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Desempenho de famílias de feijoeiro comum obtidas por diferentes métodos de condução de populações segregantes. / Performance of families of common bean obtained by different methods for conducting.SILVA, Adélia Cristina Fernandes 18 December 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-12-18 / The common bean (Phaseolus vulgaris L.) stands out in Brazil because of its economic and, above all social importance, being an essential source of fiber of the human daily diet. To quantify the fiber content and the genetic variability in Brazilian genotypes is very important because it can ensure the success of breeding programs, evaluating the relative efficiency of the methods for conducting segregating populations. The objective of this research was to compare the genetic potential of segregating populations of the common bean submitted to different breeding methods for the character of crude fiber content and grain yield. Families were obtained by hybridization between the lines CNFC 7812 and CNFC 7829 with 12.7% and 17% of fiber content respectively. The families were conducted by three different breeding methods: Bulk, Bulk within F2 and SSD until the F7 generation. The design to analyze the families was the 14x14 lattice with three replications, conducted in two locations: Santo Antonio/GO and Ponta Grossa/PR. The crude fiber content and grain yield were evaluated in all families from the three methods. The components of variance, genetic and phenotypical parameters were then estimated from the mean square expected values. Based on the results, it can be concluded that for the crude fiber character and the grain yield, the best method was the Bulk within families, which generated the greatest number of families of high rank characteristic. In this research, this method therefore was superior for both SSD and Bulk methods. It was observed among the evaluated families obtained from the crossing CNFC 7812 x CNFC 7829, enough genetic variability to be explored for the characters of crude fiber content and grain yield. / O feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.) destaca-se no Brasil por sua importância econômica e, sobretudo social, sendo uma importante fonte de fibra na dieta habitual. Conhecer a variabilidade genética para teor de fibra em feijoeiro comum é muito importante, pois pode garantir o sucesso de programas de melhoramento, avaliando-se a eficiência relativa dos métodos de condução de população disponíveis. O objetivo deste trabalho consistiu em comparar o desempenho de famílias de feijoeiro comum obtidas por diferentes métodos de condução de populações segregantes, para os caracteres teor de fibra bruta e produtividade de grãos. Foram obtidas famílias a partir do cruzamento entre os genitores CNFC 7812 e CNFC 7829 com 12,7% e 17,0% de teor de fibra, respectivamente. As famílias foram conduzidas por três métodos de melhoramento: bulk, bulk dentro de famílias e o SSD até a geração F7. O delineamento utilizado para analisar as famílias foi um látice 14x14, com três repetições, conduzido em dois locais: Santo Antônio de Goiás/GO, na safra de inverno no ano agrícola 2008 e Ponta Grossa/PR na safra das águas no ano agrícola 2008/2009. Foram realizadas avaliações para teor de fibra bruta e produtividade de grãos em todas as famílias provenientes dos três métodos de condução de populações. A partir das esperanças matemáticas dos quadrados médios estimaram-se os componentes de variância e os parâmetros genéticos e fenotípicos. Dos resultados obtidos pode-se concluir que, para os caracteres fibra bruta e produtividade de grãos, o método mais indicado foi o bulk dentro de famílias, por gerar o maior número de famílias superiores e as melhores médias sendo, por isso, superior neste trabalho ao método SSD e ao método do bulk. Entre as famílias avaliadas do cruzamento CNFC 7812 x CNFC 7829 existe variabilidade genética suficiente para ser explorada para os caracteres teor de fibra bruta e produtividade de grãos.
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Avaliação genética de tilápias das variedades GIFT e Saint Peter® / Genetic evaluation of tilapia of GIFT varieties and Saint PeterMachado, Luciana Maria Curty 09 November 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-11-09 / The objectives were to evaluate the genetic parameters for the daily weight gain (GPD) of different families of Nile tilapia strain GIFT evaluated in fish farming at UEM/Codapar in Maringá and Sgarbi in Palotina, verify the occurrence of genotype-environment interaction and to compare the morphometric characteristics and performance of single sex populations of male tilapia strains GIFT® and Saint Peter reared in mixed system in Fish Culture Station of the Sgarbi, Paraná, Brazil. The cultivation was carried out during the period June to November 2011, totaling 160 days. The system used in the Fish Culture Station of the Sgarbi was a semi-intensive being adopted the density of 2.0 fish m-2. There were housed 480 fish of the GIFT strain and 1400 fish of the red hybrid, totaling 1880 animals, with an average weight of 15 g. The total GIFT population studied consisted of 720 fish, distributed in 19 families. There were used the complete pedigree information GIFT strain since its introduction in Brazil. For performance testing, two groups of fish previously identified with 240 and 480 specimens, were housed in fish farms ponds in Maringá and Palotina, respectively. The fish were distributed to have representatives of all families in both environments. After rearing period the fish assessed in Maringá and Palotina had a final weight average of 417 g and 280 g, respectively. The covariance components, genetic parameters and phenotypic were estimated proceeding to Bayesian inference, using the computer system MTGSAM. There were used the credibility interval (IC) at 5% probability to determine the differences of genetic parameters and variance components in the local culture. The additive genetic variance to the GPD showed values of 0.113 and 0.045 and the residual variance was 0.036 and 0.024, respectively for Maringá and Palotina. The phenotypic variance estimated for GPD in Maringá was higher than that Palotina. The heritability (h2) of the GPD in Maringá (h2 = 0.707) and Palotina (h2=0.575) were considered high with wide credibility intervals. The genetic correlations and phenotypic to the GPD in Maringá and Palotina had values of 0.20 and 0.13, respectively. The estimates of Spearman correlation, based on breeding values for the individual GPD (0.48) and GPD family (0.59) were significant. The estimates of the correlations of genetic parameters to GIFT strains indicate the presence of genotype-environment interaction. The daily weight gains of tilapia in local assessed are characterized as distinct, and may be influenced by different sets of genes. There were collected and individually assessed 190 and 102 tilapia males, respectively of the GIFT and Saint Peter® strains. The average final weight and daily weight gain among the three genetic groups of the GIFT strain showed no significant differences. However all groups of GIFT strain showed average values of performance and morphometric characteristics superior to hybrid strain Saint Peter®. There was a significant difference only for the height of the GIFT strain of tilapia group higher than the bottom. The morphometric characteristics and growth performance are superior to the GIFT strain, regardless of genetic group, compared to Saint Peter®, except for the head length/standard length of tilapia evaluated. / Objetivou-se estimar os parâmetros genéticos para característica de ganho em peso diário (GPD) de diferentes famílias de tilápia do Nilo da variedade GIFT nas pisciculturas UEM/Codapar em Maringá e Sgarbi em Palotina, verificar a ocorrência de interação genótipo-ambiente e comparar as características morfométricas e o desempenho em cultivo monossexo macho de tilápia das variedades GIFT e Saint Peter® cultivadas em sistema misto na Estação da Piscicultura Sgarbi, Paraná, Brasil. O cultivo foi conduzido durante o período de junho a novembro de 2011, totalizando 160 dias. Na piscicultura Sgarbi foi utilizado o sistema semi-intensivo, sendo adotada a densidade de 2,0 peixes m-2. Foram alojados 480 peixes da variedade GIFT e 1400 peixes da variedade vermelha híbrida, totalizando 1880 animais, com peso médio individual de 15 g. A população GIFT avaliada consistiu de 720 peixes, distribuída em 19 famílias. Foram utilizadas informações de pedigree completo, desde sua introdução no Brasil. Para o teste de desempenho, dois grupos de peixes previamente identificados, o primeiro com 240 e o segundo com 480 espécimes, foram alojados em viveiros nas pisciculturas UEM/Codapar e Sgarbi, respectivamente em Maringá e Palotina. Distribuíram-se os peixes para que tivessem representantes de todas as famílias nos dois ambientes. Ao final do período de cultivo, as tilápias GIFT avaliadas em Maringá e Palotina apresentaram peso médio final de 417 g e 280 g, respectivamente. Os componentes de covariância e os parâmetros genéticos e fenotípicos foram estimados procedendo-se a inferência bayesiana, por meio do sistema computacional MTGSAM. Utilizou-se o Intervalo de Credibilidade (IC), ao nível de 5% de probabilidade, para determinação das diferenças dos parâmetros genéticos e componentes de variância nos locais de cultivo. A variância genética aditiva para o GPD apresentou valores de 0,113 e 0,045 e a variância residual foi de 0,036 e 0,024, respectivamente para Maringá e Palotina. A variância fenotípica estimada para o GPD em Maringá foi superior à de Palotina. A herdabilidade (h2) do GPD em Maringá (h2 = 0,707) e para Palotina (h2 = 0,575) foram consideradas altas, com amplos intervalos de credibilidade. As correlações genética e fenotípica para GPD em Maringá e Palotina apresentaram valores de 0,20 e 0,13, respectivamente. As estimativas da correlação de Spearman, com base nos valores genéticos, para o GPD individual (0,48) e GPD das famílias (0,59) foram significativas. As estimativas das correlações dos parâmetros avaliados na variedade GIFT indicam presença da interação genótipo-ambiente. Os ganhos em peso diário das tilápias nos locais avaliados caracterizam-se como distintos, portanto podem ser influenciados por diferentes conjuntos de genes. Foram avaliados individualmente 190 e 102 tilápias machos, respectivamente, das variedades GIFT e Saint Peter® e os valores médios de peso final e ganho em peso diário entre os três grupos genéticos da variedade GIFT não apresentaram diferença significativas. Porém, todos os grupos da variedade GIFT apresentaram valores médios do desempenho e das características morfométricas superiores à variedade híbrida Saint Peter®. Houve diferença significativa apenas para a altura das tilápias da variedade GIFT do grupo superior em relação ao inferior. As características morfométricas e desempenho zootécnico são superiores para a variedade GIFT, independente do grupo genético, quando comparada à Saint Peter®, com exceção da relação comprimento da cabeça/comprimento padrão das tilápias avaliadas.
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"Análise bayesiana da probabilidade de permanência no rebanho como característica de seleção para a raça Nelore" / Bayesian inference for stayability as selection criteria in Nelore beef cattleCintia Righetti Marcondes 12 September 2003 (has links)
As novas biotecnologias em reprodução, como a transferência de embriões e a fecundação in vitro, de certo modo, despertaram nos produtores e pesquisadores da área de melhoramento animal o interesse na seleção de fêmeas, antes pouco explorada dada a grande ênfase empregada na seleção e avaliação de reprodutores machos. A cada ano é percebido que a pecuária de corte funciona como uma empresa e, como tal, deve-se preocupar com todos os detalhes e não enfocando apenas um, como o mais importante, e é com isso que o Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-USP) estuda cada vez mais um número maior de características como, stayability e suas possíveis aplicações à seleção das vacas Nelore, pois tem grande importância econômica. Com o objetivo de analisar a característica stayability sob enfoque Bayesiano, em registros de produção de vacas da raça Nelore, inicialmente foram implementados dois tamanhos de cadeia de Gibbs (225 ou 550 mil), dois períodos de descarte amostral (25 ou 50 mil) e duas formas de tomadas de amostra (a cada 1000 ou 250 rodadas). Os registros foram codificados como 0 (fracasso, ou menos de três partos até os 6 anos de idade) ou 1 (sucesso, ou pelo menos três partos até os 6 anos de idade) e os arquivos sofreram restrição ou não para NEP (Número Efetivo de Progênie), para número de touros dentro do grupo de contemporâneos (GC) e exclusão de grupos inteiros com média para a característica igual a 0 ou 1 (ou seja, sem variabilidade dentro do GC). Testaram-se três definições para GC. Utilizou-se o software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models), sob modelo unicaráter de touro-avô materno, para obtenção de componentes de (co)variância, estimativas de herdabilidade e soluções para cada touro (que originam as Diferenças Esperadas na Progênie - DEPs). As análises resultaram em amostras com baixa correlação serial, mostraram pequenas diferenças entre as estimativas pontuais de herdabilidade e alta correlação de rank para as DEPs dos 4180 touros avaliados. Adotou-se a implementação tamanho da cadeia/descarte amostral/amostragem como 225mil/25mil/1000 para as análises subseqüentes. A comparação entre estimativas de herdabilidade obtidas sob modelo de limiar e sob modelo linear não mostrou vantagens do primeiro, sendo que análises sob modelo linear, que têm reduzido tempo de processamento, poderiam ser preferidas quando houver muitos registros de produção, bastando transformar as estimativas de herdabilidade para escala subjacente. As comparações, sob modelo linear ajustadas para escala subjacente, entre a stayability padrão (0 ou 1) e a alternativa (considerando o número de partos até os seis anos de idade para aquelas vacas antes codificadas com valor 1), mostraram que podem ocorrer alterações na classificação de um número significativo de touros avaliados, mesmo sendo nas posições intermediárias do rank, talvez pela ligeira capacidade da característica alternativa em detectar variabilidade entre touros. Classificaram-se os 4180 touros em ordem decrescente e foram estudadas as genealogias dos 42 melhores (também chamados de TOP 1% ou aqueles que apresentam DEP para stayability superior a 57,6%) para identificar famílias importantes e avaliar a variabilidade genética da stayability. Além do touro Karvadi Imp. (essencialmente presente como avô, bisavô ou tataravô das mães dos touros TOP1%), outros genearcas com grande representatividade entre os TOP1% foram os touros Godhavari Imp. (via Kurupathy e Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã e Falo da BV (estes últimos pela via materna). / The new reproduction technologies like embryo transfer and in vitro fertilization brought to animal breeding researchers, and producers, a growing interest in the selection of females, which was a subject not well explored before, when the focus used to be only on evaluation and selection of males. The beef cattle industry is becoming more competitive each year, and the producers must think about all the aspects and details that can affect the production process. The PMGRN-USP (Nelore Breeding Program of the São Paulo University) studies a large number of traits to be used as selection criteria. Among these traits, there is stayability, which has a great economic importance. The aim of this project was to analyze the trait stayability, with a Bayesian approach, in a Nelore cattle population. Firstly, the implementation used two lengths of Gibbs chain (225 or 550 thousand), two periods of burn-in (25 or 50 thousand) and two thinning intervals (at each 1000 or 250 rounds). The cows were classified as 0 (failure, or less than three calves until six years of age), or 1 (success, or at least 3 calves until six years of age). The data were, or were not, restricted for NEP (Effective Number of Progeny), for number of sires in the contemporary group (GC), and for lack of variability in the contemporary group. Three different definitions of GC were tested. The software MTGSAM for threshold (Multiple-Trait Gibbs Sampler for Animal Models) was used, under an univariate sire-maternal grandsire model to get the (co)variance components, the heritability estimate and the solutions to each sire (that are used to get the Expected Progeny Differences - EPD). The results showed a low serial correlation in the samples, small differences among heritability estimates and a high rank correlation among the EPD estimates of the 4180 sires evaluated. The implementation 225000/25000/1000 was adopted to the subsequent analysis. The comparison between the heritability estimates obtained under the threshold model and the linear model didnt show any advantage to the first. The analysis under linear models could be preferred because of its reduced processing time in large data sets, needing only a transformation of the heritability estimates to the underlying scale. The comparisons, under linear model adjusted to the underlying scale, between the standard stayalility (0 or 1) and the alternative (obtained from the perception of the fertility differences among the cows classified as 1) showed a variation in the position of a considerable number of sires in the rank, maybe because the alternative trait gets some additional variation among sires. 4180 sires were classified in a rank and the genealogies of the 42 best sires (or TOP 1%, or the ones with stayability EPD greater than 57,6%) were studied to identify major families and evaluate the genetic variation of stayability. Besides of Karvardi Imp (a bull very present as an ascendant (2, 3 or 4 generations) of the dams of the TOP1% sires), another founder sires with influence among the TOP1% were Godhavari Imp (via Kurupathy and Neofito), Rolex (via Cardeal), Rastã, and Falo da BV (the last two via maternal).
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Par?metros gen?ticos e estudo de adaptabilidade, estabilidade em h?bridos de maracujazeiro-amareloCruz Neto, Al?rio Jos? da 22 February 2016 (has links)
Submitted by Ricardo Cedraz Duque Moliterno (ricardo.moliterno@uefs.br) on 2016-04-06T23:39:59Z
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Previous issue date: 2016-02-22 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / The aims of this study were to evaluate the adaptability and stability of 14 yellow passion fruit plant hybrids and to estimate the genetic components of variance and average via mixed models (REML/BLUP), estimate the phenotypic, genotypic and environmental correlations between passion fruit characteristics in three environments. The selection of genotypes was based on methods of adaptability, as produced by the harmonic mean of genetic values (MHVG); of stability, as produced by the relative performance of genetic values (PRVG); and on a joint selection for both adaptability and stability, as produced by the harmonic mean of the relative performance of the genetic values (MHPRVG). The genetic correlations were estimated (rG), phenotypic (rF) and environment (rE) for each environment. The following traits were evaluated: fruit number (FN); total cumulative productivity (TCP); fruit mass (FM); fruit length (FL); fruit diameter (FD); peel mass (PM); peel thickness (PT); pulp mass (PUM); juice yield (JY); soluble solids (SS); titratable acidity (TA); and SS/TA (RATIO). The estimates for heritability and the genetic gains in the evaluated environments were found to have good perspectives for the selection of superior genotypes, except for traits TCP, SS, and JY. There was a marked effect from the genotype x environment interaction (GxE) for most traits, except for FL, JY, SS, TA, and SS/TA. The most stable and adaptable hybrids in the evaluated environments were BRS Gigante Amarelo (BRS Yellow Giant), HFOP-09, H09-09, GP09-02, GP09-03, and BRS Sol do Cerrado (BRS Sun of Cerrado). In 88.88% of cases the estimates of genotypic correlations were higher than phenotypic in the three environments. In Len??is genotypic correlations between FN x FM, FD, PT, PM, PUM, SS and TA, differed from the other environments. In Dom Basil?o and Rio de Contas to TCP correlated positively with FM, FL, FD and PM. In all environments the selection of fruits with higher FM facilitating higher LF, FD, PM and PUM and the selection of the oval thinner peel fruit shape. In general, for correlations between traits of agronomic importance, such as FN x TCP, SS; FM x FD, PM, PUM, RATIO; FD x FM, PUM, RATIO; FL/FD x PT e FM x RATIO showed the same behavior in the three evaluation environments, except for characteristics FN x FM, FD, PT, PM, PUM e TA in Lenc?is. / Os objetivos deste trabalho foram avaliar a adaptabilidade e estabilidade de 14 h?bridos de maracujazeiro-amarelo, estimar os componentes gen?ticos de vari?ncia e de m?dia via modelos mistos (REML/BLUP), estabelecer as correla??es fenot?picas, genot?picas e ambientais entre caracter?sticas do fruto de maracujazeiro em tr?s ambientes. Foram avaliados 14 gen?tipos de maracujazeiro nos ambientes de Dom Bas?lio-BA, Rio de Contas-BA e Len??is-BA, utilizando o delineamento experimental em blocos casualizados completos, com tr?s repeti??es e nove plantas por parcela. A sele??o gen?tipos baseou-se nos m?todos da adaptabilidade dada pela m?dia harm?nica dos valores gen?ticos (MHVG), estabilidade pela performance relativa dos valores gen?ticos (PRVG) e sele??o conjunta para adaptabilidade e estabilidade dada pela m?dia harm?nica da performance relativa dos valores gen?ticos (MHPRVG). Foram estimadas as correla??o genot?pica (rG), fenot?pica (rF) e de ambiente (rE) para cada ambiente. Foram avaliados os caracteres, n?mero de frutos (NF); produtividade total acumulada (PR); massa do fruto (MF); comprimento de frutos (CF); di?metro do fruto (DF); rela??o CF/DF; massa da casca (MC); espessura de casca (EC); massa da polpa (MP); rendimento de suco (RE); s?lidos sol?veis (SS); acidez titul?vel (AT) e RATIO (SS/AT). As estimativas de herdabilidade e os ganhos gen?ticos nos ambientes avaliados apresentaram boas perspectivas para sele??o de gen?tipos superiores. Houve efeito pronunciado da intera??o GxE para a maioria dos caracteres, exceto CF, RE, SS, AT e SS/AT. De acordo com o crit?rio MHPRVG os h?bridos mais est?veis e adapt?veis nos ambientes de avalia??o foram o BRS Gigante Amarelo, HFOP-09, H09-09, GP09-02, GP09-03 e BRS Sol do Cerrado. Em 88,88% dos casos as estimativas das correla??es genot?picas foram maiores do que as fenot?picas nos tr?s ambientes. Em len??is as correla??es genot?picas foram negativas entre NF x MF, DF, EC, MC, MP, SS e AT, divergindo dos demais ambientes. Nos ambientes de Dom Bas?lio e Rio de Contas a PR correlacionou se positivamente com MF, CF, DF e MC. Em todos os ambientes a sele??o de frutos com maiores MF proporcionar? maiores CF, DF, PC e PP e pela sele??o do formato de frutos ovais menor espessura de casca. De modo geral, para as correla??es entre caracter?sticas de import?ncia agron?mica, como NF x PR, SS; MF x DF, MC, MP, RATIO; DF x MC, MP, RATIO; CF/DF x EC e MC x RATIO apresentaram o mesmo comportamento nos tr?s ambientes de avalia??o, exceto para caracter?sticas NF x MF, DF, EC, MC, MP e AT em Len??is.
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Genetic Parameter Estimates of Milkability Traits in South African Holstein CattleTshilate, Thendo Stanley 18 September 2017 (has links)
MSCAGR (Animal Science) / Department of Animal Science / Milkability, or ease of milking, is the rate at which milk can be completely drawn from a cow’s udder. It is an important functional trait with regard to milking costs as well as udder health. Milkability traits have not been included in the breeding objectives of South African dairy cattle and their genetic parameters in the population have not been estimated. The primary objective of the study was to estimate genetic parameters for milkability traits in South African Holstein cattle. Data consisted of production and milkability records of 1 532 Holstein cows, from 6 herds, participating in the South African National Dairy Animal Recording and Improvement Scheme during the period 2015 to 2016 . Measures of milkability were average milk flow (AMF), maximum milk flow (MMF) and milking time (MT). Genetic parameters were estimated by a multi-trait sire model using the Restricted Maximum Likelihood (REML) procedure. Means for AMF, MMF and MT were 1.99 kg/min, 3.02 kg/min and 5.50 min, respectively. Non-genetic factors affecting variation in milkability traits were herd-year-season of calving, parity and milk yield. Heritability estimates for AMF, MMF, and MT were 0.23±0.09, h2 = 0.41±0.12 and h2 = 0.36±0.11, respectively. Genetic correlations between the three milkability traits were medium to high, ranging from -0.35±0.23 between AMF and MT to 0.79±0.09 between AMF and MMF. Correlations were positive between AMF and MMF and negative between MT and the other two traits. There was an increase in the mean EBV for AMF of 0.002 kg/min (0.0001 kg/min per year) during the period 2002 to 2014. Maximum milk flow also showed an increasing genetic trend of 0.04 kg/min (0.0003 kg/min per year) over the same period. The genetic trend for MT was undesirable, as it increased by 0.0003 kg/min. There is scope for improving milkability through selection, in South African Holstein cattle, as indicated by the moderate to high heritability estimates. The favourable genetic correlations among milkability traits imply that selection on one trait will result in a correlated improvement in the others. Results of the current study provide a basis for including milkability traits in the breeding objective for South African Holstein cattle.
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