Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438710.pdf: 388887 bytes, checksum: 75275a00e6033933e4d572bb06d67de4 (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 / Population data of seven short tandem repeat loci of the PowerPlex? CS7 were obtained from a sample of 401 individuals from Rio Grande do Sul (Southern Brazil). The loci are the two pentanucleotides STRs in the PowerPlex? 16 (PENTA D and PENTA E), an extra pentanucleotide (PENTA C), and four loci STR in the FFFL Fluorescent STR System (LPL, F13B, FES/FPS, and F13A01). Allele frequency and other forensically relevant statistics data were generated for these seven loci. All of the analyzed loci meet Hardy-Weinberg equilibrium expectations and no linkage disequilibrium were found, except for LPL locus. The observed and expected heterozygosity, power of discrimination and exclusion and polymorphic information content were calculated. The combined power of discrimination and combined power of exclusion were 0.999999987 and 0.998159054, respectively. Genetic distances between population from Rio Grande do Sul and other populations are presented. / Dados populacionais de sete loci Short Tandem Repeat do kit comercial PowerPlex? CS7 foram obtidos a partir de uma amostra de 401 indiv?duos do Rio Grande do Sul (sul do Brasil). Os loci s?o os dois pentanucleot?deos STRs do PowerPlex? 16 (PENTA D e PENTA E), um pentanucleot?deo extra (PENTA C), al?m dos quatro loci STR do kit comercial FFFL Fluorescent STR System (LPL, F13B, FES/FPS e F13A01). As frequ?ncias al?licas e outros dados estat?sticos de relev?ncia forense foram analisados. Todos os loci atenderam ?s expectativas de Hardy-Weinberg e n?o foram encontrados desequil?brios de liga??o, exceto para o locus LPL. A heterozigosidade observada e esperada, o poder de discrimina??o e exclus?o e o conte?do de informa??o polim?rfica foram calculados. O poder combinado de discrimina??o e o poder combinado de exclus?o foram de 0,999999987 e 0,998159054, respectivamente. As dist?ncias gen?ticas entre a popula??o do Rio Grande do Sul e outras popula??es foram apresentadas neste trabalho.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 424376.pdf: 455274 bytes, checksum: 2831ccc2e363014a1dadea0477137da7 (MD5) Previous issue date: 2009-03-20 / O lobo-guar? (Chrysocyon brachyurus) ? o maior can?deo dentre as esp?cies Neotropicais. Sua distribui??o, morfologia, ecologia e comportamento est?o intimamente associados a ambientes campestres, especialmente ao Cerrado brasileiro. Este bioma de vegeta??o aberta ? um ambiente vasto e complexo, sendo extremamente heterog?neo em sua composi??o vegetacional e apresentando muitos acidentes geogr?ficos como rios e chapadas. Al?m disso, este ? um dos biomas com maiores taxas de perda e fragmenta??o de habitat na Am?rica do Sul devido ? atividade humana. Todos estes fatores podem levar elementos nativos da fauna e flora a apresentarem algum grau de estrutura??o populacional, dependendo tamb?m de caracter?sticas da biologia de cada esp?cie. Nesse caso, uma investiga??o de tais padr?es se justifica, uma vez que para fins de conserva??o ? de suma import?ncia conhecer eventuais subdivis?es geogr?ficas hist?ricas de uma esp?cie e/ou identificar processos de isolamento populacional causados pela a??o humana. Uma vez que o lobo-guar? apresenta in?meras rela??es tr?ficas e ecol?gicas dentro do Cerrado pode-se dizer que esta ? uma esp?cie-chave para esse ambiente, e um estudo acerca da sua estrutura??o populacional ? assim importante para fins de conserva??o da esp?cie e do Cerrado como um todo. Nesse sentido, marcadores moleculares t?m sido amplamente utilizados, e os m?todos de an?lise associados t?m-se aprimorado e permitido infer?ncias cada vez mais amplas e robustas. Assim, este trabalho se prop?s a estudar a estrutura populacional do loboguar? e discutir suas causas ? luz da hist?ria natural da esp?cie, para isso utilizando marcadores moleculares de evolu??o r?pida, que assim permitam infer?ncias mesmo sobre processos demogr?ficos recentes. Para tal, amostras de tecido de 144 indiv?duos de lobo-guar? foram obtidas atrav?s de captura de animais de vida livre, animais de cativeiro com proced?ncia conhecida e indiv?duos atropelados. Foram amostradas quatro popula??es, al?m de indiv?duos de diversos pontos distintos, resultando em uma ampla cobertura da distribui??o da esp?cie. As amostram foram genotipadas para 14 locos de DNA microssat?lite, originalmente descritos para o c?o dom?stico e escolhidos atrav?s de testes de efici?ncia e polimorfismo para utiliza??o no lobo-guar?. Foram conduzidos testes de variabilidade gen?tica, Fst e Rst entre popula??es, an?lises de estrutura??o atrav?s do programa STRUCTURE e an?lises demogr?ficas testando eventos Gargalo de Garrafa, expans?o populacional e n?mero efetivo da esp?cie (Ne). Os n?veis de variabilidade foram significativamente altos (He m?dia = 0,75) quando comparados a outras esp?cies de can?deos. Al?m disso, n?o se observou nenhum ind?cio de subdivis?o populacional, resultado que sugere que o lobo-guar? se comporta como uma popula??o praticamente panm?tica na maior parte da sua distribui??o. As an?lises demogr?ficas corroboram estudos anteriores baseados em DNAmt que sugerem um evento de expans?o populacional, e os valores de Ne estimados s?o altos. Em conjunto, tais resultados s?o compat?veis com um cen?rio em que a esp?cie passou por um crescimento populacional nos ?ltimos milhares de anos, mantendo-se grande desde ent?o, e sem apresentar subdivis?es geogr?ficas. A falta de estrutura??o populacional pode em parte ser explicada pela dieta generalista e grande capacidade de dispers?o do lobo-guar?, sendo a matriz antropizada perme?vel em algum grau at? o presente momento para os indiv?duos. Contudo, n?o se pode desconsiderar a perda de habitat e fragmenta??o do Cerrado como uma amea?a ao lobo-guar?. O processo de isolamento pode ser muito recente para ser detectado at? mesmo por microssat?lites, e o alto Ne das popula??es pode estar tornando a detec??o dif?cil. Caso este processo continue e se intensifique, os presentes resultados podem servir como base para compara??o com futuros estudos gen?ticos da esp?cie, possibilitando a detec??o e monitoramento de uma poss?vel perda de variabilidade e diferencia??o geogr?fica induzida pelo homem.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438925.pdf: 2580010 bytes, checksum: 0e9447a94974bf6d2f3258aa956986f9 (MD5) Previous issue date: 2012-03-16 / The autochthonous transmission of schistosomiasis in Rio Grande do Sul was confirmed for the first time in 1998, establishing the southernmost focus in Americas. Although no morphological differences were detected in a previous study, the investigation of biological characteristics of the parasite in the current study showed some peculiarities that may be relevant for a better understanding of transmission dynamics in the Esteio focus and adequacy of control measures. The epidemiological study of this focus led to the development of a diagnostic method, Helmintex, more sensitive than the traditional methods for detecting small number of eggs shed in the patients feces. In this method eggs are isolated through magnetic interaction with paramagnetic beads and this mechanism could be related to the presence of iron in the eggshell. Schistosoma mansoni worms ingest large amounts of blood and requires specialized metabolic pathway for iron elimination. When analyzed by energy dispersive spectroscopy iron and small crystal structures probably magnetite were identified in the eggshell. The presence of structures with potentially magnetizing properties led to the magnetic characterization of Schistosoma eggs and demonstration of ferromagnetic and paramagnetic behavior. Eggs were also analyzed to see if other helminth eggs compositional differences were related to different taxonomic groups and habitat types. These findings stimulate further research on the metabolic pathway involving iron, development of new treatment modalities and diagnostic tools. / A transmiss?o aut?ctone da esquistossomose no munic?pio de Esteio, Rio Grande do Sul foi confirmada pela primeira vez em 1998, constituindo o foco mais meridional das Am?ricas. Embora n?o tenham sido detectadas diferen?as morfol?gicas do parasito em estudo pr?vio, a abordagem das caracter?sticas biol?gicas neste trabalho evidenciou algumas peculiaridades, tais como a baixa infectividade do mirac?dios e a alta taxa de infec??o unissexual por machos, que podem ter import?ncia para uma melhor compreens?o da din?mica de transmiss?o no foco de Esteio e adequa??o das medidas de controle. O estudo epidemiol?gico do foco conduziu ao desenvolvimento de um m?todo de diagn?stico, Helmintex, mais sens?vel que os m?todos coprol?gicos cl?ssicos para detectar o baixo n?mero de ovos eliminados nas fezes dos pacientes. O m?todo utiliza a intera??o magn?tica com microesferas paramagn?ticas para o isolamento dos ovos. O mecanismo de intera??o dos ovos com o campo magn?tico poderia estar relacionado com a presen?a de ferro na casca do ovo. O Schistosoma mansoni ingere grande quantidade de sangue e necessita de rota metab?lica especializada para elimina??o do ferro. O objetivo do trabalho foi investigar a presen?a de ferro na casca do ovo por an?lise por espectroscopia por dispers?o de energia. Os resultados possibilitaram a identifica??o do elemento qu?mico ferro presente no ovo, al?m de pequenas estruturas cristalinas, provavelmente magnetita. A presen?a de estruturas com propriedades magn?ticas suscet?veis de magnetiza??o foram motivo para caracteriza??o magn?tica dos ovos de Schistosoma com o encontro de comportamento ferromagn?tico e paramagn?tico. Tamb?m foram analisados ovos de outros helmintos para verificar se diferen?as composicionais dos ovos estavam associadas a diferentes grupos taxon?micos e tipos de habitat. Os achados estimulam novas investiga??es sobre a rota metab?lica envolvendo o ferro, desenvolvimento de novas modalidades de tratamento e recursos diagn?sticos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 437736.pdf: 1457817 bytes, checksum: bdde27fe7d092198d722bf49a1924aa8 (MD5) Previous issue date: 2011-06-15 / Franciscana (Pontoporia blainvillei) is the only extant representative of the Pontoporiidae family. This species occurs along the Atlantic coast of South America from Itaunas, Espirito Santo in Brazil to Golfo Nuevo, Valdes Peninsula in Argentina. The most important threat to the species is the accidental by-catch that in some places reached the number of 1000 related events per year. In recent years an increasingly number of studies had revealed the existence of considerable genetic variation along the geographical distribution of P. blainvillei. In this study, looking to collaborate towards a better comprehension of such existing structure, we analyzed new molecular data, including the sequencing of mitochondrial DNA control region and 11 microsatellite loci from 253 individuals along the Brazilian, Uruguayan and Argentine coast. For the mitochondrial DNA analysis, we added sequences previously deposited in GenBank, totalizing 512 sequences. Results obtained based on the two molecular markers revealed a clear differentiation of the species in three main groups: (1) Rio de Janeiro / Espirito Santo, (2) Sao Paulo and north of Santa Catarina, and (3) south of Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Uruguay and Argentina. The study also shows alarming estimates in reference to the effective size of some populations, mainly from Rio de Janeiro/Espirito Santo which will probably reflect on its conservation status. These results supports the definition of the four management areas (Franciscana Management Area - FMAs) previously suggested by Secchi and associates in 2003, and point out the importance of this definition to the conservation of the genetic diversity of the species. / A toninha, Pontoporia blainvillei ? o ?nico representante atual da fam?lia de odontocet?ceos Pontoporiidae. Esta esp?cie ocorre ao longo da costa atl?ntica da Am?rica do Sul, entre Ita?nas, Esp?rito Santo e o Golfo Nuevo, Pen?nsula Vald?s, Argentina. A principal amea?a ? esp?cie s?o as capturas acidentais em redes de pesca, que em algumas localidades chegaram a atingir o n?mero de 1000 capturas anuais. Nos ?ltimos anos, um n?mero crescente de estudos tem revelado a exist?ncia de varia??es gen?ticas consider?veis ao longo da distribui??o geogr?fica de P. blainvillei. Visando colaborar para uma melhor compreens?o dessa estrutura??o existente, novas informa??es moleculares foram analisadas, incluindo o sequenciamento da regi?o controladora do DNA mitocondrial e 11 loci de microssat?lites de 253 indiv?duos ao longo da costa brasileira, uruguaia e argentina. Para as an?lises do DNA mitocondrial foram incluidas sequ?ncias previamente depositadas no GenBank, totalizando 512 sequ?ncias. Os resultados obtidos a partir dos dois marcadores moleculares revelam uma clara diferencia??o da esp?cie em tr?s grupos principais: 1) Rio de Janeiro/Esp?rito Santo, 2) S?o Paulo/Paran? e norte de Santa Catarina, e 3) Sul de Santa Catarina, Rio Grande do Sul, Uruguai e Argentina. O estudo tamb?m apontou estimativas preocupantes no que se refere ao tamanho efetivo de algumas popula??es, em especial ? do Rio de Janeiro/Espirito Santo e consequentemente ao seu status de conserva??o. Os resultados corroboram a defini??o das quatro ?reas de manejo (Franciscana Management Areas FMAs) previamente sugeridas por Secchi e colaboradores em 2003, e ressaltam a import?ncia desta defini??o para a Conserva??o da diversidade gen?tica da esp?cie.