Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-15T14:52:52Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antônio Rafael Wong Ramos.pdf: 642295 bytes, checksum: fa963effe632a4620ae888ae62abe931 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-15T14:53:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antônio Rafael Wong Ramos.pdf: 642295 bytes, checksum: fa963effe632a4620ae888ae62abe931 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2017-08-15T14:54:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antônio Rafael Wong Ramos.pdf: 642295 bytes, checksum: fa963effe632a4620ae888ae62abe931 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-08-15T14:54:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Antônio Rafael Wong Ramos.pdf: 642295 bytes, checksum: fa963effe632a4620ae888ae62abe931 (MD5) Previous issue date: 2012-10-22 / CABG has as main function to supply the heart muscle blood, and became a great treatment option for arterial disease. But like any surgical procedure, the risk of infection becomes paramount, becoming one of the most frequent complications after these procedures. There are other factors that may be associated with even more with increased infectious risk as: existing Comorbidities intra operatively procedures and/or post-operative complications. Quantitative and transversal study in which we attempted to analyze the prevalence of infection in patients who underwent CAGB between the period from 2008 to 2011, with data collection in medical records of patients admitted to the FHCGV. Statistical analysis was performed on the logistic regression model, and considered a p value of 0.05. In the analytical statistics were used the exact test Chi square test and fisher, such analyses were performed on the Epi-info 3.5.1. 223 charts were analyzed, Staphyloccocus aureus, was the most frequent infectious agent (43.5%). When the variables were analyzed by logistic regression, and are associated with significantly (p < 0.05) with infection: age, smoking, pulmonary complications, pacemaker, hospitalization and ICU. And associated with death are: age, elective, transfusion and not surgery. In relation to the death, the ICU acted as protective factor. The infectious process after the CABG, is a complication exists, and can be explained by various reasons, existing Comorbidities, intraoperative events and/or post-operative complications. This work showed that age, smoking, pulmonary complications, length of ICU hospitalization time and acute renal failure, are associated with increased infection. This age-associated mortality surgical circunstances (urgent/emergency) and in post-operative transfusion. / A revascularização do miocárdio tem como principal função suprir de sangue o músculo cardíaco e se tornou uma ótima opção de tratamento para doenças arteriais. Porém como qualquer procedimento cirúrgico, o risco de infecção torna-se eminente, se tornando umas das complicações mais frequentes após estes procedimentos. Existem outros fatores que podem se associar ainda mais ao aumento do risco infeccioso como: comorbidades existentes, procedimentos intra-operatórios e/ou complicações no pós-operatório. Com o intuito de investigar a prevalência de eventos infecciosos nos pacientes submetidos a revascularização do miocárdio, foi realizado um estudo quantitativo, transversal no qual buscou-se analisar a prevalência de infecção em pacientes que realizaram revascularização do miocárdio entre o período de 2008 até 2011, com coleta de dados no prontuários destes pacientes internados na FHCGV. Na análise estatística foi realizado o modelo de regressão logística e considerado um p valor de 0,05. Na estatística analítica foram utilizados os testes exato de fisher e teste qui quadrado e tais análises foram executadas no Epi –info 3.5.1. Foram analisados 223 prontuários, onde o Staphyloccocus aureus foi o agente infeccioso mais frequente (43,5%). Dentre as variáveis analisadas, pela regressão logística, observou-se associação de forma significante (p < 0,05) com infecção: idade, tabagismo, complicações pulmonares, marcapasso, hospitalização e UTI. E associadas com o óbito estão: idade, cirurgias não eletivas e transfusão sanguínea. Em relação ao óbito, a UTI atuou como fator de proteção. O processo infeccioso após a revascularização do miocárdio é uma complicação existente e pode ser explicada por vários motivos, como comorbidades existentes, acontecimentos no intraoperatório e/ou complicações no pós-operatório. Nesse trabalho observou-se que idade, tabagismo, complicações pulmonares, tempo de UTI, tempo de hospitalização e insuficiência renal aguda estão associados com aumento da infecção. A mortalidade esta associada a idade, circunstâncias cirúrgicas (urgência / emergência ) e transfusão sanguínea no pós-operatório.

Submitted by Cibele Nogueira (cibelenogueira@ufgd.edu.br) on 2017-01-26T13:59:09Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) JHOYLEITE.pdf: 1672229 bytes, checksum: a842a3c0cc7cf9a97045d5acc3717c43 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-26T13:59:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) JHOYLEITE.pdf: 1672229 bytes, checksum: a842a3c0cc7cf9a97045d5acc3717c43 (MD5) Previous issue date: 2015-03-13 / The sand flies are widely distributed throughout the world. This insect group is of great interest in public health because their females are involved in the transmission of Leishmania, agents of cutaneous and visceral leishmaniasis. Forest fragments favor the maintenance of the life cycle of both, vector and agent, in nature. In Nova Andradina municipality, Mato Grosso do Sul state, Brazil, some cases of cutaneous leishmaniasis (CL) have been notified. So the goal of this study was to identify the sand fly fauna and investigate the presence of species naturally infected by Leishmania of urban forest fragments and peridomiciles close to them in Nova Andradina. The insects were captured from November 2013 to January 2015, using CDC light traps distributed in three urban forest fragments. Parasitological examination was performed to investigate flagellates in sand fly guts and Polymerase Chain Reaction - Restriction Fragment Length Polymorphism (PCR-RFLP) for identification of Leishmania spp. A total of 302 sand flies were captured (101 males and 201 females) of six genus and 11 species: Brumptomyia brumpti, Evandromyia cortelezzii, Evandromyia lenti, Evandromyia teratodes, Evandromyia termitophila, Nyssomyia neivai, Psathyromyia aragaoi, Psathyromyia bigeniculata, Psathyromyia campograndensis, Pintomyia christenseni and Sciopemyia sordellii. Only Ny. neivai is recognized as vector of cutaneous leishmanaisis agents in Southeast and South Brazilian regions, Paraguay and Argentina. Thus it may be linked to cases in Nova Andradina-MS. Br. brumpti was the most abundant and present in peridomiciles along with Ev. lenti, Ev. termitophila, Ny. neivai and Pi. christenseni. Although specimens were collected in nearly every month, their highest frequencies occurred during rainy periods, mainly for Br. brumpti, Sc. sordellii, Pi. christenseni and Ev. lenti. Of the 106 females dissected and placed in 55 pools, the presence Leishmania (Leishmania) amazonensis DNA was detected by PCR-RFLP in three species: Ev. lenti, Ev. teratodes and Sc. sordellii, as well as of Leishmania spp. in two females of Pi. christenseni and one of Sc. sordellii, resulting in a minimum infection rate of 5.66% for each taxon of Leishmania. / Os flebotomíneos, com ampla distribuição mundial, constituem um grupo de insetos de grande importância na saúde pública, cujas fêmeas estão envolvidas na transmissão de Leishmania, agentes das leishmanioses tegumentar e visceral. Esses insetos são encontrados com frequência em fragmentos de matas, onde habitats naturais favorecem a manutenção do ciclo de vida desses vetores na natureza. No município de Nova Andradina, Estado de Mato Grosso do Sul, Brasil tem sido notificados vários casos de leishmaniose tegumentar. O objetivo deste estudo foi conhecer a fauna flebotomínea de fragmentos de mata e peridomicílios em área urbana e investigar a presença de espécies infectadas naturalmente por Leishmania. Os insetos foram coletados de novembro de 2013 a janeiro de 2015; utilizando-se armadilhas luminosas, tipo CDC distribuídas em três fragmentos de matas e peridomicílios adjacentes a estes, em área urbana de Nova Andradina. Foi realizado exame parasitológico para pesquisa de flagelados e análise molecular para identificação da espécie de Leishmania. Foram coletados 302 espécimes de flebotomíneos; 101 machos e 201 fêmeas. A fauna flebotomínea constituiu-se de seis gêneros e 11 espécies: Brumptomyia brumpti, Evandromyia cortelezzii, Evandromyia lenti, Evandromyia teratodes, Evandromyia termitophila, Nyssomyia neivai, Psathyromyia aragaoi, Psathyromyia bigeniculata, Psathyromyia campograndensis, Pintomyia christenseni e Sciopemyia sordellii. Dentre as espécies assinaladas, Ny. neivai é a única com importância na transmissão de agentes da leishmaniose tegumentar no Sudeste e Sul no Brasil, Paraguai e Argentina, e pode estar associada aos casos ocorridos em Nova Andradina-MS. Br. brumpti foi a espécie mais abundante e presente nos peridomicílios juntamente com Ev. lenti, Ev. termitophila, Ny. neivai e Pi. christenseni. Os espécimes foram coletados em quase todos os meses e verificou-se o aumento na abundância de indivíduos em períodos chuvosos e maior riqueza das espécies Br. brumpti, Sc. sordellii, Pi. christenseni e Ev. lenti em períodos com alta precipitação pluviométrica. Das 106 fêmeas dissecadas e acondicionadas em 55 pools, detectou-se a presença de DNA de Leishmania (Leishmania) amazonensis pela PCR seguida da análise de polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição, em um pool de cada uma das espécies: Ev. lenti, Ev. teratodes e Sc. sordellii, assim como de DNA de Leishmania spp., em dois pools de Pi. christenseni e um de Sc. sordellii; resultando, portanto, em uma taxa de infecção mínima de 5,66% para cada uma das leishmânias.

Nos hospedeiros mamíferos, os parasitas do gênero Leishmania vivem nos macrófagos se evadindo de mecanismos microbicidas dessas células, tais como a produção de óxido nítrico (NO). A produção de NO pela enzima óxido nítrico sintase induzida (iNOS) nos macrófagos requer L-arginina como substrato, o mesmo aminoácido utilizado pela arginase para produzir ornitina e uréia. Logo, a arginase pode atuar na sobrevivência de Leishmania no hospedeiro competindo com a iNOS, reduzindo a produção de NO, além de seu papel na via de poliaminas, essencial para a replicação dessas células. Com isso, o objetivo desse estudo é elucidar o papel da arginase de L. (L.) amazonensis durante o ciclo de vida do parasita, particularmente, sua função no estabelecimento e na manutenção da infecção da célula hospedeira, e como esse papel seria exercido. Nesse sentido, obtivemos soros policlonais anti-arginase, a partir da arginase recombinante de L. (L.) amazonensis purificada, e esses soros foram utilizados na imunomarcação da enzima em preparações com formas promastigotas e macrófagos infectados com amastigotas de L. (L.) amazonensis. Assim, determinamos a compartimentalização da arginase nos glicossomos tanto na forma promastigota do parasita como na forma amastigota, durante a infecção. Além disso, obtivemos diversos mutantes com a expressão de arginase modificada quanto à quantidade e localização que nos permitiram avaliar a importância da compartimentalização dessa enzima nos glicossomos. Entre esses mutantes temos: superexpressores de arginase, com e sem sinal de endereçamento para glicossomo; parasitas com um alelo de arginase nocauteado e o outro substituído pelo cassete contendo o segmento ddFKBP-ARG, que teriam a expressão de arginase regulada pelo domínio ddFKB sendo nocautes funcionais de arginase; e finalmente, também obtivemos parasitas nocaute nulo de arginase. A análise desses mutantes permitiu conclusões importantes para o conhecimento da fisiologia do parasita e sua relação com o macrófago, revelando que o papel da arginase de Leishmania parece ser muito mais complexo do que o inicialmente postulado, participando na regulação de outras vias metabólicas do próprio parasita e da célula hospedeira. Paralelamente, também determinamos que o sistema ddFKBP é funcional em L. (L.) amazonensis, e assim pode ser utilizado no estudo funcional de outras proteínas importantes para esses parasitas. / In the mammal host, Leishmania parasites live inside macrophages escaping from their microbicidal mechanisms, such as the nitric oxide (NO) production. The macrophage NO production by inducible nitric oxide synthase (iNOS) requires L-arginine as substrate, the same amino acid required by arginase to generate ornithine and urea. So, arginase may play a dual role in Leishmania survival reducing the NO by competing with iNOS, and participating in the polyamines pathway, which is essential for the cells replication. Considering this, the aim of this study is to elucidate the role of L. (L.) amazonensis arginase during the parasite life cycle, mainly its function for the establishment and maintenance of the host cell infection, besides to elucidate the way that this enzyme plays its role. With this in mind, we obtained polyclonal anti-arginase sera using purified recombinant L. (L.) amazonensis arginase, these sera were used in immunolabelling assays of L. (L.) amazonensis promastigotes and macrophages infected with L. (L.) amazonensis amastigotes. These experiments determined that arginase is compartmentalized in the glycosomes of both promastigotes and amastigotes, during infection. Besides, we obtained several mutants with altered arginase expression, modified in terms of quantity and location, which permitted us to evaluate the importance of glycosome arginase compartmentalization. Among these mutants are: overexpressors of arginase, with and without glycosomal addressing signal; parasites with one arginase allele knocked out and the other one replaced by a sequence containing the ddFKBP-ARG fusion that would allow us to regulate arginase expression, working like a functional arginase knockout; and finally, we also obtained arginase null knockouts parasites. The mutants analyses lead us to important conclusions for the knowledge of the parasite physiology and its relationship with the host macrophage, revealing that the Leishmania arginase role appears to be more complex than previously thought, playing an important role in the regulation of other metabolic pathways, of the own parasite and of the host cell. In the other hand, we also determined that the ddFKBP system is functional in L. (L.) amazonensis, and then can be used for functional studies of other important parasite´s proteins.

Orientadores: Maria Francisca Collela dos Santos, Jorge Rizzato Paschoal / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-21T06:24:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Borges_LeticiaReis_M.pdf: 2034867 bytes, checksum: c8a8d60173531749240dbdcb7dd4df44 (MD5) Previous issue date: 2012 / Resumo: Introdução: A avaliação do processamento auditivo envolve a detecção e interpretação dos eventos sonoros desde a orelha externa até o córtex auditivo em uma tarefa complexa do sistema auditivo nervoso central. A otite média é a infecção mais comum que acomete as crianças nos primeiros anos de vida. A inflamação na orelha média pode alterar o sistema auditivo periférico e central. Objetivo: Analisar o Processamento Auditivo (Central), PA(C), de crianças com histórico de otite média nos primeiros cinco anos de vida. Os objetivos específicos foram analisar os resultados obtidos nos testes de PA(C) em crianças com e sem histórico de otite média na infância, considerando-se o gênero, as orelhas e a faixa etária; classificar os achados dos testes de PA(C) quanto às habilidades alteradas e comparar o resultado dos testes de PA(C) em crianças submetidas à cirurgia para inserção de tubos de ventilação em estudantes da Rede Pública e da Rede Particular de Ensino. Métodos: Foram avaliadas 109 crianças na faixa etária entre oito e 12 anos, do gênero masculino e feminino. Os indivíduos foram reunidos em três grupos: o grupo controle (GC) foi formado por 40 crianças sem antecedentes de otite média; o grupo experimental I (GEI) foi constituído por 39 estudantes da Rede Pública com histórico de otite média secretora que se submeteram à cirurgia para inserção de tubos de ventilação bilateral nos cinco primeiros anos de vida e o grupo experimental II (GEII) foi composto por 30 estudantes da Rede Particular de Ensino com histórico de otite média secretora que se submeteram à cirurgia para inserção de tubos de ventilação bilateral nos cinco primeiros anos de vida. Todas as crianças foram submetidas à avaliação audiológica completa e avaliação do PA(C) que incluiu os testes dicótico de dígitos, identificação sentenças sintéticas com mensagem competitiva ipsilateral, teste xii dicótico não verbal, padrão de frequência e detecção de intervalo no ruído. Resultados: Na comparação entre as orelhas nos testes de PA(C), considerando-se os grupos, a orelha esquerda apresentou desempenho estatisticamente inferior no teste dicótico de dígitos e no teste de padrão de frequência no GEI. Os escolares dos GEI e GEII apresentaram desempenhos estatisticamente inferiores quando comparado ao GC no teste dicótico de dígitos e teste de detecção de intervalos no ruído. Na análise dos testes de PA(C) entre os GEI e GEII, os sujeitos do GEI tiveram resultados rebaixados estatisticamente significantes no teste dicótico de dígitos na orelha esquerda e no teste de detecção de intervalos no ruído. A habilidade auditiva prejudicada de maior prevalência encontrada no GEI foi de resolução temporal e no GEII de figura-fundo. Conclusão: As crianças com histórico de otite média secretora nos cinco primeiros anos de vida e que se submeteram à cirurgia para inserção de tubo de ventilação bilateral, deste estudo, apresentaram alterações nas habilidades auditivas avaliadas, sendo que os escolares da Rede Pública de Ensino obtiveram respostas inferiores nos testes de PA(C) quando comparados aos escolares da Rede Particular de Ensino / Abstract: Introduction: Auditory processing evaluates the stages involved in detecting and interpreting sound events from the external ear to the auditory cortex in a complex central auditory nervous system. Otitis Media is one of the most common infectious diseases in early childhood. Middle ear inflammation can change the peripheral and central auditory system. Objective: To analyze the results from (Central) Auditory Processing, (C)AP, in children suffering from otitis media in the first five years of age. The specific objectives were to analyze, considering gender, the ears and age, the results obtained in tests of (C)AP in children without otitis media history and children who suffered from otitis media in childhood, to classify central auditory processing test findings regarding the hearing skills evaluated and to compare the results of (C)AP evaluates in children who underwent surgery for bilateral ventilation tubes placement belonging to student from Public and Private Schools. Methods: A total of 109 students between eight and 12 years old, males and females, were divided into three groups. The Control Group (CG) consisted of 40 students from Public School without otitis media history, the Experimental Group I (EGI) consisted of 39 students from Public School suffering from secretory otitis media in their first five years of age and undergoing a surgery for bilateral ventilation tubes placement and the Experimental Group II (EGII) consisted of 30 students from Private School suffering from secretory otitis media in their first five years of age and undergoing a surgery for bilateral ventilation tubes placement. All children underwent complete audiological evaluation and assessment of (C)AP which included the following tests: the dichotic digits, the pediatric speech intelligibility/synthetic sentence identification with ipsilateral competing message, the dichotic nonverbal, the pitch pattern sequence and the gaps-in-noise. Results: xiv Comparing the ears in the (C)AP tests, considering the groups, statistically the left ear showed significant lower performance in the dichotic digits test and the pitch pattern sequence test. The students from EGI and EGII showed lower performance whether compared to CG not only in the dichotic digits test but also in the gaps-in-noise test. Analyzing the results of (C)AP between the Experimental Groups, EGI children had significant lower results in the dichotic digits test, considering the left ear, and gaps-innoise test. The hearing skills were mostly found altered in the temporal found resolution for EGI and figure-ground for EGII. Conclusion: Children suffering from secretory otitis media in their first five years of age and undergoing a surgery for bilateral ventilation tubes placement showed lower performance in auditory abilities, and children from public school had lower responses in (C)AP test when compared with students from private school / Mestrado / Saude da Criança e do Adolescente / Mestra em Ciências

Orientador : Marcelo de Carvalho Ramos / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-02T11:14:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Resende_MariangelaRibeiro_D.pdf: 22161301 bytes, checksum: fbdb0bb0320ccb520bf9835cf8e599b8 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: No Brasil, a epidemiologia molecular da tuberculose é pouco conhecida, além disso, as instituições de cuidados à saúde, bem como as correcionais e de tratamento de pessoas infectadas pelo HIV, congregam pacientes altamente susceptíveis e práticas inadequadas de controle da transmissão da doença. Este estudo avaliou um grupo de pacientes infectados pelo HIV como sentinela para a transmissão da tuberculose em um hospital de referência, com os objetivos de determinar a ocorrência de transmissão recente do M tuberculosis e os fatores de risco a ela relacionados. Foi realizado um estudo retrospectivo de investigação epidemiológica clássica e genotipagem (IS61l0-RFLP) entre pacientes infectados pelo HIV, com cultura positiva para o M tuberculosis, atendidos no HC-UNlCAMP de 01/1996 a 07/2001. No período foram notificados 1596 casos de tuberculose; deste total 560 eram infectados pelo HIV. A TB foi confirmada em 490 (30,7%) pacientes, sendo o diagnóstico através de cultura positiva para M tuberculosis em 254 casos. A apresentação pulmonar da TB ocorreu em 81,1% dos casos e TB disseminada em 20,8% dos casos. Em 45,3% dos pacientes já havia sido diagnosticada alguma doença defmidora de AIDS previamente à TB. A mediana da contagem de linfócitos T CD4+ no momento do diagnóstico da TB foi 86 cells/mm3.O IS61l0-RFLP de 109 isolados de M tuberculosis identificou 87 padrões únicos e 13 agrupamentos genotípicos envolvendo 35 (32,1%) pacientes. O número de pacientes em cada agrupamentovariou de dois a seis. Vínculos epidemiológicosforam observados em 11 (31,4%) casos. Destes, transmissão hospitalar foi provável em cinco casos. Esta transmissão foi provavelmente relacionada à visitas concorrentes no hospitaldia para pacientes infectados pelo HIV e atendimento por longo período no ambulatório de Infectologia. Este estudo estabeleceu a ocorrência de provável transmissão recente em cerca de um terço do grupo estudado. Identificou vínculo epidemiológico em um número pequeno de casos, demonstrando a necessidade de investigação de contato mais ativa e expandida. Evidenciou, ainda, a possibilidade de transmissão hospitalar através da determinação de vínculos intra-hospitalares, bem como a associação entre seguimento prévio no HC-UNlCAMP e participação em agrupamentos genotípicos / Abstract: Objectives: The study was performed in order to evaluate the partems of TB transmission among HIV-infected patients artending to a reference Brazilian hospital and to evaluate the risk factors associated to TB recent transmission among persons HIV-infected. Methods: Retrospective, molecular (IS61l0-RFLP technique) and descriptive study involving HIV-infected patients with tuberculosis confmned by culture, ftom January 1996 through July 2001. Results: Tuberculosis was reported among 1596 patients; 560 out of these were HIV associated. Tuberculosis was bacteriologically confirmed in 254 (45.3%) HIV-infected individuaIs. Pulmonary involvement was predominant (81.1%), however AFB smear was positive in 37.9% of cases with pulmonary disease, and lung cavitations were seen in only 7.8% of cases. Tuberculosis was the AIDS-defming illness in 54.7% of cases. The IS61l0-RFLP of 109 M tubercu/osis isoIates identified 87 distinct genotyping partems; 13 clusters invoIving 35 (32.1%) patients were found. The number ofpatients in each cluster ranged from two to six. Nosocomial transmission was the probable source in five individuaIs. Conclusions: Recent transmission of M tubercu/osis could be demonstrated in approximately one third of HIV-infected patients. Epidemiologicallinks could only be evidenced in a small number of situations, strengthening the need of more extended and detaiIed contact tracing among hospitaIs reference centers for AIDS, in deveIoping countries / Doutorado / Doutor em Clínica Médica

Orientador : Maria Luiza Moretti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T22:38:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Beretta_AnaLauraRemedioZeni_D.pdf: 2511700 bytes, checksum: ea398f91fb9d1a00a22c2d0ff0cad095 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: Infecções hospitalares causadas por Staphylococcus aureus resistentes oxacilina (SARO) representam grave problema médico e hospitalar no mundo todo e têm sido causadoras de surtos e endemias, principalmente nos hospitais de médio e grande porte e nos universitários, com altas taxas de mortalidade. O emprego de técnicas discriminatórias por análise do DNA de cepas envolvidas nas infecções hospitalares é um recurso valioso para o conhecimento do comportamento epidemiológico dos SARO. Nosso estudo analisou a diversidade genômica das cepas de SARO, isoladas de pacientes portadores de infecção hospitalar, internados no Hospital das Clínicas da Universidade Estadual de Campinas, durante o período compreendido entre 1995-2001, comparativamente com os perfis genômicos obtidos no estudo, durante os anos de 1991 até 1993. Foram aplicados dois métodos de tipagem molecular. O perfil do DNA genômico de cepas de SARO no período de 1995 a 2001 por ¿Eletroforese em Gel de Campo Pulsado¿ (PFGE), comparativamente com o perfil de cepas SARO estudadas em 1991 a 1993 pela mesma técnica molecular. Foi realizada a análise de DNA genômico por polimorfismo amplificado aleatoriamente, ¿Restriction Amplification Polymorphic DNA¿ (RAPD), nas cepas SARO de 1995 a 2001. Foram estudadas 117 cepas de SARO obtidas de pacientes internados entre 1995 a 2001. Utilizando-se a técnica de PFGE, foi observado que 80 (68,4%) cepas pertenciam ao mesmo perfil genômico A, 18 (15,4%) pertenciam a um perfil genômico muito relacionado AM, 18 (15,4%) pertenciam a um perfil genômico possivelmente relacionado AP e 1 (0,8%) cepa pertenciam a um perfil genômico não relacionado. No período de 1991 a 1993, as 73 cepas de SARO estudadas foram representadas por cinco diferentes perfis: A, B, C, D e E. O perfil A foi o mais freqüente e foi identificado em 55 (75,3%) cepas; três cepas muito relacionadas e 4 possivelmente relacionadas também foram identificadas. Os perfis genômicos A, AM e AP encontrados no período de 1995-2001, foram idênticos àqueles obtidos entre 1991 a 1993, demonstrando a presença, a disseminação clonal e a persistência de uma cepa endêmica dentro do ambiente hospitalar num período de 10 anos. A análise dos padrões mostrou um coeficiente de similaridade de 96% entre os perfis A no período de 1991-1993 e 1995-2001. Através da técnica de RAPD foram identificados dois diferentes padrões de agrupamento: o padrão a foi representado por 43 cepas e o número de bandas variou de 8 a 10, enquanto que o agrupamento b foi representado por 74 cepas e o número de bandas variou de 5 a 7. O coeficiente de similaridade entre os padrões a e b obtido através desta técnica foi de 86%. A aplicação de métodos de biologia molecular permitiu uma melhor compreensão do comportamento epidemiológico de SARO no Hospital de Clínicas da Unicamp. A persistência do mesmo perfil genômico durante um período de 10 anos revela alta probabilidade de transmissão cruzada deste patógeno / Abstract: Nosocomial infections caused by MRSA represent a serious medical and nosocomial problem around the world and have been the cause of epidemics and outbreaks with a high mortality rate mainly in University Hospitals and large and medium sized hospitals. The use of discriminatory techniques through DNA analysis of strains involved in nosocomial infections is an extremely valuable resource to confirm the efficacy of control measures related to the causing agents of nosocomial infections. This study has analyzed the genomical diversity of MRSA strains isolated from nosocomial infection carriers hospitalized at the Hospital das Clínicas da Universidade Estadual de Campinas, from 1995 to 2001, comparing them with the genomical profiles obtained from 1991 to February 1993. Two molecular typing methods were applied: - RAPD-PCR genomical DNA analysis in two periods of time and the DNA profile by PFGE. 117 MRSA strains were studied-obtained from carriers hospitalized from 1995 to 2001. Through PFGE, it has been observed that 80 (68.4%) strains had the same genomic profile A, 18 (15.4%) strains had a closely-related genomic profile AM, 18 (15.4%) strains had a possibly-related genomic profile AP and only 1 (0,8%) strain presented an unrelated profile. In the period from 1991 to 1993, 73 strains presented five distinctive DNA profiles: A, B, C, D and E. Profile A was the most frequent DNA pattern and was identified 55 (75.3%) strains; three closely-related and four possibly related profiles were also identified. The genomic profiles A, AM and AP identified in the period from 1995-2001 were identical to those obtained from 1991 to 1993, demonstrating the presence, the clonal dissemination and the persistence of an endemic strain in a nosocomial environment within a ten-year period. The computer analysis of the endemic profile A identified in period 1991-1993 and profile A from period 1995-2001 showed a 96% of similarity and they were considered to be the same profile A and they came from the common MRSA clone widely recognized in Sao Paulo and other Brazilians hospitals. Two different cluster patterns have been identified through RAPD; the profie a was represented by 43 (36.7%) strains and there was a variation from 8 to 10 fragments while profile b was represented by 74 (53.3%) strains and there was a variation from 5 to 7 fragments. Cluster analysis showed an 86% coefficient of similarity. A better understanding of the epidemiological behavior of MRSA strains at Hospital de Clínicas da Unicamp has been achieved with the application of molecular biology methods. The persistence of the same genomic profile within a ten-year period has shown a high probability of a crossed transmission of such pathogen / Doutorado / Microbiologia

Orientador: Maria Silvia Viccari Gatti / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-03T22:33:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Rodrigues_DanieleMasselli_M.pdf: 1852380 bytes, checksum: f83cb847eec2bcf31bf414b3bbf154ba (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: O vírus da encefalomielite murina de Theiler (TMEV) é um patógeno entérico de camundongos, pertencente ao gênero Cardiovirus da família Picornaviridae. O TMEV é um vírus não envelopado, icosaédrico, com 20 - 30 nm e genoma constituído de RNA fita simples com polaridade positiva. Os TMEV têm sido classificados em dois subgrupos, de acordo com sua atividade biológica após inoculação intracerebral. Cepas neurovirulentas (GDVII e FA) induzem uma encefalite aguda e fatal, enquanto aquelas de baixa virulência (TO, WW, DA e BeAn) persistem no sistema nervoso central, induzindo doença crônica, caracterizada por desmielinização. A infecção natural por TMEV tem sido demonstrada em colônias onvencionais de camundongos e, em sua maioria, a infecção é assintomática. Embora o TMEV seja descrito como um patógeno de camundongos, anticorpos para TMEV-GDVII têm sido detectados em soros de ratos provenientes de biotérios que mantêm colônias convencionais. A prevalência da infecção por TMEV-GDVII nestas colônias de ratos é alta, em torno de 54,6%. Assim, este trabalho teve por finalidade demonstrar, por métodos sorológicos e molecular, a infecção natural por TMEV em colônias de ratos. Soros destes animais foram analisados pela reação de imunofluorescência indireta e a presença de anticorpos anti-TMEV-GDVII foi detectada em 86,3% deles. Ao mesmo tempo, pelo teste de soroneutralização, 77,2% destes soros demonstraram anticorpos neutralizantes para TMEV-GDVII. Com o objetivo de isolar o vírus de ratos, sistemas ¿in vitro¿ e ¿in vivo¿ foram utilizados. Nove passagens sucessivas de amostras de suspensão intestinal foram feitas em células BHK-21 e não foi possível demonstrar efeito citopático. Sinais clínicos da infecção por TMEV em camundongos, ou seja, paralisia das patas posteriores e tremores, foram demonstrados em camundongos e ratos neonatos inoculados com suspensão intestinal de ratos soropositivos e com a cepa padrão de TMEV-GDVII. Os resultados da RT-PCR demonstraram a presença de RNA viral em amostras de cérebro de ratos inoculados com a suspensão intestinal, com TMEV-GDVII e nas amostras de fezes de ratos provenientes de diferentes biotérios convencionais. Os resultados demonstram que ratos se infectam naturalmente por TMEV e, embora hajam poucas descrições na literatura da interferência deste vírus em pesquisas biomédicas, a monitoração sanitária para TMEV em biotérios que mantêm colônias de ratos deve ser incluída / Abstract: Theiler¿s murine encephalomyelitis virus (TMEV) is an enteric pathogen of mice and belongs to the Cardiovirus genus in the family Picornaviridae. TMEV is a non-enveloped, icosaedric virus with 20 ¿ 30 nm size and it has an RNAss positive sense genome. TMEV has been divided in two subgroups on the basis of their biological activities after intracerebral inoculation. Neurovirulent strains (GDVII and FA) causes an acute and fatal encephalitis in mice and in contrast, low neurovirulent strains (DA, BeAn 8386, WW and TO) causes a persistent infection in the central nervous system and produce a chronic disease characterized by demyelination. TMEV infection with low neurovirulent strains has been used as an experimental model to help the studies on demyelination process induced by virus infection and to study diseases as Multiple Sclerosis. The natural infection by TMEV has been related in conventional colonies of mice and it¿s frequently asymptomatic. Although TMEV has been described as a pathogen of mice, antibodies against TMEV-GDVII has been detected in serum of rats reared in non-barrier colonies. Facing this, the purpose of the present study was to demonstrate the natural infection of TMEV in rat colonies through serological and molecular methods (RT-PCR). The rat serum were analysed by indirect immunofluorescence assay and antibodies against TMEV-GDVII were detected in 86,3% of the serum analysed. In the neutralization assay, 77,2% of the same serum showed neutralizing antibodies anti TMEVGDVII. To further isolate this rat virus, ¿in vitro¿ and ¿in vivo¿ systems were used. Nine blinded passages of the intestinal suspension were realized in BHK-21 cells, but no citopathic effect was identified. Clinical signs of TMEV infection in mice were characterized by flaccid paralisis of hind legs and tremor when newborn rats and mice were inoculated with intestinal suspension of seropositive rats and with the prototype strain of TMEV-GDVII. The RT-PCR results showed the RNA genome in the brain samples of rats and mice inoculated both with the intestinal suspension and the prototype strain. In the fecal samples, the RNA genome was also detected. In summary, rats can be naturally infected by TMEV and although there are a few examples in the literature of TMEV infection interference with biomedical researches, a health monitoring program for TMEV should be included in the rat colonies / Mestrado / Microbiologia / Genetica e Biologia Molecular

Orientador: Sara T. O. Saad / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T23:31:08Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gilli_SimoneCristinaOlenscki_D.pdf: 6959338 bytes, checksum: 59270968defefa0da38289624c7c16a1 (MD5) Previous issue date: 2004 / Resumo: A infecção pelo vírus linfotrópico de células T tipo I (HTLV I) tem sido associada à leucemia/linfoma T do adulto (LLTA), à paraparesia espástica tropical! mielopatia associada ao HTLV I (PET/MAH), à uveíte e, recentemente, à Síndrome de Sjõgren e outras doenças do sistema conjuntivo. Os fatores que detenninam a evolução para essas doenças relacionadas à infecção são desconhecidos, mas podem estar ligados à predisposição genética e à resposta imune do hospedeiro. Camundongos com ausência do gene GATA3 demonstram várias e graves anormalidades morfológicas e fisiológicas no sistema nervoso central e periférico, além de comprometimento da hematopoese durante o desenvolvimento embrionário. Há, portanto, semelhanças entre os sistemas comprometidos na ausência do gene GATA3 e aqueles alterados secundariamente à infecção pelo HTLV I. Vários estudos sugerem que uma fosfoproteína viral presente no HTLVI, denominada Tax, ative a transcrição de vários genes envolvidos na produção de citocinas ou na resposta e na proliferação celular, como c-fos, c-myc, erg-I, IL-I, IL-2, GM-CSF. Entretanto, a crelação entre a infecção pelo vírus HTLV I e o fator de transcrição GATA3 ainda não havia sido determinada. Os objetivos do presente trabalho foram caracterizar a relação entre o fator de transcrição GATA3 e o vírus HTLV I, utilizando-se, para tanto, a técnica de RT-PCR semiquantitativo; analisar a relação entre o fator de transcrição GATA3 e o vírus HTLV I, por meio de estudos de interação DNA/proteína; e demonstrar, por estudos funcionais em modelos celulares in vitro, a resposta das regiões de controle transcricional do gene GATA3 à proteína Tax. Demonstramos, através do RT-PCR semi-quantitativo que ocorre uma evidente redução na expressão do gene GATA3 em portadores saudávies da infecção pelo HTLVI, e também de forma mais acentuada nos portadores de Leucemia Linfoma T do Adulto e Paraparesia Espástica Tropical/Mielopatia associada ao HTLVI. Estudos in vitro, que utilizaram construções com o gene reporter CAT direcionado pelo promotor e silenciador do gene GATA3 co-transfectados com vetores de expressão da proteína Tax e seu mutante, revelaram que Tax exerce atividade discreta no promotor de gene GATA3, mas reprime de modo marcante a atividade do promotor na presença de seu silenciador. Essa repressão provavelmente ocorre através da interação de tax com o fator de trans.crição ZEB, o silenciador do promotor do gene GATA3, uma vez que interação deste com a proteína Tax foi demonstrada no estudo de retardamento em gel. O estudo demonstrou, pela primeira vez, a regulação do gene GATA3 pelo vírus HTLVI. Essa regulação pode estar envolvida na fisiopatologia das doenças relacionadas à infecção pelo HTLVI / Abstract: The HTLV-I nonstructural protein Tax plays a crucial role in cellular transformation. It activates the transcription factors of various cellular genes and interacts with cellular proteins. Limited data are available on the interaction between specific T cell transcription factor GATA3 and Tax. hnplication for the significance ofGATA3 on T-cell development and function, (Th2) differentiation, and a role ofGATA3 during immune response has been reported. To determine the effect of the Tax protein on GATA3 gene expression, we investigated the interaction between this protein and the GATA3 promoter and repressor regions. The semi quantitative RT-PCR demonstrated a considerable decrease in the expression of the GATA 3 cDNA all subjects infected by HTLV I and no expression of GATA 3 mRNA was observed in one subject with ATLL and another with HAM/TSP. Results demonstrated an interaction between Tax and GATA3 gene and a role ofTax in the negative regulation of GATA3 expression, through its interaction with the repressor, ZEB. This interaction may be involved in the pathophysiology of adult T cell leukemiallymphoma and tropical spastic paraparesis/HTLV-I-associated myelophathy / Doutorado / Clinica Medica / Doutor em Clínica Médica

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:28:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1008_1.pdf: 716170 bytes, checksum: faf19841928aef100ae340cda214e7b3 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Em vigilância epidemiológica, um grande desafio é encontrar a melhor forma de monitorar a incidência do vírus da imunodeficiência humana do tipo1 (HIV-1). A Organização Mundial de Saúde (OMS) aprovou em 2001 uma metodologia laboratorial que permite identificar infecções recentes. O estudo foi desenhado para comparar o ensaio automatizado Axsym HIV 1/2gO modificado pela Guanidina que avalia o Índice de Avidez, com o ensaio imunoenzimático de captura de IgG BED-CEIA, na identificação de infecções recentes pelo HIV-1 de usuários de dois Centros de Testagem e Aconselhamento (CTA) do estado de Pernambuco. Foram utilizadas 364 amostras de soro que tiveram diagnósticos positivos para o HIV-1 de indivíduos que procuraram de forma espontânea, os Centros de Testagem e Aconselhamento (CTA) da cidade do Cabo de Santo Agostinho e da cidade do Paulista, ambas localizadas na região metropolitana do Recife, no período de 2006 a 2009. Os resultados dos dois testes foram comparados utilizando o BED como Padrão Ouro. Das 364 amostras, 103 (28,29%) foram identificadas como infecção recente pelo BED; pelo índice de avidez, com ponto de corte 0,8 e 0,9 foram identificadas 76 amostras (20,87%) e 148 (40,7%), respectivamente. para um ponto de corte de 0,9. A curva ROC mostrou que o ponto de corte para o IA com a melhor sensibilidade e especificidade em relação ao BED foi de 0,9, no qual a sensibilidade foi de 85,4% e especificidade de 77%. O presente estudo permite concluir que o IA obtido pela metodologia Axsym-HIV- 1/2gO com adição de Guanidina, possui boa performance comparado ao BED na detecção das infecções recentes pelo HIV, sendo de grande utilidade em regiões com recursos limitados

Made available in DSpace on 2014-06-12T18:28:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3058_1.pdf: 5603906 bytes, checksum: 4bea935ff4411527fbfe87b4255e77c4 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O uso das drogas antirretrovirais no Brasil tem aumentado a sobrevida e melhorado a qualidade de vida dos pacientes com HIV/Aids, porém alguns indivíduos podem apresentar falha terapêutica devido a resistência do HIV, entre outros fatores. Testes genotípicos podem detectar resistência em pacientes que nunca fizeram uso da terapia, possibilitando identificar cepas resistentes que podem ser transmitidas. Ensaios imunoenzimáticos com metodologias específicas podem identificar se uma pessoa foi infectada recentemente, distinguindo-as de pessoas com infecção crônica. Esta tese é composta por uma revisão da literatura abordando resistência primaria, infecção recente e subtipos do HIV, e por dois artigos. No primeiro, sob o titulo Resistência primaria do HIV aos antirretrovirais em Centros de Testagem e Aconselhamento (CTA) da Região Metropolitana do Recife (RMR), Pernambuco foram analisadas 130 amostras de usuários soropositivos para o HIV e virgens de tratamento antirretroviral recrutados no período de julho/2007 a abril/2009, de cinco CTA. As amostras foram analisadas utilizando-se o kit TRUGENE® HIV-1 Genotyping Assay OpenGene DNA Sequencing System (Siemens Diagnostics, USA) para detecção de mutações de resistência e no ensaio BED-CEIA® IgG HIV-1 (Calypte Biomedical Corporation- USA) , para identificação de infecção recente. Encontraram-se freqüências de 6,1% e de 4,6% de resistência primária segundo os critérios do International AIDS Society (IAS USA,2009) e Surveillance Drug Resistance Mutations- SDRM-OMS- 2009, respectivamente. O percentual de infecção recente foi de 23,1% nas amostras genotipadas e foram identificados 56,9% de subtipo B e 37,7% de subtipo F. Em conclusão, o achado de freqüência de resistência primária foi mais elevada do que a detectada em 2002 em Recife (2%), revelando um aumento da resistência associada aos Inibidores da Transcriptase Reversa Não-Nucleosideos (ITRNN). Em relação aos subtipos virais, destaca-se o alto percentual de subtipo F na Região Metropolitana do Recife, e um alto percentual de infecção recente nas amostras sequenciadas. No segundo artigo, intitulado Infecção recente e prevalência do HIV em usuários de Centros de Testagem e Aconselhamento da Região Metropolitana do Recife - Pernambuco descreve-se a taxa de infecção recente em 169 amostras de cinco CTA da RMR, a prevalência da infecção nesses CTA no período de julho/2007 a abril/2009 e as possíveis associações entre as características sócio- demográficas e laboratoriais dessa população. Observou-se um percentual de infecção recente de 23,7%, e taxas de prevalência variando de 1,2% a 3,9%. Concluímos que a infecção recente ocorre principalmente nas faixas etárias mais jovens e com maior frequência entre heterossexuais, apesar de frequência significativa entre HSH. A infecção pelo HIV-1 observada neste estudo, predominou no sexo masculino e Recife revelou-se com maior prevalência da infecção pelo HIV e com maior percentual de infecções recentes