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Sistemática molecular e implicações para a conservação de uma linhagem endêmica da Amazônia: o gênero Hylexetastes Sclater, 1889 (Aves: Dendrocolaptidae) / Molecular systematics of the Amazonian endemic genus Hylexetastes (AVES: DENDROCOLAPTIDAE): taxonomic and conservation implications

RODRIGUEZ, Roxiris Auxiliadora Azuaje 07 March 2017 (has links)
Submitted by Rose Suellen (rosesuellen@ufpa.br) on 2018-01-29T15:44:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_SistematicaMolecularImplicacoes.pdf: 2318600 bytes, checksum: f22911beb3366852ff5c9d9d3df98ba1 (MD5) / Approved for entry into archive by Rose Suellen (rosesuellen@ufpa.br) on 2018-01-29T15:44:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_SistematicaMolecularImplicacoes.pdf: 2318600 bytes, checksum: f22911beb3366852ff5c9d9d3df98ba1 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-29T15:44:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_SistematicaMolecularImplicacoes.pdf: 2318600 bytes, checksum: f22911beb3366852ff5c9d9d3df98ba1 (MD5) Previous issue date: 2017-03-07 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O gênero Hylexetastes é endêmico da floresta Amazônica. Atualmente, duas espécies são aceitas no gênero (H. perrotti e H. stresemannii), cada uma dividida em três subespécies. No entanto, alguns autores defendem que as subespécies de H. perrotti devem ser consideradas como espécies plenas. Em particular, H. p. brigidai é um táxon endêmico do Pará e Mato Grosso e parece ter a menor área de distribuição. Esta linhagem distribui-se pela região mais desmatada dentro do bioma e assim o seu status taxonômico é de particular preocupação para conservação. Até agora, somente caracteres morfológicos foram avaliados para definição taxonômica deste gênero. Portanto, neste estudo apresentamos uma hipótese filogenética molecular para ajudar a resolver as incertezas taxonômicas dentro do gênero. Foram sequenciados fragmentos de dois marcadores mitocondriais (Cytb e ND2) e três marcadores nucleares (BF5, G3PDH e MUSK) em 58 espécimes de Hylexetastes. Além disso, foram elaboradas modelagens de nicho ecológico para cada uma das linhagens identificadas, para avaliar sua potencial área de distribuição, requerimentos climáticos e sua a vulnerabilidade ao desmatamento. As análises filogenéticas sustentam a designação de H. perrotti, H. uniformis e H. brigidai como espécies plenas, sendo que H. perrotti parece ser espécie irmã de H. stresemanni e não dos demais táxons considerados co-específicos. Além disso, foi possível distinguir a presença de duas Unidades Evolutivas Significativas dentro de H. uniformis. Cada um destes táxons está distribuído em diferentes interflúvios / áreas de endemismo da bacia Amazônica. Em particular, confirma-se o status de espécie plena para H. brigidai, endêmica da segunda área de endemismo Amazônica com maior desmatamento. Assim, sugerimos a continuada avaliação aprofundada do seu status de conservação para promover sua preservação. / The genus Hylexetastes is endemic to the Amazon rainforest. Currently, two species are accepted in the genus (H. perrotti and H. stresemannii), each one divided into three subspecies. Nevertheless, some authors defend that the subspecies of H. perrotti should be considered as full species. In particular, H. p. brigidai is an endemic taxon from Pará and Mato Grosso and seems to have the smallest distribution area. This lineage is distributed by the most deforested region within the biome and thus its taxonomic status is of particular concern for conservation. So far, only morphological characters have been evaluated for taxonomic definition of this genus. Therefore, in this study we present a molecular phylogenetic hypothesis to help solve the taxonomic uncertainties within the genus. Fragments of two mitochondrial markers (Cytb and ND2) and three nuclear markers (BF5, G3PDH and MUSK) were sequenced on 58 Hylexetastes specimens. In addition, ecological niche modeling was developed for each of the identified strains to evaluate their potential distribution area, climatic requirements and their vulnerability to deforestation. The phylogenetic analyzes support the designation of H. perrotti, H. uniformis and H. brigidai as full species, and H. perrotti seems to be a sister species of H. stresemanni and not of the other taxa considered co-specific. In addition, it was possible to distinguish the presence of two Significant Evolutionary Units within H. uniformis. Each of these taxa are distributed in different interfluvial / endemic areas of the Amazon basin. In particular, it confirms the status of full species for H. brigidai, endemic to the second area of Amazonian endemism with greater deforestation. Thus, we suggest the continued in-depth evaluation of its conservation status to promote its preservation.
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Filogenia da tribo Attacobiini Roewer, 1955 (Araneae, Corinnidae, Corinninae)

PEREIRA FILHO, José Moisés Batista 02 April 2015 (has links)
Submitted by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-06T16:55:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) / Approved for entry into archive by JACIARA CRISTINA ALMEIDA DO AMARAL (jaciaramaral@ufpa.br) on 2018-06-06T16:57:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-06T16:57:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Filogenia_da_tribo_Attacobiini_Roewer_1955.pdf: 1908567 bytes, checksum: 9c6d549ced312aa3158f4555c4947fe2 (MD5) Previous issue date: 2015-04-02 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A cladistic analysis of tribe Attacobiini (Corinnidae, Corinninae) with 17 taxa and 109 characters is presented. The outgroup is composed by four species (Castianeira aff rubicunda ACR; Xeropigo cotijuba; Septentrinna yucatan and Falconina gracilis) all of them represented by males and females. The ingroup is represented by 13 Attacobiini species, seven of which represented by both sexes (Attacobius TOC; A. attarum; A. verhaaghi; A. lamellatus; A. uiriri; A. blakei and A. carranca), three represented only by females (A. luederwaldti; A. nigripes and A. kitae) and three represented only by males (Ecitocobius comissator; Attacobius PAR and A. tucurui). Regarding to terminals, the present data matrix represent an increase of two species in relation to a previous analysis of the Tribe. The availability of data was improved by adding character states on genitalic features for three terminals, of which the counterpart sex was unknown at the time in which that previous analysis was made (males of A. verhaagui and females of A. blakei and A. uiriri). Furthermore, several characters used in the previous analysis were re-interpreted and some new characters were proposed. A single tree was obtained under equal weights. Attacobinni and Attacobius were retrieved as monophyletic groups but the groups of species of Attacobius depicted here are considerably different from those recognized in the previous analysis. The exact solution under equal weights and all characters running unordered resulted in a fully resolved, single most parsimonious tree. As in the previous analysis, the bettersupported clades were Attacobiini and Attacobius. However, the groups of Attacobius species recovered here are considerably different from the ones recovered previously, with the exception of an apical clade composed by A. nigripes, A. kitae, A. attarum and A. luederwaldti, which was recognized in both analyses as the best supported group within the genus.
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Filogeografia comparada de aves com distribuição trans-amazônica e trans-andina

MIRANDA, Leonardo de Sousa 28 May 2015 (has links)
Submitted by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-05-08T14:37:39Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_FilogeografiaComparadaAves.pdf: 3337628 bytes, checksum: 5035a96d97c51224b6f2cf9dc26c319c (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-05-08T14:38:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_FilogeografiaComparadaAves.pdf: 3337628 bytes, checksum: 5035a96d97c51224b6f2cf9dc26c319c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-08T14:38:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_FilogeografiaComparadaAves.pdf: 3337628 bytes, checksum: 5035a96d97c51224b6f2cf9dc26c319c (MD5) Previous issue date: 2015-05-28 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As florestas Neotropicais possuem a avifauna mais rica do mundo, com muitos táxons endêmicos; e os padrões de distribuição e variação fenotípica dos organismos nessa região são muito complexos. Muitas hipóteses já foram propostas para tentar explicar os processos de diversificação que resultaram na atual diversidade e nos padrões de endemismo encontrados nessa região. A maior parte dessas hipóteses não havia sido testada devido à dificuldade de falseação das mesmas num contexto filogenético. Contudo, com o acumulo de informações e a disponibilidade de novos métodos analíticos, estão sendo desenvolvidos trabalhos voltados à análise das hipóteses biogeográficas a partir da descrição e dos testes de suas premissas. Estudos de paleoclimatologia e paleoecologia associados a informações da história geológica de uma área produzem cenários que, por sua vez, levam a formulação de hipóteses de diversificação. O contraste destas hipóteses com os padrões de distribuição e relações filogenéticas entre os organismos pode fornecer informações acerca dos eventos de diversificação que influenciaram a origem das espécies atuais. Dessa forma, o principal objetivo desse trabalho é usar dados moleculares de duas espécies de aves com distribuição trans-Amazônica e trans-Andina para contrastar as hipóteses de diversificação, incorporando informações sobre tempos relativos de divergência, áreas ancestrais e meios de diversificação, e realizando inferências sobre quais eventos no passado podem ter influenciado os processos de cladogênese. E finalmente foi avaliado se os padrões espaciais e temporais de divergência entre os filogrupos das espécies estudadas são congruentes para as mesmas barreiras consideradas (por exemplo, principais rios Amazônicos e a cordilheira dos Andes).
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Descrição de um gênero novo e três espécies novas de Edessinae (Hemiptera: Heteroptera: Pentatomidae)

ALMEIDA, Flávio Roberto de Albuquerque 07 December 2017 (has links)
Submitted by Carmen Torres (carmensct@globo.com) on 2018-02-02T17:50:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DescricaoGeneroNovo.pdf: 2491281 bytes, checksum: 1713bd7a42c75e2872f49b27c6f14589 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2018-02-07T17:35:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DescricaoGeneroNovo.pdf: 2491281 bytes, checksum: 1713bd7a42c75e2872f49b27c6f14589 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-07T17:35:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DescricaoGeneroNovo.pdf: 2491281 bytes, checksum: 1713bd7a42c75e2872f49b27c6f14589 (MD5) Previous issue date: 2017-12-07 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A família Pentatomidae é a quarta mais diversa dentre Heteroptera, compreendendo cerca de 4.700 espécies dividas em, aproximadamente, 800 gêneros. Pentatomidae é um grupo monofilético caracterizado pela perda das gonapófises 8, redução e fusionamento das gonapófises 9 aos gonocoxitos 9, ausência do gonângulo e ductos do receptáculo dilatados e invaginados, formando três paredes distintas. Dentre as subfamílias de Pentatomidae, Edessinae é a segunda mais diversa, com cerca de 320 espécies divididas em nove gêneros: Edessa Fabricius, 1803, Ascra Say, 1832, Brachystethus Laporte, 1832, Peromatus Amyot & Serville, 1843, Olbia Stål, 1862, Pantochlora Stål, 1870, Doesburgedessa Fernandes, 2010, Paraedessa Silva & Fernandes, 2013 e Grammedessa Correia & Fernandes, 2016. O gênero Edessa apresenta diversos problemas taxonômicos e nomenclaturais devido a falta de uma diagnose clara e objetiva. Dessa forma, as espécies que apresentam características gerais da subfamília e que não se enquadram na diagnose dos outros gêneros de Edessinae são consideradas como pertencentes à Edessa. Esta prática tornou o gênero um “depósito” de espécies com limites indefinidos. A proposta para o gênero é revisá-lo a partir de grupos de espécies com características semelhantes entre si, possivelmente sinapomorfias. Um destes enigmáticos grupos de Edessa é composto por Edessa celsa Distant, 1890 e três espécies novas. No presente trabalho um novo gênero composto por estas quatro espécies é descrito e comparado ao subgênero Hypoxys, o qual apresenta características comuns. Diagnoses, ilustrações do processo metasternal e genitália interna e externa, fotografias das vistas dorsal e ventral e um mapa de distribuição são apresentados. Uma chave dos gêneros de Edessinae e de Edessinae gen. n. também são apresentadas. Genitálias de machos e fêmeas de Edessa celsa são descritas pela primeira vez. A distribuição de E. celsa é ampliada para Costa Rica e México. O lectótipo de E. celsa é designado no presente trabalho. / The family Pentatomidae is the fourth most diverse among Heteroptera, comprising about 4.700 species divided in, approximately, 800 genera. The family is a monophyletic taxa characterized by the loss of gonapophyses 8, gonapophyses 9 reduced and fused to gonocoxites 9, gonangulum absent and the ductus receptaculi dilated and invaginated, forming three distinct walls. The subfamily Edessinae is the second most diverse, comprising about 320 species divided in nine genera: Edessa Fabricius, 1803 (about 300 species), Ascra Say, 1832 (14 species), Brachystethus Laporte, 1832 (10 species), Peromatus Amyot & Serville, 1843 (seven species), Olbia Stål, 1862 (three species), Pantochlora Stål, 1870 (one species), Doesburgedessa Fernandes, 2010 (five species), Paraedessa Silva & Fernandes, 2013 (nine species) and Grammedessa Correia & Fernandes, 2016 (12 species). The genus Edessa has many taxonomic and nomenclatural problems related to the lack of a reliable diagnosis. In this way, species which have general characteristics of the subfamily and did not fit in the diagnostic features of other genera of Edessinae are considered to belonging to Edessa. This practice made the genus a "deposit" of species with indefinite limits. The proposal for the genus is to revise Edessa in groups of species sharing morphological distinctive characters (possible synapomorphies). One of these enigmatic groups of Edessa is formed by Edessa celsa Distant, 1890 and three allied new species. Here we describe a new genus for these four species sharing a unique set of characteristics and compare with Hypoxys, subgenus of Edessa with similar facies. Diagnosis, illustrations of the metasternal process and external and internal genitalia, photographs of the dorsal and ventral view, and a distributional map are provided. A key to the genera belonging to Edessinae and a key to the species of Plagaedessa are also provided. Male and female genitalia of Plagaedessa celsa n. comb. are described for the first time. Distribution of P. celsa is extended to Costa Rica and Mexico. The lectotype of Edessa celsa is here designated.
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O ensino de sistemática e taxonomia biológica no ensino médio da rede estadual no município de São Carlos - SP / Teaching of systematics and biological taxonomy in high school of the state in the county São Carlos - SP

Liporini, Thalita Quatrocchio [UNESP] 26 February 2016 (has links)
Submitted by Thalita Quatrocchio Liporini null (tha_liporini86@yahoo.com.br) on 2016-04-16T18:17:43Z No. of bitstreams: 1 LIPORINI_THALITA_VERSÃO_FINAL_dissertacao (1).pdf: 2310518 bytes, checksum: a36dd4cda66295d8882088696870900e (MD5) / Approved for entry into archive by Felipe Augusto Arakaki (arakaki@reitoria.unesp.br) on 2016-04-19T13:20:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 liporini_tq_me_bauru.pdf: 2310518 bytes, checksum: a36dd4cda66295d8882088696870900e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-19T13:20:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 liporini_tq_me_bauru.pdf: 2310518 bytes, checksum: a36dd4cda66295d8882088696870900e (MD5) Previous issue date: 2016-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A presente dissertação teve como propósito investigar como os professores de Biologia compreendem, organizam e ensinam a Sistemática e a Taxonomia Biológica na disciplina de Biologia da rede estadual no município de São Carlos – SP. Para tanto, partimos da hipótese que os conteúdos de Biologia são trabalhados de modo memorístico e fragmentado e que o ensino dos conteúdos trazidos pela Sistemática e Taxonomia durante os anos do Ensino Médio podem ser norteadores e necessários para que haja a contextualização e compreensão das demais áreas que a Biologia contempla, entre elas a Zoologia, a Botânica, Evolução e de todo o conhecimento biológico. Desse modo, o objetivo geral desta pesquisa é verificar como se dá a organização, o entendimento e o trabalho em sala de aula, referentes ao ensino de Sistemática e de Taxonomia, a partir da perspectiva de professores efetivos da rede estadual de ensino do município de São Carlos, interior do estado de São Paulo. No que se diz respeito aos capítulos teóricos deste estudo, buscou-se tecer algumas considerações acerca do histórico da Sistemática e Taxonomia Biológica como áreas que trazem conteúdos e temas que são considerados como saberes clássicos. Além disso, uma discussão sobre alguns aspectos relevantes do ensino de Biologia e do ensino de Sistemática e Taxonomia durante os anos que compreendem o Ensino Médio também foram executadas, bem como um breve levantamento sobre as pesquisas que estão ocorrendo em relação ao ensino das áreas estudadas nesta dissertação. Para tanto, esta pesquisa de caráter qualitativo, contou com a participação de quinze professores efetivos da disciplina de Biologia, que primeiramente responderam a um questionário que contemplou questões específicas que versavam sobre três temáticos: conceitos específicos, metodologia de trabalho em sala de aula e formação docente. Em um segundo momento, a fim de aprofundar as respostas obtidas no primeiro instrumento de pesquisa, cinco docentes participantes foram submetidos a um roteiro de entrevista semiestruturada, que contou com quatro grandes momentos: conteúdos, currículo, metodologia e perspectivas futuras. As análises dos dados foram realizadas de acordo com a categorização das respostas dos participantes por meio da análise de conteúdo. Os resultados e discussões dos dados obtidos por meio dos dois instrumentos de coleta foram apresentados mediante quatro grandes eixos, sendo que houve a interlocução das respostas obtidas no questionário e na entrevista. / This thesis aims to investigate how the biology teachers understand, organize and teach Systematic and Biological taxonomy in biology courses of the state in São Carlos - SP. The starting point was the hypothesis that the Biology contents are worked memoristic and piecemeal and that the teaching of content brought by Systematics and Taxonomy during the years of high school can be guiding and necessary for there to contextualization and understanding of other areas that includes biology, including Zoology, Botany, Evolution and all the biological knowledge. Thus, the objective of this research is to see how is the organization, understanding and work in the classroom for the teaching of Systematics and Taxonomy, from the perspective of effective teachers teaching of the state of the city of San Carlos, upstate São Paulo. As regards the theoretical chapters of this study, we attempted to make a few remarks about the history of Systematic and Biological Taxonomy as areas that bring content and themes that are regarded as classics knowledge. In addition, a discussion of some relevant aspects of teaching Biology and Systematics of education and Taxonomy for years to understand the high school were also performed, as well as a brief survey of the research taking place in relation to the teaching of the areas studied this dissertation. To this end, this qualitative research, with the participation of fifteen effective teachers of Biology, who first answered a questionnaire that included specific questions that focused on three thematic: specific concepts, methodology of work in the classroom and training teacher. In a second step, in order to deepen the responses obtained in the first survey instrument, five participating teachers underwent a semi-structured interview guide, which featured four major phases: content, curriculum, methodology and future prospects. Data analyzes were performed according to the categorization of responses from participants through content analysis. The results and discussion of the data obtained by means of the two data collection instruments were presented by four major axes, and there was a dialogue of the responses from the questionnaire and interview.

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