Uma característica associada à capacidade de Pseudomonas aeruginosa sobreviver e disseminar-se frente a situações adversas encontradas no ambiente e no organismo de hospedeiros é a regulação de genes de resposta a condições de estresse celular, que incluem o evento de choque térmico. A exposição do microrganismo a um ambiente de alta temperatura resulta na indução da síntese de proteínas específicas, representadas por chaperonas e proteases, que conferem um aumento da viabilidade celular microbiana em condições consideradas letais. Presume- se que o gene PA 0657 de P. aeruginosa O1 possa estar associado à indução ou supressão do processo transcricional de genes envolvidos na resposta ao choque térmico. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a função do gene PA0657 de P. aeruginosa O1. Para isso, análises bioinformáticas foram realizadas e o gene foi clonado e expresso em sistema bacteriano, produzindo uma proteína recombinante que foi purificada e caracterizada enzimaticamente. Além disso, uma linhagem de P. aeruginosa O1 com o gene PA0657 rompido por recombinação homóloga foi construída, sendo submetida, juntamente com a linhagem selvagem, a uma condição de estresse térmico, permitindo que a expressão de diversos genes associados ao evento de choque térmico pudessem ser avaliadas por qRT-PCR. Os resultados mostraram que a proteína recombinante PA0657 foi capaz de degradar adenosina trifosfato (ATP), dependente do íon Zn2+. Foi possível verificar também que a linhagem rompida perdeu a capacidade de produzir o pigmento piocianina quando crescida em meio cetrimida e não apresentou seu fenótipo mucóide. Em análise in silico observou-se que a região promotora do gene PA0657 é dependente de σ32 e a análise de expressão gênica evidenciou uma diminuição de expressão do gene rpoH na linhagem selvagem de PAO1 após choque térmico, sendo este gene significativamente expresso na linhagem rompida. Observou-se também um acentuado aumento na expressão do gene algU, nestas mesmas condições, na linhagem selvagem PAO1, com ausência de expressão na linhagem rompida. É possível concluir, dessa forma, que o gene PA0657 exerce participação importante no processo de regulação de resposta ao choque térmico e está relacionado com a conversão do fenótipo mucóide. / Submitted by Ana Guimarães Pereira (agpereir@ucs.br) on 2015-02-12T16:39:42Z No. of bitstreams: 1 Dissertacao Franciele Maria Zanol.pdf: 2049257 bytes, checksum: 659cf19a6ee79184c9f91b239ba09a19 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-02-12T16:39:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao Franciele Maria Zanol.pdf: 2049257 bytes, checksum: 659cf19a6ee79184c9f91b239ba09a19 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES / A feature associated with the ability of Pseudomonas aeruginosa survive and dissemination in adverse conditions found in the environment and in hosts‘ organisms is a specific genes regulation of stress response, including heat shock event. The exposure of microorganisms to a high temperature environment results in the induction of synthesis os specific proteins, represent by chaperones and proteases, conferring an increase og the microbial cell viability under conditions considered lethal. . It is presumed that the PA0657 gene of P. aeruginosa O1 can be related to the induction or suppression of transcriptional process of genes that are involved in a response to heat shock. In this context, the aim of this work was to characterize the function of the PA0657 gene of P. aeruginosa O1. In this way, bioinformatic analyzes were performed and the gene was cloned and expressed in bacterial system, producing recombinant protein which was purified and enzymatically characterized. Moreover, the PA0657 gene of P. aeruginosa O1 strain was disrupted by homologous recombination. The wild type strain and the disrupted strain were submitted to a thermal stress and the expression of various genes associated with heat shock event could be evaluated by qRT -PCR. The results showed that the PA0657 recombinant protein was capable of degrading adenosine triphosphate (ATP) of Zn2+ dependent manner. It was also verified that the ruptured strain lost its ability to produce pyocyanin pigment when grown on cetrimide means and its mucoid phenotype. It was possible to find in computational analysis that the promoter region of the PA0657 gene is dependent on σ32. The gene expression analysis showed a decrease in expression of the rpoH gene in the wild type strain after heat shock, this gene is significantly expressed in the disrupted strain. A significant increase in expression of the algU gene was observed, on the wild type strain with absence of expression in the disrupted strain. Therefore, it was possible to conclude that the PA0657 gene cts in the regulatory process of thermal shock response and is related to the conversion of the mucoid phenotype.

Orientador: Maria de Lourdes Ribeiro de Souza da Cunha / Coorientador: Carlos Magno Castelo Branco Fortaleza / Banca: Paulo Câmara Marques Pereira / Banca: Patrícia Yoshida Faccioli Martins / Resumo: As Infecções estafilocócicas são grande causa de mortalidade e morbidade. A emergência de isolados de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (MRSA) originários da comunidade na década de 1990 trouxe desafios para sua prevenção e abordagem terapêutica. A identificação da prevalência e características de MRSA adquirido em comunidade (CA-MRSA) em populações de alto risco pode fornecer valiosas informações para compreensão de sua epidemiologia. O objetivo deste estudo foi identificar a prevalência, os fatores de risco e as características moleculares de CA-MRSA isolado em nasofaringe de uma população carcerária em Avaré, Brasil. Foram coletados swabs nasais de 302 homens encarcerados no Centro de Ressocialização de Avaré. A caracterização da resistência à meticilina foi feita através de difusão em disco (Oxacilina e Cefoxitina) e identificação do gene mecA (por Reação em Cadeia de Polimerase (PCR). Utilizou-se também PCR para identificação dos genes lukF-PVe lukS-PV que codificam a leucocidina de Panton-Valentine. Fatores de risco para colonização nasal por S. aureus e por MRSA foram avaliados em modelos univariados e multivariados (regressão logística). A prevalência de colonização nasal por S. aureus como um todo foi de 16,5%, e a MRSA (definida como positividade para o gene mecA), de (02) 4,0%. Os testes de difusão com disco de Oxacilina e Cefoxitina identificaram 2 (4%) resistentes simultaneamente a Oxacilina e Cefoxitina. Nenhum dos isolados de S. aureus apresentou genes codificadores da PVL. As amostras positivas para gene mecA apresentaram SCCmec tipo IV, confirmando esta tipagem presente em amostras comunitárias.Uma das amostras positivas para gene mecA apresentou SCCmec IV-d, que pelo método PFGE agrupou em 85,7% com o clone JCSC 4469 de origem japonesa. Os fatores de risco para... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Staphylococci infections are a major cause of morbidity and mortality. The emergence of methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) isolates original from the community in the 1990s brought challenges for prevention and therapeutic approach.Identifying the prevalence and characteristics of community-acquired MRSA (CA-MRSA) in high-risk populations can provide valuable information for understanding its epidemiology. The objective of this study was to identify the prevalence, risk factors and molecular characteristics of CA-MRSA isolates in nasopharynx of a prison population in Avare, Brazil. Nasal swabs were collected from 302 men incarcerated in Central Resocialization of Avaré. The characterization of methicillin resistance was done by disk diffusion (Oxacillin and Cefoxitin) and mecA gene identification (by Polymerase Chain Reaction(PCR). We also used PCR to identify the lukF-PV and lukFS-PV genes that encode the Panton- Valentine Leukocidin. Risk factors for nasal colonization by S. aureus and MRSA were evaluated with univariate and multivariate models (logistic regression). The prevalence of nasal colonization by S. aureus as a whole was 16.5%, and MRSA (defined as positive for the mecA gene), from (02) 4.0%. The diffusion testing with Oxacillin and Cefoxitin identified 2 (4%) isolates resistants to both Oxacillin and Cefoxitin. None of the isolated S.aureus had genes encoding PVL. Positive samples for mecA showed SCCmec type IV, confirming this typing in community samples. One of the positive samples for mecA showed SCCmec IV-d, which by PFGE method grouped in 85.7% with clone 4469 JCSC of Japanese origin. Risk factors for S. aureus acquisition revealed in the survey were: men who... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-03-20T10:37:11Z No. of bitstreams: 1 GerlucioMedeirosDeAraujo_DISSERT.pdf: 8590763 bytes, checksum: cd053090590caf3ddc65e88d5b8f3939 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-03-20T10:44:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 GerlucioMedeirosDeAraujo_DISSERT.pdf: 8590763 bytes, checksum: cd053090590caf3ddc65e88d5b8f3939 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-20T10:44:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 GerlucioMedeirosDeAraujo_DISSERT.pdf: 8590763 bytes, checksum: cd053090590caf3ddc65e88d5b8f3939 (MD5) Previous issue date: 2017-07-31 / O presente trabalho tem por objetivo investigar e intervir nas abordagens de ensino de gram?tica presentes no livro did?tico Portugu?s Linguagem, 9? Ano, Ensino Fundamental II. Sabe-se que o ensino de gram?tica, na escola, tem sido objeto de interesse de muitos estudiosos da linguagem e de docentes. Este trabalho, motivado pela observa??o de dificuldades encontradas na pr?tica docente de l?ngua portuguesa, tece algumas reflex?es e busca indicar caminhos com base em uma interven??o pedag?gica, no tocante ao ensino de gram?tica desenvolvido a partir do livro did?tico. A pesquisa-a??o foi realizada em turma do 9? ano do Ensino Fundamental II, de uma escola p?blica, na cidade de Ipueira - RN. Esse estudo observa ainda as contribui??es e implica??es do livro did?tico Portugu?s Linguagem para o ensino gramatical e, a partir de dados colhidos, confronta tais colabora??es com as orienta??es presentes nos Par?metros Curriculares Nacionais e em contribui??es de te?ricos como Antunes (2003), Neves (2003) Possenti (1996), Trav?glia (2009), Bagno (2001) dentre outros. Essencialmente, destacamos os conceitos, a import?ncia e a aplica??o da gram?tica, nas aulas de l?ngua portuguesa. O trabalho se prop?e, pois, a investigar e intervir no ensino de gram?tica, tomando como corpus as ora??es subordinadas adverbais, explicitando a proposta constante do livro did?tico abordado, objetivando ampli?-la. Discute ainda a relev?ncia de um trabalho reflexivo com a gram?tica na sala de aula. Analisa, para tanto, que perspectivas e que pr?ticas foram incorporadas pelo livro did?tico trabalhado, no que concerne ao ensino da gram?tica da l?ngua materna e, em consequ?ncia, tenta apontar que caminhos seguir para um ensino que priorize uma vis?o din?mica da l?ngua, trabalhando as categorias gramaticais como elementos que d?o suporte ? significa??o dos enunciados em situa??es concretas de uso. Apoia-se, para tanto, em uma sequ?ncia did?tica aplicada com os alunos participantes da pesquisa. O trabalho mostra os limites do livro did?tico, entendendo que, mesmo que este tenha m?ritos, a interfer?ncia do professor se faz indispens?vel na complementa??o das propostas daquele, pois cabe ao docente abordar os conte?dos gramaticais adaptando-os ? realidade dos alunos, de modo a fazer sentido para eles, contribuindo, desse modo, para o preenchimento das lacunas existentes no livro did?tico. / The present work aims to investigate and intervene in the approaches of grammar teaching present in the Portuguese language textbook, 9th Year, Elementary School II. It is known that the teaching of grammar, in school, has been the object of interest of many language students and teachers. This work, motivated by the observation of difficulties found in the teaching practice of Portuguese language, weaves some reflections and seeks to indicate paths based on a pedagogical intervention, in relation to the teaching of grammar developed from the textbook. The action research was carried out in a class of the 9th year of Elementary School II, of a public school, in the city of Ipueira - RN. This study also looks at the contributions and implications of the Portuguese language textbook for grammar teaching and, based on collected data, confronts such collaborations with the orientations present in the National Curricular Parameters and in the contributions of theorists such as Antunes (2003), Neves (2003) ) Possenti (1996), Trav?glia (2009), Bagno (2001) among others. Essentially, we highlight the concepts, importance and application of grammar in Portuguese language classes. The work proposes, therefore, to investigate and intervene in the teaching of grammar, taking as corpus the clauses subordinated adverbais, explaining the proposal in the textbook approached, with the purpose of amplifying it. It also discusses the relevance of reflective work with grammar in the classroom. It analyzes, therefore, what perspectives and practices have been incorporated by the textbook worked, in what concerns the teaching of the grammar of the mother tongue and, consequently, tries to point out which paths to follow a teaching that prioritize a dynamic view of the language, working the grammatical categories as elements that support the signification of statements in concrete situations of use. It is supported by a didactic sequence applied with the students participating in the research. The work shows the limits of the textbook, understanding that, even if it has merits, the teacher's interference becomes indispensable in complementing the teacher's proposals, because it is up to the teacher to approach the grammatical contents by adapting them to the students reality, in order to make sense for them, thus contributing to filling the gaps in the textbook.

Uma característica associada à capacidade de Pseudomonas aeruginosa sobreviver e disseminar-se frente a situações adversas encontradas no ambiente e no organismo de hospedeiros é a regulação de genes de resposta a condições de estresse celular, que incluem o evento de choque térmico. A exposição do microrganismo a um ambiente de alta temperatura resulta na indução da síntese de proteínas específicas, representadas por chaperonas e proteases, que conferem um aumento da viabilidade celular microbiana em condições consideradas letais. Presume- se que o gene PA 0657 de P. aeruginosa O1 possa estar associado à indução ou supressão do processo transcricional de genes envolvidos na resposta ao choque térmico. Neste contexto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar a função do gene PA0657 de P. aeruginosa O1. Para isso, análises bioinformáticas foram realizadas e o gene foi clonado e expresso em sistema bacteriano, produzindo uma proteína recombinante que foi purificada e caracterizada enzimaticamente. Além disso, uma linhagem de P. aeruginosa O1 com o gene PA0657 rompido por recombinação homóloga foi construída, sendo submetida, juntamente com a linhagem selvagem, a uma condição de estresse térmico, permitindo que a expressão de diversos genes associados ao evento de choque térmico pudessem ser avaliadas por qRT-PCR. Os resultados mostraram que a proteína recombinante PA0657 foi capaz de degradar adenosina trifosfato (ATP), dependente do íon Zn2+. Foi possível verificar também que a linhagem rompida perdeu a capacidade de produzir o pigmento piocianina quando crescida em meio cetrimida e não apresentou seu fenótipo mucóide. Em análise in silico observou-se que a região promotora do gene PA0657 é dependente de σ32 e a análise de expressão gênica evidenciou uma diminuição de expressão do gene rpoH na linhagem selvagem de PAO1 após choque térmico, sendo este gene significativamente expresso na linhagem rompida. Observou-se também um acentuado aumento na expressão do gene algU, nestas mesmas condições, na linhagem selvagem PAO1, com ausência de expressão na linhagem rompida. É possível concluir, dessa forma, que o gene PA0657 exerce participação importante no processo de regulação de resposta ao choque térmico e está relacionado com a conversão do fenótipo mucóide. / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior, CAPES / A feature associated with the ability of Pseudomonas aeruginosa survive and dissemination in adverse conditions found in the environment and in hosts‘ organisms is a specific genes regulation of stress response, including heat shock event. The exposure of microorganisms to a high temperature environment results in the induction of synthesis os specific proteins, represent by chaperones and proteases, conferring an increase og the microbial cell viability under conditions considered lethal. . It is presumed that the PA0657 gene of P. aeruginosa O1 can be related to the induction or suppression of transcriptional process of genes that are involved in a response to heat shock. In this context, the aim of this work was to characterize the function of the PA0657 gene of P. aeruginosa O1. In this way, bioinformatic analyzes were performed and the gene was cloned and expressed in bacterial system, producing recombinant protein which was purified and enzymatically characterized. Moreover, the PA0657 gene of P. aeruginosa O1 strain was disrupted by homologous recombination. The wild type strain and the disrupted strain were submitted to a thermal stress and the expression of various genes associated with heat shock event could be evaluated by qRT -PCR. The results showed that the PA0657 recombinant protein was capable of degrading adenosine triphosphate (ATP) of Zn2+ dependent manner. It was also verified that the ruptured strain lost its ability to produce pyocyanin pigment when grown on cetrimide means and its mucoid phenotype. It was possible to find in computational analysis that the promoter region of the PA0657 gene is dependent on σ32. The gene expression analysis showed a decrease in expression of the rpoH gene in the wild type strain after heat shock, this gene is significantly expressed in the disrupted strain. A significant increase in expression of the algU gene was observed, on the wild type strain with absence of expression in the disrupted strain. Therefore, it was possible to conclude that the PA0657 gene cts in the regulatory process of thermal shock response and is related to the conversion of the mucoid phenotype.

Orientadores: Angelica Zaninelli Schreiber, Plinio Trabasso / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-08T13:17:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nowakonski_AngelaVon_M.pdf: 1399484 bytes, checksum: ee465090318f9325ffdc02d5497ae055 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: Bacteriemias são ocorrências relacionadas a diferentes processos patológicos e em grande parte associadas a infecções hospitalares. Podem ser causadas por diferentes tipos de microrganismos, sendo os Gram negativos, em especial, os bacilos, responsáveis por grande número destas. O diagnóstico laboratorial envolve coleta de hemoculturas, isolamento e identificação do agente e avaliação de sua sensibilidade aos antimicrobianos. Com o aumento da sobrevida de pacientes com doenças de base muito graves e o uso indiscriminado de antimicrobianos de amplo espectro, são crescentes os relatos de desenvolvimento de resistência dos microrganismos aos antimicrobianos em uso. Trata-se este de estudo retrospectivo que buscou avaliar a prevalência e o perfil de resistência dos principais bacilos Gram negativos isolados a partir de hemoculturas de pacientes adultos, internados no HC-UNICAMP frente a antimicrobianos selecionados e correlação da tendência da resistência aos antimicrobianos com a estimativa de utilização destes antibióticos durante o período de 2000 a 2004. Neste período, os bacilos Gram negativos mais prevalentes foram Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa e Acinetobacter baumanii. Foi possível observar ao longo do período estudado uma alteração no perfil de freqüência dos bacilos Gram negativos encontrados nas hemoculturas, havendo permuta de Enterobacter cloacae por cepas de Klebsiella pneumoniae ao longo do tempo. O consumo aumentado de cefalosporinas de terceira e quarta geração no HC-UNICAMP pôde ser correlacionado de forma significativa a uma maior taxa de resistência de Klebsiella pneumoniae resistente. O aumento no consumo de quinolonas pôde ser correlacionado de forma significativa com aumento de resistência dos bacilos Gram negativos até o ano de 2002, excetuando a Klebsiella pneumoniae que manteve os níveis de resistência até 2004 / Abstract: Bacteriemias are events related to different diseases, mostly hospital infections. They can be caused by many different microorganisms, but the Gram negative bacilli are often responsible for them. The laboratory diagnosis includes blood sampling, isolation and identification of the microorganism, and evaluation of its susceptibility to the available antibiotics. Increases in prevalence of these resistant pathogens in hospitals are frequently related to high selective pressure commonly used in hospitalized patients, almost always represented by older and debilitated individuals. This is a retrospective study of the prevalence and resistance of pathogens isolated from the blood of patients in the Hospital das Clínicas UNICAMP, during the years 2000-2004, and the correlation of the intensive use of some proposed antibiotics. During this period the most commonly isolated microorganisms were: Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Pseudomonas aeruginosa and Acinetobacter baumanii. We observed an alteration of this profile during the study, having Klebsiella pneumoniae replaced the Enterobacter cloacae 's score. The increasing utilization of broad expect rum cephalosporin's in HC UNICAMP was related to the highest resistance of Klebsiella pneumoniae to these drugs. The ever increasing use of quinolones could be related in a very considerable way to the increasing resistance of all Gram negative bacilli until the year of 2002, when it declined but not for Klebsiella pneumoniae which was prolonged during all the time of the study / Mestrado / Patologia Clinica / Mestre em Ciências Médicas

Durante uma infecção, uma complexa seqüência de eventos é inkiada após a invasão do hospedeiro por microrganismos patogênicos. Escherichia coli enteroinvasora (EIEC), assim como Shigella, causa disenteria através da invasão da mucosa do cólon, levando à destruição tecidual e inflamação. Para que ocorra um processo infeccioso, porém, são necessários inóculos de 102 Shigella e 106 EIEC. Foram avaliados aspectos da resposta inflamatória desencadeada pela infecção por EIEC em modelo murino, comparativamente a Shigella. A infecção de macrófagos J774 por EIEC resultou em fagocitose bacteriana, comprometimento da viabilidade do macrófago e produção de citocinas. Macrófagos de camundongos C57BU6 infectados com EIEC produziram NO, que parece ser importante no controle da infecção. Foi observado que camundongos INOS nocaute apresentaram maior produção de citocinas pró-inflamatórias e maior letalidade após infecção do que os selvagens. EIEC induziu a migração de granulócitos e monócitos para o peritônio, e a secreção de citocinas por estas células. Houve proliferação de linfócitos em resposta aos antígenos solúveis de EIEC, mas não foi detectada produção de citocinas por estes linfócitos.Comparativamente a Shigella, EIEC escapou mais lentamente do macrófago, induziu menor produção de citocinas pró-inflamatórias e NO, e menor ativação dos linfócitos T. Estes dados sugerem o desafio com EIEC desencadeia uma resposta menos severa no hospedeiro do que Shigella, o que explicaria a forma mais branda de disenteria e resolução mais rápida do processo infeccioso causado por EIEC. / During an infection, a complex sequence of events in iniciated after invasion of the host by pathogenic microorganisms. Enteroinvasive Escherichia coli (EIEC) and Shigella cause dysentery by means of invading the colonic mucosa, leading to tissue destruction and inflammation. In arder for an infectious process to occur, inocula of 102 Shigella are necessary incontrast to e 106 EIEC. The infection of J774 macrophages by EIEC resulted in phagocytosis of the bacterium, a hindering of the viability of the macrophage and in the production of cytokines. Macrophages obtained from C57BU6 mice infected with EIEC produced NO, which seems to be important for the control if infection. We observed that in iNOS knockout mice, both the production of proinflammatory cytokines and lethality were higher than that observed in wild-type mice. EIEC induced the migration of granulocytes and monocytes to the peritoneum as well as the secretion of cytokines by these cells. We observed a proliferation of Iymphocytes in response to inoculation with soluble EIEC antigens, however, in this case, the production of cytokines was not detected. Compared to Shigella, EIEC was slower in escaping from the macrophage, and induced a shyer production of pro-inflammatory cytokines and NO, as well as promoted a smaller activation of T Iymphocytes. These data suggest that when challenged with EIEC, the host produces a less severe response than that elicited by Shigella, which might explain why the infectious process with EIEC produces a milder form of dysentery with a quicker resolution.

Submitted by Geyciane Santos (geyciane_thamires@hotmail.com) on 2015-12-02T21:00:28Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Sanay Feitosa Lima.pdf: 1448310 bytes, checksum: 5f834ba306b1fec92af1d35b4e7fc328 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-12-03T18:39:32Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Sanay Feitosa Lima.pdf: 1448310 bytes, checksum: 5f834ba306b1fec92af1d35b4e7fc328 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-12-03T18:47:06Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Sanay Feitosa Lima.pdf: 1448310 bytes, checksum: 5f834ba306b1fec92af1d35b4e7fc328 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-03T18:47:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Sanay Feitosa Lima.pdf: 1448310 bytes, checksum: 5f834ba306b1fec92af1d35b4e7fc328 (MD5) Previous issue date: 2015-07-30 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The plants belonging to the family Loranthaceae are popularly known as ervas-de- passarinho. Among the various plants known belonging to this family, there is Oryctanthus alveolatus, which sparked interest due to the few phytochemicals and microbial studies with this plant. Microorganisms are mostly seen as pathogenic agents, especially fungi and bacteria. However, they are also useful in the production of chemicals such as antibiotics and antitumor. Among the existing fungi, endophytic fungi are microorganisms that inhabit the interior of plants bringing benefits to them. So the aim of this study was to obtain and evaluate the antimicrobial activity of crude extracts of 29 isolated endophytic fungi of the leaves and stems of Oryctanthus alveolatus species, in the face of pathogenic Gram-positive Staphylococcus aureus and Staphylococcus epidermidis and Gram-negative Pseudomonas aeruginosa and Escherichia coli. All extracts were subjected to antimicrobial assay using agar diffusion test at concentrations of 0,5 μg.μL-1 and 1000 μg.mL-1. Only three extracts; Coa 007, 009a and 014, were able to inhibit bacterial growth of one or more strains tested at 1000 μg.mL-1. Subsequently, the active extracts were tested at concentrations of 200, 500, 700, 800 and 900μg.mL-1, and the Coa 007 extract showed the CIM values of 900 μg.mL-1 for the bacteria E. coli and P. aeruginosa and CIM of 1000 μg.mL-1 for the bacteria S. aureus. The Coa 009a extract showed CIM of 1000 μg.mL-1 for S. aureus and E. coli bacteria and Coa 014 extract showed CIM in the amount of 900 μg.mL-1 for E. coli and 1000 μg.mL-1 for the bacteria P. aeruginosa and S. aureus. The other fungi tested did not inhibit bacterial growth. Fungi in the extracts were active, they were also evaluated the morphological point of view. The Coa 007 and Coa 014 fungi presented macromorfológicas initially similar characteristics: both possessed white coloring, with algodonosa and opaque texture. Over time, the Coa 007 now presents beige-pink color reverse, differentiating Coa 014 that pasou to present pink pigmentation spots, with reverse part of beige. The Coa 009a initially presented black color, becoming black-gray, cotton wool spots, and reverse the black colony. / As plantas pertencentes à família Loranthaceae são popularmente conhecidas como ervas- de-passarinho. Entre as mais diversas plantas conhecidas pertencentes a essa família, destaca-se Oryctanthus alveolatus, na qual despertou o interesse, devido aos poucos estudos fitoquímicos e microbianos realizados com esta planta. Os microrganismos são em sua maioria, vistos como agentes fitopatogênicos, principalmente fungos e bactérias. Entretanto, eles também são úteis na produção de substâncias químicas, como antibióticos e antitumorais. Dentre os fungos existentes, os fungos endofíticos são microrganismos que habitam o interior das plantas trazendo benefícios às mesmas. Assim o objetivo desse trabalho foi obter e avaliar a atividade antimicrobiana dos extratos brutos de 29 fungos endofíticos isolados das folhas e caules da espécie Oryctanthus alveolatus, frente às bactérias patogênicas Gram-positivas Staphylococcus aureus e Staphylococcus epidermidis e Gram-negativas Pseudomonas aeruginosa e Escherichia coli. Todos os extratos foram submetidos a ensaio antimicrobiano utilizando teste de difusão em ágar nas concentrações de 0,5 μg. μL-1 e 1000 μg.mL-1. Apenas três extratos; Coa 007, 009a e 014, conseguiram inibir o crescimento bacteriano de uma ou mais cepas testadas na concentração de 1000 μg.mL-1. Posteriormente, os extratos ativos foram testados nas concentrações de 200, 500, 700, 800 e 900 μg.mL-1, sendo que o extrato Coa 007 apresentou CIM nos valores de 900 μg.mL-1 para as bactérias E. coli e P. aeruginosa e CIM no valor de 1000 μg.mL-1 para a bactéria S. aureus. O extrato Coa 009a apresentou CIM no valor de 1000 μg.mL-1 para as bactérias S.aureus e E.coli e o extrato Coa 014 apresentou CIM nos valores de 900μg.mL-1 para a bactéria E. coli e 1000 μg.mL-1 para as bactérias P. aeruginosa e S. aureus. Os demais fungos testados não inibiram o crescimento bacteriano. Os fungos, em que os extratos apresentaram atividade, também foram avaliados do ponto de vista morfológico. Os fungos Coa 007 e Coa 014 apresentaram características macromorfológicas inicialmente parecidas: ambos possuiam coloração branca, com textura algodonosa e opaca. Com o tempo, o Coa 007 passou a apresentar coloração reversa bege-rosa, diferenciando do Coa 014 que pasou a apresentar pontos de pigmentação rosa, com parte reversa de cor bege. O Coa 009a apresentou inicialmente coloração preta, tornando-se negro-acinzentado, algodonoso, e reverso da colônia negro.

Doctorat en Sciences / info:eu-repo/semantics/nonPublished

Este trabalho utiliza a Análise de Fluxos Metabólicos para estudar o aumento da eficiência da linhagem Burkholderia sacchari (LFM101) na produção de PHB. Foram avaliadas as eficiências de conversão de açúcares em PHA de LFM101. Esta também foi cultivada em batelada alimentada em reator, apresentando o máximo teórico durante um estado pseudo-estacionário sob oferta de glicose. Estes dados, submetidos ao software Metatool, resultaram em mapa metabólico contendo os fluxos das reações centrais ede PHA ocorrido no experimento. Através do cultivo de LFM101 e C. necator sob oferta de glicose marcada com 13C, determinou-se que estas utilizam as mesmas vias para produção de PHA, não justificando a baixa eficiência de LFM101. Em um projeto paralelo, estudou-se a eficiência da produção de PHB utilizando melaço de cana, glicerol cru e acetato, em produtores de hidrogênio e PHA, onde verificou-se não apenas o aumento de PHA em mutantes nifh- de R. capsulatus mas a interação dos parâmetros luz e nitrogênio a partir das metodologias DOE e RSM. / This work applies Metabolic Flux Analysis to discuss the eficiency of Burkholderia sacchari (LFM101) in PHA production from sugars . Conversion yields of LFM101 and Cupriavidus necator from carbohydrates to PHA were assessed. LFM101 was also grown in reactor fed-batch cultivations, and presented the theoretical maximum in a pseudo-steady stage while grown on glucose. These data were submitted to Metatool and resulted in a metabolic network containing the experimental fluxes of central and PHA metabolism. Cultivation of LFM101 and C. necator under 13C- labeled glucose showed that both species use the same metabolic pathways for the biodegradable polymer synthesis. On a parallel project, the efficiency of biopolymer production from molasses, raw glycerol and acetate in strains producing hydrogen and PHA was tested. Results showed that there was not only an increase in PHA production by R. capsulatus nifH- mutants but also the interaction of light and nitrogen effects were studied by DOE and RSM.

Thirteen bacterial cultures were isolated from the North arm of Great Salt Lake during the months of January and February of 1973. Eleven isolates were gram-negative pleomorphic rods which lysed in hypotonic solution. The remaining two were gram-positive cocci. All isolates and one known strain of Halobacterium salinarium were subjected to examination of morphological, cultural, physiological, and biochemical characteristics. A numerical taxonomic analysis was applied to the compiled characters to compute a coefficient of similarity for each individual isolate as compared to all other isolates. A comparative analysis was included in the similarity computation using characters assembled from those reported in the literature for six taxonomically accepted species of halophilic bacteria. The lake isolates proved to be extreme halophiles with relative high levels of similarity between each other and the known bacteria included in the numerical analysis.