Made available in DSpace on 2016-08-12T18:48:38Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-05. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-12T18:50:51Z : No. of bitstreams: 1 000865506.pdf: 1455699 bytes, checksum: 95843a06b568521fddadf478cd152d92 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Foram estudados 300 estafilococos isolados de casos de mastite bovina de diferentes propriedades do estado de São Paulo: 150 Staphylococcus coagulase positiva (SCP) e 150 Staphylococcus coagulase negativa (SCN). A presença de genes para produção de enterotoxinas foi detectada pela Reação da Polimerase em Cadeia (PCR) e a expressão gênica pela PCR transcriptase reversa (RT-PCR). Os isolados foram submetidos ao perfil de sensibilidade correlacionada com a detecção dos genes mecA e vanA, pela técnica de PCR. Os 150 SCN isolados foram identificados como sendo: 48 (32%) S. warneri, 22(15%) S. epidermidis, 20(13%) S. hyicus, 10(7%) S. xylosus, 7(5%) S. haemolyticus, 6(4%) S. simulans, 6(4%) S. schleiferi subsp schleiferi, 6(4%) S. hominis, 5(3%) S. pasteuri, 4(2,7%) S. cohnii, 3(2%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus 3(2%) S. chromogenes 3(2%) S. sciuri, 2(1%) S. saccharolyticus, 2(1%) S. lugdunensi, 1(0,7%) S. auriculares, 1(0,7%) S. saprophyticus subsp. bovis e 1(0,7%) S. capitis. Entre os SCP foram isolados: 105 (70%) S. aureus, 21(14%), S. hyicus, 19(13%), S. intermedius e 5(3%) S. schleiferi subsp coagulans. A concordância entre a identificação fenotípica e genotípica do total de linhagens de SCN e SCP foi de 96,7% e 98,7%, respectivamente. Foram detectados genes codificadores para enterotoxinas clássicas (sea, seb, sec, sed) e outras enterotoxinas (see, seg, seh, sei, sej, sek, sel, sem, sen, seo, sep, seq) em 175 (58%) dos 300 Staphylococcus spp. pesquisados. Estes genes foram detectados em 109 (73%) dos SCN isolados, resultado significantemente maior que entre SCP 66 (44%), P<0,0001. Entre os 109 SCN foram detectados genes codificadores de enterotoxinas nas seguintes espécies: 37(33,9%) S. warneri, 17(15,6%) S. epidermidis, 16(14,7%) S. hyicus, 5(4,6%) S. xylosus, 5(4,6%) S. haemolyticus, 4(3,7%) S. simulans, 4(3,7%) S. schleiferi subsp schleiferi, 4(3,7%) S. homini, 4(3,7%) S. pasteuri, 3(2,7%) S. saprophyticus... / A total of 300 isolates of bovine mastitis cases from several Brazilian dairy herds were studied, respectively: 150 CPS and 150 CNS strains. The isolates were analyzed to enterotoxins codifying genes by Polymerase Chain Reaction (PCR). Gene expression was evaluated by reverse transcription PCR (RT-PCR). The isolates were subjected to sensitivity profile correlated with the detection of mecA and vanA gene by PCR. Among the CNS the following species were identified: 48 (32%) S. warneri, 22(15%) S. epidermidis, 20(13%) S. hyicus, 10(7%) S. xylosus, 7(5%) S. haemolyticus, 6(4%) S. simulans, 6(4%) S. schleiferi subsp schleiferi, 6(4%) S. hominis, 5(3%) S. pasteuri, 4(2.7%) S. cohnii, 3(2%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus 3(2%) S. chromogenes 3(2%) S. sciuri, 2(1%) S. saccharolyticus, 2(1%) S. lugdunensi, 1(0,7%) S. auriculares, 1(70%) S. saprophyticus subsp. bovis and 1(0.7%) S. capitis. Among the 150 CPS: 105 (70%) S. aureus, 21(14%), S. hyicus, 19(13%), S. intermedius and 5(3%) S. schleiferi subsp coagulans. The identification by phenotypic and genotypic tests showed a concordance of 96.7% in the CNS isolates, and 98.7% in the CPS. The codifying genes to enterotoxins production were detected to classical and enterotoxin-like in 175 (58%) out of 300 staphylococci isolates. These genes were detected significantly higher among the CNS (73%) in relation to CPS (44%), P<0.0001. In 109 CNS codifying genes to enterotoxins were detected in the following species: 37(33.9%) S. warneri, 17(15.6%) S. epidermidis, 16(14.7%) S. hyicus, 5(4.6%) S. xylosus, 5(4.6%) S. haemolyticus, 4(3.7%) S. simulans, 4(3.7%) S. schleiferi subsp schleiferi, 4(3.7%) S. homini, 4(3.7%) S. pasteuri, 3(2.7%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus, 3(2.7%) S. cohnii, 3(2.7%) S. chromogenes, 2(1.8%) S. sciuri, 1(0.9%) S. lugdunensis and 1(0.9%) S. capitis. Among the 66 CPS, the enterotoxin genes were observed in the following species: 48(73 %) S. aureus, 10(15%) S. hyicus, ... / FAPESP: 11/21142-2

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-06-27Bitstream added on 2014-06-13T20:59:44Z : No. of bitstreams: 1 guimaraes_ff_me_botfmvz.pdf: 668649 bytes, checksum: 605a29631d65d4e6c7ea318a710ab952 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Alguns dos agentes patogênicos de mastite bovina são relevantes em relação à qualidade do leite, bem como, para a saúde pública. Foram estudadas dez fazendas localizadas em cinco regiões do estado de São Paulo. Foram examinadas 1.148 vacas, correspondentes a 4.592 glândulas mamárias avaliadas pelos testes de tamis e CMT. Foram colhidas 1.318 amostras de leite, das vacas positivas na triagem para avaliação microbiológica e contagem de células somáticas (CCS). A frequência dos agentes variou de 0,3 a 36,4%. Do total de isolados de Staphylococcus spp (36,4%), 48,7% corresponderam a estafilococos coagulase negativa (SCN), 34,2% S. aureus e 15,9% outros estafilococos coagulase positiva (SCP). Streptococcus spp foram isolados de 23,3% das amostras, dos quais 41,7% Streptococcus. agalactiae, 41,1% Streptococcus dysgalactiae e 17,3% Streptococcus uberis. Corynebacterium spp. foram isolados em 31,8% dos casos de mastite. As amostras de leite das glândulas mamárias infectadas apresentaram CCS significativamente mais elevada que as negativas. Dos 48,7% de SCN foram identificadas 18 espécies: S. warneri, S. epidermidis, S. hyicus, S. xylosus, S. haemolyticus, S. auriculares, S. cohnii subsp cohnii, S. lugdunensis, S. pasteuri, S. saccharolyticus, S. saprophyticus subsp bovis, S. schleiferi subsp scheleiferi, S. simulans, S. saccharolyticus, S. capitis, S. saprophyticus subsp saprophyticus, S. sciuri subsp sciuri e S. chromogenes. As fazendas, II (27,3%) e III (26,7%) apresentaram maior frequência de SCN, enquanto as fazendas I (13,3%) e X (44,4%) revelaram maior prevalência de SCP sendo as diferenças significantes. Foram avaliados por PCR 263 estafilococos para detecção de gene codificadores das enterotoxinas clássicas. Entre os SCN foram detectados: sea (35,5%) seb (7,1%), sec (6,5%), sed (1,8%) e associações destes genes. Em SCP foram detectados: sea (9,5%) seb (4,4%)... / The purpose of this study was to assess the occurrence of mastitis cases in ten Brazilian dairy herds located in five regions in São Paulo state, to characterize the main etiological agents and, to proceed staphylococcal isolates identification to species level, to perform detection by PCR assays of enterotoxin encoded genes aiming the awareness of their potential capability in producing the classical enterotoxins and, mecA a methicilin resistance gene and, evaluated resistance toward antimicrobials. A total of 4,592 mammary glands of 1,148 dairy cows were examined by strip cup and CMT. From these 1,318 milk samples were collected for microbiological exams. It was isolated 263 (19.9%) staphylococci from mastitis cases and they were identified, as being: S.aureus (34.2%), other CPS (15.9%) respectively, S. intermedius (15.2%), S.hyicus(12.9%) and, S. schleiferi subsp coagulans(3.8%), and CNS (48.7%). Among these 128 CNS isolates eighteen species were identified: S. xylosus, S. haemolyticus, S. auriculares; S. cohnii subsp cohnii, S. lugdunensis, S. pasteuri, S. saccharolyticus, S. saprophyticus subsp bovis, S. schleiferi subsp scheleiferi, S. simulans, S. capitis, S. saprophyticus subsp saprophyticus, S. sciuri subsp sciuri and, S. chromogenes. The more frequently isolated species were: S.warneri (31.3%), S. epidermidis (14.8%) and S.hyicus (12.5%). The milk samples from infected mammary glands showed higher CCS than the negatives. PCR assay was used to determine the presence of classical enterotoxin codifying genes (sea, seb, sec and sed). Among CNS the occurrence of enterotoxin classical genes was determined as: 35.1% for sea, 7.1% for seb, 6.5% for sec, 1.8% for sed) 5.3% for both sea and seb, 3.6% for both sea, sec and sed, 1.8% for both sec and sed. Whereas among CPS isolates the occurrence of enterotoxin... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Hélio Langoni / Coorientador: José Paes de Almeida Nogueira Pinto / Banca: Paulo Francisco Domingues / Banca: Vera Lúcia Mores Rall / Banca: Márcia Garcia Ribeiro / Banca: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Resumo: A atividade leiteira na agricultura familiar é fundamental para sobrevivência e manutenção do homem no campo. A mastite bovina impacta negativamente a produção leiteira e oferece riscos à saúde pública. O presente estudo avaliou a qualidade do leite proveniente da agricultura familiar na região de Botucatu-SP, as dificuldades enfrentadas pelos produtores, a etiologia das mastites, e o perfil de sensibilidade dos patógenos aos antimicrobianos. Avaliou-se também a presença de genes produtores de enterotoxinas em linhagens de Staphylococcus isoladas. Objetivou também a recomendação de ações para melhoria na produção, visando a qualidade do leite. Aplicou-se um questionário socioeconômico aos produtores e foram coletadas amostras individuais do leite do conjunto de latões de cada propriedade e de vacas diagnosticadas com mastite pelo California Mastitis Test (CMT). Avaliou-se os teores de gordura, proteína, lactose, extrato seco, extrato seco desengordurado, a contagem bacteriana total (CBT), e a contagem de células somáticas (CCS). Foram analisadas 21 propriedades onde constatou-se que a idade média dos produtores era de 59 anos. Apenas cinco deles (23,8%) tinham ensino médio completo ou superior, sendo que nenhum (0%) contava com assessoria veterinária. Quanto às instalações da sala de ordenha, apenas quatro (19,0%) possuíam estábulos com piso concretado e quatro (19,0%) utilizavam sistema de ordenha mecânica. Quanto ao manejo, apenas um (4,8%) realizava pré-dipping corretamente, nenhum (0%) realizava pós-dipping, dois (9,5%) utilizavam papel toalha descartável na ordenha e somente dois produtores (9,5%) utilizavam o CMT com periodicidade. Em contrapartida, 15 produtores (71,4%) revelaram terem utilizado antimastíticos para tratamento das vacas. Com relação aos animais, foram avaliadas 239 vacas (média = 11,4 animais/propriedade). A mastite clínica foi verificada em apenas duas vacas (<1%), enquanto que... / Abstract: Dairy farming on family farms is critical for survival and maintenance of the rural worker. Bovine mastitis negatively impacts milk production and presents risks to public health. This study evaluated the quality of the milk from the family farm in the region of Botucatu-SP, the difficulties faced by producers, the mastitis etiology, and sensitivity profile of pathogens against antimicrobials. Also evaluated the presence of enterotoxin producing genes in isolated staphylococcal strains. Also aimed the recommendation of actions to improve the production, seeking the quality of the milk. A Socioeconomic questionnaire was applied to producers and individual milk samples were collected from the set of brasses of each property and from cows diagnosed with mastitis by California Mastitis Test (CMT). It was evaluated the levels of fat, protein, lactose, dried extract and nonfat dry extract, the total bacterial count (TBC) and the somatic cell count (SCC). Twenty one (21) properties were analyzed where it was found that the average of the farmers was 59 years. Only five of them (23.8%) had completed high school or higher, and none (0%) counted on veterinary advice. As for their facilities of milking parlor, only four (19.0%) had stables with concreted floor and four (19.0%) used mechanical milking system. As to the handling, only one (4.8%) performed pre-dipping correctly, none (0%) performed post-dipping, two (9.5%) used disposable paper for milking and only two producers (9.5%) used the CMT with periodicity. On the other hand, 15 producers (71.4%) stated that they used anti mastitis for treating the cows. Regarding the animals, 239 cows (average = 11.4 animals / property) were evaluated. The clinical mastitis was detected in only two cows (<1%), whereas 86 animals showed milk positive to CMT (35.9% of subclinical mastitis). One hundred seventy-seven (177) milk samples were cultured, on 55 (31.1%) of them it was identified staphylococci, on ... / Mestre

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Coorientador: Alessandro Lia Mondelli / Banca: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Antônio Carlos Pignatari / Resumo: Na última década houve uma clara mudança na etiologia da sepse. Dados recentes do National Healthcare Safety Network (NHSN) mostram que os cocos Gram-positivos têm ultrapassado os bacilos Gram-negativos como os principais agentes etiológicos e os Estafilococos coagulase negativa (ECN) se tornaram os agentes mais frequentes. Entretanto a maioria dos laboratórios clínicos não identifica esses microrganismos a nível de espécies devido à necessidade de realização de uma série de provas bioquímicas. A aplicação de técnic as de biologia molecular, entre elas a reação em cadeia da polimerase (PCR) para a identificação de bactérias se mostrou uma técnica promissora devido a sua rapidez, acurácia e sensibilidade. Assim, este trabalho objetivou avaliar a eficiência, acurácia e sensibilidade da técnica de PCR multiplex para a detecção do gênero e de espécies de Staphylococcus spp. mais encontradas em hemoculturas, do operon ica de produção de biofilme e da presença do gene mecA de resistência à oxacilina diretamente dos frascos de hemocultivo. Foram analisadas 371 amostras de hemoculturas, positivas para o gênero Staphylococcus obtidas de pacientes atendidos no HC da Faculdade de Medicina de Botucatu (FMB). As amostras foram isoladas e identificadas por testes bioquímicos convencionais e simultaneamente o DNA bacteriano foi extraído diretamente das hemoculturas e destes realizou-se o PCR multiplex. Das 371 amostras estudadas 85 (23,0%) foram de S. aureus e 286 (77,0%) ECN. Dos ECN 152 (53,1%) foram identificados como S. epidermidis, 36 (12,6%) S. haemolyticus, 36 (12,6%) S. hominis, 23 (8,0%) S. capitis, 18 (6,3%) S. warneri, 7 S. caprae, 5 S. simulans, dois S. lugdunensis, dois S. cohnii, um S. saprophyticus, um S. schleiferi, um S. xylosus e concomitantemente um S. haemolyticus e S. hominis, e um S. haemolyticus e S. epidermidis. Das 85 amostras de S. aureus, 43 (50,6%) se mostraram resistentes à oxacilina pelo ... / Abstract: A clear shift in the etiology of sepse has occurred in the last decade. Recent data from the National Healthcare Safety Network (NHSN) show that Gram-positive cocci have exceeded Gram-negative bacilli as the major etiological agents. In this respect, coagulase-negative staphylococci (CoNS) have become the most frequent. However, most clinical laboratories do not identify these microorganisms to species level due to the need for a series of biochemical tests. The application of molecular biology techniques, including the polymerase chain reaction (PCR), for bacterial identification proved to be promising due to their speed, accuracy and sensitivity. The aim of this study was to evaluate the efficiency, accuracy and sensitivity of multiplex PCR for the detection of Staphylococcus spp. frequently found in blood cultures, investigation of the ica operon involved in biofilm formation and the mecA gene encoding oxacillin resistance, and direct detection of major CoNS species in blood culture flasks. A total of 371 blood culture samples positive for Staphylococcus spp. obtained from patients seen at the Hospital of the Botucatu School of Medicine (FMB) were analyzed. The strains were isolated and identified by conventional biochemical tests. Simultaneously, bacterial DNA was extracted directly from the blood cultures for multiplex PCR. S. aureus was isolated from 85 (23%) of the 371 samples studied and CoNS from 286 (77%). Among the latter, 152 (53.1%) isolates were identified as S. epidermidis, 36 (12.6%) as S. haemolyticus, 36 (12.6%) as S. hominis, 23 (8%) as S. capitis, 18 (6.3%) as S. warneri, 7 as S. caprae, 5 as S. simulans, two as S. lugdunensis, two as S. cohnii, one as S. saprophyticus, one as S. schleiferi, and one as S. xylosus. S. haemolyticus and S. hominis were concomitantly identified in one sample and S. haemolyticus and S. epidermidis in another. Forty-three (50.6%) of the 85 S. aureus strains were resistant to oxacillin in ... / Mestre

Orientador: Elenice Deffune / Banca: Maria de Lourdes Ribeiro da Cunha / Banca: Fábio Bernardi Dalpino / Resumo: S. aureus é, sem duvida, o patógeno humano mais importante entre os estafilococos. O surgimento e a disseminação progressiva da resistência a meticilina tiveram grande impacto na terapia das infecções estafilocócicas. O mecanismo de resistência a meticilina desenvolvido por S. aureus está relacionado com a alteração das proteínas ligadoras de penicilinas, as PBPs. Os Staphylococcus. aureus produzem 5 tipos de PBPs: 1,2,3,3', e 4. As cepas de S. aureus resistentes a meticilina produzem uma nova PBP, a PBP2a, adquirida de outras cepas de estafilococos. Diversos métodos são utilizados para detecção da resistência a meticilina no S. aureus. Dentre eles, a detecção da PBP2a por meio de métodos de aglutinação em látex utilizando anticorpo monoclonal específico dirigido para o antígeno PBP2a. Na presente pesquisa, anticorpos monoclonais murinos dirigidos contra a PP2a do S. aureus resistente a meticilina foram produzidos através de fusão celular utilizando-se células de baço de camundongos BALB/c imunizados.Cinco fusões MRSA foram realizadas e os sobrenadantes de cultura foram triados por testes Elisa indireto . Foram construídos e testados 1236 híbridos e nove híbridos se mostraram reativos após o 4º. teste de Elisa indireto. Os nove híbridos foram testados frente a diferentes bactérias para observar inibição do crescimento. Este trabalho teve como foco, a produção de anticorpo monoclonal murino para uso em testes de detecção rápida / Abstract: S. aureus is, without doubt, the most important human pathogen among staphylococci. The emergence and dissemination of progressive resistance to methicillin had great impact on therapy of staphylococcal infections. The mechanism of resistance to methicillin developed by S. aureus is related to the alteration of penicillin binding proteins, the PBPs. Staphylococcus. aureus produces five types of PBPs: 1,2,3,3 ', and 4. Strains of S. aureus resistant to methicillin produce a new PBP, PBP2a the acquired from other strains of staphylococci. Several methods are used for detection of methicillin resistance in S. aureus. Among them, the detection of PBP2a by latex agglutination methods using monoclonal antibody specific for the antigen directed PBP2a. In the present study, murine monoclonal antibodies directed against the PP2A methicillin resistant S. aureus were produced by cell fusion using spleen cells from immunized BALB / c mice. Five MRSA fusions were performed and the culture supernatants were screened by testing indirect ELISA. Were built and tested in 1236 hybrids and nine of them were reactive after the 4th indirect ELISA test. The nine hybrids were tested against different bacteria to observe inhibition of growth. This work focused on the production of murine monoclonal antibody for use in rapid detection tests / Mestre

Orientador: Germano Francisco Biondi / Banca: Anee Valéria Mendonça Stachissini / Banca: Kate Aparecida Buzi / Resumo: As hortaliças são itens indispensáveis na dieta dos seres humanos, atuando como adjuvantes na prevenção e tratamento de doenças. Porém, destaca-se o aumento de surtos de Doenças Transmitidas por Alimentos (DTA) associados ao consumo de produtos hortícolas. O objetivo desse trabalho foi verificar o perfil microbiológico de diferentes tipos de saladas de cozinhas hospitalares. No período de 2010 a 2014, o Serviço de Orientação a Alimentação Pública (SOAP) recebeu 641 amostras de saladas provenientes de hospitais da região de Bauru e Botucatu, onde foram submetidas às análises microbiológicas para a determinação do número mais provável de coliformes a 35°C e 45°C, pesquisa de Salmonella spp e contagem de estafilococos coagulase positiva. Os resultados revelaram que em 30,56% das amostras a contagem de coliformes a 35°C foi maior que 1.100 NMP/g e 12,17% apresentaram coliformes a 45°C acima de 100 NMP/g, limite máximo estabelecido pela legislação brasileira. A prevalência de amostras contaminadas sem tratamento térmico foi de 97,44% e de 2,56% para amostras com tratamento térmico, cozidas ou refogadas. Todas as amostras foram negativas para presença de Salmonella spp e apresentaram contagem de estafilococos coagulase positiva < 1,0X102 UFC/g. Apesar das amostras de saladas não oferecerem risco microbiológico associado à patógenos, deve-se atentar para os micro-organismos indicadores, pois as refeições são servidas a indivíduos hospitalizados / Abstract: Vegetables crops are indispensable items in human diet, acting as adjuvants in the prevention and treatment of diseases. However, the number of Foodborne Diseases outbreaks associated with their consumption increases. The aim of this study was determine the microbiological profile of different salads from hospital kitchens. In the period between 2010 and 2014 the Public feeding orientation service (SOAP) received 641 samples of salads from hospital kitchens in the region of Botucatu and Bauru. They, where subjected to microbiological analysis to determine the most probable number of coliforms at 35 ° C and 45 ° C, besides Salmonella spp presence and coagulase-positive staphylococci counts. The results reveal that 30.56% of the samples had counts for coliform at 35°C greater than 1.100 MPN/g and 12.17% had MPN/g of coliforms at 45°C above 100 MPN/g, the maximum limit established by Brazilian legislation. The prevalence of samples without heat treatment was 2.56% and 97.44% with heat treatment, cooked or braised. All samples were negative for Salmonella spp count and coagulase positive staphylococci < 1,0x102 UFC/g. Although most salads had an adequate microbiological quality, attention should be paid to the safety indicators as the meals are served to hospitalized individuals / Mestre

Orientador: Luiz Augusto do Amaral / Banca: Laudicéia Giacometti Lopes / Banca: Maria da Glória Buzinaro / Resumo: O objetivo deste trabalho foi determinar o número de coliformes totais, termotolerantes, Staphylococcus coagulase positivo e a presença de bactéria do gênero Salmonella no músculo, no tecido superficial, no trato gastrintestinal de peixes e na água de cultivo de pesque-pagues situados na microbacia do Córrego Rico, região nordeste do estado de São Paulo. Não foi detectado Staphylococcus coagulase positivo em nenhuma amostra de água e peixe. Na contagem de Staphylococcus sp. a água de enxaguadura da pele apresentou números que variam de 1,0 x 102 a 3,3 x 105 UFC.mL-1; no músculo de 1,0 X 102 a 6,7 x 103 UFC.g-1; no trato gastrintestinal de 1,0 x 103 a 2,9 x 105 UFC.g-\ e na água de cultivo de < 20 a 3,3 x 102 UFC.mL-1. O número mais provável (NMP) de coliformes totais na pele variou de 1,5 x 103 a > 1,1 x 104 NMP.100mL-1; no músculo variou de 2,0 x 10 a> 1,1 x 103 NMP.g-1; no trato gastrintestinal variou de 2,6 x 103 a> 1,1 x 104 NMP.g-1; e na água de cultivo variou de 4,2 x 104 a> 2,4 x 105 NMP.100mL-1. Para coliformes termotolerantes a água de enxaguadura da pele variou de < 3,0 x 10 a 1,4 x 103 NMP.IOOmL-1; no músculo variou de < 3 a 6 NMP.g-1; no trato gastrintestinal variou de 1,2 X 103 a 5,1 x 103 NMP.g-1; e na água de cultivo variou de 3,8 x 102 a 2,0 x 104 NMP.100mL-1. Não houve diferença estatística (P>0,05) entre as populações de microrganismos pesquisados na água, pele e trato gastrintestinal o que reflete a relação direta entre a presença dos microrganismos na água e nesses dois locais analisados. No que se refere à musculatura verifica-se que existe diferença (P<0,05) entre a população de microrganismos na água e na musculatura, sendo na musculatura sempre menor. Foi isolada Salmonella sp. em uma amostra de músculo e em duas amostras de trato gastrintestinal. O pescado pode ser veículo de contaminação cruzada, tendo como... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The aim of this work was to determine the number of total coliforms, thermotolerant, Staphylococcus coagulase positive and the presence of bacteria of the genus Salmonella in the muscle, in the surface tissue, in the gastrointestinal tract of fish and pond water of fee- fishing located in Cón-ego Rico microwatershed, northeast region of São Paulo state. Staphylococcus coagulase positive was not detected in any sample of pond water and fish. In the Staphylococcus sp. counts the surface tis sue ranged from 1,0 x 102 to 3,3 X 105 UFC.mL-1; in the musc1e from 1,0 x 102 to 6,7 x 103 UFC.g-1; in the gastrointestinal tract of fish from 1,0 x 103 to 2,9 X 105 UFC.g-1; and in pond water from < 20 to 3,3 X 102 UFC.mL¬1. The most probable number (NMP) of total coliforms in the surface tissue ranged from 1,5 x 103 to > 1,1 X 104 NMP.100mL-1; in the muscle from 2,0 x 10 to > 1,1 X 103 NMP.g-1; in the gastrointestinal tract offish from de 2,6 x 103 to> 1,1 X 104 NMP.g-1; and in pond water from 4,2 x 104 to > 2,4 X 105 NMP.1 00mL-1 . In thermotolerant coliforms the surface tissue ranged from < 3,0 x 10 to 1,4 X 103 NMP.100mL-1; in the musc1e from < 3 to 6 NMP.g-1; in the gastrointestinal tract of fish from de 1,2 x 103 to 5,1 X 103 NMP.g-1; and in pond water from 3,8 x 102 to 2,0 X 104 NMP.100mL-1. There was no statistical difference (P>0,05) among the studied populations of microorganisms in water, skin and gastrointestinal tract that reflects the relationship between the presence of microorganisms in water and in these two tissues analyzed. Conceming the musc1e there is difference (P<0,05) among the population of microorganisms in water and muscle, in which muscles were always smaller. Salmonella sp. was isolated in a sample of muscle and in two samples of gastrointestinal tract. The fish ean be a vehic1e of cross contamination, and the gastrointestinal tract and skin as a source of microorganisms... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Coorientador: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Paulo Câmara Marques Pereira / Banca: Patrícia Yoshida Faccioli Martins / Resumo: As Infecções estafilocócicas são grande causa de mortalidade e morbidade. A emergência de isolados de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) originários da comunidade na década de 1990 trouxe desafios para sua prevenção e abordagem terapêutica. A identificação da prevalência e características de MRSA adquirido em comunidade (CA-MRSA) em populações de alto risco pode fornecer valiosas informações para compreensão de sua epidemiologia. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência, os fatores de risco e as características moleculares de CA-MRSA isolado em nasofaringe de uma população carcerária em Avaré, Brasil. Foram coletados swabs nasais de 302 homens encarcerados no Centro de Ressocialização de Avaré. A caracterização da resistência à meticilina foi feita através de difusão em disco (Oxacilina e Cefoxitina) e identificação do gene mecA (por Reação em Cadeia de Polimerase (PCR). Utilizou-se também PCR para identificação dos genes lukF-PVe lukS-PV que codificam a leucocidina de Panton-Valentine. Fatores de risco para colonização nasal por S. aureus e por MRSA foram avaliados em modelos univariados e multivariados (regressão logística). A prevalência de colonização nasal por S. aureus como um todo foi de 16,5%, e a MRSA (definida como positividade para o gene mecA), de (02) 4,0%. Os testes de difusão com disco de Oxacilina e Cefoxitina identificaram 2 (4%) resistentes simultaneamente a Oxacilina e Cefoxitina. Nenhum dos isolados de S. aureus apresentou genes codificadores da PVL. As amostras positivas para gene mecA apresentaram SCCmec tipo IV, confirmando esta tipagem presente em amostras comunitárias.Uma das amostras positivas para gene mecA apresentou SCCmec IV-d, que pelo método PFGE agrupou em 85,7% com o clone JCSC 4469 de origem japonesa. Os fatores de risco para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Staphylococci infections are a major cause of morbidity and mortality. The emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates original from the community in the 1990s brought challenges for prevention and therapeutic approach.Identifying the prevalence and characteristics of community-acquired MRSA (CA-MRSA) in high-risk populations can provide valuable information for understanding its epidemiology. The objective of this study was to identify the prevalence, risk factors and molecular characteristics of CA-MRSA isolates in nasopharynx of a prison population in Avare, Brazil. Nasal swabs were collected from 302 men incarcerated in Central Resocialization of Avaré. The characterization of methicillin resistance was done by disk diffusion (Oxacillin and Cefoxitin) and mecA gene identification (by Polymerase Chain Reaction(PCR). We also used PCR to identify the lukF-PV and lukFS-PV genes that encode the Panton- Valentine Leukocidin. Risk factors for nasal colonization by S. aureus and MRSA were evaluated with univariate and multivariate models (logistic regression). The prevalence of nasal colonization by S. aureus as a whole was 16.5%, and MRSA (defined as positive for the mecA gene), from (02) 4.0%. The diffusion testing with Oxacillin and Cefoxitin identified 2 (4%) isolates resistants to both Oxacillin and Cefoxitin. None of the isolated S.aureus had genes encoding PVL. Positive samples for mecA showed SCCmec type IV, confirming this typing in community samples. One of the positive samples for mecA showed SCCmec IV-d, which by PFGE method grouped in 85.7% with clone 4469 JCSC of Japanese origin. Risk factors for S. aureus acquisition revealed in the survey were: men who... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientador: Hélio Langoni / Banca: Márcio Garcia Ribeiro / Banca: José Carlos de Figueiredo Pantoja / Banca: Nilson Benites / Banca: Acácia Orieth Elias / Resumo: Foram estudados 300 estafilococos isolados de casos de mastite bovina de diferentes propriedades do estado de São Paulo: 150 Staphylococcus coagulase positiva (SCP) e 150 Staphylococcus coagulase negativa (SCN). A presença de genes para produção de enterotoxinas foi detectada pela Reação da Polimerase em Cadeia (PCR) e a expressão gênica pela PCR transcriptase reversa (RT-PCR). Os isolados foram submetidos ao perfil de sensibilidade correlacionada com a detecção dos genes mecA e vanA, pela técnica de PCR. Os 150 SCN isolados foram identificados como sendo: 48 (32%) S. warneri, 22(15%) S. epidermidis, 20(13%) S. hyicus, 10(7%) S. xylosus, 7(5%) S. haemolyticus, 6(4%) S. simulans, 6(4%) S. schleiferi subsp schleiferi, 6(4%) S. hominis, 5(3%) S. pasteuri, 4(2,7%) S. cohnii, 3(2%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus 3(2%) S. chromogenes 3(2%) S. sciuri, 2(1%) S. saccharolyticus, 2(1%) S. lugdunensi, 1(0,7%) S. auriculares, 1(0,7%) S. saprophyticus subsp. bovis e 1(0,7%) S. capitis. Entre os SCP foram isolados: 105 (70%) S. aureus, 21(14%), S. hyicus, 19(13%), S. intermedius e 5(3%) S. schleiferi subsp coagulans. A concordância entre a identificação fenotípica e genotípica do total de linhagens de SCN e SCP foi de 96,7% e 98,7%, respectivamente. Foram detectados genes codificadores para enterotoxinas clássicas (sea, seb, sec, sed) e outras enterotoxinas (see, seg, seh, sei, sej, sek, sel, sem, sen, seo, sep, seq) em 175 (58%) dos 300 Staphylococcus spp. pesquisados. Estes genes foram detectados em 109 (73%) dos SCN isolados, resultado significantemente maior que entre SCP 66 (44%), P<0,0001. Entre os 109 SCN foram detectados genes codificadores de enterotoxinas nas seguintes espécies: 37(33,9%) S. warneri, 17(15,6%) S. epidermidis, 16(14,7%) S. hyicus, 5(4,6%) S. xylosus, 5(4,6%) S. haemolyticus, 4(3,7%) S. simulans, 4(3,7%) S. schleiferi subsp schleiferi, 4(3,7%) S. homini, 4(3,7%) S. pasteuri, 3(2,7%) S. saprophyticus... / Abstract: A total of 300 isolates of bovine mastitis cases from several Brazilian dairy herds were studied, respectively: 150 CPS and 150 CNS strains. The isolates were analyzed to enterotoxins codifying genes by Polymerase Chain Reaction (PCR). Gene expression was evaluated by reverse transcription PCR (RT-PCR). The isolates were subjected to sensitivity profile correlated with the detection of mecA and vanA gene by PCR. Among the CNS the following species were identified: 48 (32%) S. warneri, 22(15%) S. epidermidis, 20(13%) S. hyicus, 10(7%) S. xylosus, 7(5%) S. haemolyticus, 6(4%) S. simulans, 6(4%) S. schleiferi subsp schleiferi, 6(4%) S. hominis, 5(3%) S. pasteuri, 4(2.7%) S. cohnii, 3(2%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus 3(2%) S. chromogenes 3(2%) S. sciuri, 2(1%) S. saccharolyticus, 2(1%) S. lugdunensi, 1(0,7%) S. auriculares, 1(70%) S. saprophyticus subsp. bovis and 1(0.7%) S. capitis. Among the 150 CPS: 105 (70%) S. aureus, 21(14%), S. hyicus, 19(13%), S. intermedius and 5(3%) S. schleiferi subsp coagulans. The identification by phenotypic and genotypic tests showed a concordance of 96.7% in the CNS isolates, and 98.7% in the CPS. The codifying genes to enterotoxins production were detected to classical and enterotoxin-like in 175 (58%) out of 300 staphylococci isolates. These genes were detected significantly higher among the CNS (73%) in relation to CPS (44%), P<0.0001. In 109 CNS codifying genes to enterotoxins were detected in the following species: 37(33.9%) S. warneri, 17(15.6%) S. epidermidis, 16(14.7%) S. hyicus, 5(4.6%) S. xylosus, 5(4.6%) S. haemolyticus, 4(3.7%) S. simulans, 4(3.7%) S. schleiferi subsp schleiferi, 4(3.7%) S. homini, 4(3.7%) S. pasteuri, 3(2.7%) S. saprophyticus subsp. saprophyticus, 3(2.7%) S. cohnii, 3(2.7%) S. chromogenes, 2(1.8%) S. sciuri, 1(0.9%) S. lugdunensis and 1(0.9%) S. capitis. Among the 66 CPS, the enterotoxin genes were observed in the following species: 48(73 %) S. aureus, 10(15%) S. hyicus, ... / Doutor

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