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Analytische Untersuchungen zur Aggregation von Cetrorelix und weiteren GnRH-AntagonistenHempelt, Daniela 19 November 2012 (has links) (PDF)
In der vorliegenden Arbeit werden Beiträge zur Entwicklung neuer qualitativer und quantitativer analytischer Methoden für die Untersuchung von Cetrorelix und anderen GnRH-Antagonisten während des Aggregationsprozesses vorgestellt. Für die qualitative Untersuchung von GnRH-Antagonisten wurden am Modellpeptid Cetrorelix massenspektrometrische Methoden entwickelt und auf weitere GnRH-Antagonisten übertragen. Eingesetzt wurde sowohl die ESI-TOF-MS als auch die MALDI-TOF-MS. Beide massenspektrometrische Verfahren zeigten für die untersuchten GnRH-Antagonisten polydisperse Verteilungen oberhalb der fluoreszenzspektroskopisch bestimmten kritischen Aggregatbildungskonzentration (cac). Bei den ESI-TOF-MS-Messungen konnte ein stark von Cetrorelix abweichendes Aggregationsverhalten für Ozarelix beobachtet werden.
Für die Quantifizierung des Aggregatanteils in Cetrorelix- bzw. Ozarelixproben wurde eine Methode mit der MALDI-TOF-MS etabliert, die Untersuchungen an pharmazeutisch relevanten Peptidhormon-Formulierungen ermöglicht. Systematische Untersuchungen zum Einfluss verschiedener An- und Kationen sowie deren Konzentrationen auf die Cetrorelixaggregation erfolgten mit der Fluoreszenzspektroskopie. Die erhaltenen Ergebnisse ermöglichen eine bessere Charakterisierung der Aggregation und lassen Abschätzungen über das Aggregationsverhalten von Cetrorelix in verschiedenen Medien mit unterschiedlichen Elektrolyten zu. Mit dem Einsatz der Transmissionselektronenmikroskopie war es erstmals möglich, Aggregate von GnRH-Antagonisten visuell darzustellen.
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Analytische Untersuchungen zur Aggregation von Cetrorelix und weiteren GnRH-AntagonistenHempelt, Daniela 10 July 2012 (has links)
In der vorliegenden Arbeit werden Beiträge zur Entwicklung neuer qualitativer und quantitativer analytischer Methoden für die Untersuchung von Cetrorelix und anderen GnRH-Antagonisten während des Aggregationsprozesses vorgestellt. Für die qualitative Untersuchung von GnRH-Antagonisten wurden am Modellpeptid Cetrorelix massenspektrometrische Methoden entwickelt und auf weitere GnRH-Antagonisten übertragen. Eingesetzt wurde sowohl die ESI-TOF-MS als auch die MALDI-TOF-MS. Beide massenspektrometrische Verfahren zeigten für die untersuchten GnRH-Antagonisten polydisperse Verteilungen oberhalb der fluoreszenzspektroskopisch bestimmten kritischen Aggregatbildungskonzentration (cac). Bei den ESI-TOF-MS-Messungen konnte ein stark von Cetrorelix abweichendes Aggregationsverhalten für Ozarelix beobachtet werden.
Für die Quantifizierung des Aggregatanteils in Cetrorelix- bzw. Ozarelixproben wurde eine Methode mit der MALDI-TOF-MS etabliert, die Untersuchungen an pharmazeutisch relevanten Peptidhormon-Formulierungen ermöglicht. Systematische Untersuchungen zum Einfluss verschiedener An- und Kationen sowie deren Konzentrationen auf die Cetrorelixaggregation erfolgten mit der Fluoreszenzspektroskopie. Die erhaltenen Ergebnisse ermöglichen eine bessere Charakterisierung der Aggregation und lassen Abschätzungen über das Aggregationsverhalten von Cetrorelix in verschiedenen Medien mit unterschiedlichen Elektrolyten zu. Mit dem Einsatz der Transmissionselektronenmikroskopie war es erstmals möglich, Aggregate von GnRH-Antagonisten visuell darzustellen.
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GNRH antagonists in oocyte donor cycles: the key to safe, simple and efficient stimulation protocolsBodri, Daniel 12 January 2011 (has links)
Introducción: Desde su primera descripción en 1984 las indicaciones de donación de óvulos han ido aumentando, lo que ha provocado un incremento progresivo en el número de ciclos realizados a nivel mundial. Aunque esta técnica de reproducción garantiza una elevada tasa de embarazo en la receptora, los profesionales también se esfuerzan en convertir el tratamiento para la donante en un proceso sencillo y seguro. Durante los últimos diez años los antagonistas de la GnRH, por sus características farmacodinámicas, ha sido el fármaco utilizado para desarrollar protocolos de estimulaciones ováricas sencillos y seguros para las donantes de óvulos.
Materiales: La presente tesis doctoral resume las conclusiones de dos artículos publicados recientemente (2010) sobre la utilización de antagonistas de GnRH en la estimulación ovárica de donantes de óvulos. Además se discuten las conclusiones de otros cuatro artículos (publicados en revistas científicas de impacto durante los años 2006 y 2009) estrechamente relacionados a los aquí publicados. Los objetivos de esta tesis son: 1. comparar la eficacia de protocolos de estimulación basados en antagonistas de GnRH en comparación con protocolos basados en agonistas de GnRH a través de una revisión sistemática de la literatura y meta-análisis. 2. ilustrar que los protocolos de estimulación basados en antagonistas de GnRH aumentan la seguridad de la estimulación ovárica para la donante a través de una eliminación completa del riesgo del síndrome de hiperestimulación ovárica (SHO).
Resultados: 1. El meta-análisis de de ocho ensayos clínicos llevados al cabo en donantes de óvulos estimuladas con antagonistas de GnRH no han demostrado diferencia significativa en el número de ovocitos obtenidos y las tasas de embarazo evolutivos en las receptoras correspondientes en comparación con agonistas de GnRH. 2. El estudio observacional, prospectivo realizado en donantes de óvulos de alto riesgo ha demostrado la eliminación completa de SHO moderado/severo tras la descarga con bolo de agonista de GnRH. Además se discuten las conclusiones de cuatro otros estudios apoyando las conclusiones mencionados arriba.
Conclusiones: En el contexto de la donación de óvulos los protocolos de estimulación ovárica basados en antagonistas de la GnRH son igual de eficaces que los protocolos con agonistas de la GnRH. La inducción final de la maduración ovocitaria se puede llevar a cabo satisfactoriamente con un bolo de agonista de GnRH en vez de hCG, lo que prácticamente elimina el riesgo de SHO moderado/severo. La utilización preferencial de este protocolo de estimulación ovárica es muy aconsejable porque permite un tratamiento más sencillo y aumenta considerablemente la seguridad de la estimulación ovárica en donantes de óvulos. / Background: Since its first description in 1984 the indications of oocyte donation (OD) has widened considerably which has led to a continuous increase in the number of OD treatment cycles performed worldwide. Although this treatment option secured the highest pregnancy rates for the recipients of donor oocytes increased efforts were also made to achieve safer and simpler treament protocols for the oocyte donor. During the last decade with the advent and increased use of the GnRH antagonists this new pharmacological agent was also explored in ovarian stimulation protocols specifically tailored for oocyte donors.
Materials: The present doctoral thesis summarizes the findings of two recently published articles (2010) on the application of GnRH antagonists in the ovarian stimulation of oocyte donors. Furthermore the findings of another four strictly related articles (published in high-impact international journals between 2006 and 2009) are also discussed. The primary objectives were: 1. to compare efficiency of GnRH antagonist protocols in comparison with GnRH agonist-based protocols in the context of oocyte donation by means of a systematic review and meta-analysis and 2. to illustrate that GnRH antagonist protocols substantially increase the safety of ovarian stimulation for oocyte donors by reducing or even eliminating the incidence of moderate/severe ovarian hyperstimulation syndrome (OHSS).
Results: 1. A meta-analysis of eight randomized clinical trials (RCTs) performed in oocyte donors undergoing stimulation with GnRH antagonists showed no significant difference in the number of retrieved oocytes or recipient ongoing pregnancy rate when compared with GnRH agonists. 2. A prospective, follow-up study of a group of high risk oocyte donors showed that early onset moderate/severe OHSS was completely eliminated after triggering with a GnRH agonist. Furthermore the findings of four studies supporting the above conclusions are also presented.
Conclusions: In the context of oocyte donation the GnRH antagonist based ovarian stimulation protocols are equally efficient compared to down regulation by GnRH agonists. The induction of final oocyte maturation can be successfully achieved by a GnRH agonist instead of hCG which practically eliminates early-onset moderate/severe OHSS. The proposed ovarian stimulation protocol should be preferentially used because it permits the simplification and considerably increases the safety of ovarian stimulation for oocyte donors.
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Comparação entre dois protocolos para estimulação ovariana com agonista/antagonista do hormônio liberador de gonadotrofinas (GnRH) em mulheres submetidas ao primeiro ciclo de reprodução assistida / Comparison GnRH agonist short protocol and GnRH antagonist in Brazilian normoresponder patients undergoing their first cycle of controlled ovarian stimulationArruda, Jalsi Tacon 01 July 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-07-01 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Infertility affects more couples and assisted reproduction techniques offer a
possibility of treatment and the chance of having a child. Thus, the first attempt to
ovulation induction is critical to the success of the cycle or even for future attempts
is successful. Objective: To compare the protocols using GnRH agonist or
antagonist for ovarian stimulation in normo-responders undergoing the first cycle
of IVF/ICSI. Methods: we conducted a literature review on the history of ovulation
induction controlled by medications. From the data available in the database of
electronic medical records SISFERT used in the Laboratory of Human
Reproduction (LabRep-HC-FM-UFG) a comparative retrospective observational
study was conducted with 50 patients divided into two groups according to
protocol: GnRH-agonist (leuprolide acetate 1 mg/day short protocol) or GnRHantagonist
(Cetrorelix 0.25 mg/day), which received 150 IU/day of rFSH (follitropin
alpha) and 250 µg of rhCG (alpha-coriogonadotrofina) in both groups. Results:
Statistically significant differences were observed in the days of stimulation with
rFSH, total dose of gonadotropin, days of use of GnRH, GnRH dose and total
number of follicles (≥ 16 mm) on the day of the group rhCG GnRH agonist. There
was no significant difference in other parameters, however, the number of oocytes
retrieved was slightly higher in the GnRH agonist, but fertilization rate was higher
in the GnRH-antagonist. Pregnancy rates and clinical chemistry were similar in
both groups. Conclusions: although no significant differences in the results
analyzed, the use of flexible antagonist protocol facilitates the handling and
enables the patient using much lower doses of gonadotropins itself as the
antagonist, reducing the cost of treatment when compared to the protocol with
GnRH agonist. / A infertilidade afeta cada vez mais casais e as técnicas de reprodução assistida
oferecem uma possibilidade de tratamento e a chance de ter um filho. Assim, a
primeira tentativa de indução da ovulação é fundamental para o sucesso do ciclo
ou, até mesmo, para que tentativas futuras sejam bem sucedidas. Objetivo:
comparar os protocolos utilizando agonista ou antagonista do GnRH para
estimulação ovariana em pacientes normo-respondedoras submetidas ao primeiro
ciclo de FIV/ICSI. Métodos: foi realizada uma revisão da literatura sobre a história
da indução da ovulação controlada por medicamentos. A partir dos dados
disponíveis no banco de prontuários eletrônicos SISFERT utilizado pelo
Laboratório de Reprodução Humana (LabRep–HC–FM–UFG), um estudo
observacional retrospectivo comparativo foi conduzido com 50 pacientes
distribuídas em dois grupos de acordo com o protocolo: GnRH-agonista (acetato
de leuprolide 1 mg/dia protocolo curto) ou GnRH-antagonista (cetrorelix 0,25
mg/dia); e que receberam 150 UI/dia de rFSH (alfa-folitropina) e 250 µg de rhCG
(alfa-coriogonadotrofina) em ambos os grupos. Resultados: foram observadas
diferenças estatisticamente significativas nos dias de estimulação com rFSH, dose
total de gonadotrofina, dias de uso do GnRH, dose total de GnRH e o número de
folículos (≥ 16 mm) no dia do rhCG no grupo GnRH-agonista. Não houve
diferença significativa nos outros parâmetros, no entanto, o número de oócitos
recuperados foi ligeiramente maior no grupo GnRH-agonista, mas a taxa de
fertilização foi maior no grupo GnRH-antagonista. As taxas de gravidez química e
clínica foram similares nos dois grupos. Conclusões: embora não tenha havido
diferenças significativas nos resultados analisados, o uso do protocolo flexível
com antagonista facilita a manipulação pela paciente usuária e possibilita doses
menores tanto de gonadotrofinas quanto do próprio antagonista, reduzindo o
custo do tratamento quando comparado ao protocolo com agonista do GnRH
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Modellierung und Visualisierung von Systemen zur Beschreibung der intra- und intermolekularen Wechselwirkungen in hydrophoben PeptidenSchneider, Alexander 11 November 2014 (has links) (PDF)
Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit der Untersuchung und Beschreibung der Eigenschaften der synthetischen Dekapeptide Cetrorelix und Ozarelix durch analytische Methoden und computergestützte Modellierung. Diese Moleküle sind hydrophobe, aggregierende Antagonisten des Gonadotropin-Releasing-Hormons (GnRH). Zusätzlich wurden amyloidbildende Peptidstrukturen als Modelle für die Assoziationsprozesse in hydrophoben Peptiden untersucht und visualisiert.
Die intrinsische Fluoreszenz der GnRH-Antagonisten und zusätzlich der Peptide Teverelix und D-Phe6-GnRH sowie von verkürzten Fragmenten des Cetrorelix wurde untersucht. Ein Strukturmodell für die Beschreibung der Aggregation der Dekapeptide wurde erarbeitet. Der Aufbau eines Rechenclusters durch das Einbinden der Computer am Lehrstuhl in ein Linux-System zur Verteilung von Rechenprozessen über das Netzwerk ermöglichte die Bereitstellung der notwendigen Leistung zur Realisierung der Berechnungen.
Es wurden Werkzeuge zur Modellierung der solvatisierten Aggregate von Peptiden ohne eindeutige Vorzugsstruktur programmiert und in ein Docking-System für beliebige Moleküle eingebunden. Verwendet wurde das Kraftfeld MMFF94 mit einer Erweiterung durch ein Verfahren zur dynamischen Berechnung von Partialladungen in Molekülstrukturen.
Solvatisierte Aggregate der Dekapeptide und von bekannten amyloidbildenden Strukturen wurden modelliert (Docking). Berechnet wurden als aggregierend beschriebene Sequenzen und entsprechende Vergleichsstrukturen des Calcitonins, des Insel-Amyloid-Polypeptides, des beta2-Mikroglobulins, des Amyloid-beta-Proteins, des Lactoferrins und weitere Modellpeptide. Die wesentlichen Wechselwirkungen während der Aggregation konnten schließlich anhand von Dynamik-Simulationen der faltblattartigen Dimere des Cetrorelix und Ozarelix beschrieben werden. So wurden die Prozesse der hydrophoben Assoziation und Stabilisierung durch Wasserstoffbrücken von Peptiden veranschaulicht und auf molekularer Ebene erfolgreich analysiert.
Die Visualisierung der erhaltenen Modellierungsergebnisse erfolgt durch die Darstellung der Strukturen und Dynamik-Simulationen als interaktive 3D-Modelle in einem für diese Arbeit aufgebauten Internetauftritt. / This work discusses the analysis of the aggregation properties of the gonadotropin releasing hormone antagonists Cetrorelix, Teverelix, Ozarelix and of small amyloid forming model peptides by analytical fluorescence spectroscopy and molecular modelling. A high performance linux compute cluster was developed for calculation of molecular structures.
Solvated aggregate clusters of peptides without defined secondary structure were modelled by molecular mechanics methods (forcefield mmff94) in combination with an advanced charge equilibration and docking technique.
Molecular dynamics of solvated peptide dimers were implemented and the role of hydrophic association and hydrogen bond formation in hydrophobic peptide aggregates was explained. Finally, an aggregation model for the directed association of hydrophobic peptides is presented. The modelling results, 3d structures and dynamic simulations are visualized in an interactive web material.
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Modellierung und Visualisierung von Systemen zur Beschreibung der intra- und intermolekularen Wechselwirkungen in hydrophoben PeptidenSchneider, Alexander 08 October 2014 (has links)
Die vorliegende Arbeit beschäftigt sich mit der Untersuchung und Beschreibung der Eigenschaften der synthetischen Dekapeptide Cetrorelix und Ozarelix durch analytische Methoden und computergestützte Modellierung. Diese Moleküle sind hydrophobe, aggregierende Antagonisten des Gonadotropin-Releasing-Hormons (GnRH). Zusätzlich wurden amyloidbildende Peptidstrukturen als Modelle für die Assoziationsprozesse in hydrophoben Peptiden untersucht und visualisiert.
Die intrinsische Fluoreszenz der GnRH-Antagonisten und zusätzlich der Peptide Teverelix und D-Phe6-GnRH sowie von verkürzten Fragmenten des Cetrorelix wurde untersucht. Ein Strukturmodell für die Beschreibung der Aggregation der Dekapeptide wurde erarbeitet. Der Aufbau eines Rechenclusters durch das Einbinden der Computer am Lehrstuhl in ein Linux-System zur Verteilung von Rechenprozessen über das Netzwerk ermöglichte die Bereitstellung der notwendigen Leistung zur Realisierung der Berechnungen.
Es wurden Werkzeuge zur Modellierung der solvatisierten Aggregate von Peptiden ohne eindeutige Vorzugsstruktur programmiert und in ein Docking-System für beliebige Moleküle eingebunden. Verwendet wurde das Kraftfeld MMFF94 mit einer Erweiterung durch ein Verfahren zur dynamischen Berechnung von Partialladungen in Molekülstrukturen.
Solvatisierte Aggregate der Dekapeptide und von bekannten amyloidbildenden Strukturen wurden modelliert (Docking). Berechnet wurden als aggregierend beschriebene Sequenzen und entsprechende Vergleichsstrukturen des Calcitonins, des Insel-Amyloid-Polypeptides, des beta2-Mikroglobulins, des Amyloid-beta-Proteins, des Lactoferrins und weitere Modellpeptide. Die wesentlichen Wechselwirkungen während der Aggregation konnten schließlich anhand von Dynamik-Simulationen der faltblattartigen Dimere des Cetrorelix und Ozarelix beschrieben werden. So wurden die Prozesse der hydrophoben Assoziation und Stabilisierung durch Wasserstoffbrücken von Peptiden veranschaulicht und auf molekularer Ebene erfolgreich analysiert.
Die Visualisierung der erhaltenen Modellierungsergebnisse erfolgt durch die Darstellung der Strukturen und Dynamik-Simulationen als interaktive 3D-Modelle in einem für diese Arbeit aufgebauten Internetauftritt. / This work discusses the analysis of the aggregation properties of the gonadotropin releasing hormone antagonists Cetrorelix, Teverelix, Ozarelix and of small amyloid forming model peptides by analytical fluorescence spectroscopy and molecular modelling. A high performance linux compute cluster was developed for calculation of molecular structures.
Solvated aggregate clusters of peptides without defined secondary structure were modelled by molecular mechanics methods (forcefield mmff94) in combination with an advanced charge equilibration and docking technique.
Molecular dynamics of solvated peptide dimers were implemented and the role of hydrophic association and hydrogen bond formation in hydrophobic peptide aggregates was explained. Finally, an aggregation model for the directed association of hydrophobic peptides is presented. The modelling results, 3d structures and dynamic simulations are visualized in an interactive web material.
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