Submitted by Jos? Henrique Henrique (jose.neves@ufvjm.edu.br) on 2017-09-28T19:28:43Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) mariane_rodrigues_ferreira.pdf: 1446137 bytes, checksum: b0c55b008bb6208223dfeaa66f8b1e31 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2017-10-09T14:21:58Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) mariane_rodrigues_ferreira.pdf: 1446137 bytes, checksum: b0c55b008bb6208223dfeaa66f8b1e31 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-09T14:21:58Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) mariane_rodrigues_ferreira.pdf: 1446137 bytes, checksum: b0c55b008bb6208223dfeaa66f8b1e31 (MD5) Previous issue date: 2017 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Objetivou-se com este trabalho determinar o melhor m?todo de estima??o dos coeficientes de repetibilidade e as melhores combina??es entre cortes de acordo com a estabiliza??o genot?pica para caracter?sticas agron?micas, estimar par?metros gen?ticos e formar grupos morfofuncionais com base nas caracter?sticas morfog?nicas e estruturais por meio do agrupamento de Otimiza??o de Tocher em gen?tipos de Panicum maximum. Os coeficientes de repetibilidade para produ??o de massa seca total (MST), massa seca foliar (MSF), massa seca do colmo (MSC), porcentagem de folhas (%F), porcentagem de colmo (%C), foram estimados por meio de quatro m?todos: an?lise de vari?ncia (ANOVA), an?lise estrutural com base na m?dia dos coeficientes de correla??o (AECOR), an?lise de componentes principais com base na matriz de covari?ncia (CPCOV) e na matriz de correla??es (CPCOR). Para o estudo da estabiliza??o genot?pica, utilizaram-se os coeficientes estimados pela ANOVA e CPCOR. Para a avalia??o das caracter?sticas morfog?nicas foram estimadas: taxa de aparecimento foliar (TAPF), filocrono (FIL), taxa de alongamento foliar (TALF), taxa de senesc?ncia foliar (TSF), comprimento final da l?mina (CFL), n?mero de folhas vivas (NFV), dura??o de vida das folhas (DVF), taxa de alongamento de pseudocolmo (TALC), n?mero m?dio de perfilhos (NMP), rela??o l?mina:colmo (RLC). Para MST, foram observados coeficientes de repetibilidade variando entre 0,3500 e 0,4300 pelos m?todos da ANOVA e CPCOR, respectivamente. Altos coeficientes de repetibilidade tamb?m foram encontrados para a caracter?stica MSF. Baixos coeficientes de repetibilidade foram observados para %F e %Ce rela??o l?mina:colmo. Para estabiliza??o genot?pica da MST, os melhores coeficientes foram observados para a combina??o entre os cortes 6 a 7 e entre os cortes 5 a 8, enquanto os menores coeficientes foram observados quando se utilizaram apenas os cortes 3 a 4 e de 1 a 2, em ambos os m?todos. Para a rela??o l?mina:colmo, os melhores coeficientes foram registrados para os cortes 6 a 7 pelo m?todo da ANOVA, e 1 a 2 pelo m?todo CPCOR. De maneira geral, a combina??o entre os cortes de 6 a 7, tamb?m proporcionou maior repetibilidade e determina??o, otimizando a estabiliza??o dos gen?tipos para as massas e porcentagens de folha e de colmo. No estudo dos par?metros gen?ticos e agrupamento, foi observado que somente as caracter?sticas TALF, CFL e RLC tiveram o componente vari?ncia gen?tica significativo. Apesar disto, as caracter?sticas TALC, NFV, apresentaram coeficientes de varia??o genot?picos (CVg) superiores aos coeficientes de varia??o residual ou ambiental (CVe). As caracter?sticas TAPF, FIL, DVF e TSF apresentaram valores abaixo da unidade para a raz?o CVg/CVe. Alta raz?o CVg/CVe foi observada para as caracter?sticas RLC, NFV, TALC, TALF, CFL, sendo os maiores coeficientes foram registrados para RLC. Ap?s o agrupamento, constatou-se a forma??o de cinco grupos morfofuncionais. Os grupos que apresentaram maiores valores de TALF foram os grupos 3, 5 e 1 com valores superiores ? m?dia geral de todos os gen?tipos avaliados. Enquanto o grupo 4 obteve menor desempenho para esta caracter?stica. Para a TALC o grupo 2 se destacou, seguido pelo grupo 5. Dentre todos os grupos a maior RLC constada foi para o grupo 4 e para CFL o grupo 3. Conclui-se que os m?todos que proporcionaram os melhores coeficientes de repetibilidade de determina??o foram os dos componentes principais com base na matriz de correla??o e de covari?ncia. Para a estabiliza??o genot?pica, os melhores coeficientes de repetibilidade e determina??o s?o observados para os cortes realizados no segundo per?odo das ?guas. As caracter?sticas TALF, CFL e RLC apresentam variabilidade gen?tica significativa, e as caracter?sticas TAPF, FIL, DVF e TSF apresentam baixa raz?o CVg/CVe e necessitam de maior controle ambiental. Os grupos 3, 5 e 1, apresentam altas taxas de alongamento de folha como mecanismo de ac?mulo de forragem. J? o grupo 4 se destaca pela capacidade de perfilhamento. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2017. / The objective was to evaluate the coefficient of repeatability of the agronomic traits and to estimate the breeding value of morphogenic characteristics to stablish morphofunctional groups in the clustering analysis of Tocher in Panicum maximum genotypes. The repeatability coefficients were estimated by four methods: analysis of variance (ANOVA), structural analysis based on the correlation matrix (EACOR), principal component analysis based on the variance and covariance?s matrix (PCCOV) and principal component analysis based on the correlation matrix (PCCOR). To the genotypic stabilization study, the ANOVA and PCCOR were used. To the morphogenic evaluation, the characteristics were estimated: leaf appearance rate (LAR), phillochron (PHC), leaf elongation rate (LER), leaf senescence rate (LSR), number of live leaves (NLL), leaf life spam (LLS), leaf final length (LFL), stem elongation rate (SER), average number of tillers (ANT) and leaf:stem ratio (LSR). To total dry matter were observed repeatability coefficients ranging from 0.3500 to 0.4300 by the ANOVA and PCCOR methods, respectively. High coefficients of repeatability were estimated to leaf dry mass too. Low coefficients of repeatability were observed to percentage of leaves, stems and leaf:stem ratio. In the genotypic stabilization of total dry mass the higher coefficients were observed between the 6 and 7th harvest and between the 5 and 8th harvest, while the lowest coefficients were observed when the harvests 3 to 4 and 1 to 2 were considered in both methods. To leaf:stem ratio the higher coefficients were observed to harvests between 6 and 7 in the ANOVA method and 1 to 2 in the PCCOR method. In general, the combination between the 6 and 7th harvests also improves the repeatability and determination coefficients, optimizing the stabilization of the genotypes to dry mass and percentage of leaf and stems. In the study of genetic parameters and clustering, were observed significant effect to genetic variance component only to LER, LFL and LSR. In spite of this the characteristic SER and NLL had CVg higher than CVr. The characteristics LAR. PHC, LLS and LSR had CVg/CVr above the unity. High CVg/CVr ratio were observed to LSR, NLL, SER, LER and LFL, so that the highest coefficient observed to LSR. After the clustering analysis was found five morphofunctional groups. The groups with higher LER were 3, 5 and 1 with breeding values above the general mean. The group 4 had lowest LER. The groups 2 and 5 had the highest SER and the highest LSR was observed to the group 4. The group 3 showed high LFL. It was possible to conclude that the total and leaf dry mass have higher coefficient of repeatability, indicating better accuracy in the identification of the superior genotypes of P. maximum. In the genotypic stabilization, the higher coefficient and determination were observed to the harvests realized in the rainy period. The morphogenic characteristics that have the highest genetic variance have more possibility of gains with the selection and the traits with low CVg/CVr ratio need more environmental control. The groups 3, 5 and 1 have high potential to forage production duly its high leaf elongation rate.

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:55:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LuizAC_TESE.pdf: 1792266 bytes, checksum: ec666aacc6a6bc6fc6e042bf7f0ce339 (MD5) Previous issue date: 2013-11-05 / In this work, the Markov chain will be the tool used in the modeling and analysis of convergence of the genetic algorithm, both the standard version as for the other versions that allows the genetic algorithm. In addition, we intend to compare the performance of the standard version with the fuzzy version, believing that this version gives the genetic algorithm a great ability to find a global optimum, own the global optimization algorithms. The choice of this algorithm is due to the fact that it has become, over the past thirty yares, one of the more importan tool used to find a solution of de optimization problem. This choice is due to its effectiveness in finding a good quality solution to the problem, considering that the knowledge of a good quality solution becomes acceptable given that there may not be another algorithm able to get the optimal solution for many of these problems. However, this algorithm can be set, taking into account, that it is not only dependent on how the problem is represented as but also some of the operators are defined, to the standard version of this, when the parameters are kept fixed, to their versions with variables parameters. Therefore to achieve good performance with the aforementioned algorithm is necessary that it has an adequate criterion in the choice of its parameters, especially the rate of mutation and crossover rate or even the size of the population. It is important to remember that those implementations in which parameters are kept fixed throughout the execution, the modeling algorithm by Markov chain results in a homogeneous chain and when it allows the variation of parameters during the execution, the Markov chain that models becomes be non - homogeneous. Therefore, in an attempt to improve the algorithm performance, few studies have tried to make the setting of the parameters through strategies that capture the intrinsic characteristics of the problem. These characteristics are extracted from the present state of execution, in order to identify and preserve a pattern related to a solution of good quality and at the same time that standard discarding of low quality. Strategies for feature extraction can either use precise techniques as fuzzy techniques, in the latter case being made through a fuzzy controller. A Markov chain is used for modeling and convergence analysis of the algorithm, both in its standard version as for the other. In order to evaluate the performance of a non-homogeneous algorithm tests will be applied to compare the standard fuzzy algorithm with the genetic algorithm, and the rate of change adjusted by a fuzzy controller. To do so, pick up optimization problems whose number of solutions varies exponentially with the number of variables / Neste trabalho, a cadeia de Markov ser? a ferramenta usada na modelagem e na an?lise de converg?ncia do algoritmo gen?tico, tanto para sua vers?o padr?o quanto para as demais vers?es que o algoritmo gen?tico permite. Al?m disso, pretende-se comparar o desempenho da vers?o padr?o com a vers?o nebulosa, por acreditar que esta vers?o d? ao algoritmo gen?tico uma grande capacidade para encontrar um ?timo global, pr?prio dos algoritmos de otimiza??o global. A escolha deste algoritmo deve-se tamb?m ao fato do mesmo ter se tornado, nos ?ltimos anos, uma das ferramentas mais usadas para achar uma solu??o do problema de otimiza??o. Esta escolha deve-se ? sua comprovada efic?cia na busca de uma solu??o de boa qualidade para o problema, considerando que o conhecimento de uma solu??o de boa qualidade torna-se aceit?vel tendo em vista que pode n?o existir um outro algorimo capaz de obter a solu??o ?tima, para muitos desses problemas. Entretanto, esse algoritmo pode ser definido, levando em conta que o mesmo ? dependente n?o apenas da forma como o problema ? representado, mas tamb?m como s?o definidos alguns dos operadores, desde sua vers?o padr?o, quando os par?metros s?o mantidos fixos, at? suas vers?es com par?metros vari?veis. Por isso, para se alcan?ar um bom desempenho com o aludido algoritmo ? necess?rio que o mesmo tenha um adequado crit?rio na escolha de seus par?metros, principalmente da taxa de muta??o e da taxa de cruzamento ou, at? mesmo, do tamanho da popula??o. ? importante lembrar que as implementa??es em que par?metros s?o mantidos fixos durante toda a execu??o, a modelagem do algoritmo por cadeia de Markov resulta numa cadeia homog?nea, e quando permite a varia??o de par?metros ao longo da execu??o, a cadeia de Markov que o modela passa a ser do tipo n?o-homog?nea. Portanto, na tentativa de melhorar o desempenho do algoritmo, alguns trabalhos t?m procurado realizar o ajuste dos par?metros atrav?s de estrat?gias que captem caracter?sticas intr?nsecas ao problema. Essas caracter?sticas s?o extra?das do estado presente de execu??o, com o fim de identificar e preservar algum padr?o relacionado a uma solu??o de boa qualidade e, ao mesmo tempo, descartando aquele padr?o de baixa qualidade. As estrat?gias de extra??o das caracter?sticas tanto podem usar t?cnicas precisas quanto t?cnicas nebulosas, sendo neste ?ltimo caso feita atrav?s de um controlador nebuloso. Com o fim de avaliar empiriccamente o desempenho de um algoritmo n?o-homog?neo, apresenta-se testes onde se compara o algoritmo gen?tico padr?o com o algoritmo gen?tico nebuloso, sendo a taxa de muta??o ajustada por um controlador nebuloso. Para isso, escolhe-se problemas de otimiza??o cujo n?mero de solu??es varia exponencialmente com o n?mero de vari?veis

Made available in DSpace on 2014-12-17T15:34:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KarinK_DISSERT.pdf: 1760441 bytes, checksum: 1f006562e5e54fbb0d69c184d2961828 (MD5) Previous issue date: 2013-06-19 / The main specie of marine shrimp raised at Brazil and in the world is Litopenaeus vannamei, which had arrived in Brazil in the `80s. However, the entry of infectious myonecrosis virus (IMNV), causing the infectious myonecrosis disease in marine shrimps, brought economic losses to the national shrimp farming, with up to 70% of mortality in the shrimp production. In this way, the objective was to evaluate the survival of shrimps Litopenaeus vannamei infected with IMNV using the non parametric estimator of Kaplan-Meier and a model of frailty for grouped data. It were conducted three tests of viral challenges lasting 20 days each, at different periods of the year, keeping the parameters of pH, temperature, oxygen and ammonia monitored daily. It was evaluated 60 full-sib families of L. vannamei infected by IMNV in each viral challenge. The confirmation of the infection by IMNV was performed using the technique of PCR in real time through Sybr Green dye. Using the Kaplan-Meier estimator it was possible to detect significant differences (p <0.0001) between the survival curves of families and tanks and also in the joint analysis between viral challenges. It were estimated in each challenge, genetic parameters such as genetic value of family, it`s respective rate risk (frailty), and heritability in the logarithmic scale through the frailty model for grouped data. The heritability estimates were respectively 0.59; 0.36; and 0.59 in the viral challenges 1; 2; and 3, and it was also possible to identify families that have lower and higher rates of risk for the disease. These results can be used for selecting families more resistant to the IMNV infection and to include characteristic of disease resistance in L. vannamei into the genetic improvement programs / A principal esp?cie de camar?o marinho cultivado no Brasil e no mundo ? o Litopenaeus vannamei, que teve entrada no Brasil nos anos 80. Contudo, a chegada do v?rus da mionecrose infecciosa (IMNV), causador da doen?a da mionecrose infecciosa em camar?es marinhos, trouxe preju?zos econ?micos ? carcinicultura nacional, com mortalidades de at? 70% na produ??o de camar?es. Dessa maneira, objetivou-se avaliar a sobreviv?ncia de camar?es Litopenaeus vannamei infectados pelo v?rus da mionecrose infecciosa utilizando o estimador n?o param?trico de Kaplan-Meier e um modelo de fragilidade para dados grupados. Foram conduzidos tr?s testes de desafios virais com dura??o de 20 dias cada, em diferentes ?pocas do ano, mantendo-se os par?metros de pH, temperatura, oxig?nio e am?nia controlados diariamente. Foram avaliadas 60 fam?lias de irm?os completos de camar?es marinhos L. vannamei infectadas pelo IMNV em cada desafio viral. Foi feita a confirma??o da infec??o pelo IMNV atrav?s da t?cnica de PCR em tempo real utilizando o corante Sybr Green. Atrav?s do Estimador de Kaplan-Meier foi poss?vel detectar diferen?as significativas (p<0,0001) entre as curvas de sobreviv?ncia das fam?lias, entre as curvas de sobreviv?ncia entre os tanques por desafio viral e tamb?m na an?lise conjunta dos desafios virais. Foram estimados, em cada desafio, par?metros gen?ticos como o valor gen?tico de fam?lia e sua respectiva taxa de risco (fragilidade), e a herdabilidade na escala logar?tmica por meio do modelo de fragilidade para dados grupados. A herdabilidade estimada foi respectivamente 0,59; 0,36; e 0,59 nos desafios virais 1; 2; e 3; e tamb?m foi poss?vel identificar as fam?lias que possuem as menores e maiores taxas de risco para a doen?a. Esses resultados podem ser utilizados para sele??o de fam?lias mais resistentes ? infec??o pelo IMNV e a inclus?o da caracter?stica de resist?ncia ? doen?a em programas de melhoramento gen?tico de L. vannamei

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-11-01T21:17:49Z No. of bitstreams: 1 ZailtonSachasAmorimCalheiros_DISSERT.pdf: 970322 bytes, checksum: b3f4c21bcb05d3c25bba593777a5b94a (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-11-07T21:20:44Z (GMT) No. of bitstreams: 1 ZailtonSachasAmorimCalheiros_DISSERT.pdf: 970322 bytes, checksum: b3f4c21bcb05d3c25bba593777a5b94a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-07T21:20:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ZailtonSachasAmorimCalheiros_DISSERT.pdf: 970322 bytes, checksum: b3f4c21bcb05d3c25bba593777a5b94a (MD5) Previous issue date: 2017-07-31 / Este trabalho apresenta um modelo de compartilhamento de assentos veicular de modo a reduzir os custos de viagem de motoristas e passageiros, contribuindo de maneira significativa ao meio ambiente e ? sociedade. O problema tamb?m ? descrito atrav?s de um modelo de programa??o linear e s?o discutidas algumas variantes de um subproblema importante para resolu??o do modelo proposto. Al?m disso, algumas abordagens computacionais s?o implementadas, compostas de algoritmos evolucion?rios (gen?tico e mem?tico) e construtivos (formigas e GRASP). Al?m da adapta??o de algoritmos j? existes para o problema do caixeiro viajante tradicional como o algoritmo de Lin-Kernighan. Ap?s a realiza??o de experimentos, o algoritmo baseado em formiga revela-se promissor para inst?ncias assim?tricas enquanto que o algoritmo de Lin-Kernighan leva vantagem pela sua robustez atrav?s da implementa??o de Helsgaun que desempenha bons resultados para inst?ncias sim?tricas. / This thesis presents a vehicle seat sharing model in order to reduce travel costs for drivers and passengers, contributing significantly to the environment and society. The problem is also described by a linear programming model and it is discussed in some variants of an important subproblem for solving the main problem. Besides, some computational approaches are implemented, composed by evolutionary (genetic and memetic) e constructive (ant optimization) algorithms. In addition to the adaptation of already existing algorithms for the travaling salesman problem as the Lin-Kernighan algorithm. After performing experiments, ant-based algorithms prove itself promising for asymmetric instances while the Lin-Kernighan algorithm takes advantage of its robustness through the implementation of Helsgaun and has a good performance for symmetric instances.

Submitted by Jadson Francisco de Jesus SILVA (jadson@uefs.br) on 2018-07-11T22:03:00Z No. of bitstreams: 1 MARIANA CHAVES - Dissertacao Mariana Chaves_ DEFINITIVA.pdf: 1571122 bytes, checksum: 655c891bef9d1aa8432a75b67d4a75e7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-11T22:03:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MARIANA CHAVES - Dissertacao Mariana Chaves_ DEFINITIVA.pdf: 1571122 bytes, checksum: 655c891bef9d1aa8432a75b67d4a75e7 (MD5) Previous issue date: 2017-09-29 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Physalis angulata L. (Solanaceae) is a traditional medicinal species that can be found all over Brazil. The medicinal utility attributed derives from the production of complex substances of pharmacological interest as: vitaesteroids, fisalinas, flavonoids, steroids, fatty acids, carotenoids, ascorbic acid and alkaloids. For pharmaceutical production, the pharmaceutical industry requires a large amount of raw material, which would be very expensive and would generate significant impacts on the natural environment. In this way, it is necessary to develop breeding programs aimed at medicinal plants, in order to ensure the industrial production of special metabolites. In order to initiate the genetic improvement of a species it is necessary to obtain accurate information on several fundamental questions and one of them is the reproductive system. In this sense, the objective of this work was to carry out a study on the reproductive system of Physalis angulata, identifying the preferential crossing system through experiments of controlled pollinations, viability tests and pollen grain germination and floral visitors observations. All variables evaluated to estimate the preferential cross-breeding system of P. angulata indicated that this is a self-compatible species, and according to the egg pollen ratio it presents a facultative autogamous system. The dyes used to estimate pollen viability did not differ statistically. The pollen viability was high using the colorimetric method, however, there was no germination of the pollen tubes using the in vitro germination method, and further studies and adjustments of the culture medium were necessary. The hour factor influenced the viability of the pollen grains and reached 96% at 14 hours using the tetrazolium dye. The anthesis of the flowers of P. angulata lasted on average two days, they began the opening at 6 in the morning and the closure began at 14 o'clock in the field conditions; on the second day they reopen and close at the same time. In a greenhouse, the flowers opened at the same time, but the closure occurred around 5 pm and reopened the next day. The most frequent insects were of the order Hymenoptera (Apis mell?fera). / Physalis angulata L. (Solanaceae) ? uma esp?cie medicinal tradicional podendo ser encontrada em todo o territ?rio brasileiro. A utilidade medicinal atribu?da decorre da produ??o de subst?ncias complexas de interesse farmacol?gico como: vitaester?ides, fisalinas, flavon?ides, ester?ides, ?cidos graxos, caroten?ides, ?cido asc?rbico e alcal?ides. Para a produ??o de f?rmacos, a ind?stria farmac?utica requer uma grande quantidade de mat?ria-prima, o que seria muito dispendioso e geraria impactos expressivos no ambiente natural. Desse modo, faz-se necess?rio o desenvolvimento de programas de melhoramento voltados para plantas medicinais, visando assegurar a produ??o industrial de metab?licos especiais. Para iniciar o melhoramento gen?tico de uma esp?cie ? necess?rio obter informa??es precisas sobre v?rias quest?es fundamentais e uma delas ? o sistema reprodutivo. Nesse sentido, o objetivo desse trabalho foi realizar um estudo sobre o sistema reprodutivo de Physalis angulata, identificando o sistema de cruzamento preferencial por meio de experimentos de poliniza??es controladas, testes de viabilidade e germinabilidade dos gr?os de p?len e observa??es dos visitantes florais. Todas as vari?veis avaliadas para estimar o sistema preferencial de cruzamento de P. angulata indicaram que se trata de uma esp?cie auto-compat?vel, e segundo a rela??o p?len ?vulo apresenta um sistema aut?gamo facultativo. Os corantes utilizados para estimar a viabilidade pol?nica n?o diferiram estatisticamente. A viabilidade pol?nica foi alta utilizando o m?todo colorim?trico, entretanto n?o houve germina??o dos tubos pol?nicos utilizando o m?todo de germina??o in vitro, sendo necess?rios mais estudos e ajustes dos meios de cultura. O fator hora influenciou a viabilidade dos gr?os de p?len e alcan?ou 96% ?s 14 horas utilizando o corante tetraz?lio. A antese das flores de P. angulata durou em m?dia dois dias, iniciaram a abertura ?s 6 da manh? e o encerramento iniciou ?s 14 horas em condi??es de campo; no segundo dia reabrem e fecham no mesmo hor?rio. Em casa de vegeta??o, as flores abriram no mesmo hor?rio, mas o fechamento ocorreu por volta das 17 horas e reabriram no dia seguinte. Os insetos visitantes mais frequentes foram da ordem Hymenoptera (Apis mell?fera).

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 408010.pdf: 324019 bytes, checksum: a134e04c894f3ac9eaae510c195117e6 (MD5) Previous issue date: 2008-11-20 / Para avaliar as duas vers?es do gene SOD2 que codifica para a prote?na super?xido dismutase dependente de mangan?s na sepse, n?s determinamos a freq??ncia do polimorfismo de nucleot?deo simples (SNP) 47C>T em pacientes criticamente doentes com sepse (n=356) e sem sepse (n=173), e tamb?m investigamos as freq??ncias genot?picas nos desfechos adversos ? sepse (choque s?ptico e mortalidade) no grupo de pacientes s?pticos. N?s comparamos os portadores do alelo 47C (gen?tipos 47CC+47CT) com homozigotos 47TT e demonstramos uma associa??o estatisticamente significativa entre os portadores do alelo 47C e a ocorr?ncia de choque s?ptico no subgrupo de pacientes s?pticos (p=0.025). Na an?lise ajustada de regress?o log?stica bin?ria, incorporando o SNP 47C>T e os principais preditores cl?nicos, n?s mostramos que somente o escore SOFA [p<0.001, OR=9.107 (95%CI=5.319-15.592)] e o alelo 47C [p=0.011, OR=2.125 (95%CI=1.190-3.794)] foram significativamente associados com o desfecho de choque s?ptico. Nossos resultados e nossa hip?tese sugerem que a mais alta freq??ncia de portadores do alelo 47C em pacientes s?pticos com desfecho desfavor?vel ? provavelmente explicada por um efeito no estresse celular.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 431857.pdf: 2482469 bytes, checksum: b7a25df1538a26027ad365149defa70e (MD5) Previous issue date: 2011-03-04 / A condi??o cr?tica de sa?de ? causada pela intera??o de fatores gen?ticos e ambientais. Embora cada fator de risco em si j? esteja parcialmente sob controle gen?tico, estudos prop?em a exist?ncia de efeitos adicionais causados por genes de susceptibilidade; estes estudos iniciaram sugerindo variantes gen?ticas isoladas que poderiam aumentar o risco do paciente criticamente enfermo. Paralelamente, h? evid?ncias crescentes de que a inflama??o desempenha tamb?m um papel central nos pacientes com condi??es cr?ticas de sa?de. Durante a situa??o cr?tica, os fatores de risco cl?nicos e bioqu?micos convencionais s?o muito importantes, mas o estado inflamat?rio do paciente pode modular a gravidade do processo patol?gico. A inflama??o pode estar envolvida em todas as fases do desenvolvimento e das conseq??ncias da doen?a cr?tica, sendo o processo inflamat?rio um agente central da morbi-mortandade do paciente criticamente doente. Assim, controlando o estado inflamat?rio pode-se aumentar a chance do indiv?duo ter um melhor / pior desfecho. O CD14 (cluster of diferenciation 14) ? um receptor padr?o de reconhecimento de mol?culas envolvidas na resposta imune inata contra fatores ex?genos e end?genos de estresse. Os co-receptoes do CD14 mais importantes s?o TLR2, TLR4 (Toll-like Receptors), que s?o receptores transmembrana que mediam a resposta inflamat?ria por endotoxinas, e ativam a via do fator nuclear kappa B (NF-kappa B). O fator de necrose tumoral (TNF-&#945;) ? outra citocina relevante no ?mbito do processo de inflama??o. Mas, al?m de seu papel protetor na imunidade inata, essas citocinas pr?-inflamat?rias podem exercer tamb?m efeitos patog?nicos. Em 2006, foi avaliada a influ?ncia do polimorfismo de nucleot?deo ?nico (SNP) -260C>T CD14 em uma amostra de 85 pacientes criticamente enfermos. Com uma distribui??o aleat?ria de gen?tipos para as caracter?sticas cl?nicas, como tempo de interna??o do paciente na Unidade de Terapia Intensiva (UTI), idade e tempo de perman?ncia hospitalar, foi observado que os pacientes -260TT CD14 apresentaram maiores ?ndices de sobreviv?ncia quando comparados com os portadores do alelo -260C CD14. Em 2009 foi testado uma amostra de 514 pacientes em estado cr?tico se o gen?tipo -260TT CD14 ocorreria mais frequentemente entre os sobreviventes do que entre os pacientes falecidos. Este estudo publicado mostrou que os resultados de 2006 se confirmaram com uma maior robustez. O SNP -260C>T CD14 foi um fator protetor para a sobreviv?ncia em pacientes gravemente doentes: houve uma frequ?ncia superior de sobreviventes homozigotos -260TT CD14. Estes resultados surgiram com a hip?tese de a maior frequ?ncia do gen?tipo -260TT CD14 em pacientes de UTI sobreviventes seria, possivelmente, explicada por um efeito de sinaliza??o na imunidade inata. Naquele momento (2009), a literatura atual estava sugerindo que a an?lise de uma s?rie de marcadores gen?ticos polim?rficos poderia ser mais informativa do que a an?lise de um ?nico polimorfismo. Ciente destas informa??es buscou-se a analisar SNPs em outros genes que codificam prote?nas com a??es sin?rgicas com o CD14 para verificar se eles tamb?m poderiam ser informativos no desfecho dos pacientes com condi??es cr?ticas de sa?de. Verificou-se a heran?a de variantes nos genes TLR2, TLR4, e TNF-&#945;, os quais poderiam atuar em sinergia com o SNP -260C>T CD14 durante a condi??o cr?tica. Foram obtidos resultados que mostraram que SNPs 2029C>T e 2258G>A do TLR2, 896A>G e 1196C>T do TLR4 e o - 308G>A do TNF-&#945;, isoladamente, n?o desempenham um papel significantemente not?vel no desfecho da doen?a cr?tica. No entanto, ao se realizar uma an?lise combinada com a heran?a do -260C>T CD14, foi detectado uma taxa de sobreviv?ncia significativamente maior no grupo de pacientes duplo homozigoto -260TT CD14/-308GG TNF-&#945;. Na an?lise ajustada com o duplo gen?tipo as principais vari?veis cl?nicas preditoras de mortalidade, foram observadas que o duplo gen?tipo -260TT CD14/-308GG TNF-&#945; foi um fator importante de prote??o para a sobreviv?ncia. Conectado ao efeito ben?fico do -260TT CD14, o gen?tipo -308GG TNF-&#945; foi protetor contra a relatada superexpress?o de TNF-&#945; causada por alelo -308A TNF-&#945;. Em conclus?o, os resultados ap?iam a hip?tese de que a intera??o entre os SNPs funcionais - 260TT CD14 e -308GG TNF-&#945; pode estar influenciando o desfecho de pacientes criticamente enfermos

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 437673.pdf: 92662 bytes, checksum: 2b30c84319d430865447f76a9dfff88b (MD5) Previous issue date: 2011-08-03 / Forensic genetics has developed in recent years due to its recognized importance in helping to solve a wide variety of criminal cases. This recognition has led to an increase in demand and hence the need to achieve results on samples that previously were not worked (due to the high degree of degradation) or inconclusive reports generated. The development of new methods of analysis and search for new genetic markers for forensic use is constant, and the biallelic markers of have shown great capacity for individualization and identification of a sample. We studied the frequencies of 47 autosomal and 13 X-chromosome insertiondeletion polymorphism (InDel) markers in a sample of 90 individuals in the population of Rio Grande do Sul state, to evaluate its applicability in forensic cases. Haplotype (DH) and haploid genetic (h) diversity, and information index (I) for X-chromosome markers, and observed heterozygosity (Ho), power of discrimination (PD), power of exclusion (PE) matching probability (MP), typical paternity index (TPI) and polymorphism information content (PIC) for autosomal markers, were calculated. For the 47 autosomes indels studied, the combined power of discrimination and the combined power of exclusion were 99.999999999999998956% and 99.64%, respectively. We did not observe a significant substructure in the population studied, and the global estimated admixture components for the sample were 72.35%, 18.10%, and 9.54% for European, Native American, and African DNA. / A gen?tica forense tem se desenvolvido muito nos ?ltimos anos devido ? sua reconhecida import?ncia no aux?lio para resolver os mais diversos casos criminais. Este reconhecimento levou a um aumento na demanda e, consequentemente, na necessidade de se obter resultados em amostras que anteriormente nem eram trabalhadas (devido ao alto grau de degrada??o) ou geravam laudos inconclusivos. O desenvolvimento de novas metodologias de an?lise e busca de novos marcadores gen?ticos para o uso forense ? constante, e os marcadores bial?licos t?m mostrado grande capacidade de individualiza??o e identifica??o de uma amostra. Neste estudo foram analisadas as frequ?ncias de 47 marcadores autoss?micos e 13 marcadores do cromossomo X de polimorfismos bial?licos do tipo inser??o-dele??o (Indel) em uma amostra de 90 indiv?duos da popula??o do Rio Grande do Sul, para avaliar sua aplicabilidade em casos forenses. Diversidade gen?tica haplot?pica (DH) e hapl?ide (h), e informa??es de ?ndice (I) para marcadores do cromossomo X, e heterozigosidade observada (Ho), poder de discrimina??o (PD), poder de exclus?o (PE), probabilidade de correspond?ncia (MP), ?ndice de paternidade (TPI) e conte?do de informa??o de polim?rfica (PIC) para os marcadores autoss?micos foram calculados. Para os 47 indels autoss?micos estudados, o poder combinado de discrimina??o e o poder combinado de exclus?o foram de 99,999999999999998956% e 99,64%, respectivamente. N?o foi observada uma subestrutura??o significativa na popula??o estudada, e os componentes da mistura global estimados para a amostra foram 72,35%, 18,10% e 9,54% de DNA de europeus, nativo-americanos e africanos.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 443742.pdf: 569133 bytes, checksum: 71572bf56d3664471f8b311fafbd7bba (MD5) Previous issue date: 2012-08-28 / Metabolic syndrome (MetS) is associated with increased risk of incidence type 2 diabetes, cardiovascular disease and insulin resistance and is considered an important cause of mortality and morbidity from cardiovascular disease. According to guidelines from the National Cholesterol Evaluation Program for Adult Treatment Panel III (NCEP ATP III) diagnosis of this syndrome occurs when a person has three or more risk factors between central obesity, hyperglycemia, hypertriglyceridemia, high blood pressure and low HDL-cholesterol. Others risk factors also been associated with MetS are inflammation, genetic and environmental factors. Among the genetic factors investigated as possible risk factors are identified some polymorphisms in the gene interleukin 6 receptor, already associated with dyslipidemia, obesity and insulin resistance. The objective of this study was to evaluate the response of individuals with Metabolic Syndrome (MetS) to a lifestyle modification intervention and the influence of polymorphism 48867A>C of IL6R (rs2228145) in this response. Seventy-seven sedentary individuals with at least three criteria for MetS were included and randomly divided into two groups: NI, nutritional intervention; NIE, nutritional intervention and exercise practice. Parameters were analyzed before and after three months of intervention. When comparing the effect of different intervention according to genotype, a decrease in triglyceride levels was observed (significant for AA genotype; for AC genotype only in NIE group); a significant reduction of fasting glucose level was observed in AA genotype, independent of intervention group, but for AC genotype, only in NI group; systolic blood pressure (SBP) showed significant reduction for AA and AC genotype. When analyzing parameters mean value according to genotype (isolated and in combination) before and after intervention, triglyceride mean levels differed significantly after intervention among genotypes and for AA compared to AC+CC; SBP showed difference before intervention for AA genotype and after intervention, among genotypes and for homozygous A. The analysis of number of individuals with altered parameters revealed statistically significant difference for AA genotype before intervention for triglycerides and diastolic blood pressure (DBP). After intervention, significance was observed for triglycerides, SBP and DBP among genotypes and for AA compared to AC+CC. In conclusion, our results suggest that response to intervention based on nutritional control and exercise practice could benefit mainly individuals homozygous AA of IL6R gene 48867A>C polymorphism / A s?ndrome metab?lica (SM) est? associada a um risco aumentado de incid?ncia de diabetes tipo 2, doen?as cardiovasculares e resist?ncia ? insulina, sendo considerada uma importante causa de mortalidade e morbidade por doen?a cardiovascular. Segundo orienta??es da National Cholesterol Evaluation Program for Adult Treatment Panel III (NCEP ATP III) o diagn?stico dessa s?ndrome acontece quando um indiv?duo apresenta tr?s ou mais fatores de risco entre obesidade central; elevados n?veis de glicemia, de triglicer?deos e de press?o arterial e baixos n?veis de HDL-colesterol. Outros fatores que tamb?m t?m sido associados ? SM, s?o inflama??o, fatores gen?ticos e ambientais. Entre os fatores gen?ticos investigados como poss?vel fator de risco est?o alguns polimorfismos identificados no gene do receptor da interleucina 6, j? associados a dislipidemias, obesidade e resist?ncia ? insulina. O objetivo deste estudo foi avaliar a resposta de indiv?duos com s?ndrome metab?lica (SM) a uma interven??o de modifica??o do estilo e a influ?ncia do polimorfismo 48867A> C do IL6R (rs2228145) nesta resposta. Setenta e sete indiv?duos sedent?rios, com pelo menos tr?s crit?rios para s?ndrome metab?lica foram inclu?dos e divididos aleatoriamente em dois grupos: IN, interven??o nutricional; INE, interven??o nutricional e pr?tica de exerc?cios. Os par?metros foram analisados antes e ap?s tr?s meses de interven??o. Quando foi comparado o efeito das diferentes interven??es de acordo com o gen?tipo, foi observada uma diminui??o dos n?veis de triglicer?deos (significativa para o gen?tipo AA, mas para o gen?tipo AC somente no grupo INE); uma redu??o significativa do n?vel de glicose em jejum foi observada no gen?tipo AA, independente do grupo de interven??o, mas para o gen?tipo AC, somente no IN grupo; a press?o arterial sist?lica (PAS) mostrou redu??o significativa nos gen?tipos AA e AC. Quando valor m?dio dos par?metros foi analisado de acordo com os gen?tipos (isolados e em combina??o) antes e ap?s a interven??o, os n?veis m?dios de triglicer?deos diferiram significativamente ap?s a interven??o entre os gen?tipos e no gen?tipo AA comparado com AC+CC; a PAS mostrou diferen?a antes da interven??o para o gen?tipo AA e ap?s a interven??o, entre os gen?tipos e para homozigotos A. A an?lise do n?mero de indiv?duos com par?metros alterados revelou diferen?a estatisticamente significante para o gen?tipo AA, antes da interven??o, para triglicer?deos e press?o arterial diast?lica (PAD). Ap?s a interven??o, foi observada signific?ncia para triglicer?deos, PAS e PAD entre os gen?tipos e para o gen?tipo AA quando comparado com AC+CC. Em conclus?o, nossos resultados sugerem que a resposta ? interven??o baseada no controle nutricional e na pr?tica de exerc?cios pode beneficiar, principalmente, os indiv?duos homozigotos AA do polimorfismo 48867A> C do gene IL6R

Made available in DSpace on 2015-04-14T13:35:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 382097.pdf: 1824071 bytes, checksum: d6839918341081f6d5e679138d3edaed (MD5) Previous issue date: 2006-08-28 / Introdu??o: estudos epidemiol?gicos apontaram diferentes fatores protetores e de risco para morbidades cardiovasculares incluindo vari?veis ambientais como a atividade f?sica (AF) e gen?ticas como o polimorfismo G894T da enzima ?xido n?trico sintetase endotelial (NOS3/eNOS). Objetivos: investigar a intera??o entre AF cotidiana e o polimorfismo G894T da NOS3 em idosos que vivem em Gravata?-RS com fatores de risco e morbidades cardiovasculares. Material e m?todos: estudo observacional no qual 437 idosos foram avaliados para determina??o do polimorfismo G894T do G894T da NOS3 atrav?s da t?cnica de PCR-RFLP com a enzima de restri??o Ban II. Destes, 174 foram avaliados quanto ao n?vel de AF pelo International Physical Activity Questionnary (IPAQ) e hist?ria pr?via de fatores de risco e morbidades cardiovasculares. Na an?lise estat?stica, foram utilizados os testes qui-quadrado ou Exato de Fisher, an?lise de vari?ncia One-Way seguida de teste post hoc de Bonferroni ou teste Student t. Resultados: as freq??ncias al?licas e genot?picas nos 437 indiv?duos foram: G= 0,655, T= 0,345 e GG = 38,8% (169), GT= 53,3% (234) e TT= 7,8%(34); j? no grupo dos 174 indiv?duos foram: G= 0,672, T= 0,328 e GG= 39,7% (69), GT= 54,6% (96) e TT= 5,7% (09). As freq??ncias estavam em equil?brio de Hardy-Weinberg sendo similares ?s descritas para popula??es caucasianas. A preval?ncia do n?vel de AF foi: SA= 78,0% (136) e IA= 22,0% (38). A preval?ncia dos fatores de risco e morbidades cardiovasculares foi similar entre os grupos SA e IA e entre os idosos com diferentes gen?tipos da NOS3 com exce??o da obesidade que foi significativamente maior em portadores de pelo menos um alelo T (RC= 2,947; IC95%= 1,519-5,718). Atrav?s da an?lise da intera??o entre AF e o polimorfismo (feita somente em idosos AS), verificou-se a manuten??o da associa??o entre o alelo T e maior preval?ncia de obesidade (RC= 3,866; IC95%= 1,777-8,412) e entre o alelo T e menor preval?ncia de hipertens?o arterial sist?mica (RC= 0,110; IC95%= 0,012-0,960). Conclus?o: os resultados obtidos sugerem a exist?ncia de intera??o entre o polimorfismo G894T da NOS3 com AF.