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Estrutura da comunidade de helmintos associados ao lagarto Tropidurus torquatus (Squamata: Tropiduridae) em uma área de afloramento rochoso no distrito de Toledos, Juiz de Fora, MG

Pereira, Felipe Bisaggio 24 February 2010 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-12-16T12:33:44Z No. of bitstreams: 1 felipebisaggiopereira.pdf: 1115383 bytes, checksum: c4128dd85e239865ce346d0569b37b98 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-12-19T12:34:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 felipebisaggiopereira.pdf: 1115383 bytes, checksum: c4128dd85e239865ce346d0569b37b98 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-19T12:34:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 felipebisaggiopereira.pdf: 1115383 bytes, checksum: c4128dd85e239865ce346d0569b37b98 (MD5) Previous issue date: 2010-02-24 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A comunidade parasitária do lagarto Tropidurus torquatus em uma área de campo rupestre localizada no estado de Minas Gerais, sudeste do Brasil, foi estudada. Dos 110 hospedeiros analisados, 92 (83,6%) estavam infectados. Foram encontradas cinco espécies de helmintos, três de nematóide: Physaloptera lutzi, Parapharyngodon sp. e Oswaldofilaria sp., uma espécie de cestóide e um cistacanto não identificados. Apenas as espécies de nematóides apresentaram dados suficientes para analises ecológicas, sendo P. lutzi a espécie mais prevalente (67,3%) e com maior intensidade parasitária (4,86±4,85). Somente para Oswaldofilaria sp. foram encontradas diferenças significativas na prevalência e intensidade parasitária entre hospedeiros fêmeas e machos, esses últimos apresentando os maiores valores. A intensidade parasitária total e de P. lutzi também diferiram entre os sexos de hospedeiros com machos apresentando os maiores valores. O tamanho corporal do hospedeiro correlacionou-se de forma positiva com a intensidade de infecção de todas as espécies de nematóides. A sazonalidade local não influenciou de forma significativa a estrutura da comunidade componente de parasitos estudada. Aspectos do hospedeiro como dieta, dimorfismo sexual e comportamento (territorialiasmo e forrageamento) representaram importantes fatores na determinação da estrutura dessa comunidade de helmintos. De maneira geral, a comunidade parasitária apresentou baixa riqueza de espécies e um caráter não interativo, características comuns em comunidades parasitárias de répteis como hospedeiros. / The helminth community of the lizard Tropidurus torquatus from a rocky outcrop located in Minas Gerais state, southeast Brazil, was studied. Ninety two of the one hundred ten individuals examined (83,6%) harbored helminths. A total of five helminth species were found, tree nematodes: Physaloptera lutzi, Parapharyngodon sp. and Oswaldofilaria sp., one cestode species and one acanthocaphalan cystacanth not identified. Only nematode species had sufficient data to perform ecological analysis with Physaloptera lutzi showing the highest prevalence (67,3%) and mean intensity (4,86±4,85). Prevalence and intensity of infection between males and females hosts differed only for Oswaldofilaria sp., with males showing the highest values. Total and P. lutzi intensity of infection were different among males and females hosts, with males showing the highest values. The host body size was positively related to intensity of infection for all nematode species. Local seasonality had no influence in the helminth community structure. Host diet, sexual dimorphism and behavior (territorialism, forage strategy) represented important factors in the structuring of this parasite community. In general lines, the helminth community was species poor and non interactive, representing a typical community structure found in herps hosts.
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Comunidades de anf?bios e lagartos da Ba?a de Sepetiba e do Parque Estadual do Cunhambebe, Rio de Janeiro, Brasil / Communities of amphibians and lizards of Sepetiba Bay and State Park of Cunhambebe (RJ).

Silva, Daiane Ouvernay Fernandes da 21 June 2011 (has links)
Submitted by Sandra Pereira (srpereira@ufrrj.br) on 2016-09-15T12:14:46Z No. of bitstreams: 1 2011 - Daiane Ouvernay Fernandes da Silva.pdf: 7586481 bytes, checksum: 5a97593f1df40687d3039aaf482f7a65 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-09-15T12:14:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2011 - Daiane Ouvernay Fernandes da Silva.pdf: 7586481 bytes, checksum: 5a97593f1df40687d3039aaf482f7a65 (MD5) Previous issue date: 2011-06-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / This study investigated the relationship between species of frogs, lizards, gradients environmental and insularity. We could detect a strong relationship between lizards in open habitats and anthropic as well as a strong influence of the area to the richness and abundance of lizards, rather than habitat heterogeneity. The community was the most diverse State Park Cunhambebe. The lizards of island environments of the Sepetiba Bay showed a strong relationship between abundance and area, supporting the hypothesis of Ecological Release. The species Cycloramphus sp., Thoropa miliaris, Hylodes asper, H. phyllodes, Phasmahyla cruzi and Scinax trapicheiroi are those with lower values of tolerance of distance from this physiognomy and sometimes only occur in this environment. / Neste estudo foram investigadas as rela??es entre esp?cies de anf?bios anuros, lagartos, gradientes ambientais e insularidade. Nota-se uma forte rela??o dos lagartos com ambientes abertos e antr?picos, bem como uma forte influ?ncia da ?rea para a riqueza e abund?ncia dos lagartos, mais que a heterogeneidade de habitats. A comunidade mais diversa foi a do Parque Estadual do Cunhambebe. Os lagartos de ambientes insulares da Ba?a de Sepetiba demonstraram forte rela??o entre abund?ncia e ?rea, corroborando com a hip?tese de Libera??o ecol?gica. As esp?cies Cycloramphus sp., Thoropa miliaris, Hylodes asper, H. phyllodes, Phasmahyla cruzi e Scinax trapicheiroi s?o as que possuem menores valores de toler?ncia de dist?ncia da cachoeira e, algumas vezes, s? ocorrem neste ambiente
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Área de vida do lagarto saxícola Tropidurus semitaeniatus (Squamata: Tropiduridae) em área de Caatinga, Nordeste do Brasil / Home range of the saxicolous lizard Tropidurus semitaeniatus (Squamata: Tropiduridae) in Caatinga area, Northeastern Brazil

Daniel Cunha Passos 03 May 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / A área de vida pode ser definida como o espaço físico necessário para um animal desempenhar as atividades essenciais para sua sobrevivência, desenvolvimento e reprodução. O conhecimento sobre área de vida é essencial para a compreensão dos processos que regem o uso do espaço e a organização social em populações animais. Neste estudo, investigamos aspectos das áreas de vida do lagarto saxícola, endêmico da Caatinga, Tropidurus semitaeniatus, avaliando possíveis variações intersexuais, ontogenéticas e sazonais nos tamanhos das áreas de vida, bem como elementos da organização social da espécie. A área de estudo consistiu em uma área típica de Caatinga stricto sensu, localizada no município de Pentecoste - Ceará. Realizamos coletas em dois afloramentos rochosos, nos quais demarcamos pontos de referência a cada cinco metros. Coletamos os lagartos residentes nestes afloramentos, registrando, para cada indivíduo, o sexo e o tamanho rostro-cloacal (mm), e posteriormente, identificando-o com marcação única. Vistoriamos cada afloramento durante 20 dias em cada estação (chuvosa e seca), respectivamente em junho e dezembro de 2011, realizando recapturas visuais e coletando registros de posições espaciais de cada indivíduo. Estimamos as áreas de vida pelo método do Polígono Convexo Mínimo, para os indivíduos recapturados pelo menos seis vezes. Obtivemos 56 áreas de vida, das quais 10 foram de machos, 20 de fêmeas e 26 de jovens. Não existiu relação entre os tamanhos das áreas de vida e os comprimentos rostro-cloacais dos indivíduos. Não houve diferenças sexuais, ontogenéticas ou sazonais nos tamanhos das áreas de vida. Contudo, o espaçamento entre as áreas de vida foi menor durante a estação chuvosa e a maioria das sobreposições entre áreas de vida também ocorreu neste período. Ao todo, registramos 81 sobreposições de áreas de vida, sendo estas mais frequentes entre fêmeas e jovens e menos frequentes entre pares de machos. A proporção da área de vida total sobreposta com outro indivíduo foi maior entre pares de fêmeas e menor entre pares de machos. Os machos estiveram associados em média com 1,5 fêmeas, possuindo de zero a sete áreas de vida de fêmeas sobrepostas com suas áreas de vida. O número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos esteve positivamente associado ao tamanho dos machos. Por outro lado, não houve associação entre o número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos e os tamanhos das áreas de vida dos machos correspondentes. Em suma, à luz do conhecimento acumulado sobre a história natural do organismo de estudo, acreditamos que sua extrema especificidade por ambientes rochosos e a disponibilidade limitada de habitats adequados à ocupação constituem fatores preponderantes na determinação dos padrões singulares de uso do espaço e organização social em T. semitaeniatus. / The home range may be defined as the physical space required for an animal to perform the essential activities for its survival, development and reproduction. The knowledge on home range is essential to understanding the processes that govern the use of space and the social organization in animal populations. Herein, we investigated home range aspects of the saxicolous lizard, endemic from Caatinga, Tropidurus semitaeniatus, evaluating possible intersexual, ontogenetic and seasonal variations in home range size, as well as elements of the social organization of the species. The study area was a typical Caatinga stricto sensu area, located in Pentecoste municipality - Ceará. We performed sampling at two rocky outcrops, where we defined reference marks each five meters. We collect the lizards living in these outcrops, recording for each individual, the sex and snout-vent length (mm), and subsequently, identifying it with unique marking code. We scanned each outcrop for 20 days in each season (rainy and dry), respectively on June and December 2011, performing visual recaptures and collecting records of spatial positions of each individual. We estimated the home range size by Minimum Polygon Convex method, for individuals recaptured at least six times. We obtained 56 home range areas, of which 10 males, 20 females and 26 juveniles. There was no relationship between home range size and snout-vent length of individuals. There were no sexual, ontogenetic or seasonal differences in home range size. However, the spacing between home range areas was lowest during the rainy season and the most of the home range overlaps also occurred in this period. Overall, we recorded 81 home range overlaps, which were more frequent between females and juveniles and less frequent among pairs of males. The proportion of the total home range overlapped with another individual was highest among pairs of females and lowest among pairs of males. Males were associated on average with 1.5 females, having from zero to seven females home range overlapped with their own home ranges. The number of female home ranges overlapped with male ones was positively associated with the body size of males. Moreover, there was no association between the number of female home ranges overlapped with male ones and the home range size of the corresponding males. In conclusion, in the light of accumulated knowledge about the natural history of the studied organism, we believe that their extreme specificity to the rocky environments and restricted availability of suitable habitats for its occupation are important factors in determining patterns of use of space and social organization in T. semitaeniatus
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Ecologia comportamental de tropidurus Hispidus e Tropidurus Semitaeniatus (Squamata, Tropiduridae) em Simpatria, em ?rea de caatinga do nordeste do Brasil.

Ribeiro, Leonardo Barros 19 March 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-12-17T15:36:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LeonardoBR_TESE_Cap_II_III.pdf: 677404 bytes, checksum: 247b1251f8d1d16cb41bf4f8ec2f3c18 (MD5) Previous issue date: 2010-03-19 / Universidade Federal do Rio Grande do Norte / This study evaluated the spatial, time and alimentary niches of Tropidurus hispidus and Tropidurus semitaeniatus in sympatry in a caatinga of Rio Grande do Norte, Brazil, as well as their foraging and termoregulatory behaviors, the activity body temperature and their reproductive and fat body cycles. Monthly excursions, from October 2006 to May 2008, were conducted at the Ecological Station of the Serid? (ESEC Serid?), Serra Negra do Norte municipality, using specific methodology for investigation of the aforementioned objectives. The two species presented similarities in space niche use, mainly in rocky habitat, however they differed in vertical microhabitat use with T. hispidus using a larger vertical microhabitat range. In the dry season the time of activity of both species was bimodal. In the wet season T. semitaeniatus showed a unimodal activity period, while T. hispidus maintained an bimodal activity period. In terms of importance in the diet, to both species, Hymenoptera/Formicidae and Isoptera predominated during the dry season. In the wet season, although Hymenoptera/Formicidae had larger importance among the prey items, lizards opportunistically predated on Lepidoptera larvae, Coleoptera larvae/adults and Orthoptera nymphs/adults. The foraging intensity revealed differences between the species, mainly in the wet season, when T. semitaeniatus was more active than T. hispidus. The mean activity body temperature of T. semitaeniatus was significantly higher than that of T. hispidus. The thermoregulatory behavior showed that during the dry season T. hispidus and T. semitaeniatus spent more time in shade or under filtered sun. In the wet season, T. hispidus did not show differences in the amount of time spent among the light exposure locations, however T. semitaeniatus spent most of their time exposed to direct sun or filtered sun. The reproductive cicle of T. hispidus and T. semitaeniatus occurred from the middle of the dry season to the beginning of the wet season. In both species, female reproductive activity was influenced by precipitation, whereas males exhibited spermatozoa in their testes throughout the year, and their reproductive activity was not related with any of the climatic variables analysed. In the two species, the fat storage varied inversely with reproductive activity, and there was no difference in fat body mass between females and males. We concluded that the segregation between T. hispidus and T. semitaeniatus in this caatinga area occurs in vertical space use, in the largest vagility of T. hispidus in microhabitat use and larger range size of their alimentary xviii items. Additionally, significant seasonal differences in relation to the activity period, body temperature, and foraging and termoregulatory behaviors between these two Tropidurus species facilitate their coexistence. / Este estudo avaliou o uso dos recursos espacial, temporal e alimentar por Tropidurus hispidus e Tropidurus semitaeniatus em simpatria em uma caatinga do Rio Grande do Norte, Brasil, bem como seus comportamentos de forrageamento e termorregulat?rio, suas temperaturas corp?reas em atividade e seus ciclos reprodutivos e de gordura corp?rea. Excurs?es mensais, de outubro de 2006 a maio de 2008, foram realizadas ? Esta??o Ecol?gica do Serid? (ESEC Serid?), munic?pio de Serra Negra do Norte, com utiliza??o de metodologia espec?fica para a investiga??o dos objetivos acima mencionados. As duas esp?cies apresentaram similaridades no uso do nicho espacial, especialmente no h?bitat rochoso; contudo, elas diferiram no uso vertical do micro-h?bitat com T. hispidus usando uma faixa vertical maior do micro-h?bitat. Na esta??o seca o per?odo de atividade de ambas as esp?cies foi bimodal. Na esta??o chuvosa, a atividade de T. semitaeniatus mostrou um per?odo unimodal, enquanto T. hispidus manteve uma atividade bimodal. Em termos de import?ncia na dieta, para ambas as esp?cies, os Hymenoptera/Formicidae e Isoptera predominaram na esta??o seca. Na esta??o chuvosa ainda que os Hymenoptera/Formicidae continuaram a ter maior import?ncia entre os itens alimentares, os lagartos predaram oportunisticamente larvas de Lepidoptera, larvas/adultos de Coleoptera e ninfas/adultos de Orthoptera. A medida de intensidade de forrageamento revelou diferen?as entre as esp?cies, especialmente na esta??o chuvosa, quando T. semitaeniatus foi mais ativo do que T. hispidus. A temperatura corp?rea m?dia em atividade de T. semitaeniatus foi significativamente superior a de T. hispidus. O comportamento termorregulat?rio mostrou que, durante a esta??o seca, T. hispidus e T. semitaeniatus gastaram mais tempo expostos ? sombra ou sob sol filtrado. Na esta??o chuvosa, T. hispidus n?o mostrou diferen?as no tempo gasto entre os locais de exposi??o ? luz, contudo T. semitaeniatus esteve a maior parte de seu tempo exposto ao sol ou sob sol filtrado. A reprodu??o de T. hispidus e T. semitaeniatus ocorreu entre a metade da esta??o seca e o in?cio da esta??o chuvosa. Em ambas as esp?cies, a atividade reprodutiva das f?meas foi influenciada pela precipita??o, enquanto os machos apresentaram espermatoz?ides nos test?culos ao longo de todo o ano, e sua atividade reprodutiva n?o foi relacionada com nenhuma das vari?veis clim?ticas analisadas. O estoque de gordura corp?rea variou inversamente com a atividade reprodutiva nas duas esp?cies, e n?o houve diferen?a entre f?meas e machos quanto a massa dos corpos adiposos. Conclu?mos que xvi a segrega??o entre T. hispidus e T. semitaeniatus nesta ?rea de caatinga ocorre no uso vertical do espa?o, na maior vagilidade de T. hispidus na utiliza??o de micro-h?bitats e maior amplitude de tamanho de seus itens alimentares. Adicionalmente, diferen?as sazonais significativas em rela??o ao per?odo de atividade, temperatura corp?rea, e comportamentos de forrageamento e termorregulat?rio entre essas duas esp?cies de Tropidurus, possibilitam a coexist?ncia.
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Área de vida do lagarto saxícola Tropidurus semitaeniatus (Squamata: Tropiduridae) em área de Caatinga, Nordeste do Brasil / Home range of the saxicolous lizard Tropidurus semitaeniatus (Squamata: Tropiduridae) in Caatinga area, Northeastern Brazil

Daniel Cunha Passos 03 May 2014 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Rio de Janeiro / A área de vida pode ser definida como o espaço físico necessário para um animal desempenhar as atividades essenciais para sua sobrevivência, desenvolvimento e reprodução. O conhecimento sobre área de vida é essencial para a compreensão dos processos que regem o uso do espaço e a organização social em populações animais. Neste estudo, investigamos aspectos das áreas de vida do lagarto saxícola, endêmico da Caatinga, Tropidurus semitaeniatus, avaliando possíveis variações intersexuais, ontogenéticas e sazonais nos tamanhos das áreas de vida, bem como elementos da organização social da espécie. A área de estudo consistiu em uma área típica de Caatinga stricto sensu, localizada no município de Pentecoste - Ceará. Realizamos coletas em dois afloramentos rochosos, nos quais demarcamos pontos de referência a cada cinco metros. Coletamos os lagartos residentes nestes afloramentos, registrando, para cada indivíduo, o sexo e o tamanho rostro-cloacal (mm), e posteriormente, identificando-o com marcação única. Vistoriamos cada afloramento durante 20 dias em cada estação (chuvosa e seca), respectivamente em junho e dezembro de 2011, realizando recapturas visuais e coletando registros de posições espaciais de cada indivíduo. Estimamos as áreas de vida pelo método do Polígono Convexo Mínimo, para os indivíduos recapturados pelo menos seis vezes. Obtivemos 56 áreas de vida, das quais 10 foram de machos, 20 de fêmeas e 26 de jovens. Não existiu relação entre os tamanhos das áreas de vida e os comprimentos rostro-cloacais dos indivíduos. Não houve diferenças sexuais, ontogenéticas ou sazonais nos tamanhos das áreas de vida. Contudo, o espaçamento entre as áreas de vida foi menor durante a estação chuvosa e a maioria das sobreposições entre áreas de vida também ocorreu neste período. Ao todo, registramos 81 sobreposições de áreas de vida, sendo estas mais frequentes entre fêmeas e jovens e menos frequentes entre pares de machos. A proporção da área de vida total sobreposta com outro indivíduo foi maior entre pares de fêmeas e menor entre pares de machos. Os machos estiveram associados em média com 1,5 fêmeas, possuindo de zero a sete áreas de vida de fêmeas sobrepostas com suas áreas de vida. O número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos esteve positivamente associado ao tamanho dos machos. Por outro lado, não houve associação entre o número de áreas de vida de fêmeas sobrepostas às áreas de vida de machos e os tamanhos das áreas de vida dos machos correspondentes. Em suma, à luz do conhecimento acumulado sobre a história natural do organismo de estudo, acreditamos que sua extrema especificidade por ambientes rochosos e a disponibilidade limitada de habitats adequados à ocupação constituem fatores preponderantes na determinação dos padrões singulares de uso do espaço e organização social em T. semitaeniatus. / The home range may be defined as the physical space required for an animal to perform the essential activities for its survival, development and reproduction. The knowledge on home range is essential to understanding the processes that govern the use of space and the social organization in animal populations. Herein, we investigated home range aspects of the saxicolous lizard, endemic from Caatinga, Tropidurus semitaeniatus, evaluating possible intersexual, ontogenetic and seasonal variations in home range size, as well as elements of the social organization of the species. The study area was a typical Caatinga stricto sensu area, located in Pentecoste municipality - Ceará. We performed sampling at two rocky outcrops, where we defined reference marks each five meters. We collect the lizards living in these outcrops, recording for each individual, the sex and snout-vent length (mm), and subsequently, identifying it with unique marking code. We scanned each outcrop for 20 days in each season (rainy and dry), respectively on June and December 2011, performing visual recaptures and collecting records of spatial positions of each individual. We estimated the home range size by Minimum Polygon Convex method, for individuals recaptured at least six times. We obtained 56 home range areas, of which 10 males, 20 females and 26 juveniles. There was no relationship between home range size and snout-vent length of individuals. There were no sexual, ontogenetic or seasonal differences in home range size. However, the spacing between home range areas was lowest during the rainy season and the most of the home range overlaps also occurred in this period. Overall, we recorded 81 home range overlaps, which were more frequent between females and juveniles and less frequent among pairs of males. The proportion of the total home range overlapped with another individual was highest among pairs of females and lowest among pairs of males. Males were associated on average with 1.5 females, having from zero to seven females home range overlapped with their own home ranges. The number of female home ranges overlapped with male ones was positively associated with the body size of males. Moreover, there was no association between the number of female home ranges overlapped with male ones and the home range size of the corresponding males. In conclusion, in the light of accumulated knowledge about the natural history of the studied organism, we believe that their extreme specificity to the rocky environments and restricted availability of suitable habitats for its occupation are important factors in determining patterns of use of space and social organization in T. semitaeniatus
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Prescrire et proscrire : les enjeux de la conservation environnementale : transformations des rapports socio-environnementaux à El Cuyo, Réserve de la biosphère de Ría Lagartos, Yucatán, Mexique

Guindon, Andréanne 17 April 2018 (has links)
Ce mémoire porte sur les transformations des relations socio-environnementales à El Cuyo, Réserve de biosphère de Ria Lagartos, au Yucatân, Mexique. Il s'appuie sur l'approche de l'écologie politique pour analyser les discours et pratiques liés à l'environnement. Les relations socio-environnementales se transforment sans cesse, influencées notamment par les acteurs en place, les régimes politiques, les modes de subsistance, les activités économiques. Avec la création de la réserve de Ria Lagartos en 1979, de nouveaux acteurs, programmes de développement, fonds, discours et pratiques liés à un environnement que l'on cherche à conserver se déploient et entraînent des transformations dans les façons de penser et d'agir dans son environnement. Par ailleurs, le nouvel espace créé engendre des changements au plan des relations sociales et de pouvoir dans la localité. C'est dans ce contexte que les discours et pratiques liés à l'environnement sont analysés. Si certains résidents tentent de participer aux activités de la réserve à travers le développement de l'écotourisme, on constate que plusieurs inégalités sociales et des différences au plan de l'accès à l'environnement sont exacerbées par les programmes mis en place. Par ailleurs, il apparaît que les diverses façons de comprendre et de vivre dans son environnement ne possèdent pas toutes une valeur égale dans cet espace de conservation environnementale.
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Development of Novel High-Resolution Melting (HRM) Assays for Gender Identification of Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber ruber) and other Birds

Chapman, Alexandra 14 March 2013 (has links)
Unambiguous gender identification (ID) is needed to assess parameters in studies of population dynamics, behavior, and evolutionary biology of Caribbean Flamingo (Phoenicopterus ruber ruber) and other birds. Due to its importance for management and conservation, molecular (DNA-based) avian gender ID assays targeting intron-size differences of the Chromosome Helicase ATPase DNA Binding (CHD) gene of males (CHD-Z) and females (CHD-W) have been developed. Male (ZZ) and female (WZ) genotypes are usually scored as size polymorphisms through agarose or acrylamide gels. For certain species, W-specific restriction sites or multiplex polymerase chain-reaction (PCR) involving CHD-W specific primers are needed. These approaches involve a minimum of three steps following DNA isolation: PCR, gel electrophoresis, and photo-documentation, which limit high throughput scoring and automation potential. In here, a short amplicon (SA) High-resolution Melting Analysis (HRMA) assay for avian gender ID is developed. SA-HRMA of an 81-Base Pair (bp) segment differentiates heteroduplex female (WZ) from homoduplex male (ZZ) genotypes by targeting Single-nucleotide Polymorphisms (SNPs) instead of intron-size differences between CHD-Z and CHD-W genes. To demonstrate the utility of the approach, the gender of Caribbean Flamingo (P. ruber ruber) (17 captive from the Dallas Zoo and 359 wild from Ria Lagartos, Yucatan, Mexico) was determined. The assay was also tested on specimens of Lesser Flamingo (P. minor), Chilean Flamingo (P. chilensis), Saddle-billed Stork (Ephippiorhynchus senegalensis), Scarlet Ibis (Eudocimus ruber), White-bellied Stork (Ciconia abdimii), Roseate Spoonbill (Platalea ajaja), Marabou Stork (Leptoptilos crumeniferus), Greater Roadrunner (Geococcyx californianus), and Attwater's Prairie Chicken (Tympanuchus cupido attwateri). Although the orthologous 81 bp segments of Z and W are highly conserved, sequence alignments with 50 avian species across 15 families revealed mismatches affecting one or more nucleotides within the SA-HRMA forward or reverse primers. Most mismatches were located along the CHD-Z gene that may generate heteroduplex curves and thus gender ID errors. For such cases, taxon and species-specific primer sets were designed. The SA-HRMA gender ID assay can be used in studies of avian ecology and behavior, to assess sex-associated demographics and migratory patterns, and as a proxy to determine the health of the flock and the degree by which conservation and captive breeding programs are functioning.

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