Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-Graduação em Farmacologia. / Made available in DSpace on 2012-10-20T22:25:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 194199.pdf: 1389325 bytes, checksum: 0d9df20cf0fb27949ef3fd34e2f0837d (MD5)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica. / Made available in DSpace on 2012-10-22T10:17:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 232766.pdf: 1361063 bytes, checksum: 53a0ce36debe115f6f7581a29868d37f (MD5) / Essa dissertação tem o objetivo de analisar a capacidade da rede CMLP de separar as espículas das piscadas em sinais de EEG (Eletroencefalograma). Já existe um grande número de trabalhos desenvolvidos com MLP#s utilizando o algoritmo backpropagation real, visando à detecção de padrões epilépticos. A opção de utilizar a rede MLP (Perceptron Multicamadas) com algoritmo backpropagation-complexo para essa verificação, está baseada em fatos tais como: (a) A média da velocidade de aprendizado da MLP com algoritmo backpropagationcomplexo é superior à velocidade média de aprendizado da rede MLP com algoritmo backpropagation-real. (b) O número de pesos e bias necessários para a MLP com algoritmo backpropagation-complexo fica em torno da metade daqueles necessários na MLP com backpropagation-real. (c) Alguns valores matemáticos reais são melhor entendidos quando considerados no plano complexo, pois considera-se um maior número de informações, que não seriam levadas em conta no plano real. Focou-se este trabalho na diferenciação entre espículas e piscadas, pois é um dos casos críticos encontrados na detecção automática de padrões em EEG (eletroencefalograma). Para a realização do mesmo, utilizou-se um banco de dados fornecido pelo MNI (Montreal Neurological Institute), de pacientes comprovadamente epilépticos, onde as espículas e piscadas foram marcadas por especialistas da área médica. O treinamento foi realizado utilizando-se 120 épocas de um segundo de duração. Os testes específicos foram feitos a partir de 600 épocas, marcadas exclusivamente para este fim. A validação dos dados foi feita através dos indicadores estatísticos sensibilidade e especificidade, onde foram obtidas taxas simultâneas em torno de 55% na classificação; e também pela análise comparativa do desempenho de redes MLP que utilizam backpropagation-real e da rede MLP com backpropagation-complexo, a qual demonstrou um desempenho superior a RMLP (Rede Perceptron Multicamadas com algoritmo backpropagation-Real) no que se refere à velocidade de treinamento, dentro da metodologia aplicada nesta análise. Também se mostrou mais eficiente na classificação de eventos espículas e piscadas, quando comparada a RMLP, dentro do parâmetro estabelecido pelas curvas ROC (Receiver Operating Characteristic). This work analises the behavior of the complex MLP (multilayer Perceptron) neural network, trained with complex backpropagation, in tasks of epileptiform patterns classification (in particular, of spikes and eye-blinks events), in electroencephalogram (EEG) signals. Despite of the development of several real MLP-based approaches to automatically detect epileptiform patterns, these systems are still jeopardized by very frequent false-positive detections, caused for example by ocular movements. Potentially, the MLP neural network with complex backpropagation presents interesting features to this application, as follows: (a) the learning speed is several times faster than in the conventional technique (real MLP); (b) the space complexity (i.e. the number of learnable parameters) is only about the half of the demanded by the real MLP; (c) and comprehension of many mathematical objects is more substantial when they are considered in the complex plane (e.g., by using the Hilbert Transform), because part of its related-information is fundamentally complex, such as the phase. In fact, we have noted that spikes and eye-blinks, which are patterns of difficult differentiation using real tools, could be separated by using a complex MLP, maybe due to this complex information, usually excluded in conventional analysis. This work uses the MNI (Montreal Neurological Institute) data bank, which is formed from seven epileptic patients. Three electroencephalographers marked the spikes and blinks events of the EEG signals. The complex MLP was trained with 120 epochs of one-second of duration, and was tested with 600 different epochs. The results have been validated with sensitivity and specificity statistical parameters, obtaining simultaneous rates of about 55% in classification. Also a qualitative comparison between results with the real MLP and the complex MLP is evaluated, showing the approach#s suitability in terms of velocity and the parameters of the ROC, (Receiver Operating Characteristic), graphics.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:15:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 330263.pdf: 3453482 bytes, checksum: 1f832a793b3be455cd4f324d500d206f (MD5) Previous issue date: 2014 / O presente estudo propõe a viabilidade da utilização de Mapas Auto-organizáveis de Kohonen (MAK) para o processo de detecção e classificação de eventos epileptiformes (EE) para o apoio ao diagnóstico de epilepsia, para tanto optou-se pelo desenvolvimento de um protótipo de sistema automatizado, utilizando técnicas de Inteligência Artificial baseado em MAK. O sistema protótipo proposto chamado de Sistema Classificador Kohonen para Eventos Epileptiformes (SCKEE) foi desenvolvido com o objetivo de obter um software protótipo com capacidade de realizar o processamento dos sinais de forma eficiente e classificar automaticamente EE em sinais de eletroencefalografia de longa duração. O SCKEE é composto por dois módulos (treinamento e teste), nos quais são utilizados uma camada de entrada com 512 neurônios e uma camada de saída com 3 possibilidades de tamanhos (100, 225 e 400 neurônios), e quatro funções de ativação de vizinhança (Discreta, Gaussiana, "Chapéu Mexicano" e "Chapéu Francês"), o qual seu funcionamento segue da seguinte forma, primeiramente, no módulo de treinamento é realizada a separação das classes de padrões apresentado ao sistema, gerando o conjunto de pesos treinados, no módulo de teste é utilizado o conjunto de pesos treinados para a classificação dos padrões a serem testados. A avalição dos dados de classificação gerados pelo SCKEE foi realizada com base nos índices de desempenho obtidos através da análise dos resultados gerados por este. Concluiu-se que a função de ativação de vizinhança "Chapéu Mexicano", no tamanho de rede de 225 neurônios, obteve os melhores resultados para os índices de desempenho avaliados: Sensibilidade de 100%, Especificidade de 91%, Seletividade Positiva e Seletividade Negativa de 90% e 100%, respectivamente e Eficiência de 95%. Com a utilização de MAK com apenas uma rede neural artificial na camada de saída, foi possível a separação e classificação dos EE com resultados promissores, no qual pode-se atribuir os excelentes resultados alcançados, ao desenvolvimento de um software exclusivo para a classificação dos EE em sinais de EEG, o que pode confirmar a viabilidade da utilização do MAK para apoio ao diagnóstico.<br> / Abstract: This study proposes the feasibility of using of Self-Organized Map (SOM) for process of detection and classification of epileptiform events (EE) to support the diagnosis of epilepsy, and opted for the development of a prototype automated system using artificial intelligence techniques based on SOM. The proposed prototype system called Kohonen Classifier System for Events Epileptiform (KCSEE) was development with the goal obtaining a prototype software capable of performing signal processing quickly and automatically classify EE in signals of electroencephalogram (EEG) of long-term. The KCSEE consists of two modules (training and test), in which are used an input layer with 512 neurons and an output layer with 3 sizes different (100, 225 and 400 neurons) and four neighborhood activation functions (Discrete, Gaussian, "Mexican Hat" and "French Hat"), which its operation is given as follows, first, in the training module is made the separation of the classes of patterns presented to the system, generating a set of trained weights, in the test module is used the set of trained weights for classification of the patterns that will be tested. The evaluation of date of classification obtained by KCSEE was performed based on the performance indices obtained by analyzing of the results generated from this. Was concluded that the "Mexican Hat" neighborhood activation function, with network size of 225 neurons, obtained the best results for performance indices evaluated: Sensitivity 100%, Specificity 91%, Positive Selectivity and Negative Selectivity 90% and 100%, respectively, and Efficiency 95%. Using SOM with only an artificial neural network in the output layer, was possible the separation and classification of EE with promising results, which can attribute the good results to the development of an exclusive software for classification of EE in signals of EEG, which can confirm the feasibility of using SOM to support the diagnosis.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T10:14:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 276062.pdf: 2021277 bytes, checksum: f869a34271a14cd372cc3f0791f8cf33 (MD5)

Foram submetidos à análise molecular, 15 isolados do vírus da bronquite infecciosa (VBI) obtidos durante o período de 1988 a 2000, de surtos à campo da Bronquite Infecciosa (BI), em aves de corte ou de postura das regiões Sul e Sudeste do Brasil. Os resultados obtidos da análise filogenética das sequências parciais dos genes da glicoproteína de espícula (S1) e da nucleoproteína (N) evidenciaram que a maior parte dos isolados estão distribuídos em dois grandes grupos; o primeiro deles mais estreitamente relacionado às estirpes do genótipo Massachusetts e o segundo constituído apenas por isolados brasileiros autóctones com uma grande diversidade em relação às estirpes ou isolados do grupo Massachusetts e de outros países ou continentes. Os sítios polimórficos mais importantes formaram-se em locais específicos e de maneira agrupada nas sequências dos genes S1 ou N e predominam em regiões codificadoras das cadeias polipeptídicas S1 e N que configuram sítios estruturais e antigênicos importantes envolvidos, na expressão de propriedades biológicas relevantes. / Fifteen Brazilian field isolates of infectious bronchitis virus (IBV); were recovered, between 1988 and 2000, from commercial broiler or layer flocks located in South and Southeast Brazilian regions. Molecular and phylogenetic analysis of partial sequences of 5\'-proximal of S1 gene and 3\'-terminus of N gene from these IBV isolates, identified two main groups; the Massachusetts group and a Brazilian indigenous group, which presenting a high diversity regarding the first group or other IBV strains from different countries and continents. The major polymorphic sites are arranged in clusters and predominate in the regions of S1 and N genes which code for relevant structural and antigenic sites responsible for the expression of important biological properties.

Infectious bronchitis virus (IBV) is the causative agent of an economically important disease of poultry. In Brazil this disease causes respiratory, renal and reproductive problems in birds of all ages, despite constant vaccination with the Massachusetts strain H120. This lack of immunological protection is known to be due the genetic variation in the spike glycoprotein of IBV, which is involved in host cell attachment, neutralization and the induction of protective immunity. Brazilian IBV variants resulting of this genetic variation are present since the 80s and this study aimed to epidemiologicaly analyze and molecularly characterize the existing variants during 2010-2015 and perform a bioinformatics analysis of the available sequences of IBV variants in a 40 year period. Of the 453 samples tested, 61.4% were positive for IBV and 75.9% of them were considered variants and were detected in birds of all ages, distributed in all five Brazilian regions. A fragment of 559-566 bp was obtained from 12 isolates, where BR-I was the predominant variant while only one isolate belonged to the BR-II genotype. Bioinformatics analysis of the sequences of 40 years of Brazilian IBV variants was performed and the ratio of non-synonymous substitutions per non-synonymous site (dn) to synonymous substitutions per synonymous site (ds) dN/dS was calculated. It revealed a predominance of codons with non-synonymous substitutions in the first third of the S1 gene and a dN/dS ratio of 0.6757, indicating that this portion of the gene was under negative selection. Additionally prediction of N-glycosilation sites showed that most of the BR-I variants (from 2003 to early 2014) present an extra site at animoacid position 20, while the newest ones lack this feature.Together these results suggest that IBV Brazilian variants had probably suffered drastic mutations in some points between the years 1983 to 2003 and after achieving an antigenic structure effective enough for invasion and replication in their hosts, the selection processes became silent. / O vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) é o agente causador de uma doença aviária economicamente importante. No Brasil, esta doença ocasiona problemas respiratórios, renais e reprodutivos em aves de todas as idades, apesar da vacinação constante com a cepa Massachusetts H120. Esta falha na proteção conferida pela vacina é ocasionada por mutações nos nucleotídeos do gene da glicoproteína da espícula, a qual está envolvida no processo de interação comas células do hospedeiro, a neutralização e a indução de imunidade protetora. As variantes brasileiras resultantes dessa mutação genética estão presentes desde os anos 80 e este estudo teve como objetivo analisar epidemiologicamente e caracterizar molecularmente os vírus variantes existentes durante 2010-2015 e realizar uma análise bioinformática das sequências disponíveis no GenBank em um período de 40 anos. Das 453 amostras analisadas, 61,4% foram positivas para IBV e 75,9% delas foram consideradas variantes e foram detectados em aves de todas as idades, distribuídos em todas as 5 regiões do Brasil. Um fragmento de 559-566 pb foi obtido a partir de 12 isolados, onde BR-I foi a variante predominante ao contrario que apenas um isolado pertencia ao genótipo BR-II. Análise bioinformática de 40 anos de variantes do IBV brasileiros revelou uma predominância de codões com as substituições não sinónimos no primeiro terço do gene S1 e uma relação dN / dS de 0,6757, indicando que esta porção do gene estava sob selecção negativa. Além disso a previsão de pontos de de N-glicosilação mostrou que a maioria das amostras variantes BR-I (entre o 2003 e início de 2014) apresentam um ponto adicional na posição 20, enquanto as variantes mais novas não apresentam esse ponto de nglicosilação. Estes resultados sugerem que as variantes brasileiras teriam sofrido mutações provavelmente drásticas em alguns pontos do genoma, entre os anos de 1983 a 2003 e depois de atingir uma estrutura antigênica eficaz o suficiente para a invasão e replicação em seus hospedeiros, o processo de seleção mudou para seleção negativa.

Foram submetidos à análise molecular, 15 isolados do vírus da bronquite infecciosa (VBI) obtidos durante o período de 1988 a 2000, de surtos à campo da Bronquite Infecciosa (BI), em aves de corte ou de postura das regiões Sul e Sudeste do Brasil. Os resultados obtidos da análise filogenética das sequências parciais dos genes da glicoproteína de espícula (S1) e da nucleoproteína (N) evidenciaram que a maior parte dos isolados estão distribuídos em dois grandes grupos; o primeiro deles mais estreitamente relacionado às estirpes do genótipo Massachusetts e o segundo constituído apenas por isolados brasileiros autóctones com uma grande diversidade em relação às estirpes ou isolados do grupo Massachusetts e de outros países ou continentes. Os sítios polimórficos mais importantes formaram-se em locais específicos e de maneira agrupada nas sequências dos genes S1 ou N e predominam em regiões codificadoras das cadeias polipeptídicas S1 e N que configuram sítios estruturais e antigênicos importantes envolvidos, na expressão de propriedades biológicas relevantes. / Fifteen Brazilian field isolates of infectious bronchitis virus (IBV); were recovered, between 1988 and 2000, from commercial broiler or layer flocks located in South and Southeast Brazilian regions. Molecular and phylogenetic analysis of partial sequences of 5\'-proximal of S1 gene and 3\'-terminus of N gene from these IBV isolates, identified two main groups; the Massachusetts group and a Brazilian indigenous group, which presenting a high diversity regarding the first group or other IBV strains from different countries and continents. The major polymorphic sites are arranged in clusters and predominate in the regions of S1 and N genes which code for relevant structural and antigenic sites responsible for the expression of important biological properties.

Infectious bronchitis virus (IBV) is the causative agent of an economically important disease of poultry. In Brazil this disease causes respiratory, renal and reproductive problems in birds of all ages, despite constant vaccination with the Massachusetts strain H120. This lack of immunological protection is known to be due the genetic variation in the spike glycoprotein of IBV, which is involved in host cell attachment, neutralization and the induction of protective immunity. Brazilian IBV variants resulting of this genetic variation are present since the 80s and this study aimed to epidemiologicaly analyze and molecularly characterize the existing variants during 2010-2015 and perform a bioinformatics analysis of the available sequences of IBV variants in a 40 year period. Of the 453 samples tested, 61.4% were positive for IBV and 75.9% of them were considered variants and were detected in birds of all ages, distributed in all five Brazilian regions. A fragment of 559-566 bp was obtained from 12 isolates, where BR-I was the predominant variant while only one isolate belonged to the BR-II genotype. Bioinformatics analysis of the sequences of 40 years of Brazilian IBV variants was performed and the ratio of non-synonymous substitutions per non-synonymous site (dn) to synonymous substitutions per synonymous site (ds) dN/dS was calculated. It revealed a predominance of codons with non-synonymous substitutions in the first third of the S1 gene and a dN/dS ratio of 0.6757, indicating that this portion of the gene was under negative selection. Additionally prediction of N-glycosilation sites showed that most of the BR-I variants (from 2003 to early 2014) present an extra site at animoacid position 20, while the newest ones lack this feature.Together these results suggest that IBV Brazilian variants had probably suffered drastic mutations in some points between the years 1983 to 2003 and after achieving an antigenic structure effective enough for invasion and replication in their hosts, the selection processes became silent. / O vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV) é o agente causador de uma doença aviária economicamente importante. No Brasil, esta doença ocasiona problemas respiratórios, renais e reprodutivos em aves de todas as idades, apesar da vacinação constante com a cepa Massachusetts H120. Esta falha na proteção conferida pela vacina é ocasionada por mutações nos nucleotídeos do gene da glicoproteína da espícula, a qual está envolvida no processo de interação comas células do hospedeiro, a neutralização e a indução de imunidade protetora. As variantes brasileiras resultantes dessa mutação genética estão presentes desde os anos 80 e este estudo teve como objetivo analisar epidemiologicamente e caracterizar molecularmente os vírus variantes existentes durante 2010-2015 e realizar uma análise bioinformática das sequências disponíveis no GenBank em um período de 40 anos. Das 453 amostras analisadas, 61,4% foram positivas para IBV e 75,9% delas foram consideradas variantes e foram detectados em aves de todas as idades, distribuídos em todas as 5 regiões do Brasil. Um fragmento de 559-566 pb foi obtido a partir de 12 isolados, onde BR-I foi a variante predominante ao contrario que apenas um isolado pertencia ao genótipo BR-II. Análise bioinformática de 40 anos de variantes do IBV brasileiros revelou uma predominância de codões com as substituições não sinónimos no primeiro terço do gene S1 e uma relação dN / dS de 0,6757, indicando que esta porção do gene estava sob selecção negativa. Além disso a previsão de pontos de de N-glicosilação mostrou que a maioria das amostras variantes BR-I (entre o 2003 e início de 2014) apresentam um ponto adicional na posição 20, enquanto as variantes mais novas não apresentam esse ponto de nglicosilação. Estes resultados sugerem que as variantes brasileiras teriam sofrido mutações provavelmente drásticas em alguns pontos do genoma, entre os anos de 1983 a 2003 e depois de atingir uma estrutura antigênica eficaz o suficiente para a invasão e replicação em seus hospedeiros, o processo de seleção mudou para seleção negativa.

A Bronquite Infecciosa das Aves (BIG) é uma das doenças respiratórias aviárias de maior impacto na avicultura mundial. No Brasil, as estirpes BR-I (GI-11) e Massachusetts (GI-1) são as mais prevalentes nos planteis avícolas. O presente estudo teve como objetivos desenvolver reações de semi-nested PCR para o diagnóstico das estirpes BR-I e Mass, em amostras brasileiras obtidas durante o período de 2016 e 2017. Foram desenvolvidas duas reações de semi-nested PCR tendo como alvo a subunidade 1 do gene S, específicas para as estirpes BR-I e Mass. O limiar de detecção foi de 104 cópias de DNA/&micro;L nas duas reações (3,76fg/&micro;L na reação exclusiva de BR-I; e 5,58fg/&micro;L e 5,57fg/&micro;L na reação duplex de BR-I e Mass, respectivamente). Posteriormente, foram avaliados 572 pools de órgãos procedentes das 5 regiões do Brasil. Dentre estas amostras, 62,24% foram positivas para Coronavírus, sendo o alvo desta reação a região 3UTR. A reação de semi-nested PCR específica detectou a estirpe BR-I em 84,83% das amostras positivas para Coronavírus. A reação de semi-nested PCR duplex detectou 65,44% das amostras positivas para a estirpe BR-I; 7,35% positivas para a estirpe Mass e co-infecção da estirpe BR-I com Mass em 17,65% das amostras. Após a análise dos controles positivos (vacinas Mass e BR-I) no BLASTn, do resultado do sequenciamento dos produtos de PCR, da análise filogenética, da similaridade de nucleotídeos e a dedução em aminoácidos, foi confirmado o agrupamento esperado das sequências detectadas pelas reações PCR dirigidas para a estirpe BR-I ou Mass. Estes resultados confirmaram a presença predominante da estirpe BR-I, e em menor número, da estirpe Mass nos planteis avícolas do Brasil. As reações desenvolvidas no presente estudo serão valiosas no diagnóstico e na monitoria da doença. / Avian Infectious Bronchitis (IB) is one of the avian respiratory diseases with the greatest impact on poultry farming worldwide. In Brazil, strains BR-I (GI-11) and Massachusetts (GI-1) are the most prevalent in poultry flocks. The present study aimed to develop semi-nested PCR reactions for the diagnosis of IBV BR-I and Mass strains, in Brazilian samples obtained during the period of 2016 and 2017. Two semi-nested PCR reactions targeting the 1 subunit of the S gene were developed, specific for BR-I and Mass strains. The detection threshold was 104 copies of DNA/&micro;L in both reactions (3,76fg/&micro;L in the exclusive BR-I reaction; and 5,58fg/&micro;L and 5,57fg/&micro;L in the duplex reaction of BR-I and Mass, respectively). Subsequently, 572 organ pools from the 5 regions of Brazil were evaluated. Among these samples, 62,24% were positive for Coronavirus, being the target of this reaction the 3UTR region. The specific semi-nested PCR reaction detected the BR-I strain in 84,83% of the Coronavirus positive samples. The duplex semi-nested PCR reaction detected 65,44% of the samples positive for the BR-I strain, 7,35% positive for Mass strain, and co-infection of the BR-I and Mass strain in 17,65% of the samples. After the analysis of the positive controls (Mass and BR-I vaccines) in BLASTn, the result of the sequencing of the PCR products, phylogenetic analysis, nucleotide similarity and amino acid deduction, was confirmed the expected clustering of the sequences detected by the PCR reactions directed to BR-I and Mass strains. These results confirm the predominant presence of the BR-I strain, and to a lesser extent, the Mass strain in Brazilian poultry flocks. The reactions developed in the present study will be valuabe in the diagnosis and monitoring of the disease.

Coronavírus bovino (BCoV) é o agente causador de doença, tanto entérica como respiratória em bovinos, mas até agora existem controvérsias sobre a relação genealógica entre as amostras de BCoV em diferentes tecidos. Neste estudo, amostras de fezes e secreções nasais de 14 vacas de um mesmo rebanho apresentando simultaneamente disenteria epizoótica e doença respiratória foram estudados quanto a presença de BCoV. As amostras virais detectadas tiveram tanto o gene de espícula (S) como o gene hemaglutinina-esterase (HE) parcialmente sequenciados. Para o gene HE, foram obtidas 12 sequências de secreções nasais e 12 de amostras de fezes e para o gene S, foram obtidas 14 sequências de secreções nasais e 12 de amostras de fezes, com 100% de identidade nucleotídica para cada gene para as amostras deste estudo. Estes resultados apresentam algumas divergências com estudos anteriores os quais relatam que linhagens diferentes de BCoV podem ser esperados em casos de disenteria e doença respiratória em vacas, pois linhagens com sequências idênticas dos genes S e HE podem não mostrar diferenças em relação tropismo pelos diferentes tecidos. Sequências completas de duas amostras brasileiras de BCoV mostram que o já descrito padrão filogeográfico baseado no sequenciamento do gene S parcial foi mantido, foram encontradas substituições de aminoácidos específicos. / Bovine coronavirus (BCoV) is the causative agent of both enteric and respiratory disease in cattle, but hitherto there were some controversy on the genealogic relationship amongst strains from these different tissues. In this study, samples of feces and nasal secretions of 14 cows from a same herd simultaneously presenting epizootic dysentery and respiratory disease were screened for BCoV and the strains detected had both the spike (S) and hemagglutinin-esterase (HE) genes partially sequenced. For HE gene, 12 sequences from nasal secretions and 12 from fecal samples were obtained and for S gene, 14 sequences from nasal secretions and 12 from fecal samples were obtained, with 100% nucleotide identities for each gene for the strains of this study. These results have some disagreements with previous reports which try to put forward that divergent BCoV strain should be expected in cases of dysentery and respiratory disease in cows, showing that strain with identical S and HE sequences might show no differences in tropisms. Complete S gene sequences of two Brazilian BCoV strains show that the already described phylogeographic pattern based on partial S gene is sustained, though specific amino acids subtitutions are found.