Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-01-23T14:44:54Z No. of bitstreams: 1 FranciscoMarcioBarboza_TESE.pdf: 8557102 bytes, checksum: 12d460591e55e242af090bdb4f4cfbb9 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-01-25T13:26:13Z (GMT) No. of bitstreams: 1 FranciscoMarcioBarboza_TESE.pdf: 8557102 bytes, checksum: 12d460591e55e242af090bdb4f4cfbb9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-01-25T13:26:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 FranciscoMarcioBarboza_TESE.pdf: 8557102 bytes, checksum: 12d460591e55e242af090bdb4f4cfbb9 (MD5) Previous issue date: 2017-11-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Invers?o em eletrorresistividade ? um problema inverso mal posto, porque diferentes realiza??es de um mesmo modelo podem satisfazer aproximadamente o mesmo crit?rio de ajuste. Se faz necess?rio portanto o uso de v?nculos para obter solu??es ?nicas e/ou est?veis ? pequenas perturba??es nas medidas. Contudo, em geral, a introdu??o de v?nculos tem ficado restrita aos casos de v?nculos diferenci?veis e que podem ser tratados com algoritmos de otimiza??o local. A modelagem direta 1D e 2D em resistividade DC ? computacionalmente barata, permitindo o uso de m?todos de otimiza??o global (GOMs) para resolver problemas inversos 1.5D e 2D com flexibilidade na incorpora??o de v?nculos. As modifica??es da fun??o de custo, seja na mudan?a de v?nculos ou no crit?rio de ajuste de dados, podem ser realizadas com facilidade, j? que cada termo da fun??o de custo ? devidamente normalizado para permitir a invari?ncia aproximada dos multiplicadores Lagrange. Os GOMs t?m potencial para suportar um ambiente computacional adequado para interpreta??o quantitativa em que a compara??o de solu??es que incorporam diferentes restri??es ? uma maneira de inferir caracter?sticas da distribui??o real da resistividade subterr?nea. Neste trabalho foram desenvolvidas: (i) Compara??o das performances dos m?todos Simulated Annealing (SA), Algoritmo Gen?tico (GA) e Particle Swarm Otmization (PSO) para resolver o problema inverso 1.5D na resistividade DC usando dados sint?ticos e de campo; (ii) Apresenta??o de uma abordagem de invers?o baseada no Particle Swarm Optimization (PSO) para os dados 2D de resistividade de corrente cont?nua (DC); (iii) Explora??o de v?rios v?nculos na varia??o de log da resistividade: continuidade espacial tanto nas normas L1 quanto L2, incluindo o caso de restri??o de varia??o apenas na dire??o horizontal, varia??o total e v?nculos de esparsidade usando transformada discreta do cosseno e bases de Daubechies. Al?m disso, exploramos o v?nculo de m?nimo momento de in?rcia, incluindo o caso de usar a superf?cie da Terra como eixo alvo, para impor a concentra??o de materiais resistivos ou condutores ao longo dos eixos alvo. Os principais resultados da compara??o para o case 1.5D s?o: a) todos os m?todos reproduzem bastante a distribui??o de resistividade de modelos sint?ticos, b) PSO e GA s?o muito robustos para mudan?as na fun??o de custo e SA ? comparativamente muito mais sens?vel, c) primeiro PSO e GA segundo apresentam o melhores desempenhos computacionais, exigindo um menor n?mero de modelos de encaminhamento do que SA, e d) GA mostra o melhor desempenho em rela??o ao valor final alcan?ado da fun??o de custo e seu desvio padr?o, enquanto a SA tem o pior desempenho neste aspecto. Igualmente importante para ambos os casos 1.5D e 2D, a partir dos crit?rios de parada do algoritmo PSO resulta n?o apenas a melhor solu??o, mas tamb?m um conjunto de quase-solu??es sub-?timas a partir dos quais as an?lises de incerteza podem ser realizadas. Como resultado, o int?rprete tem liberdade para realizar um processo de interpreta??o quantitativa com base em uma abordagem de invers?o de julgamento e erro, de forma semelhante, ele tem ao usar um software de modelagem avan?ado amig?vel, sendo capaz de conduzir a solu??o para incorporar suas concep??es sobre o ambiente geol?gico, al?m de avaliar o ajuste de dados e a estabilidade das solu??es obtidas. Apresentamos exemplos de dados sint?ticos e de campo para ambos os casos de invers?o. / Inversion in DC-resistivity is an ill-posed inverse problem because different realizations of the same model might satisfy approximately the same data fitting criterium. It is therefore necessary to use constraints to obtain unique and / or stable solutions to small perturbations in the measurements. However, in general, the introduction of constraints has been restricted to cases of differentiable constraints, which can be treated with local optimization algorithms. 1D and 2D modeling in DC-resistivity is computationally inexpensive, allowing the use of global optimization methods (GOMs) to solve 1.5D and 2D inverse problems with flexibility in constraint incorporation. Changes in the cost function, either in the constraints or data fitting criteria, can be easily performed, since each term of the cost function is properly normalized to allow the approximate invariance of the Lagrange multipliers. GOMs have the potential to support a computational environment suitable for quantitative interpretation in which the comparison of solutions incorporating different constraints is one way of inferring characteristics of the actual distribution of the underground resistivity. In this work, we developed: (i) comparison of the performances of the Simulated Annealing (SA), Genetic Algorithm (GA) and Particle Swarm Optimization (PSO) methods to solve the 1.5D inverse problem in DC resistivity using synthetic and field data; (ii) an inversion approach based on particle swarm optimization (PSO) to solve the 2D DC-resistivity inverse problem; (iii) exploration of several constraints in the variation of log-resistivity, including spatial continuity in both L1 andL2 norms, total variation and sparsity constraints using discrete cosine and Daubechies bases. In addition, we explore the minimum inertia constraint, including the case of using the Earth?s surface as the target axis, to impose the concentration of resistive or conductive materials along target axes. The main results of the comparison for the 1.5D case are: a) all methods reproduce quite well the resistivity distribution of synthetic models, b) PSO and GA are very robust to changes in the cost function and SA is comparatively much more sensitive, c) PSO first and GA second present the best computational performances, requiring smaller number of forwarding modeling than SA, and d) GA shows the best performance with respect to the final attained value of the cost function and its standard deviation, whilst SA has the worst performance in this aspect. Equally important for both 1.5 and 2D cases, from the stopping criteria of the PSO algorithm results not only the best solution but also a cluster of suboptimal quasi-solutions from which uncertainty analyses can be performed. As a result, the interpreter has freedom to perform a quantitative interpretation process based on a feedback trial-and-error inversion approach, in a similar manner he/she has when using a friendly forward modeling software, being capable of driving the solution to incorporate his/her conceptions about the geologic environment, besides appraising data fitting and stability of the obtained solutions. We present both synthetic and field data examples for all inversion cases.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-02-15T11:21:03Z No. of bitstreams: 1 MatheusFernandesTorquato_DISSERT.pdf: 2354339 bytes, checksum: 32d0b6ee431808fccf375481ef94b8a9 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-02-16T11:39:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 MatheusFernandesTorquato_DISSERT.pdf: 2354339 bytes, checksum: 32d0b6ee431808fccf375481ef94b8a9 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-02-16T11:39:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MatheusFernandesTorquato_DISSERT.pdf: 2354339 bytes, checksum: 32d0b6ee431808fccf375481ef94b8a9 (MD5) Previous issue date: 2017-12-01 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Os Algoritmos Gen?ticos (AGs) s?o utilizados para resolver problemas de busca e otimiza??o no qual, uma solu??o ?tima pode ser encontrada utilizando um processo iterativo e transi??es probabil?sticas. Todavia, dependendo do tipo de problema, o tempo para encontrar a solu??o pode ser elevado em m?quinas sequenciais devido ? complexidade computacional do algoritmo gen?tico. Assim, esse trabalho possui como objetivo o desenvolvimento de um prot?tipo associado a uma implementa??o paralela de um algoritmo gen?tico em FPGA (Field-programmable gate array). O principal objetivo do desenvolvimento dessa arquitetura ? a otimiza??o do tempo de processamento do sistema. Resultados associados com o tempo de processamento e a ?rea ocupada para v?rios tamanhos de popula??o foram analisados. Estudos relativos ? precis?o da resposta do algoritmo gen?tico para o problema de otimiza??o de fun??es com uma e duas vari?veis tamb?m foram analisados para a implementa??o em hardware. Todo projeto foi desenvolvido utilizando a plataforma de desenvolvimento System Generator da Xilinx tendo como FPGA alvo um Virtex-7 xc7vx550t-1ffg1158 FPGA. / Genetic Algorithms (GAs) are used to solve search and optimization problems in which an optimal solution can be found using an iterative process and using probabilistic transitions. However, depending on the type of problem, the time required to find a solution can be high in sequential machines due to the computational complexity of genetic algorithm. This work proposes a parallel implementation of a genetic algorithm on fieldprogrammable gate array (FPGA). Optimization of the system?s processing time is the main goal of this project. Results associated with the processing time and area occupancy (in FPGA) for various population size are analyzed. Studies concerning the accuracy of the GA response for the optimization of functions with one and two variables were also analyzed for the hardware implementation. The project was developed using the System Generator software (Xilinx development platform) and the Virtex-7 xc7vx550t-1ffg1158 FPGA.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-05-08T23:59:12Z No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-05-09T00:09:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T00:09:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DanielFerreiraDaCosta_DISSERT.pdf: 447435 bytes, checksum: 3f684603b1cf2fc0e045701ddabedf68 (MD5) Previous issue date: 2014-12-15 / A esp?cie Hancornia speciosa Gomes ? nativa do Brasil com ampla distribui??o no territ?rio nacional. Seu fruto ? bastante apreciado pelas popula??es locais, sendo utilizado para fabrica??o de doces, sorvetes e polpas. O crescimento urbano e a expans?o agr?cola favoreceram ? fragmenta??o das ?reas florestais onde a esp?cie ocorre, com a consequente redu??o do tamanho populacional, podendo ocasionar s?rias implica??es para a manuten??o da esp?cie a longo prazo. O objetivo deste estudo foi avaliar a diversidade gen?tica remanescente em sete popula??es de H. speciosa do estado do Rio Grande do Norte, ap?s selecionar marcadores de DNA entre repeti??es de sequ?ncias simples do genoma (ISSR). Na avalia??o da qualidade do DNA, o material gen?tico obtido a partir do caule apresentou pureza semelhante ao extra?do da folha, obtendo valores para a raz?o entre as absorv?ncias (A260/A280) de 1,46 para o caule e de 1,42 para a folha, ficando, ambos, um pouco abaixo do valor considerado ?timo que ? entre 1,5 e 2,5. O tecido caulinar apresentou DNA de qualidade para an?lises moleculares da esp?cie. Foram testados 19 primers ISSR onde seis foram selecionados (UBC 808, UBC 810, UBC 826, UBC 827, UBC 841, UBC 842) por apresentarem locos n?tidos, inequ?vocos e em maior n?mero, totalizando 63 locos, sendo que 30 (47,62%) apresentaram polimorfismo. O valor de PIC (conte?do de informa??es polim?rficas) para os primers selecionados atingiu a m?dia de 0,37, variando de 0,26 a 0,44, indicando que s?o ?teis para avaliar a diversidade gen?tica da esp?cie. Para o total das popula??es, o n?mero de locos polim?rficos foi de 57 (81,43%), com o n?mero total de alelos efetivos (Ne) 1,493. A diversidade gen?tica de Nei (He) foi de 0,287 e o ?ndice de Shannon (I) o valor de 0,429. Entre as popula??es o n?mero de locos polim?rficos foi considerado baixo, variando de 29 (41,43%) na popula??o Cotovelo, ? 33 (47,14%) em Maca?ba. Os ?ndices de diversidade He e I para cada popula??o variou respectivamente de 0,161 e 0,237 na popula??o Parque das Dunas ? 0,206 e 0,294 na popula??o Maca?ba. De acordo com a an?lise bayesiana os gen?tipos foram divididos em cinco grupos distintos (K = 5). Os padr?es observados para diversidade al?lica indicam a ocorr?ncia de gargalo gen?tico em todas as popula??es, de acordo com o modelo de passos de muta??o. O modelo de alelos infinitos revelou desequil?brio entre muta??o e deriva gen?tica apenas na popula??o Parque das Dunas. Os ?ndices de fluxo g?nico (Nm) revelaram troca de alelos entre todas as popula??es. Os resultados obtidos sugerem que a diversidade gen?tica est? distribu?da em diversas popula??es, sendo essencial a conserva??o das ?reas de sua ocorr?ncia para a manuten??o da diversidade gen?tica da esp?cie. / The Hancornia speciosa Gomes is a native of Brazil with wide distribution in the country. Its fruit is well appreciated by local people and is used for the manufacture of sweets, ice creams and pulps. Urban growth and agricultural expansion led to fragmentation forest areas where the species occurs, with a consequent reduction in population size, which can cause serious implications for the maintenance of long-term species. The objective of this study was to evaluate the remaining genetic diversity in seven populations of H. speciosa at Rio Grande do Norte state. In DNA's quality evaluation, the genetic material obtained from stems showed similar purity to the extracted sheet, obtaining values for the ratio between the absorbance (A260/A280) of 1.46 for the stem and 1.42 for the sheet, both were slightly below the value considered optimal which is between 1.5 and 2.5. The stem tissue showed DNA quality for molecular analyzes of the species. For the selection, 19 ISSR primers were tested, six of them were selected (UBC 808, UBC 810, UBC 826, UBC 827, UBC 841, UBC 842), for presenting clear locus, unambiguous and in great numbers, totaling 63 locus, and 30 (47.62%) showed polymorphism. The PIC value (polymorphic content information) for the selected primers averaged 0.37, ranging from 0.26 to 0.44, indicating that they are useful to evaluate the genetic diversity of the species. For the total population, the number of polymorphic locus was 57 (81.43%), with the total number of effective alleles (Ne) 1.493. The genetic diversity of Nei (He) was 0.287 and the Shannon index (I) was 0.429. Among populations the number of polymorphic locus was considered low, ranging from 29 (41.43%) in Cotovelo's population, to 33 (47.14%) in Maca?ba. The diversity indices He and I for each population ranged respectively 0.161 and 0.237 in Parque das Dunas's population to 0.206 and 0.294 in Maca?ba's population. According to the Bayesian analysis, the genotypes were divided into five groups (K = 5). The patterns observed in allelic diversity indicate the occurrence of bottleneck in all populations, according to the model of mutation steps. The infinite alleles model revealed imbalance between mutation and genetic drift only in the Parque das Dunas's population. The gene flow rates (Nm) revealed an exchange of alleles between all populations. The results suggest that genetic diversity is distributed among different populations, it is essential to conservation of areas of its occurrence to maintain the genetic diversity of the species.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-03T12:42:00Z No. of bitstreams: 1 AcassioRochaSantos_DISSERT.pdf: 9390259 bytes, checksum: d25d8e92963faba78cb36774741179e4 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-06T11:41:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 AcassioRochaSantos_DISSERT.pdf: 9390259 bytes, checksum: d25d8e92963faba78cb36774741179e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-06T11:41:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AcassioRochaSantos_DISSERT.pdf: 9390259 bytes, checksum: d25d8e92963faba78cb36774741179e4 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / O estudo te?rico de clusters met?licos tem despertado um interesse consider?vel, devido ? possibilidade de criar novas ligas de materiais em nanoescala, as chamadas "nanoligas". Pesquisas sobre nanoligas desempenham papel significativo na Ci?ncia de Materiais, pois, entre seus objetivos mais importantes, est?o o de prever a estabilidade das estruturas, seus modos de crescimento, bem como o de auxiliar a interpreta??o de medidas espectrosc?picas e outras medi??es experimentais. Nesse contexto, um grande n?mero de m?todos foi relatado nos ?ltimos anos para a otimiza??o do m?nimo global de grupos at?micos e moleculares, sendo um dos mais utilizados atualmente o do Algoritmo Gen?tico (doravante, GA), o qual baseia-se em princ?pios relacionados a processos evolutivos, em operadores inspirados na Teoria da Evolu??o e na Gen?tica, isto ?, na recombina??o, muta??o e sele??o natural. Particularmente, o GA com a implementa??o do potencial Gupta tem se mostrado eficiente na busca de solu??es ??timas? em problemas de otimiza??o de clusters met?licos. Esta disserta??o ? composta por cap?tulos de introdu??o, de metodologia, de abordagem te?rica (Cap. 1, 2 e 3); e tamb?m por cap?tulos que cont?m artigos sobre o tema proposto (Cap. 4, 5 e 6). No primeiro artigo (Cap. 4), analisaram-se clusters bimet?licos AlxNay (x+y?55) por meio da aplica??o do GA com a implementa??o do potencial Gupta. Com base tamb?m na aplica??o do GA, no segundo cap?tulo (Cap. 5) foram estudados clusters de AlxLiy e AlxKy (x+y ? 55). Em ambos os trabalhos, para elevar a efici?ncia do GA, introduziu-se mais dois operadores: o Aniquilador e o Hist?ria. Ao serem comparadas as estruturas obtidas por meio do GA com potencial Gupta para clusters de alum?nio puro, l?tio puro e alum?nio-l?tio com resultados recentes da literatura, verificou-se que para os sistemas Al2, Al3, Al6, Al8, Al9, Li5, Li6, Li7, Al1Li5, Al1Li7 e Al1Li8 as geometrias obtidas foram muito semelhantes ?quelas resultantes de c?lculos de funcional de densidade e ab initio[como CCSD(T)]. No terceiro artigo (Cap. 6), analisou-se um novo algoritmo gen?tico qu?ntico (Q-GA) para pequenos sistemas de clusters NaxLiy com (x+y ? 10). Constatou-se que o Q-GA apresenta maior efici?ncia na busca do m?nimo global em rela??o ao GA com o potencial Gupta. Isso porque o primeiro utiliza m?todo qu?ntico, enquanto o segundo usa um m?todo cl?ssico. Por ser mais preciso, o Q-GA possui uma abrang?ncia menor. Neste artigo, al?m de c?lculos ab inito, tamb?m foram realizados c?lculos topol?gicos a partir da Teoria Qu?ntica de ?tomos em Mol?culas (QTAIM) para as estruturas Na1Li5, Na2Li4, Na3Li3, Na4Li2 e Na5Li1, obtidas pelo Q-GA. Nessas estruturas, chama a aten??o o fato de n?o haver caminho de liga??o envolvendo diretamente os metais, sendo unidos por pseudo?tomos, com exce??o do Na5Li1. Algumas intera??es at?micas n?o foram indicadas pelo caminho de liga??o e sua an?lise foi feita pelo ?ndice de deslocaliza??o (DI). No sistema Na1Li5, os pares at?micos Na1-Li2 e Na1-Li6 t?m as intera??es mais fortes (e equivalentes ? do sistema NaLi) de todos os pares Na-Li de todos clusters NaxLiy(x+y=6); ao mesmo tempo, os outros pares Na-Li t?m intera??es dez vezes mais fracas do que aquelas do sistema NaLi. As intera??es Na-Na dos clusters Na4Li2 e Na5Li1 s?o as mais fortes quando comparadas com sistemas puros. Por fim, verificou-se que a f?rmula do grau de degeneresc?ncia do ?ndice de aromaticidade D3BIA e a carga at?mica indicaram que os ?tomos de l?tio mais pr?ximo ao ?tomo de s?dio transferem carga para esse ?ltimo. / The theoretical study of metal clusters has drawn considerable interest due to the possibility of creating new alloys from materials in nanoscale, the so-called "nanoalloys". Research on nanoalloys has had an important role in materials science, since, among some of its most relevant objectives, we may find the prediction of stability in structures, their manners of growth and further assistance in the interpretation of spectroscopic and other experimental measures. In this context, several methods have been reported in the last few years towards the global minimum optimization of atomic and molecular groups, where the Genetic Algorithm (henceforth GA) is currently considered one of the most used methods, whilst based on principles related to evolutionary processes as well as operators inspired by the Theory of Evolution and Genetics, i. e., by recombination, mutation and natural selection. The GA method in particular, and altogether with the implementation of the Gupta potential, has become efficient in the search for ?optimal? solutions for optimization problems in metallic clusters. The present dissertation is composed of chapters consisting of introduction, methodology and theoretical considerations (Chap. 1, 2 and 3), as well as of chapters containing articles on the proposed subject (Chap. 4, 5 and 6). In the first article (Chap. 4), we may find the analysis of AlxNay (x + y ? 55) bimetallic clusters through the Genetic Algorithm method with the implementation of the Gupta potential. Also based on the GA application, in the following chapter (Chap. 5) we may find a study regarding AlxLiy e AlxKy (x+y ? 55) clusters. In both works, in order to improve GA efficiency, two additional operators have been introduced: Annihilator and History. By being compared to structures obtained by means of GA with Gupta potential for pure aluminum, pure lithium and aluminum-lithium clusters in recent results from literature, it has been verified that, regarding systems Al2, Al3, Al6, Al8, Al9, Li5, Li6, Li7, Al1Li5, Al1Li7 e Al1Li8, the obtained geometries were very similar to those resulting from density functional and ab initio calculations [such as CCSD(T)]. In the third chapter (Chap. 6), we analyzed a new quantum genetic algorithm (QGA) for small cluster systems NaxLiy with (x+y ? 10). It has been observed that Q-GA presents an improved efficiency towards a global minimum regarding the GA with the Gupta potential. That has been the case since the former uses the quantum method, while the latter uses a classic method. More specifically, the Q-GA has a narrower scope. In this article, besides ab initio calculations, topological calculations were performed as well, grounded on the Quantum Theory of Atoms in Molecules (QTAIM) for the structures Na1Li5, Na2Li4, Na3Li3, Na4Li2 e Na5Li1 obtained by the Q-GA. In these structures, it is evident that there is no bonding path between the metals, since they are bonded by pseudo atoms, with the exception of the Na5Li1. Some of the atomic interactions have not been suggested by the bonding path, being their analysis performed according to the delocalization index (DI). In the Na5Li1 system, the atomic pairs Na1-Li2 and Na1-Li6 have the strongest interactions (equivalent to the NaLi system) of all Na-Li pairs in all of the NaxLiy (x+y=6) clusters; concurrently, other Na-Li pairs bear interactions ten times weaker than those from the NaLi system. The Na-Na interactions from the clusters Na4Li2 e Na5Li1 are stronger when compared to pure systems. Finally, it has been verified that the degree of degeneracy formula of the aromaticity index D3BIA and the atomic charge suggest that the lithium atoms that are closer to the sodium atom transfer charge to the latter.

Submitted by PPG Gerontologia Biom?dica (geronbio@pucrs.br) on 2017-12-11T16:22:38Z No. of bitstreams: 1 JACONDINO_BITTENCOURT_CAMILA_TESE.pdf: 3976957 bytes, checksum: f39c098e5a7074b67c812ed17b136305 (MD5) / Approved for entry into archive by Caroline Xavier (caroline.xavier@pucrs.br) on 2017-12-18T13:48:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 JACONDINO_BITTENCOURT_CAMILA_TESE.pdf: 3976957 bytes, checksum: f39c098e5a7074b67c812ed17b136305 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-18T13:52:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 JACONDINO_BITTENCOURT_CAMILA_TESE.pdf: 3976957 bytes, checksum: f39c098e5a7074b67c812ed17b136305 (MD5) Previous issue date: 2017-08-25 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Aging is becoming a reality in Brazil, as well as an increase in chronic no communicable diseases, among which depression is among the most frequent mental disorders in the population over 60 years. The causes of this mood disorder are multi factorial, and recent research points to a decrease in oxytocin, a neuropeptide, which acts as a neurotransmitter and neuromodulator, plays an important role in social behavior. The gene for its receptor (OXTR) is located on the short arm of the human chromosome 3p25, and a single nucleotide variation (rs2254298), have been linked with the emergence of mood disorders. Due to a point mutation, the guanine (G) was replaced by adenine (A), causing the G allele carriers to be favored by the behavioral relations. On the other hand, absence or a poor or ineffective social network, low self-esteem, associated with aging, OXTR polymorphism and depression may increase cardiovascular risk factors (CRF), making the elderly more susceptible to a negative outcome. PURPOSE: to analyze the association of oxytocin receptor gene polymorphism (2254298) with depression, social support, self-esteem and cardiovascular risk factor (CVRF). METHODS: A cross-sectional study carried out with a population of elderly people from the basic care of Porto Alegre, with and without depression, diagnosed by the Brazilian version of Mini International Neuropsychiatric Interview (MINI Plus), DNA extraction was performed from the leukocyte layer, and Genotyping by the Polymerase Chain Reaction and Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) technique, and the digestion fragments were run with agarose gel stained with ethidium bromide. Self-esteem and social emotional / affective support were verified through the Rosemberg and Griep Social Support scales respectively. Hypertension, diabetes mellitus (DM), dyslipidemia, obesity, sedentary lifestyle and smoking were the CVRF investigated, and the metabolic variables investigated were triglycerides and postprandial glucose concentration by capillary puncture. Body mass index (BMI) and waist circumference and blood pressure were also measured. The hormones oxytocin and cortisol were obtained through the serum and measured by the ELISA technique. RESULTS: The sample consisted of 177 elderly people of basic care in Porto Alegre, mean age 72.6 ? 6.9, of which 129 (72.9%) were female. 66 (37.3%) had a diagnosis of depression, there was no association between OXTR rs 2254298 with depression, social support, self-esteem and CVRF. In the Poisson regression analysis, it was observed that the self-esteem (p = 0.031), and the social interaction domain (p = 0.037). A negative correlation was observed between serum oxytocin and BMI (p = 0.019) and postprandial triglycerides, (p = 0.035). The elderly classified as lean by Lipschitz criterion had significantly higher oxytocin averages (p = 0.005) and this relationship was maintained by regression analysis (p = 0.010). CONCLUSIONS: The results suggest that the OXTR polymorphism (rs 2254298) is not associated with depression, social support, self-esteem, and cardiovascular risk factors in this sample. The final multivariate analysis showed a higher frequency of depression in individuals with lower self-esteem and social interaction; and the elderly with higher levels of serum oxytocin had lower BMI, and those with lower concentration of this hormone, higher postprandial TGC. / O envelhecimento est? se tornando uma realidade no Brasil, assim como o aumento das doen?as cr?nicas n?o transmiss?veis, dentre as quais a depress?o est? entre as patologias mentais mais frequentes na popula??o acima de 60 anos. As causas deste transtorno de humor s?o multifatoriais, e pesquisas recentes apontam a diminui??o da ocitocina, um neuropept?dio, que agindo como neurotransmissor e neuromodulador, exerce um importante papel no comportamento social. O gene do seu receptor (OXTR) est? localizado no bra?o curto do cromossomo humano 3p25, e uma varia??o de nucleot?deo ?nico (rs2254298), possui uma estreita rela??o, com o surgimento de transtornos do humor. Devido a uma muta??o pontual, houve a substitui??o da guanina (G) por adenina (A), fazendo com que os portadores do alelo G, sejam favorecidos pelas rela??es sociais e afetivas. Por outro lado, a aus?ncia ou uma rede social pobre ou ineficaz, baixa autoestima, morbidades caracter?sticas do envelhecimento, polimorfismo do OXTR e depress?o podem ampliar os fatores de risco cardiovascular (FRCV), tornando o idoso mais suscept?vel a um desfecho negativo. OBJETIVO: Analisar a associa??o do polimorfismo do gene do receptor da ocitocina rs (2254298) com depress?o, apoio social, autoestima e fatores de risco cardiovascular (FRCV) em idosos da aten??o prim?ria de Porto Alegre. M?TODOS: Estudo transversal realizado com uma popula??o de idosos provenientes da aten??o b?sica de Porto Alegre, com e sem depress?o, diagnosticados pela vers?o brasileira do Mini International Neuropsychiatric Interview, (M.I.N.I Plus). A extra??o de DNA foi realizada a partir da camada de leuc?citos, e a genotipagem pela t?cnica de Polymerase Chain Reaction and Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP), e os fragmentos da digest?o foram corridos com gel de agarose corados com brometo de et?dio. A autoestima e o suporte s?cio emocional/afetivo foram verificados atrav?s das escalas de Rosemberg e Apoio Social de Griep respectivamente. A hipertens?o arterial (HAS), diabetes mellitus (DM), dislipidemia, obesidade, sedentarismo e tabagismo foram os (FRCV) investigados, e as vari?veis metab?licas averiguadas foram os triglicer?deos (TGC) e glicemia p?s-prandial, por pun??o capilar. O ?ndice de massa corporal (IMC) e circunfer?ncia da cintura e a press?o arterial tamb?m foram mensurados. Os horm?nios ocitocina e cortisol foram obtidos atrav?s do soro e mensurados atrav?s da t?cnica de ELISA. RESULTADOS: A amostra foi composta por 177 idosos da aten??o b?sica de Porto Alegre, com m?dia de idade 72,6?6,9 anos, sendo 129 (72,9%) do sexo feminino. Do total de idosos, 66 (37,3%) possuem o diagn?stico de depress?o, n?o foi observada associa??o entre o OXTR rs 2254298 com o epis?dio depressivo maior, apoio social, autoestima e os (FRCV). Na an?lise de regress?o de Poisson observou-se que a autoestima (p=0,031), e o dom?nio de intera??o social (p=0,037) mantiveram-se associados como desfecho para a depress?o. Foi verificada uma correla??o negativa entre a ocitocina s?rica com o IMC (p=0,019) e (TGC) p?s-prandial, (p=0,035). Os idosos classificados como magros pelo crit?rio de Lipschitz, apresentaram significativamente maiores m?dias de ocitocina, (p=0,005) e esta rela??o manteve-se associada pela an?lise de regress?o (p=0,010). CONCLUS?O: Os resultados sugerem que o polimorfismo do OXTR (rs 2254298) n?o est? associado com depress?o, apoio social, autoestima e (FRCV). O modelo final da an?lise multivariada mostrou maior frequ?ncia de depress?o em indiv?duos com menor autoestima e intera??o social; e os idosos com n?veis mais elevados de ocitocina s?rica apresentaram menor IMC, e os com menor concentra??o deste horm?nio, maior TGC p?s-prandial.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 401555.pdf: 2665347 bytes, checksum: 54a1f015b8e051e3e55fe6965ea02f9d (MD5) Previous issue date: 2008-04-09 / Introdu??o: A forma??o do co?gulo de fibrina no s?tio de les?o endotelial constitui um processo crucial para a manuten??o da integridade vascular. Por?m, os mecanismos do sistema hemost?tico devem ser regulados para, simultaneamente, contrapor-se ? perda excessiva de sangue e evitar a forma??o de trombos intravasculares, decorrentes de forma??o excessiva de fibrina. Por isso, um equil?brio entre a coagula??o e a fibrin?lise ? essencial. O ativador do plasminog?nio tecidual (t-PA) ? o principal ativador do sistema fibrinol?tico derivado de c?lulas endoteliais, desempenhando importante papel na fibrin?lise. Nos ?ltimos anos, tem sido estudada a rela??o entre o polimorfismo de inser??o e dele??o (I/D) de uma sequ?ncia Alu do gene t-PA e o risco de desenvolver doen?as relacionadas ao sistema cardiovascular, como infarto do mioc?rdio e trombose venosa, em diferentes popula??es do mundo. Objetivo: Esse estudo tem por objetivo pesquisar a rela??o entre o polimorfismo de inser??o/dele??o do gene t-PA e trombose venosa (TV), comparando um grupo de indiv?duos com epis?dio de tromboembolismo pulmonar (TEP) ou trombose venosa profunda (TVP) e um grupo de indiv?duos sem hist?ria de TV. Materiais e M?todos: Foram avaliados 89 indiv?duos com epis?dio de tromboembolismo venoso (grupo caso) e 81 indiv?duos sem hist?rico de doen?a tromboemb?lica (grupo controle). O gen?tipo do t-PA foi determinado por rea??o em cadeia da polimerase (PCR). Todas as amostras identificadas como gen?tipo DD eram confirmadas mediante a realiza??o de uma nova PCR utilizando um primer interno que reconhece e hibridiza especificamente na seq??ncia de inser??o, possibilitando uma identifica??o precisa dos gen?tipos. Resultados: A freq??ncia do alelo D foi de 41,6% entre os pacientes e 46,9% entre os controles; a do alelo I foi 58,4% e 53,1%, respectivamente. O gen?tipo DD foi encontrado em 14,6% dos pacientes e 17,3% dos controles, e o gen?tipo ID, em 53,9% dos casos e 59,3% dos controles. Os homozigotos II representaram 31,5% dos indiv?duos do grupo caso e 23,4% dos indiv?duos do grupo controle. Discuss?o e Conclus?es: N?o foi observada diferen?a estatisticamente significante entre os gen?tipos do gene t-PA nos grupos de indiv?duos estudados. No entanto, o gen?tipo II foi mais freq?ente no grupo caso do que no grupo controle, sugerindo uma tend?ncia de associa??o entre o gen?tipo II do gene t-PA e o desenvolvimento de doen?as tromboemb?licas. N?o foram encontrados dados na literatura sobre a freq??ncia do polimorfismo I/D do gene t-PA na popula??o brasileira. Este relato representa, portanto, o primeiro relato sobre a freq??ncia deste polimorfismo no Brasil, em grupos de indiv?duos com e sem hist?rico de trombose, contribuindo para o conhecimento da rela??o entre este polimorfismo e tromboembolismo venoso (TEV)

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 409998.pdf: 638895 bytes, checksum: 9abf7327c0b1c2233d7c0064062f2d9a (MD5) Previous issue date: 2009-03-06 / O Fator de Necrose Tumoral (TNF)-a ? uma citocina proinflamat?ria multifuncional, com efeitos no metabolismo de lip?deos, na coagula??o sangu?nea e na fun??o endotelial. Diferentes estudos sugerem que pacientes com o gen?tipo - 308AA, do SNP -308G>A do gene TNF-a, possuiriam n?veis mais elevados de TNFa no plasma, levando o sistema imune a uma resposta inapropriada e aberrante frente a uma infec??o, o que poderia aumentar o risco de sepse, choque s?ptico ou disfun??o org?nica. O objetivo deste estudo foi comparar as condi??es cl?nicas (disfun??es org?nicas) e a freq??ncia de sepse, choque s?ptico e mortalidade em pacientes cr?ticos internados em uma Unidade de Terapia Intensiva (UTI), quanto ? pacientes com e sem o alelo -308A do TNF-a. Foram utilizados dados cl?nicos e demogr?ficos (idade, g?nero, tempo de interna??o, mortalidade durante a perman?ncia total no hospital, escores APACHE II e SOFA), e genotipagem dos pacientes para o SNP -308G>A do TNF-a por PCR-RFLP. Um total de 437 pacientes cr?ticos internados na UTI do Hospital S?o Lucas da PUCRS (Porto Alegre, Brasil) foram avaliados. As freq??ncias genot?picas -308GG= 0.71 (n=312); -308GA=0.28 (n=120); -308AA=0.01 (n=5); e al?licas -308G=0.85 e -308A=0.15 n?o diferiram dos valores esperados pelo modelo de Equil?brio de Hardy-Weinberg (P=0.211). Do total, 297 (68%) pacientes desenvolveram sepse e 212 (48%) choque s?ptico. Nenhuma diferen?a significativa foi encontrada entre pacientes -308GG (n=312; 71%) e - 308GA+AA (n=125; 29%) quanto ? suscetibilidade a sepse, choque s?ptico, fal?ncia org?nica ou mortalidade. Os resultados mostram que SNP -308G>A do TNF-a n?o tem efeito sobre as condi??es cl?nicas e na susceptibilidade ? sepse e choque s?ptico ou na mortalidade dos pacientes em estado cr?tico de sa?de.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:50:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 412181.pdf: 1636756 bytes, checksum: 3138ac69bb4f361c6d1b29069af27d7a (MD5) Previous issue date: 2009-03-26 / O Toll-like receptor 2 (TLR2) ? um receptor de reconhecimento de microorganismos que identifica um amplo repert?rio de padr?es moleculares associados a pat?genos. Entre os polimorfismos j? descobertos no gene que codifica para o TLR2, dois SNPs (single nucleotide polimorphism) (supposed-2029C>T e 2258G>A) podem estar relacionados com a redu??o da ativa??o do NF-kB e, consequentemente, com o aumento do risco ?s doen?as infecciosas. O objetivo deste estudo foi investigar os SNPs supposed-2029C>T e 2258G>A do TLR2 em 422 pacientes criticamente doentes oriundos de uma popula??o do sul do Brasil (295 com sepse e 127 sem sepse), e realizar uma revis?o sistematizada de 33 trabalhos publicados sobre esses SNPs conduzindo um estudo de avalia??o de qualidade com um sistema de escores. Entre os pacientes admitidos no estudo foi encontrado apenas um heterozigoto (0,2%; 1/422) para o SNP supposed-2029C>T e nenhum para o SNP 2258G>A (0%; 0/422). Assim, n?o foi poss?vel identificar qualquer aplicabilidade cl?nica entre esses SNPs do TLR2 nos pacientes cr?ticos do sul do Brasil. A revis?o sistematizada detectou que os atuais trabalhos com tais SNPs do TLR2 apresentam conclus?es controversas e contradit?rias resultantes de estudos com uma ampla variedade de crit?rios de qualidade. Os resultados sugerem que, quando analisados individualmente, os SNPs supposed-2029C>T e 2258G>A n?o s?o bons candidatos para os trabalhos que buscam por aplica??es cl?nicas diretas entre gen?tipo e fen?tipo. Esfor?os futuros para aumentar o conhecimento e para realizar an?lises simult?neas com outros polimorfismos poder?o revelar efeitos mais efetivos do TLR2 na susceptibilidade ?s doen?as infeciosas.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438120.pdf: 2337312 bytes, checksum: 3bcbd6b2d333489c6e0cefb866d0b73c (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 / Ewing s sarcoma was first described by James Ewing in 1921 and it is the second most common bone tumor in children and young adults. Both chromosomal breakage and translocation occur in this sarcoma. The EWS gene is localized in chromosome 22 and is involved in this translocation. However, little is known about this gene breaking region and what sequences could be involved in higher chromosomal break susceptibility. In this study we aimed to investigate three SNPs in the EWS gene breaking region in a healthy subjects population and in Ewing s sarcoma patients. Genotyping was performed by TaqMan? assay for allelic discrimination using Real-Time PCR System. We conducted analysis of allelic and genotypic frequencies, as well as association and transmission disequilibrium tests. According to our results, the control group showed similar and different genotypes distribution of all SNPs when compared to other populations studied by different projects, which shows how important it is to know the frequencies of our population. To test the hypothesis that some SNP, SNParrangement or haplotype could influence in the susceptibility to develop Ewing s sarcoma, we compared affected with non-affected individuals using association studies. The results showed one significant difference: a higher presence of homozygote T-rs4820804 in Ewing s Sarcoma patients. Transmission Disequilibrium Test (TDT) was performed to compare data from Ewing s Sarcoma patients and from their families but no statistically significant result was found. In conclusion, we find that the TT-rs4820804 EWS genotype can be associate with Ewing s sarcoma and that the rs4820804 SNP can be a candidate to understand the EWS breakage susceptibility. / O sarcoma de Ewing foi primeiramente descrito por James Ewing em 1921 e ? o segundo tumor ?sseo mais frequente em crian?as, adolescente e adultos jovens. Neste sarcoma, ? comum ocorrer a quebra e a transloca??o cromoss?mica. Dentre os genes envolvidos nesta transloca??o est? o gene EWS, localizado no cromossomo 22. Entretanto, pouco se sabe a respeito da regi?o de quebra deste gene e quais sequ?ncias poderiam levar a uma maior susceptibilidade a quebra cromoss?mica. Sendo assim, o objetivo deste trabalho foi investigar tr?s polimorfismos de base ?nica (SNPs) presentes na regi?o de quebra do gene EWS, em uma popula??o de indiv?duos saud?veis e em pacientes afetados pelo Sarcoma de Ewing. A genotipagem para os SNPs selecionados foi realizada usando TaqMan SNP Genotyping Assay pelo sistema de PCR em tempo real. N?s realizamos an?lises de frequ?ncias al?licas e genot?picas, assim como um estudo de associa??o e de desequil?brio de transmiss?o. A compara??o das frequ?ncias al?licas e genot?picas entre as popula??es deste estudo e entre popula??es de projetos j? publicados mostrou particularidades entre as popula??es, revelando a import?ncia de se conhecer tais frequ?ncias na popula??o de estudo. Para testar a hip?tese de que algum SNP, hapl?tipo ou combina??o espec?fica de SNPs poderia influenciar na susceptibilidade ao Sarcoma de Ewing, comparamos afetados com n?o-afetados realizando estudos de associa??o cujos resultados mostraram uma ?nica diferen?a significativa: a maior incid?ncia no gen?tipo TT-rs4820804 entre os afetados pelo Sarcoma de Ewing. O Teste de Desequil?brio de Transmiss?o (TDT) comparou os dados dos pacientes afetados e os dados de seus familiares, mas nenhum resultado significativo foi encontrado. Em conclus?o, o gen?tipo TT-rs4820804 pode estar associado ao Sarcoma de Ewing e o SNP rs4820804 pode ser candidato para aux?lio do entendimento da susceptibilidade de quebra do gene EWS.

Made available in DSpace on 2015-04-14T14:51:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 438127.pdf: 909961 bytes, checksum: 5f9f40febc8291b363b759367f823d98 (MD5) Previous issue date: 2012-03-30 / In this study the SNPs rs640098, rs491714, rs611307 into the FLI1 gene were genotyped in a sample of 201 subjects from southern Brazilian population, in 24 Ewing s sarcoma patients (geographically matched with control group) and 54 of their family members, including parents and siblings. We performed association studies comparing genotypic frequencies of rs640098, rs491714, rs611307 into the FLI1 gene, and all possible genotype combinations between Ewing s Sarcoma patients and control group. Of the three SNPs investigated individually, only one of them showed a significant result when compared to the control group; our non-combined analysis revealed a significantly higher presence of homozygote A-rs497714 among Ewing s Sarcoma patients (p=0.0065; Chi square Test). In all other tested clusters, we always noticed a higher rate of homozygote A-rs497714 among Ewing s Sarcoma patients independent of the other SNP-arrangements and/or haplotype combinations. In addition, we performed transmission disequilibrium tests comparing data from Ewing s Sarcoma patients and from their families (parents and siblings), but no statistically significant result was found. In conclusion, the present study provides evidence statistically founded that the AA-rs497714 FLI1 genotype can associated with Ewing's sarcoma. And that this polymorphism can be clinically useful as a potential genetic marker to the prognostic of risk to develop this cancer or to provide insights into FLI1 chromosome breakage context of tumorigenesis. / Neste estudo, os SNPs rs640098, rs491714, rs611307 no gene FLI1 foram genotipados em uma amostra de 201 indiv?duos da popula??o do sul do Brasil, e em 24 pacientes portadores de Sarcoma Ewing (geograficamente comparado com grupo controle) e 54 de seus familiares, incluindo pais e irm?os. Realizamos estudos de associa??o, comparando as freq??ncias genot?picas do rs640098 e rs491714 e rs611307 no gene FLI1, e todas as combina??es poss?veis entre o gen?tipo de pacientes Sarcoma de Ewing e grupo controle. Dos tr?s SNPs investigados individualmente, apenas um deles apresentou um resultado significativo quando comparado com o grupo controle; nossa an?lise n?o-combinada revelou uma presen?a significativamente maior de homozigoto A-rs497714 entre os pacientes de Sarcoma Ewing (p = 0,0065; Chi quadrado). Em todos os outros grupos testados, foi notada uma maior taxa de homozigoto A-rs497714 entre os pacientes com Sarcoma de Ewing, independentemente dos outros arranjos e / ou combina??es de SNP e hapl?tipos. Al?m disso, foram realizados testes de desequil?brio de transmiss?o, comparando dados de pacientes portadores de Sarcoma de Ewing e de suas fam?lias (pais e irm?os), mas nenhum resultado estatisticamente significativo foi encontrado. Em conclus?o, o presente estudo fornece evid?ncias estatisticamente fundada de que o gen?tipo AA-rs497714 FLI1 pode associado ao sarcoma de Ewing. E que este polimorfismo pode ser clinicamente ?til como um potencial marcador gen?tico para o progn?stico de risco para desenvolver este c?ncer ou para fornecer insights no contexto de quebras cromoss?micas de tumorig?nese no gene FLI1.