Orientador: Roberto Feijo de Figueiredo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Civil / Made available in DSpace on 2018-07-24T20:47:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carraro_VeniltonJose_M.pdf: 4145062 bytes, checksum: 12ff27fe25f25f667f0b7641516fdcee (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: Aplicou-se o processo de tratamento de efluente bruto de no solo através de sulcos largos de infiltração, irrigando Eucalyptus grandis. Foi utilizada para isso uma área de 2 ha onde foi analisado o método de tratamento no solo e foram monitoradas água retirada de sondas de ponta porosa, coletores de drenagem livre e poços de observação, comparando os resultados com uma área não irrigada. Foram feitas análises do solo da área nas profundidades de Oa 25, de 25 a 50, de 50 a 75 e de 75 a 100 cm., com a finalidade de se detectar alguma influência do resíduo líquido nas características químicas do solo, comparando-o com uma área não irrigada. Foi acompanhado o desenvolvimento radicular, perímetro do caule e altura das plantas da área experimental e de uma área testemunha, que não recebeu irrigação. Esse monitoramento teve a finalidade de detectar influências desse processo no desenvolvimento dos eucaliptos após comparação entre as áreas. Os resultados obtidos indicam uma boa eficiência na remoção de matéria orgânica, turbidez, cor e sólidos suspensos. As porcentagens de remoção de D Q O ultrapassaram 90 porcento. Não ocorreu nenhum efeito negativo sobre o crescimento das plantas durante o experimento / Abstract: Raw effluent &om a citrus processing plant was applied on soil across wide furrows infiltration method, with Eucalyptus grandis as crop. A total area of 2 hectares was utilized for that purpose where water samples were collected &om lysimeters, &ee-drainage collectors, and observations wells. Results &om irrigated and non-irrigated area were compared. Soil samples &om different depths ( Oto 25, 25 to 50, 50 to 75, and 75 to 100 cm) were analyzed, aiming the detection any possible effects of the effluent upon soil chemistry characteristics, both for irrigated and non-irrigated areas. AIso root development, perimeter, and height of the plants &om irrigated and non-irrigated areas were monitored. Results indicated a good efficiency on organic matter, turbidity, color and suspended solids remova!. Removal of COD was above 90 percent. No deleterious effect was notices on the vegetation / Mestrado / Recursos Hidricos e Saneamento / Mestre em Engenharia Civil

Orientador: Tamas Szmrecsanyi / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Geociencias / Made available in DSpace on 2018-07-25T14:55:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RamosFilho_LuizOctavio_M.pdf: 4548314 bytes, checksum: 678ba4487589ac1892255b3d6ca34232 (MD5) Previous issue date: 1999 / Resumo: Considerando a atual importância econômica da agroindústria citrícola no Estado de São Paulo, e a reconhecida excelência científica do Centro de Citricultura do Instituto Agronômico de Campinas (IAC), o presente estudo procura resgatar a história do trabalho com citros neste Instituto, traçando um paralelo entre a evolução das atividades de P&D e o desenvolvimento da citricultura paulista. O período analisado vai da década de 1920 até meados da década de 1960, compreendendo a fase em que a produção citrícola brasileira era destinada ao mercado de frutas in natura. A partir de uma análise de fontes documentais da instituição, e dos artigos técnicos e científicos publicados no período, são identificadas as diferentes fases da atividade de pesquisa, bem como suas principais contribuições. Nota-se que houve diversos trabalhos em cooperação com outras instituições, nacionais e internacionais, principalmente na década de 1940, quando o IAC se consolidou como o principal articulador dos trabalhos de P&D com citros no Estado. O caráter híbrido desse Instituto permitiu um papel dinâmico ao longo do tempo, tendo sua atuação se voltado tanto para o trabalho de pesquisa científica e experimental como também para o de fomento e difusão, enfatizando-se um ou outro conforme as exigências da conjuntura. Foram levantadas evidências de que os esforços de P&D no Instituto começaram quando a citricultura ainda possuía pouca importância em São Paulo, sugerindo que a cultura teve uma atenção privilegiada por parte das instituições públicas de pesquisa, principalmente do IAe. Estes esforços seriam decorrentes de uma política de diversificação da agricultura de exportação, por parte do Governo estadual, a qual incluía uma política de ciência e tecnologia, ainda que de forma implícita. Ao final conclui-se que o sistema público de pesquisa, em particular o IAC, teve um papel decisivo no desenvolvimento da citricultura paulista. O êxito econômico alcançado pelo setor a partir da década de 1970, bem como a excelência científica verificada recentemente, podem ser explicados, em grande parte, pela estreita sintonia entre a evolução do setor produtivo e das atividades de P&D, construída historicamente desde a década de 1920 / Abstract: Considering the current economical importance of the citriculture agro-industry in the State of São Paulo and the acknowledged scientific excellence of the Centro de Citricultura (Citriculture Center) at the Instituto Agronômico de Campinas (IAC - Campinas Agronomic Institute), the present study seeks to trace the Institute's work on citrus, drawing a parallel between the evolution of the R&D activities and the development of citriculture in the State of São Paulo. The analyzed period extends from the 1920s to the mid-1960s, embracing early stages, when the Brazilian citriculture production was mainly intended to the fresh fruit market. The different steps of the research activities and their main contributions are highlighted through an analysis of both the Institution's documentary sources and the technical and scientific articles published during that period. Cooperation with either national or intemational institutions is worth noting, particularly in the 1940s, when the IAC emerged as the main articulator of the R&D work on citrus in the State. Over the time, its dual characteristic provided the Institute with its dynamic role and its action then focused on scientific and experimental research as well as on support and diffusion, spotlighting either ones or the others, according to what the circumstances demanded. Evidences show that the Institute's R&D efforts began as citriculture was still of little importance in São Paulo, suggesting this culture received a privileged attention from the public research institutions, mainly the IAC. Such efforts seem to be attributable to the diversification of the State Govemment policies with regard to the exportation agriculture, which, although implicit1y, comprised a science and technology policy.In conclusion, the public research system, particularly the IAC, played a decisive role in the citriculture expansion in the State of São Paulo. Historically designed from the 1920s on, the fine tuning between the evolution of the productive sector and the R&D activities explains, for the greatest part, both the economical success in this sector, from the 1970s on, and the recent acknowledgement of scientific excellence / Mestrado / Politica Cientifica e Tecnologica / Mestre em Política Científica e Tecnológica

Orientador: Walter Belik / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Economia / Made available in DSpace on 2018-07-25T21:24:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paulillo_LuizFernandodeOriani_D.pdf: 39224323 bytes, checksum: a18fbc47d232035bd7391a0be62d6196 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: O objetivo do presente trabalho é o de realizar uma contribuição analítica que dê conta dos aspectos institucionais relevantes da gênese, desenvolvimento e dinâmicas dos complexos agroindustriais amadurecidos em termos tecnológicos e organizacionais no Brasil. Para tal, apresenta-se um marco de análise neo-institucional, que articula três dimensões relevantes para a abordagem desses complexos: a tecnologia, a estrutura de poder e o território. A proposta mais específica do trabalho é a de utilizar o território, a terceira dimensão relevante do marco analítico proposto, em articulação com as dimensões tecnológica e organizacional, para explicar o desenvolvimento e a dinâmica do complexo agroindustrial citrícola brasileiro, localizado estrategicamente no cinturão da laranja, que abrange as macrorregiões de Campinas, Ribeirão Preto, São José do Rio Preto, Sorocaba e uma parte do Triângulo Mineiro. A análise do processo de transformação institucional no território citrícola dá margem para pensar e propor uma política pública que vá além da mera articulação de interesses dos atores privados, já que a proximidade territorial pode impulsionar movimentos de mobilização social e cultural localizadas. O desenvolvimento deste território esteve sempre atrelado às transformações de seu campo organizacional, que caracterizaram três fases: regulação estatal (1964/fins dos anos 70), auto-regulação (anos 80) e crise da auto-regulação (1991/99). O resultado mais relevante deste longo processo foi a intensificação da assimetria de poder entre indústria e citricultura, impulsionando a exclusão de milhares de produtores de laranja no período 1986/1999. Diante desse quadro estrutural, o trabalho pretende estudar e propor uma instituição política que possibilite reduzir o perfil excludente do território citrícola nacional, atingindo produtores e trabalhadores rurais / Abstract: The objective of this thesis is to analyze the main institutional aspects of the genesis, development and dynamics of some Brazilian agri-industrial complexes that have reached their technological and organizational maturity. The theoretical approach used here is the neo-institutional analysis, which is able to link three important dimension of complexes: technology, power structure and territory. 'Territory', the third dimension of the theoretical approach, was used, articulated with the technological and organizational dimensions, as a way to explain the development and the dynamics of the citrus agri-industrial complex in Brazil, located in the State of São Paulo and in the Triangulo Mineiro ofthe State ofMinas Gerais. The analysis of the process of institutional transformation in the citrus territory suggests that public police should consider that territorial proximity can foster local cultural and social mobilization movements. The development of the studied region have always been linked with organizational transformations, which can be split into three phases: state regulating (1994 to the end ofthe 70s), self-regulating (during the 80s) and self-regulating crisis (1991 to 1999). The most relevant result ITom this long process was the intensification of the already existent unbalanced distribution of power between industry and agriculture, which have fostered exclusion of thousands of orange producers during 1986 to 1999. Given this context, this thesis presents a study and a proposal of an institutional framework that aims to reduce the restrictive profile of the citrus national territory, benefiting many small farmers and rural workers / Doutorado / Doutor em Ciências Econômicas

Orientador: Dirceu Brasil Vieira / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia Civil / Made available in DSpace on 2018-07-18T21:58:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ribeiro_TulioAssuncaoPires_M.pdf: 5716006 bytes, checksum: d58ef1046b183cf1a3429a07e7e20a14 (MD5) Previous issue date: 1993 / Resumo: O presente trabalho teve como objetivo estudar o comportamento de alguns parâmetros básicos que afetam o manejo da irrigação por microaspersão sobre a cultura do limão tahiti. Foram investigados, à distribuição do sistema radicular, o controle de umidade do solo que afeta à disponibilidade de água no solo para a cultura e a performance do equipamento. Detalhe especial foi dado ao estudo da uniformidade de emissão de água no campo como também o perfil de distribuição de água do microaspersor utilizado. o pomar localiza-se no Campo de Pesquisa Hidroagrícola do Pinhal (CAPIN), no Estado de São Paulo, a 22°40' de latitude sul e 47°20' de longitude a oeste de Greenwich, no município de Limeira. O solo é do tipo litólico com textura bastante variada e inclinado. O clima é Cwa, segundo a classificação de Kõeppen. As plantas tem como porta-enxerto o limão Cravo (Citrus limonia, OSBECK) e a copa o limão tahiti, com 3 anos e meio de idade, anteriormente não era irrigado. A àrea total do pomar era de 2 hectares e com 11% de declividade. O sistema de irrigação era por microaspersão com cabeçal de controle, linhas laterais de distribuição de polietileno e linha principal de PVc. Os rnicroaspersores fabricados pela ASBRASIL, é do tipo autocompensante com bailarina, funcionando a uma pressão de serviço de 25 a 40 M.C.A. e uma vazão de aproximadamente 73 litros/hora. A intensidade de aplicação do microaspersor ao longo do raio variou bastante entre os locais estudados e apresentaram coeficientes de variação (CV) entre 40 a 75,8% para praticamente uma mesma vazão. O estudo do sistema radicular foi feito pelo método do trado, tendo sido tomadas amostras do solo contendo as radicelas a distancias de 70, 140, 210, 280 e 350 cm do tronco. Em cada um desses pontos as amostras foram tomadas até a profundidade de 60 cm. Os resultados mostraram que 74,1% das radicelas estavam na profundidade de Oa 30 cm e que o re stante está na profundidade de 30 a 60 cm. Nessas camadas a maior porcentagem das radicelas está na faixa de 70 a 140 cm de distancia do tronco. Durante um ano foi feito o acompanhamento sistemático da umidade do solo, através do método gravimétrico, em 4 locais, e tensiométrico, em 3 locais. O controle foi nas profundidades de O a 15 cm, 15 a 30 cm, 30 a 60 cm de profundidade a 70 cm do tronco, onde se concentra o sistema radicular. O balanço hídrico foi restrito a distancia de 70 cm do tronco e a profundidade de O a 60 cm. Os valores do coeficiente de cultura (kc), provenientes de ambos os métodos, denominou-se de kc operacional que variou de 0,61 a 0,90 durante o ano. No verão o coeficiente obtido variou de 0,76 a 0,77, no outono até final de inverno de 0,90 a 0,73 e na primavera de 0,99 a 0,84. Através do manejo empregado obteve-se produção de frutos de junho a agosto, considerado fora de época. Os resultados observados na presente pesquisa indicam que a irrigação pode ser de grande valia para o produtor para a regularização da oferta de frutas no mercado / Abstract: The present work studies some basic parameter used in water management of lemon orchard iffigated by microsprinkler. Those parameters are root systems distribution, soil's characteristics and moisture control, water consumption and to the equipament's performance, such as water distribution's profile and emission uniformity under field conditions. The orchard is located at Pinhal Hydroagriculture Research Field (CAPIN), in the State of São Paulo, at latitude 47°20'S and longitude west of Greenwich, in Limeira's area. The soil is litholics type with variable texture and slope of 11%. The climate is Cwa type, by KOEPPEN'S classification. The plant are Tahiti with over cravo's lemon (Citrus limonia, OSBECK), with three and half years of age, no irrigated previosly. A 2 hec microirrigation systems has control head filters, main and laterallines of PVc. The microsprinklers are self compensated models manufactured by ASBRASIL S.A., with working pressure of 25 to 40 mca and the outflow of aproximatly 73 liter/hour. The aplication intensity of the microsprinkler along the radius showed variable distribution within the wetted area for different levels in the orchard. The coefficient variation (CV) were between 40 to 75.8% for basically the same outflow. However, outflow was not affect by pressure variation. The sutdy of root systems were made by auger method. Soi! sample with root were taken at 70, 140, 210, 280 and 350 cm of the trunck. The results showed that 74,1 % of the root were at the depth of O to 30 cm and the rest were at the depth of 30 to 60 cm. ln these layers the higher porcentage of the root were in an area of 70 to 140 cm of distance fiom the trunck. During one year, were systematically accompanied the wetness of the soil, through the gravimeter method, in 4 different places, and tensiometer method in 3 different places. The control was Oa 15 cm, 15 to 30 cm and 30 to 60 cm deep and 70 cm far from the trunck, where root system is concentrated. The hidric balance was restriced to 70 cm of distance from the trunck and Oa 60 cm of depth. The values of the culture coefficient from both methods, was denominated kc operational, and varied from 0,61 to 0,90 during one year. ln the summer, the coeffcient obtained varied from 0,76 to 0,77. ln the fall, until the end of the wimer, it varied from 0,90 to 0,73 and in spring from 0,79 to 0,84. Through this management obtained the production of fuit from june to august, what is considered out of season. The observed results in the present research indicate that irrigation can be very useful to the producer and to the reguralization of fruit offering in the market / Mestrado / Recursos Hidricos e Saneamento / Mestre em Engenharia Civil

Orientador: Marcos Antonio Machado / Coorientador: Alessandra Alves de Souza / Banca: Celso Benedetti / Banca: Anete Pereira de Souza / Banca: Ivan de Godoy Maia / Banca: Henrique Ferreira / Resumo: A citricultura brasileira responde por 85% das exportações de suco concentrado do mundo, mesmo enfrentando graves problemas de ordem fitossanitária. Dentre as doenças que mais afetam sua produtividade encontra-se a clorose variegada do citros (CVC), causada pela Xylella fastidiosa. Cultivares dentro das espécies de Citrus apresentam respostas diferentes em relação à susceptibilidade à CVC. Enquanto cultivares de laranja doce (Citrus sinensis L. Osb) são bastante suscetíveis, as tangerinas (Citrus reticulata Blanco) por sua vez são consideradas tolerantes. Resultados prévios do nosso grupo sugerem que a resistência deve estar efetivamente envolvida com a ativação de vias de sinalização, não sendo somente consequência de menor bloqueio dos vasos do xilema. Portanto, a hipótese desse trabalho é que a resistência da tangerina Poncan e a suscetibilidade de laranja doce à CVC pode ser comparada através da avaliação da expressão diferencial de genes durante o processo de infecção. Desse modo, o objetivo do trabalho foi avaliar a expressão de genes dessas duas espécies submetidas à infecção pela bactéria. Para tanto plantas de laranja Pera e tangerina Poncan foram desafiadas com X. fastidiosa e as coletas das folhas infectadas e seus respectivos controles feitas em diferentes tempos (1, 7, 14 e 21 dias). Esse material foi utilizado para extração de DNA total que foi usado na confirmação, por RT-qPCR, da presença da bactéria. Após essa verificação, o RNA foi extraído em pools para a construção das bibliotecas subtrativas supressivas (SSHs). Foram feitas seis bibliotecas, porém, não foram obtidas sequencias de qualidade. Em função do baixo rendimento das SSHs, optou-se por proceder as análises com RNA-seq utilizando tecidos xilemáticos de tangerina Poncan, com um dia após... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The Brazilian citrus industry accounts for 85% of exports of concentrated juice in the world despite facing serious plant health problems. Among the main diseases that affect its productivity is the citrus variegated chlorosis (CVC), caused by Xylella fastidiosa. Citrus species present different responses in relation to susceptibility to CVC. While sweet orange (Citrus sinensis L. Osb) is very susceptible, mandarin (Citrus reticulata Blanco) is considered tolerant. Previous results from our group suggest that this tolerance observed in mandarin effectively involves activation of signaling pathways and is not only consequence of limited blockage of the xylem vessels. Therefore, the hypothesis of this study is that the tolerance of Ponkan mandarin and susceptibility of sweet orange to CVC can be compared evaluating the differential expression of genes during the infection process, being that the objective of this study. For that, Ponkan mandarin and sweet orange plants were challenged with X. fastidiosa. Infected/non-infected leaves were collected at different times (1, 7, 14, and 21 days). This material was used for extraction of total DNA, which was used for confirming the presence of bacteria by RT-qPCR. After this verification, the RNA was extracted in pools for the construction of suppressive subtractive libraries (SSHs). Six libraries were prepared, but good quality sequences were not obtained. Due to the low efficiency of SSHs, it was decided to proceed with RNA-seq analysis using xylem tissues of mandarin Ponkan, one day after infection with X. fastidiosa. In this analysis it was obtained 35,344,265 transcripts for the non-infected library and 37,326,339 for the infected one. These transcripts were mapped in the whole reference genome of Citrus clementine by using TopHat software. The contigs generated... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Jesus Aparecido Ferro / Coorientador: José Belasque Júnior / Banca: Roberto Hirochi Herai / Banca: Fabrício José Jaciani / Banca: Flávia Maria de Souza Carvalho / Banca: Marcos Túlio de Oliveira / Resumo: A bactéria Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii tipo C (XauC) é o agente causal da cancrose C, que afeta apenas lima ácida 'Galego' (Citrus aurantifolia (Christm) Swingle). A principal característica fenotípica desta doença é a hiperplasia e hipertrofia do tecido afetado, que leva à formação de lesões erupescentes características, sendo que o responsável pela proliferação celular desordenada é um efetor tipo TAL da família AvrBs3/PthA, que é injetado na planta pelo sistema de secreção tipo III (SST3) da bactéria e é translocado até o núcleo, onde interage com regiões UPA-box (up-regulated by AvrBs3) e funciona como um ativador transcricional. As variedades de laranja doce são resistentes à cancrose C e, quando inoculadas com XauC apresentam forte reação de hipersensibilidade (HR), causando morte celular programada local (apoptose) e abscisão das folhas afetadas. O(s) mecanismo(s) que confer(em) à lima ácida 'Galego' susceptibilidade à XauC não é(são) conhecido(s). Este estudo teve como objetivo identificar, através de sequenciamento de nova geração (NGS), transcritos de plantas diferencialmente expressos envolvidos na interação patógeno-hospedeiro nos patossistemas XauC-laranja 'Hamlin' (espécie resistente) e XauC-lima ácida 'Galego' (espécie susceptível). Para isso, folhas de laranja 'Hamlin' e lima ácida 'Galego' foram inoculadas com suspensão de XauC a uma concentração de 106 ufc/mL, sendo que o controle foram folhas inoculadas com água estéril. Essas folhas foram coletadas nos tempos de 5 e 7 dias após inoculação (dai) e o RNA total foi extraído e utilizado para a análise dos transcrissomas por RNA-seq. Os transcritos obtidos do sequenciamento foram normalizados e as redundâncias foram removidas. Foi montado um banco único de dados genômicos e de transcritos de citros... / Abstract: The bacterium Xanthomonas fuscans subsp. aurantifolii type C (XAC) is the causative agent of cancrose C, which affects only acid lime 'Galego' (Citrus aurantifolia (Christm) Swingle). The main phenotypic characteristic of this disease is the hyperplasia and hypertrophy of the affected tissue, leading to the formation of erupescentes characteristic lesions, and responsible for the abnormal cell growth is a transcription activator-like (TAL) effector family (also called the avrBs3/pthA family), which is injected into the plant by the type type III secretion system (T3SS) and is translocated to the nucleus, where it interacts with UPA-box regions (up-regulated by AvrBs3) and acts as a transcriptional activator. The sweet orange varieties are resistant, and when inoculated with XauC show strong hypersensitive response (HR), causing local programmed cell death (apoptosis) and abscission of affected leaves. The mechanisms that give the acid lime 'Galego' susceptibility to XauC is not known. This study aimed to identify, through next-generation sequencing (NGS), plant differentially expressed transcripts involved in host-pathogen interaction in pathosystems XauC-orange 'Hamlin' (species resistant) and XauC-acid lime 'Galego' (species susceptible). Leaves from 'Hamlin' and acid lime 'Galego' were inoculated with XauC suspension at a concentration of 106 cfu/mL (experimental) or sterile water (control) and collected at 5 and 7 days after inoculation (dai). Total RNA was extracted and used for transcriptome analysis by RNA-seq. The transcripts obtained from sequencing were normalized and redundancies removed. A single bank of genomic data and citrus transcripts was assembled, which was called CitSeqDB and is the junction of 6 public banks: AFFYM, NCBI Unigene, USDA, CITRUSGDB and PHYTOZOME. Transcripts that proved to be differentially expressed relative to controls were confronted with the bank and functional annotation was performed using ... / Doutor

Orientador: Jesus Aparecido Ferro / Banca: Tiago Santana Balbuena / Banca: Fabrício José Jaciani / Banca: Flávia Maria de Souza Carvalho / Banca: Henrique Ferreira / Resumo: A bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) é o agente causal do cancro cítrico, doença ainda sem método curativo que gera grande impacto econômico na produção de laranja. Estudos moleculares envolvendo patossistemas, como o Xac-citros, vêm ganhando espaço no auxílio do entendimento sobre os processos fitopatogênicos. Diante disto, o objetivo do presente trabalho foi investigar a expressão dos genes exsF e exsG de Xac e o efeito dos seus nocautes na patogenicidade de Xac em limoeiro cravo (Citrus limonia Osbeck), bem como obter as proteínas por eles codificadas e utilizá-las em ensaios iniciais de cristalização. Na análise da expressão destes genes, foi utilizada a técnica de PCR em tempo real (qRT-PCR), onde foi avaliada a expressão dos mesmos em Xac inoculada em folhas de limoeiro cravo coletadas em três tempos após a inoculação (48, 72 e 120 h) comparada com a expressão em Xac inoculada em meio de cultura. Já para a produção do mutante duplo de Xac apresentando os genes exsF e exsG nocauteados, foi utilizada a técnica de mutação sítio-dirigida por PCR utilizando o vetor suicida pOK1 e a estratégia de troca alélica. Para a produção das proteínas ExsF e ExsG recombinantes foi utilizada a expressão heteróloga em E. coli através do uso do vetor de expressão pET SUMO e os ensaios iniciais de cristalização foram realizados utilizando-se kits comerciais e não comerciais. A análise da expressão dos genes exsF e exsG revelou que estes foram induzidos, cerca de 10 vezes mais, após 72 horas de infecção da Xac em folhas de limoeiro cravo, em comparação com a Xac multiplicada em meio de cultura. Os ensaios de patogenicidade utilizando o mutante duplo de Xac Δ3135/3136 revelaram que este foi avirulento em folhas de limoeiro cravo, em contraste com a linhagem 306 selvagem, que elicitou os sintomas de cancro cítrico. Além disso, a mutação reduziu a capacidade de multiplicação... / Abstract: The Gram-negative bacterium Xanthomonas citri subsp. citri (Xac) is the causal agent of citrus canker, disease that causes a significant economic impact on the orange production. Molecular studies involving pathosystems like Xac-citrus have been used to as an approach to understand the pathogenic processes. Therewith, the objective of this study was to investigate the expression of exsF and exsG Xac genes and the effect of its silencing in Xac pathogenicity in Rangpur lime (Citrus limonia Osbeck) leaves and also get the proteins coded by them and use it in initial tests of crystallization. The real-time PCR (qRT-PCR) technique was used in the analysis of gene expression.The in planta expression of exsF and exsG genes were evaluated in Xac isolated from Rangpur lime leaves collected at 48, 72 and 120 h after inoculation compared to Xac growing in NA culture. For the production of Xac double mutant having the ExsF and exsG genes silenced, the site-directed mutagenesis technique by PCR using the suicide vector pOK1 was used. For the production of ExsF and ExsG recombinant proteins, the E. coli heterologous expression in the pET SUMO expression vector was used. Finally, the initial crystallization trials were performed using commercial and non-commercial kits. The gene expression analysis showed that the exsF and exsG genes were induced about 10-fold more after 72 hours of Xac infection in Rangpur lime leaves, compared with the Xac grown in the culture medium. The functional assays performed with the Xac Δ3135/3136 double mutant showed that it was avirulent on Rangpur lime leaves, in contrast to the wild type strain Xac 306. Moreover, the mutation reduced the multiplication of the bacteria in planta. The mutation also affected the biofilm production, that was reduced in the mutated strain. Through the heterologous expression assays and protein purification it was possible to obtain only the ExsG protein, soluble and pure enough to be ... / Doutor

Orientador: Antonio Batista Filho / Banca: Lucas Detogni Simi / Banca: Dinalva Alves Mochi / Banca: Regiane Cristina Oliveira de Freitas Bueno / Banca: Edson Luiz Lopes Baldin / Resumo: Em 2004 foi relatada, nos pomares cítricos do estado de São Paulo, a presença do Huanglongbing. No Brasil, esta doença é causada pelas bactérias Candidatus Liberibacter asiaticus e Candidatus Liberibacter americanus, que são transmitidas pelo psílideo-dos-citros Diaphorina citri. A principal forma de controlar a doença é através do controle do inseto vetor, atualmente realizada com o uso de produtos fitossanitários. A mortalidade de adultos do psilídeo por fungos entomopatogênicos tem sido observada em campo, e alguns estudos estão sendo desenvolvidos, há pouca informação na literatura sobre o 2 efeito desses patógenos no controle microbiano do inseto vetor. Dessa forma, o presente estudo avaliou a patogenicidade de 20 isolados de fungos entomopatogênicos sobre adultos e ninfas de D. citri em condições de laboratório e semi-campo, bem como a sua compatibilidade com produtos fitossanitários, de diferentes grupos, utilizados na citricultura. Ninfas e adultos de D. citri, provenientes de criação em laboratório, foram expostas à uma concentração de 6,7x107 conídios/mL, avaliando a mortalidade desses insetos. Através dessa mortalidade foi determinado o tempo letal médio para 8 isolados, com maior porcentagem de mortalidade confirmada. A compatibilidade em laboratório foi observada adicionando os produtos químicos ao meio de cultura BDA, foi inoculado com o fungo em três pontos equidistantes da placa de Petri, a qual foi mantida em câmara climatizada tipo BOD por u... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: In 2004 it has been reported the presence of HLB, also known as "greening", in citrus orchards at São Paulo state. In Brazil, this disease is caused by bacteria Candidatus Liberibacter asiaticus and Candidatus Liberibacter americanus, which are transmitted by the psyllid-of-citrus Diaphorina citri. The main way to control the disease is through the control of the insect vector, which is currently carried out using chemicals. The mortality of psyllid adults by entomopathogenic fungi have been observed in the field and studies are being developed, but little is known about the effect of these pathogens in the insect vector control. Thus, we performed a study to determine the pathogenicity of entomopathogenic fungi on adults and nymphs of D. citri in laboratory and semi-field as well as its compatibility with pesticides used in citriculture. Laboratory created nymphs and adults of D. citri were exposed to a constant concentration of the pathogen 6,7x107 conidia/ml and it was observed the mortality of these insects. Through this mortality it was determined the median lethal time for 8 isolates, confirmed with the best mortality percentage. Laboratory compatibility was observed by incorporating chemicals to PDA culture medium which, after solidification, were inoculated with the fungus at three equidistant points of the Petri dish, which was kept in BOD chamber for a period of seven days. After this period, its vegetative growth, sporulation, viability of the pathogen has been eva... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Orientador: Antonio Batista Filho / Banca: Luis Garrigós Leite / Banca: Carlos Gilberto Raetano / Banca: Eduardo Marcondes de Almeida / Banca: Adalton Raga / Resumo: A mosca-negra-dos-citros constitui-se uma ameaça à fruticultura, por ser uma praga com grande potencial de dano econômico. O objetivo deste trabalho foi avaliar a patogenicidade e virulência de isolados de fungos entomopatogênicos sobre a mosca-negra-dos-citros, Aleurocanthus woglumi (Hemiptera: Aleyrodidae) em condições de laboratório, e o efeito de diferentes produtos fitossanitários sobre o desenvolvimento do fungo Purpureocillium lilacinum in vitro e semicampo. No teste de patogenicidade, foram utilizadas dez ninfas de segundo e terceiro ínstares de Aleurocanthus woglumi e os fungos Beauveria bassiana, Metarhizium anisopliae, Lecanicillium muscarium, Fusarium proliferatum e Purpureocillium lilacinum. Para determinação da concentração letal 50 (CL50) e do tempo letal médio 50 (TL50) foi escolhido o fungo P. lilacinum, sendo cada tratamento representado por uma concentração 1 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 1 x 108 e 5 x 108 conídios/mL. Nos testes de compatibilidade de agrotóxicos sobre o fungo P. lilacinum, foram testados os produtos Ampligo® (clorantraniliprole + lambda-cialotrina), Kohinor 200 SC® (imidacloprido), Provado 200 SC® (imidacloprido), Recop® (oxicloreto de cobre), Iharol® (óleo mineral), Talstar 100 EC® (bifentrina), Stimulate® (ácido 4-indol-3-ilbutírico + ácido giberélico + cinetina) e Neenmax® (azadiractina), nas doses recomendadas para campo. No experimento em casa de vegetação, mudas de limão Cravo foram pulverizadas com os produtos e o patógeno P. lilacinum (4,76 x 107 conídios/mL) de três formas diferentes, primeiramente os agrotóxicos e depois o fungo; primeiro o fungo e posteriormente o agrotóxico e os dois simultaneamente. As mudas foram mantidas em estufa telada, e, após as pulverizações, 24, 48 e 72 horas, foi feita a contagem de colônias para determinar o número de unidades formadoras de colônia (UFC). Em relação aos ... / Abstract:Citrus blackfly is a threat to fruit, to be a plague with great potential for economic damage. The objective this study was to evaluate the pathogenicity and virulence of entomopathogenic fungi on citrus blackfly, Aleurocanthus woglumi (Hemiptera: Aleyrodidae) under laboratory conditions, and effect of different pesticides on the development of fungus Purpureocillium lilacinum in vitro and greenhouse. In pathogenicity test were used ten nymphs second and third instars of Aleurocanthus woglumi and fungi Beauveria bassiana, Metarhizium anisopliae, Lecanicillium muscarium, Fusarium proliferatum and Purpureocillium lilacinum. To determine the lethal concentration 50 (CL50) and median lethal time 50 (TL50) the fungus P. lilacinum was chosen, each treatment represented by a concentration 1 x 106, 5 x 106, 1 x 107, 5 x 107, 1 x 108 and 5 x 108 conidia/mL. In compatibility tests the fungus P. lilacinum were tested products, Ampligo® (clorantraniliprole + lambda-cyhalothrin), Kohinor® (imidacloprid), Provado® (imidacloprid), Recop® (copper oxychloride), Iharol® (oil mineral), Talstar® (biphenthrin), Stimulate® (indole butyric acid + gibberellic acid + kinetin) e Neenmax® (azadirachtin), the recommended dose for field. The experiment in greenhouse, rangpur lemon seedlings were sprayed with the products and the pathogen P. lilacinum (4,76 x 107 conidia/mL) in three different ways, first the pesticide and then the fungus; first the fungus and then the pesticide and the two simultaneously. Seedlings were kept in screened greenhouse, and after spraying, 24, 48 and 72 hours, the colony count was done to determine the number of colony forming units (CFU). With respect to pathogenicity and virulence tests, it was concluded that the isolates of B. bassiana, M. anisopliae, L. muscarium, F. proliferatum and P. lilacinum were pathogenic to nymphs of A. woglumi and the evaluated concentrations of the ... / Doutor

Orientador: Henrique Ferreira / Resumo: A citricultura constitui uma importante atividade econômica no país, com o Brasil sendo o maior produtor de laranja doce no mundo. A produção é ameaçada pelo cancro cítrico asiático, uma doença severa que traz grande prejuízo e leva a necessidade do controle de seu agente causador, a bactéria Gram-negativa Xanthomonas citri subsp. citri (Xac). Atualmente não há nenhuma medida curativa para os pomares e a opção é o manejo integrado para evitar o avanço da doença. O único controle químico utilizado no presente é a aplicação de compostos a base de cobre, os quais trazem riscos de contaminação ao solo e de mananciais de água. Desta forma, estratégias alternativas de controle são essenciais para manter a citricultura brasileira competitiva no mercado. Compostos derivados do metabolismo vegetal tais como os flavonoides, ácido fenólicos e terpenóides são classes de substâncias com um grande potencial antimicrobiano. Nesse contexto, foi avaliada a ação anti-Xac de compostos híbridos de chalcona, ésteres do ácido vanílico e os monoterpenóides Timol e Carvacrol. No caso dos híbridos de pirazinamida-chalconas, não houve atividade antimicrobiana constatada contra Xac. Para os vanilatos, os compostos de cadeia lateral de 5 até 8 carbonos apresentaram ação anti-Xac, com atividade bacteriostática. Timol e Carvacrol mostraram atividade anti-Xac, uma vez que foram bactericidas a 200 μg.mL-1. Estes terpenóides foram avaliados quanto ao seu modo de ação e apresentaram atividade na permeabilizaç... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Citriculture has great importance to Brazil`s economy, with the country occupying the post of the largest sweet orange producer in the world. This production is threatened by Asiatic citrus canker, a crop disease which causes great losses in production and fruit quality. Because of these problems, there is a need to manage its causal agent – the Gram-negative bacteria Xanthomonas citri subps. citri (Xac). Nowadays there are no curative measure to surpass the disease in the orchards and the only option is the integrated management to avoid its spread. The only chemical control used in this strategy is based on copper, which is associated with soil and water springs contamination. For that reason, new alternative control strategies become essential to maintain the Brazilian citriculture competitive in the market. Compounds derived from plants metabolism such as flavonoids, phenolic acids and terpenoids are interesting substances with antimicrobial proprieties. In this context, we evaluated the anti-Xac action of hybrid chalcone compounds, vanillic acid esters and monoterpenoids (Thymol and Carvacrol). The pyrazinamide-chalcone hybrids showed no antimicrobial activity against Xac. In the case of the vanillic acid esters, synthetic compounds with a side chain structure composed of 5 to 8 carbons presented an bacteriostatic anti-Xac activity. Compounds Thymol and Carvacrol also showed anti-Xac action, once this compounds were bactericidal at 200 μg.mL-1. These terpenoids were eval... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre