Made available in DSpace on 2015-01-26T13:21:24Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-04-22Bitstream added on 2015-01-26T13:30:32Z : No. of bitstreams: 1 000797010.pdf: 1250816 bytes, checksum: 1af36177fcc1dfc25a11c59958a55c25 (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A subfamília Corydoradinae possui um total de 183 espécies válidas, incluindo os gêneros Aspidoras, Brochis, Scleromystax e Corydoras, o maior entre os Siluriformes e muito conhecido em aquariofilia. Os Callichthyidae apresentam uma ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde rios da vertente do Pacífico, no Panamá, até a bacia do rio da Prata, no leste da Argentina e, além disto, ocorrem em vários ambientes, incluindo grandes rios de água rápida e bem oxigenada até pequenos riachos de água quase parada e estagnada, e mesmo poças de água ácida no interior de florestas. Considerando o uso promissor do DNA barcode para a identificação de espécies, o presente trabalho testou a hipótese de que é possível identificar molecularmente as espécies de um grupo especioso de peixes, no caso a subfamília Corydoradinae, utilizando a técnica de DNA barcoding e, os dados gerados foram disponibilizados ao banco de dados internacional. Sequências parciais do COI foram obtidas para 610 espécimes, representando 94 espécies. Um total de 80 espécies (85%) foi discriminado corretamente com o DNA barcoding, sendo que a maioria das espécies exibiu baixas distâncias genéticas intraespecíficas, cerca de 30 vezes menor que a distância entre espécies congenéricas. Sete pares de espécies apresentaram divergência menor que 2% entre elas, o que pode estar relacionado com à grande similaridade morfológica e, portanto a difícil identificação em nível de espécie. Este estudo evidenciou que as espécies da subfamília Corydoradinae analisadas, puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode gerando dados que podem fornecer subsídios para estudos posteriores desta fauna / The subfamily Corydoradinae with a total of 183 valid species, and includes, among Aspidoras, Brochis and Scleromystax, the genus Corydoras, the largest among the Siluriformes and very well known in the aquarium hobby. Callichthyidae have a wide geographical distribution, occurring from rivers of the Pacific slope, in Panama, to the basin of the La Plata River in eastern Argentina. Considering the promising use of DNA barcode to species identification, the present study aimed to test the hypothesis that it is possible to molecularly identify the species of Corydoradinae, using the technique of DNA barcoding and with the data generated to create a database to allow molecular identification of the specimens studied. Partial sequences of COI were obtained for 610 specimens, representing 94 species. A total of 80 species (85%) were discriminated correctly with DNA barcoding, and most species exhibited low intra-specific genetic distances, approximately 30 times smaller than the distance between congeneric species. Seven pairs of species showed less than 2% divergence between them, due to a relevant morphological similarity and therefore difficult to identify to species level. This study showed that the species of the subfamily Corydoradinae analyzed, could be identified efficiently by using barcode generating data that can provide information for further studies of this fauna

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3095.pdf: 1545712 bytes, checksum: fb785bf4285325c762ff7f39a652816f (MD5) Previous issue date: 2010-05-24 / The present study was aimed to assess the role of the flood pulse related to the composition of the ichthyofauna of the Caiçara Basin System (Upper Baía Caiçara/UBC e Lower Baía Caiçara/LBC) in a pantanal environment, in Cáceres, Mato Grosso. 90,041 specimens were collected from September 2005 to September 2007, distributed in two classes, 8 orders, 32 families and 171 species, with 145 of them occurring in both environments. Characiforms, Siluriforms and Gymnotiforms were the most representative orders accounting for more than 90% of all the species obtained in the sampled environments. The UBC, with 155 collected species, considering the two sampled cycles, obtained 68 and 81 constant species, accounting for 50 and 56% of the total species in this bay. In the LBC, with 161 sampled species, the constant species were most significant, with respectively 43 and 56% per cycle and 54 species for the entire sampling period. Odontostilbe pequira, Serrapinnus calliurus and Moenkhausia dichroura were abundant in all the periods. M. dichroura was the most abundant species in practically all the periods and environments. Cyphocharax gillii and Hypoptopoma inexspectatum (detritivores) were abundant in the ebb tide and dry periods. Acestrorhynchus pantaneiro and Roeboides prognathus were the most abundant piscivores in the ebb tide period. Hemiodus orthonops was abundant in the flood and high tide periods. Among the invertivores/insectivores, M. dichroura and O. pequira were abundant in all the seasonal periods. Concomitantly to the fish collection, data from the limnological variables in the two sampled environments were also obtained, which showed significant differences between the seasonal periods. In the dry periods, the UBC remained totally disconnected from the Paraguay River, and the BCI obtained a smaller water amount from the main channel. In the flood period the connectivity between the UBC and the Paraguay River was reestablished. The concentration of dissolved oxygen varied from 0.67 to 5.94 mg/l in BCS and 0.64 and 5.87 mg/l in the LBC. The highest water temperatures were observed during the flood period (31.35 °C) and the lowest temperature during the dry period (22.33°C). Concerning electrical conductivity, the highest values were observed in the flood period (84.19 μS.cm-1). The lowest values were obtained in the ebb tide period (23.30 μS.cm-1). It obtained the lowest pH values (5.66) in the high tide period, and the highest pH values (7.50) in the dry period. Characiforms and Siluriforms were the orders that showed the best adaptation to the variations caused by the flood pulse of this system and the limnological attributes (dissolved oxygen, pH, electrical conductivity in water, pH, water transparency and depth) are decisive in the arrangement of the ichthyofauna, but their action is not isolated. On the contrary, they are interdependent together with the river-basin connectivity. / Este trabalho teve por objetivo estudar o papel do pulso de inundação relacionado à composição da ictiofauna do sistema de baías Caiçara (Baía Caiçara Superior BCS e Baía Caiçara Inferior BCI), no pantanal de Cáceres MT. Foram coletados 90.041 espécimes, de setembro de 2005 a setembro de 2007, compreendendo dois ciclos, distribuídos em duas classes, 8 ordens, 32 famílias e 171 espécies, representando 63% de toda ictiofauna descrita para todo o ambiente pantaneiro. As Ordens Characiformes e Syluriformes foram as mais representativas, com 81,9% de todas as espécies obtidas para o sistema estudado. BCS, com 155 espécies coletadas, obteve 68 (Ciclo I) e 81 (Ciclo II) espécies constantes, representando 50 e 56% do total para essa baía. Em BCI, com 161 espécies amostradas, as espécies constantes foram mais significativas, com respectivamente 43 e 56% por ciclo e 54 espécies para todo o período amostral. Odontostilbe pequira, Serrapinnus calliurus e Moenkhausia dichroura foram abundantes em todos os períodos. M. dichroura foi a espécie mais abundante em praticamente todos os períodos e ambientes. Cyphocharax gillii e Hypoptopoma inexspectatum (detritívoros) foram abundantes no período de vazante e estiagem. Acestrorhynchus pantaneiro e Roeboides prognathus se destacaram entre os piscívoros na vazante. Hemiodus orthonops foi abundante nos períodos de enchente e cheia. Dentre os invertívoros/insetívoros, M. dichroura e O. pequira foram abundantes em todos os períodos sazonais. Concomitante as coletas de peixes também foram obtidos os dados das variáveis físicas e químicas, apresentando diferenças significativas entre os períodos sazonais. Nos períodos de estiagem BCS permaneceu totalmente desconectada do rio Paraguai, e BCI obteve um menor aporte hídrico do canal principal. No período de enchente foi restabelecida a conexão entre BCS e o rio Paraguai. A concentração de oxigênio dissolvido variou de 0,67 a 5,94 mg/l em BCS e 0,64 e 5,87 mg/l em BCI. As maiores temperaturas da água foram observadas no período de enchente (31,35 °C) e a menor no período de estiagem (22,33°C). Para a condutividade elétrica observam-se maiores valores na enchente (84,19 μS.cm-1). Os menores valores foram obtidos na vazante (23,30 μS.cm-1). No período de cheia apresentou os menores valores de pH (5,66), e na estiagem os maiores (7,50). Characiformes e Siluriformes são as ordens mais adaptadas às variações decorrentes do pulso de inundação neste sistema e os atributos limnológicos (oxigênio dissolvido, pH, condutividade elétrica da água, pH, transparência da água e profundidade) são decisivos na estruturação da ictiofauna, mas não atuam de maneira isolada, sendo interdependentes, juntamente com a conectividade rio-baía.

Orientador: Claudio de Oliveira / Banca: Luiz Henrique Garcia Pereira / Banca: Gleisy Semencio Avelino / Resumo: A subfamília Corydoradinae possui um total de 183 espécies válidas, incluindo os gêneros Aspidoras, Brochis, Scleromystax e Corydoras, o maior entre os Siluriformes e muito conhecido em aquariofilia. Os Callichthyidae apresentam uma ampla distribuição geográfica, ocorrendo desde rios da vertente do Pacífico, no Panamá, até a bacia do rio da Prata, no leste da Argentina e, além disto, ocorrem em vários ambientes, incluindo grandes rios de água rápida e bem oxigenada até pequenos riachos de água quase parada e estagnada, e mesmo poças de água ácida no interior de florestas. Considerando o uso promissor do DNA barcode para a identificação de espécies, o presente trabalho testou a hipótese de que é possível identificar molecularmente as espécies de um grupo especioso de peixes, no caso a subfamília Corydoradinae, utilizando a técnica de DNA barcoding e, os dados gerados foram disponibilizados ao banco de dados internacional. Sequências parciais do COI foram obtidas para 610 espécimes, representando 94 espécies. Um total de 80 espécies (85%) foi discriminado corretamente com o DNA barcoding, sendo que a maioria das espécies exibiu baixas distâncias genéticas intraespecíficas, cerca de 30 vezes menor que a distância entre espécies congenéricas. Sete pares de espécies apresentaram divergência menor que 2% entre elas, o que pode estar relacionado com à grande similaridade morfológica e, portanto a difícil identificação em nível de espécie. Este estudo evidenciou que as espécies da subfamília Corydoradinae analisadas, puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode gerando dados que podem fornecer subsídios para estudos posteriores desta fauna / Abstract: The subfamily Corydoradinae with a total of 183 valid species, and includes, among Aspidoras, Brochis and Scleromystax, the genus Corydoras, the largest among the Siluriformes and very well known in the aquarium hobby. Callichthyidae have a wide geographical distribution, occurring from rivers of the Pacific slope, in Panama, to the basin of the La Plata River in eastern Argentina. Considering the promising use of DNA barcode to species identification, the present study aimed to test the hypothesis that it is possible to molecularly identify the species of Corydoradinae, using the technique of DNA barcoding and with the data generated to create a database to allow molecular identification of the specimens studied. Partial sequences of COI were obtained for 610 specimens, representing 94 species. A total of 80 species (85%) were discriminated correctly with DNA barcoding, and most species exhibited low intra-specific genetic distances, approximately 30 times smaller than the distance between congeneric species. Seven pairs of species showed less than 2% divergence between them, due to a relevant morphological similarity and therefore difficult to identify to species level. This study showed that the species of the subfamily Corydoradinae analyzed, could be identified efficiently by using barcode generating data that can provide information for further studies of this fauna / Mestre

Resumo: O rio Ribeira de Iguape e os rios litorâneos drenam uma importante faixa de terras da região leste de São Paulo e sua ictiofauna de água doce tem algumas semelhanças e muitas diferenças em relação às drenagens continentais. Os levantamentos ictiofaunísticos realizados nesses rios, como nas outras grandes bacias hidrográficas brasileiras, são ainda incompletos. Além disso, não existe consenso acerca do status taxonâmico de muitas espécies listadas nesses levantamentos. As estimativas disponíveis sugerem que existam cerca de 100 espécies de água doce na bacia do Ribeira de Iguape e 50 nos rios litorâneos. Estudos recentes têm proposto o uso do gene mitocondrial Citocromo Oxidase subunidade I (Cox 1) como um sistema global de identificação para as plantas e animais. Essas sequências têm sido interpretadas como um código de barras (barcode), com as espécies sendo delimitadas por uma sequência particular ou por um conjunto de sequências muito similares. Foram obtidas e analisadas 400 sequências do gene Citocromo Oxidase subunidade I (Cox1) de 68 espécies para a bacia do Ribeira de Iguape e 315 sequências de 58 espécies pertencentes aos rios costeiros do estado de São Paulo. A distância K2P média encontrada entre indivíduos dentro das espécies do Ribeira de Iguape foi de 0,41 %, e 6,32% entre espécies dentro de um mesmo gênero, similar ao encontrado nos rios costeiros onde a distância K2P foi de 0,77% dentro de espécies, em comparação à 6,16% entre espécies dentro de um mesmo gênero. Todas as espécies puderam ser diferenciadas por sua sequência Cox1, embora alguns indivíduos isolados de espécies distintas apresentaram haplótipos característicos de uma espécie do mesmo gênero. O presente estudo evidenciou que as espécies de peixes analisadas puderam ser identificadas de forma eficiente através da utilização do barcode, e pode ser usada para aplicações / Abstract: The Ribeira Iguape river and coastal rivers drain a large range of land east of São Paulo and its freshwater fishes has some similarities and many differences frem the continental drainage. Surveys conducted ichthyofauna in these rivers, as in other large river basins in Brazil, is still incomplete. Moreover, there is no consensus on the taxonomic status of many species Iisted in these surveys. Available estimates suggest that there are about 100 freshwater fishes species in the Ribeira Iguape basin and 50 in coastal rivers. Recent studies have proposed the use of mitochondrial gene cytochrome oxidase subunit I (Cox 1) as a global system of identification for plants and animais. These sequences have been interpreted as a barcodes, with species being bounded by a particular sequence or a set of very similar sequences. Were obtained and analyzed 400 sequences of the gene cytochreme oxidase subunit I (Cox1) from 68 species of Ribeira de Iguape basin and 315 sequences of 58 species of coastal rivers from Sao Paulo state. The average K2P distance between individuais within species of Ribeira Iguape basin was 0.41 % and 6.32% between species within a genus, similar to that found in coastal rivers where the K2P distance was 0.77% within species, compared to 6.16% between species within the same genus. Ali species were differentiated by their sequence Cox1, although some isolated individuais of different species had haplotypes of species of the same gender. The present study showed that fish species analyzed could be identified efficiently using barcode, and can be used for subsequent applications in ecology and systematics / Orientador: Claudio de Oliveira / Coorientador: Oswaldo Takeshi Oyakawa / Banca: Cristina Yumi Miyaki / Banca: Anderson Luís Alves / Banca: Fábio Porto-Foresti / Banca: Ricardo Cardoso Benine / Mestre

Um dos principais objetivos da Biologia Subterrânea é identificar e entender as modificações morfológicas apresentadas pelos organismos subterrâneos que podem ser relacionadas a seu modo de vida. No presente trabalho, realizamos essa investigação utilizando como modelo as espécies subterrâneas de Ituglanis Costa & Bockmann, 1993 (Siluriformes: Trihomycteridae). Atualmente são conhecidas sete espécies subterrâneas do gênero, as quais se distribuem em regiões geográficas muito próximas entre si, as áreas cársticas de São Domingos e de Mambaí e Posse, no nordeste do estado de Goiás. Analisamos caracteres externos (tamanho e alonga-mento corporal, nadadeiras pares e pigmentação) e sensoriais (olhos, barbilhões, sistema láte-rosensorial e encéfalo), e identificamos tendências de modificação em todos eles. As espécies subterrâneas de Ituglanis tendem a apresentar: alongamento do corpo e, nas espécies que tran-sitam ou ocupam espaços confinados, redução do tamanho corporal; nadadeiras peitorais mais longas e com mais raios, e as pélvicas reduzidas; pigmentação reduzida, os cromatóforos me-nos abundantes e com formas irregulares; olhos menores, deformados, assimétricos e encober-tos por pele; barbilhões bem desenvolvidos, os maxilares mais longos; sistema láterosensorial de canais fragmentado e reduzido, com grande variabilidade e assimetria; e o encéfalo com lobos vagais e faciais desenvolvidos, lobos ópticos reduzidos e aumento do tamanho do cere-belo, da bexiga natatória e dos canais semicirculares do ouvido interno. Muitas dessas caracte-rísticas já haviam sido observadas em espécies subterrâneas de outros grupos de peixes, suge-rindo que elas de fato estejam relacionadas a esse modo de vida. Nem todas as espécies sub-terrâneas de Ituglanis apresentam todas as características em um mesmo grau, de forma que é possível dividi-las entre as menos troglomórficas, Ituglanis sp. 1 e I. mambai, as intermediá-rias, Ituglanis sp. 2 e I. bambui, e as mais troglomórficas, I. passensis, I. ramiroi e I. epikars-ticus. A grande variabilidade tanto intra- quanto interespecífica sugere que essas característi-cas evoluem em mosaico, corroborando hipóteses anteriores de colonização independente do ambiente subterrâneo por cada uma das espécies. As modificações identificadas podem ser divididas em progressivas e regressivas, e discutimos os mecanismos evolutivos que explicam seu surgimento nas espécies subterrâneas. A evolução de características que conferem vanta- gem evolutiva é explicada por mecanismos de seleção natural direta, enquanto que os caracte-res regressivos que não apresentam vantagem ou desvantagem óbvia se encaixam em cenários de evolução neutra. Algumas das características das espécies subterrâneas são típicas de indi-víduos em estágios iniciais de desenvolvimento, o que sugere que a heterocronia pode ter um papel importante na evolução do troglomorfismo. Além disso, a linhagem a que pertencem as espécies subterrâneas apresenta características consideradas preaptativas para o modo de vida subterrâneo, o que favoreceria o desenvolvimento desse modo de vida repetidas vezes na fa-mília Trichomycteridae e, mais especificamente, no gênero Ituglanis. / One of the main objectives of Subterranean Biology is to identify and understand the morpho-logical modifications exhibited by subterranean organisms which can be related to their hypogean life habit. In the present work, we performed this investigation using as model the subterranean species of Ituglanis Costa & Bockmann, 1993 (Siluriformes: Trihomycteridae). Nowadays, seven subterranean species of the genus are recognized, distributed in close geo-graphic regions, the São Domingos karstic area and the Mambaí and Posse karstic area, both on northeastern Goias state, Brazil. We analyzed external (body size and elongation, paired fins and pigmentation) and sensorial characters (eyes, barbels, laterosensory system and brain), and identified tendencies of modification in all of them. Subterranean species of Ituglanis tend to shown: body elongation, and those species occupying confined spaces, body-size reduction; longer pectoral fins, with increased number of rays, and pelvic fins reduced; reduced pigmentation, the cromatophores less numerous and with irregular forms; smaller, deformed and asymmetric eyes, covered by skin; well developed barbels, the maxillary long-er; the canals of the laterosensory system fragmented and reduced, with variability and asymmetry; and the brain with well developed vagal and facial lobes, reduced optic lobes and increased cerebellum, swim bladder and semicircular canals of the inner ear. Many of these characters were already reported for subterranean fishes of other groups, suggesting a rela-tionship with this life habit. The subterranean species of Ituglanis does not exhibit all the characters on the same degree, in such a way that it is possible to classify them as the less troglomorphic, Ituglanis sp. 1 and I. mambai, the intermediary, Ituglanis sp. 2 and I. mambai, and the most troglomorphic, I. passensis, I. ramiroi and I. epikarsticus. The large inter- and intraspecific variability observed suggests a mosaic of evolution for these characters, corrobo-rating previous hypothesis of independent colonization of the subterranean environment in each species. The modifications identified can be divided in progressive and regressive, and we discuss the evolutionary mechanisms that explain their origin. The evolution of characters that can be evolutively advantageous is explained by mechanisms of direct natural selection, whilst regressive characters that do not provide any obvious advantage os disadvantage fit to scenarios of neutral evolution. Some of the characters observed in the subterranean species are typical of individuals in early stages of development, suggesting that heterocrony can play an important role in the evolution of troglomorphism. Furthermore, the lineage to which the subterranean species belong exhibit some characters considered preadaptative for the subter-ranean life habit, favouring its development repeatedly in the family Trichomycteridae and, more specifically, in the genus Ituglanis.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-05-05T16:37:21Z No. of bitstreams: 1 Carolina Alves Collier de Almeida.pdf: 2662056 bytes, checksum: cf8885f0a98b8341f6f0148020426e95 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-05-05T16:37:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carolina Alves Collier de Almeida.pdf: 2662056 bytes, checksum: cf8885f0a98b8341f6f0148020426e95 (MD5) Previous issue date: 2016-02-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Anthropogenic disturbances on aquatic ecosystems are related to the multiple uses of water and soil, being the agriculture and urbanization the most commonly observed impacts. These threats on the integrity of aquatic ecosystems has been increasingly recognized and associated with negative effects on the habitat, water quality and biota. With natural ecosystem degradations the environmental services are affected, causing economic and cultural problems. This scenario of degradation of aquatic ecosystems can be seen in the Capibaribe River Basin in northeastern Brazil. The Capibaribe has been suffering anthropogenic impacts since colonial period, being currently its banks dominated by monoculture of sugarcane and the urban-industrial development. The fishing activity is highlighted in the Capibaribe river basin, being these activities affected by the degradation of this river, affecting the income generation of fishermen and modified his view and relationship with the aquatic environment. In this context, the present study investigated the relationship between human impacts, fish fauna and the quality of the aquatic environment, as well as some of the consequences of environmental degradation for the riverine population. Thus, this thesis is divided into two chapters: the first aimed to understand a river degradation, and in particular its effects on the ecosystem and the local community; and the second aimed to understand the effects of human impacts in a river, assessing the relationship between assemblage of fish, environmental variables and predominant land use. In the first chapter the research was developed in Beira Rio community, in municipality São Lourenço da Mata (PE), inserted in a context of disorderly growth and without basic infrastructure, situated on the margins of the Capibaribe River. In this study geoprocessing techniques were employed to evaluate urban growth, and monitoring water data of the last two decades to assess changes in water quality. This research employed ethnobiological approaches, through interviews and participatory methods to retrieve information about the river environment, its fish fauna and their environmental services. According to the GIS analysis, can be observable an accelerated process of urbanization, with the urban area increasing from 73 383 565.98 m2 to 363.6 m2 in three decades. Informants perceived the urban growth, especially in the late twentieth century, with the transition of this century recognized as the period of greatest negative changes in the river environment. The perceived decline of fish stocks was appointed by the community as one of the effects of river degradation. Environmental data indicated that the river is suffering eutrophication, and has a fecal coliform concentrations 160 times higher than the maximum allowed by Brazilian law. The second chapter was developed along the lower stretch of the Capibaribe river, being monthly sampled the fish fauna and 20 environmental variables at five locations under different land uses. To collect the fish fauna were used gill nets and "berço", while the environmental variables were measured from the collection of water samples. The identification of the land uses was carried out from the vectorization of georeferenced satellite images being analyzed five classes of land use. Our results showed the influence of anthropogenic impacts in aquatic environment, revealing that the predominant land use affects the environmental variables as well as the assemblage of fish. The importance of the presence of forest buffers along the banks of water bodies was evident in this study, in which the reference environments showed the best environmental conditions, sustaining a more diverse and equitative fish fauna. The human impacts resulting from agriculture and urbanization promoted the simplification and the imbalance of the fish fauna, and promote the enrichment of nutrients in the aquatic ecosystem. These impacts were more pronounced in the urbanizated environment, suggesting that this land use has greater effects on the aquatic ecosystem. The interdisciplinary approach used in this study allowed us to understand the process of anthropogenic degradation in a river and some of its effects on water quality, fish fauna and the surrounding human population, revealing that integrate environmental data, GIS, fish fauna and the local human population allow a more holistic understanding of reality. This model approach enables the development of more effective plans to improve land use practices, the protection of aquatic ecosystems, the restoration of riparian areas, biodiversity conservation, as well as the inclusion of the adjacent human communities in this context. / As perturbações antropogênicas sobre os ecossistemas aquáticos estão relacionadas aos múltiplos usos da água e do solo, sendo a agrícultura e urbanização os impactos mais comumente observados. Essas ameaças sobre a integridade dos ecossistemas aquáticos tem sido cada vez mais reconhecida, sendo associadas a efeitos negativos sobre o habitat, a qualidade da água e a biota. Com a degradação do ecossistema natural os serviços oferecidos pelo ambiente são afetados, ocasionando problemas econômicos e culturais. Esse cenário de degradação dos ecossistemas aquáticos pode ser observado na bacia do rio Capibaribe, no nordeste do Brasil. O Capibaribe vem sofrendo impactos antrópicos constantes desde o período colonial, sendo atualmente suas margens dominadas pela monocultura da cana-de-açúcar e pelo desenvolvimento urbano-industrial. A atividade pesqueira tem destaque na bacia do rio Capibaribe, sendo esta atividade afetada pela degradação do rio, o que compromete a geração de renda dos pescadores e modifica seu modo de ver e se relacionar com o ambiente aquático. Neste contexto, o presente estudo buscou compreender a relação entre os impactos antrópicos, a ictiofauna e a qualidade do ambiente aquático, bem como, algumas das consequências da degradação ambiental para a população ribeirinha. Diante disso, esta tese encontra-se dividida em dois capítulos: o primeiro teve o objetivo de compreender o processo de degradação de um rio, e em particular suas consequências sobre esse ecossistema e a comunidade ribeirinha local; e o segundo objetivou compreender os efeitos dos impactos antrópicos em um rio, avaliando a influência da sazonalidade e as relações entre a taxocenose de peixes e as variáveis ambientais com a cobertura predominante da terra. No primeiro capítulo a pesquisa foi desenvolvida junto à comunidade Beira Rio, no município de São Lourenço da Mata (PE), e que encontra-se inserida em um contexto de crescimento desordenado e sem infraestrutura básica, situada às margens do rio Capibaribe. Neste estudo foram empregadas técnicas de geoprocessamento para avaliar a expansão urbana, além de dados de monitoramento da água das últimas duas décadas para avaliar as alterações da qualidade da água. Esta pesquisa empregou abordagens etnobiológicas, através de entrevistas e metodologias participativas para recuperar informações sobre o ambiente do rio, sua ictiofauna e seus serviços ambientais. De acordo com as análises de SIG, pode ser obervado um acelerado processo de urbanização, com a área urbana aumentando de 73.565,98 m2 para 383.363,6 m2 em três décadas. Os informantes perceberam o crescimento urbano, principalmente no final do século XX, sendo a transição deste século reconhecida como o período de maiores modificações negativas no ambiente do rio. O declínio percebido dos estoques pesqueiros foi apontado pela comunidade como um dos efeitos da degradação do rio, sendo indicado o decréscimo de 13 das 15 espécies avaliadas. Os dados ambientais indicaram que o rio está sofrendo eutrofização e apresenta uma concentração de coliforme fecal 160 vezes maior que o máximo permitido pela legislação brasileira. O segundo capítulo foi desenvolvido ao longo do trecho baixo do rio Capibaribe, sendo amostradas mensalmente a ictiofauna e 14 variáveis ambientais em cinco locais com diferenças na cobertura da terra. Para coleta da ictiofauna foram utilizadas redes de espera e berço, enquanto as variáveis ambientais foram mensuradas a partir da coleta de amostras de água. A identificação das principais coberturas da terra foi realizada a partir da vetorização de imagens de satélite georreferenciadas, sendo analisadas cinco classes de cobertura da terra. Nossos resultados evidenciam a influência dos impactos antrópicos sobre o ambiente aquático, revelando que a cobertura predominante da terra afetou variáveis ambientais do ecossistema aquático, bem como a taxocenose de peixes. A importância da presença de áreas florestais na margem dos corpos hídricos ficou evidente em nosso estudo, no qual, as áreas florestadas apresentaram as melhores condições ambientais, sustentando uma fauna de peixes mais diversa e equilibrada. Os impactos antrópicos decorrentes da agricultura e urbanização promoveram a simplificação e o desequilíbrio da fauna de peixes, além de promoverem o enriquecimento de nutrientes no ecossistema aquático. Esses impactos foram mais pronunciados no ambiente submetido à urbanização, sugerindo que esta atividade apresenta maiores efeitos sobre o ecossistema aquático. A abordagem interdisciplinar utilizada neste estudo permitiu compreender o processo de degradação antropogênica em um rio e alguns de seus efeitos sobre a qualidade da água, a ictiofauna e a população humana do entorno, revelando que integrar dados ambientais, SIG, ictiofauna e a população humana local, permite uma compreensão mais holística da realidade. Esse modelo de abordagem possibilita o desenvolvimento de planos mais eficazes para a melhoria das práticas de uso da terra, a proteção dos ecossistemas aquáticos, a recuperação das áreas ribeirinhas, a conservação da biodiversidade, bem como a inserção das comunidades humanas adjacentes neste contexto.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2016-08-10T12:14:44Z No. of bitstreams: 1 Karina Maria de Souza Silva.pdf: 1154042 bytes, checksum: 579118d05c5d55cfa66ef36893f7609d (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-10T12:14:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Karina Maria de Souza Silva.pdf: 1154042 bytes, checksum: 579118d05c5d55cfa66ef36893f7609d (MD5) Previous issue date: 2013-07-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Brazilian Northeast suffers with water scarcity and because of the irregularity of rainfall, dams were created for water storage in order to minimize the effects of drought periods. Due to the close relationship between fish taxocenose and environmental characteristics, seasonality of the environment can interfere with the structure and composition of the local ichthyofauna. The weir Canoes, located in Environmental Protection Area of Araripe Plateau (CE), works for the water supply in the region and is used for irrigation and fishing activities. In this context, this work aims to understand the distribution patterns of fish species according to environmental seasonality. In this work, monthly collections were conducted from September of 2011 to August of 2012 with gillnets with mesh size between 12 and 70 mm between adjacent nodes were used. A total of 4,922 specimens were obtained, among 4,584 collected with gillnets and 338 trawl. A total of 16 species, divided into four orders and nine families was obtained. The most representative family Characidae was 80% of the specimens. For the species, the most representative and constant were Astyanax gr. bimaculatus, Triportheus siginatus, Steindachnerina notonota and Leporinus piau. Considering the months, the richness values were between 6-12 species, with the highest values from August to January. The diversity values were low throughout the year, with the highest diversity in January (2,19 bists/ind.). Analyzing of species through number of individuals and biomass, In the rainy and dry seasons, no significant difference was also observed, in which (p = 0.696 and p = 0.656 respectively). Among the species Leporinus piau, Triportheus signatus showed a higher frequency in the rainy season and Astyanax gr. bimaculatus and Steindachnerina notonota in the dry. In relation to environmental parameters, Triportheus signatus was influenced by precipitation, temperature, dissolved oxygen, pH and conductivity; in which the latter had an inverse relation. / O Nordeste brasileiro sofre com a escassez de água e por causa da irregularidade das chuvas, foram criados açudes para armazenamento de água com a finalidade de minimizar os efeitos do período de seca. Devido às estreitas relações entre a taxocenose de peixes e as características ambientais, a sazonalidade do ambiente pode interferir na estrutura e composição da ictiofauna local. O açude Canoas, localizado na Área de Proteção Ambiental da Chapada do Araripe (CE), funciona para abastecimento de água na região e é utilizado para atividades pesqueiras e de irrigação. O presente trabalho objetivou compreender os padrões de distribuição da ictiofauna de acordo com a sazonalidade do ambiente. Foram realizadas coletas mensais no período de setembro de 2011 a agosto de 2012 com redes de espera com malhas entre 12 e 70 mm entre os nós adjacentes e redes de arrasto de 5 mm. Foram medidos os parâmetros ambientais in situ temperatura, oxigênio dissolvido, pH, condutividade e turbidez. Foram capturados 4.922 espécimes sendo 4.584 coletados com rede de espera e 338 com rede de arrasto, pertencentes a quatro ordens, 9 famílias e 16 espécies. Characidae foi à família melhor representada em abundância, com 80% dos exemplares. As espécies mais representativas e classificadas como constantes foram Astyanax gr. bimaculatus, Triportheus siginatus, Steindachnerina notonota e Leporinus piau. A riqueza variou entre 6 e 12 espécies, com os maiores valores de agosto a janeiro. A diversidade apresentou baixos valores ao longo do ano, com o maior índice no mês de janeiro (2,19 bits/ind.). A análise dos dados de número de indivíduos e biomassa entre os períodos seco e chuvoso não apresentou diferença significativa (p=0,696 e p=0,656 respectivamente). Entre as espécies, Leporinus piau e Triportheus signatus apresentaram uma maior frequência no período chuvoso e Astyanax gr. bimaculatus e Steindachnerina notonota no período seco. Relacionado com os parâmetros ambientais, Triportheus signatus teve relação positiva com precipitação, temperatura, oxigênio dissolvido, pH e condutividade sendo com este último uma relação inversa.

FundaÃÃo de Amparo à Pesquisa do Estado do Cearà / O litoral do Rio Grande do Norte, devido à sua orientaÃÃo geogrÃfica, possui particularidades que o distingue das outras zonas costeiras do Nordeste brasileiro. Com caracterÃsticas climatolÃgicas, geomorfolÃgicas e fitogeogrÃficas diferentes, o litoral à dividido em duas Ãreas distintas: setentrional e oriental, onde a frota de pequena escala atua com grande efetividade. Apesar de ser uma atividade de grande importÃncia socioeconÃmica, esse setor atualmente està tendo dificuldades no seu ordenamento, devido à alta complexidade que apresenta, dificultando a obtenÃÃo de informaÃÃes necessÃrias para a avaliaÃÃo e monitoramento das pescarias. Portanto, o objetivo central da pesquisa foi analisar a bioecologia da ictiofauna marinha e a dinÃmica das pescarias, considerando a orientaÃÃo geogrÃfica e as mudanÃas estacionais dos fatores climÃticos do litoral do Rio Grande do Norte. Os dados utilizados foram obtidos durante a execuÃÃo do Projeto de EstatÃstica Pesqueira no Rio Grande do Norte, coordenado pelo Centro de Pesquisa e GestÃo de Recursos Pesqueiros do Litoral Nordeste e desenvolvido pela GerÃncia Executiva do Instituto Brasileiro do Meio Ambiente e dos Recursos Naturais RenovÃveis, no perÃodo de janeiro de 2005 a dezembro de 2006. Para atender os objetivos, a bioecologia da ictiofauna marinha foi analisada com base em quatro objetos de estudo: composiÃÃo, caracterizaÃÃo (ecolÃgica e comercial), abundÃncia e diversidade, avaliando possÃveis diferenÃas estacionais nos dois Ãltimos componentes que, posteriormente, foram descritos e correlacionados com a biologia das principais espÃcies. A dinÃmica das pescarias foi analisada por meio de quatro objetos de estudo: caracterizaÃÃo das embarcaÃÃes e aparelhos-de-pesca, esforÃo de pesca, rendimento e composiÃÃo especÃfica, tambÃm avaliando possÃveis diferenÃas estacionais que foram descritas e relacionadas com as principais espÃcies capturadas. TÃcnicas multivariadas foram utilizadas com o objetivo de sintetizar a estrutura de variabilidade dos dados, facilitando a interpretaÃÃo dos resultados. Dessa forma, o litoral setentrional apresentou-se como um ambiente com variaÃÃes estacionais evidenciadas principalmente pela presenÃa de uma importante Ãrea de ressurgÃncia, onde a estrutura da ictiofauna foi definida pela baixa diversidade especÃfica e composta por espÃcies pelÃgicas com altos nÃveis de biomassa. Os principais recursos dessa Ãrea corresponderam à pesca do peixe voador e do dourado, tendo o bote com linha/jererÃ, a pescaria de melhor desempenho na captura dessas espÃcies, que à mais acentuada na estaÃÃo chuvosa devido ao perÃodo reprodutivo do peixe voador. O litoral oriental demonstrou caracterÃsticas distintas daquelas do setentrional, com um ambiente mais complexo devido à presenÃa de um grande nÃmero de recifes de coral, onde a estrutura da ictiofauna apresentou uma alta diversidade especÃfica e composta por espÃcies demersais com baixos nÃveis de abundÃncia especÃfica. Os principais recursos dessa Ãrea foram referentes Ãs vÃrias espÃcies das famÃlias Lutjanidae, Haemulidae e Carangidae, sendo os paquetes com rede-de-espera e linha, as pescarias mais importantes desse litoral durante todo o ano. Conclui-se que, a estruturaÃÃo das informaÃÃes sobre a bioecologia da ictiofauna marinha e dinÃmica das pescarias comprovou a hipÃtese levantada, que foi a seguinte: âAs especificidades ambientais dos litorais setentrional e oriental do Estado do Rio Grande do Norte modelam a estrutura da ictiofauna marinha que configuram diferentes estratÃgias de explotaÃÃo executadas pela pesca de pequena escalaâ / The coast of Rio Grande do Norte, due to its geographical orientation, has characteristics that distinguish it from other coastal areas of Northeast Brazil. With climate conditions, geomorphological and phytogeographical different, the coastline is divided into two distinct areas: north and east where the fleet of small-scale works with great efficiency. Despite being an activity of great socioeconomic importance, this sector is currently experiencing difficulties in their land due to the high complexity features, making it difficult to obtain information necessary for evaluation and monitoring of fisheries. Therefore, the central objective of the research was to analyze the bio-ecology of marine fishes and fisheries dynamics, considering the geographical orientation and the seasonal changes of climatic factors on the coast of Rio Grande do Norte. The data used were obtained during the execution of Fisheries Statistics Project in Rio Grande do Norte, coordinated by the Center for Research and Management of Fishery Resources of the Northeast Coast and developed by the Executive Management of the Brazilian Institute of Environment and Renewable Natural Resources, in From January 2005 to December 2006. To meet these objectives, the bio-ecology of marine fishes was analyzed based on four objects of study: composition, characterization (ecological and commercial), abundance and diversity, evaluating possible seasonal differences in the last two components that were later described and correlated with the biology of key species. The dynamics of the fishery was analyzed by means of four objects of study: characterization of vessels and equipment-for-fishing, fishing effort, yield and composition, also evaluating possible seasonal differences have been described and related to the principal species. Multivariate techniques were used in order to synthesize the structure of variability of the data, facilitating the interpretation of results. Thus, the northern coast presented itself as an environment with seasonal variations mainly evidenced by the presence of an important area of ​​upwelling, where the structure of the ichthyofauna was defined by low species diversity and composed of pelagic species with high levels of biomass. The main features of this area corresponded to fishing for flying fish and gold, and the boat with online / jererÃ, fishing better performance in capturing these species, which is more pronounced in the rainy season due to the reproductive period of the flying fish. The eastern coast showed different characteristics from those of the Northern, with a more complex due to the presence of a large number of coral reefs, where the structure of the ichthyofauna showed a high species diversity and composed of demersal species with low levels of fish abundance. The main features of this area were related to several species of the families Lutjanidae, and Carangidae Haemulidae, and the bellboy to-network and waiting line, the most important fisheries of the coast throughout the year. It is concluded that the structure of the information on the bio-ecology of marine fishes and fisheries dynamics proved the hypothesis, which was as follows: "The environmental characteristics of northern and eastern coasts of Rio Grande do Norte model the structure of the ichthyofauna Navy configure different strategies of exploitation carried out by small-scale fisheries "

The occurrence of ichthyofauna on the territory of the Jizera Mountains (Northern Bohemia, Czech Republic) is limited, besides other factors, by the water chemistry. pH value and pH-related concentration of inorganic monomeric aluminum (Ali) are crucial parameters of the water, determining the survival of fish in streams. Low pH and high concentrations of Ali cause severe damages to fish gills. The thesis deals with the influence of the water chemistry on distribution of ichthyofauna in the Jizera Mts and gill morphology in brook charr (Salvelinus fontinalis), a dominant fish species of the upper plateau of the mountains. The results show that the species diversity of fish in acidified streams is lower than that in streams without meaningful acidic episodes. Histopathological analyses of gills of brook charr individuals from an acidified stream confirm, that low pH values and high concentrations of Ali have a cummulative effect and lead to degenerative changes on gills. Key words: The Jizera Mountains, ichthyofauna, brook charr, gill morphology, water chemistry, toxic aluminium, acidification

Primary taxonomic research in neotropical ichthyology still suffers from limited integration between morphological and molecular tools, despite major recent advancements in both fields. Such tools, if used in an integrative manner, could help in solving long-standing taxonomic problems. The genus Pimelodella Eigenmann & Eigenmann, 1888 is a perfect case for an integrative and multidisciplinary approach in taxonomy. Pimelodella is a genus of the Heptapteridae broadly distributed throughout trans- and cis-Andean South America, and one of the main components of Neotropical Ichthyofauna. Nowadays is the most species-rich genus of the family, with 79 valid species. However, the validity and delimitation of those species is extremely problematic, due their broad geographic distribution, conserved morphology, and ancient and imprecise descriptions. Pimelodella is undoubtedly one of the most severe taxonomic bottlenecks in neotropical ichthyology. This project presents a taxonomic revision of Pimelodella using an integrative morphological-molecular approach. The traditional taxonomic revision covers the genus in its entirety, with all the components of this kind of study. All types were examined, and the number of valid species herein recognized was reduced to 55 species, for which full descriptions are presented. The molecular taxonomy was done for a circumscribed subset of the genus, with representation enough to understand the molecular divergences and compare them with the traditional taxonomy results, allowing an evaluation of the results of the revision. / A pesquisa taxonômica primária ainda apresenta pouca integração entre as ferramentas morfológicas e moleculares para o estudo de peixes neotropicais, apesar de grandes avanços recentes em ambos os campos. Tais ferramentas, se usadas de maneira integrativa, poderiam solucionar grupos reconhecidos por representarem problemas taxonômicos renitentes. O gênero Pimelodella Eigenmann & Eigenmann, 1888 se enquadra como um ótimo caso para a aplicação de uma estratégia integrativa e multidisciplinar. Pimelodella é um gênero da família Heptapteridae, distribuído amplamente por drenagens sul-americanas trans- e cis-andinas e compreende um dos principais componentes da ictiofauna neotropical. Atualmente é reconhecido como o maior gênero da família, com 79 espécies válidas descritas. Entretanto, a validade e delimitação dessas espécies é problemática, devido à elevada diversidade do gênero, aliada à ampla distribuição, morfologia conservada e descrições antigas e imprecisas. Trata-se de um dos grandes gargalos taxonômicos na sistemática e taxonomia de peixes neotropicais. Este projeto apresenta uma revisão taxonômica de Pimelodella utilizando uma abordagem integrativa morfológica-molecular. A revisão taxonômica clássica cobre a integridade da diversidade do gênero, com todos os componentes deste tipo de estudo. Todos os tipos foram examinados, e o número de espécies validas é aqui reduzido para 55 espécies, para as quais descrições completas são apresentadas. A parte molecular foi realizada em um subgrupo delimitado, com diversidade suficiente para que as estimativas de divergência molecular pudessem ser comparadas aos resultados da revisão morfológica, fornecendo um modelo de avaliação para o restante da revisão.