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Estudo sobre a matriz extracelular de diferentes regiões de tres tendões de ratos

Covizi, Daniela Zanin 27 July 1995 (has links)
Orientador: Edson Rosa Pimentel / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-07-20T12:49:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Covizi_DanielaZanin_M.pdf: 5501060 bytes, checksum: d867f84ccf659267d9d346abfc1db3d9 (MD5) Previous issue date: 1995 / Resumo: o tendão é um tipo de tecido conjuntivo denso onde há um predomínio de matriz extracelular (MEC) em relação a quantidade de células. Sua principal função é transmitir as forças de tensão geradas pela contração do músculo onde ele se origina ao osso no qual ele se insere. Os principais componentes da MEC de tendões são o colágeno do tipo I, os pequenos proteoglicanos (PGs) e as proteínas não colagênicas (PNC). Existem tendões que passam próximo a um osso em uma articulação antes da inserção, que ocorre numa direção diferente do músculo, e neste caso são denominados "wrap around", e no local em que estão sob a articulação recebem forças de compressão e fricção adicionais às forças de tensão. Neste local geralmente ocorre o desenvolvimento de uma estrutura fibrocartilaginosa com feixes de colágeno espessos, quantidade elevada de PG e células semelhantes a condrócitos. O objetivo deste trabalho foi analisar a composição de PNC e pequenos PGs da MEC de diferentes regiões do tendão do músculo flexor digital profundo (TFDP), do tendão do músculo flexor digital superficial (TFDS) e do tendão calcanear (TC), que por apresentarem trajeto não linear provavelmente estão sob a ação de forças de compressão e fricção além das forças de tensão. O TFDP e o TFDS foram divididos em regiões denominadas proximal, intennediária e distal, enquanto o TC foi dividido nas regiões proximal e distal. Todas as regiões dos três tendões foram extraídas com 25 volumes de c1oridrato de guanidina (GuRCI) 4M com inibi dores de proteases. As dosagens de proteínas realizadas em cada extrato mostraram que no TFDP havia uma maior presença de proteínas não colagênicas/mg de tecido, sendo que nas regiões intennediária e distal esta proporção foi maior. Com relação às dosagens de glicosaminoglicanos (GAGs) sulfatados, após digestão com papaína, foi verificado que a região distal do TC apresentou uma maior quantidade de GAG/mg de tecido, comparando com as regiões dos TFDP e TFDS. De um modo geral, a quantidade de GAG/mg de tecido, nos três tendões, foi sempre maior nas regiões em que os tendões contornam a articulação. O GAG dermatam sulfato foi encontrado em todas as regiões nos três tendões na eletroforese em gel de agarose, enquanto condroitim sulfato foi encontrado apenas nas regiões que estão sob forças de compressão do TFDP e do TC. Amostras de todos os extratos foram fracionadas em coluna de DEAE-celulose. O material ligado à resina foi eluído da coluna em gradiente linear de NaO de O a 1 M, e as frações analisadas em SDS-PAGE 4 a 16 % com e sem 2-mercaptoetanol (2-Me). Em todas as regiões dos três tendões observou-se a presença de componentes com Mr entre 94 kDa e 232 kDa. O pequeno PG fibromodulim foi encontrado em todas as regiões dos TFDP, TFDS e TC, e pelo resultado do teste imunoquímico podemos deduzir que possui duas isoformas do PG. Uma característica interessante deste fibromodulim foi seu comportamento em SDS-PAGE migrando mais lentamente quando não era previamente incubado com 2-Me. O componente poli disperso com Mr na faixa de 67 a 115 kda, provavelmente decorim, também foi encontrado em todas as regiões dos tendões TFDP, TFDS e Te. A presença desses pequenos PGs em tecidos tipicamente fibrosos deve-se à sua provável função de regular a fibrilogênese das moléculas de colágeno. As propriedades de intumescimento apresentadas pelos três tendões foram típicas de uma matriz colagênica fibrosa / Abstract: Tendon is a typical example of done connective tissue, with a predominance of extracellular matrix (ECM). Its main function is transmitting tension from the musc1e to the bone. The main ECM component of tendons are type I collagen, small proteoglycans and non collagenous proteins. Tendons which pass under bones are called a wrap around tendon, and way receive compression and frictional forces in adhesion to tensile forces. Normally, this region has a structure similar to a fibrocartilage with collagen fibers and elevated levels of g1ycosaminoglycans, with cells resembling chondrocytes. The purpose of this work was to analyse the composition of non collagenous proteins and small proteoglycans present in the ECM of different regions of the deep digital flexor tendon (DDFT), superficial digital flexor tendon (SDFr) and calcanear tendon (CT). These tendons probably experience compressive and frictional forces in addition to tensile forces. The DDFr and SDFr were divided in proximal, intermediate and distal regions, while the CT was divided in proximal and distal regions. Every region was treated with 25 volumes of 4M guanidine hydrochIoride (GuHCI) with proteases inhibitors. Quantitation of proteins in each extract showed that in DDFr there was a larger presence of non collagenous protein/ .g of tissue than in the other two tendons. In the intermediate and distal region of the DDFr, the proposition of this protein was higher. In relation to the presence of sulfated glycosaminog1ycans (GAGs), after papain digestion, more GAG/mg of tissue was found in the distal region of CT, compared to the regions of the DDFr and SDFr. In general, the amount of GAG/mg of tissue, was always higher in regions where the tendon passed under the joint. Eletrophoresis in agarose gel showed the presence of sulfate dermatan, in alI regions of the three tendons, whi1e chondroitin sulfate was found only in regions passing under bone, in DDFf and CT. Samples of every extract were fractioned on a DEAE-celulose column. The bound material was eluted with a linear gradient of O-1M NaCI, and fractions analysed in SDS-PAGE in presence and absence of 2-mercaptoethanol. In alI regions of the three tendons components with Mr between 94 and 232 kDa were delected. The small proteoglycan fibromodulin was present in every region of the DDFf, SDFf and CT. The immunochemical test inc1inated tqat fibromodulin may be present in two isoforms of the proteog1ycan. A interesting characteristic of this fibromodulin was its behaviour in SDS- P AGE, migrant more slowly when electrophoresis was in non reducing conditions. The polydisperse component with Mr in the range of 67 to 115 kDa, probably corresponding to decorin, was found in every region of the three tendons. The presence of these two small proteoglycans in fibrous tissues it is probable due to the function of regulating collagen fibrilogenesis. The swelling properties demonstrated for the three tendons were tipical of a collagenous fibrous matrix / Mestrado / Biologia Celular / Mestre em Ciências Biológicas
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MATRICES COMBINADAS DE ALGUNOS TIPOS DE MATRICES

Santana de Asís, Máximo de Jesús 14 April 2015 (has links)
[EN] Several authors have studied the Hadamard product or entry wise product of two matrices with di erent objectives. In particular, the product of a Hadamard matrix and the transpose of its inverse has proved useful in many areas such as in the study of chemical processes. This product is called combined matrix and is denoted by C(A). The combined matrix also has various applications in the eld of linear algebra. For example, from the combined matrix an interesting relationship between the eigenvalues and the diagonal elements of a diagonal- izable matrix is obtained. Furthermore, since the sum of each row and each column of a combined matrix is exactly equal to 1, in cases where the combined matrix is nonnegative, C(A) will be a doubly stochastic matrix. The study of properties of C(A) is still under research and many results have recently been published. Herein are collected and extended results concerning the combined matrix of some classes of matrices related to positivity? For this, a long list of related works has been consulted and a summary of the most relevant results has been made before showing the new results. The interest of some open issues was also raised. The memory is structured as follows. In the rst chapter the concepts are de ned and listed. General results are proven that will be used in the rest of the memory. In the three remaining chapters, we present the problems to solve, the results we have obtained and summarize their interest as conclusions. In Chapter 2 it is determined whether the combined matrix of some clas- sic classes of matrices may or may not be doubly stochastic. The combined matrix of these classes is studied and we concluded that the positivity of the combined matrix is obtained for some G-matrices, some H-matrices and some 2x 2 matrices. It never occurs to completely positive or completely negative ma- trices; and only it is obtained that C(A) 0 when C(A) = I in the case where A is not completely negative or M-matrix. Finally, only totally non positive anti-triangular matrices of size 2x2 have its combined matrix nonnegative. In Chapter 3 the previous study is extended to sign-regular matrices. The sign of the entries of the combined matrix from the signature of the matrix and of its inverse matrix transpose is analyzed and a list with all possible cases is obtained. This list shows cases where C(A) is never negative and others where C(A) is nonnegative when it is a diagonal or anti-diagonal matrix, that is, only when C(A) coincides with the identity matrix I or the anti-identity J. Likewise, it follows that the sign of the elements in C(A) is determined solely by the rst two and the last two elements of the symbol of A. In Chapter 4, we determine relations between the diagonal elements of the combined matrix of a totally negative matrix and thereby we characterize when a given vector can be the diagonal entries of C(A). Thus, relations between the rst two and last two diagonal elements of C(A), both for symmetric and non- symmetric cases are obtained. The diagonal of a combined matrix of a totally negative matrix of dimension 3x3 is also characterized. Finally, a chapter is written with all our achievements and a short list of possible future lines of work upon aspects that the author of this report would like to continue studying in order to reach new related goals. / [ES] El producto de Hadamard o producto elemento a elemento de dos matrices ha sido estudiado por diversos autores con diferentes objetivos. En particular, el producto de Hadamard de una matriz y la traspuesta de su inversa ha de- mostrado su utilidad en múltiples áreas como por ejemplo en el estudio de procesos químicos. Este producto se denomina matriz combinada y se denota por C(A). La matriz combinada tiene además diversas aplicaciones en el ámbito del álgebra lineal. A partir de la matriz combinada se obtiene, por ejemplo, una interesante relación entre los valores propios y los elementos diagonales de una matriz diago- nalizable. Además, dado que la suma de cada fi la y de cada columna de una matriz combinada es exactamente igual a 1, en aquellos casos en que la matriz combinada sea no negativa, C(A) será una matriz doblemente estocástica. El es- tudio de propiedades de C(A) sigue siendo de actualidad y muchos resultados han sido publicados recientemente. En esta memoria se recogen y amplían los resultados referentes a la matriz combinada de algunas clases de matrices relacionadas con la positividad. Para ello se ha consultado una larga relación de trabajos relacionados y se ha realizado un resumen de los resultados más relevantes antes de incluir los nuevos resultados. Se plantea también el interés de algunas cuestiones abiertas. La memoria se estructura de la siguiente manera. En el primer capítulo se de nen los conceptos y se enuncian y/o demuestran los resultados de ámbito general que van a ser utilizados en el resto de la memoria. En los tres restantes capítulos se plantea el tipo de problema a resolver, se enuncian y demuestran los resultados obtenidos y se resume su interés a modo de conclusiones. En el Capítulo 2 se determina si la matriz combinada de clásicas clases de matrices puede ser o no doblemente estocástica. Se estudia la matriz combinada de estas clases y se concluye que se obtiene la positividad de la matriz combinada para algunas G-matrices, algunas H-matrices y algunas matrices 2x2; nunca se da para matrices totalmente positivas o totalmente negativas; y s'olo se obtiene C(A) mayor o igual que 0 cuando C(A) = I en el caso de que A sea totalmente no negativa o M-matriz. Por último, sólo las matrices anti-triangulares totalmente no positivas de tamaño 2x2 tienen matriz combinada no negativa. En el Capítulo 3 se extiende el estudio anterior a matrices signo-regulares. Se analiza el signo de las entradas de la matriz combinada a partir de la signatura de la matriz y de la signatura de su matriz inversa traspuesta y se obtiene una lista con todos los casos posibles. Esta lista muestra casos en los que C(A) nunca es no negativa y otros en los que C(A) es no negativa cuando es una matriz diagonal o anti-diagonal, esto es, sólo cuando C(A) coincide con la matriz identidad, I, o con la anti-identidad, J. Así mismo, se deduce que el signo de los elementos de C(A) viene determinado únicamente por los dos primeros y los dos últimos elementos de la signatura de A. En el Capítulo 4 se busca determinar relaciones entre los elementos diagonales de la matriz combinada de una matriz totalmente negativa y con ello caracterizar cuándo cierto vector puede coincidir con la diagonal de C(A). Así, se obtienen relaciones entre los dos primeros y dos últimos elementos de la diagonal de C(A), tanto para el caso simétrico como no simétrico. También se caracteriza la diagonal de la matriz combinada de una matriz totalmente negativa de dimensión 3x3. Finalmente, se incluye un capítulo donde se resume los logros alcanzados y un pequeño listado de las posibles líneas futuras de trabajo sobre aspectos que el autor de esta memoria querría continuar estudiando en vista a unos nuevos objetivos. / [CAT] El producte de Hadamard o producte element a element de dues matrius ha sigut estudiat per diversos autors amb diferents objectius. En particular, el pro- ducte de Hadamard d'una matriu i la trasposta de la seua inversa ha demostrat la seua utilitat en mltiples rees com per exemple en l'estudi de processos qumics. Aquest producte es denomina matriu combinada i es denota per C(A). La ma- triu combinada t a ms diverses aplicacions en l'mbit de l'lgebra lineal. A partir de la matriu combinada s'obt, per exemple, una interessant relaci entre els val- ors propis i els elements diagonals d'una matriu diagonalizable. A ms, ats que la suma de cada la i de cada columna d'una matriu combinada s exactament igual a 1, en aquells casos en qu la matriu combinada siga no negativa, C(A) ser una matriu doblement estocstica. L'estudi de propietats de C(A) segueix sent d'actualitat i molts resultats han sigut publicats recentment. En aquesta memria s'arrepleguen i amplien els resultats referents a la matriu combinada d'algunes classes de matrius relacionades amb la positividad. Per a a s'ha consultat una llarga relaci de treballs relacionats i s'ha realitzat un resum dels resultats ms rellevants abans d'incloure els nous resultats. Es planteja tamb l'inters d'algunes qestions obertes. La memria s'estructura de la segent manera. En el primer captol es de- neixen els conceptes i s'enuncien i/o demostren els resultats d'mbit general que van a ser utilitzats en la resta de la memria. En els tres restants captols es planteja el tipus de problema a resoldre, s'enuncien i demostren els resultats obtinguts i es resumeix el seu inters a manera de conclusions. En el Captol 2 es determina si la matriu combinada de clssiques classes de matrius pot ser o no doblement estocstica. S'estudia la matriu combinada d'aquestes classes i es conclou que s'obt la positividad de la matriu combinada per a algunes G-matrius, algunes H-matrius i algunes matrius 2 x2; mai es dna per a matrius totalment positives o totalment negatives; i noms s'obt C(A) 0 quan C(A) = I en el cas que A siga totalment no negativa o M-matriu. Finalment, noms les matrius anti-triangulars totalment no positives de grandria 2x2 tenen matriu combinada no negativa. En el Captol 3 s'estn l'estudi anterior a matrius signe-regulars. S'analitza el signe de les entrades de la matriu combinada a partir de la signatura de la matriu i de la signatura de la seua matriu inversa trasposta i s'obt una llista amb tots els casos possibles. Aquesta llista mostra casos en els quals C(A) mai s no negativa i uns altres en els quals C(A) s no negativa quan s una matriu diagonal o anti-diagonal, a s, noms quan C(A) coincideix amb la matriu identitat I o amb la anti-identitat J. Aix mateix, es dedueix que el signe dels elements de C(A) ve determinat nicament pels dos primers i els dos ltims elements de la signatura de A. En el Captol 4 se cerca determinar relacions entre els elements diagonals de la matriu combinada d'una matriu totalment negativa i amb a caracteritzar quan cert vector pot coincidir amb la diagonal de C(A). Aix, s'obtenen relacions entre els dos primers i dos ltims elements de la diagonal de C(A), tant per al cas simtric com no simtric. Tamb es caracteritza la diagonal de la matriu combinada d'una matriu totalment negativa de dimensi 3x3. Finalment, s'inclou un captol on es resumeix els assoliments aconseguits i un petit llistat de les possibles lnies futures de treball sobre aspectes que l'autor d'aquesta memria voldria continuar estudiant en vista a uns nous objectius. / Santana De Asís, MDJ. (2015). MATRICES COMBINADAS DE ALGUNOS TIPOS DE MATRICES [Tesis doctoral no publicada]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/48806 / TESIS
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Determinación de una matriz de seguridad en energía para maquinas eléctricas de la planta concentradora en la Unidad Minera Atacocha

Espinoza García, John Carlos 31 October 2018 (has links)
La investigación responde al problema ¿Cómo Influye la matriz de seguridad en energía en la producción del molino de bolas en la planta concentradora de la unidad minera Atacocha?, como objetivo determinar la influencia de la matriz de seguridad en energía en la producción del molino de bolas en la planta concentradora de la unidad minera Atacocha y como hipótesis se asume la matriz de seguridad en energía influye positivamente en la producción del molino de bolas en la planta concentradora de la unidad minera Atacocha. El diseño fue el de tipo comparativa longitudinal, en la muestra de los resultados del funcionamiento del molino de bolas mediante la matriz de seguridad en la planta concentradora, a quien se aplicó la experimentación, basado en el análisis de criticidad que permitió mejorar la confiabilidad operacional de la planta concentradora en la unidad minera Atacocha. Concluyendo que la matriz de seguridad en energías mejora el proceso de trabajo en la compañía minera de Atacocha, lo que nos indica que el diagnóstico de sistema de trabajo del molino de bolas con o sin matriz de seguridad en la planta concentradora posibilitó reflejar resultados similares al encontrado en el análisis global; pues los resultados estadísticos permiten aseverar (muestra total) un incremento en la producción, como consta en la tabla 4, donde antes de la implementación de la matriz de seguridad en energías el molino de bolas en la planta concentradora tenía una producción de 11 274 420 Tn y una vez implementado el modo de trabajo del molino de bolas con la matriz de seguridad en energías se tuvo una producción de 12 242 634 Tn, de ello se desprende que la Matriz de seguridad en energías permite una eficiencia en el funcionamiento permitiendo una producción por encima del promedio.
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Algoritmo paralelo para determinação de autovalores de matrizes hermitianas

Miranda, Wilson Domingos Sidinei Alves 05 August 2015 (has links)
Dissertação (mestrado)–Universidade de Brasília, Universidade UnB de Planaltina, Programa de Pós-Graduação em Ciência de Materiais, 2015. / Submitted by Raquel Viana (raquelviana@bce.unb.br) on 2016-06-01T21:17:59Z No. of bitstreams: 1 2015_WilsonDomingosSidineiAlvesMiranda.pdf: 850688 bytes, checksum: ebf1c7ea3222d989fe0dd442d10edd33 (MD5) / Approved for entry into archive by Raquel Viana(raquelviana@bce.unb.br) on 2016-06-01T21:18:27Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2015_WilsonDomingosSidineiAlvesMiranda.pdf: 850688 bytes, checksum: ebf1c7ea3222d989fe0dd442d10edd33 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-01T21:18:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015_WilsonDomingosSidineiAlvesMiranda.pdf: 850688 bytes, checksum: ebf1c7ea3222d989fe0dd442d10edd33 (MD5) / Um dos principais problemas da álgebra linear computacional é o problema de autovalor, Au = lu, onde A é usualmente uma matriz de ordem grande. A maneira mais efetiva de resolver tal problema consiste em reduzir a matriz A para a forma tridiagonal e usar o método da bissecção ou algoritmo QR para encontrar alguns ou todos os autovalores. Este trabalho apresenta uma implementação em paralelo utilizando uma combinação dos métodos da bissecção, secante e Newton-Raphson para a solução de problemas de autovalores de matrizes hermitianas. A implementação é voltada para unidades de processamentos gráficos (GPUs) visando a utilização em computadores que possuam placas gráficas com arquitetura CUDA. Para comprovar a eficiência e aplicabilidade da implementação, comparamos o tempo gasto entre os algoritmos usando a GPU, a CPU e as rotinas DSTEBZ e DSTEVR da biblioteca LAPACK. O problema foi dividido em três fases, tridiagonalização, isolamento e extração, as duas últimas calculadas na GPU. A tridiagonalização via DSYTRD da LAPACK, calculada em CPU, mostrou-se mais eficiente do que a realizada em CUDA via DSYRDB. O uso do método zeroinNR na fase de extração em CUDA foi cerca de duas vezes mais rápido que o método da bissecção em CUDA. Então o método híbrido é o mais eficiente para o nosso caso. _______________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / One of the main problems in computational linear algebra is the eigenvalue problem Au = lu, where A is usually a matrix of big order. The most effective way to solve this problem is to reduce the matrix A to tridiagonal form and use the method of bisection or QR algorithm to find some or all of the eigenvalues. This work presents a parallel implementation using a combination of methods bisection, secant and Newton-Raphson for solving the eigenvalues problem for Hermitian matrices. Implementation is focused on graphics processing units (GPUs) aimed at use in computers with graphics cards with CUDA architecture. To prove the efficiency and applicability of the implementation, we compare the time spent between the algorithms using the GPU, the CPU and DSTEBZ and DSTEVR routines from LAPACK library. The problem was divided into three phases, tridiagonalization, isolation and extraction, the last two calculated on the GPU. The tridiagonalization by LAPACK’s DSYTRD, calculated on the CPU, proved more efficient than the DSYRDB in CUDA. The use of the method zeroinNR on the extraction phase in CUDA was about two times faster than the bisection method in CUDA. So the hybrid method is more efficient for our case.
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Envolvimento de metaloproteinases de matriz no desenvolvimento e na regressão da prostata ventral de roedores / Involvement of matrix metalloproteinases in the rodent ventral prostate development and regression

Cardoso, Alexandre Bruni 15 August 2018 (has links)
Orientador: Hernandes Faustino de Carvalho / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-15T10:03:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Cardoso_AlexandreBruni_D.pdf: 5087353 bytes, checksum: c88d322680c216b0a0f0c99aef894042 (MD5) Previous issue date: 2010 / Resumo: Importante glândula acessória do trato reprodutor de mamíferos, a próstata é um órgão alvo de várias doenças benignas e malignas, que ocorrem principalmente com o envelhecimento. Tanto o desenvolvimento prostático pós-natal como a regressão da glândula após a ablação hormonal são caracterizados por intensa modificação no comportamento das células e remodelação da matriz extracelular (MEC). As metaloproteinases de matriz (MMP) constituem uma família de enzimas que degradam principalmente componentes de MEC. Portanto, pareceu-nos plausível que as MMPs tenham papel crucial na remodelação tecidual que ocorre em decorrência dos eventos morfogenéticos da próstata ventral (PV) e na progressiva regressão prostática pós-castração. Assim, o objetivo desse trabalho foi investigar o papel da MMP-2 no desenvolvimento prostático pós-natal em roedores e das MMP-2, -7 e - 9 na regressão da PV de ratos pós-castração. Para isso, foram empregadas técnicas moleculares, bioquímicas e análises morfológicas. A aplicação do siRNA específico para MMP-2 comprometeu o crescimento, a ramificação, a formação de lúmen e a proliferação de células epiteliais da PV de ratos in vitro, além de provocar um acúmulo de fibras colagênicas no compartimento estromal. A PV do camundongo MMP-2-/- adultos apresentou peso relativo reduzido e um menor volume epitelial, que resultaram de menor proliferação epitelial, menor ramificação ductal e maior estabilização da matriz colagênica durante a primeira semana de desenvolvimento pós-natal. Na regressão da próstata ventral de ratos após a castração encontraram-se múltiplas ondas de morte celular e uma relação direta entre a expressão e atividade das MMP-2, -7 e -9 e o pico de apoptose que ocorre 11 dias após a castração. Conclui-se através dos resultados apresentados neste trabalho, que tanto o desenvolvimento prostático pós-natal, como a regressão prostática pós-castração são dependentes da expressão e atividade das MMPs. / Abstract: The prostate is an important gland of the reproductive tract of mammals, which is a target of several benign and malign diseases affecting the elder. Both postnatal prostate development and prostate regression after androgenic ablation are characterized by intense modification in cell behavior and remodeling of extracellular matrix (ECM). MMPs constitute a family of endopeptidases which are able to cleave preferentially ECM components. Thus, it seems reasonable that these enzymes play a crucial role in tissue remodeling that happens during the ventral prostate (VP) morphogenesis and in the prostate regression after castration. In this study, we aimed to define the involvment of MMP-2 in the postnatal prostate development of rodent and the involvement of MMP-2, -7 and -9 rat ventral prostate regression after castration. For this aim, we have used molecular, biochemical and morphological approaches. siRNA specific for MMP-2 compromised the rat VP growth, branching, lumen formation and epithelial cell proliferation, besides leading an accumulation of collagen fibers in the stroma. MMP-2-/- VP showed a reduced relative weight and epithelial volume, besides displaying a decreased epithelial proliferation and branching and a stabilization of collagen matrix at the end of the first postnatal week. In the prostate regression after castration, we found multiple waves of cell death and a direct association between activity and expression of MMP-2, -7 and -9 and an apoptotic peak that occurs at the 11th Day after castration. In conclusion, the results presented here showed that both postnatal prostate development and prostate regression after castration are dependent on the expression and activity of MMPs. / Doutorado / Biologia Celular / Doutor em Biologia Celular e Estrutural
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Presencia y niveles de metaloproteinasa de matriz extracelular-14 (MMP-14) en dientes con periodontitis apical asintomática, absceso apical agudo y en lesiones periapicales

Ledezma Rojas, Paulina Constanza January 2013 (has links)
Trabajo de Investigación Requisito para optar al Título de Cirujano Dentista / Autor no autoriza el acceso a texto completo de su tesis en el Portal de Tesis Electrónicas / Introducción: Las patologías periapicales de origen endodóntico se describen como un transtorno inflamatorio de los tejidos perirradiculares, causado por la infección microbiana persistente dentro del sistema de canales radiculares (SCR). Entre éstas podemos encontrar la periodontitis apical asintomática (PAA) y el absceso apical agudo (AAA), los cuales se caracterizan por la destrucción de los tejidos periapicales en presencia de mediadores inflamatorios. La metaloproteinasa de matriz extracelular-14 (MMP-14) es una enzima clave para la migración de macrófagos y para la degradación catabólica de la matriz extracelular (MEC), por lo que MMP-14 podría participar en la patogénesis de las lesiones periapicales (LPAs) y su caracterización en el exudado periapical (EP) podría reflejar el estado salud/ enfermedad de los tejidos perirradiculares. El objetivo de este estudio es identificar y comparar los niveles de las formas enzimáticas y moleculares de MMP-14, en homogeneizados de LPAs de dientes con PAA y de ligamento periodontal (LP) de dientes sanos; y en el EP de dientes con PAA y AAA. Materiales y Métodos: Se incluyeron 23 sujetos con diagnóstico clínico de PAA e indicación de exodoncia y 18 sujetos con diagnóstico clínico de ligamento periodontal sano e indicación de exodoncia por ortodoncia. Adicionalmente se incluyeron sujetos con diagnóstico clínico de PAA (n=10) y AAA(n=10) en dientes uniradiculares a los cuales se les realizó el tratamiento endodóntico correspondiente. Se obtuvieron muestras de exudado periapical antes de la preparación quimiomecánica. Para determinar la presencia de MMP-14 se realizó inmuno western blot. La intensidad de bandas se midió por análisis densitométrico con el programa UN SCAN IT®. Resultados: Se detectó la presencia de MMP-14 en homogeneizados de LPAs de dientes con PAA y también en el grupo control, presentando una tendencia a ser mayores sus niveles en LPAs. Así mismo se detectó la presencia de MMP-14 en EP de dientes con PAA y AAA, siendo mayores sus niveles en presencia de AAA. Conclusiones: MMP-14 tendría un rol en la patogenia de estas enfermedades sobre todo en los procesos agudos que desencadenan la aparición del AAA.
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Efecto del H2O2 sobre la actividad de las metaloproteinasas de matriz extracelular con actividad osteolítica y la vía de señalización NFkB en fibroblastos del ligamento perioodontal humano

Osorio Alfaro, Constanza Andrea January 2012 (has links)
Trabajo de Investigación Requisito para optar al Magister en Ciencias Odontológicas con Mención en Periodontologia / las especies reactivas de oxígeno (ERO), entre ellas H202, son liberadas durante la inflamación crónica inducen la destrucción tisular por medio de la sobreexpresión de citoquinas proinflamatorias y la activación de metaloproteinasas de matriz (MMP), en ocasiones involucrando la activación de la vía de señalización NFκB. Si bien, los fibroblastos del ligamento periodontal (FLP) regulan la homeostasis del periodonto, no se conoce el efecto de las ERO sobre la síntesis y actividad de las MMPs y las vías de señalización involucradas. Objetivo: Evaluar la actividad de MMPs -2 y -9 en conjunto con la participación de la vía NFκB en cultivos primarios de FLP humano tratados o no con dosis subletales de H2O2. Metodología: FLP fueron aislados y cultivados a partir de 14 terceros molares sanos de 14 sujetos con indicación de extracción y expuestos a dosis subletales de peróxido. La activación de NFκB se determinó mediante la translocación nuclear de la subunidad p65 en presencia de H2O2 y/o SN50, un péptido inhibidor de la subunidad p50 de la vía NFκB y controles respectivos mediante inmunofluorescencia. Los FLP fueron estimulados con dosis subletales de H2O2 (2,5-10 µM) por 24 h y/o SN50 como control negativo. Los sobrenadantes fueron recolectados y procesados. La actividad de las proformas y formas activas de MMP-2 y MMP-9 fueron determinadas mediante zimografías en gelatina y evaluadas por densitometría. Los resultados fueron expresados como unidades arbitrarias densitométricas (ua) por mg de proteínas totales. Los resultados fueron analizados por medio del test estadístico ANOVA con el software StataV11.1. Resultados: La viabilidad celular se mantuvo en los grupos estimulados con H2O2 en dosis de 2,5-10 µM por 24 h. El H2O2 Indujo la translocación nuclear de NFκB. El porcentaje de activación (% A) de MMP-9 fue mayor en el grupo H2O2 5 μM que en el grupo 5 μM/ SN50 (p=0,051); mientras que el % A de MMP-2, aumentó significativamente en el grupo H2O2 5 μM comparado con el control. La actividad de MMP-9 fue significativamente mayor en el grupo H2o2 2,5 μM comparado con el de 5 μM/ SN50 y el de 10 μM; mientras que la actividad de MMP-2 aumentó significativamente en el grupo de 5 μM en comparación con el grupo control, 10 μM y el grupo de 5 μM + SN50. Conclusiones: La actividad gelatinolítica de MMP-2 aumenta con dosis subletales de H2O2 (<10 µM), en parte vía NFκB en FLP humano. La actividad de MMP-9 en FLP humano, está regulada parcialmente por la vía NFκB. El aumento en la actividad de MMP-2 inducido por H2O2, podría estar relacionado con la destrucción de tejido en las enfermedades periodontales. / FINANCIAMIENTO FONDECYT 1090461
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Distribuição da avifauna em ambientes fragmentados de Floresta Ombrófila Mista na Bacia Hidrográfica do Rio Forqueta, RS, Brasil

Mohr, Luciane Rosa Da Silva 14 November 2012 (has links)
Submitted by Ana Paula Lisboa Monteiro (monteiro@univates.br) on 2013-03-01T13:22:31Z No. of bitstreams: 3 LucianeMohr.pdf: 1450661 bytes, checksum: 38b29398a360887c9ac76724bbddb1e3 (MD5) license_text: 19927 bytes, checksum: 24891eab170680c4b7a264ff8f59f8d1 (MD5) license_rdf: 23599 bytes, checksum: 9e2b7f6edbd693264102b96ece20428a (MD5) / Made available in DSpace on 2013-03-01T13:22:31Z (GMT). No. of bitstreams: 3 LucianeMohr.pdf: 1450661 bytes, checksum: 38b29398a360887c9ac76724bbddb1e3 (MD5) license_text: 19927 bytes, checksum: 24891eab170680c4b7a264ff8f59f8d1 (MD5) license_rdf: 23599 bytes, checksum: 9e2b7f6edbd693264102b96ece20428a (MD5) / A fragmentação e degradação dos habitats são as maiores ameaças à avifauna. A agricultura e pecuária alteraram a região de estudo, localizada em Soledade/RS, ao norte da Bacia Hidrográfica do Rio Forqueta (BHRF). Esta era originalmente coberta por campos e fragmentos de Floresta Ombrófila Mista (FOM). Os fragmentos estão reduzidos, invadidos pelo gado e dispostos em uma matriz de vegetação, em maioria, diferente da original. Esta pesquisa objetivou avaliar a distribuição, diversidade e composição da riqueza de aves em fragmentos de FOM e suas respectivas áreas de borda e matriz, na BHRF, bem como analisar a distribuição da abundância e guildas alimentares de aves nestes ambientes. Foram identificadas, também, as variáveis da paisagem que influenciam na distribuição da abundância e riqueza. Foram analisados nove fragmentos e suas áreas de matriz, nos quais as aves foram amostradas em pontos, sem raio definido, durante 10 minutos. Foram avaliados um ponto em cada área de matriz, um em cada área de borda e dois pontos no interior dos fragmentos, sendo duas amostragens realizadas na primavera/2011 e duas no verão/2012. Foram identificadas taxonomicamente 125 espécies de aves, destas 12 são migratórias e duas constam como prioritárias para a conservação. A maioria das espécies teve uma baixa frequência de ocorrência. As áreas de matriz registraram maior riqueza e abundância em relação a outros ambientes estudados, e essas diferenças foram significativas em relação à riqueza (H=10; P<0,05) e abundância (H=12,9; P<0,05). Em relação à diversidade as áreas de borda diferiram significativamente dos demais ambientes (F=4,95; GL=2; P<0,05). As análises de escalonamento multidimensional não-métricas (NMDS) revelaram, para riqueza e abundância, com ou sem espécies generalistas, que as aves ocorrem nas bordas e no interior dos fragmentos de forma semelhante. Assim, as aves que ocorrem nas áreas de matriz se diferenciam das que ocorrem nos demais ambientes, conforme esperado. A análise das métricas da paisagem revelou que a abundância das aves está mais fortemente relacionada com as métricas dos fragmentos do que a riqueza. Em relação à análise das guildas alimentares, as mais representativas foram as dos insetívoros, onívoros e granívoros, sendo que os insetívoros se destacaram em relação à riqueza (em todas as áreas) e à abundância (na borda e no interior dos fragmentos). Os granívoros foram mais abundantes nas áreas de matriz. Apenas quatro espécies consideradas de hábitos florestais foram registradas. As áreas de matriz podem funcionar como uma barreira para estas aves. Algumas aves de áreas abertas parecem se beneficiar dos fragmentos, pois 48 espécies foram registradas na matriz e nos outros ambientes também. Por outro lado, algumas espécies de áreas abertas, dependentes da heterogeneidade natural dos campos, como Xanthopsar flavus, espécie registrada prioritária para a conservação, estão também ameaçadas localmente, principalmente devido às 8 monoculturas. Os resultados mostram que os fragmentos analisados não são capazes de sustentar uma diversidade de aves de hábito florestal, isso porque se encontram degradados. Sendo assim, o presente estudo reitera a necessidade de investimentos nas medidas de recuperação e conservação de habitat para a manutenção da biodiversidade.
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Desenvolvimento de metodologia analítica para determinação de atrazina e seus principais produtos de transformação nas águas superficiais da Bacia Hidrográfica do Paraná 3

Flora, Alexandre Della January 2018 (has links)
A Bacia Hidrográfica do Paraná 3 (BP3) situada no oeste do estado do Paraná, apresenta um consumo de agrotóxicos acima da média do estado. A atrazina (ATZ) é um dos principais agrotóxicos utilizados na BP3. Foram avaliadas três técnicas de extração e de préconcentração: extração em fase sólida (SPE), microextração em fase sólida (SPME) e microextração dispersiva líquido-líquido (DLLME), com o objetivo de avaliar a capacidade de extração de ATZ e seus produtos de transformação (TPs), deisopropilatrazina (DIA) e deetilatrazina (DEA). A DLLME foi realizada a otimização através do planejamento Doehlert. A SPE e SPME foram realizadas a partir de adaptações da literatura. A escolha da técnica de extração foi realizada através da análise de custos e demanda temporal. A DLLME apresentou o menor valor de custo de extração e demanda temporal quando comparada com as outras. Esta técnica foi utilizada como rotina na análise das amostras da BP3. Foram analisadas 407 amostras, sendo que dessas, 23.83 % apresentaram a presença de ATZ, e uma amostra apresentou concentração acima do limite estabelecido na resolução CONAMA 357/2005. Sobre os TPs, 1,22 % das amostras apresentaram o DEA. Já para o DIA, somente em uma amostra esse analito foi quantificado. / The Paraná 3 Hydrographic Basin (BP3), located in the western part of the state of Paraná, shows a consumption of pesticides above the state average. Atrazine (ATZ) is one of the main pesticides used in BP3. Three extraction and preconcentration techniques were used: solid phase extraction (SPE), solid phase microextraction (SPME) and dispersive liquid-liquid microextraction (DLLME), with the objective of evaluating the extraction capacity of ATZ and its transformation products (TPs), deisopropylatrazine (DIA) and deethylatrazine (DEA). The DLLME was optimized through Doehlert planning. SPE and SPME were carried out based on adaptations of the literature. The extraction technique was chosen through the analysis of costs and time demand. DLLME presented the lowest value of extraction cost and temporal demand when compared to the others. This technique was used routinely in the analysis of BP3 samples. A total of 407 samples were analyzed, of which, 23.83% presented the presence of ATZ, and one sample presented concentration above the limit established in CONAMA Resolution 357/2005. On the TPs, 1.22% of the samples presented the DEA. For the DIA, only in one sample this analyte was quantified.
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Desenvolvimento de matriz extracelular temporária para gênese de mucosa urotelial

Tomedi, Joelson January 2011 (has links)
Propósito: Os avanços obtidos pela engenharia de tecidos propiciaram o desenvolvimento de substitutos biológicos para tecidos urinários permanentemente danificados. O objetivo deste estudo é gerar um modelo para investigar as etapas fundamentais da formação de uma mucosa urotelial in vitro. Materiais e Métodos: Quatro tipos de matrizes foram produzidos com uma mistura de gelatina e diferentes combinações de ácido hialurônico e gelatina. Elas foram caracterizadas com o objetivo de verificar o efeito da modificação na composição sobre propriedades físico- -químicas relacionadas com a interação celular. As células utilizadas no estudo foram extraídas de segmentos do sistema urinário descartados após cirurgias. Após o período de cultura, tanto as células uroteliais quanto células-tronco derivadas de tecido adiposo foram semeadas nas matrizes manufaturadas. Cotes histológicos avaliaram a integração das células às matrizes. O multipotencial de diferenciação das células-tronco e a expressão de citoqueratina 7 pelo urotélio também foram investigados. Resultados: A maior interação da heparina com as moléculas da gelatina provocou uma redução na densidade de cargas eletrostáticas das matrizes. Este efeito também se refletiu na hidrofilicidade da superfície e na capacidade de absorção das matrizes em que a heparina estava presente. As células-tronco e o urotélio expandidos em culturas primárias demonstraram capacidade de proliferar em todas as matrizes. As células-tronco confirmaram seu multipotencial de diferenciação in vitro. As células uroteliais mantiveram a expressão de citoqueratina 7 ao serem cultivadas nas matrizes. Conclusão: Todas as matrizes produzidas suportaram a adesão e proliferação celulares. / Purpose: Advances in culture techniques and production of temporary matrices have allowed the development of biological substitutes to injured urinary tissues. The aim of this work is to generate a model to study the fundamental steps required to produce a urothelial mucosa in vitro. Materials and Methods: Four types of matrices were manufactured based on a mixture of gelatin and different combinations of heparin and hyaluronic acid. They were characterized in order to evaluate the effect of composition on physicochemical properties related to cellular integration. Adipocyte-derived stem cells and urothelium were isolated from urinary tissues and expanded in culture. Mesenchymal stem cells were investigated so as to verify their multilineage potential. Each cellular type was seeded in matrices and after two weeks of culture the specimens were histologically analyzed. Additionally, urothelial cells expression of cytokeratin 7 was tested. Results: The addition of heparin to scaffolds decreased their electrostatic charges density, surface hydrophilicity and absorption capacity. Both cellular types were expanded in primary cultures and grew in all matrix types. Adipocyte-derived stem cells confirmed their multilineage potential. Urothelial cells maintained the cytokeratin 7 expression when cultured in matrices. Conclusion: Despite differences in composition and physicochemical properties, all matrices were able to support cellular attachment and proliferation.

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