• Refine Query
  • Source
  • Publication year
  • to
  • Language
  • 94
  • 73
  • 17
  • 13
  • 12
  • 4
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 3
  • 2
  • 2
  • Tagged with
  • 238
  • 69
  • 38
  • 24
  • 20
  • 19
  • 18
  • 17
  • 15
  • 15
  • 14
  • 12
  • 12
  • 11
  • 11
  • About
  • The Global ETD Search service is a free service for researchers to find electronic theses and dissertations. This service is provided by the Networked Digital Library of Theses and Dissertations.
    Our metadata is collected from universities around the world. If you manage a university/consortium/country archive and want to be added, details can be found on the NDLTD website.
221

Modulação da função de macrófagos pela nattectina: uma lectina tipo C do veneno de Thalassophryne nattereri. / Modulation of macrophage function by Nattectin: a C-type lectin from Thalassophryne nattereri fish venom.

Edson Kiyotaka Ishizuka 08 July 2011 (has links)
A Nattectina é uma toxina isolada do veneno de Thalassophryne nattereri que possui homologia com lectinas tipo C. Este estudo consistiu em avaliar a ação da Nattectina sobre as funções de macrófagos e a influência de citocinas Th1/Th2 nessa ativação. Nossos resultados mostram que a Nattectina induziu o aumento da expressão de moléculas coestimuladoras dependente da sinalização MAPK p38 e PI3K em macrófagos derivados da medula óssea, e também um aumento na capacidade endocítica e expressão de MHC de classe II dependentes da sinalização ERK1/2 e da ligação da Nattectina ao carboidrato. Verificamos ainda que alterações induzida pela Nattectina nos macrófagos são consistentes com a ativação clássica M1 dependente de IL-12 e IFN-<font face=\"Symbol\">g, e regulada negativamente por IL-4, IL-10 e IL-13. Por fim, verificamos uma ação coadjuvante da IL-4 com IFN-<font face=\"Symbol\">g na mobilização de SPMs (Small Peritoneal Macrophages) para cavidade peritoneal e na ativação de macrófagos. Dessa forma, a Nattectina pode ser considerada um importante agente imunomodulador capaz de modular as funções de macrófagos. / Nattectin is a toxin isolated from Thalassophryne nattereri fish venom that has homology with C-type lectin. This study was carried out to evaluate the action of Nattectin on macrophage functions and the influence of Th1/Th2 cytokines in this activation. Our results show that Nattectin induced the increased expression of costimulatory molecules dependent on MAPK p38 and PI3K signaling in bone marrow-derived macrophages, and also an increase in endocytic capacity and MHC class II expression dependent on ERK1/2 signaling and binding of Nattectin to carbohydrate. We also found that modifications induced by Nattectin in macrophages are consistent with classical (M1) activation of macrophages dependent on IL-12 and IFN-<font face=\"Symbol\">g cytokines, and negatively regulated by IL-4, IL-10 and IL-13. Finally, it was demonstrated an adjuvant role of IL-4 with IFN-<font face=\"Symbol\">g in mobilization of SPMs (Small Peritoneal Macrophages) to peritoneal cavity and also in macrophage activation. Thus, Nattectin can be considered an important immunomodulatory agent able to modulate macrophage functions.
222

Contribution to the study of diagnosis and prognosis of cutaneous melanoma: is Galectin-3 a relevant biomarker ? / Contribution à l'étude du diagnostic et du pronostic du mélanome cutané: évaluation de la galectine-3 comme biomarqueur

Vereecken, Pierre 21 August 2008 (has links)
La galectine-3 (Gal-3), protéine de type lectine, de 29-35 kDa, étudiée comme marqueur d’aggressivité dans les gliomes, présente des caractéristiques biologiques importantes justifiant son étude dans le domaine du mélanome. En effet, la Gal-3 est une protéine qui peut se lier à la laminine, tout comme l’intégrine α6/β1 dont l’expression est réduite dans le mélanome. L’expression de cette intégrine peut d’ailleurs être modulée par la Gal-3 comme récemment montré dans des lignées cellulaires de cancer du sein (BT-549) et de glioblastome (U373).<p>Le mélanome, véritable problème de santé publique qui est susceptible d’atteindre 1 individu sur 75 dans nos contrées, reste un tumeur mal comprise avec des évolutions parfois incertaines, et des traitements dont l’efficacité est limitée. Le diagnostic histologique du mélanome lui-même peut parfois représenter une difficulté pour le clinicien et l’expert pathologiste ou dermatopathologiste. La couleur (hyperpigmentation d’un lésion pigmentée), dont l’évaluation d’ailleurs reste subjective à défaut de standardisation, ne peut à elle seule signer la malignité d’une lésion pigmentée. Globalement l’évolution d’un patient est prédite par l’indice de Breslow qui traduit en mm l’épaisseur de la tumeur. Si cet indice dépasse 1mm, le risque métastatique augmente, justifiant la réalisation de bilans extensifs de suivi. Ceci dit, certains mélanomes épais peuvent ne pas présenter de caractéristiques d’aggressivité, alors que des mélanomes fins sont parfois mortels. L’identification de marqueurs moléculaires est donc impérative, tant pour développer des stratégies thérapeutiques ciblées, que pour affiner le diagnostic et le pronostic d’un patient. <p>Après avoir mis en évidence par immunohistochimie une expression de Gal-3 par les mélanocytes, nous avons démontré une surexpression de cette protéine par les mélanocytes tumoraux. Nous avons démontré également sur des lésions primitives qu’à l’aggressivité mesurée selon l’indice de Breslow correspondait une diminution de cette surexpression. Cette observation a pu être confirmée par un modèle de greffe orthotopique chez la souris nude.<p>Nous nous somme intéressés par la suite à la détection de la protéine dans le sérum, et nous avons constaté, un taux élevé de Gal-3 dans le sérum de patients en stade métastatique avancé, ce taux élevé pouvant s’expliquer tant par la charge tumorale que par la présence d’une inflammation, d’ailleurs bien connue chez le patient cancéreux en stade avancé. Le rôle antiapoptotique de la Gal-3 nous a alors amené à préciser la valeur prédictive et pronostique de cette protéine. L’hypothèse d’une potentielle action bénéfique sur la réponse immunitaire des patients atteints de mélanome qui ont été vaccinés a été rejetée. La Gal-3 sérique s’est révélée comme facteur de mauvais pronostic chez les patients métastatiques, et une analyse multivariée avec la définition d’une valeur « cut-off » de 10 ng/ml a permis de montrer une valeur pronostique indépendante, supérieure à la S100B et à la CRP. <p> / Doctorat en Sciences médicales / info:eu-repo/semantics/nonPublished
223

La gastrine et la galectine 1 modifient les propriétés biologiques des ménalomes cutanés / Gastrin and galectin-1 modify the biological properties of cutaneous melanoma

Mathieu, Véronique 04 June 2007 (has links)
Comme nous l’indiquions dans le But du Travail, le mélanome figure parmi les cancers associés aux pronostics les plus sombres, et ce en raison de son taux de réponse très faible à la radiothérapie et à la chimiothérapie. Cette résistance à la radiothérapie et à la chimiothérapie provient essentiellement du fait que les cellules de mélanomes sont résistantes à l’apoptose, et que la radiothérapie ainsi que bon nombre d’agents chimiothérapiques induisent la mort des cellules cancéreuses en y induisant l’apoptose. Nous avons voulu investiguer les rôles de la gastrine et de la galectine 1 sur le comportement biologique des cellules de mélanomes afin de voir s’il était possible de proposer la gastrine et/ou la galectine 1 comme nouvelles cibles thérapeutiques potentielles dans le cas du mélanome. <p>Notre stratégie de recherche est basée sur le principe (démontré sur le plan expérimental par de nombreuses études) selon lequel les cellules cancéreuses migrantes résistent à l’apoptose, et sont dès lors protégées contre les effets pro-apoptotiques de la chimiothérapie et de la radiothérapie qui représentent la quasi totalité de l’arsenal thérapeutique dont disposent les oncologues pour combattre les cancers. Diverses études expérimentales ont démontré que le fait de réduire le taux de migration de cellules cancéreuses résistantes à l’apoptose conférait à celles-ci une sensibilité accrue aux agents pro-apoptotiques. Nos résultats démontrent que la gastrine modifie de manière très significative les propriétés migratoires des cellules de mélanomes, sans toutefois modifier leur sensibilité à des agents pro-apoptotiques. Au contraire, la gastrine protègerait les cellules de mélanomes contre l’apoptose. Nous démontrons également dans notre travail, in vivo, un rôle pro-angiogénique pour la gastrine au sein de xénogreffes de mélanomes humains. Signalons que notre travail est le premier à démontrer un rôle potentiel de la gastrine au niveau de la biologie des mélanomes, tout au moins sur le plan expérimental. <p>Tout comme nous l’avons observé pour la gastrine, la galectine 1 semble également conférer aux cellules de mélanomes un certain degré de résistance aux agressions chimiothérapiques. Cette fois, le fait de diminuer le taux d’expression de la galectine 1 au sein de cellules du mélanome murin expérimental B16F10 (qui exprime des quantités importantes de galectine 1) renforce l’effet thérapeutique du témozolomide qui est une molécule cytotoxique. Cet effet semble survenir, tout au moins partiellement, suite à une diminution du taux d’expression de la protéine Hsp70 (suite à la diminution du taux d’expression de la galectine 1), avec pour conséquence une augmentation de la mort cellulaire par perméabilisation de la membrane des lysosomes.<p>Nous proposons une nouvelle approche thérapeutique pour combattre les mélanomes en faisant appel à la technique des petits ARN interférants (siRNA), dirigés dans le cas présent contre la galectine 1.<p> / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques / info:eu-repo/semantics/nonPublished
224

Comparison of Lectins and their suitability in Lectin Affinity Chromatography for isolation of Glycoproteins

Andersson, Pontus January 2020 (has links)
Virtually all extracellular proteins in humans are glycoproteins and likewise are many biopharmaceuticals. The glycosylation is directly correlated to biological function and stability of these proteins. The ability to isolate glycoproteins is thus of great importance in many applications. The most common isolation method for glycoproteins is affinity chromatography using lectins, a ubiquitous and versatile group of carbohydrate-binding proteins. The lectin Concanavalin A (ConA) has long been used for this purpose but suffers from undesired leakage into the eluate, causing an inquiry of alternative chromatography ligands or optimization of the ConA resin.In this study, a total of 20 different lectins, including ConA, were evaluated and compared in terms of suitability as ligands in affinity chromatography for glycoprotein isolation. The lectins’ binding to glycoproteins were studied, mainly through microtiter plate binding assays using a monoclonal IgG1 antibody and Conalbumin (Ovotransferrin). Further, sugar-specificities and potential eluting sugars for the lectins were examined through inhibition with eight different carbohydrates. Additionally, the glycoprotein binding and leakage of ConA columns were examined, and a potential leakagereducing treatment of ConA resin evaluated.ConA was found to be superior in binding to the investigated glycoproteins but exhibited a limited binding when immobilized to an agarose resin. This discrepancy is likely a consequence of structurally hidden glycans on the used glycoproteins and requirements of long residence time when used in a chromatographic setting. Binding competition with several sugars were investigated with a similar microtiter plate binding assay. This method displayed potential to predict the behaviour of sugars and their suitability as eluting agents in a chromatography column. The best eluting sugar for ConA was showed to be methylmannoside, ideally in combination with methylglucoside. Lastly, evaluation of ConA columns with a crosslinking glutaraldehyde-treatment showed that the ConA ligand leakage may be significantly reduced, although further studies and optimizations are needed.This study thus presents a repertoire of lectins and their differences in terms of glycoprotein-binding and sugar-specificity, as well as evaluations of ConA columns’ efficiency and potential leakage-prevention.
225

Využití průtokové cytometrie pro diagnostiku a charakterizaci dědičných poruch glykosylace / Flow cytometry in the diagnostics and characterization of congenital disorders of glycosylation

Veselá, Šárka January 2021 (has links)
Congenital disorders of glycosylation (CDG) are rare multisystem metabolic diseases and their number has rapidly grown in recent years. The clinical manifestation includes very broad spectrum of symptoms. In most of all cases CDG are caused by mutations in genes encoding the enzymes of glycosylation pathway. Based on the type of defect, CDG are divided into the following groups: disorders of N-glycosylation or O-glycosylation of proteins, defects in modification of proteins by GPI anchor, disorders of lipid glycosylation and defects that impact multiple glycosylation pathways. The aim of the thesis was to find new biochemical analyses suitable for diagnostics and characterization of CDG patients. The experimental conditions were optimized for selected markers (Sambucus Nigra (SNA) lectin, proaerolysin (FLAER), antibodies to proteins CD55 and CD59) and the staining was applied to cultivated skin fibroblasts from controls and patients diagnosed with CDG by whole-exome sequencing (ATP6AP1-CDG, PIGN-CDG, SLC10A7-CDG, PISD deficiency). The experiments were performed using flow cytometry (FACS) and fluorescent microscopy (FM). The detection of sialylation by SNA lectin and analysis of the mitochondrial membrane potential changes by a fluorescent labelled probe JC-1 with FCCP simulation of mitochondrial...
226

Conception, synthèse et étude de modules de reconnaissance multivalents pour des anticorps / Design, synthesis and study of multivalent antibody binding modules

Laigre, Eugénie 18 December 2018 (has links)
En dépit d’importants progrès dans le domaine de la thérapie anti-cancéreuse, les traitements actuels restent controversés, notamment en raison de la quantité importante d'effets secondaires induits. L'immunothérapie ciblée a récemment émergée en tant qu'alternative, afin d'améliorer les modalités de traitement des patients atteints du cancer. Malgré tout, seul un nombre limité d’approches sont aujourd’hui disponibles, et une grande partie des problèmes demeurent actuellement sans solution. C'est dans ce contexte que nous nous sommes intéressés à la conception de structures biomoléculaires innovantes et bifonctionnelles, capables de rediriger des anticorps endogènes, présents naturellement dans la circulation sanguine de l'homme, contre les tumeurs et, ce, sans immunisation préalable. Les anticorps naturels circulant étant polyspécifiques et ayant la capacité d’interagir avec des antigènes glycosylés, nous nous sommes plus particulièrement concentrés sur la conception de glycoconjugués multivalents, ligands d’anticorps endogènes. Une première partie de notre étude a consisté à synthétiser différents glycodendrimères multivalents, reposant sur des châssis peptidiques et obtenus par ligations chimiosélectives, tout en variant la nature du motif glycosylé et des plateformes, ainsi que la valence du conjugué. Puis, dans un second temps, des tests d’interaction par biopuce ont été mis en place avec une lectine modèle, la lectine Helix Pomatia Agglutinin (HPA). Des protocoles expérimentaux visant à calculer des constantes de dissociation de surface, ainsi que des IC50 ont été mis en place, permettant d’identifier de bons ligands de HPA avec des affinités de l’ordre du nanomolaire. Les tests par biopuce ont ensuite été confirmés avec d’autres méthodes d’analyses (BLI, ELLA). Finalement, afin d'identifier des architectures tri-dimensionnelles permettant une affinité optimale avec des anticorps, les tests d’interaction ont été adaptés au criblage de séra humains. Un large panel de glycoconjugués a alors été criblé par biopuce avec une vingtaine de séra, permettant la détermination de structures glycosylés prometteuses, qui pourront par la suite être utilisées dans le cadre de notre approche anti-cancéreuse. / Despite significant progress in anti-cancer therapy, current treatments are still controversial due to numerous side effects. Targeted immunotherapy recently emerged as an ideal alternative to improve treatment modalities for cancer patients. However, very limited approaches are available today and major issues remain to be addressed. In this context, we are interested in the design of biomolecular structures, innovative and bifunctional, able to hijack endogenous antibodies - which are naturally present in the human blood stream - toward cancer cells without pre-immunisation. Since natural circulating antibodies are polyspecific and have the ability to interact with multiple carbohydrate antigens, we focused on the design of multivalent glycodendrimers, as ligands for endogenous antibodies. The first part of our study consisted in synthesizing several multivalent glycoconjugates, based on peptide scaffolds and obtained by chemoselective ligations. To evaluate their influence on antibodies, the nature of both the carbohydrate and the scaffold, and the valency were varied. Then, in a second part of the study, microarray assays were developed with a model lectin, the Helix Pomatia Agglutinin (HPA). Experimental procedures were designed to determine surface dissociation constant and IC50 values, leading to the identification of high affinity ligands for HPA in the nanomolar range. Microarray assays were confirmed by other analytical methods (BLI, ELLA). Finally, the assays on slides were adapted to human sera screening, in order to identify tridimensional architectures highly affine to sera antibodies. A large panel of glycoconjugates were screened by microarray with around twenty sera, leading to the determination of promising glycosylated structures, as antibody ligands. The latter could be subsequently used for our anti-cancer approach.
227

La galectine-1 influence fortement les caractéristiques biologiques des cellules gliales tumorales humaines / Galectin-1 strongly affects the biological caracteristics of human glial tumor cells.

Le Mercier, Marie 20 May 2009 (has links)
Comme décrit dans la partie But du Travail, les tumeurs gliales sont particulièrement agressives d’un point de vue clinique. Le glioblastome, qui correspond au grade de malignité le plus élevé des gliomes, est associé à un pronostic très sombre car aucun patient atteint de ce cancer n’a pu être guéri à ce jour. Ces tumeurs envahissent de manière diffuse (par essaimage de cellules tumorales isolées) le parenchyme cérébral, ce qui empêche une résection chirurgicale complète de la tumeur. De plus, les cellules tumorales gliales d’origine astrocytaire sont souvent résistantes à l’apoptose et donc aux thérapies adjuvantes telles que la chimiothérapie et la radiothérapie. La galectine-1 est une petite protéine intervenant directement dans les processus migratoires des cellules gliales tumorales. Nous avons donc poursuivi la caractérisation des rôles biologiques que pourrait exercer la galectine-1 au sein des gliomes.<p>Nous avons tout d’abord montré que la galectine-1 est impliquée dans la chimiorésistance des gliomes. En effet, nous avons démontré que la diminution du taux d’expression de la galectine-1, au moyen d’un siRNA au sein d’un modèle de gliome expérimental, permet d’augmenter le bénéfice thérapeutique du témozolomide in vivo sans toutefois induire d’apoptose, d’autophagie ou de perméabilisation de la membrane des lysosomes. Nous avons également montré que la diminution du taux d’expression de la galectine-1 au sein de ce modèle de gliome expérimental affecte les processus d’angiogenèse in vivo et de « vasculogenic mimicry » in vitro. Nous avons identifié la protéine ORP150 comme l’une des principales cibles de l’effet pro-angiogénique de la galectine-1, sachant que la protéine ORP150 contrôle la maturation du facteur VEGF. Nous avons ensuite montré que le rôle de la galectine-1 dans la chimiorésistance des gliomes et dans l’angiogenèse est directement lié à l’implication de la galectine-1 dans le processus de réponse au stress du réticulum endoplasmique. Via ce processus, la galectine-1 modulerait l’expression d’un certain nombre de gènes tels que ATF3, DUSP5 et HERP, qui sont impliqués dans la chimiorésistance et des gènes tels que ORP150 et MDG1 qui sont impliqués dans l’angiogenèse. <p>Enfin, nous avons également montré que la galectine-1 régule l’expression du gène BEX2 et que celui-ci joue un rôle important dans la biologie des gliomes, notamment dans les processus d’angiogenèse et de migration cellulaire. <p>En conclusion, notre travail suggère que l’étiquette « biomarqueur » pourrait être attribuée à la galectine-1 pour qualifier l’agressivité biologique des gliomes malins et que la galectine-1 pourrait représenter une nouvelle cible thérapeutique dans le combat contre les gliomes malins en général, et le glioblastome en particulier.<p> / Doctorat en Sciences biomédicales et pharmaceutiques / info:eu-repo/semantics/nonPublished
228

β-Glucan Receptors on IL-4 Activated Macrophages Are Required for Hookworm Larvae Recognition and Trapping

Bouchery, Tiffany, Volpe, Beatrice, Doolan, Rory, Coakley, Gillian, Moyat, Mati, Esser-von Bieren, Julia, Wickramasinghe, Lakshanie C., Hibbs, Margaret L., Sotillo, Javier, Camberis, Mali, Le Gros, Graham, Khan, Nemat, Williams, David L., Harris, Nicola L. 01 April 2022 (has links)
Recent advances in the field of host immunity against parasitic nematodes have revealed the importance of macrophages in trapping tissue migratory larvae. Protective immune mechanisms against the rodent hookworm Nippostrongylus brasiliensis (Nb) are mediated, at least in part, by IL-4-activated macrophages that bind and trap larvae in the lung. However, it is still not clear how host macrophages recognize the parasite. An in vitro co-culture system of bone marrow-derived macrophages and Nb infective larvae was utilized to screen for the possible ligand-receptor pair involved in macrophage attack of larvae. Competitive binding assays revealed an important role for β-glucan recognition in the process. We further identified a role for CD11b and the non-classical pattern recognition receptor ephrin-A2 (EphA2), but not the highly expressed β-glucan dectin-1 receptor, in this process of recognition. This work raises the possibility that parasitic nematodes synthesize β-glucans and it identifies CD11b and ephrin-A2 as important pattern recognition receptors involved in the host recognition of these evolutionary old pathogens. To our knowledge, this is the first time that EphA2 has been implicated in immune responses to a helminth.
229

Profiling Cell Surface Sialylation and Desialylation Dynamics of Immune Cells

Wang, Dan 15 July 2016 (has links)
No description available.
230

Molecular cloning and expression of mannose-binding lectin from Chinese herb, yu chu (Polygonatum odoratum) in rice. / Molecular cloning & expression of mannose-binding lectin from Chinese herb, yu chu (Polygonatum odoratum) in rice

January 2005 (has links)
by Wai Ching Man. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2005. / Includes bibliographical references (leaves 154-159). / Abstracts in English and Chinese. / Statement --- p.ii / Acknowledgements --- p.iii / Abstract --- p.v / 摘要 --- p.vii / List of Abbreviations --- p.viii / Table of contents --- p.x / List of Tables --- p.xiv / List of Figures --- p.xv / Chapter Chapter 1 --- Introduction --- p.1 / Chapter Chapter 2 --- Literature review --- p.4 / Chapter 2.1 --- Plant lectins --- p.4 / Chapter 2.1.1 --- Introduction --- p.4 / Chapter 2.1.2 --- Definition and subdivision of plant lectins --- p.4 / Chapter 2.2 --- Monocot mannose-binding lectins --- p.6 / Chapter 2.2.1 --- Occurrence and carbohydrate binding specificity --- p.6 / Chapter 2.2.2 --- Molecular structure and amino acid sequence --- p.7 / Chapter 2.2.3 --- "Molecular cloning, biosynthesis and post-translational modification" --- p.10 / Chapter 2.2.4 --- Mannose-binding lectins of Family Liliaceae --- p.11 / Chapter 2.2.4.1 --- Tulipa gesneriana lectins (TGL) --- p.12 / Chapter 2.2.4.2 --- Aloe arborescens lectins (AAL) --- p.13 / Chapter 2.2.4.3 --- Polygonatum multiflorum agglutinin (PMA) and lectin-related protein --- p.14 / Chapter 2.3 --- Polygonatum odoratum lectins (POL) --- p.15 / Chapter 2.3.1 --- Isolation and purification of POL from Yu Chu --- p.15 / Chapter 2.3.2 --- Agglutinating activity and anti-viral activities of POL --- p.17 / Chapter 2.3.3 --- Bacterial expression of POL in Escherichia coli --- p.18 / Chapter 2.4 --- Plant-based production of recombinant proteins --- p.20 / Chapter 2.4.1 --- Advantages of using plants as expression system --- p.20 / Chapter 2.4.2 --- Plant-derived recombinant proteins --- p.22 / Chapter 2.5 --- Expression of heterologous proteins in rice --- p.24 / Chapter 2.5.1 --- The facts of rice --- p.24 / Chapter 2.5.2 --- Rice storage proteins --- p.25 / Chapter 2.5.2 --- Expression of lysine-rich protein (LRP)/glutelin fusion proteinin rice seeds --- p.28 / Chapter 2.5.3 --- Expression of Galanthus nivalis agglutinin in rice --- p.29 / Chapter 2.6 --- Protein trafficking in plants --- p.30 / Chapter 2.6.1 --- Golgi-dependent pathways --- p.30 / Chapter 2.6.2 --- Golgi-independent pathway --- p.32 / Chapter 2.6.3 --- Expression of protein targeting determinants in tobacco plants and suspension cells --- p.33 / Chapter Chapter 3 --- Materials and Methods --- p.35 / Chapter 3.1 --- Introduction --- p.35 / Chapter 3.2 --- Chemcials --- p.35 / Chapter 3.3 --- Bacterial strains --- p.35 / Chapter 3.4 --- Cloning of POL cDNA --- p.36 / Chapter 3.4.1 --- Plant materials --- p.36 / Chapter 3.4.2 --- RNA extraction --- p.36 / Chapter 3.4.3 --- RT-PCR amplification of POL cDNA --- p.36 / Chapter 3.4.4 --- 5'RACE and 3'RACE --- p.38 / Chapter 3.4.5 --- Sequencing of POL cDNA --- p.39 / Chapter 3.5 --- Analysis of POL protein --- p.40 / Chapter 3.5.1 --- Protein extraction and Tricine-SDS PAGE --- p.40 / Chapter 3.5.2 --- Western blot analysis --- p.41 / Chapter 3.6 --- Chimeric gene construction --- p.42 / Chapter 3.6.1 --- Construction of the Cauliflower mosaic virus (CaMV)35S promoter/POL constructs --- p.44 / Chapter 3.6.2 --- Construction of the glutelin-1 promoter/POL constructs --- p.48 / Chapter 3.6.3 --- Sequence fidelity of chimeric genes --- p.55 / Chapter 3.7 --- Expression of transgenes in rice --- p.55 / Chapter 3.7.1 --- Plant materials --- p.55 / Chapter 3.7.2 --- Agrobacterium transformation --- p.55 / Chapter 3.7.3 --- Callus induction --- p.56 / Chapter 3.7.4 --- Agrobacterium culture and rice transformation --- p.56 / Chapter 3.7.5 --- Selection and regeneration of rice callus --- p.56 / Chapter 3.7.6 --- Isolation of genomic DNA --- p.58 / Chapter 3.7.7 --- Southern blot analysis --- p.58 / Chapter 3.7.8 --- Extraction of leaf total RNA --- p.59 / Chapter 3.7.9 --- Extraction of seed total RNA --- p.59 / Chapter 3.7.10 --- Northern blot analysis --- p.60 / Chapter 3.7.11 --- Protein extraction and Tricine SDS-PAGE --- p.60 / Chapter 3.7.12 --- Western blot analysis --- p.61 / Chapter 3.8 --- Cytopathic effect (CPE) reduction assay --- p.61 / Chapter 3.8.1 --- Protein extraction --- p.61 / Chapter 3.8.2 --- CPE reduction assay --- p.62 / Chapter 3.9 --- Confocal immunofluorescence --- p.63 / Chapter 3.9.1 --- Preparation of sections --- p.63 / Chapter 3.9.2 --- Labelling of fluorescence probes --- p.63 / Chapter 3.9.3 --- Image collection --- p.64 / Chapter Chapter 4 --- Results --- p.65 / Chapter 4.1 --- Cloning of POL cDNA from Yu Chu --- p.65 / Chapter 4.1.1 --- RNA extraction and partial POL cDNA amplification --- p.65 / Chapter 4.1.2 --- 5'RACE and 3'RACE --- p.67 / Chapter 4.1.3 --- Sequencing of POL cDNA --- p.68 / Chapter 4.1.4 --- Sequences comparison of POL and Liliaceae lectins --- p.75 / Chapter 4.2 --- Occurence of POL protein in Yu Chu plant --- p.77 / Chapter 4.3 --- Constitutional expression of POL in rice --- p.79 / Chapter 4.3.1 --- Construction of Cauliflower mosaic virus 35S promoter constructs --- p.80 / Chapter 4.3.2 --- Southern blot analysis --- p.82 / Chapter 4.3.3 --- Northern blot analysis --- p.84 / Chapter 4.3.4 --- Western blot analysis --- p.85 / Chapter 4.3.5 --- Western blot analysis of 35S/POL T1 plant --- p.87 / Chapter 4.4 --- Seed-specific expression of POL in rice --- p.88 / Chapter 4.4.1 --- Construction of the glutelin-1 promoter constructs --- p.89 / Chapter 4.4.2 --- Southern blot analysis --- p.92 / Chapter 4.4.3 --- Northern blot analysis --- p.96 / Chapter 4.4.4 --- Western blot analysis --- p.101 / Chapter 4.4.5 --- Western blot analysis of POL-BP-8O and POL-α-TIP T1 transgenic plants --- p.117 / Chapter 4.5 --- Cytopathic effect (CPE) reduction assay --- p.122 / Chapter 4.6 --- Confocal immunofluorescence studies --- p.125 / Chapter Chapter 5 --- Discussion --- p.134 / Chapter 5.1 --- Cloning of POL cDNA --- p.134 / Chapter 5.2 --- Analysis of constitutional expression of POL in rice --- p.136 / Chapter 5.3 --- Analysis of seed-specific expression of POL in rice --- p.138 / Chapter 5.4 --- Localization of POL in POL-BP-8O and POL-α-TIP transgenic rice seeds --- p.146 / Chapter 5.5 --- Cytopathic effect (CPE) reduction assay --- p.148 / Chapter 5.6 --- Future prospects --- p.151 / Chapter Chapter 6 --- Conclusion --- p.153

Page generated in 0.049 seconds