The intention of this master‘s thesis is the measurment of relative variance of optical intensity. In the first place, I have been studied Kolmogorov cascade theory of turbulence and relative variance of optical intensity . In addition, I have been deal with turbulent cells, Gaussian beam, Top Hat beam and influence of the atmospheric turbulences on the intensity profile of the laser beam. Lastly I have been measured determine influence of the atmospheric turbulences on the intensity profile of the laser beam and I have been calculated relative variance of optical intensity. I have suggested the optimum beam profile in the turbulent atmosphere from acquired data.

Diploma thesis deal with design of laser beam shaping system. The theoretical part presents basic information about the light spread lika the optical beams. There are also properties of optical and optoelectronic components that are used for shaping the laser beam. The next section provides basic molding methods, their principles and qualities. In the last, experimental, part is first introduced designed computer algorithm, which is then used to calculate the quality parameters shaped laser beams. Following, there are presented the results of measurements and calculations for some of these methods.

Suite à l'observation d'une différence de rendement de photomarquage entre le récepteur AT[indice inférieur 1] humain (hAT[indice inférieur 1]) marqué avec un agoniste et un antagoniste, nous avons voulu identifier le point de contact entre le récepteur et la position 3 du ligand en fonction de l'état d'activation du récepteur ou de l'activité intrinsèque du ligand. Pour ce faire, nous avons utilisé deux analogues de l'angiotensine II, le [Sar[indice supérieur 1] Bpa[indice supérieur 3]] Ang II, un agoniste partiel, et le [Sar[indice supérieur 1] Bpa[indice supérieur 3] Ile[indice supérieur 8]] Ang II, un antagoniste et la méthode de photomarquage par affinité. Les analogues ont une forte affinité pour le récepteur hAT[indice inférieur 1]-WT avec des K[indice inférieur d] respectifs de 1,2nM et 0,7nM. De plus, pour travailler avec différents états d'activation du récepteur nous avons utilisé les récepteurs mutants constitutivement actifs hAT[indice inférieur 1]-N111G et hAT[indice inférieur 1]-N111G-I172M produits par mutagenèse dirigée, le récepteur de type sauvage (hAT[indice inférieur 1]-WT) et un récepteur constitutivement inactif hAT[indice inférieur 1]-N111W. À l'aide des analogues monoiodés ([indice supérieur 125]I-[Sar[indice supérieur 1] Bpa[indice supérieur 3]] Ang II et [indice supérieur 125]I-[Sar[indice supérieur 1] Bpa[indice supérieur 3] Ile[indice supérieur 8]] Ang II), nous avons spécifiquement photomarqué le récepteur hAT[indice inférieur 1]-WT et les différents mutants transfectés dans des cellules COS-7. L'étude des rendements de photomarquage a démontré un meilleur rendement avec le ligand [Sar[indice supérieur 1] Bpa[indice supérieur 3] Ile[indice supérieur 8]] Ang II pour le récepteur hAT[indice inférieur 1]-WT. Le récepteur mutant hAT[indice inférieur 1]-N111G ne voyait pas de différence entre les deux ligands et avait un rendement très élevé, il en était de même pour le récepteur mutant hAT[indice inférieur 1]-N111W. Ainsi, l'état d'activation du récepteur ne changerait pas la proximité du résidu 3 et de son contact. Alors le contact serait peut-être réorienté. Pour déterminer cette région, nous avons fait l'analyse des complexes covalents séparés sur gel de polyacrylamide (SDS-PAGE) qui a révélé une bande radioactive de poids similaire pour tous les récepteurs correspondant à la masse relative apparente d'environ 100 kDa. Les complexes marqués ont ensuite subi diverses digestions pour déterminer la région de contact entre la 3[indice supérieur e] position de l'Ang II et les différents récepteurs mutés. Suite à ces digestions nous avons été en mesure de conclure que la région de contact se situait entre N[indice supérieur 168]-E[indice supérieur 173]. Afin de vérifier si la région de contact était la même pour le récepteur hAT[indice inférieur 1]-WT et le récepteur mutant hAT[indice inférieur 1]-N111G nous avons déterminé s'il y avait une monopolisation du marquage, qui est un indice de proximité du point de contact. Ces résultats permettent de conclure que la région de contact entre la position 3 de l'angiotensine II et le récepteur hAT[indice inférieur 1] activé est la même que pour le récepteur inactivé. Ainsi, peu de mouvements seraient observés dans cette région lors de l'activation du récepteur.

Le virus de la leucémie bovine (BLV) est un rétrovirus B-lymphotrope qui a été identifié comme l’agent étiologique de la leucose bovine enzootique. L’infection par le BLV se caractérise par l’absence de virémie due à la latence du virus dans la majorité des cellules infectées. Cette latence résulte de la répression transcriptionnelle du provirus in vivo; elle favorise très probablement le développement tumoral en permettant aux cellules infectées d’échapper au système immunitaire de l’hôte. Cependant, la transcription du BLV peut être activée de manière rapide et très efficace par la protéine virale TaxBLV. La trans-activation par TaxBLV joue un rôle crucial dans la pathogenèse associée au BLV car elle permet la production de nouvelles particules virales nécessaires à la propagation du virus. Au cours de notre travail de thèse, nous avons étudié différents mécanismes impliqués au cours de ces deux phases clés (latence et trans-activation par TaxBLV) de l’expression du BLV. Le promoteur unique de la transcription du BLV se situe à l’extrémité 5’ du génome proviral, dans la longue répétition terminale 5’ (LTR 5’) composée des régions U3, R et U5. Les mécanismes impliqués dans la trans-activation du LTR 5’ par TaxBLV sont encore mal connus. La trans-activation du LTR 5’ du BLV par TaxBLV requiert la présence de trois répétitions imparfaites de 21pb (TxREs pour Tax Responsive Elements) agissant en cis et situées dans la région U3. Chacune des TxREs possède dans sa partie centrale un motif imparfait de 8 nucléotides correspondant au site de liaison des protéines de la famille CREB/ATF (sites CREs pour cAMP-Responsive Element). Des expériences de retard de migration sur gel ont montré que les protéines CREB, ATF-1 et ATF-2 lient les CREs viraux in vitro. Comme TaxBLV ne semble pas capable de lier directement l’ADN du LTR, il a été suggéré que les facteurs CREB/ATF serviraient de médiateurs de la trans-activation par TaxBLV. De plus, il a également été suggéré au cours de ces dernières années que les facteurs de transcription CREB/ATF jouent aussi un rôle essentiel en l’absence de TaxBLV lors de l’initiation de la transcription virale. CREB/ATF sont connus pour recruter les co-activateurs CBP/p300 qui possèdent une activité histone-acétyltransférase, suggérant qu’à l’instar d’autres rétrovirus tels que HIV-I ou HTLV-I, l’acétylation protéique pourrait jouer un rôle important dans la régulation de la transcription du BLV. Au cours de la première partie de ce travail, nous avons mis en évidence un synergisme transcriptionnel entre TaxBLV et les inhibiteurs de désacétylases TSA et NaBut, indiquant que l’acétylation protéique joue un rôle important dans la trans-activation par TaxBLV. Nous avons ensuite montré que ni TaxBLV, ni son médiateur CREB ne sont acétylés in vivo au niveau d’un résidu lysine interne, mais que la TSA synergise avec TaxBLV via un mécanisme indirect, sensible à l’inhibition de la synthèse protéique. Fonctionnellement, CREB/ATF semblent jouer un rôle crucial dans le synergisme TaxBLV/TSA car la mutation des CREs viraux ou la sur-expression d’un dominant négatif CREB inhibent ce synergisme. Des expériences de gel retard et de ChIP ont démontré, in vitro et in vivo, que les inhibiteurs de désacétylases augmentent la liaison des facteurs CREB/ATF aux TxREs. Nos résultats suggèrent donc que le synergisme TaxBLV/TSA serait dû à une augmentation de la trans-activation par TaxBLV observée suite à l’augmentation, induite par la TSA, du recrutement de CREB/ATF au niveau des TxREs. CREB/ATF appartiennent à la famille des facteurs de transcription CREB/CREM/ATF agissant au niveau des promoteurs contenant des éléments CREs. Cependant, la liaison de CREM aux CREs imparfaits du LTR du BLV n’a jamais été étudiée. Dans la seconde partie de ce travail, nous avons montré que des isoformes du gène CREM sont exprimées dans des PBMCs isolés à partir d’un mouton infecté par le BLV et que ces protéines CREM sont capables de lier in vitro et in vivo le promoteur du BLV, via les motifs CREs présents au centre de chacune des TxREs. Des analyses fonctionnelles ont ensuite montré qu’en l’absence de TaxBLV, la surexpression de l’isoforme activatrice CREMt induit la transcription dirigée par le LTR 5’ du BLV. Les résultats que nous avons obtenus suggèrent que CREMt serait capable d’activer la transcription du BLV en réponse à l’activation des cellules B infectées, via la phosphorylation de la sérine 117 de CREMt et via le recrutement par CREMt des co-activateurs CBP/p300. CREMt serait donc impliqué dans les stades précoces de l’initiation de la transcription du BLV. Cependant, nous avons montré que CREMt n’est pas impliqué dans les stades tardifs de l’expression virale puisqu’il ne semble pas capable d’induire la trans-activation par TaxBLV. Au contraire, nous avons montré par des expériences de compétition que CREMt diminue la trans-activation par TaxBLV lorsque celle-ci est induite par CREB, probablement en entrant en compétition avec CREB pour la liaison au niveau des TxREs. L’expression du gène CREM est régulée transcriptionnellement et post-transcriptionnellement et mène à la production de différentes isoformes capables d’agir comme des activateurs ou des répresseurs de la transcription. Des expériences de RT-PCR nous ont permis de mettre en évidence la présence d’isoformes répressives ICER dans les cellules YR2 infectées par le BLV. Par des expériences de transfection transitoire, nous avons montré qu’ICER est capable de réprimer la trans-activation par TaxBLV, suggérant qu’ICER retarderait la trans-activation par TaxBLV afin d’échapper au système immunitaire de l’hôte infecté jusqu’à ce qu’un niveau suffisant du trans-activateur TaxBLV soit produit.

Undersökningen är baserad på en intervjustudie med tio reportrar på kvällstidningarna Expressen och Aftonbladet. Syftet är att undersöka hur hotbilden riktad mot svenska reportrar ser ut. Studien syftar även till att undersöka om tidningarnas digitalisering har ökat hatet mot yrkesgruppen, samt om det finns några skillnader i hotbilden riktad mot manliga respektive kvinnliga journalister. Den tidigare forskningen om ämnet är bristfällig och vi har därför valt att beskriva utgå från forskning och teorier som rör ämnet och vår frågeställning, vilket är statistik på anmälningar av hat och hot i Sverige och forskning kring sexuella trakasserier. Som teoretiskt ramverk har vi använt oss av Jöran Höks problematisering av medieutveckling samt Thomas Hanitzsch modell av journalistisk kultur. Undersökningen visar att det finns en normalisering av de hot som journalisterna mottar. Majoriteten av våra intervjupersoner har betonat att de negativa kommentarerna de mottar inte är något personligt, utan riktar sig mot yrkesgruppen journalister. Många uttrycker också att reportrar på kvällstidningar är illa omtyckta inom denna yrkesgrupp. Trots det kunde vi i undersökningen dra slutsatsen att majoriteten av hoten var personligt riktade. Undersökningen visar också att det finns skillnader mellan manliga och kvinnliga reportrar när det gäller genre av hot. De kvinnliga intervjupersonerna mottar till större del sexuella kommentarer, men också kommentarer riktat mot yrkesprestationen. Medan de manliga intervjupersonerna till större del mottar kommentarer riktat mot deras yrkesprestation. Något vi initialt inte räknat med är den mängd rasistiska kommentarer som våra intervjupersoner mottar dagligen. Detta valde vi därför att fördjupa oss i ämnet högerextremism under arbetets gång.

Denna studie syftar till att undersöka hur kvinnliga sportjournalister upplever det hat och hot de får motta och huruvida haten och hoten är kopplat till att de är kvinnor. Vi har utfört fem stycken kvalitativa semistrukturerade intervjuer med kvinnor som är eller har varit sportjournalister. Följande frågeställningar har använts i studien: - Hur upplever informanterna att det hot och hat de får motta påverkar deras yrkesroll? - I vilken utsträckning upplever informanterna att hatet och hoten är relaterade till deras kön? - På vilket sätt framförs haten och hoten mot informanterna? - I vilken utsträckning har informanterna fått anpassa sitt arbete utifrån hot och hat? - Hur upplever informanterna omfattningen av hat och hot, och har det ökat eller minskat de senaste åren? Resultatet visade att fyra av fem informanter hade fått motta hot eller hat. Alla fyra hade någon eller flertalet gånger mottagit könsrelaterat hot och hat, och de uppgav att samtliga hot kom från män. Kvinnorna berättade också att det hårda klimatet, framför allt på nätet, har gjort att de ibland undviker att skriva om vissa ämnen som de vet kan trigga hatarna.   Sporten och sportjournalistiken är ett område som historiskt, och i stor utsträckning fortfarande, domineras av männen. I denna studie vittnar de kvinnliga sportjournalisterna om att det är när de kliver in på detta journalistiska fält som präglas av en manlig doxa, som de får motta hat och hot. Att kommentera matcher eller att uttrycka en åsikt är det som resulterar i mest hat.

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We analyze full-orbit phase curve observations of the transiting hot Jupiters WASP-19b and HAT-P-7b at 3.6 and 4.5 mu m, obtained using the Spitzer Space Telescope. For WASP-19b, we measure secondary eclipse depths of 0.485% +/- 0.024% and 0.584% +/- 0.029% at 3.6 and 4.5 mu m, which are consistent with a single blackbody with effective temperature 2372 +/- 60 K. The measured 3.6 and 4.5 mu m secondary eclipse depths for HAT-P-7b are 0.156% +/- 0.009% and 0.190% +/- 0.006%, which are well described by a single blackbody with effective temperature 2667 +/- 57 K. Comparing the phase curves to the predictions of one-dimensional and three-dimensional atmospheric models, we find that WASP-19b's dayside emission is consistent with a model atmosphere with no dayside thermal inversion and moderately efficient day-night circulation. We also detect an eastward-shifted hotspot, which suggests the presence of a superrotating equatorial jet. In contrast, HAT-P-7b's dayside emission suggests a dayside thermal inversion and relatively inefficient day-night circulation; no hotspot shift is detected. For both planets, these same models do not agree with the measured nightside emission. The discrepancies in the model-data comparisons for WASP-19b might be explained by high-altitude silicate clouds on the nightside and/or high atmospheric metallicity, while the very low 3.6 mu m nightside planetary brightness for HAT-P-7b may be indicative of an enhanced global C/O ratio. We compute Bond albedos of 0.38 +/- 0.06 and 0 (<0.08 at 1 sigma) for WASP-19b and HAT-P-7b, respectively. In the context of other planets with thermal phase curve measurements, we show that WASP-19b and HAT-P-7b fit the general trend of decreasing day-night heat recirculation with increasing irradiation.

Over the past two decades movement of cattle towards the north of Uganda has enabled the Trypanosoma brucei rhodesiense focus in south-eastern Uganda to spread into previously unaffected districts. This thesis brings together important epidemiological data regarding the impact of mass cattle drug treatment on the point prevalence of several different species of trypanosome in a newly endemic area of human sleeping sickness. Crucially the findings illustrate mass drug treatment is effective in reducing the prevalence of T. b. rhodesiense in cattle, thus minimising the reservoir potential of these animals in the epidemiology of human disease. During 2006 a control programme was launched to halt the northward spread of this zoonotic parasite. This programme, entitled ‘Stamping Out Sleeping Sickness’ (SOS) proposed to reduce the prevalence of Human African Trypanosomiasis (HAT) in the newly affected districts by reducing the prevalence of this parasite in the main animal reservoir of infection – domestic cattle. Cattle were mass treated using trypanocides to clear infections. Previous work demonstrated the prevalence of T. brucei s. l. and T. b. rhodesiense in cattle was higher in the districts of Dokolo and Kaberamaido than in the other SOS intervention districts (Selby 2011). To determine whether animals in these areas were also exposed to pathogenic cattle trypanosomes samples were screened for the presence of T. vivax and T. congolense savannah using PCR. Chapter three of this thesis determined the prevalence of these trypanosomes in cattle in these districts. Before treatment had taken place the prevalence of T. vivax was 2% (4/200, 95% CI 3.57 – 0.12%) in Dokolo and 7.3% (21/310, 95% CI 10.17 - 4.24 %) in Kaberamaido. The prevalence of T. congolense savannah at baseline was 3.5% (7/200, 95% CI 7.08–1.42 %) in Dokolo and 9.1% (21/230, 95% CI13.6–5.7 %) in Kaberamaido. Monitoring was conducted three, nine and 18 months post treatment and both pathogens were detected at all time points. The impact the treatment had on point prevalence varied by trypanosome species and between the two districts. Several clusters of villages in Dokolo and Kaberamaido continued to report cases of HAT after the initial SOS intervention due in part to their proximity to livestock markets (Batchelor et al., 2009). In 2008 re-treatment of these ‘high risk’ areas was undertaken. Monitoring was performed before and six months after treatment. Cattle blood samples were collected at 20 village sites from ten ‘case-positive villages’ (from which human sleeping sickness cases had been reported six months prior to June 2007) and from ten ‘case-negative villages’ (no reported human sleeping sickness cases six months prior to June 2007). These samples were screened for all of the aforementioned trypanosomes using species specific PCR protocols. Chapter five details the results of this screening, and assessed whether re-treatment in Dokolo and Kaberamaido was effective in reducing the prevalence of trypanosomiasis. The re-treatment had a dramatic effect, significantly reducing the point prevalence of overall trypanosomiasis in the 20 villages screened from 38.1% (95% CI = 40.5 – 35.79%) at baseline to 26.9% (95% CI 28.96 – 24.97, p < 0.0001) at six months. Looking at each species separately, point prevalence of three out of four detected species of trypanosome fell significantly, including T. b. rhodesiense, which was reduced to 25% of its baseline prevalence. Finally the two SOS treatment cycles were compared both statistically and spatially with emphasis on trends at village level and the occurrence of mixed infections.

Master of Science / Department of Electrical and Computer Engineering / William B. Kuhn / This work was a part of NASA EPSCoR Project NNX11AM05A: Biosensor Networks and Telecommunication Subsystems for Long Duration Missions, EVA Suits, and Robotic Precursor Scout Missions. The project’s main goal is the development of a wireless sensor network inside an astronaut’s spacesuit. Antennas are essential components in a wireless network. Since this antenna will be used inside the spacesuit it is important to consider both the physical size limitations and the desired antenna polarization. After exploring the WWVB radio station antenna which provides the preferred vertical polarization and has a suitable aspect ratio, the top hat antenna seemed promising for intrasuit communication. The design of a top hat antenna is outlined. Then, the antennas were tested using 433 MHz radios in a full scale model spacesuit. This spacesuit was designed specifically to model the behavior of aluminized mylar in the real suit. Test results support the feasibility of an intrasuit wireless network. If a gateway radio is placed on the chest or back, a sensor could be placed anywhere on the body and provide an adequate signal. These initial tests did not include a matching network, but the additional link-margin afforded by a matching network, even an imperfect match, is considered. Energy harvesting is explored as an alternative to batteries powering the intrasuit radio. In the oxygen rich environment of a spacesuit, even the smallest spark can be catastrophic. A variety of energy harvesting options are explored with a focus on thermal energy harvesting. The temperature difference between the human skin and the astronaut’s Liquid Cooling and Ventilation Garment can be used to produce a small voltage. To increase the voltage a step-up converter is implemented. Final integration of the two systems with a biosensor is left for on-going work in the three year NASA project.