Thesis (MSc Food Sc)--Stellenbosch University, 2015. / ENGLISH ABSTRACT: The microbial growth, colour stability and pH changes for black wildebeest (Connochaetes gnou) meat under chilled (4.2±0.8°C) vacuum storage were investigated. The investigation centred on the role of ultimate muscle pH on shelf life of the meat. Although bacterial growth was observed over time for both DFD (pH >6) and Normal (pH <6) meat, DFD meat exhibited higher growth rates for lactic acid bacteria (LAB), total viable counts (TVC) and total coliforms. This was attributed to the combination of high pH and possibly the depletion of glucose in the DFD muscles. On the other hand, the growth rate of total coliforms was less than what was observed for the other microorganisms tested. It was assumed that chilled vacuum storage in combination with the high levels of LAB inhibited the growth of total coliforms. Salmonella was not detected in any of the samples analysed. There were no changes in pH during the 12 days storage period for DFD meat whereas pH for Normal meat decreased towards the end of storage possibly due to lactic acid production by LAB. The colour changes were more noticeable in Normal meat (more browning) than in DFD meat after blooming for 30 min. The conclusion for this study was that DFD meat spoiled faster than Normal meat. The meat was further subjected to preservation by oregano essential oil (1% v·v-1). In this case, there was an initial inhibition of TVC, LAB and total coliforms. Furthermore, the growth rates for TVC and LAB were lower (p<0.05) in the oregano oil treatment group than in the control. For total coliforms however, there was only an initial inhibition observed and no effect on the growth rate. Addition of oregano essential oil also resulted in a significant lowering of meat pH. This may have added to the microbial inhibition observed. Based on TVC values, addition of oregano essential oil extended the shelf-life of black wildebeest meat by 3 days. At the beginning of the study, the lipid oxidation (TBARS) values were above the threshold for detection. Also, the percentage of metmyoglobin had exceeded the levels at which browning becomes visible. Therefore, conclusions on the effects of oregano essential oil on the colour and lipid oxidations were not made in this study. However, oregano essential oil inhibited microbial growth and stabilised TBARS throughout the 9 day storage period. Therefore there is potential to use oregano essential oil as a preservative for black wildebeest meat, although more research is needed. / AFRIKAANSE OPSOMMING: In hierdie studie word die mikrobiese groei, stabiliteit en pH kleur verandering ondersoek vir swartwildebeestevleis onder verkoelde (4.2 ± 0.8 ° C) vakuum berging. Die ondersoek is spesifiek gefokus op die rol van die eind-spier pH op die raklewe van die vleis. Alhoewel mikrobiese groei vir beide DFD (pH >6) en Normal (pH <6) vleis waarneembaar was met verloop van tyd, het die DFD vleis hoër groeitempo vir melksuurbakterieë (MSB) en totale lewensvatbare tellings (LVT) getoon. Dit was as gevolg van die kombinasie van hoë pH en die moontlikheid van die vermindering van die glukose in die DFD spiere. Aan die ander kant was dit waargeneem dat die groeikoers van die totale kolivormig bakterieë minder was, teenoor die ander mikro-organismes wat getoets was. Dit was aangeneem dat die verkoelde vakuum stoor die groei van die totale kolivormig bakterieë geïnhibeer het. Salmonella was nie opgespoor in enige van die geanaliseerde monsters nie. Daar was geen verandering in pH tydens die stoor tydperk vir DFD vleis nie, maar die pH vir normale vleis het tydens die einde van die stoor tydperk afgeneem. Die kleur verandering onder vakuum stoor was meer waarneembaar in die normale vleis as wat dit was in die DFD vleis. Die gevolgtrekking van hierdie studie was dat DFD vleis baie vinniger bederf teenoor normale vleis. Maar daar was variasie op die gewig van die oorspronklike mikrobiese lading en dit kon die bakteriese groeitempo van die normale vleis beïnvloed. Die vleis is verder behandel met oregano essensiële olie ( 1 % v·v-1) vir preservering . In hierdie geval, was daar 'n aanvanklike inhibisie van LVT, MSB en totale kolivormig bakterieë. Verder was die groeitempo vir LVT en MSB aansienlik laer (p<0.05 ) in die behandelings groep teenoor die in die kontrole . Vir die totale kolivormig bakterieë was daar egter net 'n aanvanklike inhibisie waargeneem en geen effek op die groeikoers nie. Die byvoeging van oregano essensiële olie het ook gelei tot 'n beduidende verlaging van die pH. Dit kon gelei het tot die mikrobiese inhibisie wat waar geneem was. Gebaseerd op die LVT, het die byvoeging van oregano essensiële olie gelei tot die verlenging van die swartwildebeeste vleis se raklewe met 3 dae. Aan die begin van hierdie studie was die lipied oksidasie (TBARS) waardes bo die drumpel van opsporing. Ook, die persentasie van metmyoglobin het die vlakke waarop verbruining sigbaar word, oorskry. Daar is potensiaal vir die gebruik van oregano essensiële olie as n middel vir die verlenging van swartwildebees vleis, maar nog navorsing is nodig.

Orientador: Ana Lúcia Barretto Penna / Coorientador: / Banca: Daise Aparecida Rossi / Banca: Roberto da Silva / Resumo: As culturas selvagens ou autóctones isoladas de diversos alimentos podem produzir enzimas, vitaminas e compostos aromatizantes, ou ainda, compostos que apresentem efeitos fisiológicos em humanos. Estudos recentes realizados pelo nosso grupo de pesquisa mostraram que algumas cepas autóctones isoladas de muçarela de búfala são produtoras de bacteriocinas, e outras apresentam características probióticas. Neste contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as características de segurança e tecnológicas de treze cepas autóctones de bactérias acidoláticas (BAL) termófilas de Lactobacillus helveticus (SJRP56 e SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 e SJRP109) e Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149, SJRP181). Para a caracterização de segurança das culturas foram verificadas a susceptibilidade a antibióticos, a atividade hemolítica e das enzimas β-glucosidase, N-acetil-β-glucosaminidase e β-glucuronidase, e a presença de genes que caracterizam fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e resistência a antibióticos. As propriedades tecnológicas: cinética de acidificação, produção de exopolissacarídeos e atividade enzimática, foram avaliadas para todas as cepas. Para as cepas consideradas seguras também foram realizadas as análises da hidrólise da caseína e a atividade de aminopeptidases. A partir da caracterização de segurança e tecnológica foram selecionadas quatro cepas: Lb. helveticus SJRP56 e SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 e S. thermophilus SJRP107 para aplicação na produção de queijo Parmesão. Os queijos foram produzidos em escala industrial em dois processamentos independentes, utilizando-se leite pasteurizado e padronizado com 2,3% de gordura. Foi determinada a composição centesimal dos queijos após a produção, e durante o período de maturação foram avaliadas as características físico-químicas... / Abstract: Autochthonous lactic acid bacteria (LAB) isolated from various food can produce enzymes, vitamins, and flavor compounds, or compounds that exhibit physiological effects. Recently, studies performed by our research group showed that some autochthonous strains isolated from water buffalo mozzarella cheese are capable of producing bacteriocin as well as some strains presented probiotic properties. In this context, the aim of this study was to evaluate the safety and technological characteristics of autochthonous thermophilic lactic acid bacteria (LAB) strains of Lactobacillus helveticus (SJRP56 and SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 and SJRP109) and Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149 and SJRP181). For the safety characterization of the cultures, the antibiotic resistance, the hemolytic, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase and β-glucuronidase activities, and the investigation of the presence of genes that characterize virulence factors, production of biogenic amines and antibiotic resistance were carried out. The technological properties: acidification kinetics, exopolysaccharide production and enzymatic activity were evaluated for all strains. For the safe strains the analyses of the casein hydrolysis and aminopeptidase activity were also performed. From the safety and technological characterization, four strains were selected: Lb. helveticus SJRP56 and SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 and S. thermophilus SJRP107, and used in the production of Parmesan cheese. The cheese were produced in industrial scale in two independent processing using 2.3% fat pasteurized standardized milk. After cheese production, the chemical composition was determined, and during the ripening period, the physicochemical characteristics were evaluated (acidity, pH value and proteolysis). At the third month of ripening, the microbiological quality of cheese was carried out. During ... / Mestre

Introdução: A dieta para neutropênicos foi desenvolvida para prevenir infecções por patógenos transmitidos por alimentos em pacientes com a imunidade comprometida pelo tratamento antineoplásico. Baseia-se no conceito hipotético que alguns alimentos possuem maior carga microbiana e seriam potencialmente danosos aos indivíduos neutropênicos. As restrições impostas pela dieta podem ocasionar deficiências de nutrientes. Objetivo: comparar a qualidade microbiológica e a composição nutricional de uma dieta padrão hospitalar com a dieta oferecida para pacientes pediátricos neutropênicos em um hospital de Porto Alegre, RS. Métodos: para a análise microbiológica, amostras de alimentos da dieta padrão (n=18) e da dieta para neutropênicos (n=18) foram coletadas no momento da entrega aos pacientes. Ambas as dietas foram produzidas sob cuidados de higiene e manipulação de alimentos preconizados pela legislação brasileira. As amostras foram testadas quanto à contaminação para E. coli, Salmonella sp., Bacillus cereus e Staphylococcus coagulase positiva. Para a análise da qualidade nutricional foi calculada a composição nutricional da alimentação oferecida ao longo de seis dias e a adequação das dietas de acordo com as recomendações estabelecidas. Foi calculada a composição nutricional da dieta padrão hospitalar e, para a dieta para neutropênicos foram consideradas duas versões: uma que permite frutas de casca grossa e outra estrita, sem nenhum alimento cru. Os resultados foram apresentados em média, desvio padrão e frequência. Para comparação entre variáveis categóricas dicotomizadas independentes foi aplicado o teste exato de Fisher. A comparação da composição nutricional das dietas foi realizada através da aplicação do teste t de Student para amostras independentes. Realizou-se o cálculo de razão de chances para contaminação microbiológica entre as dietas com intervalo de 95% de confiança. Resultados: das 36 amostras de alimentos analisadas quanto à contaminação por patógenos, 5 (13,89%) apresentaram contaminação microbiana acima do permitido, sendo 4 por Bacillus cereus e 1 por Staphylococcus coagulase positiva. Nenhuma amostra apresentou contaminação por Salmonella sp e E. Coli. Das contaminações microbiológicas, 3 foram provenientes da dieta para neutropênicos e 2 da dieta padrão livre, não havendo diferença entre as dietas analisadas (p=1.00). A razão de chances para contaminação microbiológica entre as dietas também não apresentou diferença (OR=0,62; IC95%= 0,05 – 6,35; p=0,63). A dieta para neutropênicos estrita apresentou menor quantidade de vitamina C (p=0,01) e fibras (p=0,05) quando comparada à dieta padrão. Conclusão: a dieta padrão hospitalar apresentou-se similar em relação à carga microbiana e com maior conteúdo nutricional comparativamente à dieta para neutropênicos no hospital em que foi realizado o estudo. / Introduction: The neutropenic diet was developed to prevent food-related infections in patients with impaired immunity caused by oncologic treatment. It is based on the hypothetical theory that some foods carry greater microbe content that would be potentially harmful for neutropenic subjects. The diet restrictions can lead to several nutrient deficiencies. Objective: the present study aimed to analyze and compare the microbiological profile and nutritional content of the regular and neutropenic diets offered to pediatric patients at a Hospital at Porto Alegre, RS. Methods: microbiological analyses of food samples from the general hospital diet (n=18) and neutropenic diet (n=18) served to pediatric patients were performed. It was investigated the contamination by E. coli, Salmonella sp., Bacillus cereus and coagulase-positive Staphylococcus. Nutritional content of the diets offered to the patients during a 6 day period were calculated to assess nutritional quality. For the neutropenic diet it was considered 2 versions: one that allowed fruits that can be peeled and one strict, with no raw foods. Data was described as mean, standard deviation and frequency. Fisher's exact test was applied for comparison between independent dichotomized categorical variables. Nutritional content comparison between the diets was assessed applying Student’s t test for independent samples. The odds ratio was calculated for microbiological contamination between diets with 95% confidence interval. Results: for the microbiologic content 36 food samples were analyzed, 5 (13,89%) presented microbiologic contamination above recommended limits, 4 by Bacillus cereus and 1 by coagulase-positive Staphylococcus. Contamination by Salmonella sp e E. Coli were absent in all samples. Regarding the microbiologic contamination, 3 food samples were from the neutropenic diet and 2 from the general hospital diet, with no statistical differences between the diets (p=1.00). The odds ratio for microbiological contamination between the diets did not presented differences (OR=0,62; 95%CI=0,05 – 6,35; p=0,63). The strict neutropenic diet had lower content of vitamin C (p=0,01) and fiber (p=0,05) when compared to general hospital diet. Conclusion: the general hospital diet was similar in terms of microbiological content and with greater nutritional content when compared to the neutropenic diet produced in the hospital where the study was conducted.

Made available in DSpace on 2016-04-01T17:54:48Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-06-19. Added 1 bitstream(s) on 2016-04-01T18:00:29Z : No. of bitstreams: 1 000859888_20160801.pdf: 334978 bytes, checksum: 81a2861719bda9564d402ab39b8d3b8e (MD5) Bitstreams deleted on 2016-08-01T11:30:03Z: 000859888_20160801.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2016-08-01T11:30:59Z : No. of bitstreams: 1 000859888.pdf: 1448324 bytes, checksum: cf4beae2aa8b1123f4ae4731ec579d6c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As culturas selvagens ou autóctones isoladas de diversos alimentos podem produzir enzimas, vitaminas e compostos aromatizantes, ou ainda, compostos que apresentem efeitos fisiológicos em humanos. Estudos recentes realizados pelo nosso grupo de pesquisa mostraram que algumas cepas autóctones isoladas de muçarela de búfala são produtoras de bacteriocinas, e outras apresentam características probióticas. Neste contexto, o objetivo do trabalho foi avaliar as características de segurança e tecnológicas de treze cepas autóctones de bactérias acidoláticas (BAL) termófilas de Lactobacillus helveticus (SJRP56 e SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 e SJRP109) e Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149, SJRP181). Para a caracterização de segurança das culturas foram verificadas a susceptibilidade a antibióticos, a atividade hemolítica e das enzimas β-glucosidase, N-acetil-β-glucosaminidase e β-glucuronidase, e a presença de genes que caracterizam fatores de virulência, produção de aminas biogênicas e resistência a antibióticos. As propriedades tecnológicas: cinética de acidificação, produção de exopolissacarídeos e atividade enzimática, foram avaliadas para todas as cepas. Para as cepas consideradas seguras também foram realizadas as análises da hidrólise da caseína e a atividade de aminopeptidases. A partir da caracterização de segurança e tecnológica foram selecionadas quatro cepas: Lb. helveticus SJRP56 e SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 e S. thermophilus SJRP107 para aplicação na produção de queijo Parmesão. Os queijos foram produzidos em escala industrial em dois processamentos independentes, utilizando-se leite pasteurizado e padronizado com 2,3% de gordura. Foi determinada a composição centesimal dos queijos após a produção, e durante o período de maturação foram avaliadas as características físico-químicas... / Autochthonous lactic acid bacteria (LAB) isolated from various food can produce enzymes, vitamins, and flavor compounds, or compounds that exhibit physiological effects. Recently, studies performed by our research group showed that some autochthonous strains isolated from water buffalo mozzarella cheese are capable of producing bacteriocin as well as some strains presented probiotic properties. In this context, the aim of this study was to evaluate the safety and technological characteristics of autochthonous thermophilic lactic acid bacteria (LAB) strains of Lactobacillus helveticus (SJRP56 and SJRP191), S. thermophilus (SJRP02, SJRP03, SJRP107 and SJRP109) and Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus (SJRP49, SJRP50, SJRP51, SJRP57, SJRP76, SJRP149 and SJRP181). For the safety characterization of the cultures, the antibiotic resistance, the hemolytic, β-glucosidase, N-acetyl-β-glucosaminidase and β-glucuronidase activities, and the investigation of the presence of genes that characterize virulence factors, production of biogenic amines and antibiotic resistance were carried out. The technological properties: acidification kinetics, exopolysaccharide production and enzymatic activity were evaluated for all strains. For the safe strains the analyses of the casein hydrolysis and aminopeptidase activity were also performed. From the safety and technological characterization, four strains were selected: Lb. helveticus SJRP56 and SJRP191, Lb. delbrueckii subsp. bulgaricus SJRP57 and S. thermophilus SJRP107, and used in the production of Parmesan cheese. The cheese were produced in industrial scale in two independent processing using 2.3% fat pasteurized standardized milk. After cheese production, the chemical composition was determined, and during the ripening period, the physicochemical characteristics were evaluated (acidity, pH value and proteolysis). At the third month of ripening, the microbiological quality of cheese was carried out. During ...

Introdução: A dieta para neutropênicos foi desenvolvida para prevenir infecções por patógenos transmitidos por alimentos em pacientes com a imunidade comprometida pelo tratamento antineoplásico. Baseia-se no conceito hipotético que alguns alimentos possuem maior carga microbiana e seriam potencialmente danosos aos indivíduos neutropênicos. As restrições impostas pela dieta podem ocasionar deficiências de nutrientes. Objetivo: comparar a qualidade microbiológica e a composição nutricional de uma dieta padrão hospitalar com a dieta oferecida para pacientes pediátricos neutropênicos em um hospital de Porto Alegre, RS. Métodos: para a análise microbiológica, amostras de alimentos da dieta padrão (n=18) e da dieta para neutropênicos (n=18) foram coletadas no momento da entrega aos pacientes. Ambas as dietas foram produzidas sob cuidados de higiene e manipulação de alimentos preconizados pela legislação brasileira. As amostras foram testadas quanto à contaminação para E. coli, Salmonella sp., Bacillus cereus e Staphylococcus coagulase positiva. Para a análise da qualidade nutricional foi calculada a composição nutricional da alimentação oferecida ao longo de seis dias e a adequação das dietas de acordo com as recomendações estabelecidas. Foi calculada a composição nutricional da dieta padrão hospitalar e, para a dieta para neutropênicos foram consideradas duas versões: uma que permite frutas de casca grossa e outra estrita, sem nenhum alimento cru. Os resultados foram apresentados em média, desvio padrão e frequência. Para comparação entre variáveis categóricas dicotomizadas independentes foi aplicado o teste exato de Fisher. A comparação da composição nutricional das dietas foi realizada através da aplicação do teste t de Student para amostras independentes. Realizou-se o cálculo de razão de chances para contaminação microbiológica entre as dietas com intervalo de 95% de confiança. Resultados: das 36 amostras de alimentos analisadas quanto à contaminação por patógenos, 5 (13,89%) apresentaram contaminação microbiana acima do permitido, sendo 4 por Bacillus cereus e 1 por Staphylococcus coagulase positiva. Nenhuma amostra apresentou contaminação por Salmonella sp e E. Coli. Das contaminações microbiológicas, 3 foram provenientes da dieta para neutropênicos e 2 da dieta padrão livre, não havendo diferença entre as dietas analisadas (p=1.00). A razão de chances para contaminação microbiológica entre as dietas também não apresentou diferença (OR=0,62; IC95%= 0,05 – 6,35; p=0,63). A dieta para neutropênicos estrita apresentou menor quantidade de vitamina C (p=0,01) e fibras (p=0,05) quando comparada à dieta padrão. Conclusão: a dieta padrão hospitalar apresentou-se similar em relação à carga microbiana e com maior conteúdo nutricional comparativamente à dieta para neutropênicos no hospital em que foi realizado o estudo. / Introduction: The neutropenic diet was developed to prevent food-related infections in patients with impaired immunity caused by oncologic treatment. It is based on the hypothetical theory that some foods carry greater microbe content that would be potentially harmful for neutropenic subjects. The diet restrictions can lead to several nutrient deficiencies. Objective: the present study aimed to analyze and compare the microbiological profile and nutritional content of the regular and neutropenic diets offered to pediatric patients at a Hospital at Porto Alegre, RS. Methods: microbiological analyses of food samples from the general hospital diet (n=18) and neutropenic diet (n=18) served to pediatric patients were performed. It was investigated the contamination by E. coli, Salmonella sp., Bacillus cereus and coagulase-positive Staphylococcus. Nutritional content of the diets offered to the patients during a 6 day period were calculated to assess nutritional quality. For the neutropenic diet it was considered 2 versions: one that allowed fruits that can be peeled and one strict, with no raw foods. Data was described as mean, standard deviation and frequency. Fisher's exact test was applied for comparison between independent dichotomized categorical variables. Nutritional content comparison between the diets was assessed applying Student’s t test for independent samples. The odds ratio was calculated for microbiological contamination between diets with 95% confidence interval. Results: for the microbiologic content 36 food samples were analyzed, 5 (13,89%) presented microbiologic contamination above recommended limits, 4 by Bacillus cereus and 1 by coagulase-positive Staphylococcus. Contamination by Salmonella sp e E. Coli were absent in all samples. Regarding the microbiologic contamination, 3 food samples were from the neutropenic diet and 2 from the general hospital diet, with no statistical differences between the diets (p=1.00). The odds ratio for microbiological contamination between the diets did not presented differences (OR=0,62; 95%CI=0,05 – 6,35; p=0,63). The strict neutropenic diet had lower content of vitamin C (p=0,01) and fiber (p=0,05) when compared to general hospital diet. Conclusion: the general hospital diet was similar in terms of microbiological content and with greater nutritional content when compared to the neutropenic diet produced in the hospital where the study was conducted.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-05-08T14:01:51Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Samira Obeid Georges - 2015.pdf: 3115879 bytes, checksum: d0827bc72104594da4d318d17d927b3b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-05-08T14:13:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Samira Obeid Georges - 2015.pdf: 3115879 bytes, checksum: d0827bc72104594da4d318d17d927b3b (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-08T14:13:12Z (GMT). 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The samples were collected in July and August 2013 in 43 butchers of the city of Aparecida de Goiânia, Goiás and, for each of them, it was noted the manufacturing process, whether homemade or industrial. In addition, the temperature of exposure counters and sausages was measured. The samples were submitted to microbiological analysis according to RDC nº 12 of January 2, 2001, following the methodology proposed by the American Public Health Association. The susceptibility testing to antibiotics followed the diffusion technique in Müeller-Hinton agar and the genetic variability was observed by the technique of Pulsed Field Gel Electrophoresis. Were obtained from sausages, eight isolates of E. coli and seven of Staphylococcus aureus. The homemade sausages, as well as pork sausages were more contaminated than the industrialized and chicken. The chicken sausages presented lower average temperatures than strains pork sausages (6,0 and 6,5ºC, respectively), whereas homemade sausages showed higher average temperatures compared to industrialized (5,7 and 6,8ºC, respectively). The most strains of E. coli (71,4%) were resistant to at least one antibiotic tested. Higher resistance profile were observed to tetracycline and ampicillin, while 100,0% of the isolates were susceptible to ceftazidime, ciprofloxacin, aztreonam and imipenen. There was observed a high genetic variability among isolates by PFGE technique. The sausages were according to the Brazilian law, although the results may indicate failure in sanitary control, antibiotic-resistant strains and high genetic diversity among the isolates, indicating different sources of contamination. / A linguiça do tipo frescal é bem aceita e comercializada no Brasil. Mesmo pronta para o consumo, pode apresentar alguns micro-organismos patogênicos, caracterizando possível falha no seu controle higienicossanitário. A bactéria Escherichia coli destaca-se por ser indicativa de contaminação fecal, por apresentar resistência a antimicrobianos e alta variabilidade genética. O objetivo da presente pesquisa foi avaliar a qualidade microbiológica de linguiças suínas e de frango, artesanais e industriais, do tipo frescal, segundo a legislação brasileira vigente. Além disso, objetivou-se testar a susceptibilidade a antimicrobianos e identificar o perfil genético dos isolados de E. coli destas linguiças. As amostras foram coletadas nos meses de julho a agosto de 2013, em 43 açougues do Município de Aparecida de Goiânia, Goiás e, para cada uma delas, anotou-se o processo de fabricação, isto é, se artesanal ou industrial. Além disso, aferiu-se a temperatura das linguiças e de seus respectivos balcões de exposição à venda. As amostras foram submetidas à análise microbiológica de acordo com a RDC nº 12 de dois de janeiro de 2001, seguindo metodologia preconizada pela American Public Health Association. O teste de susceptibilidade a antimicrobianos seguiu a técnica de disco difusão em ágar Müeller–Hinton e a variabilidade genética foi observada pela técnica do Pulsed Field Gel Electrophoresis. Obtiveram-se oito isolados de E. coli e sete de Staphylococcus aureus. As linguiças artesanais, assim como as suínas estiveram mais contaminadas do que as industrializadas e de frango. Estas últimas apresentaram temperaturas médias menores do que as amostras suínas (6,0 e 6,5ºC, respectivamente), enquanto que linguiças artesanais apresentaram temperaturas médias superiores às industriais (6,8 e 5,7ºC, respectivamente). A maioria dos isolados de E. coli (71,4%) foi resistente a, no mínimo, um antibiótico testado. Apresentaram ainda maior resistência à tetraciclina e ampicilina (71,4%) e 100,0% apresentaram sensibilidade à ceftazidima, ciprofloxacina, aztreonam e imipenem. Observou-se ainda, alta variabilidade genética entre os isolados pela técnica do PFGE. As linguiças estiveram, em sua maioria, próprias ao consumo humano de acordo com a legislação brasileira, embora os resultados possam indicar falha no controle higienicossanitário, cepas resistentes a antibióticos e alta diversidade genética entre os isolados, indicando fontes diferentes de contaminação.

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-10-06T14:16:54Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lívia Milhomem Silva - 2015.pdf: 1118991 bytes, checksum: 26b69bc2d0f19179ebc3a27c577341f8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-10-06T14:17:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lívia Milhomem Silva - 2015.pdf: 1118991 bytes, checksum: 26b69bc2d0f19179ebc3a27c577341f8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T14:17:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lívia Milhomem Silva - 2015.pdf: 1118991 bytes, checksum: 26b69bc2d0f19179ebc3a27c577341f8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-06-30 / The fresh Minas cheese is widely consumed in Brazil due to its good taste, people's behavior and its easy marketing. It’s a highly sensitive food to microbial contamination due to its characteristics and may have pathogenic microorganisms, a result of a possible failure in the hygienic and sanitary control. The Escherichia coli is a bacterium commonly found in this product and stands out for being indicative of fecal contamination and it’s related to resistance to antimicrobials and high genetic variability between strains found in food. This study evaluated the microbiological quality of fresh Minas cheeses, handmade and industrially produced according to Brazilian legislation. In addition, the aim of this study was also test the susceptibility of E. coli to different antibiotics and identifies its genetic profile. The samples were collected in supermarkets and fairs in the city of Goiânia, Goiás and subjected to microbiological analysis in accordance with the standards established by Resolution RDC nº. 12 of January 2, 2001, of the National Health Surveillance Agency, following the methodology recommended by the American Public Health Association. The antimicrobial susceptibility testing followed the disk diffusion technique in Mueller- Hinton agar and, the genetic variability, was observed by the technique of Pulsed Field Gel Electrophoresis. The analysis detected the presence of coliforms in 100.0% of samples, while fecal coliforms were observed in 10.0% and 14.3% of samples from supermarkets and fairs, respectively. 12.5% of the samples fairs confirmed the presence of Escherichia coli. Handmade cheeses were more contaminated than industrially produced chesses. Of eight isolates, one (8.0%) were sensitive to ampicillin, six (48.0%) showed intermediate susceptibility to cefepime and one (8.0%) was resistant to tetracycline, while 100.0% were sensitive to amoxicillin/clavulanic acid, aztreonam, ceftazidime, ceftriaxone, ciprofloxacin, gentamicin, imipenem, sulfamethoxazole/trimethoprim and piperacillin-azobactam. The cheeses showed high contamination than the limits established to Brazilian legislation, making it unfit for human consumption. These results indicate failures in hygienic sanitary controls in the food chain. The technique of PFGE revealed high genetic variability among isolates while the antibiogram revealed high sensitivity of isolates to antibiotics. / O queijo Minas Frescal é bastante consumido no Brasil devido seu sabor agradável, hábito da população e pela sua fácil comercialização. É um alimento altamente suscetível a contaminação microbiana devido a suas características e pode apresentar micro-organismos patogênicos, resultado de uma possível falha no seu controle higienicossanitário. A bactéria Escherichia coli é comumente encontrada nesse produto e destaca-se por ser indicativa de contaminação de origem fecal, além de apresentar resistência a antimicrobianos e alta variabilidade genética entre as cepas encontradas nos alimentos. O presente estudo avaliou a qualidade microbiológica de queijos tipo Minas Frescal, artesanais e industriais, segundo a legislação sanitária brasileira vigente. Além disso, objetivou-se também testar a susceptibilidade a diferentes antimicrobianos e identificar o perfil genético dos isolados de Escherichia coli destes produtos. As amostras foram coletadas em supermercados e feiras livres na cidade de Goiânia, Goiás e, submetidas às análises microbiológicas de acordo com os padrões estabelecidos pela Resolução RDC nº 12 de dois de janeiro de 2001 da Agência Nacional de Vigilância Sanitária, seguindo metodologia preconizada pela American Public Health Association. O teste de susceptibilidade a antimicrobianos seguiu a técnica de disco difusão em ágar Müeller–Hinton e a variabilidade genética foi observada pela técnica do Pulsed Field Gel Electrophoresis. Detectou-se a presença de coliformes totais em 100,0% das amostras analisadas; enquanto que os coliformes termotolerantes foram observados em 10,0% e 14,3% das amostras provenientes de supermercados e feiras, respectivamente. Ressalta-se que em 12,5% das amostras de feiras confirmou-se presença de Escherichia coli. Os queijos artesanais encontravam-se mais contaminados do que os industrializados. Do total de oito isolados, um (8,0%) foi sensível a ampicilina, seis (48,0%) apresentaram sensibilidade intermediária para cefepime e um (8,0%) se mostrou resistente a tetraciclina, enquanto que 100,0% foram sensíveis a amoxicilina/ácido clavulânico, aztreonama, ceftazidima, ceftriaxone, ciprofloxacina, gentamicina, imipenem, sulfametoxazol/trimetoprim e piperacillin–tazobactam. Os queijos apresentaram alta contaminação em relação a legislação vigente, tornando-se impróprios ao consumo humano. Esses resultados indicam falhas no controle higienicossanitário durante a cadeia de fabricação até o consumo. A técnica do PFGE revelou variabilidade genética considerável entre os isolados enquanto que o antibiograma revelou sensibilidade dos isolados aos antibióticos.

Submitted by JÚLIO HEBER SILVA (julioheber@yahoo.com.br) on 2017-04-11T18:05:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Luiza Rezende Ribeiro - 2017.pdf: 1775886 bytes, checksum: 5582a3f36c670d7b39e468c2e09807d2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-12T14:31:23Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Luiza Rezende Ribeiro - 2017.pdf: 1775886 bytes, checksum: 5582a3f36c670d7b39e468c2e09807d2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-12T14:31:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maria Luiza Rezende Ribeiro - 2017.pdf: 1775886 bytes, checksum: 5582a3f36c670d7b39e468c2e09807d2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The ingestion of foods contaminated with Campylobacter spp. results in campylobacteriosis in humans. This disease is the main cause of diarrhea in the United States and European Union. The most common reservoirs of this microorganism are chickens and the consumption of their meat, raw or undercooked, is the main source of contamination to humans. The most prevalent species involved in infections are Campylobacter jejuni, Campylobacter coli and Campylobacter lari that can contaminate carcasses during the slaughter and handling of chickens. The aim of this study was to determine the prevalence of thermotolerant Campylobacter in chilled and later frozen chicken carcasses commercialized in the city of Goiânia, Goiás. With the support of the Municipal Sanitary Surveillance Department and the Goiás Agency for Agricultural and Farming Defense, forty cooled and frozen carcasses samples were collected in abattoirs and its retail outlets, from May to September/2015. The microbiological analysis was performed according to the methods of the International Organization for Standardization 10272-1:2006. For molecular identification, the Polymerase Chain Reaction technique was performed to detect the hipO (Campylobacter jejuni) and glyA genes (Campylobacter coli and Campylobacter lari). It was found a contamination prevalence of 17.5 % (n=7) of Campylobacter spp.. Between the 24 samples collected from slaughterhouses, 12.5% (n = 3) were contaminated. Among the 16 collected in points of sale, 25.0% (n = 4) presented positivity for the bacterium. Campylobacter lari was not detected in the evaluated samples. The results show that the bacteria remains viable at all stages of the chicken production chain, representing a risk for outbreaks of gastroenteritis. The presence of bacteria in chicken from market reinforces the need for education of poultry farmers and traders regarding the public health risk that these products represent. Awareness raising is needed to improve management, as well as preventive and corrective measures in the production and marketing of these products. In addition, the prevalence found in the present study reinforces the need to establish legal standards that determine the research of the microorganism in this type of food. / A ingestão de alimentos contaminados por bactérias do gênero Campylobacter resultam em campilobacteriose em humanos. Esta é uma das causas mais comuns de diarreia nos Estados Unidos e União Europeia. Um dos maiores reservatórios deste micro-organismo são produtos avícolas, sendo sua carne, crua ou mal cozida, a principal fonte de contaminação para o homem. As espécies mais prevalentes envolvidas nas infecções são Campylobacter jejuni, Campylobacter coli e Campylobacter lari que podem contaminar as carcaças durante o abate e a manipulação de frangos. O objetivo desse estudo foi determinar a prevalência de Campylobacter termotolerantes em carcaças de frango refrigeradas e posteriormente congeladas comercializadas no município de Goiânia, Goiás. Com o apoio do Departamento de Vigilância Sanitária Municipal e Agência Goiana de Defesa Agropecuária, foram coletadas, entre os meses de maio e setembro de 2015, 40 amostras de carcaças refrigeradas e congeladas em abatedouros em Goiás e seus pontos de venda em Goiânia. A metodologia para isolamento e identificação obedeceu às normas da International Organization for Standardization 10272- 1:2006. Para identificação molecular, foi realizada a técnica da Reação em Cadeia da Polimerase para detecção dos genes hipO (Campylobacter jejuni) e glyA (Campylobacter coli e Campylobacter lari). Foi encontrada prevalência de 17.5 % (n=7) de contaminação de carcaças por Campylobacter spp.. Dentre as 24 amostras coletadas em abatedouros, 12,5 % (n=3) estavam contaminadas. Já entre as 16 coletadas em pontos de venda, 25,0 % (n=4) apresentaram positividade para a bactéria. Não foi detectado Campylobacter lari nas amostras avaliadas. Os resultados evidenciam que a bactéria permanece viável em todas as etapas da cadeia produtiva de frangos, representando um risco para a ocorrência de surtos de gastroenterites. A presença da bactéria em frangos aponta para a necessidade de educação de criadores de aves e comerciantes quanto ao risco à saúde pública que estes produtos representam. É necessária sensibilização para melhorar a gestão, além da realização de medidas preventivas e corretivas no sistema de produção e comercialização destes produtos. Além disso, a prevalência encontrada no presente estudo reforça a necessidade do estabelecimento de padrões legais que determinem a pesquisa do micro-organismo neste tipo de alimento.

A emergência de fenótipos de resistências aos antimicrobianos, tanto na clínica humana e veterinária quanto na agropecuária, constitui uma urgência epidemiológica. O objetivo do presente trabalho foi monitorar os mecanismos de resistência em amostras de Salmonella spp. e E. coli isoladas (2005-2010) de animais de produção agropecuária (aves e suínos) e fontes relacionadas. Do total de 143 amostras de Salmonella spp., 9% (3 S. Thyphimurium, 7 S. Schwarzengrund e 2 S. Agona) eram resistentes a cefolosporinas de amplo espectro pela produção de ESBL do tipo CTX-M-2, prevalecendo dois clusters disseminados clonalmente no ciclo de produção avícola. Em E. coli, a resistência às cefalosporinas de amplo espectro foi associada com a presença do gene blaCTX-M-2 (n=24), blaCMY-2 (n=2) e blaCTX-M-15 (n=1, novo ST, complexo clonal 206), não existindo relação clonal no ciclo de produção suína. Em 5 amostras de E. coli (suínos) resistentes a fluoroquinolonas foi confirmada a presença de genes do tipo qnr. A aquisição e disseminação de genes conferindo resistências a cefaloporinas de amplo espectro e quinolonas, em isolados de origem animal, pode ter impacto em saúde pública. / Emergence of drug-resistant phenotypes in human and veterinary medicine, and in the animal husbandry has epidemiological significance. The aim of this study was to investigate the resistance mechanisms of Salmonella and E. coli strains isolated (2005-2010) from food-producing animals (poultry and swine) and related sources. Among 143 Salmonella spp., 9% strains (3 S. Thyphimurium, 7 S. Schwarzengrund and 2 S. Agona) exhibited resistance to extended-spectrum cephalosporins, which was associated to the presence of the blaCTX-M-2 gene. These strains were clonally related (2 major clusters). Resistance to extended-spectrum cephalosporins among clonally unrelated E. coli strains from swine was associated to the presence of blaCTX-M-2 (n=24), blaCMY-2 (n=2) and blaCTX-M-15 (n=1, new ST belonging to the clonal complex 206) genes. Five E. coli strains (from swine) resistant to fluoroquinolones carried qnr genes. Acquisition and spread of genes conferring resistance to extended-spectrum cephalosporins and fluoroquinolones among Salmonella spp. and E. coli strains from food-producing animals is worrisome and it should be considered a public health issue.

O presente estudo foi dividido em duas fases; a primeira visou avaliar o desempenho de diversos meios de cultura, para fungos, no ar de ambientes de produção de alimentos, através da resposta de contagem e identificação dos gêneros que podem conter espécies indesejáveis; também foi avaliada a condição ambiental juntamente com a contagem total de bactérias. O ambiente de duas áreas foi utilizado para a pesquisa, uma indústria de doces, produção de doce de leite e doce de amendoim, na Cidade de Ribeirão Preto (SP) e, outra, uma indústria de embutidos, nos setores de empacotamento e produção, na Região de Piracicaba (SP). Os meios de cultura utilizados foram: "ichloran Rose Bengal Chloramphenicol Ágar" RBC), "Sabouraud Dextrose a 4% Ágar", "Malt Ágar" (MA), "Malt Extract Agar – Yeast and Molds" (MEAYM), "Plate Count Ágar-Cloranfenicol" (PCA-Cloranfenicol), "Dichloran 18% Glycerol Ágar" (DG 18), Batata Dextrose Ágar (BDA) e "Oxytetracycline Glucose YeastAgar" (OGY); para a contagem de bactérias foi utilizado o meio "Plate Count Agar" (PCA). Cada um dos pontos foi amostrado em triplicata utilizando um amostrador de impactação linear. A segunda fase do projeto avaliou os meios de cultura "Dichloran Rose Bengal Chloramphenicol Ágar" (DRBC), "Sabouraud Dextrose a 4% Ágar" selecionados da primeira fase. Novas coletas foram realizadas amostrando cinco repetições em cada um dos pontos, que permaneceram os mesmos da primeira fase. Em paralelo foram utilizadas culturas puras de Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus, Aspergillus niger, Aspergillus parasiticus, Fusarium moniliforme, Fusarium verticulloides, Histoplasma capsulatum e Stachybotrys chartarum, inoculando os dois meios selecionados e avaliando o desenvolvimento desses fungos ao longo do período de incubação de sete dias, a 28ºC, para servir de parâmetro de comparação com as coletas de ar realizadas no mesmo período, a fim de se verificar se algum desses fungos indesejáveis estaria presente nas amostras de ar. De acordo com os resultados obtidos, os meios DRBC e Sabouraud Dextrose a 4% Ágar, foram, estatisticamente, melhores que os demais meios testados, apresentando um maior número de unidades formadoras de colônias/m3. O meio de Extrato de Malte diferenciou estatisticamente dos demais e teve o menor desempenho para a quantificação desses microrganismos no ar. A recomendação do melhor meio para identificação de fungos no ar de indústrias alimentícias não foi conclusiva, com exceção do PCA-Cloranfenicol que apresentou baixa diversidade de gêneros, sendo considerado reprovado. No geral foi observado um número elevado de unidades formadoras de colônias de fungos e bactérias/m 3 durante as amostragens. A avaliação quali-quantitativa dos ambientes estudados sugere que esses não se encontram em condições adequadas, sendo necessária a elaboração de um padrão referencial para o monitoramento da indústria alimentícia em nosso país. O amostrador utilizado nas coletas promoveu rapidez nas coletas e proporcionou a expressão dos resultados em medidas confiáveis, por ser um equipamento que permite calibração em seu sistema de aspiração de ar. / The present study consisted of two phases. The first one aimed at evaluating the performance of different culture media for fungi found in the air of food production environments, through the results of counting and identifying genders that may contain undesirable species. The environmental condition was also evaluated along with a total bacteria counting. The present work took place in two different places, an industry which produces sweets made from milk or peanuts, in Ribeirao Preto city (SP) and, in the packing and production sections of a meat encased products industry located in Piracicaba region (SP). The culture media used were: "Dichloran Rose Bengal Chloramphenicol Agar (DRBC)", "Sabouraud Dextrose 4% Agar (MA)", "Malt Extract Agar – Yeast and Molds (MEAYM)", "Plate Count Agar – Chloramphenicol (PCA-Chloramphenicol)", "Dichloran 18% Glycerol Agar (DG 18)", "Potato Dextrose Agar (BDA)" and "Oxytetracycline Glucose Yeast Agar (OGY)". The medium used for the bacteria counting was "Plate Count Agar (PCA)". Three replicates of each sampled spot were obtained by using a linear impacting sampler. The second phase of this project evaluated the following culture media, selected during the first phase of this study: "Dichloran Rose Bengal Chloramphenicol Agar (DRBC)" and "Sabouraud Dextrose 4% Agar". New sample collections (five replicates) were carried out for each of the spots selected. The sampled spots were the same for both phases. In a parallel manner, pure cultures of Aspergillus flavus, Aspergillus fumigatus, Aspergillus niger, Aspergillus parasiticus, Fusarium moniliforme, Fusarium verticulloides, Histoplasma capsulatum and Stachybotrys chartarum were employed to inoculate the two selected media. The development of these fungi was evaluated throughout a 7-day-incubation period, at 28ºC, to function as a comparative reference for the air samples obtained in the same period in order to verify if any of these undesirable fungi was present in the air samples. According to the results obtained, DRBC and Sabouraud Dextrose 4% Agar media were statistically superior than the others, presenting a higher number of colony forming units/m3. The Malt Extract medium was statistically different from the others and showed the worse performance as to the quantification of microorganisms present in the air. There was no conclusive recommendation as to the best medium for the identification of fungi found in the air of food industries, except for PCA-Chloramphenicol, which showed low diversity of genders and was discarded. In general, a high number of fungi and bacteria colony forming units/m3 was observed during the sampling procedures. The qualitative-quantitative evaluation of the environments studied suggests that they do not present adequate conditions, evidencing the need for the establishment of a referential standard in order to monitor food industries in our country. The sampler used in this work allowed a quick sample collection and a reliable expression of results, as this equipment enables the calibration of its air intake system.