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Desenvolvimento e caracterização de microssatélites, mapeamento genético e identificação de QTL para tempo de cocção em Phaseolus vulgaris / Development and characterization of SSR, genetic mapping and QTL indetification of Cooking time in Phaseolus vulgarisGarcia , Robertha Augusta Vasconcelos 27 February 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-02-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / From the 50 described species of the Phaseolus genera, Phaseolus vulgaris (common bean) is the most cultivated in the world and occupies 85% of the total production area. Brazil has an outstanding position in the world scenario and is considered the main grower, contributing with 17.58% of total production in an area estimated in 4.01 million hectares. Among grain legumes, common bean is the most important for direct human consumption, representing an important source of protein, amino-acids and minerals in the diet of Brazilian population. Breeding programs have searched for ways to increase productivity and simultaneously enhance its nutritional value and decrease the cooking time. The demand on the use of molecular tools has increased in the past few years, aiming to generate information that can be used in genetic breeding programs. This work presents two studies that were conducted from the development of a set of microsatellite markers derived from expressed sequences and genomic libraries. In the first study EST-SSR markers developed with a set of genomic SSR were evaluated for their amplification quality, transferability, genic information content and polymorphism in the Bat 93 x Jalo EEP558 population study. A total of markers 377 EST-SRR were developed, from which 80% showed PCR amplification products. For the transferability analysis 65 EST-SSR and an additional set of 102 genomic SSR were selected, from which 82% were transferred to, at least, one of the 10 legume species evaluated, where the higher amplification rate was observed between species from the Phaseolus genera (63.67%) and the lower was observed for the Arachis (1.8%). In the characterization of 167 SSR, 72% were polymorphic and the mean estimated PIC varied from 0.53 for genomic SSR to 0.47 to EST-SSR. The analysis of polymorphism in the BJ population revealed that from the 315 markers (302 EST - SSR and 13 genomic), 24% were polymorphic and incorporated to the common bean reference map, totalizing 180 mapped loci with a total map distance of 1154.63cM. The second study presents the construction of a genetic map using a population derived from the cross CNFM 7875 x Laranja, where 132 families were obtained and evaluated in three generations, three locations and four experiments where the genotypic data were obtained. A set of 1,034 SSR loci were tested for polymorphism and 105 (10%) were polymorphic and 93 were mapped on 12 linkage groups with a total map length of 1,369.9cM. The analysis of the phenotypic data indicated that the families show great variability for cooking time. The coefficients of heritability between the means varied between 42.89% and 62.85%. QTL mapping was performed using composite interval mapping and eight regions were associated to the control of this trait, varying from 2 to 4 QTL in generations F2:3 e F2:5, respectively. Significant interactions were observed between QTL and locations, but one QTL was stable between generations conducted in the same environment. The proportion of the phenotypic variation explained by the QTL varied from 3.35% to 21.77%. / Das 50 espécies do gênero Phaseolus descritas, a espécie Phaseolus vulgaris (feijoeiro comum) é a mais cultivada no mundo, ocupando 85% da área total de produção. O Brasil ocupa posição de destaque, sendo o maior produtor mundial, contribuindo com 17,58% da produção total, com área de cultivo estimada em 4,01 milhões de ha. Dentre os legumes de grãos, o feijoeiro comum é o mais importante para o consumo direto humano em todos os continentes, representando uma importante fonte de proteínas, aminoácidos e minerais na dieta alimentar da população brasileira. Programas de melhoramento têm buscado meios de aumentar a produtividade de grãos, aliado a um incremento no valor nutricional e ao atendimento às exigências do consumidor, como a maior facilidade no preparo do alimento. A demanda pelo uso de ferramentas moleculares tem aumentado nos últimos anos visando gerar informações que possam ser agregadas aos programas de melhoramento genético. Esse trabalho apresenta o desenvolvimento de dois estudos que foram conduzidos a partir do desenvolvimento de uma bateria de marcadores microssatélites derivados de seqüências expressas e bibliotecas genômicas. No primeiro estudo, os marcadores EST-SSR desenvolvidos, juntamente com um conjunto de SSRs genômicos, foram avaliados quanto à capacidade de amplificação, transferibilidade, conteúdo de informação gênica e polimorfismo na população Bat 93 x Jalo EEP558 (BJ) para fins de mapeamento. Foram sintetizados 377 EST-SSR, dos quais 80% amplificaram produto de PCR. Para a análise de transferibilidade, foram selecionados 65 EST-SSR e um conjunto adicional de 102 SSR genômicos, dos quais 82% foram transferíveis para, pelo menos, uma das 10 espécies de leguminosas avaliadas, onde o maior índice de amplificação foi observado entre as espécies do gênero Phaseolus (63,67%) e o menor para Arachis (1,8%). Na análise de caracterização dos 167 SSR, 72% foram polimórficos e as estimativas de PIC médio variaram de 0,53 para os SSRs genômicos a 0,47 para os EST-SSR. Quanto ao polimorfismo na população BJ, dos 315 testados (302 EST-SSR e 13 genômicos), 24% foram polimórficos e integrados no mapa de referência da cultura do feijoeiro comum, totalizando 180 locos mapeados, compreendendo uma distância total de mapa de 1154,63 cM. O segundo trabalho apresenta a construção de um mapa genético utilizando uma população derivada do cruzamento CNFM7875 x Laranja, onde foram geradas 132 famílias que foram avaliadas em três gerações e em quatro ambientes dos quais foram obtidos os dados fenotípicos. Uma bateria de 1.034 locos SSR foram avaliados quanto ao polimorfismo, onde apenas 105 (10%) segregaram e 93 foram mapeados em 12 grupos de ligação, com uma extensão final de mapa de 1.369,9 cM. A análise dos dados fenotípicos indicou que as famílias são amplamente variáveis para o tempo de cocção, apresentando coeficientes de herdabilidade no sentido amplo, que variaram de 42,89% a 62,85%. O mapeamento de QTL, utilizando o método de intervalo composto, identificou oito regiões associadas ao controle dessa característica, variando de 2 a 4 QTL na gerações F2:3 e F2:5. Foram observadas interações significativas entre QTL por locais. Porém, foi identificado um (1) QTL estável entre gerações conduzidas em um mesmo ambientes. A proporção da variação fenotípica explicada pelos QTL detectados variou de 3,35% até 21,77%.
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Marcadores SSR e STS ligados ao gene Co-4 que controla a reação à antracnose do feijoeiro comum / SSR and STS markers linked to Co-4 gene that controls reactions to anthracnose of common beanMota, Ana Paula Simplício 28 October 2015 (has links)
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Previous issue date: 2015-10-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The aim of this study was to validate molecular markers specifically associated with alleles of
the Co-4 gene that controls the reaction to anthracnose of common bean, in particular the Co-
42 allele, and foment the integration of these markers in breeding programs aimed at
developing resistant cultivars. For this, we evaluated 261 individuals F2 and 197 F2:3 progenies
coming from crosses between SEL 1308 (carrier of Co-42 allele) and BRS Cometa. The studies
confirm that the inheritance of reaction to anthracnose in SEL1308, using race 73 of
Colletotrichum lindemuthianum, it is conditioned by an allele with complete dominance. In all,
15 markers were analyzed, ten STS (Sequence-Tagged Sites) and two SSR (Simple Sequence
Repeat), recently identified by the Embrapa research group, and three SCAR (Sequence
Characterized Amplified Regions) previously reported in the literature. Of these, 13 were
polymorphic between the parents and segregated in the expected proportions to generations
analyzed (3:1 or 1:2:1). Among the markers linked in repulsion phase, six STS (P8283-V1,
P8284 -V1, P8285-V2, P8286-V1, P8286-V2 and P8286-V3) co-segregated at a distance of
2,64 cM from the allele Co-42 and 0,0 cM apart. As regards the SCAR markers, it was found
that all are linked in coupling phase of the Co-42 allele at distances ranging from 2,93 cM
(SAS13) at 6,42 cM (SH18). Of codominant markers, the STS P8286-V6 was mapped closest
to Co-42 allele at a distance of 2,58 cM. Thus, the STS tested are excellent tools markers for
assisted selection of genotypes resistant to anthracnose, since that present the highest
selection efficiency estimates (84 - 99%) and the detection of plants carriers of different
alleles of the Co-4 gene. However, only the SCAR SH18 possible the specific breakdown of Co-
42 allele, despite having less selection efficiency (85%) compared to the other analyzed
markers. Therefore, it is recommend the combined or sequential use of P8286-V6 and SH18
markers for Co-42 selection at the expense of other alleles of the Co-4 gene. As for the
selection of resistant genotypes in populations in which only the Co-42 allele is present, it is
suggested to use only the P8286-V6 marker, which stands out for being codominant and
strongly associated with the resistance allele. From a practical standpoint, the molecular
markers validated in this study have shown great potential for use in the development of
common bean cultivars resistant to anthracnose, being affordable to laboratories with
different levels of infrastructure and highly efficient in monitoring genotypes carriers of
resistance alleles of the loco Co-4. / O objetivo desse estudo foi validar marcadores moleculares especificamente associados aos
alelos do gene Co-4 que controla a reação à antracnose do feijoeiro-comum, em particular ao
alelo Co-42, e fomentar a integração destes marcadores a programas de melhoramento
visando ao desenvolvimento de cultivares resistentes. Para isso, foram avaliados 261
indivíduos F2 e 197 progênies F2:3, provenientes de cruzamentos entre SEL 1308 (portadora
do alelo Co-42) e BRS Cometa. Os estudos confirmaram que a herança da reação à antracnose
em SEL 1308, usando a raça 73 de Colletotrichum lindemuthianum, é condicionada por um
alelo com dominância completa. Ao todo, foram analisados 15 marcadores, sendo dez
Sequence-Tagged Sites (Sítios Marcados por Sequências) e duas Simple Sequence Repeat
(Sequências simples repetidas), identificadas recentemente pelo grupo de pesquisa da
Embrapa, e três Sequence Characterized Amplified Regions (Regiões Amplificadas
Caracterizadas por Sequências) previamente relatados na literatura. Destes, 13 foram
polimórficos entre os genitores e segregaram nas proporções esperadas para as gerações
analisadas (3:1 ou 1:2:1). Dentre os marcadores ligados em fase de repulsão, seis STS
(P8283-V1, P8284-V1, P8285-V2, P8286-V1, P8286-V2 e P8286-V3) co-segregaram a uma
distância de 2,64 cM do alelo Co-42 e a 0,0 cM entre si. No que se refere aos marcadores
SCAR, constatou-se que todos estão ligados em fase de acoplamento ao alelo Co-42, a
distâncias que variaram de 2,93 cM (SAS13) a 6,42 cM (SH18). Dos marcadores
codominantes, o STS P8286-V6 foi mapeado como mais próximo do alelo Co-42, a uma
distância de 2,58 cM. Dessa forma, os marcadores STS testados constituem excelentes
ferramentas para a seleção assistida de genótipos resistentes à antracnose, visto que
apresentaram as maiores estimativas de eficiência de seleção (84 a 99%) e a detecção de
plantas portadoras dos diferentes alelos do gene Co-4. Contudo, somente o SCAR SH18
possibilitou a discriminação específica do alelo Co-42, apesar de apresentar menor eficiência
de seleção (85%) em comparação aos demais marcadores analisados. Diante disso,
recomenda-se a utilização combinada ou sequencial dos marcadores P8286-V6 e SH18 para
seleção do Co-42 em detrimento dos demais alelos do gene Co-4. Já para a seleção de
genótipos resistentes em populações nas quais somente o alelo Co-42 está presente, sugerese
a utilização apenas do marcador P8286-V6, que se destaca por ser codominante e
fortemente associado ao alelo de resistência. Do ponto de vista prático, os marcadores
moleculares validados neste estudo demonstraram grande potencial para utilização no
desenvolvimento de cultivares feijoeiro-comum resistentes à antracnose, por serem acessíveis
a laboratórios com diferentes níveis de infraestrutura e altamente eficientes no
monitoramento de genótipos portadores de alelos de resistência para o loco Co-4.
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Investigação genética de duas diferentes famílias com formas dominantes de distrofia muscular do tipo cinturas / Genetic investigation of two different families with dominant forms of limb-girdle muscular dystrophyLuciana de Castro Paixão Licinio 02 August 2011 (has links)
As distrofias musculares tipo cinturas (DMC) incluem um grupo heterogêneo de doenças genéticas, caracterizadas por degeneração progressiva da musculatura esquelética pélvica e escapular, cuja herança pode ser autossômica dominante (DMC1) ou autossômica recessiva (DMC2). As formas dominantes são relativamente raras, compreendendo menos que 10% dos casos. Até o momento foram mapeados 8 locos para DMC1, (DMC1A-H), onde 3 genes já foram identificados (DMC1A-C) e 17 locos para DMC2 (DMC2A-Q), onde 16 genes já foram identificados. No presente estudo, identificamos uma família uruguaia (família 1) com 11 indivíduos afetados por DMC, distribuídos em 3 gerações, com um padrão de herança autossômico dominante. Os objetivos desse trabalho foram: mapear e refinar o loco gênico associado a uma manifestação familiar de DMC1, verificar se há co-localização da região mapeada com outras formas de DMC1 descritas na literatura e, apontar genes candidatos na região mapeada e triar mutações. Foi realizado estudo de ligação, no qual mapeou-se o loco para essa doença na região 4q13-q24 com Lod score de valor máximo 4.78 para o marcador D4S414. A região foi delimitada entre os marcadores D4S392 e D4S1572. A análise da região redefiniu o loco em 4q21.22-21.23, com uma redução de 33 Mb para 4Mb. Esse loco compreende a DMC1G (família 2), descrita anteriormente pelo nosso grupo. A triagem de mutação, realizada em amostras de afetados das duas famílias, nos permitiu encontrar uma alteração Thr141Iso no exon 5 do gene FAM175A apenas nos pacientes da família 2. Essa mesma alteração foi encontrada em 1 dos 500 controles testados, o que não nos permite excluir esse gene como um candidato para DMC1G já vez que essa frequência foi inferior a 1%. O fato dessa alteração não ter sido vista na família 1 também não nos permite excluí-lo, pois foi sequenciada apenas a região exônica e a metodologia utilizada também não nos permite verificar deleções nem duplicações. Estudos mais detalhados precisam ser realizados a fim de elucidar: (1) se a alteração desse gene é a causadora dessas DMCs ou, (2) se excluído esse gene, poderia ser o responsável. / Limb girdle muscular dystrophy (LGMD) include a heterogeneous group of genetic diseases characterized by progressive degeneration of skeletal muscles of the pelvic and scapular girdles, whose inheritance may be autosomal dominant (LGMD1) or autosomal recessive (LGMD2). The dominant forms are relatively rare, comprising less than 10% of cases. So far eight loci were mapped for LGMD1 (LGMD1A-H), where three genes have been identified (LGMD1A-C) and 17 loci for LGMD2 (LGMD2A-Q), with 16 identified genes. In this study, we analised a family from Uruguay (family 1) with 12 individuals affected by LGMD, with an autosomal dominant pattern distributed in three generations. The objectives of this study were: to map and refine the gene locus associated with a familial DMC1, check for co-location of the mapped region to other forms of DMC1 described in the literature and, to point candidate genes mapped in the region and to screen mutations. A linkage study was conducted, and we mapped the locus for this disease in the region 4q13-q24 with a maximum Lod score of 4.78 for marker D4S414. The region was defined between markers D4S392 and D4S1572. The analysis of the region has redefined the locus to 4q21.22-in 21:23, a reduction from 33 Mb to 4 Mb. This site includes LGMD1G (family 2), previously described by our group. Mutation screening, performed on samples of affected pacients from both families, allowed us to find a modification Thr141Iso in exon 5 on FAM175A gene only in patients of family 2. This same alteration was found in one of the 500 controls tested but does not allow us to exclude this gene as a candidate for LGMD1G since that frequency was less than 1%. The fact that this change was not seen in a family 1 does not allow us to exclude it either because only the exonic region was sequenced and the methodology used does not allow us to detect deletions or duplications. More detailed studies should be conducted to elucidate: (1) whether the alteration found in this gene is the cause of these DMCs, or (2) if not this gene, which could be the one responsible.
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Secreção de vasopressina e ocitocina após estímulo osmótico e hipovolêmico em animais sobreviventes à sepse / Vasopressin and oxytocin secretion after osmotic and hypovolemic stimuli in sepsis surviving animalsLucas Favaretto Tazinafo 14 November 2014 (has links)
Vários estudos clínicos e experimentais relatam o aumento das concentrações plasmáticas de vasopressina (AVP) na fase inicial da sepse, como tentativa de restabelecer a pressão sanguínea que nesta fase começa a diminuir. Porém em uma fase mais tardia da doença, as concentrações do hormônio estão reduzidas mesmo sob um quadro de hipotensão progressiva, um dos principais estímulos para aumento da secreção deste hormônio. Este padrão de secreção hormonal alterada também parece ocorrer com o outro hormônio neurohipofisário, ocitocina (OT). O objetivo deste trabalho foi analisar a secreção dos hormônios AVP e OT, após estímulos osmótico e hipovolêmico em animais sobreviventes à sepse. A sepse foi induzida pelo método de ligação cecal e punção (CLP) (1 perfuração com agulha 14G) e os animais observados por 10 dias. Os sobreviventes foram submetidos à estímulo osmótico por desidratação (retirada de água para beber da gaiola) por dois dias, ou hipovolêmico por injeção intraperitoneal (i.p) de Polietileno glicol (PEG) (PEG-4000, 200mg/ml de PBS) por 90 minutos. Os animais controles foram hidratados ou receberam injeção intraperitoneal de PBS 0,01M. Após os estímulos, os animais foram decapitados para coleta de sangue e neurohipófise, para as análises de hematócrito, sódio sérico, osmolalidade plasmática, e dosagem hormonal de AVP e OT plasmática e neurohipofisária. Resultados: Os animais sobreviventes à sepse mantiveram a capacidade de responder aos estímulos com relação à secreção de AVP. Porém estes animais apresentaram uma secreção diminuída de OT após desidratação embora nenhuma alteração de secreção aparente ao estímulo volêmico. Conclusão: Animais sobreviventes à sepse apresentam alterações no padrão de resposta hormonal do eixo hipotálamoneurohipofisário ao estímulo osmótico sem aparente alteração quando o estímulo é volêmico, sugerindo que seus osmorreceptores encontram-se alterados / Many clinical and experimental studies reported the increase of plasma vasopressin (AVP) concentration in the early phase of sepsis, as an attempt to restore blood pressure that begins to decrease at this stage. However, in a later stage of the disease, the hormone concentrations are reduced even under a state of progressive hypotension, one of the major stimulus for the increase of secretion of this hormone. This pattern of impaired hormonal secretion during sepsis also seems to happen to the other pituitary hormone, oxytocin (OT). The aim of this study was to evaluate the secretion of the hormones AVP and OT after osmotic and hipovolemic stimuli in sepsis surviving animals. Sepsis was induced by cecal ligation and perforation (CLP) (1 perforation with 14G needle) and the animals observed for 10 days. The survivors were submited to osmotic stimulus by dehydration (privation of drinking water from the Cage) for two days, or hipovolemic by intraperitoneal (i.p) injection of polyethylene glycol (PEG) (PEG-4000, 200mg/ml of PBS) for 90 minutes. The control animals were hydrated or that received intraperitoneal injection of PBS 0,01M. After the stimuli, the animals were decapitated for the collection of blood and neurohypophysis, for the analysis of hematocrit, serum sodium, plasma osmolality and hormonal analysis of AVP and OT in the plasma and neurohypophysis. Results: Sepsis surviving animals maintained the capacity of answering the stimulus with AVP secretion. But these animals presented a lowered secretion of OT after dehydration, while they presented no alterations in secretion after volemic stimulus. Conclusion: Sepsis surviving animals presented alterations in the pattern of hormonal answer for the osmotic stimulus, with lowered secretion of OT, apparently there are no alterations in the pattern of a hormonal secretion after hypovolemia.
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Efeitos da especificação incorreta da função de ligação no modelo de regressão beta / The impact of misspecification of the link function in beta regressionAugusto Cesar Giovanetti de Andrade 09 August 2007 (has links)
O ajuste de modelos de regressão beta requer a especificação de uma função de ligação. Algumas funções de ligação úteis são: logito, probito, complemento log-log e log-log. Usualmente, a ligação logito é utilizada pois permite interpretação simples para os parâmetros de regressão. O principal objetivo deste trabalho é avaliar o impacto da especificação incorreta da função de ligação em regressão beta. Estudos de simulação serão usados com esse prop´osito. Amostras da variável resposta serão geradas assumindo uma função de ligação conhecida (verdadeira) e o modelo de regressão beta será ajustado usando a função de ligação verdadeira (correta) e algumas funções de ligação incorretas. Resultados numéricos serão comparados para avaliar o efeito da especificação incorreta da função de ligação sobre as inferências em regressão beta. Adicionalmente, será introduzido um modelo de regressão beta com função de ligação de Aranda-Ordaz, a qual depende de um parâmetro que pode ser estimado através dos dados. / Fitting beta regression models requires the specification of the link function. Some useful link functions for beta regression are: logit, probit, complementary log-log and log-log. Usually, the logit link is used since it allows easy interpretation for the regression parameters. The main objective of this work is to evaluate the impact of misspecification of the link function in beta regression. Simulation studies will be used for this purpose. Samples of the response variable will be generated assuming a known (true) link function, and the beta regression will be fitted using the true (correct) link and some incorrect link functions. Numerical results will be compared to evaluate the effect of misspecification of the link function on inference in beta regression. Also, we will introduce a beta regression model with Aranda-Ordaz link function, which depends on an unknown parameter that can be estimated through the data.
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Comportamento de juntas de argamassa solicitadas à compressão na ligação entre elementos pré-moldados / Compression mortar joints behavior at the precast elements connectionAline da Silva Ramos Barboza 28 February 2002 (has links)
Este trabalho apresenta uma análise teórico-experimental do comportamento de juntas de argamassa solicitadas à compressão, usando para preenchimento da junta materiais comercialmente disponíveis e almofada de apoio de argamassa flexível, com o objetivo de propor recomendações de projeto que caracterizem a deformabilidade e a resistência da junta, visando um melhor aproveitamento da capacidade resistente do sistema pré-moldado. Inicialmente foi feito um levantamento bibliográfico sobre os principais parâmetros que influenciam o comportamento da junta e, posteriormente, foram realizadas algumas simulações numéricas utilizando-se o programa ANSYS 5.5.1. Em seguida, desenvolveu-se um programa experimental cujas variáveis foram: a espessura da camada de argamassa, a resistência do elemento pré-moldado e da argamassa, o material de preenchimento da junta, a presença de armadura de reforço na região adjacente à ligação e a rugosidade na superfície do elemento. Os resultados obtidos mostraram que a espessura de 20mm seria a mais indicada, pois, além de minimizar o efeito de descontinuidade provocado pela presença da junta, melhora o controle da uniformidade da espessura e o aparecimento de vazios. Observou-se também que o uso de concreto de alta resistência no elemento pré-moldado faz com que as tensões de fendilhamento tenham maior importância. Para um maior aproveitamento da capacidade resistente do sistema, o material de preenchimento também deve ser de alta resistência. Dos diversos materiais usados para o preenchimento da junta, a argamassa do tipo Dry Pack foi a que ofereceu melhores condições de execução. Além de proporcionar total aproveitamento da capacidade resistente do sistema, diminuiu a deformabilidade da junta e, conseqüentemente, a fissuração / In this thesis a theoretical-experimental analysis of the compression mortar joints behavior is presented. The joints were produced with commercially available materials and flexible support cushion. The purpose of this research was to obtain design recommendations that characterize the deformability and the strength of the joints, in order to have a better use of the precast system bearing capacity. Previous studies of this problem showed the main parameters related to the joint behavior and numerical simulations were carried out using ANSYS 5.5.1. An experimental program was developed considering as variables the thickness of the mortar layer, the strength of the precast concrete element and of the mortar, the joint material, the additional reinforcement in the connection area and the roughness of the element surface. The results showed that a 20mm thickness is most suitable, because besides minimizing the discontinuity effects, it improves the control of the uniformity of the thickness as well as the air retained in the joint. It was also observed that using high strength concrete precast elements the splitting stresses becomes more important. For a larger use of the bearing capacity of the system, the joint material should also be of high strength. The use of a "Dry Pack" mortar offered better execution conditions, improving the bearing capacity of the system, with less deformability as well as cracking
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Caracterização por linhagens, mapeamento por associação e controle genético para resistência às doenças foliares em milho no Oeste do ParanáKaefer, Kaian Albino Corazza 21 February 2017 (has links)
Submitted by Helena Bejio (helena.bejio@unioeste.br) on 2017-11-23T18:28:14Z
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Previous issue date: 2017-02-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The work aimed to characterize common corn strains for resistance to main leaf diseases and to suggest crosses based on the genetic diversity detected in SNP markers, besides to identify genomic regions and to study of control involved in the resistance of white leaf spot (WLS) and northern leaf blight (NLB). For genetic diversity, the 72 maize lines were genotyped with SNP markers using the 650K Platform (Affymetrix®) and quantified using the Tocher and UPGMA methods. For the characterization, the experiment was conducted in a randomized complete block design with three repetitions. The genotypic values of the main diseases were predicted using by the procedure of REML / BLUP. For association mapping, 72 maize lines genotyped for SNP markers were associated with genotypic values of WLS and NLB. For the study of genetic control, the experiment was conducted in the agricultural year 2016 and it was composed of a randomized block design with three replications, being estimates based on the analysis of the variances of the segregating and nonsegregating generations. According to the results, the existence of genetic variability was detected among maize lines and this way, with the data of the distances through the molecular markers, it is possible to orient the crosses accurately, aiming at genetically resistant genotypes to the foliar diseases. The use of association mapping may be an efficient strategy in the selection of WLS and NLB resistant genotypes, without the need for crosses. With genetic control studies, inheritances of the quantitative type allied with the high restricted heritabilities of WLS and NLB, allow good selection efficiency and satisfactory selection gains. / Os objetivos do trabalho foram caracterizar linhagens de milho comum para resistência às principais doenças foliares e sugerir cruzamentos com base na diversidade genética detectada em marcadores SNP, além de mapear regiões genômicas e estudar o controle genético envolvido nas resistências à mancha branca (MB) e à helmintosporiose (HT). Para a caracterização das 72 linhagens, o experimento foi conduzido no delineamento em blocos casualizados com três repetições. Os valores genotípicos para às principais doenças foram preditos empregando-se o procedimento REML/BLUP. Para a diversidade genética, as 72 linhagens foram genotipadas com marcadores SNP empregando-se a Plataforma 650K (Affymetrix®), sendo quantificada utilizando-se os métodos de Tocher e UPGMA. Para o mapeamento por associação, as 72 linhagens genotipadas com marcadores SNP foram associados aos valores genotípicos da MB e HT, utilizando o modelo linear misto (MLM). Para o estudo do controle genético, o experimento foi conduzido no ano de 2016 e foi composto por blocos casualizados com três repetições, sendo as estimativas genotípicas baseadas na análise das variâncias das gerações segregantes e não segregantes. De acordo com os resultados, detectou-se a existência de variabilidade genética entre as linhagens de milho e deste modo, com os dados das distâncias por meio dos marcadores moleculares é possível orientar com maior precisão os cruzamentos, visando obter genótipos mais resistentes às principais doenças foliares. O emprego do mapeamento por associação pode ser uma estratégia eficiente na seleção de genótipos resistentes à MB e à HT, sem a necessidade de cruzamentos. Com os estudos de controle genético, heranças do tipo quantitativa aliadas com as altas herdabilidades restritas de MB e HT, permitem boa eficiência na seleção e ganhos de seleção satisfatórios.
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\"Transferência de carga e ligação de hidrogênio intramolecular em derivados de 9-aminoacridina\" / \"Intramolecular charge and hydrogen bon transfer in 9-aminoacridine derivatives\"Robson Valentim Pereira 25 August 2006 (has links)
Neste trabalho, o corante 9-aminoacridina foi derivatizado com compostos vinílicos que possuem grupos retiradores de elétrons. A incorporação destes leva à mudanças nas propriedades fotofísicas dos derivados, tais como deslocamentos para regiões de menor energia nos espectros de absorção e emissão, sugerindo a presença de transferência de carga intramolecular (ICT). Os estudos de fluorescência resolvida no tempo confirmam este processo para os derivados. Este estado ICT possui um tempo formação na faixa de 150 300 ps e um tempo de vida entre 1 3 ns, que depende do solvente. Os derivados que apresentam pelo menos um grupo carbonila como retirador de elétron, possuem um tempo de vida longo na faixa de 8 10 ns, atribuído à emissão do enol, formado a partir da conjugação estendida por ponte de hidrogênio. A polimerização destes derivados com o ácido metacrílico promoveram mudanças em suas propriedades fotofísicas estacionárias e resolvidas no tempo devido à quebra da conjugação  estendida. Este fato é ilustrado pelos espectros de absorção e emissão que mostram bandas estruturadas, deslocadas para a região de maior energia e um decaimento monoexponencial, semelhante ao observado com 9-aminoacridina. Anisotropia de fluorescência resolvida no tempo mostra que nos copolímeros o tempo de relaxação rotacional do corante é muito sensível à mudança conformacional do poli (ácido metacrílico) com o pH, possibilitando assim o estudo da dinâmica deste polímero em solução aquosa. / In this work, the dye 9-aminoacridine was derivatized with vinylic compounds containing electron withdrawing groups. The incorporation of these groups leads to changes in the photophysical properties of the dye, such a red shift in the absorption and emission spectra, suggesting the presence of intramolecular charge transfer (ICT) effect. Time-resolved studies have confirmed such process in all derivatives. This ICT state has a risetime in the range 150 300 ps and a fluorescence lifetime between 1 3 ns, that depends of the solvent. The derivatives with at least one carbonyl group as electron withdrawing, have an additional lifetime in the range of 8 10 ns, attributed to the enol emission formed by the extended conjugation. The polimerization of these derivatives with methacrylic acid induces changes in the stationary and time-resolved properties of the dye due to the breaking of the extended conjugation. This fact is illustrated by the absorption and emission spectra that show structured bands with a blue shift, and a monoexponencial decay, similar to the behavior of 9- aminoacridine. Time-resolved fluorescence anisotropy of the bound dye shows that the copolymers have a segment relaxation of the chain is very sensitive to the change in the conformational shape of poly (methacrylic acid) with pH, and such a process is well indicated by following the rotational relaxation of the dye.
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Estudo teórico de propriedades químicas de sistemas hetero-macrocíclos que complexam metais de transição divalentes da primeira e segunda filas / Theoretical study of chemistry proprieties of the hetero-macrocycle systems that complex bivalentes transition metals of the first and second-rowFrancisco das Chagas Alves Lima 06 May 2008 (has links)
Um estudo teórico detalhado das estruturas e energias do ligante 1, 7, 11, 17-tetraoxa-2, 6, 12, 16-trazaocicloocsano ([20]aneN4O4) coordenado com íons metálicos de transição Fe2+, Co2+, Ni2+, Ru2+, Rh2+ e Pd2+ foi realizado em nível de teoria B3LYP/Lanl2DZ. As geometrias dos complexos foram totalmente otimizados em simetria Cs com os íons metálicos coordenados com quatro átomos de nitrogênio (complexos 1a e 1aq) ou quatro átomos de oxigênios (complexos 1b e 1bq) e duas moléculas de água. Os arranjos octaédricos (1a e 1b) e quadrado-planares (1aq e 1bq) foram consideremos neste trabalho. A estrutura teórica está em excelente acordo com a estrutura de difração de raio-x experimental determinada para o complexo octaédrico de Ni2+ de [20]AneN4O4. Os cátions M2+ ligam-se preferencialmente aos átomos de nitrogênios com energia de ligação que aumenta na ordem Fe2+ < Ru2+ < Co2+ < Ni2+ < Rh2+ < Pd2+. Para os metais de transição da primeira fila, os complexos de spin alto são mais estáveis que os complexos de spin baixo. Em contraste, para os metais de transição da segunda fila, os estados de spin baixo mostraram-se mais estáveis que os estados de spin alto. As ligações metal-ligante nos complexos foram analisadas em termo das interações covalentes e iônicas e ajudaram a entender porque os complexos (1a e 1aq) são mais estáveis que os complexos (1b e 1bq). Os complexos poliaminas [20]aneN4 e poliéteres [20]aneO4 foram obtidos substituindo os átomos de nitrogênio e oxigênio da posição alfa dos macrociclos [20]aneN4O4 e [20]aneO4N4, respectivamente. O macrociclo [20]aneO4 tem preferência em complexar íons metálicos da primeira fila, enquanto o macrociclo [20]aneN4 prefere complexar os íons metálicos da segunda fila. / A detailed theoretical study of structures and energies of the 1,7,1l,17-tetraoxa-2,6,12,16-tetraaza-cycloeicosane ligand ([20]AneN4O4) coordinated to Fe2+, Co2+, Ni2+, Ru2+, Rh2+ and Pd2+ transition metals ions was carried out with the B3LYP/Lanl2DZ method. The geometries of the complexes were fully optimized in Cs symmetry with the metal ions coordinated either to four atoms nitrogen (complexes 1a e 1b) or to the four atoms oxygen (complexes 1aq e 1bq). The octahedral and square planar arrangements were considered in this work. The theoretical structure is in excellent agreement with the experimental X-ray diffraction structure determination for the [20]AneN4O4 octahedral Ni2+ complex. The M2+ cations bind preferentially to the nitrogen atoms with binding energies that increase in the order Fe2+ < Ru2+ < Co2+ < Ni2+ < Rh2+ < Pd2+. For the first-row transition metals, the highspin complexes are more stable than the low-spin complexes. In contrast, for the second-row of transition metals, the low-spin states were found more stable than the high spin states. The metal-ligand bonds in the complexes were analyzed in terms of the covalent and ionic interactions and helped to understand why complexes (1a e 1aq) are more stable than complexes (1b e 1bq). The polyamines [20]aneN4 and polyethers [20]aneO4 complexes were obtained substituting the atoms N or O of the alfa position of the macrocycles [20]aneN4O4 and [20]aneO4N4, respectively. The macrocycle [20]aneO4 prefers to complex first-row transition metals; however, the macrocycle [20]aneN4 prefers to complex second-row transition metals.
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Concretos e pastas de elevado desempenho: contribuição aos estudos de reparos estruturais e ligações entre concretos novo e velho, com tratamento da zona de interface. / High-performance concrete and pastes: contribution to the studies of structural repairs and new-to-old concretes bonding, with interfacial zone treatment.Samir Costa Fagury 28 March 2002 (has links)
A ligação entre concretos com cimento Portland de diferentes idades, composições e resistências é um dos problemas da tecnologia dos concretos estruturais. A continuidade desta ligação é prejudicada por uma diversidade de fatores que implicam desde a retomada de uma concretagem (junta fria) até a recuperação de estruturas de concreto deterioradas. Sob esse ponto de vista apresenta−se neste trabalho uma análise do comportamento de um sistema de reparos aplicados à recuperação de estruturas, ligações concretos velhos x concretos novos (caso das ampliações) e continuidades de concretagens. Um dos pontos mais frágeis de uma estrutura é a zona de interface, tanto dos materiais que a compõe quanto da transição entre os diferentes concretos. Utilizou−se como substrato corpos−de−prova prismáticos executados com concretos (fck=15MPa, 18MPa, 21MPa, 25MPa, 30MPa, 40MPa e 50MPa), que após ruptura completa através de ensaios de tração na flexão foi posteriormente executada ligação com concretos de reparo, e corpos−de−prova cilíndricos de concretos convencionais apresentando ninhos de concretagem. Com a finalidade de melhorar a zona de transição citada, utilizou−se como sistema de reparo, concretos de elevado desempenho executados com cimento Portland CP V ARI RS − NBR 5733⁄NBR 5737 − ABNT, agregados: miúdo de origem quartzosa, e graúdo de Dmáx ≤ 6,3 mm de origem basáltica, adições de sílica ativa (Fe−Si) de 5%, 10% e 15% e aditivo superplastificante de pega normal em teores de 1,5%, 1,8% e 2,0%, após prévio tratamento, através de desbaste superficial e imprimação com pastas de cimento de elevado desempenho. A eficácia da ligação é percebida principalmente pelo fato de que em resultados de ensaios de tração na flexão do corpo−de−prova prismático recuperado a ruptura ocorreu, em quase 100% dos casos na região do concreto velho. Em ensaios de compressão axial com corpos−de−prova cilíndricos com ninhos de concretagem recuperados, percebeu−se através do modo de ruptura, que as transferências de tensões ocorreram normalmente através do sistema de reparo, sem que houvesse desvio de tensões, além de um acréscimo de resistência em alguns casos. / The bonding among Portland cement concrete of different ages, compositions and resistances is one of the technological problems of structural concretes. The continuity of this connection is harmed by a several factors from the re−starting of a casting (cold joint) to the recovery of deteriorated concrete structures. From this point of view this paper presents an analysis of the behavior of a repair system applied to the recovery of structures, new−to−old concrete bonding (amplification cases) and casting continuities. One of the most fragile points of a concrete structure is the interface zone, of both materials that compose it and the transition among the different concretes. Prismatic specimens executed with concretes (fck=15MPa, 18MPa, 21MPa, 25 MPa, 30 MPa, 40 MPa and 50 MPa), were used as substratum after a previous complete rupture through a flexural strength test for a further connection, with repair concrete as a bond link, and cylindrical specimens of conventional concretes presenting intentionally \"holes\". High−performance concretes with Portland cement CP V ARI RS (NBR 5733⁄NBR 5737 − ABNT), small quartz aggregates, basaltic coarse aggregates with Dmáx ≤ 6,3mm, silica fume (Fe−Si) additions of 5%, 10% and 15%, and normal setting superplasticizer with contents of 1,5%, 1,8% and 2,0% were used as repair system to improve the transition zone mentioned. Such materials were used after the specimens had been treated superficially and primed with High−performance Portland cement paste. The effectiveness of the connection is noticed mainly by the fact that in results of the flexural strength test of recovered prismatic specimens, the rupture occurred in almost 100% of the cases in the area of the old concrete. In axial compression tests with cylindrical specimens presenting recovered \"holes\", the rupture way demonstrated that the transfers of tensions usually occurred through the repair system, with no tension deviation, and there was a resistance increase in some cases.
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