Made available in DSpace on 2015-04-14T13:48:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 388948.pdf: 11858820 bytes, checksum: 6c8ee0f65797263709c32b96d9372a84 (MD5) Previous issue date: 2007-03-15 / Este estudo versa sobre pessoas, coisas e um lugar. Partiu do objetivo inicial de resgatar a cole??o do s?tio arqueol?gico Morro da Formiga, que foi escavado na d?cada de 1960 por Eurico Miller. Al?m disso, visava contribuir com o conhecimento existente acerca da ocupa??o na regi?o sul do Brasil pelos grupos ceramistas do planalto (identificados na arqueologia como Tradi??o Taquara). Isto foi feito atrav?s da realiza??o de uma an?lise em micro-escala, representada pelo exame dos vest?gios l?ticos e cer?micos encontrados neste local. A pesquisa foi orientada de um modo geral no sentido de compreender a arqueologia enquanto uma forma de produ??o do conhecimento sobre o passado no presente, na qual o investigador desenvolve uma pr?tica interpretativa. Na busca pelos significados atribu?dos ?s coisas pelas pessoas, foram considerados os contextos de cria??o e de consumo dos objetos. Ao procurar entender como os indiv?duos experimentaram o lugar que habitaram, a partir de uma an?lise espacial intra-s?tio, as atividades realizadas em seu interior foram avaliadas. Como resultado, foi elaborado discurso arqueol?gico, uma forma de escrever e contar aspectos de um passado a partir de um olhar no presente

Orientador: Marcelo Diniz Vitorino. / Co-orientador: Ricardo Andrade Rebelo. / Dissertação (mestrado) - Universidade Regional de Blumenau, Centro de Ciências Tecnológicas, Programa de Pós-Graduação de Engenharia Ambiental.

Colônias de insetos sociais representam um recurso estável no tempo e no espaço. Esta característica contribuem para que um grande número de parasitas sejam encontrados associados a esses insetos. Soma-se a isso o fato de um grande número de indivíduos aparentados geneticamente viverem muito próximo uns dos outros, o que favorece a transmissão de patógenos. Inúmeros inimigos naturais são encontrados entre as formigas-cortadeiras, destacando-se dentre estes forídeos parasitoides (Diptera: Phoridae). Neste sentido, o presente trabalho teve por objetivo avaliar a ocorrência desses parasitoides em A. balzani em duas áreas distintas: pastagem e borda de mata, na cidade de Gurupi, estado do Tocantins. As coletas de operárias forrageadoras ocorreram entre os meses de janeiro a agosto de 2015, em intervalos aproximados de 20 dias, totalizando oito coletas ao final. Foram determinadas três colônias na área de pastagem e três na borda de mata, com uma média de coleta por colônia de 46 ± 0,53 e 45 ± 8,4 (média ± desvio padrão) operárias forrageadoras, respectivamente. Ao final dos experimentos, coletaram-se 1.093 operárias na área de pastagem e 1.211 na borda de mata. As operárias coletadas de uma mesma colônia foram mantidas em container plástico durante 15 dias sob dieta controlada, temperatura de 25 °C e fotoperíodo de 12 h. A fim de verificar se havia relação entre o tamanho das operárias com a taxa de parasitismo, procedeu-se a medição da largura máxima da cápsula cefálica (distância entre os olhos) das operárias. As maiores taxas de parasitismo observadas neste estudo foram registradas nos meses com maior índice pluviométrico e temperatura média, coincidindo com alta umidade relativa, que foram os meses de fevereiro, março e abril. Não houve diferença significativa na média do tamanho das operárias parasitadas comparando com as não parasitadas e as que sobreviveram, e nem entre as duas áreas de estudo. Uma única morfoespécie de forídeo pode ser identificada a partir dos adultos que emergiram. Pelas características morfológicas e comportamentais trata-se de uma espécie do gênero Apocephalus. / Social insect colonies represent a stable resource in time and space. These feature contribute to a large number of parasites are found associated with these insects. Added to this the fact that a large number of genetically related individuals live very close to each other, which favors the transmission of pathogens. Numerous natural enemies are found between the leaf-cutting ants, standing out among these phorid parasitoids (Diptera: Phoridae). In this sense, this study aimed to evaluate the occurrence of parasitoids in A. Balzani into two distinct areas: grassland and edge of forest in the city of Gurupi, state of Tocantins. The collections of foraging workers occurred between the months January to August 2015, approximately once every 20 days, totaling eight sessions to end. They were determined three colonies in the pasture area and three in the forest edge, with an average collection per colony of 46 ± 0.53 and 45 ± 8.4 (mean ± standard deviation) forage workers, respectively. At the end of the experiments, collected up 1,093 workers in the pasture area and 1,211 in the forest edge. Workers gathered from a single colony were kept in plastic containers during 15 days under controlled diet, temperature 25 ° C and 12 hour photoperiod. In order to verify the relationship between size of the worker and parasitism rate, it was measured the maximum width of the head capsule (distance between the eyes) of the workers. The higher parasitism rates were recorded in the months with the highest rainfall and average temperature index, coinciding with high relative humidity, i. e., February, March and April. There was no significant difference in the average size of parasitized workers compared to non-parasitized and those that survived, nor between the two areas of study. A single morphospecies of Phoridae was identified from the emerged adults. Its morphological and behavioral characteristics indicate a species of Apocephalus genus.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-02Bitstream added on 2014-06-13T19:19:40Z : No. of bitstreams: 1 vieira_as_dr_rcla.pdf: 1961772 bytes, checksum: 3060f9b6fd2bb1240360d44353301ddc (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A glândula metapleural é um órgão exclusivo das formigas e sua principal função seria a de produzir secreções antibióticas. O objetivo foi de investigar e comparar as possíveis modificações na morfologia interna da glândula metapleural, assim como a composição química das suas secreções nas formigas cultivadoras (Attini) e não cultivadoras de fungos (Ectatommini, Blepharidattini e Myrmicini). Ficou demonstrado que a glândula metapleural nos grupos Ectatommini, Myrmicini, Blepharidatiini e Attini (basal e derivada), apresentam suas porções: secretora formada por várias células secretoras, e armazenadora (reservatório), conectadas entre si por meio de canalículos (intra e extracitoplasmáticos). As Attini derivadas e basais (cultivadoras de fungos) diferiram das não cultivadoras de fungos, por possuírem as células secretoras com forma oval. Ainda, as células secretoras da glândula metapleural das formigas cortadeiras apresentaram muitas mitocôndrias próximas as microvilosidades da porção intracitoplasmática do canalículo, ao contrário dos outros grupos, aqui estudado. A glândula metapleural das formigas não cultivadoras de fungos (Ectatommini, Mymicini e Blepharidattini) e a das atine basais possuem menor número de células secretoras do que aquelas das atines derivadas. Nas formigas cortadeiras, também, a glândula metapleural teve mais agrupamentos de células secretoras e placas perfuradas na câmara coletora. Morfometricamente o diâmetro do reservatório foi proporcional ao tamanho do corpo das operárias mínimas, médias e maiores de Atta laevigata, porém, o estudo ultraestrutural das glândulas metapleurais desta espécie indicou que as operárias mínimas seriam as responsáveis por produzirem maior variedade de secreções quando comparadas as médias e as maiores... / The metapleural gland is an organ exclusive to ants. Its main role is to produce antimicrobial secretions. The aimed was investigating and comparing the possible changes in the internal morphology of metapleural gland, as well as the chemical composition of secretions in fungus-growing (Attini) and non-fungus-growing ants (Ectatommini, Blepharidattini and Myrmicini). The metapleural gland of the groups Ectatommini, Myrmicini, Blepharidatiini and Attini (basal and derived), exhibited secretory portion formed by many secretory cells, and the storage (reservoir) units connected by canaliculi (intra and extracytoplasmic). Derived and basal attines (fungus-growing ants) differed from non-fungus-growing ants by the presence of oval secretory cells. Also, the secretory cells of the metapleural gland of leafcutting ants exhibited many mitochondria near microvilli of the intracytoplasmic portion of the canaliculus, unlike other groups examined in this study. The metapleural gland of nonfungus- growing ants (Ectatommini, Mymicini, and Blepharidattini) and basal attines contained fewer secretory cells than derived attines. In leaf-cutting ants, the metapleural gland exhibited more clusters of secretory cells and sieve plates in the collecting chamber. The diameter of the reservoir was morphometrically proportional to the body size of minor, medium, and major workers of Atta laevigata. However, the ultrastructural analysis of the metapleural gland of this species revealed that minor workers may be responsible for producing a greater variety of secretions compared to medium and major workers, due to the presence of a well-developed rough endoplasmic reticulum and strongly stained secretion granules for lipids and polysaccharides. The secretion produced by the metapleural glands of all ant groups examined in this study consisted of... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013-04-27Bitstream added on 2014-06-13T19:40:30Z : No. of bitstreams: 1 ferro_m_dr_rcla_parcial.pdf: 557493 bytes, checksum: fcae382eb9a89592e907d3171f912924 (MD5) Bitstreams deleted on 2015-05-04T12:07:27Z: ferro_m_dr_rcla_parcial.pdf,Bitstream added on 2015-05-04T12:07:58Z : No. of bitstreams: 1 000713741.pdf: 1451277 bytes, checksum: 241fb4d825af417c9645365b1885c071 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As formigas Attini são destacadas pragas agrícolas e invertebrados modelos em estudos em genômica, metagenômica, sistemática e evolução molecular. Tais estudos têm gerado milhares de sequências nucleotídicas, cuja análise demanda o uso de diferentes programas de Bioinformática em processamentos automatizados. Pensando nisso, foram desenvolvidos protocolos para análises de ESTs e de bibliotecas de sequências ITS e 16S obtidas de formigas Attini. Foi desenvolvida uma arquitetura baseada no padrão MVC e J2EE responsável por todos os processos cliente-servidor. Os protocolos foram implementados na forma de pipelines em que cada componente é um serviço web em REST acoplado a arquitetura desenvolvida. bESTscan realiza a anotação de sequências EST transcriptômicas, 16Scan e ITScan realizam análises de ecologia microbiana, para bactérias (sequências 16S) e para fungos (sequências ITS) respectivamente, bem como identifica as sequências através de pesquisas em bancos de dados públicos. O sistema computacional desenvolvido automatiza a anotação de sequências para um pequeno volume de sequências como as obtidas por Sanger ou para grande volume de dados como as geradas por Sequenciadores de Nova Geração, reduzindo o tempo de processamento e facilitando a análise dos resultados. Todos os pipelines desenvolvidos foram validados com sequências de Attini, obtidas por Sanger e Illumina, geradas a partir de diferentes projetos do nosso laboratório e estão disponíveis na web nos endereços http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics / The Attini ants are agricultural pests and invertebrate models for studies on genomics, metagenomics, molecular systematics and evolution. These studies have generated thousands of nucleotide sequences whose analysis requires the use of different Bioinformatics tools and automated processing. We developed automated sequence annotation protocols for ESTs and ITS and 16S libraries analysis for Attini ants. We developed an architecture model based on J2EE and MVC patterns which is responsible for all client-server processes and each tool in the pipeline is a REST web service coupled in the architecture model developed. The bESTscan pipeline to perform the EST transcriptome annotation, 16Scan e ITScan realize microbial ecology studies for both, bacteria (16S sequences) and for fungi (ITS sequences), as well as identify sequences through public databases. The computer system developed automates the annotation for both a small volume of sequences obtained by Sanger and for a large number of data generated by the Next Generation Sequencers (NGS), reducing processing time and with high performance. Pipelines were developed and validated using sequences Sanger and Illumina generated with different projects from our laboratory and are available at http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-06-21Bitstream added on 2014-06-13T21:01:38Z : No. of bitstreams: 1 porfirio_lfp_dr_rcla.pdf: 1394069 bytes, checksum: af176c7fa468a0d84248e814bd46e00b (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As glândulas mandibulares, dos insetos Hymenoptera, fazem parte do seu sistema salivar. São estruturas pares que se localizam uma em cada lado da cabeça, possuindo um ducto excretor abrindo na base da articulação da mandíbula, por onde eliminam a secreção produzida. São compostas por um reservatório associado às células secretoras, sendo que cada célula desemboca individualmente no reservatório através de canalículos. Embora as glândulas mandibulares estejam ligadas às peças bucais, utilizando seu produto glandular na ingestão e digestão de alimentos, essas glândulas evoluíram no sentido de se dissociarem da função digestiva para terem função comportamental. No presente estudo avaliou-se a morfo-histologia, citoquímica ultra-estrutural, dosagem e eletroforese de proteínas, além da expressão gênica das glândulas mandibulares das operárias mínimas, médias e soldados de formigas Atta sexdens rubropilosa, com o objetivo de fornecer informações sobre a dinâmica da produção, bem como a composição e origem da secreção dessas glândulas nas três castas desses insetos. A análise morfológica e ultra-estrutural evidenciou uma organização glandular saculiforme, constituída por uma porção secretora e um reservatório com um ducto excretor a ele conectado. A porção secretora é formada por células arranjadas em ácinos e o reservatório é constituído por um epitélio simples pavimentoso revestido pela íntima cuticular. Essas duas porções encontram-se interligadas por canalículos intra e extracitoplasmáticos. Tanto a histoquímica, quanto a citoquímica ultra-estrutural detectou lipídios, proteínas e polissacarídeos nas diferentes regiões das glândulas mandibulares nas três castas estudadas, inclusive em suas secreções, demonstrando... / The mandibular glands, in the Hymenoptera insects, make up part of the salivary system. These glands are paired structures that are located one on each side of the head, containing an excretory duct, at the base of the mandible articulation, from which the secretion produced is eliminated. They contain a reservoir associated with the secretory cells, being that each cell opens individually in the reservoir through the canaliculi. Even though the mandibular glands are connected to the bucal parts, using its glandular product in the ingestion and digestion of food, these glands have evolved in the sense of being disassociated with the digestive function to having a behavioural function. In the present study the morpho-histology, ultrastructural cytochemistry, protein dosage and electrophoresis were evaluated, as well as the gene expression of the mandibular glands of the minima, media workers and soldiers of ants Atta sexdens rubropilosa, with the objective of providing information about the production dynamics, as well as the composition and origin of the secretion of these glands in the three castes of these insects. The morphological and ultrastructural analysis described a glandular organization consisting of sacs, formed by a secretory portion and a reservoir with a connected excretory duct. The secretory portion is formed by cells arranged in alveoli and the reservoir is constituted of a simple pavimentous epithelium covered by the cuticular intima. These two portions are interconnected by intra- and extra-cytoplasmic canaliculi. The histochemistry, as well the ultrastructural cytochemistry, highlighted lipids, proteins and polysaccharides in different regions of the mandibular glands in the three castes studied demonstrating... (Complete abstract, click electronic address below)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-10-11Bitstream added on 2014-06-13T19:19:43Z : No. of bitstreams: 1 roma_gc_dr_rcla.pdf: 2022594 bytes, checksum: eece8bf27b13004335d7c54d03d168df (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / O corpo gorduroso dos insetos é um tecido de preenchimento que está principalmente no abdômen e ao redor dos órgãos, onde é denominado de corpo gorduroso perivisceral, e logo abaixo do tegumento, ou corpo gorduroso parietal. No presente estudo avaliou-se a morfologia, a morfometria, a histoquímica e a citoquímica ultra-estrutural, além da química dos lipídios, das células do corpo gorduroso das operárias e gynes (fêmeas aladas) de formigas de Cyphomyrmex rimosus e de Mycetarotes parallelus e operárias médias e rainhas de Acromyrmex disciger e de Atta laevigata pertencentes à tribo Attini, com o objetivo de descrever os tipos celulares e analisar morfológica e fisiologicamente suas células, com vistas a detectar a ocorrência de possíveis variações neste tecido tanto entre as espécies quanto entre as castas, além de avaliar se existiriam diferenças entre as espécies basais e derivadas que possivelmente teriam surgido ao longo do processo evolutivo dos indivíduos pertencentes a esta tribo. Os resultados mostraram que em todas as espécies e castas o corpo gorduroso é constituído pelos trofócitos, células que se tornam poligonais devido à compressão de uma contra a outra, com núcleos irregulares e com presença de proteínas, polissacarídeos neutros e lipídios distribuídos por todo o citoplasma. Nas gynes e rainhas, em geral, esses elementos mostraram-se mais evidentes do que nas operárias. Verificou-se ainda que os trofócitos das castas reprodutivas seriam caracterizados pela presença de toda a estrutura relacionada à síntese de proteínas, elementos essenciais nos processos relacionados à vitelogênese. Os lipídios nos trofócitos das operárias e rainhas das espécies derivadas apareceram em maiores quantidades do que nas operárias e gynes basais. Os enócitos, outro tipo celular freqüentemente associado aos trofócitos, mostraram-se... / The insect fat body is a filling tissue which is distributed principally in the abdomen, around the organs (also known as perivisceral fat body) and right above the tegument (called the parietal fat body). The present study evaluated the morphology, morphometry, histochemistry and ultrastructural cytochemistry, as well the lipid chemistry, of the fat body cells of ant workers and gynes (winged females) of Cyphomyrmex rimosus and Mycetarotes parallelus and media workers and queens of Acromyrmex disciger and Atta laevigata belonging to the Attini tribe, with the objective of describing the cell types and the morphological and physiological analysis of their cells. This was done in an attempt to detect the occurrence of possible tissue variations between the species and castes, as well as evaluating if there are differences between the basal and derived species that may have surfaced during the evolution of these individuals belonging to this tribe. The results showed that in all species and castes the fat body is constituted of trophocytes, which are polygonal in shape due to the compression of one cell against another, and with irregular nuclei, proteins, neutral polysaccharides and lipids distributed all over the cytoplasm. In general, these elements were more evident in the gynes and queens than in the workers. It was also verified that the trophocytes of the reproductive castes are characterized by the presence of structures related to protein synthesis, essential elements in activities related to vitellogenesis. The lipids in the worker and queen trophocytes from the derived species are present in larger amounts when compared to the basal workers and gynes. The oenocytes, another cell type frequently associated to the trophocytes, are spherical in all species and castes, in addition to spherical nuclei, proteins, lipids and a few neutral polysaccharides distributed all over the... (Complete abstract click electronic access below)

Orientador: Luiz Carlos Forti / Banca: Odair Correa Bueno / Banca: Ivone Paschoal Garcia / Abstract: The objective of this paper was to have a better understanding of plant-ant-symbiotic fungus interaction focusing on foraging behavior of Atta sexdens rubropilosa workers during plant selection. Physical and chemical substrate factors were approached which can have a role on foraging material selection for symbiotic fungus cultivation besides defoliating localization in artificial plants. Tested hypothesis was that besides chemical characteristics physical stimulus and leaves localization in a plant also play a very important role in substrate selection by A. sexdens rubropilosa workers. Different shape and thickness material was used (different leaves, paper leaves with different shapes and thickness impregnated in plant extract and artificial plants). The aim was to verify the existence of physical and chemical resistance, leaf palatability and defoliating localization. Wood plants Actinostemon communis, Alchornea triplinervea, Croton floribundus, Faramea cyanea, were offered to workers and evaluated 4 according to mechanical resistance of cut and palatability. Each plant was offered individually in big disc shape (2,5cm diameter), small disc shape (0,5cm diameter) and whole leaves. Other studies were carried out for detecting physical and chemical stimulus through simulated cuts and impregnation of plant extract in paper leaves with different thickness making it possible to evaluate the combinations between physical and chemical substrate characteristics. Defoliating localization in plants was studied when offering artificial plants with four levels where either wood plant or Ligustrum sp. leaves was attached. Defoliating intensity was measured by the number of fallen leaves by ants. In order to study wood plant attractiveness small disc shaped leaves (0,5cm diameter) were offered at the same time for ants in laboratory. The end of the experiment was determined either by the carrying... (Complete abstract, click electronics address below). / Mestre

Orientador: Luiz Carlos Forti / Coorientador: Juliane Floriano Lopes Santos / Banca: Pedro Leite Ribeiro / Banca: Vânia Maria Ramos / Banca: Roberto da Silva Camargo / Banca: Ivone Paschoal Garcia / Resumo: Não disponível / Abstract: Not available / Doutor

Orientador: Maurício Bacci Júnior / Banca: André Rodrigues / Banca: Henrique Ferreira / Banca: Flávio Henrique da Silva / Banca: Claudio José Von Zuben / Resumo: As formigas Attini são destacadas pragas agrícolas e invertebrados modelos em estudos em genômica, metagenômica, sistemática e evolução molecular. Tais estudos têm gerado milhares de sequências nucleotídicas, cuja análise demanda o uso de diferentes programas de Bioinformática em processamentos automatizados. Pensando nisso, foram desenvolvidos protocolos para análises de ESTs e de bibliotecas de sequências ITS e 16S obtidas de formigas Attini. Foi desenvolvida uma arquitetura baseada no padrão MVC e J2EE responsável por todos os processos cliente-servidor. Os protocolos foram implementados na forma de pipelines em que cada componente é um serviço web em REST acoplado a arquitetura desenvolvida. bESTscan realiza a anotação de sequências EST transcriptômicas, 16Scan e ITScan realizam análises de ecologia microbiana, para bactérias (sequências 16S) e para fungos (sequências ITS) respectivamente, bem como identifica as sequências através de pesquisas em bancos de dados públicos. O sistema computacional desenvolvido automatiza a anotação de sequências para um pequeno volume de sequências como as obtidas por Sanger ou para grande volume de dados como as geradas por Sequenciadores de Nova Geração, reduzindo o tempo de processamento e facilitando a análise dos resultados. Todos os pipelines desenvolvidos foram validados com sequências de Attini, obtidas por Sanger e Illumina, geradas a partir de diferentes projetos do nosso laboratório e estão disponíveis na web nos endereços http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics / Abstract: The Attini ants are agricultural pests and invertebrate models for studies on genomics, metagenomics, molecular systematics and evolution. These studies have generated thousands of nucleotide sequences whose analysis requires the use of different Bioinformatics tools and automated processing. We developed automated sequence annotation protocols for ESTs and ITS and 16S libraries analysis for Attini ants. We developed an architecture model based on J2EE and MVC patterns which is responsible for all client-server processes and each tool in the pipeline is a REST web service coupled in the architecture model developed. The bESTscan pipeline to perform the EST transcriptome annotation, 16Scan e ITScan realize microbial ecology studies for both, bacteria (16S sequences) and for fungi (ITS sequences), as well as identify sequences through public databases. The computer system developed automates the annotation for both a small volume of sequences obtained by Sanger and for a large number of data generated by the Next Generation Sequencers (NGS), reducing processing time and with high performance. Pipelines were developed and validated using sequences Sanger and Illumina generated with different projects from our laboratory and are available at http://evol.rc.unesp.br/lem/?q=bioinformatics / Doutor