Orientador: João Lucio de Azevedo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-25T15:34:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Martens_IngridSchmidt-Hebbel_D.pdf: 7343296 bytes, checksum: 4ce47b2ce62b55b5bca6954dc4e9d09c (MD5) Previous issue date: 1999 / Doutorado

Orientador : Nelson Eduardo Duran Caballero / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-14T00:39:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MachucaHerrera_AngelaElena_M.pdf: 4768752 bytes, checksum: bbfe2e28c845d51b2f793118e54a226e (MD5) Previous issue date: 1991 / Resumo: A cepa brasileira de Thermoascus aurantiacus,. um fungo termófilo. foi estudada quanto as condiçeies de crescimento. produção de enzimas e ação sobre materiais lignocelulósicos. O fungo mostrou capacidade para crescer em meios de cul tivo que continham materiais lignocelulósicos como bagaço de cana, casca de arroz e serragem de Eucaliptus grandis. como únicas fontes de carbono. O crescimento do fungo nestes substratos foi melhor do que em substratos celulósicos. As condições ótimas de crescimento do fungo foram determinadas através de métodos estatisticos de otimização. As condiçõs ótimas obtidas em meio Czapek modificado foram: 0.8% (8.0 g/l) de glicose como fonte de carbono, 37.8 mEq/l (3.2 g/l) de NaN03 como fonte de nitrogênio em pH 6,0 a 48C. Nestas condições o fungo alcançou uma velocidade máxima de crescimento ae 4.74 -0.02 (mm/h). Um teor de 27.4% (p/p) de proteina foi obtida do micélio de Thermoascus aurantiacus aos 10 dias de crescimento em meio contendo 1,5% de glicose sob condições estacionárias. A proteina micelial foi hidrolisada e sua composição em aminoácidos foi determinada. A qualidade da proteina de T.aurantiacus é semelhante à proteína da soja e à sugerida pela FAO. Apresentando uma alta concentração de aminoácidos essenciais Na cultura contendo 1,5% de glicose, sob condições estacionárias e de agitação foi detectada a presença de etanol e metanol provavelmente produtos da fermentação de glicose pelo fungo. O fungo produzi enzimas celuloliti cas, hemiceluloliticas e ligninoliticas em maior ou menor quantidade, quando cultivado em meios que continham diferentes substratos de crescimento. As máximas atividades de endo-glicanase (1.49 UI/ml) e xilanase (1.20 UI/ml), foram obtidas em meio contendo 1.5% de glicose. Os máximos valores foram obtidos quando a glicose alcançou uma concentração de 0.3%. no sexto dia de crescimento. sob condições estacionárias. A atividade celulolitica de Thermoascus aurantiacus foi comparável à do fungo Trichoderma reesei (cepa selvagem), o fungo apresentou, atividade enzimática capaz de descolorir Remazol brilliant blue R. sendo que a máxima descoloração ocorreu quando foram adicionados ao meio 1.5% de glicose e 0.5% de serragem de Eucaliptus grandis, simultaneamente. Uma ligeira descoloração ocorreu quando o meio continha somente glicose. Uma alta atividade fenol oxidase foi obtida quando o fungo foi culivado em meio que continha 1,5% de serragem de Eucaliptus grandis e 0,5% de glicose. Nenhuma atividade foi obtida utilizou-se apenas glicose como fonte de carbono. Foi estudada a biodegradação dos componentes da madeira de Eucaliptus grandis (serragem e cavacos) . Após 21 dias de tratamento da madeira com Thermoascus aurantiacus, sob condições estacionárias e 50°C. obteve-se uma perda de peso de 6,7% para serragem e de 6,2% para cavacos, em cultura contendo 0.5% de glicose. Em ambos os casos (serragem e cavacos), o fungo atacou, principalmente, os componentes extraiveis em etanol/benzeno, provovando uma perda em peso de 64.4% na serragem e 59.0% nos cavacos / Abstract: Growth conditions, enzime production and lignocellulosic materials degradation by Brazilian strain of Thermoascus aurantiacus, were studied. The fungus showed ability to grow on lignocellulosic materials such as sugar cane bagasse, rice hull and Eucaliptus grandis sawdust, as single carbon sources. Growth of the fungus in these subtrates was better than cellulosic one. Statistical methods were applied for optimization of the growth conditions in Czapek-glucose (0,8%) modified medium in ph 6.0 at 48 degree degree and a NaN09 concentration of 37.8 mEq/1 (3.2 g/1) were observed. The growth rate value obtained in these conditions was 4.74 +- 0.02mm/h. Cultures of Thermoascus aurantiacus using glucose (1.50%) showed a 27.4% (w/w) of mycelila protein after 10 days incubation. Mycelial protein showed essential amino acids content similar to soybean protein and FAO standard requirements. Ethanol and methanol were detected in the extracellular medium of Thermoascus aurantiacus agitated as well as in stationary cultures using glucose 1.5%. Cellulolytic, hemicellilolytic and ligninolytic activities were produced when the fungus grown on a variety of substrates High endo-glucanase (1.49 UI/ml) and xylanase (1.20 UI/ml) activities were detected on glucose 1.5%. A higher enzyme activity was reached when the glucose concentration was reduced to 0.3% (sixth day) Thermoascus aurantiacus exhibits cellulolytic similar to Trichoderma reesei (wild strain). The higher decoloriation of Remazol brilliant blue (RBB-R) by cultures of Thermoascus aurantiacus in the presence of glucose (0.5% ) and Eucaliptus grandis sawdust (1.5%) simultaneously was observed. A light decolorization was observed when glucose was used as single carbon source. High phenol-oxidase activirty was reached when the fungal growth was on Eucaliptus grandis sawdust (1.5%) plus glucose (0.5%). No phenol-oxidase activity was observed when glucose was used as single carbon source. Sawdust and chips of Eucaliptus grandis biodegradation was studied. Growth of Theromoascus aurantiacus on Eucaliptus grandis resulted in a weight loss of 6.7% and 6.2%, for sawdust and chips respectively after 21 days of incubation at 50 degree on glucose 0.5% Fungal attack was more efficient on the extractives than other wood components. An extractive loss of 64.4% in sawdust and 59.0% in chips was obtained. / Mestrado / Bioquimica / Mestre em Ciências Biológicas

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9605_1.pdf: 412573 bytes, checksum: 422dbdb03973f6f3d662a1a50c3e02cb (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2012 / A ação conservante de óleos essenciais de especiarias em alimentos tem se destacado como alternativa natural para a substituição de aditivos químicos. Objetivou-se avaliar a efetividade dos óleos essenciais de plantas em diferentes concentrações em inibir o crescimento de fungos (Aspergillus flavus- 4540; Fusarium moniliforme- 4542; Penicillium vaiabil- 4534; Penicillium funiculosum- 4511; Penicillium pinhophill- 4546) in vitro e incidência de Aspergillus flavus em milho (Zea mays L). As técnicas adotadas foram: determinação das atividades antifúngicas em discos de papel de filtro em meio sólido, determinação da Concentração Inibitória Mínima- CIM e Concentração Fungicida Mínima- CFM através da técnica de diluição em caldo bem como do crescimento micelial radial em Agar e a visualização do efeito do óleo essencial de orégano na morfologia de A. flavus através da microscopia óptica e eletrônica. Sementes de milho previamente desinfetadas foram tratadas com diferentes concentrações dos óleos essenciais e inoculadas com A. flavus, sendo avaliadas quanto à incidência do fungo e percentual de germinação de sementes, de acordo com o Regulamento de Análise de Sementes- RAS (2009). Os resultados demonstraram que as cepas foram mais sensíveis aos óleos essenciais de orégano, cravo e canela. A CIM variou de 0,06-2,0 μL. mL -1 e a CFM variou de 0,12- 4,0 μL. mL -1, de acordo com o fungo e o óleo em estudo. O óleo essencial de orégano retardou o crescimento micelial radial até o 8º dia. Os óleos de cravo e canela tiveram menor eficiência, apresentando o crescimento dos fungos a partir do 2º dia. As principais alterações morfológicas do A. flavus foram hifas curtas, largas e deformadas apresentando dilatações ao longo de sua estrutura, bem como a formação de clamidósporos. Na Microscopia Eletrônica de Varredura, o efeito mais drástico foi observado com 0,12 μL.mL-1 do óleo de orégano, o qual inibiu o processo de germinação, verificando-se esporos sem germinar ou apresentando apenas os tubos germinativos. Na germinação de sementes de milho, observou-se que o tratamento com óleo de orégano apresentou 94,9% de germinação, não diferindo dos controles (p>0,05). Já com os óleos de cravo e canela apresentaram uma redução acima de 25% do percentual de germinação, quando comparado com os demais tratamentos. Em sementes de milho, o A. flavus se mostrou mais sensível quando em contato com o óleo essencial de orégano, onde se utilizou concentrações bem inferiores (0,12-1,0 μL.mL-1) aos dos óleos de canela e cravo (2,0-16,0 μL.mL-1). Conclui-se que o óleo essencial de orégano exerce significante efeito fungicida, sendo mais eficiente na inibição do crescimento fúngico in vitro e em milho, podendo ser usado racionalmente na conservação de alimentos

Made available in DSpace on 2014-06-12T23:15:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9046_1.pdf: 688167 bytes, checksum: 9e852eb8e43d4826e028b767d621ae8f (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2004 / Os fungos micorrízicos arbusculares (FMA) são componentes importantes dos ecossistemas, pois eles associam-se a plantas e incrementam a absorção de fósforo, sendo importante estudar os efeitos da conversão de áreas nativas em pastagem ou cultivo sobre os FMA em áreas de Caatinga e de Mata Atlântica de Altitude, e avaliar a capacidade de plantas micorrizadas em absorver P de solos com crescente capacidade de fixação de P ou em situação de competição com biota heterotrófica pelo P do solo. No estudo realizado em áreas nativas de caatinga convertidas em pastagem ou cultivo, com declínio na fertilidade do solo e sinais de erosão, o objetivo foi investigar o efeito da mudança no uso destas áreas sobre a qualidade e a quantidade de propágulos de FMA. Amostras de solo tinham sido retiradas de 10 locais contendo áreas de caatinga adjacentes a áreas sob cultivo ou pastagem, nas profundidades 0-7,5 e 7,5-15 cm, ao longo de transeções com quatro pontos de amostragem (10 locais × 2 situações de uso × 2 profundidades × 4 pontos amostrais). A intensidade de uso e da erosão do solo foram usadas para agrupar as áreas nas categorias: Caatinga preservada (CaatP), Caatinga raleada (CaatR), Cultivada preservada (CultP) e Cultivada degradada (CultD). O solo foi analisado quanto à disponibilidade de P e a quantidade de esporos de FMA viáveis, usando cloreto de iodonitrotetrazólio (INT), e dos não viáveis. As raízes finas foram catadas, coloridas com azul de tripan e analisadas a colonização por FMA. O número de esporos viáveis e não viáveis nas áreas de estudo foi maior na profundidade 0-7,5 cm que na 7,5-15 cm. A densidade de esporos viáveis nas amostras variou de 1,4 a 6,8 esporos/50 g de solo e a de esporos não viáveis de 91 a 226 esporos/50 g de solo. A mudança intensidade do uso do solo teve pouco efeito sobre o número de esporos viáveis, enquanto o aumento da profundidade promoveu diminuição no número de esporos. A colonização dar raízes por FMA nas áreas cultivadas com concentrações de P-resina < 1 mg Kg-1 foram menores que em áreas com teores >1 mg Kg-1, na profundidade 0-7,5 cm, o que talvez indique uma concentração crítica de P no solo para viabilizar a simbiose. Para estudar o efeito da conversão de uma área de Mata Atlântica de Altitude em pastagem (Brachiaria decumbens Stapf) e em reflorestamento com sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth) sobre a diversidade de espécies e os propágulos de FMA foram retiradas sete amostras de solo (pseudorepetições), da camada de 0-15 cm de profundidade, totalizando 21 amostras (3 locais com diferentes usos x 7 pontos amostrais). Foi coletado o folhedo que estava sobre a área onde seriam retiradas as amostras de solo. As raízes do solo e folhedo foram preparadas para verificação de colonização por FMA. Esporos de FMA foram extraídos do solo e contados os viáveis (corados por INT), os não viáveis e os mumificados. Nas três áreas foram encontradas 28 espécies de FMA, distribuídas nos gêneros Archaeospora (1), Acaulospora (8), Entrophospora (1), Glomus (14), Gigaspora (1) e Scutellospora (3). A área de pastagem teve 2 maior riqueza de espécies (22 espécies), seguida pela área de sabiá (14) e pela de mata (11). Archaeospora leptoticha, Glomus sp1, G. etunicatum, G. macrocarpum e G. microaggregatum ocorreram em todas as áreas. Nas áreas com mata e com sabiá as espécies Glomus invermaium e G. macrocarpum tiveram maior freqüência, enquanto na pastagem as espécies mais freqüentes foram Entrophospora colombiana, Glomus diaphanum e G. macrocarpum. Na área de mata teve uma espécie de FMA com ocorrência exclusiva, na de sabiá foram duas espécies e na de pastagem foram 11 espécies. As áreas de mata nativa e de reflorestamento com sabiá apresentaram infectividade micorrízica semelhantes, e a grande proporção de raízes colonizadas pareceu ser a fonte principal de propágulos nestes locais. Na área com pastagem a grande quantidade de esporos viáveis pode ser o fator mais importante para a manutenção da infectividade micorrízica. Foi estudado o efeito dos FMA no favorecimento da absorção de fósforo (P) por plantas em solos com capacidade crescente de fixação de P, e também na competição pelo P do solo entre plantas e a biota heterotrófica, ativada pela adição de fontes de carbono. Foram montados dois experimentos, com delineamento ao acaso, em vasos com dois compartimentos concêntricos, o compartimento interno contendo areia lavada e o externo solo marcado com o isótopo radioativo 32P. O compartimento interno dos vasos continha aberturas laterais, nas quais foram coladas telas de nylon: ou com malha 40 &#956;m, que permite a passagem de hifas e não a de raízes, ou malha com 1 mm, pela qual passam hifas e raízes. O arranjo fatorial do primeiro experimento foi de 3 solos (alta, média e baixa fixação de P) × 2 telas (40 &#956;m e 1 mm) × 4 repetições. No segundo experimento o arranjo foi de 2 solos (alta e baixa fixação de P) × 2 fontes de C (celulose e palha) × 2 telas (40 &#956;m e 1 mm) × 3 repetições. No compartimento interno foram colocados esporos de FMA e plântulas de braquiária. Os experimentos tiveram duração de cinco semanas. Avaliou-se a massa seca, o conteúdo de P e a atividade específica do P nas plantas. A massa seca e o conteúdo de P e a atividade específica diminuíram com o aumento da capacidade de fixação de P pelo solo. A variação na atividade específica sugere diferentes níveis de diluição isotópica em cada solo. A contribuição dos FMA para massa seca e conteúdo de P foi maior com o aumento da fixação de P pelo solo. A adição de fontes de carbono ao solo com baixa fixação de P produziu diminuição na massa seca e no conteúdo de P nas plantas. A celulose teve efeito mais depressivo que a palha. A variação na atividade específica indicou que o P disponível para as plantas foi de distintas origens no tratamento com palha e celulose. No solo de alta fixação, a adição de celulose produziu diminuição de massa seca, conteúdo de P e atividade específica, independentemente da malha. Os maiores valores de atividade específica encontrados nas plantas com acesso livre ao solo (malha 1 mm) podem se dever à exploração mais imediata do solo que as plantas com acesso restrito (40 &#956;m)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biologia de Fungos, Algas e Plantas, Florianópolis, 2016. / Made available in DSpace on 2016-09-20T04:06:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 341623.pdf: 9150275 bytes, checksum: ba095a08ddfda26e42f11f0b242bd56d (MD5) Previous issue date: 2016 / Fomitiporia é um gênero de Hymenochaetaceae caracterizado por apresentar espécies com basidiomas perenes, pileados a ressupinados, basidiósporos hialinos e dextrinoides, sistema hifal dimítico e presença de setas himeniais em algumas espécies. Em Fomitiporia, conceitos morfológicos de espécie relativamente amplos foram empregados tradicionalmente, fazendo com que vários táxons fossem sinonimizados, o que, combinado com uma baixa variação morfológica entre algumas espécies, levou ao que hoje conhecemos por complexos taxonômicos. Porém, muitas hipóteses de sinonímia estão aos poucos sendo reavaliadas, através de estudos morfológicos detalhados e moleculares levados a cabo recentemente. Por consequência, uma desconhecida diversidade representada por diferentes linhagens, e em alguns casos com relações de especificidade com hospedeiros em particular, vem sendo revelada. No Brasil, F. robusta e, principalmente, F. apiahyna, são dois nomes frequentemente empregados para espécimes pileados. Fomitiporia robusta s.s. tem ocorrência restrita à Europa. Já F. apiahyna, descrita a partir de um espécime coletado em Apiaí-SP, apresenta uma distribuição geográfica ampla, com ocorrências registradas do sul da Flórida ao norte da Argentina, sendo considerada como um complexo de espécies crípticas. Ainda, há espécies pileadas de Fomitiporia ocorrentes em áreas pouco exploradas, que devem ser estudadas e possivelmente nomeadas, já que sua morfologia não está relacionada com a dos complexos citados. Com o intuito de reconhecer a diversidade de espécies pileadas de Fomitiporia que ocorrem em áreas ainda pouco exploradas no Brasil, foram realizadas coletas no Cerrado, Mata Atlântica e Amazônia, além de revisão de coleções de herbário, totalizando 79 espécimes estudados. Análises morfológicas detalhadas e filogenéticas (moleculares: nrITS, nrLSU, tef1-a e rpb2) foram realizadas a partir dos espécimes estudados. A topologia previamente apresentada, acerca de F. apiahyna s.l., foi da mesma forma apresentada em nossas análises filogenéticas moleculares. Além destas, no clado F. apiahyna s.l., outras três linhagens de coletas realizadas na Mata Atlântica foram apresentadas. Uma delas, Fomitiporia sp. 2 é descrita como nova (F. drimydophila ad int.) a partir de espécimes coletados parasitando Drimys angustifolia em Matas Nebulares na Serra Geral. Ainda, na linhagem Neotropical do gênero, outras seis linhagens foram encontradas. Duas delas, Fomitiporia sp. 4 e sp. 5, com morfologia particular não correspondendo a nenhum complexo taxonômico, são descritas como novas (F. subtilissima e F. atlantica), a partir de espécimes pileados, encontrados em um fragmento urbano de Mata Atlântica. As outras espécies são representadas por espécimes pileados coletados na Mata Atlântica (sp. 6 e sp. 7), no Cerrado (sp. 9) e Amazônia (sp. 10). Fomitiporia sp. 9 e sp. 10 ficaram posicionadas em um clado junto de espécies ressupinadas do gênero. Fomitiporia sp. 7 e sp. 9, mesmo apresentando morfologia correspondente ao complexo morfológico F. apihayna, não são relacionadas ao clado F. apiahyna s.l. Ainda, Fomitiporia sp. 7 apresenta macromorfologia detalhada que corresponde ao tipo de Phellinus elegans, sinônimo de F. apiahyna. Por fim, as análises filogenéticas apresentam uma diversidade antes não conhecida, sendo até mesmo, encontradas coexistindo (F. apiahyna sensu Amalfi & Decock, F. atlantica, F. subtilissima e Fomitiporia sp. 7) em fragmentos de mata até então não explorados. Essas linhagens distintas merecem ser estudadas e reconhecidas, quanto à sua delimitação e relações filogenéticas.<br> / Abstract : Fomitiporia is a poroid Hymenochaetaceae genus that includes species with perennial, pileate to resupinate basidiomata, hyaline and dextrinoid basidiospores, dimitic hyphal system, and hymenial setae present in some species. The slightly morphological variations between Fomitiporia species, the wide morphological concepts used in the classification, and the vast geographical distribution, resulted in many species complex within the genus. In previous taxonomic studies using accurate morphological and molecular data the synonymy hypothesis of some Fomitiporia species complex are gradually being re-evaluated. Therefore, an unknown high diversity has been revealed, represented by distinct lineages, occasionally with particular host specificity relationships. In Brazil, F. robusta and F. apiahyna are two names frequently applied to pileate Fomitiporia specimens. However, F. robusta sensu stricto is exclusively from Europe. On the other hand, F. apiahyna was described from Apiaí-SP specimen. Currently, F. apiahyna has wide-ranging geographic distribution, from southern Florida to northeastern Argentina, comprising a cryptic species complex. In order to recognize pileate Fomitiporia species diversity occurring in Brazil we performed morphological, molecular phylogenetic (nrITS, nrLSU, tef1-a e rpb2) and ecological studies. In total, we analyzed 79 specimens from collects from Mato Grosso Cerrado, Santa Catarina and São Paulo Atlantic forest and Mato Grosso and Amazonas Amazonia, besides of herbaria specimens. Previous lineages from F. apiahyna s.l. were recovered in our analyses. In addition, three more lineages from Atlantic forest were recovered too. One of them, Fomitiporia sp. 2, is described as new species (F. drimydophila ad int.) from specimens growing on Drimys angustifolia trees from Cloud forest. Others six lineages were recovered in Neotropical clade. Two of them, Fomitiporia sp. 4 e Fomitiporia sp. 5 are described as new species (F. subtilissima e F. atlantica) from pileate specimens from Atlantic forest urban fragment; both, morphologically does not seem to be none taxonomic complex. The leftover are pileate specimens from Atlantic forest (sp. 6 e sp. 7), from Cerrado (sp. 9) and from Amazonia (sp. 10). Fomitiporia sp. 9 and sp. 10 form a clade within resupinate Neotropical lineage. Fomitiporia sp. 7 and sp. 9, even with morphology corresponding to the F. apiahyna morphological complex, they are not related to F. apiahyna s.l. clade. Fomitiporia sp. 7 has macro morphology that corresponds to Phellinus elegans type; a synonym of F. apiahyna. Finally, considering these results, it is clear that there is a high unknown diversity within pileate Fomitiporia specimens from Neotropics, which could be to reveal only with an integrative approach using molecular, morphological and ecological data.

Orientador: Maria Ligia Rodrigues Macedo / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T15:28:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Freire_MariadasGracasMachado_D.pdf: 9297117 bytes, checksum: 049cc272bcd152bc866cfe89d28224f4 (MD5) Previous issue date: 2003 / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Biologia Funcional e Molecular

Submitted by Isaac Francisco de Souza Dias (isaac.souzadias@ufpe.br) on 2016-04-15T18:42:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE Marcos Mateus Barros Barbosa.pdf: 7286701 bytes, checksum: 81244550c09ab3a4c3d0cc4a9b0df8db (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-15T18:42:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE Marcos Mateus Barros Barbosa.pdf: 7286701 bytes, checksum: 81244550c09ab3a4c3d0cc4a9b0df8db (MD5) Previous issue date: 2015-03-03 / CNPQ / Os fungos gasteroides são um grupo artificial pertencente ao filo Basidiomycota caracterizados, principalmente, pelo desenvolvimento angiocárpico do basidioma e liberação passiva dos esporos. Seus principais representantes são as bufas-de-lobo, bufas-de-lobo-estipitadas, estrelas-da-terra, fungos ninhos de passarinhos, tentáculos fedorentos e fungos clatrados. Desde o seu estabelecimento em 1821, a classe foi pontualmente estudada resultando em diversas classificações sempre tentando atingir ao máximo uma construção natural do grupo; algo nunca conseguido devido à alta polifilia dos Gasteromycetes. Com o objetivo de conhecer melhor a micobiota gasteroide e suas relações filogenéticas foram efetuadas coletas no período de 2011 a 2014 na Floresta Nacional do Araripe, no Estado do Ceará. Posteriormente, os fungos foram desidratados e, após as análises, incorporado ao acervo do herbário. Para as análises macroscópicas e microscópicas, todas as estruturas de importância taxonômica foram descritas e medidas de acordo com a literatura especializada e, posteriormente, ilustradas. A extração de DNA foi realizada com base no protocolo tradicional com uso do nitrogênio líquido e tampão CTAB. As amplificações tiveram como alvo as regiões genômicas do DNA ribossomal ITS e LSU e do DNA mitocondrial ATP6. Como resultados foram obtidas 146 amostras totalizando 41 espécies (tendo como gêneros mais representativo Cyathus e Geastrum) com base em análises de dados morfológicos e/ou filogenéticos. Do total de espécies registradas nesta tese, treze consistem em novos registros para a ciência (9 de Cyathus, 1 de Morganella, 1 de Bovista, 1 de Geastrum e 1 de Calvatia); um novo registro para a América do Sul (Morganella subincarnata). Além do registro de novas espécies de Cyathus, uma atualização da sua classificação infragenérica do gênero foi estudada. O presente trabalho trouxe uma contribuição importante para o conhecimento da micobiota cearense, a qual vários novos registros além de novas espécies foram aqui propostos. / The gasteroid fungi are an artificial group belong to the Basidiomycota phylum that are characterized, mainly, by an angicocarpic development of fruting body and passive spore dispersion. It’s main representatives are the puffballs, stalked-puffballs, earthstars, bird’s nest fungi, stink horns and cage fungi. Since it’s establishment in 1821, the class was occasionally studied resulting in many classifications always trying hard to achieve a more natural classification; something that was never reached due to the high polyphyly of Gasteromycetes. With the aim of better understand the gasteroid mycobiota and it’s phylogenetic relationships were carried out expeditions in the period of 2011 to 2014 at Nationa Forest of Araripe, in the state of Ceará. Then, the samples were dehydrated and, after the analysis, incorporated into the herbarium collection. To the macroscopic and microscopic analysis, every structure of taxnomic importance were described and measured according to specialized literatura and, then, illustrated. DNA extractionwas perfomed with base on traditional protocol with use of liquid nitrogen and CTAB buffer. The amplification have targeted the genomic regions of ribossomal DNA ITS and LSU and mitocondrial DNA ATP6. As results were obtained 146 samples totaling 41 species (being the genera more representatives Cyathus and Geastrum) with base in analysis of morphological and/or phylogenetic data. Of the total species recoreded in this doctoral thesis, thirteen represent new records to science (9 of Cyathus, 1 of Morganella, 1 of Bovista, 1 of Geastrum and 1 of Calvatia); a new record to South America (Morganella subincarnata). Beyond the records of new species of Cyathus, an update of its infrageneric classification was studied. This work brought an importante contribution to the knowledge of cearense mycobiota, which several new records and new species were proposed.

Orientador: Hiroshi Aoyama / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T18:24:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MachucaHerrera_AngelaElena_D.pdf: 8160555 bytes, checksum: a51de738a15ce680819592e7da08a4a0 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: No presente trabalho estudou-se a produção de extratos com atividade fenoloxidásica (FOx) pelo fungo termófilo lhermoasclls aurantiacus. Foram determinadas as melhores condições de cultivo para produção da atividade FOx em meio líquido. A adição de substratos polissacarídicos induziu altos teores de atividade, quando comparado com cultura contendo somente glicose. Farelo de trigo foi o melhor substrato, e em concentração de 1,5% (m/v) induziu níveis entre 1 a 2 UI/mL de atividade. O tipo e tamanho do inóculo afetaram significativamente a produção de atividade, porém a agitação e a oxigenação das culturas não tiveram efeitos significativos. Um pH inicial do meio de cultura entre 6 e 8 favoreceu a produção de atividade FOx. Quando substratos polissacarídicos foram adicionados à cultura, diversas atividades enzimáticas relacionadas à degradação de lignina, em menor ou maior grau, foram detectadas: lacase, peroxidase, manganês-peroxidase, celobiose-quinona oxidoreductase e álcool veratrílico-oxidase. Nas mesmas condições não foi detectada atividade lignina-peroxidase. Após estabelecer as melhores condições para produção de atividade FOx pelo Taurantiacus, foram produzidos extratos com alta atividade para estudos de caracterização cinética. A atividade FOx presente no extrato bruto apresentou características semelhantes às fenoloxidases do tipo lacase. O extrato bruto oxidou uma variedade de substratos típicos de fenoloxidases, na ausência de H202. As maiores atividades foram alcançadas com ácido 2,2'azino-bis-(3 etil benzotiazolina-6-sulfónico) (ABTS), 2,6-dimetóxifenol (2,6-DMF) e odianisidina. Azida sódica e ácido tioglicólico foram os mais potentes inibidores da reação de oxidação catalizada pelo extrato bruto, ambos típicos inibidores de oxidases que contêm metal. O pH ótimo da reação de oxidação de o-dianisidina foi de 2,8, porém a estabilidade neste pH foi rapidamente perdida após 5 horas de incubação. A temperatura ótima de reação foi observada entre 70 e 80°C, e a estabilidade térmica do extrato bruto foi extremamente elevada, conservando mais de 50% da atividade após 5 horas de incubação à 100°C. Todas as características apresentadas pelo extrato bruto foram semelhantes às da maioria das fenoloxidases de tipo lacase, exceto a elevada temperatura ótima e termoestabilidade, nunca descritas para fenoloxidases de fungos mesófilos ou termófilos. Na intenção de desvendar a natureza responsável pela atividade FOx, procedeu-se à purificação de uma fração contendo tal atividade, a partir das culturas de Tauralltiacus. O trabalho teve que ser redirecionado devido ao inesperado resultado desta etapa, uma vez que a fração com atividade FOx atravessou uma membrana de ultrafiltração de 1,0 kDa e eluiu de uma coluna de Sephadex G-l0 em um volume correspondente a uma massa molecular £ 700 Da. Este resultado, junto com a elevada estabilidade térmica, descartou a possibilidade da existência de uma lacase ou alguma outra enzima, como responsável pela atividade FOx. A fração com alta atividade FOx (fração FOx), parcialmente purificada por Sephadex G10, foi caracterizada quanto às propriedades cinéticas e estruturais. As propriedades de pH e temperatura ótimos de atividade e estabilidade, foram semelhantes às do extrato bruto. A fração FOx oxidou os mesmos substratos que o extrato bruto, porém com maiores velocidades. Somente o efeito de inibidores foi diferente, observando-se uma diminuição do efeito inibitório em relação ao extrato bruto. A suspeita da presença de um sideróforo (complexante de Fe de baixa massa molecular), responsável pela atividade FOx, presente no extrato bruto e na fração, levou à procura destes compostos nas culturas de T.aurantiacus, utilizando o reagente universal Chromo azurol S (CAS). Através deste método foi possível confirmar a produção de sideróforos pelo fungo, em meio sólido e líquido, sendo que em meio líquido a máxima produção de atividade FOx coincidiu com uma mínima reação CASo Porém, apesar dos resultados positivos em meio de cultura, a fração FOx não reagiu com CASo. A caracterização estrutural da fração FOx revelou uma estrutura tipo hidroxamato com uma massa molecular aproximada de 530 Da, aparentemente sem aminoácidos, e com alguns metais (Ca, Mg, Fe) participando desta estrutura. Todos os resultados de caracterização estrutural sugeriram que o composto responsável pela atividade FOx, era um sideróforo pertencente à classe dos hidroxamatos. Estes resultados e outros preliminares, sugerem um mecanismo de ação para a fração FOx, onde o Fe presente na fração seria o responsável pelo potencial de oxidação de diversos substratos. Resultados preliminares indicam também que o F e participante na reação de oxidação de o-dianisidina é Fe (II). Assim, parece que a fração FOx complexa Fe (III) e, posteriormente, quando necessário esse Fe (III) seria reduzido para Fe (II) pela própria fração. Visando a aplicação biotecnológica dos extratos com alta atividade FOx de T. aurantiacus, estes foram utilizados no tratamento de uma polpa Kraft de Eucalipto e de um efluente, resultante do processo Kraft. Os extratos ativos mostraram-se eficientes no tratamento das polpas, obtendo-se 39% de deslignificação após 60 minutos à 500C e pH 3,0, porém nestas condições uma redução da viscosidade foi observada. A adição de ABTS, como um mediador redox, não aumentou a eficiência de deslignificação observada na sua ausência. Os efluentes, após 72 horas de tratamento com o extrato ativo de J:aurantiacus, à 250C e pH 4,0, apresentaram 60 a 70% de redução de fenóis, dependendo das condições de incubação. Sob condições estacionárias, obteve-se 67% de despolimerização e 5% de mineralização das cloroligninas de elevada massa molecular. Ao mesmo tempo, sob condições agitadas obteve-se 47% de mineralização. A redução da cor variou de 61 a 35%, sob condições agitadas ou estacionárias, respectivamente / Abstract: This work involves the phenoloxidase activity (POx) production by the thermophilic fungus Thermoascus auralltiacus. The best conditions for POx activity production in liquid culture were determined. The addition of lignocellulosic and polyssacharides substrates to culture induced high leveI POx activity. The best substrate was the wheat bran which induced between 1-2 UI/mL, when utilized in concentration of 1.5% (w/v). The type and size of inoculum influenced the activity production, however the agitation and oxygenation of cultures did not affect it significantly. The initial pH between 6-8 supported the higher POx activity production. Different enzymatic activities related to lignin degradation such as laccase, peroxidase, Mn-peroxidase, cellobiose-quinone oxidoreductase and veratryl alcohol oxidase, but no ligninperoxidase, were detected in the cultures containing polyssacharides substrates. After the best conditions to POx activity production by Taurantiacus were established, crude extracts with high POx activity were utilized in the kinetic characterization. The POx activity showed similar characteristics to phenoloxidases laccase type. The crude extracts oxidized various typical substrates of phenoloxidases, in the absence of H202. The higher activities were produced with ABTS, 2,6-DMP and o-dianisidine. Typical inhibitors of oxidases containing metal, such as sodic azide and thioglycollic acid, were the most potent inhibitors of POx activity. The optimal pH for o-dianisidina oxidation was 2.8, but in this pH the stability was rapidly lost after 5 hours of incubation. The optimal temperature was found between 70 and 800C, and the crude extract showed an high thermostability, keeping more than 50% of activity after 5 hours of incubation at 100°C. All the characteristics of the crude extract were similar to phenoloxidases laccase type, except the high optimal temperature and thermostability, never report for phenoloxidases of mesophilic and thermophilic fungi. To elucidate the responsible nature for POx activity, the purification of an active fraction from Taurantiacus was conducted. The unexpected results of the purfication stage redirected this study. Because of that fraction with POx activity crossed over a 1 kDa ultrafiltration membrane, eluted from Sephadex G-10 column in a elution volume correponding with molecular mass of £ 700 Da, as well as presented high thermostability. The possibility of a laccase or some other enzyme to be responsible by POx activity was excluded. The kinetic and structural properties of the fraction partially purified by Sephadex G-10 with high POx activity, were studied. The properties of optimum pH and temperature for activity and stability were similar to those of the crude extract. The POx fraction oxidized the same substrates than the crude extract, but with higher rates. Unlike of the crude extract a decrease of inhibition was observed with POx fraction. The presence of a siderophore type compound (low-molecular mass Fe chelators) responsible by POx activity in the crude extracts as well in the partially purified fraction was then considered, and led to search for these compounds in the T.aurantiacus cultures, using the universal CAS reactive. Through this method the siderophore production by the fungus, in solid and liquid medium, was confirmed. The maximum production of POx activity in liquid medium coincided with a minimum CAS reaction. However, in spite of the positive results in culture medium, the POx fraction partially purified was not reactive with CAS. The structural characterization of partially purified POx fraction revealed a structure hydroxamate type with approximate molecular mass of 530 Da, apparently lacking aminoacids, and some metais (Ca, Mg, Fe) present in the structure. Thus, the existence of a siderophore hydroxamate type, responsible by POx activity, was suggested through of structural characterization. With these results an mechanism of substrate oxidation by POx fraction was proposed, in which Fe would be responsible by the oxidation of different substrates. Preliminary results showed that Fe is involved in the o-dianisidina oxidation as Fe(II). Apparently, the fraction possessed the ability to both chelate Fe(III) and reduce it to Fe(II), when necessary. The extracts with high POx activity fTom T.aurantiacus were used in biotechnological processes such as treatment of Eucalyptus Kraft pulps and effiuent result of Kraft processo The active extracts showed efficience on pulp biobleaching, with a 39% deslignification after 60 minutes at 500C and pH 3, however a viscosity reduction also was observed. The ABTS addition, as a redox mediator, it not increase the deslignification. After 72 hours of treatment with active extracts at 250C and pH 4, the effiuents showed between 60-70% phenol reduction, depending of incubation conditions. Under static conditions a 67% despolimerization and a 5% mineralization of chlorolignins high-molecular mass were observed. Under agitation conditions a 47% mineralization was observed. A colour reduction effiuent of61 or 35% was obtained under agitation or static conditions, respectively / Doutorado / Bioquimica / Doutor em Ciências

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-04T22:27:38Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Tatianne Leite Nascimento.pdf: 6416686 bytes, checksum: 1c52bd9452e9c07e8480350a2c97d256 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-17T23:04:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Tatianne Leite Nascimento.pdf: 6416686 bytes, checksum: 1c52bd9452e9c07e8480350a2c97d256 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-17T23:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Tatianne Leite Nascimento.pdf: 6416686 bytes, checksum: 1c52bd9452e9c07e8480350a2c97d256 (MD5) Previous issue date: 2014-06-27 / CNPq / A aceroleira (Malpighia emarginata) e uma planta frutífera rustica, resistente e apresenta grande potencial econômico, no entanto sua produtividade pode ser afetada pela antracnose, doença causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides. Apesar de seu claro papel como agente causal de doenca de plantas, espécies de Colletotrichum tem sido frequentemente encontradas associadas a comunidade de fungos endofíticos de plantas tropicais. Diante disso, os objetivos do trabalho foram analisar a estrutura e a composição da comunidade de fungos endofíticos de aceroleira, caracterizar por morfologia e técnicas de biologia molecular isolados de Colletotrichum spp. (endófitos e fitopatógenos) e avaliar o potencial antagônico dos endófitos frente ao agente causal da antracnose. Os endófitos foram isolados de folhas saudáveis de diferentes níveis da copa (ápice e parte inferior) de aceroleiras e os dados obtidos avaliados por análises ecológicas. Os fitopatógenos foram isolados de lesões de folhas com sintomas de antracnose. Os isolados de Colletotrichum foram caracterizados pela velocidade de crescimento, micro e macromorfologia, submetidos a extração do DNA, PCR e sequenciamento (ITS e β-tubulina) e analisados por iniciadores ISSR. Os fitopatógenos foram submetidos ao teste de patogenicidade in vitro. O antagonismo se deu pela técnica de cultura pareada e disco difusão (extratos brutos/acetato de etila). Foi verificada alta diversidade de endófitos e o método de amostragem foi eficaz para aumentar o número de táxons obtidos. As espécies dominantes foram Colletotrichum spp. (inferior da copa) e Guignardia bidwellii (ápice da copa). Foram identificadas sete espécies de Colletotrichum (C. karstii, C. brasiliense, C. gloeosporioides sensu estricto, C. theobromicola, C. siamense, C. fructicola, C. cliviae), sendo alta a variabilidade intra e interespecífica. Colletotrichum karstii, C. siamense, C. fructicola e C. cliviae são citados pela primeira vez como patógenos de aceroleira. As especies endofíticas Pteroconium state of Apiospora camptospora e Bipolaris setariae se destacaram como potencialmente úteis no controle de C. theobromicola. / The acerola (Malpighia emarginata) is a rustic plant, resistant and has great economic potential, though their productivity may be affected by anthracnose disease caused by Colletotrichum gloeosporioides. Despite its clear role as the causal agent of plant disease, Colletotrichum species has been often found associated with community endophytes of tropical plants. The objectives were to analyze the structure and composition of endophytic fungi Malpighia emarginata community, characterize Colletotrichum spp. (endophytes and pathogens) by morphology and molecular biology techniques and evaluate the antagonistic potential of endophytes against the causal agent of anthracnose. Endophytes were isolated from healthy leaves of the apex and the lower part of the canopy of M. emarginata and the data evaluated by ecological analyzes. The pathogens were isolated from leaves with anthracnose. Colletotrichum isolates were characterized by the rate of growth, and micro macromorphology, submitted to DNA extraction, PCR and sequencing (ITS and β-tubulin) and analyzed by ISSR primers. The pathogens were subjected to in vitro pathogenicity test. The antagonism was assessed by the technique of paired culture and disk diffusion (crude extracts / ethyl acetate). High diversity of endophytes was detected; the sampling method was effective in increasing the number of taxa obtained. The dominant species were Colletotrichum spp. (lower canopy) and Guignardia bidwellii (apex canopy). Seven species of Colletotrichum (C. karstii, C. brasiliense, C. gloeosporioides sensu stricto, C. theobromicola, C. siamense, C. fructicola and C. cliviae) been identified and these showed high genetic and morphological variability. Colletotrichum karstii, C. siamense, C. fructicola and C. cliviae are first mentioned as pathogens Malpighia emarginata. Endophytic species Pteroconium state of Apiospora camptospora and Bipolaris setariae stood out as potentially useful in controlling C. theobromicola.

De acordo com Ata de Defesa e Termo de Depósito Legal, trata-se de uma tese, apesar da folha de rosto referir-se ao trabalho como uma dissertação. / Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-09-10T22:02:07Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Caroline Sanuzi Quirino de Medeiros.pdf: 2630900 bytes, checksum: 6019b3d5ec33dc62cd9b09ecdac8cbf2 (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-09-26T22:38:13Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Caroline Sanuzi Quirino de Medeiros.pdf: 2630900 bytes, checksum: 6019b3d5ec33dc62cd9b09ecdac8cbf2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-26T22:38:13Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) TESE Caroline Sanuzi Quirino de Medeiros.pdf: 2630900 bytes, checksum: 6019b3d5ec33dc62cd9b09ecdac8cbf2 (MD5) Previous issue date: 2015-07-29 / A anemia falciforme é uma hemoglobinopatia hereditária, ocasionada por mutação que provoca alteração dos eritrócitos. A ocorrência de vaso-oclusões, pode conduzir a formação de úlceras em membros inferiores (UMIs) associadas a infecções secundárias. Considerando que a resposta às infecções é dependente da ação de proteínas, como a Lectina Ligadora de Manose (MBL), é importante analisar polimorfismos do gene que a codifica. Assim, a pesquisa teve como objetivo determinar a relação entre a fisiopatologia das UMIs e infecções microbiológicas em pacientes atendidos no HEMOPE portadores de anemia falciforme, correlacionando com possível polimorfismo do gene MBL2 e caracterizar os agentes fúngicos quanto à formação de biofilme e sensibilidade antifúngica. As amostras provenientes das UMIs foram coletadas e processadas para exame direto e cultura. Os fungos foram avaliados pelo cristal violeta para a formação de biofilme e conforme o CLSI, a susceptibilidade. Para verificação de índices hematimétricos e moleculares foram coletadas amostras sanguíneas. Os pacientes apresentaram nas UMIs bactérias e fungos. Todos os isolados fúngicos formaram biofilme e foram sensíveis à anidulafungina e a ciclopirox olamina, variando em sensível e resistente aos outros antifúngicos. Não houve significância entre os haplótipos βˢ e polimorfismos no gene MBL2 com a etiofisiopatologia das UMIs ou com as infecções microbianas. Os resultados mostram a necessidade de acompanhamento das UMIs de pacientes com anemia falciforme através de exames microbiológicos periódicos para prevenção do possível risco de septicemia. / Sickle cell disease is an inherited hemoglobinopathy, caused by mutation that causes red blood cells change. The vaso-occlusions occur, can lead to ulcers in the lower limbs (UMIs) associated with secondary infections. Whereas the response to infections is dependent on the protein action, such as binding lectin of Mannose (MBL), it is important to analyze gene polymorphisms that encodes. Thus, the research aimed to determine the relationship between the pathophysiology of UMIs and microbiological infections in patients treated at HEMOPE sickle cell disease, correlating with possible polymorphism MBL2 gene and characterize the fungal agents on the biofilm formation and sensitivity antifungal. Samples from the UMIs were collected and processed for direct examination and culture. The fungi were assessed by crystal violet for formation of biofilm and as CLSI, susceptibility. For verification hematimetric and molecular indices blood samples were collected. Patients presented in UMIs bacteria and fungi. All fungal isolates formed biofilm and were sensitive to anidulafungin and ciclopirox olamine, varying in sensitive and resistant to other antifungals. There was no significant difference between the βˢ haplotypes and polymorphisms in the gene MBL2 with etiopathophysiology of UMIs or microbial infections. The results show the need for monitoring of UMIs of sickle cell patients through regular microbiological tests to prevent the possible risk of septicemia.