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Resistência da planta daninha capim-branco (Chloris polydactyla) ao herbicida glyphosate / Resistance of Tall windmill grass (Chloris polydactyla) to glyphosateCaio Augusto de Castro Grossi Brunharo 16 July 2014 (has links)
Recentemente, tem sido constatadas falhas no controle da planta daninha capim-branco (Chloris polydactyla) pelo herbicida glyphosate em áreas de culturas anuais e perenes no Brasil. Suspeita-se que estas falhas sejam decorrentes da seleção de populações resistentes desta planta daninha ao glyphosate. No entanto, até o momento, poucos relatos estão disponíveis na literatura caracterizando estas falhas. Esta pesquisa teve como objetivo a caracterização dos níveis de suscetibilidade de populações que apresentaram falha de controle, assim como estudar seus mecanismos de resistência. Também foi objetivo do trabalho analisar comparativamente o crescimento das populações suscetíveis e as supostamente resistentes ao glyphosate e avaliar a eficácia de herbicidas considerados alternativos ao glyphosate. Na primeira etapa, foram estudadas 87 populações do capim-branco vinda de diferentes regiões do Brasil, das quais duas sobreviveram ao experimento designado \"screening\". Esses dois biótipos, 59 e 69, juntamente com outras 15 populações suscetíveis, foram submetidos a experimentos de dose-resposta para a caracterização de suas suscetibilidades e determinação da dose eficiente de controle, da qual foi calculada em 705,41 g e.a. ha-1 de glyphosate. Em seguida, os biótipos supostamente resistentes foram comparados a um biótipo suscetível (34) para o cálculo do fator de resistência, que variou entre 3,92 e 7,95, confirmando a resistência dos biótipos. Não foi possível inferir claramente que existem diferenças de crescimento entre os biótipos resistente e suscetível que implicaria em custo adaptativo do biótipo resistente. No entanto, fica evidente que nas fases iniciais de crescimento, o biótipo 34S foi ou superior ou estatisticamente igual ao biótipo 69R. Não foi possível estabelecer uma relação entre diferenças de suscetibilidade entre os biótipos, portanto, a resistência do biótipo 69R ao glyphosate não alterou sua suscetibilidade aos herbicidas alternativos ao glyphosate aqui estudados. Na pós-emergência, clethodim e fenoxaprop-P-ethyl foram eficientes para controlar os biótipos 34S e 69R, enquanto que em pré-emergência, todos os herbicidas testados foram eficientes. O biótipo 69R absorveu menor quantidade de 14glyphosate em relação ao biótipo 34S em todos os tratamentos, do qual foi estatisticamente inferior àqueles contendo 14glyphosate + surfactante não-iônico (0,25%), 14glyphosate + sulfato de amônio (3kg ha-1) e 14glyphosate isolado. O tratamento que proporcionou maior absorção para ambos os biótipos foi o 14glyphosate + surfactante não-iônico. O biótipo 69R teve absorção máxima (Amax) 17% inferior ao biótipo 34S e maior retenção de 14glyphosate na folha tratada. O acúmulo de ácido chiquímico no biótipo 34S foi 2,56 vezes maior que no biótipo 69R. Mutações no gene que codificam a EPSPs dos biótipos 34S e 69R não foram observadas. Por fim, baseando-se nos dados aqui obtidos, é possível afirmar que a absorção reduzida, bem como a maior retenção do 14glyphosate nas folhas do biótipo 69R, possuem papel importante na resistência desse biótipo ao glyphosate. / It has been recently observed failures in controlling Tall windmill grass (Chloris polydactyla) by glyphosate in agricultural areas in Brazil. It is suspected that these failures are due to selection of resistant biotypes to glyphosate. However, to date, few reports are available in the literature characterizing these failures. Therefore, this study aimed to characterize the levels of susceptibility of differents populations of Chloris polydactyla, and to study the possible mechanisms of resistance to glyphosate. It was also an objective of this study to build a comparative growth analysis between populations, as well as evaluating the effectiveness of alternatives herbicides to glyphosate. In the first step, 87 populations from different regions of Brazil were studied, of which two survived the experiment called \"screening\". These two biotypes, 59 and 69, along with 15 other susceptible populations were subjected to a dose- response experiment for the characterization and determination of their susceptibility to glyphosate and a baseline herbicide sensitivity was obteined, which was calculated in 705.41 g ae ha-1 of glyphosate. Then the supposedly resistant biotypes (59R and 69R) were compared to a susceptible population (34S) for calculate the resistance factor, which ranged from 3.92 to 7.95, confirming the resistance of the biotypes. It was impossible to infer accurately that there are differences in growth between the resistant and susceptible biotypes of Tall windmill grass, which would imply in fitness penalty for the resistant biotype. However, it is evident that in the early growth stages, in most of the variables analyzed, the 34S was biotype or higher or statistically equal to biotype 69R. It was not possible to establish a statistical difference in susceptibility among biotypes, therefore the resistance of 69R biotype to glyphosate did not alter its susceptibility to alternative herbicides. At post-emergence, clethodin and fenoxaprop-P-ethyl were efficient to control biotypes 34S and 69R. On the other hand, at pre-emergence, all herbicides were efficient to control both biotypes. The biotype 69R absorbed smaller amount of 14glyphosate relative to 34S biotype in all treatments, which was statistically inferior to those containing 14glyphosate + non-ionic surfactant (0.25%), 14glyphosate + ammonium sulfate (3 kg ha-1) and 14glyphosate alone. The treatment providing greater absorption for both biotypes was 14glyphosate + non-ionic surfactant. Biotype 69R absorbed 17% less than the biotype 34S and had higher treated leaf retention. The shikimic acid accumulation assay in the biotype 34S was 2.56 times higher than in biotype 69R. Mutations in the gene encoding EPSPs were not observed. Finally, based on data obtained here, it is clear that the reduced absorption and treated leaf retention of 14glyphosate in biotype 69R, have an important role in the resistance of this biotype to glyphosate.
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Regressão não linear no desdobramento da interação em experimentos com mais de um fator / Nonlinear regression in the unfolding of the interaction in experiments with more than one factorSantos, Alessandra dos 25 January 2013 (has links)
Em experimentos que envolvam um fator quantitativo e um qualitativo, é aconselhável que, se detectado efeito significativo da interação entre os fatores na análise de variância, recorra-se a análise de regressão no desdobramento da mesma, no entanto nem sempre a utilização de modelos de regressão linear é a forma mais adequada para avaliar o efeito do fator quantitativo. Neste trabalho é apresentada a forma de ajuste de um modelo de regressão não linear em um experimento com medida repetida no tempo. No experimento considerou-se o ganho de peso, em quilos, de ovinos, machos e fêmeas, da raça Santa Inês em doze idades diferentes. Conduzido como parcela subdividida, pois fator tempo não foi aleatorizado, a análise variância necessita de correção dos graus de liberdade devido à condição de esfericidade não satisfeita. A correção de Geisser e Greenhouse (G-G) foi utilizada para os efeitos da interação e do tempo. O teste F na análise de variância apresentou resultado significativo para interação entre os fatores e, no desdobramento da interação, para avaliação do efeito do fator tempo em cada nível do fator sexo foi proposto o ajuste do modelo Gompertz bem como um teste de aderência para o modelo. Após o ajuste do modelo aos dados de peso de ovinos também foi considerado no estudo a comparação dos parâmetros das curvas de machos e fêmeas. Pela análise proposta foi possível concluir que o modelo univariado, com esquema de parcelas subdivididas, pode ser utilizado em experimentos de crescimento animal, porém sua aplicação está sujeita a verificação da condição de esfericidade. Também foi verificado que incorporar, no desdobramento de interações, o ajuste do modelo Gompertz é um procedimento viável e permitiu avaliar a real qualidade de ajuste do modelo aos dados. Com a comparação dos parâmetros das curvas ajustadas verificou-se que ovinos machos e fêmeas apresentam valores estatisticamente iguais para os parâmetros α e γ, ambos relacionados com o peso ao nascer dos animais. O peso máximo esperado para fêmea (40,7kg) é estatisticamente inferior ao encontrado para os machos (57,3kg), no entanto, sua taxa de crescimento (0,011kg/dia para fêmeas) é superior (0,007kg/dia para machos), ou seja, as fêmeas atingem o peso de estabilização mais rapidamente que os machos. / In experiments involving a qualitative and a quantitative factor, it is advisable that if a significant interaction is detected between factors in the analysis of variance, one should perform regression analysis of the splitting factors. However, the use of linear regression models is not always the most appropriate way to assess the effect of the quantitative factor. This paper presents a way to fit a nonlinear regression model in an experiment with repeated measurements over time. In the experiment, the weight gain of male and female Santa Inês breed sheep, in pounds, in twelve different ages is measured. Conducted in a split-plot design, as the time factor was not randomized, the analysis of variance requires correction of the degrees of freedom, as the sphericity condition is not satisfied. The Greenhouse and Geisser correction (G-G) was used for the purposes of interaction and time. The F test in the analysis of variance showed a significant result for the interaction between the factors and the splitting of the interaction. In order to evaluate the effect of the time factor at each level of the gender factor, a Gompertz model was proposed, as well as a test of model adherence. After fitting the model to the data, a comparison study of the parameters for males and females was also made. For the proposed analysis, we concluded that the univariate model, with split-plot design, can be used in experiments of animal growth, but its application is prone to verification of the sphericity condition. They also found that the incorporation of the splitting of interactions, by adjusting the Gompertz model, is a viable procedure and allowed to evaluate the real quality of fit. By comparing the fitted parameter values, it was found that males and females have statistically identical values for the parameters α and γ, both related to the birth weight of the animals. The maximum weight expected for a female (40.7 kg) is statistically lower than that found for the males (57.3 kg), however, their growth rate (0.011 kg / day for females) is greater than the males\' (0.007 kg / day for males), i.e., females reach weight stabilization faster than males.
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An Investigation of Power Analysis Approaches for Latent Growth ModelingJanuary 2011 (has links)
abstract: Designing studies that use latent growth modeling to investigate change over time calls for optimal approaches for conducting power analysis for a priori determination of required sample size. This investigation (1) studied the impacts of variations in specified parameters, design features, and model misspecification in simulation-based power analyses and (2) compared power estimates across three common power analysis techniques: the Monte Carlo method; the Satorra-Saris method; and the method developed by MacCallum, Browne, and Cai (MBC). Choice of sample size, effect size, and slope variance parameters markedly influenced power estimates; however, level-1 error variance and number of repeated measures (3 vs. 6) when study length was held constant had little impact on resulting power. Under some conditions, having a moderate versus small effect size or using a sample size of 800 versus 200 increased power by approximately .40, and a slope variance of 10 versus 20 increased power by up to .24. Decreasing error variance from 100 to 50, however, increased power by no more than .09 and increasing measurement occasions from 3 to 6 increased power by no more than .04. Misspecification in level-1 error structure had little influence on power, whereas misspecifying the form of the growth model as linear rather than quadratic dramatically reduced power for detecting differences in slopes. Additionally, power estimates based on the Monte Carlo and Satorra-Saris techniques never differed by more than .03, even with small sample sizes, whereas power estimates for the MBC technique appeared quite discrepant from the other two techniques. Results suggest the choice between using the Satorra-Saris or Monte Carlo technique in a priori power analyses for slope differences in latent growth models is a matter of preference, although features such as missing data can only be considered within the Monte Carlo approach. Further, researchers conducting power analyses for slope differences in latent growth models should pay greatest attention to estimating slope difference, slope variance, and sample size. Arguments are also made for examining model-implied covariance matrices based on estimated parameters and graphic depictions of slope variance to help ensure parameter estimates are reasonable in a priori power analysis. / Dissertation/Thesis / Ph.D. Educational Psychology 2011
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Otimização do processo de descontaminação no sistema isolador de Bio-ManguinhosCyranka, Beatriz January 2011 (has links)
Submitted by Priscila Nascimento (pnascimento@icict.fiocruz.br) on 2012-11-30T12:31:09Z
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Previous issue date: 2011 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto de Tecnologia em Imunobiológicos. Rio de Janeiro, RJ, Brasil. / Novas tecnologias, como o sistema isolador para ensaios de esterilidade vieram a
contribuir com a incorporação de um melhor desempenho destes ensaios no
controle de qualidade das indústrias farmacêuticas.Este trabalho teve como objetivo
a verificação do processo de biodescontaminação dentro do sistema isolador de Bio-Manguinhos, utilizado como agente esterilizante o gás de peróxido de hidrogênio.
Foram utilizadas como biocarga para redução de contaminação microbiológica três
concentrações dos microrganismos, Candida albicansATCC 10231, Clostridium
sporogenesATCC 11437 eMicrococcus luteusATCC 9341, impregnadas em discos
de filtro de celulose. Os estudos de cinética de crescimento dos microrganismos
foram realizados para um melhor entendimento do seumetabolismo, bem como
aspectos gerais de crescimento que contribuíram para ressaltar que a Candida
albicans inicia sua fase exponencial de crescimento na segunda hora do cultivo e
finaliza esta etapa na sexta hora do cultivo, com produção máxima de células
viáveis, fato observado também no microrganismo Micrococccus luteus. Para o
cultivo doClostridium sporogenes o crescimento foi mais lento com uma curva de
crescimento com 60 horas de cultivo total. A produção de maior número de células
para o Clostridiumfoi alcançada na vigésima quarta hora de cultivo, assim como a
maior produção de esporos. Foi estabelecida, ao longo da curva de crescimento, a
relação entre densidade ótica e número de células viáveis, relação essa importante
para o estabelecimento das condições do estudo em relação à biocarga empregada
de cada microrganismo no momento do desafio no sistema isolador. A capacidade
de descontaminação avaliada dentro do sistema isolador com o biocida peróxido de
hidrogênio revelou o tempo de exposição ao gás de 10 minutos, como resultado final
satisfatório apresentando redução total da carga microbiana com destruição total das
células viáveis, assim como as formas esporuladas do Clostridium sporogenes.
Desta forma conclui-se que o peróxido de hidrogênioé um biocida de eficácia
comprovada, nas variáveis deste estudo e o processode descontaminação no
sistema isolador de Bio-Manguinhos é compatível comsua atividade finalística na
produção de insumos para a saúde. / New technologies such as isolator system for sterility tests came to help with the
incorporation of a better performance of these kinds of tests in quality control of
pharmaceutical companies. This study aimed to verify the decontamination process
within the system isolator of Bio-Manguinhos, usinghydrogen peroxide gas as a
sterilizing agent. Three concentrations of microorganisms were used as bioburden for
the microbiological contamination reduction, Candida albicansATCC 10231,
Clostridium sporogenesATCC 11437 and Micrococcus luteusATCC 9341,
impregnated in cellulose filter discs. Studies of growth kinetics of microorganisms
were carried out to a better understanding of theirmetabolism, as well as general
aspects of growth that contributed to emphasize that the Candida albicansbegins its
exponential growth phase in the second hour of cultivation and this step ends at the
sixth hour cultivation, with maximum yield of viable cells, this was also observed in
the Micrococcus luteusmicroorganism. For the Clostridium sporogenescultivation,
growth was slower with a 60 hours growth curve of total culture. The production of
more cells for Clostridiumwas achieved in the twenty-fourth hour of cultivation, as
well as the maximum spores production. It was established along the growth curve
the relationship between optical density and numberof viable cells, this relationship
was important to establish the conditions of the study related to the bioburden of
each microorganism used to challenge the isolator system. The decontamination
capacity evaluated within the isolator system with the hydrogen peroxide biocide
showed that the gas exposure time of 10 minutes wassatisfactory demonstrating
total reduction of the microbial load with total destruction of viable cells, as well as
the sporulated forms of Clostridium sporogenes. Thus it is concluded that hydrogen
peroxide is a proved effective biocide, in the variables of this study and
decontamination process in the Bio-Manguinhos insulator system is compatible with
its main activity in the production of health supplies.
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Potrava, růst, poměr pohlaví a hloubková distribuce okouna říčního \kur{(Perca fluviatilis L.)} v nově vytvořených jezerech v Podkrušnohoří / Food, growth, sex ratio and depth distribution of perch \kur{(Perca fluviatilis L.)} in newly created lakes in PodkrušnohoříVEJŘÍK, Lukáš January 2013 (has links)
Food, growth, sex ratio and depth distribution of perch (Perca fluviatilis L.) were studied in Milada Lake, Most Lake and Barbora Lake. These lakes were artificialy created after a coal mining. Sex ratio and depth distribution were also compared with data gathered from Vír Reservoir and Římov Reservoir. Fish designed for the research were captured by gillnets. Age analysis was carried out by otolite scanning. Food, growth and depth distribution were analysed with consideration of size and sex of the fish.
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Características do crescimento corporal, dos órgãos e tecidos de duas linhagens comerciais de frangos de corteMarcato, Simara Márcia [UNESP] 30 March 2007 (has links) (PDF)
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Previous issue date: 2007-03-30Bitstream added on 2014-06-13T20:25:13Z : No. of bitstreams: 1
marcato_sm_dr_jabo.pdf: 1013964 bytes, checksum: d793681174ebe0af179b43c6de3b4b20 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Com objetivo determinar os parâmetros de crescimento do peso vivo e da ave depenada, das penas e componentes químicos corporais, das partes, dos órgãos e tecidos de frangos de corte, machos e fêmeas das linhagens Ross e Cobb, foram utilizados 1920 pintos criados em galpão alojados em boxes. O delineamento foi inteiramente casualizado em esquema fatorial 2x2 (linhagens e sexo), 4 repetições de 120 aves cada. Foi avaliado o crescimento das aves depenadas e das penas, das partes e dos órgãos, dos músculos, ossos e peles. Foram realizados abates semanais até 56 dias de idade, após jejum de 24 horas. As aves foram pesadas para obtenção do peso de jejum, um grupo de aves foram depenados para obter o peso de penas, e as demais aves foram evisceradas e realizadas os cortes para avaliação do desenvolvimento das partes e órgãos. Após, foram pesadas, identificadas e congeladas. Posteriormente, as amostras foram moídas, liofilizadas e encaminhadas para análises de matéria seca, nitrogênio, extrato etéreo e cinzas. Foram elaboradas curvas e taxas de crescimento através da equação de Gompertz. As aves Cobb foram mais precoces no crescimento e deposição de proteína e cinzas corporais, na deposição de proteína, gordura e água das penas, na taxa de crescimento e deposição de nutrientes da coxa, dorso, cabeça, proventrículo e no crescimento do intestino. As aves Ross apresentaram maior potencial de crescimento de asa, pescoço, sobrecoxa e pés, e foram mais precoces no crescimento das penas, do fígado e deposição de água e cinzas no fígado. Houve semelhança entre as linhagens para peso do músculo, crescimento e deposição de nutrientes para o peito e coração e no peso e proteína dos ossos. / The objective of this study was determine the growth parameters of the live weight, of feathers, of parts, organs and tissues and body chemical components strains chickens, males and females Cobb and Ross broilers. Were used 1920 chicks raised in boxes from 1 to 56 days of age, distributed randomly in a factorial model (2 strains x 2 sex), with 4 replicate pens of 120 birds. The birds were fed ad libitum with diets formulated according to requirements for each age phase. The birds were weight and four birds of each group were slaughtered weekly. Afther 24 hours of fasting, the birds were slaughtered to determined body, parts, organs, tissues weight and nutrients deposition. Thereafther, samples were freeze-fried to be analized for dry matter, protein, ash and fat. The parameters of weight and in nutrient depositions obtained weekly were adjusted by the Gompertz equation in order to estimate the growth parameters Wt= Wm exp(-exp(-B(t-t))). The growth and body nutrients deposition rates were determined by derived of the equations. Cobb broilers were more precocious in growth and of body protein and ash deposition than Ross. The deposition of protein, fat and water feather, in growth rate and depositions of nutrients in the thigh, dorsum, head and proventriculum and intestine were higher compared to Ross. The of Ross boilers was bigger than Cobb wing, neck, drumstick and feet growth potential. The Ross strains were more precocious in the growth of leg, liver and depositions of water and ash in the liver. The strains had similarity growth potencial of muscle and nutrients deposition in the breast, heart and bones.
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Curva de crescimento de novilhas holandesas / Growth curve of holstein heifersFernandes, Emanuela Costa 24 July 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013-07-24 / This study aimed to evaluate the growth curve of Holstein heifers. For this purpose, 839 weight and height measurements of heifers raised in Animal Science Department of Federal University of Viçosa was collected. Data collection was performed every 30 days in confined animals fed with sugarcane and corn silage, receiving on average 1 kg / head / day of concentrate. The correlation between body weight and age of heifers was describe by four nonlinear models: Brody: Weight (W) = A x (1 be-kt)3; Gompertz: W = A x exp(- be-kt); Logistics: W = A x (1 + be-kt)-1; Von Bertalanffy: W = A x (1 be-kt), where A = represents the adult weight; k = maturity rate; b = mathematical constant, no biological definition; t = age in days. The estimation model of body weight from the wither heightwas tested using the general dataset, i.e., using 839 measurements, and separately analyzed different weight categories: 0-500 kg; 0 -400 kg and 0-300 kg, which contained, respectively, 770, 647 and 530 observations.The weight / height ratio was evaluated as function of age, adjusted a simple linear regression in function of age. Was adjusted Heinrichs and exponential models to describe the weight of heifers in function of wither height. All models were fitted using SAS®software using MODEL, NLIN and GLM procedures. Regarding the setting of nonlinear models, the Logistic model showed better results, resulting in the estimates for the parameters: mature weight of 615 kg, maturity rate of 0.0056 and sexual maturity at about 307 kg. The wither height stabilization occurred at the age of 632 days (21 months at a height of 138 cm). Exponential model showed better results compared to Heinrichs model, therefore was chosen to describe the correlation between wither height and body weight. An estimated equation for this model was given by: Weight = 4.3577 x EXP (0.0343 x ALT), where ALT = wither height. The use of body measurements as wither height to estimate body weight of Holstein heifers can be performed until the age of 21 months, allowing small farmers,who do not have scales to monitor the development of the heifers. / O presente trabalho foi conduzido para avaliar a curva de crescimento de novilhas Holandesas. Foram obtidas 839 medidas de peso e altura de novilhas criadas no Setor de Gado de Leite do Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa, MG. A coleta de dados foi realizada a cada 30 dias. Os animais foram criados em sistema confinado, com alimentação de cana de açúcar e silagem de milho, recebendo diariamente 1 kg de concentrado. A relação entre peso vivo e idade de novilhas foi descritapor meio de quatro diferentes modelos não lineares: Brody: Peso = A x (1 be-kt)3; Gompertz: Peso = A x exp(-be-kt); Logístico: Peso = A x (1 + be-kt)-1; Von Bertalanffy: Peso = A x (1 be-kt), onde: A = representa o peso adulto; k = taxa de maturidade, ou velocidade de crescimento; b = constante matemática, sem definição biológica; t = idade em dias.O modelo de estimação do peso corporal a partir da altura de cernelha foi testado com o conjunto geral de dados, i.e., utilizando as 839 medidas, e também analisou-se separadamente as categorias de peso: 0-500 kg; 0-400 kg; e 0-300 kg, as quais continham, respectivamente, 770, 647 e 530 observações. Foi realizada uma avaliação da relação peso/altura em função da idade utilizando-se uma regressão linear simples. Foram ajustadosos modelos Heinrichs e exponencial para descrever o peso das novilhas em função da altura da cernelha. Todos os modelos foram ajustados por meio do software SAS® usando os procedimentos MODEL, NLIN e GLM. Em relação ao ajuste dos modelos não lineares, o modelo Logístico apresentou melhor resultado, resultando nas seguintes estimativas para os parâmetros: peso à maturidade de 615 kg, taxa de maturidade de 0,0056 e maturidade sexual com cerca de 307 kg. A estabilização da altura de cernelha ocorreu na idade de 632 dias (21 meses a uma altura de 138 cm). O modelo exponencial apresentou melhor resultados em relação ao modelo Heinrichs, portanto foi escolhido para descrever a relação entre altura de cernelha e peso corporal. A equação estimada para este modelo foi dada por: Peso = 4,3577 x EXP(0,0343 x ALT), onde ALT é altura de cernelha. O uso de medidas corporais, como altura de cernelha, para estimar o peso corporal de novilhas Holandesas pode ser realizado até a idade de 21 meses, possibilitando aos pequenos produtores rurais, que não possuem balança, a acompanhar o desenvolvimento ponderal de suas novilhas.
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Estimativas de (co) varância genética de pesos do nascimento até a maturidade em rebanhos da raça Nelore usando modelos de regressão aleatória e de características múltiplas /Boligon, Arione Augusti. January 2008 (has links)
Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Nelore por meio de análises uni, bi e multicaracterísticas e modelos de regressão aleatória. Os dados utilizados são de animais nascidos de 1975 e 2002, provenientes de 8 fazendas participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN). Os pesos foram obtidos do nascimento aos 8 anos de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterísticas foram utilizados pesos em idades padrão como nascimento, desmama, ano, sobreano e aos 2, 3 e 5 anos de idade. Também foram realizadas análises utilizando o peso mais próximo aos 4,5 anos de idade como indicativo de peso adulto, considerando uma única medida a partir de 2, 3 e 4 anos de idade ou como registros repetidos de pesos a partir dessas mesmas idades. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento aos 8 anos de idade, considerando como variáveis independentes polinômios de Legendre da idade na data da pesagem. A variância residual foi modelada por meio de classes variando de 1 a 5. Foram utilizados 8 modelos de coeficientes de regressão aleatória para os efeitos direto e materno de animal, e de ambiente permanente de animal e materno. O modelo multicaracterística, incluindo registros de pesos ao desmame e à seleção é o mais indicado para a avaliação genética de pesos pós-desmama. Em avaliações genéticas para a característica de peso adulto, o emprego de modelos de repetibilidade, considerando pesos a partir de 3 anos de idade, seria o mais adequado em relação à utilização de medida única...(Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Weight records of Nelore cattle from birth to mature age were analyzed using univariate, bivariate, multivariate and random regression models. Records of Nelore cattle born from 1975 to 2002, from 8 herds participating in the Nelore Cattle Breeding Program (NCBP) were used. The weights were obtained from birth to 8 years of age. Weights at birth, weaning, yearling, 18 months and 2, 3 and 5 years of age were analyzed using univariate, bivariate and multivariate models. Also, as indicative of the mature weight, the weight closest to 4.5 years of age, was analyzed considering only one record or repeated records obtained from 2, 3 and 4 years of age. For random regression models age of cow varied from birth to 8 years. Direct and maternal genetic and, animal and maternal permanent environmental variances were modeled by random regression on Legendre polynomials of age at recording, with order of fit from 3 to 6 and a total of 8 models. Residual variances were modeled by a step function with 1 or 5 classes. The multivariate model including weight records at weaning and at selection age is the most indicated for genetic evaluation of pos-weaning weights. For genetic evaluation of mature weight to use repeated records obtained from 3 years of age is better than only one record per animal. The random regression models were able to model changes of variances with age adequately, with parameter estimates similar to those obtained by multivariate analyses. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects ajusted by quartic, cubic, sixth and cubic polynomials, respectively, and residual variances modeled by 5 classes, was the most adequate to describe the covariance structure of the data...(Complete abstract, click electronic access below) / Orientadora: Lucia Galvão de Albuquerque / Coorientadora: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Cláudia Cristina Paro de Paz / Mestre
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Estimação de parâmetros genéticos para características de crescimento em bovinos da raça Canchim com modelos de dimensão finita e infinita /Baldi Rey, Fernando Sebastián. January 2008 (has links)
Resumo: Foram estimados parâmetros genéticos para pesos do nascimento à idade adulta de animais da raça Canchim por meio de análises uni, bi e multicaracterística, e por modelos de regressão aleatória. Os dados analisados são provenientes do rebanho da raça Canchim da Embrapa Pecuária Sudeste, localizada no município de São Carlos, São Paulo. Os pesos foram obtidos do nascimento até os nove anos e meio de idade. Nas análises uni, bi e multicaracterística foram utilizados pesos em ao nascimento, desmama, 12, 18, 24 e 30 meses de idade e, na idade adulta. Na análise unicaracterística foram utilizados quatro modelos, em que, diferentes efeitos aleatórios (efeito genético materno e de ambiente permanente materno) foram adicionados em seqüência. Nas análises de regressão aleatória, foram utilizados pesos de fêmeas do nascimento até os nove anos e meio de idade, considerando como funções base polinômios de Legendre e funções "b-splines". A variância residual foi modelada utilizando 1, 4, 11 e 19 classes. Foram utilizados 12 modelos de regressão aleatória sobre polinômios de Legendre de segunda à sétima ordem para modelar a trajetória da variância dos efeitos genético aditivo direto e aditivo materno e de ambiente permanente direto e materno. Vinte modelos de regressão aleatória sobre funções "bsplines" foram considerados, empregando polinômios linear, quadrático e cúbico para cada segmento individual. Polinômios do mesmo grau foram considerados no modelo para todos os efeitos aleatórios. Até sete segmentos foram utilizados para os efeitos genético direto e de ambiente permanente do animal. Para os efeitos genético aditivo materno e de ambiente permanente materno foi utilizado um único segmento com dois nós nos extremos da curva Os efeitos maternos influenciam os pesos do nascimento aos dois anos de idade sendo o peso à desmama... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Genetic parameters were estimated for weights taken from birth to mature age in Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) cattle of breed by one, two and multitrait analyses and by random regression models. The data analyzed were from a herd of Canchim beef cattle belonging to Embrapa's Southeast Cattle Research Center, located in São Carlos county, state of São Paulo. Weights were taken from birth to nine and half years of age. Weights at birth, weaning, 12, 18, 24 and 30 months of age and at mature age were analyzed using one, two and multitrait models. In onetrait analyses, four models were tested, in which different random effects (genetic and environment permanent maternal effects) were added. For random regression models age of cow varied from birth to 3.542 days of age. Legendre polynomials and b-splines functions of age at recording were used as basis functions in random regression models. Residual variances were modeled by a step function with 1, 4, 11 and 19 classes. A total of 12 random regression models using Legendre polynomials as basis functions, from second to seventh order, were used to model direct and maternal genetic effects, animal and maternal permanent environmental effects. A total of twenty analyses, considering linear, quadratic and cubic b-splines functions and up to nine knots, were carried out. Spline functions of the same order were considered for all random effects. Maternal effects influenced weights from birth until two years of age, being weaning weight the most affected by maternal effects. Direct heritabilities obtained by twotrait and multitrait analyses were higher than estimates obtained from onetrait analyses. In order to estimate genetic parameters for weights after selection it is important to consider weights before selection and the multitrait analyses is the most adequate. The model with direct and maternal genetic effects, animal and maternal... (Complete abstract click electronic access below) / Orientador: Maurício Mello de Alencar / Coorientadora: Lúcia Galvão de Albuquerque / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Henrique Nunes de Oliveira / Banca: Lenira El Faro Zadra / Banca: Maria Eugênia Zerlotti Mercadante / Doutor
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Captação de ferro e efeito desse metal para crescimento e morfologia de Xylella fastidiosa / Iron uptake and effect on growth and morphology of X. fastidiosaGustavo Antonio Teixeira Chaves 07 December 2012 (has links)
O ferro é essencial para a sobrevivência das bactérias, estando envolvido em vários processos metabólicos. Apesar de sua baixa solubilidade, as bactérias dispõem de sistemas eficientes e específicos para captação, utilização e armazenamento desse metal, ao mesmo tempo controlando adequadamente a concentração de ferro livre no meio, para evitar seus potenciais efeitos tóxicos. Xylella fastidiosa é uma bactéria gram-negativa que coloniza o xilema de uma diversidade de plantas cultivadas e silvestres em várias partes do mundo, sendo o agente causador de uma série de doenças em plantas economicamente importantes como citros, videiras e café. Alguns mecanismos de virulência de X. fastidiosa já foram elencados, entre esses a formação de biofilme, que promoveria a oclusão do xilema e consequente estresse hídrico para a planta. Postula-se que a captação de ferro por X. fastidiosa, causando redução da concentração desse metal no xilema das plantas infectadas, seja uma das estratégias utilizadas pela bactéria em seu processo de infecção. Nosso objetivo neste trabalho foi de investigar o processo de captação de ferro por X. fastidiosa e avaliar em maior detalhe o efeito da concentração de ferro no crescimento e na expressão de fatores de virulência dessa bactéria, expandindo os estudos anteriormente realizados em nosso grupo. Para tal propusemos: (i) avaliar a capacidade de X. fastidiosa produzir sideróforos, pequenas moléculas quelantes de ferro; (ii) investigar, em condições de cultivo com diferentes concentrações de ferro, o perfil de expressão de alguns genes de X. fastidiosa que possam ser integrantes do stimulon do ferro; (iii) analisar o efeito da concentração de ferro no crescimento e formação de biofilme por X. fastidiosa. Observamos que X. fastidiosa parece produzir um composto quelante de ferro que pode ser um sideróforo e elencamos alguns genes que poderiam estar envolvidos na síntese desse composto. Confirmamos que ferro é necessário para o crescimento de X. fastidiosa, sendo que em alta concentração de ferro foi observada maior deposição de biofilme pela cultura bacteriana. Interessantemente também foi observado que as células crescidas em meio com pouco ferro secretaram mais exopolissacarídeos totais na fração do biofilme, o que estabelece uma relação entre as concentrações de ferro no meio com a expressão de um fator de virulência essencial para o desenvolvimento da infecção por X. fastidiosa. / Iron is an essential nutrient for bacteria, being involved in many metabolic processes. Despite its low solubility, bacteria present efficient and specific systems for uptake, utilization and storage of iron, meanwhile controlling metal concentration adequately to prevent potential toxic effects of free iron. Xylella fastidiosa is a Gram-negative bacterium which colonizes the xylem of a wide range of crops and wild species of plants worldwide. This bacterium is the agent of several diseases affecting economically important crops, such as citrus, grapevine and coffee. Among the proposed X. fastidiosa virulence mechanisms is the formation of biofilm which may occlude xylem vessels causing hydric stress. It is postulated that iron uptake might cause reduction of its concentration within the xylem of infected plants therefore constituting a virulence strategy during bacterial infection process. Our aims in this work were to investigate the process of iron uptake in X. fastidiosa and to evaluate the effect of iron concentration in the growth and morphology of this bacterium, expanding previous studies. For this we set to: (i) investigate the capacity of X. fastidiosa in producing siderophores, small biomolecules utilized for iron quelation; (ii) evaluate, under culture conditions at different iron concentrations, the expression profile of candidate genes that might be part of the iron stimulon; (iii) analyse the effect of iron concentration in growth and biofilm formation of X. fastidiosa. We observed that X. fastidiosa seems to produce a compound with iron quelating ability, such as a siderophore, and we point to a group of genes that might be involved in the synthesis of this compound. We confirmed that iron is necessary for growth of X. fastidiosa. At high concentrations of iron we observed higher biofilm production. Interestingly, we also observed that when grown in low iron concentration, X. fastidiosa secretes more exopolysaccharides (EPS) associated with the biofilm, suggesting a link between iron concentration and expression of an essential virulence factor to the infection process of X. fastidiosa.
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