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Produtividade, qualidade de raiz, resistência aos insetos de solo e aos nematóides-das-galhas, e estimativas de parâmetros genéticos em clones de batata-doce cultivados no Distrito Federal

Kalkmann, Danielle Cristina 15 September 2011 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2011. / Submitted by Albânia Cézar de Melo (albania@bce.unb.br) on 2011-12-14T14:22:22Z No. of bitstreams: 1 2011_DanielleCristinaKalkmann.pdf: 1865870 bytes, checksum: 0a510c27bbe5fe4066698525a81d339c (MD5) / Approved for entry into archive by Leila Fernandes (leilabiblio@yahoo.com.br) on 2012-01-02T13:22:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2011_DanielleCristinaKalkmann.pdf: 1865870 bytes, checksum: 0a510c27bbe5fe4066698525a81d339c (MD5) / Made available in DSpace on 2012-01-02T13:22:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011_DanielleCristinaKalkmann.pdf: 1865870 bytes, checksum: 0a510c27bbe5fe4066698525a81d339c (MD5) / O objetivo deste trabalho foi avaliar clones de batata-doce quanto à produtividade, qualidade de raiz, resistência aos nematóides formadores de galhas e aos insetos de solo, além de estimar parâmetros genéticos e correlações entre caracteres agronômicos de interesse, a fim de orientar as próximas etapas do programa de melhoramento de batata-doce da Universidade de Brasília - UnB. No primeiro ensaio, foram avaliados 21 acessos provenientes do jardim clonal da UnB, e mais quatro variedades (Amarela, Brazlândia Roxa, Rainha e Roxa comum). O experimento foi conduzido em campo, com delineamento em blocos casualizados, 25 tratamentos, quatro repetições e dez plantas por parcela. As raízes foram avaliadas quanto à incidência de danos e número de furos causados por insetos de solo, formato, comprimento, diâmetro, espessura da casca, coloração de casca e polpa, produtividade total e comercial, rendimento de amido, umidade, percentual de sólidos solúveis totais, acidez total titulável e ratio. Os acessos 1223 e 1210 apresentaram aptidão para consumo in natura, com alta produtividade e moderada resistência aos insetos de solo. O clone 1229 mostrou-se moderadamente resistente aos insetos e promissor tanto para cultivo de mesa quanto para cultivo industrial. Os acessos 1227, 1197, 1230, 1231 e 1232 também foram selecionados por apresentarem características desejáveis. Diversos caracteres correlacionaram-se, indicando a possibilidade de seleção indireta para esses fatores. A relação entre os coeficientes de variação genética e ambiental, e a herdabilidade no sentido amplo foram altas para a espessura de casca, rendimento de amido, umidade da polpa, produtividade total e produtividade comercial de raízes, demonstrando a eficiência do método empregado na seleção. No segundo ensaio, 21 acessos do jardim clonal e três cultivares de batata-doce (Brazlândia Branca, Brazlândia Roxa e Amarela) foram avaliados para resistência aos nematóides formadores de galhas. O experimento foi conduzido em casa de vegetação, com delineamento de blocos casualizados em arranjo simples, com 24 tratamentos e quatro repetições para cada ensaio (cada ensaio correspondeu a uma população de Meloidogyne spp.). A inoculação do patógeno foi feita trinta dias após o plantio das ramas, e, após noventa dias, foram avaliadas as seguintes características: número médio de massas de ovos, número de ovos, massa fresca e seca da parte aérea e massa fresca das raízes. Atribuiu-se o grau de resistência dos clones de acordo com o número médio de massas de ovos e com o fator de reprodução. Os acessos 1199, 1202, 1209, 1210, 1216, 1230 e 1231 foram identificados como resistentes a todas as populações de nematóides, e foram selecionados para permanecerem no programa de melhoramento. Constatou-se correlação entre número de massas de ovos, número de ovos e fator de reprodução em todos os ensaios. A relação entre os coeficientes de variação genética e ambiental e a herdabilidade no sentido amplo foram altas para o número de massas de ovos, o número de ovos e o fator de reprodução de apenas uma das populações analisadas (Meloidogyne spp. – jiló), o que demonstra a eficiência do método empregado na seleção de genótipos resistentes a essa população. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this study was to evaluate sweet potato clones for productivity, root quality, root-knot nematodes and soil insects resistance, and estimate genetic parameters and correlations between traits of interest, to guide the next steps of the breeding program of sweet potatoes at the University of Brasilia - UnB. In the first trial were evaluated 21 clones from a clonal garden of the UnB, and four varieties (Amarela, Brazlândia Roxa, Rainha e Roxa comum). The experiment was conducted in field, with randomized block design, 25 treatments, four replications and ten plants per plot. The roots were evaluated for the incidence of damage and number of holes caused by soil insects, format, length, diameter, shell thickness, color of skin and flesh, total and commercial yield, starch income, moisture, soluble solids content, total acidity and ratio. The clones 1223 and 1210 showed aptitude for fresh consumption, with high productivity and moderate resistance to soil insects. Clone 1229 was moderately resistant to insects and had multiple horticultural aptitudes. 1227, 1197, 1230, 1231 and 1232 were also selected because of their desirable characteristics. Several characters were correlated, indicating the possibility of indirect selection for these factors. The ratio between genetic and environmental coefficients of variation, and the broad-sense heritability estimates were high for shell thickness, starch income, moisture, total yield and marketable yield of roots, demonstrating the efficiency of the selection method. In the second trial, 21 clones of the clonal garden and three cultivars of sweet potato (Brazlândia Branca, Brazlândia Roxa e Amarela) were tested about their reaction to root-knot nematodes. The experiment was conducted in a greenhouse with a randomized block design in simple arrangement, with 24 treatments and four replicates for each test (each test corresponded to a population of Meloidogyne spp.). The inoculation of the pathogen was made thirty days after branches planting, and after ninety days, were evaluated the following characteristics: average number of egg masses, number of eggs, fresh and dry weight from the aerial part of the plant, and root fresh mass. Nematode resistance levels were defined both by the average number of egg masses and the reproduction factor. The clones 1199, 1202, 1209, 1210, 1216, 1230 and 1231 were identified as resistant to all nematode populations, and were selected to remain in the breeding program. In all tests, correlations were observed between the number of egg masses, number of eggs and reproductive factor. The relationship between the coefficients of genetic and environmental variation and broad sense heritability were high for the number of egg masses, the number of eggs and reproduction factor of only one of the populations analyzed (Meloidogyne spp. - Jiló), which demonstrates the efficiency of the method employed in the selection of resistant genotypes to this population.
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Variabilidade genética e agressividade a soja [Glycine max (L.) Merrill] de populações de Meloidogyne spp. do Cerrado e de áreas de cultivo / Genetic variability and aggressiveness to soybean [Glycine max (L.) Merrill] of Meloidogyne spp. populations from cerrado and cultivated areas

Mattos, Vanessa da Silva 24 April 2013 (has links)
Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Programa de Pós-Graduação em Fitopatologia, 2013. / Submitted by Tania Milca Carvalho Malheiros (tania@bce.unb.br) on 2013-08-20T15:21:18Z No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2013-08-27T13:11:23Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-27T13:11:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_VanessaSilvaMattos_Parcial.pdf: 1084596 bytes, checksum: 280cf0f4a212b1b281420bd334f20eae (MD5) / A conversão para a agricultura intensiva, a fim de atender à crescente demanda por soja, cana-de-açúcar e criação de gado, está ocorrendo rapidamente sobre as vastas áreas dos 1,8milhões de km² do cerrado brasileiro, uma região que é naturalmente um mosaico de vegetação, clima e solos. Apesar de sua biodiversidade, há poucos estudos com nematoides, especialmente os do gênero Meloidogyne. O objetivo deste trabalho foi estudar e comparar a variabilidade genética e a variação em agressividade em cultivares de soja de populações de três espécies de Meloidogyne (M. javanica, M. incognita e M. morocciensis) provenientes de diferentes fitofisionomias do Cerrado e comparar com populações de áreas de cultivo agrícola. O estudo da variabilidade genética foi realizado através da utilização de 30 primers RAPD e 7 de AFLP. Bandas foram separadas num gel de agarose a 1,5% e contadas como presentes ou ausentes nas fotografias digitalizadas dos géis. Para cada um dos dois marcadores moleculares, esses dados referentes aos fragmentos foram convertidos em uma matriz binária. Análises de clusters mostraram a separação entre as populações do Cerrado e as populações de áreas de cultivo. A variabilidade intra-específica em M. javanica, M. morocciensis e M. incognita representou 26,7; 16,6 e 15,3% dos fragmentos polimórficos, respectivamente. A agressividade dessas populações em cinco diferentes cultivares de soja foi também estudada. O experimento foi conduzido em casa de vegetação em que cinco cultivares de soja foram inoculadas com 5.000 ovos por planta com cada população selecionada. Sessenta dias após a inoculação (DAI), foi determinado o fator de reprodução (FR). As populações de Meloidogyne spp. provenientes da soja e as populações coletadas no Cerrado apresentaramreações de agressividade semelhantes, com exceção de M. morocciensis, cuja população da soja foi bem mais agressiva que a do cerrado. ______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Conversion to intensive agriculture to meet rising demand for soybeans, sugarcane, and livestock products is rapidly occurring over vast areas of the 1.8 million km Brazilian Cerrado; a region that is naturally a mosaic of vegetation, climates and soils. Despite a vast biodiversity in the Cerrado, there are few studies with nematodes, especially those of the genus Meloidogyne. The aim of this work was to study and compare the genetic variability and variation in aggressiveness in soybean cultivars among populations of three Meloidogyne species (M. javanica, M. incognita and M. morocciensis) from different physiognomic vegetation of Cerrado and from crop areas. DNA amplifications were done using 7 AFLP and 30 RAPD primers. Amplified fragments were separated on a 1.5% agarose gel and scored as present or absent from the digitized photographs of the gels. For each of the two markers, DNA fingerprints of the populations were converted into a binary matrix. Cluster analyses separated Cerrado populations and the populations from cropping areas. The intraspecific variability in M. javanica, M. morocciensis and M. incognita represented 26,7%; 16,6% and 15,3% of the polymorphic fragments, respectively. The aggressiveness of the nematode populations on five soybean cultivars was also studied. The experiment was conducted under greenhouse conditions in which soybeans cultivars were inoculated with 5.000 eggs per plant of each population. Sixty days after inoculation, nematode reproduction factor (RF) was determined. Populations of Meloidogyne spp. from Cerrado and cultivated areas showedsimilar aggressiveness, except for M. morocciensis, whose population from soybean field was more aggressive than the one from Cerrado.
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EFEITOS DA ADUBAÇÃO FOLIAR COM SILÍCIO NA RESISTÊNCIA DO CACAUEIRO (Theobroma cacao L.) À VASSOURA-DE-BRUXA (Moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora)

FANTINATO, D. E. 26 February 2014 (has links)
Made available in DSpace on 2018-08-02T00:16:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_8117_DISSERTAÇÃO_FANTINATO.pdf: 1694906 bytes, checksum: 1a63022cbdc58b7056c51aae00381077 (MD5) Previous issue date: 2014-02-26 / RESUMO Efeitos da adubação foliar com silício na resistência do cacaueiro (Theobroma cacao L.) à vassoura-de-bruxa (Moniliophthora perniciosa (Stahel) Aime & Phillips-Mora) O grande interesse econômico do cacaueiro (Theobroma cacao) é devido, principalmente, à utilização de suas sementes para a produção de manteiga de cacau e chocolate. No entanto, esse agronegócio tem enfrentado uma crise em decorrência da vassoura-de-bruxa, considerada uma das doenças mais destrutivas do cacaueiro e causada pelo fungo Moniliophthora perniciosa. Uma alternativa no manejo de doenças em plantas que tem sido utilizada é a indução de resistência, podendo ser obtida através de tratamentos utilizando produtos a base de silício. Assim o objetivo do presente trabalho foi avaliar a eficácia de diferentes doses de silício na proteção de plantas de cacaueiro, genótipo Catongo, contra a doença vassoura-de-bruxa por meio da análise de características morfo-fisiológicas e bioquímicas. O delineamento experimental foi em Blocos Casualizados (DBC), com 4 repetições, em arranjo fatorial 2 x 4, constituído de dois fatores de inoculação (inoculado e não-inoculado) e quatro doses de silício (0 mg mL-1 ; 0,5 mg mL-1; 1,0 mg mL-1 e 2,0 mg mL-1) com o produto AgriSil (98% de SiO2), resultando em 32 parcelas com 10 plantas cada, totalizando 320 plantas. Os resultados obtidos foram submetidos à análise de variância e regressão. Foram realizadas análises enzimáticas, trocas gasosas, teor de silício foliar e densidade estomática. Plantas inoculadas apresentaram aumento da fotossíntese e das atividades de quitinases e polifenoloxidases com a aplicação de doses crescentes de Si. Já a densidade estomática mostrou-se máxima na dose 0,79 mg/mL de Si, enquanto a concentração máxima de Si nas folhas foi obtida na dose 0,7 mg/mL de Si. Os resultados sugerem que doses crescentes de silício demonstram-se benéficas para amenizar os efeitos causados por M. perniciosa em mudas de cacaueiros. Palavras-chave: cacauicultura, fitopatologia, resistência induzida, quitinase, polifenoloxidase.
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Isolamento e caracterização de uma nova sequencia de DNA envolvida com patogenicidade de Xanthomonas campestris pv vesicatoria em tomate

Tahara, Sandra Toshico 21 July 2018 (has links)
Orientador: Yoko Bomura Rosato / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-21T10:08:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tahara_SandraToshico_M.pdf: 4098148 bytes, checksum: 05c9dc310c3ac4e06ee0cee4ae7e7adb (MD5) Previous issue date: 1996 / Mestrado
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Produção de oxido nitrico pela oxido nitrico sintase, nitrato redutase e uma atividade mitocondrial redutora de nitrito na resposta de defesa de Arabidopsis thaliana a Pseudomonas syringae

Modolo, Luzia Valentina 16 December 2004 (has links)
Orientador: Ione Salgado / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-04T03:06:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Modolo_LuziaValentina_D.pdf: 799010 bytes, checksum: 1363bbb027c17ac1fd3b4e9f93479455 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A origem do óxido nítrico (?NO) em plantas tem sido controversa e uma enzima do tipo óxido nítrico sintase (NOS), bem como nitrato redutase (NR) são consideradas possíveis fontes deste radical livre. Contudo, ainda não há nenhuma evidência direta da formação de ?NO a partir da NR durante interações planta-patógeno. Nos estudos aqui descritos foram utilizadas plantas de Arabidopsis thaliana deficientes na enzima NR para investigar o mecanismo de produção de ?NO em resposta à inoculação da bactéria Pseudomonas syringae pv. maculicola (Psm). Aumento na síntese de L-citrulina a partir de L-arginina foi observado em homogenatos de folhas de plantas do tipo selvagem e daquelas deficientes na síntese de NR, após inoculação com Psm. Experimentos de ressonância paramagnética eletrônica, contudo, mostraram uma produção muito maior de ?NO dependente de NO2-, mas não de L-arginina ou NO3-, síntese esta inibida por alta concentração de L-arginina. A inibição da cadeia de transporte de elétrons da mitocôndria aboliu ou inibiu parcialmente esta atividade em plantas mutantes ou selvagens, respectivamente. A utilização do marcador fluorescente 4,5 diaminofluoresceína diacetato (DAF-2DA) mostrou que a inoculação com Psm aumentou substancialmente a produção de ?NO in situ em plantas selvagens, mas não em mutantes deficientes na síntese de NR. No entanto, a infiltração de L-arginina ou NO2- causou uma produção de ?NO in vivo nas plantas mutantes. Plantas de A. thaliana deficientes na síntese de NR mostraram suscetibilidade à P. syringae que foi prevenida pela co-infiltração de NO2-. O conjunto de resultados sugere que NOS, NR e uma importante atividade mitocondrial de redução de NO2- podem cooperar para produzir ?NO em quantidade suficiente para prevenir a disseminação de Psm em plantas de A. thaliana / Abstract: The origin of nitric oxide (?NO) in plants has been controversial and nitric oxide synthase (NOS)-like enzyme and nitrate reductase (NR) are claimed as potential sources. However, there is still no direct evidence for ?NO formation from NR during plant-pathogen interactions. Here, we used NR-defective double mutants of Arabidopsis thaliana to investigate the mechanism of ?NO production following infection by an avirulent strain of Pseudomonas syringae pv. maculicola (Psm). Increased formation of L-citrulline from L-arginine was observed in leaf homogenates of both wild-type and nia1 nia2 mutant plants. Electron paramagnetic resonance experiments, however, showed a much higher ?NO production that was dependent on NO2- rather than on L-arginine or NO3- and was also inhibited at high L-arginine concentrations. Inhibition of mitochondrial electron transport abolished and inhibited partially this activity in nia1 nia2 mutants and wild-types, respectively. In situ ?NO production was substantially increased in wild type-plants but not in mutants, following Psm challenge, as measured with the fluorescent probe 4,5-diaminofluorescein diacetate. However, in vivo ·NO production in NR-deficient mutants was visualized only after L-arginine or NO2- infiltration into the leaves. A. thaliana plants defective in NR showed susceptibility to P. syringae that was prevented by infiltration of NO2-. The overall results suggest that NOS, NR, and an important mitochondrial-dependent nitrite-reducing activity cooperate to produce ?NO in amounts enough to prevent Psm dissemination in A. thaliana plants / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular
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Analise e aplicabilidade do complexo ecologico de Anthonomus grandis Boheman, 1843 (coleoptera, curculionidae), na região de Campinas, SP

Pierozzi Junior, Ivo 16 July 2018 (has links)
Orientador : Mohamed E. M. Habib / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-16T21:32:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PierozziJunior_Ivo_D.pdf: 14148271 bytes, checksum: c6c64277d26716869fbda5e024686261 (MD5) Previous issue date: 1989 / Resumo: O presente trabalho teve como objetivo fornecer uma análise abrangente do complexo ecológico no qual Anthonomus grandis Boheman está inserido na região de Campinas, SP, bem como avaliar sua aplicabilidade em termos de orientação para a elaboração de programas de M.I.P. Durante quatro anos consecutivos, foram desenvolvidos estudos que visam descrever o comportamento populacional do curculionídeo tanto durante o ciclo do algodão, como durante a entressafra considerando, conjuntamente, as influências dos fatores climáticos, da fenologia do algodoeiro cultivado, a atuação dos inimigos naturais e do impacto de medidas de supressão das populações das pragas da cultura. Os resultados desses estudos permitiram visualizar que as populações de A. grandis exibem, durante o ano, um padrão bem definido de comportamento. O início de cada ciclo caracterizou-se, sempre, por apresentar baixíssimos níveis populacionais, que somente atingiram valores preocupantes quando as medidas de controle não puderam ser adequadamente empregadas. Nesse particular, os fatores climáticos, como estiagem prolongada no início de primavera, inviabilizando a instalação de cultura isca ou pesadas chuvas, atrapalhando as operações de aplicação de inseticidas, foram os principais problemas enfrentados. Mesmo assim, tal aumento nunca se deu antes de a cultura completar 60 dias. Em todos os campos estudados observou-se que os frutos, formados durante a fase da cultura em que há abundância de botões florais, ficaram relativamente livres do ataque do inseto, por causa da sua preferência por estes últimos sítios de alimentação e reprodução. ...Observação: O resumo, na íntegra, poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The presente work was undertaken in order to obtain an over-all analysis of the ecological complex in which Anthonomus grandis Boheman is included in the region of Campinas, SP, Brazil. Also, the applicability of this analysis in the elaboration of I.P.M. programs was considered. During a continuous period of four years, the population behavior of A. grandis was evaluated. The effects of climate, host plant phenology, natural enemies and control methods were analysed. These studies revealed that the insect populations exhibit a characteristic behavior which was repeated yearly. In the beginning of each season the infestation level was extremely low. Only during the plant flowering stage, the boll weevil population density could reach a considerable level, principally when control methods were not adequately utilized. In this case, the trapping plants were not grown successfully due to drought during Spring. Also, excess of rainy water reduced the efficiency of chemical control in such a case. It was observed, also during the present study. That A. grandis prefers squares than bolls for feeding and reproduction. Specific symptoms and signs could be utilized to identify and evaluate the different natural mortality factors affecting this insect in squares as well as in bolls. However, in the first site, putrefaction showed to be the principal cause of death, due to the high humidity at the soil surface. On the other hand, the natural occurrence of Bracon spp. was the main mortality factors for the second site. ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations / Doutorado / Doutor em Ecologia
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Desenvolvimento de sistema inteligente para classificação da severidade da mancha foliar bacteriana do eucalipto /

Favan, João Ricardo, 1986. January 2019 (has links)
Orientador: José Raimundo de Souza Passos / Banca: Osvaldo Cesas Pinheiro de Almeida / Banca: Luis Hilario Tobler Garcia / Banca: Tadeu Antonio Fernandes da Silva Júnior / Banca: Rogerio Antonio de Oliveira / Resumo: O setor florestal brasileiro e, principalmente, o setor de árvores plantadas tem suma importância para a economia do Brasil. Nessa cadeia produtiva, os viveiros florestais são os responsáveis por fornecer as mudas utilizadas em reflorestamentos, sendo que esses fornecem matéria prima para as indústrias de energia e papel e celulose. Dessa forma, o adequado manejo e a prevenção de doenças nas plantas comercializadas ocupam um lugar de destaque na produção dos viveiros. A Mancha Foliar Bacteriana (MFB) do eucalipto é uma doença preocupante para a produção de mudas de eucalipto, visto que sua incidência, sem o devido tratamento, pode levar a grandes perdas. A reflectância foliar de plantas pode ser um indicador para as respostas a diversos fenômenos biofísicos e bioquímicos em plantas. Este trabalho desenvolveu classificadores baseados em Inteligência Artificial para discriminar a ocorrência da mancha foliar bacteriana, assim como determinar sua severidade e seu período de latência, utilizando imagens digitais e assinaturas espectrais das folhas de eucalipto. Mudas de eucalipto foram inoculadas com uma suspensão de bactérias Xanthomonas spp. e suas assinaturas espectrais e imagens digitais foram coletadas durante oito dias consecutivos. Mudas de eucalipto não inoculados foram utilizados com controle negativo. Os dados coletados foram analisados utilizando técnicas estatísticas e de inteligência artificial, a fim de se obter a severidade da doença, seu período de latência, distin... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Brazilian forestry sector has great importance to the Brazilian economy. Forest nurseries are responsible for supplying the seedlings used in reforestation, which provide raw material for the energy, pulp and paper industries. Adequate management and prevention of diseases in plants is important for nurseries. Bacterial leaf spot of eucalyptus is a worrying disease for the production of seedlings, since its incidence, without treatment, causes losses. Leaf reflectance can be an indicator for the responses to various biophysical and biochemical phenomena in plants. The objective of this work was to develop classifiers based on artificial intelligence to discriminate the existence of the bacterial disease of the leaf spot, as well as to determine its severity and period of latency using digital images and spectral signatures of eucalyptus leaves. Eucalyptus seedlings were infected with Xanthomonas spp. and their spectral signatures and digital images were collected during eight consecutive days. Collected data were analyzed using statistical and artificial intelligence techniques, obtain the severity of the infection, latency period distinction between healthy and infected seedlings. computational models showed good results for the discrimination between diseased and healthy plants, allowing the presymptomatic detection of the disease. Severity of the disease was better adjusted by the statistical models of multiple linear regression. Computational and statistical tools should be used together to obtain best results in the classification of diseases and the prediction of their severity. / Doutor
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Antracnose em inflorescências de plantas ornamentais tropicais:caracterização de isolados de Colletotrichum, escala diagramática e reação de cultivares

BARGUIL, Beatriz Mireles 23 November 2006 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-21T13:02:56Z No. of bitstreams: 1 Beatriz Meireles Barguil.pdf: 866270 bytes, checksum: c8c6c11db8a2c4bc261affc072520e23 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-21T13:02:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Beatriz Meireles Barguil.pdf: 866270 bytes, checksum: c8c6c11db8a2c4bc261affc072520e23 (MD5) Previous issue date: 2006-11-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The tropical flower crop has increased in several states of the Northeast region of Brazil based on the high acceptance of the product and it potencial as a profitable activity. The anthracnose caused by Colletotrichum spp. can affects many of these species influencing negatively the quantity and quality of the final product. The present work aimed: a) to characterize Colletotrichum isolates from tropical flowers by morphological, exoenzimes production, pathogenicity and molecular methods; b) to develop a diagrammatic key for anthracnose on torch ginger; c) to evaluate the response of anthurium cultivars, the effect of inoculation point quantity, and the different development stages on anthracnose development. All isolates presented Colletotrichum gloeosporioides characteristics, by morphological and molecular methods, excepted the DNA from C 23 and C 35 isolates that weren`t amplified with the specific primer. The conidia from the different isolates were hyaline, unicellular and cilindrical, and apressoria varied in shape and size, with dark brown color. The colony color varied from white to dark gray. All isolates showed enzymes activity on specific mediums. Thepathogenicity was variably between isolates. Six anthurium`s isolates and four heliconia`s isolates weren`t pathogenic when inoculated on their hosts. All isolates from torch ginger were pathogenic. Some of them showed cross-infection capacity. Genetic variability was verified by ap-PCR with three different primers. The diagrammatic key elaborated to evaluate anthracnose on torch ginger includ the levels 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 82 and 92% of diseased bracts area. On the first evaluation without the key raters overestimated and underestimate the disease severity. With the diagrammatic key raters obtained better levels of accuracy and precision, with absolute errors concentrated around 10%. Raters showed good repeatability and high reproducibility of estimative by using the key compared to the no use of it. The lesion size development was influenced by espathe age on anthurium. On espathes on stage 1, where the esphathes still closed, the lesions were significantly bigger them espathes on 4 and 5 stages. Bigger lesions were observed with five points per wound on the two cultivars (cvs. Tropical and Cananéia) and isolates tested. Inoculation time not influenced the lesion size oncultivars tested. The incubation period (IP) was variable with cultivars and isolate. The smaller IP for Cg 1 were observed on Astral, Tropical, Netuno and Farao. On Sonate,for Cg 1 and on Farao and Midori for Cg . / O cultivo de flores tropicais tem-se expandido em vários estados do Nordeste do Brasil pela grande aceitação desses produtos pelo mercado consumidor e a perspectiva de um agronegócio de elevado retorno econômico. A antracnose causada por Colletotrichum spp. pode afetar várias espécies tropicais, comprometendo a quantidade e qualidade do produto final. Devido à carência de informações nesses patossistemas, o presente trabalho objetivou: a) Caracterizar através de morfologia, produção de exoenzimas, patogenicidade e análise molecular de isolados de Colletotrichum de flores tropicais; b) Elaborar uma escala diagramática para avaliação da severidade da antracnose em bastão do imperador; e c) Avaliar o comportamento de cultivares de antúrio, em diferentes fases de desenvolvimento e o efeito da quantidade de pontos de inoculação na severidade da antracnose quando infectadas com C. gloeosporioides. Todos os 37 isolados testados produziram conídios hialinos, unicelulares, retos e cilíndricos e apressórios de coloração marrom escuro e formato variável. A coloração das colônias variou de branco a cinza escuro. O DNA da maioria dos isolados foi amplificado com o oligonucleotídeo específico para a espécie C. gloeosporioides, confirmando os dados obtidos através das características morfológicas. O DNA dos isolados C 23 e C 35foi amplificado com os primers espécie-específicos para a confirmação da espécie. Todos os isolados produziram enzimas amilolíticas, lipolíticas e proteolíticas em meios de cultura específicos. A patogenicidade dos isolados foi variável. Seis isolados obtidos de antúrio e quatro isolados de helicônia não foram patogênicos quando inoculados nos respectivos hospedeiros, sendo que todos os isolados provenientes de bastão do imperador foram patogênicos. Alguns isolados de antúrio, bastão do imperador, helicônia e musa foram patogênicos quando em inoculações cruzadas. A variabilidade genética dos 37 isolados de Colletotrichum foi determinada com três oligonucleotídeos arbitrários. A escala diagramática elaborada para a antracnose em bastão do imperador apresenta níveis de 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 82 e 92% de área lesionada da bráctea. A avaliação da severidade da antracnose em bastão do imperador sem a utilização dessa escala gerou resultados contraditórios onde os avaliadores tanto superestimaram como subestimaram a intensidade da doença. Com o emprego da escala, os avaliadores obtiveram melhores níveis de acurácia e precisão, com os erros absolutos concentrandose na faixa de 10%. Os avaliadores apresentaram boa repetibilidade e elevada reprodutibilidade das estimativas com a utilização da escala, o mesmo não sendo verificado sem a utilização dessa. Em antúrios, a idade da espata influenciou o desenvolvimento da lesão para os dois isolados avaliados. Em espatas no estádio 1, sem a completa abertura, as lesões formadas foram significativamente maiores do que aquelas formadas em espatas nos estádios 4 e 5. As maiores lesões causadas pelos isolados do patógeno foram formadas com cinco pontos de ferimento nas duas cultivares de antúrio (cvs. Tropical e Cananéia). A época de inoculação não influenciou no tamanho da lesão, nas duas cultivares avaliadas. Os menores períodos de incubação (PI) para o isolado Cg 1 foram observados nas cultivares Astral, Tropical, Netuno e Farao, diferindo significativamente nas demais cultivares. Nas cultivares Sonate, Astral, Tropical, Netuno e Farao foram observados os menores PI para o isolado Cg 2. A menor AACPD resultante da inoculação com Cg 1 foi observada em Sonate, que diferiu das demais cultivares. As menores AACPD ocasionadas pelo isolado Cg 2 foram observadas em Farao e Midori, que diferiram das cultivares Cananéia, Sonate, Tropical e Netuno.
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Variabilidade de isolados de Curvularia eragrostidis (Henn) meyer causando queima das folhas do inhame (Discorea cayennensis Lam.) no estado de Pernambuco

PAULA, Helenilza de 20 December 2000 (has links)
Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-13T12:23:23Z No. of bitstreams: 1 Helenilza de Paula.pdf: 563470 bytes, checksum: 8516fe943f64533b1a028f0edced6282 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-13T12:23:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Helenilza de Paula.pdf: 563470 bytes, checksum: 8516fe943f64533b1a028f0edced6282 (MD5) Previous issue date: 2000-12-20 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Leaf blight, caused by Curvularia eragrostidis, is one of the main diseases of the yam in Brazilian Northeast, however studies on the pathogen variability are inexistent. In order to characterize the variability of C. eragrostidis, 42 strains obtained from yam fields in the Pernambuco State were evaluated in relation to epidemiological components, physiologic characteristics and sensibility to iprodione. In the epidemiological components study, yam plants, cv. Da Costa, were inoculated with strains of C. eragrostidis (1x104 conidia/ml) and evaluated daily for occurrence and severity of disease symptoms, to record incubation period (IP) and area under disease progress curve (AUDPC). Strains were evaluated “in vitro” for micelial growth rate (MGR), sporulation (SP) and germination of conidia (GER), as well as for sensitivity to iprodione, evaluated by the lethal dose which inhibited 50% of micelial growth (DL50) and percentage of inhibition of conidium germination (ICG). There were significant differences (P=0.05) among the strains of C. eragrostidis in relation to all variables, resulting in different similarity groups of strains according to the Scott-Knott test. There were no significant correlation (P=0.05) between the variables associated with disease (IP and AUDPC) and the other variables studied (MGR, SP, GER, DL50 and ICG). When all variables were analyzed by the Euclidean distance (single linkage), the 42 strains were gathered into seven similarity groups. Therefore, there is variability among the strains of C. eragrostidis, which causes leaf blight of yam in different planting areas in Pernambuc / A queima das folhas, causada por Curvularia eragrostidis, constitui uma importante doença do inhame no Nordeste brasileiro, embora inexistam estudos sobre a variabilidade do patógeno. Com o objetivo de analisar a variabilidade de C. eragrostidis, 42 isolados obtidos de áreas de plantio de inhame do Estado de Pernambuco foram avaliados em relação a componentes epidemiológicos, características fisiológicas e sensibilidade ao fungicida iprodione. No estudo dos componentes epidemiológicos, plantas de inhame (cv. Da Costa) com quatro meses de idade foram inoculadas com os isolados de C. eragrostidis (1x104 conídios/ml) e avaliadas diariamente quanto à presença e severidade dos sintomas de queima, sendo obtidos o período de incubação (PI) e a área abaixo da curva de progresso de doença (AACPD). Cada isolado foi também avaliado “in vitro” quanto a características fisiológicas como taxa de crescimento micelial (TCM), esporulação (ESP) e germinação de conídios (GER), assim como em relação à sensibilidade ao fungicida iprodione, avaliada pela dose do fungicida suficiente para inibir 50% do crescimento micelial (DL50) e pela porcentagem de inibição da germinação dos conídios (IGC). Foram constatadas diferenças significativas (P=0,05) entre os isolados de C. eragrostidis em relação a todas as variáveis avaliadas, sendo possível a separação dos isolados em diferentes grupos de similaridade pelo teste de Scott-Knott. Não foram constatadas correlações significativas (P=0,05) das variáveis associadas à doença (PI e AACPD) com as demais variáveis (TCM, ESP, GER, DL50 e IGC). Utilizando o conjunto das variáveis, a análise da distância Euclidiana por ligações simples permitiu a separação dos 42 isolados de C. eragrostidis em sete grupos de similaridade. Os resultados obtidos indicam a existência de variabilidade entre os isolados do patógeno causando queima das folhas em diferentes áreas de cultivo de inhame de Pernambuco.
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Caracterização funcional e envolvimento do operon htrA-XAC3983 na patogenicidade e virulência de Xanthomonas citri subsp. citri /

Silva, Ana Carolina Buzinari da. January 2019 (has links)
Orientador: Jesus Aparecido Ferro / Resumo: O cancro cítrico tem como agente causal a bactéria Xanthomonas citri subsp. citri (Xac), que afeta todas as espécies de citros economicamente importantes. O sequenciamento do genoma do isolado 306 desta bactéria (Xac 306) revelou que 37,4 % dos genes não tinham uma função predita. Assim, a genômica funcional da interação Xac-hospedeiro tem um papel importante na elucidação da função dos genes e dos mecanismos envolvidos na patogenicidade e virulência dessa bactéria. Os genes XAC3981, XAC3982 e XAC3983 fazem parte deste contexto de genes codificadores de proteínas sem função conhecida (hipotéticas). As proteínas codificadas por estes três genes são conservadas em bactérias da família Xanthomonadaceae. Em um estudo prévio, o gene XAC3981 da Xac 306 foi interrompido por inserção do transposon Tn5 e esse mutante apresentou ausência de sintomas quando inoculado em plantas cítricas, sugerindo que possui um papel importante na patogenicidade de Xac. No presente estudo demonstrou-se que os genes XAC3981-3983, juntamente com o gene htrA (XAC3980), constituem um operon funcional de Xac 306. O presente estudo avaliou também os efeitos de mutações por deleção em algumas regiões do operon htrA-3983. Um mutante foi produzido por deleção de 84% da sequência codificadora do gene XAC3982 (ΔXAC3982) e outros três foram obtidos pela deleção das regiões promotoras desse operon. O mutante ΔXAC3982, quando comparado com a estirpe selvagem, alterou o fenótipo em genótipos resistentes e suscetíveis ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) is the causal agent of citrus canker, a disease that affects all economically important citrus species. The genome sequencing of the 306 isolate of this bacterium (Xac 306) revealed that 37.4% of the genes had no predicted function. Thus, the functional genomics of the Xac-host interaction play an important role in the elucidation of the function of the genes and in the mechanisms involved in the pathogenicity and virulence of this bacterium. The genes XAC3981, XAC3982 and XAC3983 are part of this context of protein coding genes with unknown function (hypothetical). The proteins encoded by these three genes are conserved and present exclusively in bacteria of the family Xanthomonadaceae. In a previous study, the ORF XAC3981 from Xac306 was disrupted by insertion of the Tn5 transposon and the mutant showed no symptoms when inoculated in citrus plants, suggesting that it plays an important role in Xac pathogenicity. In the present study, genes XAC3981-3983, together with gene htrA (XAC3980), have been shown to constitute a functional operon of Xac 306. The present study also evaluated the effects of deletion mutations in some regions of XAC3980-3983 operon. One mutant was produced by deleting 84% of the coding sequence of the gene XAC3982(ΔXAC3982) and another three were obtained by deleting the promoter regions of that operon. The ΔXAC3982 mutant, when compared to the wild type strain, altered the phenotype in resistant citrus... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

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