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Capacidade produtiva e progresso genético de pinhão-manso (Jatropha curcas L.)

Borges, Catiele Vieira 15 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2015-04-11T13:55:49Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Catiele Vieira Borges.pdf: 1231779 bytes, checksum: d72dab79964f3c9da27e72040b426932 (MD5) Previous issue date: 2012-02-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The jatropha (Jatropha curcas L., Euphorbiaceae), is a perennial cycle plant whose attentions in the last six years has directed its capacity for vegetable oil. Given their biological attributes, agronomic, economic and industrial, the species is one of oleaginous on the agenda of government interest, which through the National Program for Production and Use of Biodiesel has intensified the search for new bioenergy sources. However, this is still oleaginous phase of domestication and quest for technological mastery. Meet the productive potential, the relationship between characters, the genetic variability and infer genetic parameters have directed in recent years, most quantitative genetic studies and breeding in Brazil. Therefore, the aim of the present study was to estimate genetic parameters and predict random variables important to the strategies of selection and breeding; meet the minimum harvest / measurements needed to choose jatropha trees; estimate genotypic and phenotypic correlations; evaluate the progress of genetic grain production and to study the genetic variability. Was evaluated for 24 months at the experimental farm of Embrapa, in Porto Velho - RO, an experiment with three full blocks, four provenances (two of Rondônia, one of Minas Gerais and São Paulo) with 16 trees per plot, spaced 2x3 meters. The traits associated with grain yield and plant architecture. The great genetic evaluation procedure REML/BLUP was used for the prediction of random variables, genetic parameter estimation and inference about repeatability. Inferences about variance components and estimates of genetic parameters for some agronomic traits during the first two years of development of Jatropha curcas, showed genetic variability exists. The numbers of fruits per bunch and maturation index showed little characters are informative and useful in quantitative genetic studies. The stabilization genotypic characters for number of clusters at harvest of half a year, number of branches, height, crown projection in greater spacing and canopy volume was obtained with equal or less than three measurements per year. Already for grain yield and number of clusters at harvest year end, required a greater number of measurements (mi > 4). High correlations (r.) were obtained genotypic and phenotypic characters among themselves for grain yield, its components and those characters associated with plant architecture (r.  0.75). Predicted genetic gains for grain production of the first two years of planting were respectively higher than 20%, considering the selection of the ten best individuals. When considering the two growing seasons for variable grain production, most plants exhibited average performance (adaptability) generally indicated as the centroid method. Considering the information of the individual additive effects, genetic diversity was not necessarily linked to geographical origin, as plants of different provenances formed groups. At the level of individuals, formed several genetically divergent groups. / O pinhão-manso (Jatropha curcas L., Euphorbiaceae), é uma planta de ciclo perene cujas atenções nos últimos seis anos tem se dirigido a sua capacidade para produção de óleo vegetal. Dado a seus atributos biológicos, agronômicos, econômicos e industriais, a espécie é uma das oleaginosas em pauta de interesse do governo, que por meio do Programa Nacional de Produção e Uso do Biodiesel tem intensificado a busca por novas fontes bioenergéticas. Contudo, essa oleaginosa ainda encontra-se em fase de domesticação e busca por domínio tecnológico. Conhecer o potencial produtivo, a relação entre caracteres, a variabilidade genética e inferir sobre parâmetros genéticos têm direcionado, nos anos recentes, a maioria dos estudos genéticos quantitativos e de melhoramento no Brasil. Portanto, objetivou-se no presente estudo estimar parâmetros genéticos e predizer variáveis aleatórias importantes às estratégias de seleção e melhoramento; conhecer o período mínimo de colheita/mensurações necessário para selecionar árvores de pinhão-manso; estimar correlações genotípicas e fenotípicas; avaliar o progresso genético da produção de grãos e estudar a variabilidade genética. Foi avaliado durante 24 meses na fazenda experimental da Embrapa, em Porto Velho RO, um experimento com três blocos completos, quatro procedências (duas de Rondônia, uma de Minas Gerais e uma de São Paulo) com 16 árvores úteis por parcela, espaçadas 2x3 metros. Foram avaliados os caracteres associados à produção de grãos e de arquitetura da planta. O procedimento ótimo de avaliação genética REML/BLUP foi usado para a predição de variáveis aleatórias, estimação de parâmetros genéticos e inferência sobre a repetibilidade. As inferências sobre os componentes de variância e as estimativas de parâmetros genéticos para alguns caracteres agronômicos, durante os dois primeiros anos de desenvolvimento do pinhão-manso, mostraram existir variabilidade genética. Os números de frutos por cacho e índice de maturação mostraram serem caracteres pouco informativos e úteis nos estudos genéticos quantitativos. A estabilização genotípica para os caracteres número de cachos, na colheita do meio ano, número de ramos, altura, projeção da copa no maior espaçamento e volume de copa, foi obtida com número igual ou inferior a três medições anuais. Já para a produção de grãos e número de cachos, na colheita do final do ano, exigiu-se maior número de mensurações (mi > 4). Elevadas correlações (r.) genotípicas e fenotípicas foram obtidas entre si para os caracteres de produção de grãos, seus componentes e aqueles caracteres associados à arquitetura da planta (r.  0,75). Ganhos genéticos preditos para a produção de grãos dos dois primeiros anos de plantio foram respectivamente superiores a 20%, considerando a seleção dos dez melhores indivíduos. Ao se considerar os dois anos agrícolas para a variável produção de grãos, a maioria das plantas exibiram médio desempenho (adaptabilidade) geral, conforme indicou o método do centroide. Ao se considerar as informações dos efeitos aditivos individuais, a diversidade genética não esteve necessariamente associada à origem geográfica, pois plantas de diferentes procedências formaram grupos. Em nível de indivíduos, formaram-se vários grupos divergentes geneticamente.
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Progresso genético para produção de grãos obtido em doze anos de melhoramento da população elite de arroz de terras altas / Genetic progress for grain yield obtained in twelve years of improvement in elite population of upland rice

Barros, Matheus Souza de 10 August 2015 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:23:20Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-18T14:23:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-18T14:23:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Matheus Souza de Barros - 2015.pdf: 1949086 bytes, checksum: 889a6c45d4ce66700cc7ff366ef3caed (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The genetic improvement resulted from plant breeding acts decisively in maintaining the supply of agricultural foods like rice. The contribution of this genetic improvement to increase productivity is expressed in many crops by genetic progress which represents the genetic changes in the course of the selection cycles, and promotes the advance of genotypic average towards selection. Among the strategies adopted to increase the gain by selection, the early generation selection proves to be promising. This work has aimed to evaluate the genetic potential for selecting upland rice progenies and estimate the genetic progress for grain yield. The data used in this study were obtained from the progeny yield trials conducted in the period of eleven agricultural years 2002/03 to 2012/13 conducted by Embrapa Rice and Beans. The traits analyzed were grain yield (kg ha-1), plant height (cm) and days to flowering (day). In each year of the experiment, a group of progeny was tested in four to six sites. It was used Federer's augmented block design without replication per site in seven years and with at least three checks, in four years of the series were used two replications. The experimental data within each year were submitted to joint analysis. A mixedeffects linear model was applied for estimating the components of variance by the method of restricted maximum likelihood (REML). From this estimate of the components, it was calculated the genetic and phenotypic parameters, in addition the selective accuracy, the experimental precision coefficient, the experimental variation coefficient and relative variation coefficient. The genetic progress was estimated by the method of generalized linear regression of the adjusted means of progeny groups evaluated in each year by the mixed model approach. The estimates of the relative annual mean gain and the total relative gain for the three studied traits were also obtained. The estimates of genetic variance among progenies for grain yield were highly significant (p < 0.001), except for the progeny group evaluated in 2007. The heritability estimation ranging from 0.22 to 0.69 that, associated with the selective accuracy, indicates the expected level of efficiency with early generation selection in each group of progenies. For Plant height and daysto- flowering, the genetic variance estimates were significant (p ≤ 0.01) in all groups. The variance components for these traits led to a rather high heritability estimation that suggests favorable conditions for selection in early generations. The genetic progress for grain yield (80.5 kg ha-1 yr-1) was highly significant. This value represents a relative annual mean gain of 2.88%. Throughout the period, the cumulative gain was estimated in 32.86% which indicates an increase of 918 kg ha-1 for grain yield. The response for plant height was not significant, suggesting that the height of progenies remained stable over the period. For days-to-flowering, it was detected significant increase in cycle length, indicated by the cumulative increase of the vegetative period in about five days (6.73%). From these results we conclude that early generation selection, adopted by the breeding program, were effective in promoting the genetic gain for grain yield in the elite populations. / O melhoramento genético de plantas atua de modo decisivo na manutenção da oferta de alimentos de origem agrícola como o arroz. A contribuição do melhoramento para o aumento da produtividade em várias culturas é expressa pelo progresso genético, que representa as alterações genéticas, no decorrer dos ciclos seletivos, promovendo o deslocamento da média genotípica do caráter no sentido da seleção. Entre várias estratégias adotadas para aumentar os ganhos com a seleção merece destaque a seleção precoce, que envolve a avaliação de progênies endogâmicas nas gerações F3 ou F4. Este trabalho teve como objetivo avaliar o potencial genético para a seleção em progênies de arroz de terras altas e estimar o progresso genético para produção de grãos. Foram utilizados dados dos ensaios de rendimento de progênies conduzidos no período de onze anos agrícolas, 2002/03 a 2012/13 pela Embrapa Arroz e Feijão. Foram analisados os caracteres produção de grãos (kg.ha-1), altura de plantas (cm) e dias para a floração (dia). Em cada ano da série um grupo de progênies foi testado em experimentos instalados entre quatro a seis locais. Foi empregado o delineamento blocos aumentados de Federer em sete anos da série sem repetição por local e com no mínimo três testemunhas, e em quatro anos os ensaios foram duplicados. Os dados foram submetidos à análise conjunta dos experimentos dentro de cada ano. Por meio de um modelo linear de efeitos mistos foram estimados os componentes de variância pelo método da máxima verossimilhança restrita ou residual (REML). A partir da estimativa dos componentes foram calculados os parâmetros genéticos e fenotípicos. O progresso genético foi estimado pelo método da regressão linear generalizada das médias ajustadas dos grupos de progênies avaliadas em cada ano, pela abordagem de modelos mistos. Foram obtidas as estimativas do ganho médio relativo anual e do ganho relativo total. As estimativas de variância genética, para produção de grãos, entre progênies foram altamente significativas (p<0,001), exceto pelo grupo de progênie avaliado em 2007. As estimativas de herdabilidade variaram de 0,22 a 0,69, que associadas às estimativas de acurácia seletiva indicam o nível de eficiência esperado com a seleção precoce em cada grupo de progênies. Para os caracteres altura de plantas e dias para floração as estimativas de variância genética foram significativas (p≤0,01) em todos os grupos. Os componentes de variância para esses caracteres conduziram a estimativas de herdabilidade bastante elevadas, sugerindo, por tanto, condições favoráveis para seleção em gerações iniciais. O progresso genético estimado para produção de grãos (80,5 kg.ha-1ano-1) foi altamente significativo, representando um ganho relativo médio anual de 2,88%. Em todo o período o ganho acumulado estimado foi de 32,86%, que equivale ao incremento em produtividade de 918 kg ha-1. A resposta para altura de plantas não foi significativa, sugerindo que a estatura das progênies avaliadas permaneceu estável ao longo do período. Para dias para floração houve aumento significativo na duração do ciclo, expresso pelo acréscimo acumulado de aproximadamente cinco dias (6,73%) na duração do ciclo vegetativo. Conclui-se que a estratégia de seleção precoce, adotada pelo programa de melhoramento, foi eficiente em promover o progresso genético para o caráter produção de grãos nas populações elites.
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Proposição de índices de seleção em frangos de corte / Proposition of selection indexes in broilers

Jane Lara Brandani Marques Grosso 19 August 2011 (has links)
O presente estudo foi subdividido em duas partes: análises genéticas e análises econômicas. A primeira teve por objetivos definir modelos de avaliação genética para as características de desempenho e carcaça em uma linhagem comercial de frangos e estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos para essas características. A segunda parte teve por objetivos derivar os ponderadores econômicos para essas características de acordo com dois segmentos de mercado de carne de frango e propor índices econômicos de seleção para esses segmentos. As características avaliadas foram: taxa de conversão alimentar (CA), peso corporal à seleção juvenil (PC), pesos de carcaça (PCAR), carne de peito (PPEI) e pernas (PPER), rendimentos de carcaça (RCAR), carne de peito (RPEI) e pernas (RPER). As estimativas dos componentes de (co)variância foram obtidas pelo método de máxima verossimilhança restrita utilizando os programas MTDFREML e VCE-6. O teste de razão de verossimilhança foi utilizado para verificar qual o modelo mais adequado à avaliação genética para cada característica. Para a obtenção dos ponderadores econômicos foi desenvolvido um modelo bioeconômico determinístico e a análise econômica foi simulada para uma cadeia de produção de frangos integrada. Foi proposto um índice de seleção para o segmento de mercado frango inteiro e outro para cortes de frango. Foram obtidas estimativas de correlação por postos de Spearman entre os valores preditos pelos dois índices para três intensidades de seleção. Os efeitos de ambiente permanente materno e genético aditivo materno foram significativos (P<0,01) para todas as características. As estimativas de herdabilidade direta e materna foram 0,29 e 0,02 para CA, 0,45 e 0,05 para PC, 0,17 e 0,04 para PCAR, 0,26 e 0,06 para PPEI, 0,22 e 0,02 para PPER, 0,31 e 0,02 para RCAR, 0,53 e 0,04 para RPEI, e 0,44 e 0,02 para RPER, respectivamente. Os ponderadores econômicos foram -1,1783 R$/ponto para CA, 0,007 e 0,006 R$/g para PC respectivamente para o segmento de mercado frango inteiro e cortes de frango, 0,0552, 0,0758 e 0,0629 R$/% para RCAR, RPEI e RPER, respectivamente. Os resultados sugerem que todas as características podem ser selecionadas esperando progresso genético na população estudada. Os efeitos maternos foram importantes, mesmo de pequena magnitude (0,02 a 0,06), e devem ser considerados nos modelos de avaliação genética a fim de obter maior acurácia da predição dos valores genéticos individuais. A CA representou relevante impacto econômico para os dois segmentos de mercado. Para o segmento de mercado cortes de frango, as características de carcaça foram quase tão importantes quanto às de desempenho. A classificação das aves gerada pelos dois índices foi alterada à medida que diminuiu a proporção de aves selecionadas. Portanto, índices de seleção distintos devem ser considerados nos programas de melhoramento de frangos enquanto segmentos diferentes de mercado de carne de frango na proposta de maior eficiência econômica da utilização do mérito genético predito. / The present research was subdivided in two parts: genetic analyses and economic analyses. The first part was conducted to determine models for genetic evaluation of performance and carcass traits in a commercial broiler line and to estimate genetic and phenotypic parameters for these traits. The second part was conducted to derive economic weights for these traits according to two market segments of broiler meat and to propose economic selection indexes for these segments. The traits analyzed were: feed conversion ratio (CA), body weight at juvenile selection (PC), carcass (PCAR), breast meat (PPEI) and leg (PPER) weights, and carcass (RCAR), breast meat (RPEI) and leg (RPER) yields. Estimates of the (co)variance components were obtained by the restricted maximum likelihood method by the software MTDFREML and VCE-6. The likelihood ratio test was applied in order to verify which model was more adapted to the genetic evaluation for each trait. A deterministic bioeconomic model was developed for the derivation of economic weights and the economic analysis was simulated for an integrated broiler production system. It was proposed a selection index for the market segment of whole carcass and another for cuts. Spearman correlation estimates among predicted values from the two indexes were obtained for three selection intensities. For all traits, the maternal genetic and permanent environmental effects were significant (P<0.01). The estimates of direct and maternal heritability were 0.29 and 0.02 for CA, 0.45 and 0.05 for PC, 0.17 and 0.04 for PCAR, 0.26 and 0.06 for PPEI, 0.22 and 0.02 for PPER, 0.31 and 0.02 for RCAR, 0.53 and 0.04 for RPEI, and 0.44 and 0.02 for RPER, respectively. The economic weights were -1.1783 R$/point for CA, 0.007 and 0.006 R$/g for PC respectively for the market segment of whole carcass and cuts, 0.0552, 0.0758 and 0.0629 R$/% for RCAR, RPEI and RPER, respectively. The results suggest that traits analyzed can be selected and genetic progress will be expected. Maternal effects were important, even of small magnitude (0.02 to 0.06), and should be considered in genetic evaluation models in order to obtain accurate prediction of the breeding values of the individuals. The CA represented significant economic impact for the two market segments. For the market segment of cuts, carcass traits were almost as important as the performance traits. The classification of chickens generated by the two selection indexes was changed as the proportion of selected chickens decreased. Therefore, different selection indexes should be considered in broiler breeding programs while different segments of broiler meat market in the proposal for greater economic efficiency in the use of predicted genetic merit.
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Aspectos genéticos e fenotípicos de características produtivas, temperamento e repelência em bovinos da raça Nelore / Phenotypic and genetic aspects to productive traits, temperament and resistance in Nelore beef cattle

Cristiano de Carvalho Balieiro 14 March 2008 (has links)
O objetivo geral deste trabalho foi avaliar aspectos fenotípicos e genéticos de características de crescimento, temperamento e repelência em bovinos da raça Nelore. As características analisadas neste trabalho foram peso ao nascer (PN, N=13.374), peso a desmama (PD, N=19.835), peso ao sobreano (P18M, N=15.291), ganho de peso da desmama ao sobreano (GP345, N=12.873), ganho de peso da desmama ao sobreano diferenciado (GP345DIF, N=12.873), temperamento (TEMP, N=13.253) e repelência (REP, N=1.859). O arquivo de pedigree foi constituído por 30.233 animais. Os componentes de variância, (co)variância, parâmetros genéticos, bem como as predições dos valores genéticos foram estimados por máxima verossimilhança restrita (REML). As estimativas de herdabilidade observadas para PN, PD, P198M, GP345, GP345DIF, TEMP e REP foram 0,22, 0,34, 0,34, 0,12, 0,12, 0,15 e 0,18, respectivamente. As estimativas de correlação genéticas verificadas foram 0,50 (PD e PN), 0,96 (PD e P18M), 0,49 (PD e GP345), 0,55 (PD e GP345DIF), 0,41 (PD e TEMP) e 0,20(PD e REP). As tendências fenotípicas para as características avaliadas foram todas negativas (P<0,01), a exceção de PD (P>0,05). As tendências genéticas para as características avaliadas foram todas positivas (P<0,01), a exceção de REP (P<0,01) que apresentou tendência negativa. As taxas de endogamia individual, paterna e materna apresentaram comportamento crescente (P<0,01) ao longo do período de estudo. Foram verificados efeitos significativos dos coeficientes de endogamia individuais sobre todas as características avaliadas, a exceção de TEMP. Os coeficientes de endogamia paternos influenciaram significativamente as características P18M, GP345 e GP345DIF. Por outro lado, a endogamia materna influenciou significativamente as características PD, GP345 e GP345DIF. / The general aim of this study was evaluated phenotypic and genetic aspects to growth traits, temperament and resistance in Nelore beef cattle. The traits analyzed in this study were birth weight (BW, N=13,374), weaning weight (WW, N=19,835), weight to over year (W18M, N=15,291), weight gain from weaning to over year (WG345, N=12,873), differentiated weight gain from weaning to over year (WG345DIF, N=12,873), temperament (TEMP, N=13,253) e resistance (RES, N=1,859). The pedigree information was composed by 30,233 animals. Variance and (co)variance components, genetic parameters, as well as predict breeding values were estimated using restricted maximum likelihood analyses (REML). Heritability estimates for BW, WW, W18M, WG345, WG345DIF, TEMP and RES were 0.22, 0.34, 0.34, 0.12, 0.12, 0.15 e 0.18, respectively. The genetics correlations verified were 0.50 (WW and BW), 0.96 (WW and W18M), 0.49 (WW and WG345), 0.55 (WW and WG345DIF), 0.41 (WW and TEMP) and 0.20 (WW and RES). All phenotypic trends to the evaluated traits were negatives (P<0.01), except for WW (P>0.05). All genetic trends to the evaluated traits were positives (P<0.01), except for RES (P<0.01) which presented negative trend. The individual, paternal and maternal inbreeding rates showed increasing behavior (P<0.01) along the study period. Were verified significant effects of individual inbreeding coefficients in all evaluated traits, except for TEMP. The paternal inbreeding coefficients affected significantly the W18M, WG345, WG345DIF traits. Even so, the maternal inbreeding coefficients affected significantly the WW, WG345, WG345DIF traits.
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Objetivos de seleção e valores econômicos para bovinos Nelore em sistema de ciclo completo / Breeding Objectives and Economic Values for Nellore Cattle in a Full-Cycle System

Heverton Luís Moreira 15 September 2015 (has links)
O objetivo do presente trabalho foi definir os objetivos de seleção e estimar os valores econômicos para característica de importância econômica em um sistema de bovinos de corte criados em regime de ciclo completo, além de estimar os parâmetros genéticos para características produtivas, reprodutivas e de qualidade de carcaça avaliadas no programa de seleção Nelore Brasil. O desenvolvimento do modelo bioeconômico foi realizado considerando as informações do sistema de produção e dos parâmetros biológicos com objetivo de estabilizar o rebanho e calcular o número de animais em cada categoria, obter as informações de desempenho produtivo e econômico (receita e despesas) do sistema pecuário, e por fim a obtenção dos valores econômicos das características contidas no objetivo de seleção em sistema de ciclo completo, que para tal, foram utilizadas planilhas interligadas do programa Microsoft Excel®. Os valores econômicos foram estimados simulando o aumento de 1% no valor da característica do objetivo de seleção, mantendo as demais constantes. A estimação dos parâmetros genéticos foi pelo método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) usando o modelo animal, utilizando o software WOMBAT e o ganho genético anual para as características de reprodução, carcaça e desenvolvimento ponderal foi estimado pela regressão linear do valor genético (VG) em função do ano de nascimento. O modelo bioeconômico foi eficaz na estimação das fontes de receitas e despesas do sistema de produção e os valores econômicos estimados seguindo a ordem de importância para o ciclo completo foram R$ 3,69 para peso ao abate de macho (PAM), R$ 3,63 para peso a desmama de macho (PDM), R$ 3,58 para taxa de desmama (TD), R$ 3,40 para peso ao abate de fêmea (PAF), R$ 2,30 para peso a desmama de fêmea (PDF) e R$ 0,13 para peso ao adulto de vaca (PAV). Portanto, o PAM foi à característica de maior impacto no sistema de produção, porém, todas promoveram retorno econômico positivo com exceção do PAV que foi praticamente nulo. As estimativas de herdabilidade para as características de produção, reprodução e qualidade de carcaça foram favoráveis ao progresso genético por seleção direta. As correlações estimadas demonstram que machos com maior perímetro escrotal tendem a ser mais pesados e esses apresentarem maior rendimento e acabamento da carcaça. O processo de Resumo 13 seleção empírica utilizado pelo programa Nelore Brasil está sendo eficiente, de acordo com os resultados positivos dos progressos genéticos nas estimativas de tendência. Portanto todas as características avaliadas no sistema de ciclo completo tiveram importância econômica positivas, indicando que o processo de seleção trariam aumentos de lucratividade e as avaliadas geneticamente poderiam ser incluídas como critério de seleção contribuindo com a maximização da resposta esperadas para as características do objetivo de seleção. / The objective of this study was to define the objectives of selecting and estimating economic values for characteristics of economic importance in a system of beef cattle raised in fullcycle scheme. We also aimed to estimate the parameters for genetic reproductive and productive characteristics of carcass quality evaluated in the breeding program Nellore Brazil. The bio-economic model was developed considering the information and production system of biological parameters to stabilize the herd and calculate the number of animals in each category, obtain information on economic performance (revenue and expenses) of the livestock system, and finally to obtain economic values of the characteristics contained in the objective of selection in full-cycle system. We used interlinked spreadsheets in the Microsoft Excel®. The economic values were estimated by simulating the increase of 1% for the value of the characteristic of objective selection, keeping the others constant. The estimation of genetic parameters was obtained by the method of Restricted Maximum Likelihood (REML) using the animal model in the WOMBAT software and genetic gain for annual breeding characteristics; weighted carcass and development were estimated by linear regression of genetic value (GV) depending on the year of birth. The bio-economic model was effective in estimating revenue and expenditure sources of the production system and the estimated economic values, following the order of importance for the complete cycle, were R$ 3.69 for slaughter weight of male (SWM), R$ 3.63 for weaning weight of male (WWM), R$ 3.58 for weaning rate (WR), R$ 3.40 for the slaughter weight of female (SWF), R$ 2.30 for weaning weight of female (WWF) and R$ 0.13 for adult cow weight (ACW). Therefore, SWM had the greatest impact on the production system, however, all aspects promoted positive economic return with the exception of ACW, which was practically null. Heritability estimates for production, reproduction and carcass characteristics and quality were favorable to genetic progress for direct selection. The estimated correlations demonstrate that males with larger scrotal perimeter tend to be heavier and have higher carcass yield and finishing. The empirical selection process used by the program Brazil Nellore is efficient, according to the positive results of the genetic progress in trend estimates. Therefore, all features evaluated in the fullAbstract 16 cycle system had positive economic importance, indicating that the selection process could bring gains in profitability and the genetically evaluated characteristics could be included as a breeding criterion, contributing to the maximization of the expected response for the traits of interest in breeding programs.
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Resistência genética à infestação natural e artificial por Rhipicephalus (Boophilus) microplus em bovinos das raças Hereford e Braford / Genetic resistance to Rhipicephalus (Boophilus) microplus natural and artificial infestation in Hereford and Braford cattle

Biegelmeyer, Patrícia 29 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:38:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_patricia_biegelmeyer.pdf: 576535 bytes, checksum: 210ef4efc6311207454f251dd80d5018 (MD5) Previous issue date: 2012-02-29 / The overall aim of this study was to analyze different perspectives of Rhipicephalus (Boophilus) microplus genetic resistance. Therefore, the present study was divided into three manuscripts. Firstly, a literature review was conducted to present some aspects of tick resistance, like results of previous studies of bovine resistance, environmental effects on this triat, and some findings in molecular biology that will help to identify resistant animals. The second trial was conducted to estimate genetic parameters for tick resistance measured by two assessment methods in Hereford and Braford cattle, and genetic correlations between tick resistance and growth of animals. The animals belonging to the Delta G Connection genetic improvement consortium, were raised on nature and artificial pastures in Southern Brazil, and the age at the evaluation period was about 18 months. Data were analyzed from 6,462 bovines naturally exposed to ticks. The number of ticks was counted at inner hind legs region (IHL) of 3,413 animals between 2001 and 2008, and was recorded up to three consecutive counts at one side of body (LAT) in 3,049 bovines between 2009 and 2010, a total of 7,813 records. In addition, the database contained data of 109,566 birth weights (BW), 112,815 records of weight gain from birth to weaning (ADG) and 54,843 data of weight gain from weaning to yearling (PWG). For the analyses, tick count data was transformed using a logarithmic function. Heritability estimates obtained by bivariate analysis were IHL = 0.152 ± 0.043 and LAT = 0.235 ± 0.063 and genetic correlation between both methods was 0.575 ± 0.220. Single-trait analysis of LAT indicated a repeatability of 0.312 ± 0.014. Genetics association analysis between IHL and LAT and the development characteristics evaluated indicated significant associations between IHL and BW (0.220 ± 0.102), and favorable negative correlations between LAT and ADG (-0.211 ± 0.099) and LAT and PWG (-0.650 ± 0.125) (P<0.05). The objective of third trial was to analyze the bovine genetic resistance effect on tick biological traits. The engorged female ticks analyzed were collected from 40 Braford heifers classified as genetically resistant (R) or susceptible (S), according to the breeding values for tick count, calculated based on a database with 9,036 records of Hereford and Braford bovines. After classification, the selected heifers were moved to an experimental area in Embrapa Pecuária Sul, located in the city of Bagé, in the Brazilian state of Rio Grande do Sul, and subjected to four artificial infestations, 14 days apart each one. Weights of engorged female ticks and of female ticks after oviposition did not differ between resistant and susceptible heifers. Female ticks engorged in genetically susceptible heifers showed higher capacity of posture (R = 0.097 ± 0.021g and S = 0.109 ± 0.030g) and higher values of reproductive efficiency index (R = 47.23 ± 5.85% and S = 53.27 ± 3.74%) The overall aim of this study was to analyze different perspectives of Rhipicephalus (Boophilus) microplus genetic resistance. Therefore, the present study was divided into three manuscripts. Firstly, a literature review was conducted to present some aspects of tick resistance, like results of previous studies of bovine resistance, environmental effects on this triat, and some findings in molecular biology that will help to identify resistant animals. The second trial was conducted to estimate genetic parameters for tick resistance measured by two assessment methods in Hereford and Braford cattle, and genetic correlations between tick resistance and growth of animals. The animals belonging to the Delta G Connection genetic improvement consortium, were raised on nature and artificial pastures in Southern Brazil, and the age at the evaluation period was about 18 months. Data were analyzed from 6,462 bovines naturally exposed to ticks. The number of ticks was counted at inner hind legs region (IHL) of 3,413 animals between 2001 and 2008, and was recorded up to three consecutive counts at one side of body (LAT) in 3,049 bovines between 2009 and 2010, a total of 7,813 records. In addition, the database contained data of 109,566 birth weights (BW), 112,815 records of weight gain from birth to weaning (ADG) and 54,843 data of weight gain from weaning to yearling (PWG). For the analyses, tick count data was transformed using a logarithmic function. Heritability estimates obtained by bivariate analysis were IHL = 0.152 ± 0.043 and LAT = 0.235 ± 0.063 and genetic correlation between both methods was 0.575 ± 0.220. Single-trait analysis of LAT indicated a repeatability of 0.312 ± 0.014. Genetics association analysis between IHL and LAT and the development characteristics evaluated indicated significant associations between IHL and BW (0.220 ± 0.102), and favorable negative correlations between LAT and ADG (-0.211 ± 0.099) and LAT and PWG (-0.650 ± 0.125) (P<0.05). The objective of third trial was to analyze the bovine genetic resistance effect on tick biological traits. The engorged female ticks analyzed were collected from 40 Braford heifers classified as genetically resistant (R) or susceptible (S), according to the breeding values for tick count, calculated based on a database with 9,036 records of Hereford and Braford bovines. After classification, the selected heifers were moved to an experimental area in Embrapa Pecuária Sul, located in the city of Bagé, in the Brazilian state of Rio Grande do Sul, and subjected to four artificial infestations, 14 days apart each one. Weights of engorged female ticks and of female ticks after oviposition did not differ between resistant and susceptible heifers. Female ticks engorged in genetically susceptible heifers showed higher capacity of posture (R = 0.097 ± 0.021g and S = 0.109 ± 0.030g) and higher values of reproductive efficiency index (R = 47.23 ± 5.85% and S = 53.27 ± 3.74%) / O objetivo geral do presente estudo foi abordar diferentes perspectivas sobre a resistência genética de bovinos ao carrapato Rhipicephalus (Boophilus) microplus. Para tanto, foi dividido em três trabalhos. Primeiramente, foi realizado um estudo de revisão que abrangeu alguns aspectos relacionados à resistência, como resultados de trabalhos que avaliaram a resistência de bovinos, fatores ambientais capazes de afetar os fenótipos de resistência e algumas descobertas na área da biologia molecular que poderão ser úteis no processo de identificação de animais geneticamente resistentes. O segundo trabalho objetivou estimar parâmetros genéticos para a resistência mensurada por dois métodos de avaliação em bovinos Hereford e Braford, e as correlações genéticas entre a resistência e características de crescimento dos animais. Os bovinos que participaram das avaliações foram provenientes de rebanhos controlados pelo programa de melhoramento da Conexão Delta G, localizados no estado do Rio Grande do Sul e criados a campo sobre pastagens naturais e artificiais. Foram avaliados dados de 6.462 bovinos com idade média de 18 meses, naturalmente infestados, sendo as contagens realizadas na região do entrepernas (ENT) em 3.413 animais entre 2001 e 2008, e 7.813 registros de contagens na lateral do corpo (LAT) de 3.049 bovinos realizadas entre 2009 e 2011. Foram utilizados também 109.566 dados de peso ao nascimento (PN), 112.815 registros de ganho de peso do nascimento à desmama (GPD) e 55.843 dados de ganho da desmama ao sobreano (GDS). Para as análises, os dados de contagens sofreram transformação logarítmica. As estimativas de herdabilidade dos métodos de avaliação obtidas por análise bicaracterística foram ENT = 0,152 ± 0,043 e LAT = 0,235 ± 0,063, e a correlação genética entre ambos foi de 0,575 ± 0,220. A análise unicaráter da LAT apontou uma repetibilidade de 0,312 ± 0,014. As associações genéticas entre a ENT e a LAT e as características de desenvolvimento avaliadas apontaram associações significativas entre ENT e PN (0,220 ± 0,102), e favoráveis correlações negativas e entre LAT e GPD (-0,211 ± 0,099) e LAT e GDS (-0,650 ± 0,125) (P<0,05). O terceiro trabalho objetivou analisar o efeito da resistência dos bovinos sobre características biológicas dos carrapatos. As teleóginas analisadas foram coletadas em 40 novilhas Braford classificadas como geneticamente resistentes (R) ou suscetíveis (S), de acordo com os valores genéticos obtidos para a característica de contagem de carrapatos, calculados com base em um banco de dados com registros de 9.036 animais das raças Hereford e Braford. Após a classificação, as novilhas selecionadas foram encaminhadas à Embrapa Pecuária Sul (Bagé, RS), onde foram submetidas a quatro infestações artificiais, com intervalos de 14 dias. Os pesos médios iniciais das teleóginas e os pesos das quenóginas não diferiram entre os grupos de novilhas resistentes e suscetíveis. Fêmeas ingurgitadas em novilhas geneticamente suscetíveis apresentaram maior capacidade de postura (R = 0,097 ± 0,021g e S = 0,109 ± 0,030g) e maiores índices de eficiência reprodutiva (R = 47,23 ± 5,85% e S = 53,27 ± 3,74%) e nutricional (R = 54,33 ± 4,36% e S = 65,62 ± 8,84%) que teleóginas ingurgitadas em novilhas resistentes.
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Escolha de genitores e estratégias de seleção para caracteres de aparência de tubérculo, rendimento e qualidade de fritura, em batata / Parental choice and strategy selection for tuber appearance and tuber yield traits

Terres, Laerte Reis 25 August 2014 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-27T12:34:55Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese Laerte Terres.pdf: 575630 bytes, checksum: 6b313133a7ae48316c5c9f025e362be2 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-09-28T17:02:36Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese Laerte Terres.pdf: 575630 bytes, checksum: 6b313133a7ae48316c5c9f025e362be2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-28T17:02:36Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese Laerte Terres.pdf: 575630 bytes, checksum: 6b313133a7ae48316c5c9f025e362be2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-08-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Em programas de melhoramento genético de batata, a escolha de genitores e de estratégias de seleção devem ser definidos, cuidadosamente, e incorporados, como prática nos programas, para aumentar a eficiência e a eficácia. A pesquisa foi composta de cinco estudos. O primeiro teve como objetivo verificar as estimativas de capacidades de combinação de genitores de batata em gerações iniciais de seleção. Foram avaliadas 12 famílias segregantes, entre dois grupos de genitores de batata em um dialelo parcial (4x3). As famílias foram avaliadas para caracteres de aparência e rendimento de tubérculos. Os dados foram submetidos às analises de variância e dialélica parcial. Verificou-se que há predominância de efeitos aditivos dos genes para os caracteres uniformidade de formato, apontamento, curvatura, aparência geral, uniformidade de tamanho, número, massa e massa média de tubérculos. O segundo estudo teve como objetivo de estimar as respostas esperadas de seleção para caracteres de rendimento, de aparência e qualidade de fritura. Foram estudadas três populações segregantes de batata para caracteres de rendimento, aparência de tubérculos e qualidade de fritura. Os dados foram analisados estatisticamente segundo o modelo REML/BLUP. As respostas esperadas de seleção para qualidade de fritura sugerem que para se obter populações superiores deve-se utilizar ao menos um genitor de ótima qualidade de fritura. O terceiro estudo teve como objetivo principal estimar os parâmetros genéticos de caracteres componentes de rendimento e aparência de tubérculo nas primeiras gerações de seleção. Foram avaliadas 12 famílias segregantes de batata para caracteres de rendimento e aparência de tubérculos. Pode-se concluir que seleção pode ser aplicada com intensidade de leve a moderada na geração de plântula para os caracteres textura de película, aparência geral, número, massa e massa média de tubérculos. O quarto estudo objetivou verificar correlações entre e dentro de gerações para caracteres de aparência e rendimento de tubérculos, nas gerações iniciais de seleção e as implicações destas correlações na seleção. Foram VII avaliadas 12 famílias segregantes de batata nas gerações de plântula e primeira geração de campo, para caracteres de rendimento e aparência de tubérculo. Foram realizadas análises de correlação entre e dentro das gerações. Os resultados demonstraram que seleção de forma negativa pode ser aplicada na geração de plântula para apontamento, número e massa média de tubérculos, descartando os extremos. Ainda sugerem que a seleção para massa de tubérculos pode ser feita selecionando com leve intensidade para os caracteres tamanho e massa média. O quinto estudo teve como objetivo comparar a eficiência de diferentes índices de seleção de clones superiores de batata. Foram comparados seis índices de seleção. Foram estudadas três populações híbridas de batata, para caracteres de rendimento e aparência de tubérculos. O índice multiplicativo e o índice de “ranks” mostraram-se mais eficientes. / In potato breeding programs, the choice of parents and selection of strategies must be carefully defined, and incorporated as a practice in programs trying to increase the efficiency and efficacy. The research consisted of five studies. The first study aimed to verify the combining ability of potato parents in early generations of selection. Twelve segregating potato families derived from crosses between two groups of parents in a partial diallel (3x4) were evaluated. The families were evaluated to tuber appearance and yield traits. Data were analyzed for variance and partial diallel analysis. It was found that there is predominance of additive effects of genes for skin color, tuber shape uniformity, tuber pointing, tuber curvature, general tuber appearance, tuber size uniformity, tuber number, tuber yield, and average tuber weight. The second study aimed to estimate the expected response to selection for yield, appearance and fry quality traits. Three hybrid potato populations were studied and evaluated to yield, appearance and fry quality. Data were statistically analyzed according to the REML/BLUP model. The expected response to selection for frying quality suggests that to obtain superior populations, at least one parent of good fry quality should be used. The third study aimed to estimate genetic parameters for yield and tuber appearance traits in early generations of selection. Twelve segregating potato families were evaluated to yield and appearance traits. The experimental design was randomized blocks. It was concluded that selection can be applied with mild to moderate intensity in seedling generating for skin texture, general tuber appearance, tuber number, tuber yield, and average tuber yield. The fourth study aimed to examine correlations between and within generations for tuber appearance and tuber yield in early generations of selection and their implications in the selection. Twelve segregating potato families were evaluated in seedling and first field generation to appearance and yield traits. Correlation analysis between and within generations were performed. The results showed that negative selection can be applied in the seedling generation for tuber IX pointing, tuber number, and average tuber weight. The results also suggest that selection for tuber yield can be applied at mild intensity for average tuber weight and tuber size. The fifth study aimed to compare the efficiency of different index selection methods for selection of superior potato clones. Three hybrid potato populations were studied. Six selection index were compared. The families were evaluated to yield and appearance traits. It was concluded that the multiplicative index and the index based on the sum of ranks are more efficient.
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Biometria e estratégias de seleção em progênies S1 de milho crioulo. / Biometry and selection strategies in S1 progenies of landrace maize

Ferrari, Maurício 07 February 2017 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-03-06T16:25:25Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação_Mauricio_Ferrari.pdf: 1308879 bytes, checksum: 47b7ba5b511198a17226bd8456ede375 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-03-09T20:22:03Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação_Mauricio_Ferrari.pdf: 1308879 bytes, checksum: 47b7ba5b511198a17226bd8456ede375 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-09T20:22:03Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação_Mauricio_Ferrari.pdf: 1308879 bytes, checksum: 47b7ba5b511198a17226bd8456ede375 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-07 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / No melhoramento genético de milho, a seleção precoce de progênies é uma etapa minuciosa e demanda critérios rigorosos do melhorista. Neste sentido, a utilização de técnicas biométricas auxilia na avaliação das constituições genéticas. Dessa forma, o objetivo deste trabalho é estimar e identificar associações fenotípicas, genéticas e de ambiente em progênies S1, assim como estimar a herdabilidade e quantificar a variância genética por meio de análises multivariadas em progênies S1 provenientes de populações crioulas de milho cultivadas na região Sul do Rio Grande do Sul. O experimento foi conduzido na área experimental do Centro de Genômica e Fitomelhoramento, da Universidade Federal de Pelotas, localizada no Centro Agropecuário da Palma, no munícipio de Capão do Leão – RS, sob as coordenadas geográficas: latitude 31°45’ S, longitude 52°29’ O, com altitude média de 13 metros. O delineamento experimental utilizado foi de blocos aumentados, com dez grupos de progênies S1, e duas testemunhas comerciais, os híbridos simples Pioneer 30F53 e Agroeste 1590, alocados em quatro repetições. As progênies S1 foram obtidas após a autofecundação de plantas aleatórias nas populações crioulas de milho. Sendo estas: Amarelão, Argentino Branco, Argentino Amarelo, Branco Roxo Índio, Branco Oito Carreiras, Caiano Rajado, Cateto Branco, Criolão e Dente de Ouro, e da variedade de polinização aberta (VPA) BRS Planalto. Em cada progênie S1 foram avaliadas 40 plantas. Os caracteres avaliados foram: Altura de Inserção da espiga (AE): Altura de Planta (AP); Diâmetro do colmo (DC): Comprimento da haste principal do pendão (CHP): Número de ramificações primárias do pendão (NRP): Número de dias para o florescimento (NDF): Comprimento da espiga (CE): Diâmetro da Espiga (DE): Massa da espiga (ME): Profundidade dos grãos (PFG). Realizou-se a análise de correlação fenotípica, genotípica e de ambiente, de parâmetros genéticos e distância genética. O comprimento da espiga possui correlação fenotípica e genética forte e positiva com a massa da espiga, e pode ser utilizado para seleção indireta de progênies S1 com maior massa de espiga, independentemente da origem de formação das progênies. Para as demais associações, as progênies S1 apresentam correlações genéticas e fenotípicas específicas tanto em sentido como em magnitude, dificultando a definição de estratégias abrangentes de seleção indireta baseada na correlação entre caracteres. As progênies S1 Caiano Rajado, Criolão, Branco Roxo Índio, BRS Planalto, Dente de Ouro, Amarelão e Branco Oito Carreiras possuem padrões de herdabilidade semelhantes para os caracteres estudados. Os caracteres profundidade de grão e altura de inserção da espiga expressam as maiores estimativas de herdabilidade no sentido amplo. As progênies S1 provenientes de populações crioulas de milho apresentam variabilidade genética para os caracteres de importância agronômicos estudados. / In maize genetic breeding, early progeny selection is a meticulous step, and it demands rigorous criteria from the breeder. In this sense, the use of biometric techniques assists on evaluating genetic constitutions. Therefore, the aim of this work is to estimate and identify phenotypic, genetic and environmental associations in S1 progenies, as well as to estimate heritability and to quantify the genetic variance through multivariate analyzes of S1 progenies from landrace maize populations grown in southern Rio Grande do Sul. The experiment was conducted at the experimental area of the Center of Genomics and plant breeding of the Federal University of Pelotas, located in the Palma Agricultural Center, city of Capão do Leão-RS, with geographic coordinates: 31°45’ S latitude, 52°29’ O longitude, and average altitude of 13 meters. The experimental design used was augmented blocks with ten S1 progeny groups and two commercial controls, the single cross hybrids Pioneer 30F53 and Agroeste 1590, allocated in four repetitions. The S1 progenies were obtained after self-fertilization of random plants in the landrace maize populations. Being these: Amarelão, Argentino Branco, Argentino Amarelo, Branco Roxo Índio, Branco Oito Carreiras, Caiano Rajado, Cateto Branco, Criolão and Dente de Ouro, and the open pollinated variety (OPV) BRS Planalto. 40 plants were evaluated in each S1 progeny. The evaluated characters were: Spike Insertion Height (SH); Plant Height (PH); Stem Diameter (SD), Main Tassel Stem Length (TSL); Number of Primary Ramifications of the Tassel (NPR); Number of Days for Flowering (NDF); Spike Length (SL); Spike Diameter (SD); Spike Mass (SM); Grains Depth (GD). The analysis of phenotypic, genotypic and environmental correlation of genetic parameters and genetic distance was performed. Spike length presented a strong and positive genetic and phenotypic correlation with spike mass, and may be used for indirect selection of greater spike mass S1 progenies, regardless the progeny origin. For the other associations, S1 progenies present specific genetic and phenotypic correlations in both sense and magnitude, making it difficult to define indirect selection strategies based on correlation between characters. The S1 progenies Caiano Rajado, Criolão, Branco Roxo Índio, BRS Planalto, Dente de Ouro, Amarelão and Branco Oito Carreiras present similar heritability patterns for the characters in study. The characters grain depth and spike insertion height express the largest estimates of heritability in the broad sense. The S1 progenies from landrace maize populations present genetic variability for the agronomic traits studied.
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Critérios na escolha de genitores e mecanismos de seleção para caracteres agronômicos nas primeiras gerações em batata (Solanum tuberosum L.)

Silva, Giovani Olegario da 19 June 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_ giovani_silva.pdf: 460851 bytes, checksum: adb7606c2a47a97c51d55223bc5fb96b (MD5) Previous issue date: 2006-06-19 / The choice of parents and selection strategies when carefully defined and incorporated as usual practice in potato breeding programs, increase their efficiency and versatility. This research was composed of four studies. The work had as the main objective to analyze the use of distance measurements among potato genotypes through genealogy, morphologic and molecular markers, and jointed morphologic plus molecular markers. Thirteen cultivars and elite clones were grown in springs of 1999, 2000, 2001, 2002 and 2003, in the field. Can concluded that all estimates of genetic distances owe be considered jointly to obtain contrasting crossings. The second study aimed to estimate the combining ability of potato parents in early generations of selection. A hybrid population composed by 20 progenies in a partial diallel (4x5) arranged in a factorial design was evaluated. The results allowed infer that, number and average tuber weight are characters with CGC and CEC effects important, whereas tuber yield was a character governed by predominant additive genetic effects. In seedlings generation, the estimates of combinations capacities can is predicted. The third study was aimed to estimate genetic parameters of component traits of tuber appearance, evaluated in the two first generations of potato, aiming to estimate selection gains. The experiment was conducted in two generations, seedlings generation, in plastic house, and first clonal generation, in the field, during autumn of 2004 and 2005, respectively. A population of 15 potato families with 20 plants (genotypes) for each family was used. Can conclude that the seedling generation provide better expression of tuber appearance traits, than in the first clonal generation. High pressure of selection can be applied in early generations to shape, pointing and curving of tubers. The fourth study aimed to estimate genetic parameters of component traits of tuber appearance, evaluated in the two first generations of potato, aiming to estimate selection gains in the seedling generation. Two populations (1 and 2) were evaluated in plastic house, during autumn and spring seasons of 2004. Expected correlated and direct gains were estimated for tuber appearance and yield. In seedling generation, the expected correlated gains are bigger in tuber appearance by selecting for tuber curving, pointing and tuber shape, however lower to direct selection. The selection for tuber appearance based on its individual components does not offer possibility of higher gains that the direct selection, whereas the selection for tuber yield through its components (number and tuber medium weight) results in higher gains than direct selection. / A escolha de genitores e de estratégias de seleção nas primeiras gerações, quando cuidadosamente definidos e incorporados como prática em programas de melhoramento de batata, aumentam sua eficiência/versatilidade. A pesquisa foi composta de quatro estudos. O primeiro teve como objetivo principal analisar a utilização de medidas de distâncias genéticas entre genitores de batata por meio de genealogia, caracteres morfológicos, moleculares e, morfológicos e moleculares conjuntamente. Foi avaliado um grupo de 13 cultivares e clones elite de batata,cultivados nas primaveras de 1999, 2000, 2001, 2002 e 2003. Pode-se concluir que todas as estimativas de distância devem ser consideradas conjuntamente para obter cruzamentos contrastantes. O segundo estudo teve como objetivo verificar as estimativas das capacidades de combinação de genitores de batata em gerações iniciais de seleção. Foi avaliada uma população de batata composta por 20 progênies, em um dialelo parcial (4x5). Os resultados permitiram inferir que. Número e peso médio de tubérculos são caracteres com efeitos de CGC e CEC importantes, enquanto que rendimento de tubérculo mostra-se um caráter governado por efeito gênico predominantemente aditivo. Na geração de plântula, as estimativas de capacidade de combinação podem ser preditas. O terceiro estudo objetivou estimar parâmetros genéticos de caracteres componentes da aparência de tubérculo, avaliados nas duas primeiras gerações de batata, visando estimar os ganhos com a seleção. O experimento foi realizado na geração de plântula, em casa plástica, e primeira geração clonal, no campo, nos outono de 2004 e 2005, respectivamente. Foi utilizada uma população de 15 famílias de batata com 20 plantas (genótipos) de cada família. Os resultados obtidos demonstraram que, a geração de plântula proporciona melhor expressão dos caracteres componentes de aparência de tubérculo do que a primeira geração clonal. Pode-se aplicar forte pressão de seleção nas gerações iniciais para os caracteres formato, apontamento e curvatura de tubérculos. O quarto estudo teve por objetivo verificar os ganhos esperados em aparência e rendimento de tubérculo de batata com a seleção para seus componentes na geração de plântulas. Foram avaliadas duas populações em casa de vegetação no outono e na primavera de 2004. Estimou-se os ganhos esperados com a seleção direta e através da seleção de caracteres correlacionados geneticamente. Foi verificado que: na geração de plântula, os ganhos correlacionados esperados em aparência de tubérculo pela seleção para curvatura,apontamento e formato de tubérculo, no entanto são inferiores à seleção direta. A seleção para rendimento de tubérculo através de seus componentes (número e peso médio de tubérculos) resulta em ganhos mais elevados do que a seleção direta.
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Análise genética da produção in vitro de embriões em bovinos Guzerá / Genetic analysis of in vitro embryo production in Guzerá cattle

Bruno da Costa Perez 04 February 2016 (has links)
O objetivo dessa pesquisa foi avaliar aspectos genéticos que relacionados à produção in vitro de embriões na raça Guzerá. O primeiro estudo focou na estimação de (co) variâncias genéticas e fenotípicas em características relacionadas a produção de embriões e na detecção de possível associação com a idade ao primeiro parto (AFC). Foi detectada baixa e média herdabilidade para características relacionadas à produção de oócitos e embriões. Houve fraca associação genética entre características ligadas a reprodução artificial e a idade ao primeiro parto. O segundo estudo avaliou tendências genéticas e de endogamia em uma população Guzerá no Brasil. Doadoras e embriões produzidos in vitro foram considerados como duas subpopulações de forma a realizar comparações acerca das diferenças de variação anual genética e do coeficiente de endogamia. A tendência anual do coeficiente de endogamia (F) foi superior para a população geral, sendo detectado efeito quadrático. No entanto, a média de F para a sub- população de embriões foi maior do que na população geral e das doadoras. Foi observado ganho genético anual superior para a idade ao primeiro parto e para a produção de leite (305 dias) entre embriões produzidos in vitro do que entre doadoras ou entre a população geral. O terceiro estudo examinou os efeitos do coeficiente de endogamia da doadora, do reprodutor (usado na fertilização in vitro) e dos embriões sobre resultados de produção in vitro de embriões na raça Guzerá. Foi detectado efeito da endogamia da doadora e dos embriões sobre as características estudadas. O quarto (e último) estudo foi elaborado para comparar a adequação de modelos mistos lineares e generalizados sob método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) e sua adequação a variáveis discretas. Quatro modelos hierárquicos assumindo diferentes distribuições para dados de contagem encontrados no banco. Inferência foi realizada com base em diagnósticos de resíduo e comparação de razões entre componentes de variância para os modelos em cada variável. Modelos Poisson superaram tanto o modelo linear (com e sem transformação da variável) quanto binomial negativo à qualidade do ajuste e capacidade preditiva, apesar de claras diferenças observadas na distribuição das variáveis. Entre os modelos testados, a pior qualidade de ajuste foi obtida para o modelo linear mediante transformação logarítmica (Log10 X +1) da variável resposta. / The objective of this research was to evaluate genetic aspects permeating in vitro embryo production in Guzerá cattle. The first study aimed for estimating genetic and phenotypic (co)variances among embryo production traits and detecting possible genetic association with the age at first calving (AFC). Low and medium heritabilities were detected for oocyte and embryo production traits. A weak genetic association between artificial reproduction traits and AFC was identified. The second study evaluated genetic and inbreeding trends in the Brazilian Guzerá population. Female donors and in vitro produced embryos were considered as two subpopulations in order to perform comparisons and infer over differences in inbreeding and genetic annual variations. Embryos\' subpopulation showed higher genetic gains for age at first calving and milk production than donors\' subpopulation and the general population. Higher annual mean inbreeding values were also detected for the embryos\' subpopulation. The third study examined the effects of donor, sire (used for in vitro fertilization) and embryos\' inbreeding coefficient over in vitro embryo production traits in Guzerá cattle. Donors\' and embryos\' inbreeding effects over the analyzed traits were detected. Fourth and final study was designed to compare the performance of Linear and Generalized Linear Mixed Models under Restricted Maximum Likelihood method when fitting discrete variables. Four hierarchical models assuming different distributions for the response variable were fit to the (count) data. Inference was performed upon residual diagnostics and comparison of variance component ratios between models within each trait. Poisson models outperformed both linear (with and without variable transformation) and negative binomial models for goodness of fit and predictive ability despite clear differences in each trait\'s distribution. Logarithmic transformation (Log10 X +1) showed lowest goodness of fit among all models tested.

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