região para as aves da Mata Atlântica e para preservação dessas no estado do Rio de Janeiro. / Biodiversity distribution is associated to spatial, environmental and biological factors. These factors influence the biological communities dynamics, generating differences in species distribution and abundance, both locally and regionally, and also creating variation in population processes and in animal movements. Variation in the distribution and structure of bird communities in altitudinal gradients is an example, but, there is no consensus about the pattern of altitudinal distribution for birds, and four different patterns are recognized. In this context, the present thesis intended to evaluate the ecological responses of birds to altitude. In the first chapter, we reviewed the literature to evaluate the state of the art about birds altitudinal movements/migrations. We found 84 studies, most conducted in the Neotropics. In these studies, authors reported 380 species of birds performing some kind of altitudinal migration, with insectivores and nectarivores the main trophic guilds involved. The studies also showed that there is a set of interacting biotic and abiotic factors that can explain altitudinal migration. Movement to higher altitudes can be explained mainly by resource availability and low predation risk, while migration to lower altitudes appears to be related to competition and limited foraging opportunities. In the second chapter, we analyzed the regional distribution of hummingbirds in the Brazilian Atlantic Forest, using distribution maps and information available in the literature. We found variation in hummingbird species composition in relation to altitude, but a set of factors could probably explain this variation. Our results showed that in addition to the altitudinal effect, the spatial component (latitude and longitude) related to environmental variables were also important to evaluate the birds distributions. In the third chapter, we investigated the altitudinal distribution of birds (and hummingbirds) in five altitudes in the Ecological Reserve of Guapiaçu (170 and 370 m) contiguous to the Três Picos State Park (570, 770 and 1000 m), Rio de Janeiro state. Data were collected bimonthly (July/2010 to June/2011) and monthly (August/2011 to July/2012), using a capture-marking-recapture method with mist-nets (12 x 2.5 m, 32 mm mesh) opened in the undergrowth for 7 hours/day in each sampling point. We also collected data on hummingbirds monthly using linear transects (400 m long). We captured 95 bird species (53% endemic to the Atlantic Forest), including 10 hummingbird species (8 endemic). The highest species richness was found at the altitude of 770 m and the lowest species richness was found at the altitude of 170 m. We did not find a relationship between altitude and bird richness. However, we found differences in the composition, richness, abundance and in the trophic organization of birds in the five altitudes, with the altitude of 170 m being different from the others in most cases. For hummingbirds sampled with both methods (captured with mist-nets and observed; 13 species), we did not find differences in the composition and in the richness in all five studied altitudes. Diversity and the higher endemism recorded for the area emphasize the importance of the region for the conservation of the Atlantic Forest birds in Rio de Janeiro state.

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