Submitted by EDGARD HENRIQUE COSTA SILVA null (edgarddragde@gmail.com) on 2016-10-10T18:47:14Z No. of bitstreams: 1 silva_ehc_diss.pdf: 1266827 bytes, checksum: ca0139e7f9d8e5d85ced4f1e7541654f (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-10-17T13:13:37Z (GMT) No. of bitstreams: 1 silva_ehc_me_jabo.pdf: 1266827 bytes, checksum: ca0139e7f9d8e5d85ced4f1e7541654f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-17T13:13:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 silva_ehc_me_jabo.pdf: 1266827 bytes, checksum: ca0139e7f9d8e5d85ced4f1e7541654f (MD5) Previous issue date: 2016-07-16 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Dentre os fitopatógenos de maior importância econômica para o quiabeiro, destacam-se os nematoides de galhas (Meloidogyne spp.). Várias técnicas e abordagem de manejo vem sendo estudadas, no entanto, com potencial agroeconômico restrito. A resistência genética é vista como o manejo mais eficiente e sustentável, todavia não se tem relatos de resistência à nematoides de galhas dentro do gênero Abelmoschus. Uma alternativa promissora para manejar Meloidogyne spp. na cultura do quiabeiro seria a enxertia com porta-enxertos da mesma família botânica. Nesse sentido, objetivou-se com este trabalho, em duas etapas, verificar a reação de genótipos de quiabeiro e vinagreira aos nematoides de galhas Meloidogyne enterolobii, M. javanica e M. incognita raça 3 e de acessos de algodoeiro à M. incognita raça 3, e avaliar a compatibilidade para enxertia dos materiais resistentes com o quiabeiro. Na etapa 1, adotou-se delineamento inteiramente casualizado, com sete repetições. No ato do transplantio, as mudas foram inoculadas com 5.000 ovos e juvenis de segundo estádio de cada espécie de nematoide separadamente. Considerou-se uma planta por vaso como uma repetição. As plantas foram avaliadas aos 90 dias após a inoculação. Estimou-se a população final e o número de ovos e juvenis de segundo estádio por grama de raiz, bem como, o fator e o índice de reprodução para classificação de resistência ou suscetibilidade. Na etapa 2, os materiais resistentes na etapa anterior foram avaliados em duas sub-etapas, quanto à compatibilidade inicial e ao desenvolvimento inicial das plantas enxertadas. Adotou-se delineamento inteiramente casualizado em esquema fatorial 20x4, onde o primeiro fator foi constituído dos candidatos à porta-enxertos, e o segundo de intervalo de semeadura entre enxerto e porta-enxerto (-5D, o porta-enxerto foi semeado cinco dias antes do enxerto; 0D, o porta-enxerto e o enxerto foram semeados no mesmo dia; +5D e +10D, o porta-enxerto foi semeado 5 e 10 dias após o enxerto, respectivamente). Utilizou-se dez repetições, sendo uma repetição representada por uma planta. Os enxertos foram padronizados para 3 cm de comprimento e enxertados pelo método de garfagem fenda cheia. As mudas enxertadas foram acondicionadas em câmara úmida do tipo “floating” durante 20 dias. As mudas foram transplantadas para campo aberto no espaçamento 1x0,25 m. Mensurou-se o comprimento do enxerto e o número de folhas no transplantio e a taxa de sobrevivência cinco dias após o transplantio. Aos 40 dias após o transplantio, aferiu-se a massa fresca, massa seca, comprimento e diâmetro do enxerto e do porta-enxerto, massa fresca, massa seca e diâmetro da região da enxertia e número de folhas. Os resultados obtidos foram submetidos à análise de variância e as médias foram comparadas pelo teste de Tukey ou Scott-Knott à 5% de probabilidade. Todos os genótipos de quiabeiro foram suscetíveis às três espécies de nematoides. As vinagreiras roxa e flor-de-veludo foram resistentes às três espécies estudadas, e a vinagreira comum foi resistente à M. incognita raça 3. Foram resistentes à M. incognita raça 3 os acessos de aldogoeiro TMG 43 WS, IAC 20-233, PRO 136, Nou PAL-RR, LD 990 11213, Stoneville Cluster, Dunn 224, IAC 25, PA 04-158, IAPAR 97-141, Parrot, Acala 22, Wild Mexican Jack Jones, Coodetec 404, AP 0460, AUB 612 RNR, BJ 3128, SA 2572 e CS 8601. Os genótipos de algodoeiro e a vinagreira comum não são compatíveis para enxertia com quiabeiro. As vinagreiras roxa e flor-de-veludo são compatíveis para enxertia com quiabeiro ‘Santa Cruz 47’, sendo porta-enxertos promissores que devem ter o potencial agronômico do quiabeiro avaliado. Melhores resultados foram encontrados quando o enxerto ‘Santa Cruz 47’ e os porta-enxertos vinagreiras roxa e flor-de-veludo foram semeados no mesmo dia. / Among the pathogens of major economic importance to okra, it highlights the root-knot nematodes (Meloidogyne spp.). Various techniques and management approach has been studied, however, with restricted agroeconomic potential. Genetic resistance is seen as the most efficient and sustainable management, but there is no root-knot nematode resistance reported in Abelmoschus. A promising alternative to manage Meloidogyne spp. in okra crop would be grafting with rootstocks of the same botanical family. In this sense, the aim of this work, in two steps, was to screen okra and Hibiscus genotypes to Meloidogyne enterolobii, M. javanica and M. incognita race 3 and cotton access to M. incognita race 3, and to evaluate the compatibility of grafting of resistant materials with okra. In step 1, we adopted a randomized complete block design with seven replicates. At the time of transplanting, the seedlings were inoculated with 5.000 eggs and second stage juveniles of each species of nematode separately. It was considered one plant per pot as a repetition. The plants were evaluated 90 days after inoculation. We estimated the final population and the number of eggs and second stage juveniles as well as the factor and the reproduction rate for resistance or susceptibility classification. In step 2, the resistant material in the previous step were evaluated in two sub-steps, as for the initial compatibility and the initial development of grafted plants. A randomized complete block design in a factorial 20x4 was adopted. The first factor was composed of rootstocks candidates, and the second was seeding interval between scion and rootstock (-5D, the rootstock was sown five days before the scion, 0D, the rootstock and scion were sown on the same day; +5D and +10D, the rootstock was seeded with 5 and 10 days after the scion, respectively). We used ten replicates, with a repetition represented by a plant. Scions were standardized to 3 cm long and grafted by the cleft grafting method. Grafted seedlings were placed in a moist chamber of the floating type, for 20 days. Seedlings were transplanted to open field, spaced 1x0,25 m. It was measured the scion length and the number of leaves at transplanting and the survival rate five days after transplanting. At 40 days after transplanting, we assessed the fresh weight, dried weight, length and diameter of the scion and rootstock, fresh weight, dry weight and diameter of the graft area and number of leaves. The results were submitted to analysis of variance and means were compared by the Tukey or ScottKnott tests at 5% probability. All okra genotypes were susceptible to the three nematode species. The kenaf and false roselle were resistant to the three studied species, and the roselle was resistant to M. incognita race 3. The cotton access TMG 43 WS, IAC 20-233, PRO 136, Nou PAL-RR, LD 990 11213, Stoneville Cluster, Dunn 224, IAC 25, PA 04-158, IAPAR 97-141, Parrot, Acala 22, Wild Mexican Jack Jones, Coodetec 404, AP 0460, AUB 612 RNR BJ 3128, SA 2572 and CS 8601 were resistant to M. incognita race 3. The cotton genotypes are not compatible for grafting with okra. The roselle, despite initial compatibility, showed up, over time, incompatible. The kenaf and false roselle are compatible for grafting with okra 'Santa Cruz 47', and promising rootstocks that should have the agronomic potential assessed. Best results were found when the scion and rootstock were sown on the same day.

Orientadora: Eliana Gertrudes Macedo Lemos / Coorientador: Alexandre Lima Nepomuceno / Banca: Jaime Maia dos Santos / Banca: Ricardo Vilela Abdelnoor / Resumo: Este trabalho teve como objetivo analisar a expressão de genes de soja envolvidos na resistência ao nematóide de galhas, Meloidogyne javanica, utilizando a técnica de PCR em tempo real (RT-PCR). Foram avaliadas raízes de soja inoculadas e não inoculadas com o nematóide. Linhagens de soja resistentes (genótipo PI595099) e suscetíveis (cultivar BRS133) e indivíduos resultantes deste cruzamento foram inoculados com juvenis do nematóide. Raízes foram coletadas após um, três e seis dias de inoculação. O RNA total foi extraído e em seguida foi feita a síntese de cDNA, para ser utilizado nas reações de PCR em tempo real. As reações para quantificação do nível de expressão relativa foram preparadas em triplicatas, e um controle endógeno, o gene RNAr 18S também foi incluído. Os resultados mostraram que comparando os indivíduos resistentes com os suscetíveis, os resistentes apresentaram maior expressão dos genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2. / Abstract: This work objective was to analyze the expression of soybean genes involved in the resistance to the root nematode, Meloidogyne javanica, using the Real Time PCR (RT-PCR) technique. Soybean roots inoculated and not inoculated with the nematode were evaluated. Resistant soybean lineages (genotype PI595099) and susceptible lineages (cultivate BRS133) and resulting individuals of this crossing were inoculated with juvenile of the nematode. Roots were collected after one, three and six days after inoculation. The Total RNA was extracted and, afterwards cDNA synthesis was made, to be used in the reactions of Real Time PCR. The reactions for quantification relative expression level were prepared in triplicate, and an endogenous control, gene rRNA 18S, was also included. The results showed that comparing the resistant individuals with the susceptible ones, resistants showed higher expression level of the genes, Chs, Xet, Hs1pro-1, Sth-2. / Mestre

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, Programa de Pós-Graduação em Agronomia, 2014. / Submitted by Ana Cristina Barbosa da Silva (annabds@hotmail.com) on 2014-11-28T18:28:11Z No. of bitstreams: 1 2014_MarinaDechechiGomesCarneiro.pdf: 1425629 bytes, checksum: 24bcce226b7d83a3c3e895803751b2c4 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2014-11-28T19:41:01Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_MarinaDechechiGomesCarneiro.pdf: 1425629 bytes, checksum: 24bcce226b7d83a3c3e895803751b2c4 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-11-28T19:41:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_MarinaDechechiGomesCarneiro.pdf: 1425629 bytes, checksum: 24bcce226b7d83a3c3e895803751b2c4 (MD5) / Meloidogyne ethiopica é uma espécie de nematoide com potencial emergente no Brasil. Recentemente, foi detectada em lavouras de tomate, em cultivo protegido nos estados de São Paulo, Minas Gerais, Goiás, Distrito Federal, Paraíba, Pernambuco e Santa Catarina; neste último, foi detectada na cultivar Paronset, portadora do gene de resistência Mi. Há poucos relatos sobre a hospedabilidade de diferentes culturas hortícolas para essa espécie. Os objetivos deste estudo foram: a) avaliar a hospedabilidade de diferentes espécies e variedades de hortaliças para M. ethiopica e estudar a virulência desse nematoide ao pimentão 'Margarita', a pimenteira porta-enxerto 'Silver' e ao tomateiro 'Laura', todos portadores de genes de resistência a Meloidogyne spp.; b ) sugerir um sistema de rotação de hortaliças para M. ethiopica em áreas infestadas. Os experimentos foram realizados em casa de vegetação em blocos inteiramente casualizados com oito repetições. O tomateiro suscetível 'Santa Clara VF 5600' foi utilizado como testemunha. As plantas foram inoculadas com 10.000 ovos e eventuais juvenis de segundo estadio (J2) e avaliadas de dois a quatro meses após a inoculação com base no índice de galhas, índice de massa de ovos e o fator de reprodução (FR). Cultivares apresentando FR ? 1 foram considerados bons hospedeiros (preferencial, padrão, intermediário), FR < 1, maus hospedeiros e FR = 0, imunes ou não hospedeiros. Os ovos e eventuais J2 das raízes de cada planta foram extraídos utilizando NaOCl a 1%. Berinjela 'Embú', abobrinha 'Menina Brasileira', abóbora 'Tetsukabuto', couve chinesa 'Michihilli', brócolis 'Santana', pepino 'Safira', repolho 'Kirei', alfaces 'Elisa' e 'Veronica', rúcula 'Folha Larga' e espinafre 'Nova Zelândia' foram todos bons hospedeiros. Comportaram-se como maus hospedeiros: tomate 'Laura', alface 'Americana Grandes Lagos' e 'Veneza Roxa' e pimenta 'De Bico'. A pimenta 'Silver' e os pimentões 'Margarita' e 'Magali R' foram imunes. Em um sistema de rotação de culturas, cultivares considerados maus hospedeiros e não hospedeiros podem ser alternados entre si ou com cultivares considerados boas hospedeiros, permitindo o manejo das densidades populacionais do nematoide, afim de reduzir os danos agrícolas e econômicos. _________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Meloidogyne ethiopica is a root-knot nematode with emerging potential in Brazil. Recently, has been detected in tomato crops under greenhouses in the states of São Paulo, Minas Gerais, Goiás, Distrito Federal, Paraíba, Pernambuco and Santa Catarina, in this later, it was detected in the Paronset cultivar, which carries the Mi resistance gene. There are few reports about host suitability of different vegetable crops to this species. The objectives of this study were: a) to assess host suitability of different vegetable varieties to M. ethiopica and study the virulence of this nematode to pepper 'Margarita', chilli 'Silver' and tomato 'Laura', all carrying resistance genes to Meloidogyne spp.; b) to suggest a rotation system to M. ethiopica in infested areas. The experiments were carried out in greenhouse with randomized blocks design with 8 replications. Susceptible tomato 'Santa Clara VF 5600' was used as control. Plants were inoculated with 10,000 eggs and second stage juveniles and evaluated two to four months after inoculation based on gall index, egg mass index and reproduction factor (RF). Cultivars showing RF ≥ 1 were considered hosts, RF <1 poor hosts and RF = 0 immune or non-host. Eggs and second stage juveniles from each plant were extracted using 1% NaOCl. Eggplant 'Embú', zucchini 'Menina Brasileira', squash 'Tetsukabuto', sprouts 'Chinesa Michihilli', sprouting broccoli ‘Santana', cucumber 'Safira', cabbage 'Kirei', lettuce 'Elisa' and 'Veronica', arugula 'Folha Larga' and spinach 'Nova Zelândia' were all hosts. Behaved as poor hosts: tomato 'Laura', lettuce 'Americana Grandes Lagos' and 'Veneza Roxa' and pepper 'De Bico'. Chilli 'Silver' and peppers 'Margarita' and 'Magali R' were immune. In a crop rotation system, vegetables considered poor host and non-host can be alternated with vegetables considered host, allowing management of nematode population densities and ultimately reducing agronomic and economical damages.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2006. / Submitted by wesley oliveira leite (leite.wesley@yahoo.com.br) on 2009-10-28T20:15:14Z No. of bitstreams: 1 2006_Ana Cristina Meneses Mendes Gomes.pdf: 1279166 bytes, checksum: c2f231484d30a61a36863f7226b35f87 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-06-16T19:26:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2006_Ana Cristina Meneses Mendes Gomes.pdf: 1279166 bytes, checksum: c2f231484d30a61a36863f7226b35f87 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-06-16T19:26:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2006_Ana Cristina Meneses Mendes Gomes.pdf: 1279166 bytes, checksum: c2f231484d30a61a36863f7226b35f87 (MD5) Previous issue date: 2006-04 / Pfaffia glomerata, comumente denominada “ginseng brasileiro”, é uma planta da família Amaranthaceae que ocorre nas Américas e África, sendo que o Brasil é o mais importante centro de coleta dessa espécie para fins medicinais, alimentícios e cosméticos. Existem vários problemas fitossanitários que podem prejudicar essa planta, entre eles, os nematóides de galhas, Meloidogyne spp, que ocorrem causando sérios danos ao sistema radicular, onde estão armazenados os princípios ativos. Acessos de P. glomerata foram selecionados, quanto à resistência a Meloidogyne incognita raça 1, de coleções de plantas mantidas na Universidade de Brasília (UNB) e Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia (Cenargen). Plântulas foram obtidas por mini estaquia a partir da planta mãe e inoculadas com 5000 ovos quando tinham aproximadamente 15 cm de comprimento. Noventa dias após a inoculação foram avaliados os sistemas radiculares quanto aos índices de galhas, de massas de ovos e os fatores de reprodução (FR). Os acessos São Luís (MA), UFV (MG), Cenargen 1 (DF), Pedra de Guaratiba (RJ), Itabaiana (SE) e Cenargen 2213-6 foram considerados altamente resistentes (FR<1); IAPAR (PR), Cenargen 2216-10 e Cenargen 2216-16, medianamente resistentes (FR= de 1,9 a 2,3); Cenargen 2217-10 e UFC (CE), suscetíveis (FR=10,0) e os demais acessos (Farmacotécnica, DF e Cenargen 2217-9) altamente suscetíveis (FR >80,0). A partir desses resultados, a utilização de acessos resistentes é uma medida bastante promissora para o controle de M. incognita, em cultivos comerciais de P. glomerata. O presente estudo também comparou as respostas histológicas através de secções de radicelas quanto à infestação por M. incognita de um acesso resistente (UFV) com um acesso suscetível (Farmacotécnica), com o objetivo de estudar o mecanismo da resistência. Primeiramente, a resistência do (UFV) esteve associada a um fator não identificado que limitou a penetração do nematóide e a uma resposta bioquímica que se manifestou após a penetração. Algumas células apresentaram características particulares como citoplasma colorido em azul escuro ou apresentando autofluorescência azul esbranquiçada (luz UV). Organelas alteradas foram observadas, indicando a presença de uma resposta de xii hipersensibilidade (RH) nas células parasitadas do hospedeiro resistente e/ou entre elas. Células gigantes deformadas foram também observadas muitas vezes associadas a nematóides com autofluorescência azul esbranquiçada, indicando uma degeneração citoplasmática, devido à presença de compostos fenólicos no seu interior. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Pfaffia glomerata, commonly denominated “Brazilian ginseng”, is a plant of Amaranthaceae family that occurs in Americas and Africa. Brazil is the most important center of assessment of this species for usage as medicinal, nutritious and cosmetics aims. Some disease problems can damage that plant, among them, the root-knot nematodes, Meloidogyne spp., cause serious gall symptoms on the roots, where the phyto-chemical compounds are stored. Accessions of P. glomerata were selected from a collection maintained in the University of Brasília (UNB) and Embrapa Genetic Resources and Biotecnology (Cenargen). Plants were obtained by cuttings from the plant mother and inoculated with 5.000 eggs when they were15 cm of length approximately. Ninety days after the eggs inoculation the roots were evaluated, using galls index and the reproduction factor (RF). The accessions São Luís (MA), UFV (MG), Cenargen 1 (DF), Pedra de Guaratiba (RJ), Itabaiana (SE) and Cenargen 2213-6 were considered highly resistant (RF<1); IAPAR (PR), Cenargen 2216-10 and Cenargen 2216-16, moderately resistant (RF= from 1.9 to 2.3); Cenargen 2217-10 and UFC (CE), susceptible (FR=10) and the other accessions (Farmacotécnica, DF e Cenargen 2217-9) highly susceptible (RF >80). The current study also compared the histological response of section an accession resistant (UFV) and one susceptible (Farmacotécnica) to M. incognita infection with the aim to clarify the resistance mechanism. Resistance of ‘UFV’ was associated with unidentified factor that limited nematode penetration and with a post-penetration biochemical response. Several cells features including dark-stained or blue-white autofluorescence (UV xiv light) cytoplasm and altered organelle structure were observed in the resistant accession, indicating a hypersensitive response (HR) of the infested host cells. Features of giant cells were sometimes associated with nematodes with blue autofluorescence showing the degeneration of its cytoplasm and the presence of phenolic compounds.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Fitopatologia, 2008. / Submitted by Kelly Marques (pereira.kelly@gmail.com) on 2009-11-16T19:45:03Z No. of bitstreams: 1 2008_AnaPaulaGomesCastro.pdf: 1121044 bytes, checksum: 87662e0ed4a91b97c5364589274574dd (MD5) / Approved for entry into archive by Carolina Campos(carolinacamposmaia@gmail.com) on 2009-12-07T15:33:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_AnaPaulaGomesCastro.pdf: 1121044 bytes, checksum: 87662e0ed4a91b97c5364589274574dd (MD5) / Made available in DSpace on 2009-12-07T15:33:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_AnaPaulaGomesCastro.pdf: 1121044 bytes, checksum: 87662e0ed4a91b97c5364589274574dd (MD5) Previous issue date: 2008-08-25 / O Brasil tem se destacado na produção de maracujá, entretanto, a produtividade média está abaixo do potencial da cultura. Um dos motivos da baixa produtividade são os problemas fitossanitários, inclusive aqueles causados por nematóides, que comprometem a produção e qualidade dos frutos. Mesmo sabendo da importância dos nematóides para essa cultura, não se sabe a real dimensão desses problemas por carência de informações de campo, como é o caso Distrito Federal em que o último levantamento de nematóides fitoparasitas em maracujazeiros ocorreu há uma década. Diante das dificuldades de controle de doenças nessa cultura, a exploração da grande diversidade genética de Passiflora em busca de resistência varietal é o que há de mais promissor na solução dos problemas fitossanitários do maracujazeiro. Em decorrência disso, objetivou-se neste trabalho avaliar a ocorrência e a distribuição de nematóides fitoparasitas em plantios comerciais de maracujazeiro e em áreas de vegetação nativa no Distrito Federal; caracterizar a variabilidade genética desses acessos comerciais com base em marcadores moleculares RAPD; avaliar a reação de acessos comerciais e silvestres de maracujazeiros a uma população do nematóide Meloidogyne incognita. Amostras de solo e de raízes foram coletadas em áreas plantadas com maracujazeiro e em áreas adjacentes de vegetação nativa de Cerrado, em cinco diferentes núcleos rurais do Distrito Federal (Gama, Lago Oeste, Brazlândia, Pipiripau e Paranoá), em 14 propriedades, no período de julho de 2007 a janeiro de 2008. Foram coletadas 20 amostras compostas em áreas plantadas com maracujazeiro e cinco em áreas de Cerrado nativo. Foram encontrados nove gêneros de nematóides fitoparasitas (Meloidogyne, Helicotylenchus, Rotylenchulus, Scutellonema, Pratylenchus, Paratylenchus, Hemicycliophora, Xiphinema e Criconemoides) e cinco de micófagos (Aphelenchus, Aphelenchoides, Tylenchus, Coslenchus e Ditylenchus) nas amostras coletadas em plantios comerciais de maracujazeiro e em Cerrado nativo. No presente trabalho, foram verificados altos níveis populacionais de nematóides fitoparasitas associados à cultura do maracujazeiro no DF, como Rotylenchulus reniformis e Meloidogyne spp. O número total de nematóides fitoparasitas por amostra foi consideravelmente maior em plantios de maracujazeiro, indicando que a monocultura favoreceu esses nematóides. Estima-se que algumas das espécies de nematóides encontradas possam estar envolvidas na redução do crescimento das plantas com conseqüente reflexo na queda da produção de maracujá. Para avaliar a variabilidade genética dos acessos comerciais de maracujazeiros, foram coletadas folhas de 24 acessos de maracujazeiro-azedo representando plantações comerciais de 14 propriedades do DF. Também foram analisados três híbridos de maracujazeiro-azedo, recentemente lançados pela Embrapa Cerrados (BRS Sol do Cerrado, BRS Ouro Vermelho e BRS Gigante Amarelo), dois acessos de maracujazeiro-doce, utilizados como outgroup e um acesso maracujazeiro-azedo obtido no comércio local. O DNA genômico foi extraído utilizando o método do CTAB, com modificações. Amostras de DNA de cada acesso foram amplificadas pela técnica de RAPD. Os marcadores RAPD gerados foram convertidos em uma matriz de dados binários, a partir da qual foram estimadas as distâncias genéticas entre os diferentes acessos. A análise de agrupamento realizada com base nas distâncias genéticas permitiu a separação dos dois acessos de maracujazeiro-doce (outgroup) e a formação de vários grupos de acessos, evidenciando a variabilidade genética entre os mesmos. O posicionamento gráfico do híbrido BRS Ouro Vermelho confirma a maior contribuição deste material para a variabilidade genética dos materiais comerciais de maracujazeiro-azedo. A dispersão dos demais acessos evidencia as diferentes origens genéticas dos materiais utilizados pelos produtores de maracujá do Distrito Federal. Para avaliar a resistência de acessos comerciais e silvestres de maracujazeiro a uma população de nematóide de galhas, nove materiais genéticos foram analisados, sendo três espécies silvestres (P. capsularis, P. setacea e P.nitida), dois acessos de maracujá doce (P.alata), três híbridos comerciais recentemente lançados pela Embrapa Cerrados e parceiros (BRS Sol do Cerrado, BRS Ouro vermelho e BRS Gigante Amarelo) e um acesso de maracujazeiro azedo obtido no comércio local. O inóculo de Meloidogyne incognita proveniente do município de Santos Dumont (MG) foi multiplicado em plantas de tomate cv. Santa Clara em casa-de-vegetação. Plantas de maracujazeiro foram inoculadas com M. incognita, utilizando-se aproximadamente 2.200 ovos/juvenis por planta. O delineamento foi o inteiramente casualizado com 10 repetições. Cada genótipo de maracujazeiro teve 10 plantas inoculadas e quatro não inoculadas que serviram de controle. As plantas foram mantidas em casa de vegetação sob temperatura de 18 a 29 ºC e umidade, de 30 a 90%. Aos 62 dias após a inoculação foram avaliados, o comprimento da parte aérea, o número de folhas, o diâmetro do caule, o peso fresco da parte aérea, o peso seco da parte aérea, o peso fresco da raiz, o número de galhas/planta, o número de massas de ovos/planta, o número de ovos/massa de ovos, o número total de nematóides no solo e nas raízes e o fator de reprodução. Todos os genótipos se comportaram como resistentes com base no fator de reprodução, embora existam diferenças entre os genótipos com base em outras características relacionadas à resistência. Com base nos marcadores moleculares RAPD e na resistência a M. incognita foi possível analisar e quantificar a variabilidade genética entre os acessos comerciais e silvestres. Este resultado subsidia futuros trabalhos de seleção de acessos comerciais e silvestres, com importantes genes relacionados à produtividade, adaptabilidade e resistência a doenças, valiosos para trabalhos de melhoramento genético. _______________________________________________________________________________ ABSTRACT / Brazil is a world leader in passion fruit production, however, yield average is under potential levels of the fruit production. Phytossanitary constraints, including those cased by plant-parasitic nematodes are among the reasons for poor yield and fruit quality. Despite the importance of plant pathogens for passion fruit production, the exact dimension of crop losses is ignored due to lack of field information, as it occurs in the Brazilian Federal District (DF) where the last survey of plant-parasitic nematodes in soils planted with passion fruit occurred a decade ago. In front of the difficulties for disease control, the exploration of the wide genetic diversity among Passiflora spp. in search for plant disease resistance, seems to be the most promising approach for the control of passion fruit diseases. Therefore, the objectives of this work were: to evaluate the occurrence and distribution of plantparasitic nematodes in fields planted with passion fruit, and in soils of corresponding areas of native vegetation in DF; to characterize the genetic variability in commercial accessions of passion fruit planted in DF, on the basis of molecular markers, RAPD; to evaluate host reaction of nine genotypes of Passiflora spp. to a population of the root-knot nematode, Meloidogyne incognita. Soil and root samples had been collected in areas planted with passion fruit, and in areas of corresponding native cerrado vegetation, of five different agricultural regions of DF (Gama, Lago Oeste, Brazlândia, Pipiripau and Paranoá), in 14 farms, from July, 2007 through January, 2008. Twenty composed soil and root samples from the rhizosphere of passion fruit, and five composed soil samples in corresponding areas of native vegetation had been collected. Nine genera of plant-parasitic nematodes (Meloidogyne, Helicotylenchus, Rotylenchulus, Scutellonema, Pratylenchus, Paratylenchus, Hemicycliophora, Xiphinema and Criconemoides), and five of fungal feeder nematodes (Aphelenchus, Aphelenchoides, Tylenchus, Ditylenchus and Coslenchus) were found in both land use systems. High population levels of important plant-parasitic nematodes as Rotylenchulus reniformis and Meloidogyne spp. were associated with passion fruit root system. The total number of plant-parasitic nematodes per sample was considerably higher in passion fruit fields, indicating that monocropping favored these nematodes. Therefore, some of the nematode species recovered may be involved in the reduction of plant growth, and consequently with reflex on passion fruit yield. To evaluate genetic variability of commercial accessions of passion fruit, leaves of 24 accessions of sour passion fruit had been collected in commercial plantations of 14 farms in DF. In addition, three hybrids of sour passion fruit (BRS Sol do Cerrado, BRS Ouro Vermelho, and BRS Gigante Amarelo), recently released by Embrapa Cerrados and partners, one accession of sour passion fruit from the local market, and two accessions of sweet passion fruit (outgroup) had been analyzed. Genomic DNA had been extracted by CTAB method, with modifications. DNA samples of each accession had been amplified by RAPD technique. RAPD markers generated had been converted into a matrix of binary data, from which the genetic distances between the different accessions had been estimated. Clustering analyis based on the genetic distances allowed to separate the two sweet passion fruit accessions (outgroup), and to build-up various clusters of sour passion fruit accessions, supporting the wide range of genetic variabillity enclosed in these accessions. The graphical positioning of the hybrid BRS Ouro Vermelho confirms its major contribution for the genetic variability of the commercial accessions of sour passion fruit planted in the sampled areas. Dispersal of genetic distances among the commercial accessions of sour passion fruit supports the evidence that the materials planted by growers in DF came from different genetic orign. To evaluate resistance of commercial an wild accessions of passion fruit, nine genotypes of Passiflora spp. including three wild species (P. capsularis, P. setacea and P.nitida), two of sweet passion fruit (P. alata (J) and P. alata (N)), three hybrids of sour passion fruit (BRS Sol do Cerrado, BRS Ouro vermelho, and BRS Gigante amarelo), and a commercial accession from the local market were evaluated for host reaction to a population of Meloidogyne incognita. The inoculum from the municipality of Santos Dumont, MG. was multiplied in tomato plants cv. Santa Clara under green house. Plants of Passiflora spp. had been inoculated with 2,200 juveniles/eggs of per plant. A complete randomized design was applied. For each genotype 10 plantlets had been inoculated, and four other non-inoculated served as control. The plants had been kept under green house (temperature of 18 - 29 ºC, and humidity of 30 - 90%). Sixty-two days after inoculation the assay was evaluated for, shoot length, number of leaves, diameter of stem, fresh shoot weight, dry shoot weight, fresh root weight, number of galls per root system, number of egg masses per root system, number of egg per egg mass, number of nematodes in soil pot, number of nematodes per root system, and the nematode factor of reproduction. Based on RAPD markers, and resistance to M. incognita, it was possible to analyze and to quantify the genetic variability between accessions of wild and commercial passion fruit. Present results give support for further works to select genetic resources from commercial and wild background, with important genes related to fruit yield, adaptability and resistance the diseases, valuable for breeding programs.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2018-11-08T12:47:26Z No. of bitstreams: 1 Carolina de Lima França.pdf: 1419474 bytes, checksum: 9f51fc18e45826f7cb7c395571e7cbf7 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-08T12:47:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Carolina de Lima França.pdf: 1419474 bytes, checksum: 9f51fc18e45826f7cb7c395571e7cbf7 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Sugarcane is one of the most important crop in Northeastern Brazil and the plant-parasitic nematodes, one of the most important threat for the crop productivity. The high temperature in the dray sand soils of the costal tables cultivated with sugarcane has increased the losses. Considering that the nematode spatial distribution in soil is associated to the soil water content, structure and management, this study aimed to evaluate the effect of irrigation on spatial distribution of Meloidogyne spp. and Pratylenchus spp., the main plant-parasitic nematodes, in a costal table cultivated with sugarcane. Experiments were carried out in two areas, irrigated and non irrigated, and soil samples were collected before planting and at 4, 9 and 14 months after, on a 12.5 × 12.5-m grid, with 36 points per area, at 0-25 cm depth. Descriptive statistics and geostatistics were used to characterize the nematode spatial dependence and prepare kriging maps. Based on semi variance, most data fitted to spherical model. In general, spatial dependence was high and weak, with ranges higher than 3 m. Sugarcane irrigation on the table area drove to a more uniform distribution of Pratylenchus sp. in soil, in contrast to the non irrigated area, in which the nematode population presented more aggregated. / A cana-de-açúcar é uma das principais culturas no Nordeste e os nematoides parasitos de plantas uma das principais ameaças para a produtividade da cultura na região. As perdas são maiores quando associadas às altas temperaturas, irregularidade de chuvas e solos arenosos dos tabuleiros costeiros. Considerando que a distribuição espacial de nematoides no solo está associada a disponibilidade de água, estrutura e manejo do solo, o presente estudo teve como objetivo avaliar o efeito da irrigação na distribuição espacial de Meloidogyne spp. e Pratylenchus spp. em tabuleiros cultivados com cana-de-açúcar. Os experimentos foram conduzidos em duas áreas, irrigada e não irrigada, e as amostras de solo e raiz foram coletadas antes do plantio e 4, 9 e 14 meses após, em malha de 12,5 × 12,5 m, com 36 pontos por área, na profundidade de 0-25 cm. Estatística descritiva e geoestatística foram utilizadas para caracterização da dependência espacial dos nematoides e elaboração de mapas de krigagem. Com base na semivariância ocorreu ajuste com modelo esférico para a maioria dos dados. Em geral, o grau de dependência espacial foi forte e observado alcances acima de 3 m para os nematoides que apresentaram dependência espacial. A irrigação da cana-de-açúcar em área de tabuleiro favoreceu uma distribuição mais uniforme de Pratylenchus sp. no solo, ao contrário da área não irrigada, que mostrou tendência a manter a população do nematoide mais agregada na área.

Made available in DSpace on 2017-07-10T17:40:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Edilaine_D_V_GoncalvesTrevisoli.pdf: 2707364 bytes, checksum: 7b7a664f9727d5909c470f377ee155e8 (MD5) Previous issue date: 2016-02-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The induction of resistance in plants to pathogens is an alternative method of disease control, wich involves activation of plant resistance mechanisms such as induction of phytoalexins. The elicitors molecules are able to induce and activate those responses, and therefore, techniques have sought to isolate and characterize fractions with elicitor character. The study aimed to purify, through ion exchange chromatography and gel filtration chromatography, eliciting molecules from pathogenic nematodes, and test them in phaseolin induction in beans hypocotyls beans and gliceolin in soybean cotyledons. The buffer solution Tris HCl 0.05 M (pH 6.8) was used as control and the acibenzolar-S-methyl (50 mg a.i. L-1) and Saccharomyces cerevisiae (20 mg mL-1) were used as induction standard treatments. Ion exchange chromatography (IEC) and gel filtration chromatography (GC) were performed to separate fractions with eliciting power from 500 female nematodes of Meloidogyne incognita and Meloidogyne javanica. For purification of elicitors from Meloidogyne javanica, through IEC, six glycidic fractions and six glycoproteins were obtained. These were purified on GC, obtaining sixty-three fractions. They have been classified according to their nature, as twenty-six glycidic and thirty-seven glycoprotein with molecular weights ranging from 29.19 to 2989.25 kDa. Regarding the elicitors purification of Meloidogyne incognita through IEC, nine glycidic and five glycoprotein fractions were obtained. From these fractions, a total of fifty-eight fractions was obtained through GC, twenty-five glycidic and thirty-three glycoprotein with molecular weights ranging from 37.42 to 200.32 kDa. From the fractions purified from Meloidogyne javanica eight had inducing potential of phaseolin. For gliceolin fifteen fractions showed inducing effect. Regarding the fractions purified from Meloidogyne incognita, no fraction has inductive potential of phaseolin superior to the standard treatment. However, twenty-two fractions suppressed phytoalexin inducing activity. For gliceolin ten fractions induced the same, whereas, twenty-three fractions suppressed the induction of gliceolin. Chromatography was efficient in the purification of elicitors compounds. Compounds with suppressing characteristics of gliceolin and phaseolin were checked in bioassays. For those fractions obtained through IEC, and then submitted to GC that did not induce phytoalexin, it is suggested that molecules need to act together to have elicitor effect and thus induce defense response in the plant / A indução de resistência em plantas contra patógenos é um método de controle alternativo de doenças, e que envolve a ativação dos mecanismos de resistência da planta, como a indução de fitoalexinas. As moléculas eliciadoras possuem a capacidade de induzir e ativar tais repostas, e assim sendo, técnicas têm buscado isolar e caracterizar frações com caráter eliciador. O trabalho teve por objetivo purificar, por cromatografia de troca iônica cromatografia de filtração em gel, moléculas eliciadoras a partir de nematoides fitopatogênicos, e testá-las na indução de faseolina em hipocótilos de feijoeiro e gliceolina em cotilédones de soja. O tampão Tris HCl 0,05 M (pH 6,8) foi utilizado como tratamento controle e o acibenzolar-S-metil (50 mg i.a. L-1) e o Saccharomyces cerevisiae (20 mg mL-1) foram utilizados como tratamento padrão de indução. Cromatografia de troca iônica (CTI) e cromatografia de filtração em gel (CFG) foram realizadas para separar frações com poder eliciador a partir de quinhentas fêmeas de nematoides de Meloidogyne incognita e Meloidogyne javanica. Para a purificação de eliciadores a patir de Meloidogyne javanica, por CTI, foram obtidos seis frações glicídicas e seis glicoproteicas. Estas, por sua vez, foram purificadas em CFG, sendo obtidos no total sessenta e três frações. As mesmas foram classificadas de acordo com sua natureza, sendo vinte e seis glicídicas e trinta e sete glicoproteicas, com massas moleculares variando de 29,19 a 2.989,25 kDa. Em relação a purificação de eliciadores de Meloidogyne incognita por CTI, foram obtidos nove frações glicídicas e cinco glicoproteicas. A partir destas, foram obtidos por CFG um total de cinquenta e oito frações, sendo vinte e cinco glicídicas e trinta e três glicoproteicas, com massas moleculares variando de 37,42 a 200,32 kDa. Das frações purificadas a partir de Meloidogyne javanica oito apresentaram potencial indutor de faseolina. Para gliceolina quinze frações mostraram efeito indutor. Em relação as frações purificadas a partir de Meloidogyne incognita, nenhuma fração apresentou potencial indutor de faseolina superior ao tratamento padrão. Entretanto, vinte e duas frações suprimiram a atividade de indução de fitoalexina. Para gliceolina dez frações induziram a mesma, enquanto que, vinte e três frações suprimiram a indução da gliceolina. A cromatografia foi eficiente na purificação de compostos eliciadores. Compostos com características supressoras de gliceolina e faseolina foram verificadas nos bioensaios. Para aquelas frações obtidas por CTI e posteriormente submetidas a CFG que não induziram fitoalexina, sugere-se que as moléculas necessitam atuar juntas para haver efeito eliciador e assim induzir a resposta de defesa no vegetal

Memoria para optar al Título Profesional de Ingeniero Agrónomo Mención: Manejo de Suelos y Aguas

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Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-17T11:09:23Z No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 508100 bytes, checksum: 6edd668b30bf2762181cf01456fd64d7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-17T11:09:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.PDF: 508100 bytes, checksum: 6edd668b30bf2762181cf01456fd64d7 (MD5) Previous issue date: 2002-03-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Uma amostra de solo com alto teor de matéria orgânica foi dividida em frações de 1 kg e estas foram submetidas ao tratamento térmico em autoclave (120°C/1 h), em forno de microondas (4min) ou não tratadas (natural). Raízes de Mucuna aterrima, Crotalaria juncea, Tagetes erecta e Lycopersicon esculentum foram maceradas em liquidificador, peneiradas e os sucos resultantes foram adicionados, separadamente, aos três tipos de solo, aguardando-se 24h a 28°C. Isolados bacterianos foram obtidos por diluição serial como descrito por ROMEIRO (2001), a partir de suspensão aquosa de cada substrato, obtendo-se 78 isolados de rizobactérias. As rizobactérias foram submetidas à seleção massal em que sementes de tomate foram microbiolizadas por imersão em suspensão de propágulos de cada uma das culturas, semeadas e o solo foi infestado com M. javanica. Dos 78 isolados, 56 reduziram o número de galhas e 22 não apresentaram diferença significativa em relação ao controle. Quanto ao número de ovos presentes nas raízes, 26 isolados ocasionaram a redução, 43 não diferiram do controle e nove estimularam a formação. O isolado UFV-6 reduziu o número de galhas em maior proporção (80%) ao passo que o isolado UFV-8 foi o mais eficiente na redução do número de ovos (83%). Ambos os isolados foram provenientes do tratamento térmico de solo em microondas acrescidos do suco de raízes de T. erecta e de M. aterrima, respectivamente. Em contraposição, o isolado UFV-48 foi o mais deletério. Os dez isolados mais promissores foram reavaliados, em recipientes maiores pela inoculação com 1000 ovos de M. javanica por tubete e com 10 repetições. Não foi encontrada diferença no que tange ao número de galhas, mas os isolados UFV-41 e UFV-8 foram os mais eficientes em reduzir o número de ovos (35,3% e 35,0%, respectivamente). Os isolados UFV-29 e UFV-31 permitiram o aumento do número de ovos. Para investigar se o tipo de substrato pode potencializar a capacidade antagonista dos isolados UFV-8 e UFV-57 a M. javanica, comparou-se solo de terriço de mata com solo de barranco, com 15 repetições por tratamento. Os isolados reduziram galhas em 34,9% e 36,4% no solo de terriço e 41,5% e 35,3% em solo de barranco, respectivamente, não apresentando diferença significativa quanto ao tipo de substrato. Avaliou-se também a inibição da eclosão de juvenis in vitro. Os isolados mais eficientes na inibição de eclosão foram UFV-6 e UFV-53 reduzindo a eclosão em 64,9% e 85,7% respectivamente. / Five 1-kg samples of organic soil were autoclaved at 120°C for 1 hour, five were microwaved in a 660 watts and 2450Hz microwave oven at full power for 4 minutes, and five were not heat-treated. Roots of Mucuna aterrima, Crotalaria juncea, Tagetes erecta and Lycopersicon esculentum were macerated, separately, in 1000 mL of tap water in a blender at low speed for 30 seconds, sieved, and each of the resulting juices, or just tap water (control treatment) was poured on one of the treated and non-treated soil, inside of a plastic bag (5x3 factorial design). Each plastic bag was closed and vigorously shaken to mix the juice with the soil, and placed in the incubator at 28°C for 24 hours. Seventy eight bacterial isolates were obtained from all the soils by serial dilution. The screen of isolates for the biocontrol of Meloidogyne javanica was made by allowing tomato seeds to soak in water suspension of each bacterial isolate sowing them in substrate inside plastic tubes in the greenhouse, and inoculating the resulting seedlings with nematode eggs. Fifty six isolates promoted reduction of the number of root galls compared to the control treatment (seeds soaked in distilled water). Twenty six isolates promoted reduction of the number of nematode eggs per root system. The isolate UFV-6 was the most effective in reducing the number of galls (80% less than the control), and UFV-8 was the most effective in reducing egg numbers (83% reduction). Both isolates came from microwaved soil, but the UFV-6 was isolated from soil amended with T. erecta root juice and the UFV-8 from soil amended with M. aterrima root juice. The UFV-48, isolated from non-heated soil amended with tomato root juice was the most deleterious, increasing the number of eggs in 134,3% compared to the control treatment. The ten most effective isolates were re-evaluated in larger recipients (400 mL plastic pots) by the inoculation with 1,000 M. javanica eggs per plant (one plant/pot) and 10 replicates per treatment. There was no statistical difference among treatments for the number of galls, but the number of eggs was reduced in 35,3% and 35% by the UFV-41 and the UFV-8, respectively. The isolates UFV-29 and UFV-31 promoted increase in the number of eggs. In order to investigate if the substrate type has influence in the performance of the rhizobacteria, two effective isolates, the UFV-8 and the UFV-57 were tested in a highly organic soil and in a B horizon soil, with 15 replicates. They promoted gall reductions of 34,9% and 36,9% in the organic soil and 41,5% and 35,3% in the B horizon soil, respectively. Both treatments differed from the control, but did not differ from each other. The effect of ten good candidates and ten deleterious ones on the M. javanica egg hatch was evaluated in vitro. The UFV-6 and UFV-53 were the most effective, reducing egg hatch in 64,9% and 85,7%, respectively.