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Seleção de famílias de feijão carioca visando extração de linhagens por modelos mistos / “Carioca” bean families selection aiming lineages extraction using mixed modelsNunes, Kharenn Vailant 18 December 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-12-18 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O feijoeiro-comum é suscetível à várias doenças, dentre elas a murcha-de-Fusarium. A murcha-de-Fusarium é uma doença muito presente nas áreas de plantio de feijão e pode levar a perdas de até 100%. Além da resistência a doenças, o objetivo do melhoramento do feijoeiro é a obtenção de linhagens que sejam produtivas, com arquitetura de plantas ereta e grãos comercialmente aceitáveis. Assim, o objetivo deste trabalho foi a seleção de famílias endogâmicas de feijoeiro, visando a extração de linhagens superiores quanto à resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, aspecto comercial de grãos e produtividade. As famílias avaliadas foram provenientes de duas populações selecionadas a partir de um conjunto de híbridos oriundos de um cruzamento dialélico. As populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 (população 1) e Pérola x VC 25 (população 2) foram as que se mostraram promissoras quanto a produtividade de grãos e resistência à murcha-de-Fusarium. Noventa famílias oriundas da população 1 e 34 famílias oriundas da população 2 juntamente com 7 testemunhas (genitores e variedades comerciais) foram avaliadas por três gerações/safras (F 2:3 , F 2:4 e F 2:5 ) em experimentos de campo. As características avaliadas foram dias da emergência ao florescimento (DEF), arquitetura de plantas (ARQ), produtividade de grãos (PROD), aspecto comercial de grãos (GRÃO), severidade de murcha-de-Fusarium (FUS), crestamento bacteriano (CREST) e mofo-branco (MOFO). Os dados obtidos foram analisados utilizando-se metodologia de modelos mistos. Observou-se significância para o efeito de famílias sobre a maioria dos caracteres, com exceção de DEF, ARQ (F 2:5 ) e PROD (F 2:5 ), o que indica variabilidade genética entre as famílias avaliadas. Por meio do índice de seleção FAI-BLUP ranqueou-se as 124 famílias com o intuito de selecionar as 20 melhores que sofrerão extração de linhagens. A partir das 20 famílias selecionadas foram estimados, para todos os caracteres significativos, ganhos de seleção direta (- 5.73% a -27.36%) e simultânea pelo FAI-BLUP (-0.15% a -9.34%). As 124 famílias foram agrupadas pelo método de Tocher em 3 grupos de diversidade e um destes grupos foi dividido em 30 subgrupos pelo mesmo método. As 20 famílias selecionadas pelo índice foram alocadas em 11 subgrupos de dissimilaridade genética, o que mostra que o índice considera, em parte, a diversidade genética na seleção. As 20 melhores e as 20 piores famílias também apresentaram diversidade genética pelo gráfico biplot. Assim, conclui-se que as populações oriundas dos cruzamentos CVIII 8511 x VC 25 e Pérola x VC 25 apresentam potencial para a extração de linhagens superiores considerando as características resistência a murcha-de-Fusarium, arquitetura de plantas, produtividade de grãos e aspecto comercial de grãos. / Common bean is susceptible to several diseases, among them Fusarium wilt. Fusarium wilt is a very common disease in the areas of bean planting and can lead to losses of up to 100%. In addition to resistance, bean breeding seeks for lineages that are productive, with erect plant architecture and commercially acceptable grains. Thus, the objective of this work was the identification of inbred families of common bean, aiming the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield. The families evaluated were obtained from two populations selected from a set of hybrids originated from a diallel cross. The populations obtained from the crosses CVIII 8511 x VC 25 (population 1) and Pérola x VC 25 (population 2) were the ones that showed potential regarding grain yield and resistance to Fusarium wilt. Ninety population 1 inbred families and 34 population 2 inbred families along with 7 controls (breeders and commercial varieties) were evaluated in three field harvests / generations (F 2:3 , F 2:4 and F2 :5 ). The evaluated characteristics were days of emergence to flowering (DEF), plant architecture (ARQ), grain yield (PROD), commercial aspect of grain (GRÃO), and severity of Fusarium wilt (FUS), bacterial blight (CREST) and white-mold (MOFO). The data obtained were analyzed using a mixed model methodology. Significance was observed for the effect of families on most of the characters except for DEF, ARQ (F 2:5 ) and PROD (F 2:5 ). This indicates genetic variability among the evaluated families. Using the FAI-BLUP selection index, the 124 families were ranked in order to select the 20 best that will undergo inbred line extraction. From the 20 families selected, considering all the significant characters, direct selection gains (-5.73% to -27.36%) and simultaneous FAI- BLUP gains (-0.15% to -9.34%) were estimated. The 124 families were grouped by the Tocher method into 3 diversity groups and one of these groups was divided into 30 subgroups by the same method. The 20 families selected by the index were allocated in 11 subgroups of genetic dissimilarity, which shows that the index considers the genetic diversity in the selection. The 20 best and the 20 worst families also presented genetic diversity by the biplot graph. Therefore, it is concluded that the populations obtained from the crossings CVIII 8511 x VC 25 and Pérola x VC 25 shows potential for the extraction of superior inbred lines considering resistance to Fusarium wilt, plant architecture, grain commercial aspect and grain yield.
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Calogênese em anteras e diversidade genética de acessos de pimenta (Capsicum spp.) do banco de Germoplasma da Universidade Federal de Roraima com base em Marcador RAPDLeonildo de Paula Farias Filho 24 August 2006 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Analisa a resposta a calogênese em dois acessos de pimenta, acesso 43- Capsicum annuum e acesso 40 - C. chinense, por meio da cultura de anteras visando à regeneração de plantas haplóides, correlacionar o tamanho do botão com o estádio do desenvolvimento do microscópio e avaliar a diversidade genética de 29 acessos de pimentas do Banco de Germoplasma da Universidade Federal de Roraima utilizando marcadores RAPD / The objective of this work was to analyze the adrogenesis in two pepper accessions, accession 43 - Capsicum annuum and access 40 - C. chinense, by the anther culture aiming to regenerate of haploids plants, to correlate the size of the bud with the development stadium of the of microscope and to evaluate the genetic diversity of 29 pepper accessions of Germoplasm of the Federal University of Roraima (UFRR) using RAPD markers
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Análise da diversidade genética entre genótipos de Mamona (Ricinus communis Euphorbiaceae) através de Fingerprinting de DNA com marcadores AFLP e ISSRSelmo de Vasconcelos Júnior, Santelmo 31 January 2011 (has links)
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Previous issue date: 2011 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / A mamoneira (Ricinus communis L.) é uma das oleaginosas cultivadas mais
importantes em todo o planeta, e no Brasil, uma das principais aplicações para o
óleo de rícino é a produção de biodiesel. Apesar da grande importância da cultura
para o Nordeste brasileiro, pouco é conhecido a respeito da diversidade genética de
genótipos adaptados às condições ambientais encontradas na região. Com o intuito
de prover informações acerca dos níveis de diversidade genética de acessos de
mamona provenientes da Embrapa Algodão, perfis de fingerprinting de DNA foram
descritos utilizando marcadores AFLP e ISSR. A partir da amplificação de 749
marcas no total (496 de AFLP e 253 de ISSR), foi observado o total de 53,4% de
bandas polimórficas (44,4% para o AFLP e 71,1% para o ISSR). O AFLP apresentou
a média mais alta de fragmentos amplificados por combinação de primers (33,1) em
comparação com os primers únicos de ISSR (16,9). As médias obtidas para os
índices PIC e MI foram mais altas para os primers de ISSR. No entanto, a média
mais alta de RP foi observada para as combinações de primers de AFLP. Uma forte
correlação positiva foi observada entre os parâmetros calculados, indicando a
validade dos índices para a escolha de marcadores AFLP e ISSR informativos. Os
valores de dissimilaridade genética entre os acessos variaram de 0,104 a 0,312
(AFLP), de 0,156 a 0,454 (ISSR) e de 0,143 a 0,339 (AFLP+ISSR). Em relação à
análise fenética, os 27 genótipos analisados dividiram-se em cinco grupos principais,
os quais, no entanto, não apresentaram indícios de estruturação (Fst = 0,108), com
maior variação dentro dos grupos (89,2%) sendo muito superior em relação à
variação entre grupos (10,8%). Apesar dos indícios de baixa diversidade genética e
ausência de estruturação entre os acessos, a associação de marcas específicas a
determinados genótipos de mamona revelam o potencial da aplicação das
metodologias de fingerprinting de DNA para acessar a variabilidade existente na
espécie. Adicionalmente, a descrição de primers capazes de gerar várias marcas
polimórficas capazes de diferenciar genótipos fornece subsídios para o melhor
direcionamento de cruzamentos entre acessos com características de interesse
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Herança do porte e descritores morfoagrônomicos de abóbora (Cucurbita moschata Duchesne) / Inheritance of plant habit and morphological descriptors of pumpkin (Cucurbita moschata Duchesne)Almeida, Cleverson Freitas 25 July 2017 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2018-06-13T14:32:59Z
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Previous issue date: 2017-07-25 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A abóbora (Cucurbita moschata Duch.) possui grande potencial para utilização de suas sementes como fonte de óleo, com excelente qualidade nutricional. Uma grande dificuldade em aumentar a produtividade de óleo em abóbora é o seu hábito de crescimento, que em geral é indeterminado com caules rastejantes que atingem grandes distâncias, a partir da coroa central o que impede maiores adensamentos de plantio, proporcionando reduzida quantidade de plantas por área. No entanto, alguns genótipos apresentam hábito reduzido, os quais possuem entrenós mais curtos, que possibilitaria aumento da densidade e, consequentemente, maior produtividade de sementes e óleo por área. Dessa forma, a transferência de alelos que confere essa redução do entrenó para genótipos com alto teor de óleo possibilitaria maior produtividade de semente por área, consequentemente de óleo. Para aumentar a eficiência desse processo é necessário o entendimento da herança desse hábito, assim como dos descritores relacionados. Diante disso, o objetivo desse trabalho foi estudar o controle genético de descritores morfoagronômicos e relacionados ao porte, visando reduzir o comprimento do entrenó e aumentar a produção de sementes e óleo em C. moshata. Para isso foi realizada análise de gerações, que permite avaliar simultaneamente várias gerações ou populações, incluindo genitores (P1 e P2 ), híbridos (F1 ) e gerações segregantes F 2 , além das derivadas de retrocruzamentos. O genitor P 1 é o acesso BGH 7319 pertencente ao Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV), acesso considerado promissor para produção de óleo funcional. O genitor P 2 é o cultivar Tronco Verde que possui o gene que confere a redução do entrenó, em homozigose. Foram avaliados 17 descritores relacionados ao porte, quatro ao florescimento, 11 aos frutos, sete as sementes e três de produção, totalizando 42 descritores. Todas as características avaliadas foram submetidas à análise de geração, em que foram estimadas as médias e variâncias aditivas, desvios da dominância, fenotípica, genética e ambiental. Para o modelo aditivo dominante, foram estimados os efeitos aditivos, dominantes e da média. Para o modelo completo foram estimados os efeitos das médias de todos os possíveis homozigotos, aditivos, dominantes e epistáticos: aditivo x aditivo, aditivo x dominante e dominante x dominante. Além disso, foram utilizados estimadores de máxima verossimilhança para determinar qual o melhor modelo genético em explicar as características de comprimento médio do entrenó antes e após o florescimento. O modelo aditivo dominante foi adequado para explicar 22 dos 42 descritores avaliados (52,42%). Para este modelo, o desvio de dominância foi significativo para 17 (77,27%) e para aqueles explicados pelo modelo completo foi significativo para 15 (75,00%), demonstrando sua grande influência no controle de tais descritores. Com a utilização de estimadores de máxima verossimilhança o modelo mais adequado para explicar o comprimento médio do entrenó antes do florescimento foi aquele que considera o gene de efeito maior com efeitos aditivos e de dominância mais poligenes de efeitos aditivos e de dominância sob influência do ambiente. Para o comprimento médio do entrenó após o florescimento o modelo mais adequando é aquele que considera apenas poligenes de efeitos aditivos mais efeitos ambientais. / The pumpkin seeds (Cucurbita moschata Duch.) has a great potential to be used as an oil source, which one has a high nutritional quality. Despite of that, there is a great difficult to increase the pumpkin oil production, related to type of plant pumpkin growth. The main features of pumpkin plant are undetermined growth, crawling stems which generally reach great distances from the central growth. As a result, occurs the inhibition of planting density and a less amount of pumpkin can be planting by area. As a possible solution, there is some genotypes of pumpkin which have a reduced habit growth and shorter internodes, providing a possibility to increase the planting density and consequently, higher seed and oil yields per area. This manner, the transference of these alleles, responsible by reduction of internodes of the training to genotypes with high oil content would allow higher seed productivity per area, consequently of oil. To increase the efficiency the allele transference process, it is necessary to understand the inheritance of this habit of plant growth, as well as related descriptors. Therefore, this research aimed to study the genetic control of morphoagronomic descriptors related to plant size, providing manner to reduce the length of internodes and increase the pumpkin seed and oil production in C. moshata. To undertake this research it was performed a generational analysis allowing the simultaneous evaluation of various generations or populations, including parents (P1 and P2 ), hybrids (F1 ), segregating generations F2 and those derived from backcrossing. The P 1 parent is the BGH 7319 access belonging to the Vegetable Germplasm Bank of the Federal University of Viçosa (BGH-UFV), an access considered promising to the production of functional oil. The P 2 parent is the Tronco Verde, cultivar that possesses the gene that confers the reduction of the internodes, in homozygous. Seventeen descriptors related to plant size, four to flowering, 11 to fruits, seven seeds and three of production were evaluated, totalizing 42 descriptors. All evaluated characteristics were submitted to the generation analysis, in which were estimated the means and additive, dominance deviations, phenotypic, genetic and environmental variances. To the dominant additive model were estimated the additive, dominant and means effects. In the complete model were estimated the effects of the means, additive, dominant, epistatic and of all possible homozygotes. In addition, maximum likelihood estimators were used to determine the best genetic model to explain the characteristics of length internode before and after flowering. The dominant additive model was adequate to explain 22 of the 42 descriptors evaluated (52.42%). To this model, the dominance deviation was significant for 17 (77.27%) and for those explained by the complete model it was significant for 15 (75.00%), demonstrating its great influence in the control of such descriptors. With the use of maximum likelihood estimators, the most adequate model to explain the length internode average before flowering was that considered the major effect gene with additive and dominance effects plus polygenes of additive effects and dominance, under influence of the environment. For the average length of the internodes after flowering the most suitable model is that considered only polygenes of additive effects plus environmental effects.
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Protocolo de indução da calogênese in vitro a partir de folíolos imaturos de plantas adultas de macaúba / A protocol for in vitro callogenesis induction from immature leaflets of adult macaw palm plantsNascimento, Antonia Maiara Marques do 07 March 2018 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T11:32:09Z
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Previous issue date: 2018-03-07 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A macaúba (Acrocomia aculeata) tem despertado interesse econômico devido ao seu elevado teor de óleo. Entretanto, problemas na propagação desta espécie limitam seu uso em larga escala, sendo necessários estudos que viabilizem a sua produção em escala comercial. Por conseguinte, a micropropagação se apresenta como uma excelente alternativa para esta finalidade. A embriogênese somática é uma ferramenta promissora para esta espécie. Porém, balanços hormonais adequados são requisitos fundamentais para a indução da calogênese. Com isso, este trabalho teve por objetivo estabelecer um protocolo de calogênese in vitro a partir de folíolos imaturos de plantas adultas de macaúba. Foram realizados dois experimentos. No primeiro foi avaliada a influência de acessos, meios de cultura e auxinas. No segundo, além da influência dos acessos, também foram avaliadas diferentes vitaminas e concentração de sacarose. Para o primeiro experimento, aos 90 dias após a inoculação, os explantes foram avaliados. Uma amostra dos explantes com calos foi avaliada anatomicamente, sendo os demais transferidos para um meio de multiplicação contendo ou não citocinina. Para o segundo experimento, aos 75 dias após a inoculação, foi realizada a avaliação da resposta dos explantes ao meio de cultivo. Os resultados mostraram que diferentes acessos de A. aculeata respondem de forma distinta às mesmas condições de cultivo, para o primeiro experimento. O meio de indução contendo 17,34 mM de nitrogênio acrescido de vitaminas B5 modificadas, 135 μM de Picloram e 20 ou 30 g L -1 de sacarose foi o melhor para a indução de calos em explantes foliares de plantas adultas de macaúba. Para a multiplicação, o meio com citocinina aumentou a proliferação dos calos. Segundo os estudos anatômicos, no primeiro experimento, não houve a formação de calos embriogênicos. Dessa maneira, foi estabelecido o meio de cultura para a calogênese, sendo necessários estudos para confirmar a resposta eficiente do meio independentemente do acesso. / Macaw palm (Acrocomia aculeata) has awakened great economic interest due to its high oil content. Nevertheless, propagation issues affecting this species impose limitations on its widespread use, being desirable studies focusing on making feasible its production on a commercial scale. In this sense, micropropagation is an excellent alternative. Somatic embryogenesis is a promising tool for this species, but it requires a proper balance of hormones for inducting callogenesis accordingly. Taking this into account, the goal of this study is to establish a protocol for in vitro callogenesis induction from immature leaflets of adult macaw palm plants. To this end, two experiments were undertaken. In the first one, the influence of two different genotypes, culture media, and auxins was assessed. In the second one, in addition to the influence of genotypes, several vitamins as well as sucrose concentrations were assessed too. For the first experiment, 90 days after inoculation, the explants’ response was evaluated. A sample was chosen, from those explants that generated calli, for being anatomically assessed. The remaining explants were transferred to two different multiplication media, containing or not cytokinin. For the second experiment, 75 days after inoculation, the evaluation of the explants’ response to the culture medium was performed. The results showed different responses for the selected genotypes from A. aculeata when the same treatment was applied. The best medium for callus’ induction, in foliar explants coming from adult macaw palm plants, was the one containing 17.34 mM of nitrogen with modified B5 vitamins, 135 μM of Picloram, and 20 or 30 g·L -1 of sucrose added on it. Regarding multiplication, the medium with cytokinin increased calli proliferation. As reported by the anatomic study, no embryogenic calli formation appeared in the first experiment. In conclusion, this work established a culture medium for callogenesis induction, even if further studies should be conducted to verify the efficient response of the proposed medium irrespectively of the genotype.
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Caracterização molecular de acessos de Coffea arabica por marcadores moleculares microssatélites / Molecular characterization of Coffea arabica accesses by microsatellite molecular markersMoreira, Júlia Rosa 27 July 2017 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2018-06-14T12:08:57Z
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Previous issue date: 2017-07-27 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A espécie Coffea arabica é autógama com base genética estreita e originada no sudoeste da Etiópia. As variedades botânicas de cafeeiros introduzidas no Brasil mais representativas foram a Típica e o Bourbon, as quais deram origem a outras variedades. A variedade Bourbon é a reconhecida internacionalmente por apresentar elevado potencial de bebida. E é, por isso, valorizada nos mercados de cafés especiais. Dessa forma é essencial para programas de melhoramento que essa espécie seja conservada em Bancos de Germoplasma. O Banco Ativo de Germoplasma (BAG) de café da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig), situado no município de Patrocínio, Minas Gerais, dá suporte aos programas de melhoramento e conta com 1596 acessos de café, destes, 140 foram registradas como Bourbon. O BAG de café da Epamig recebe o apoio do BAG de café da Universidade Federal de Viçosa (UFV), situado na Área Experimental do Fundão, no munícipio de Viçosa. Apesar de apresentarem uma ampla disponibilidade de características, esses bancos ainda não foram devidamente caracterizados, como é o caso do Bourbon, que ainda se tem muitas dúvidas sobre seus acessos, o que dificulta o uso no melhoramento e na comercialização. Para auxiliar a caracterização desses acessos, uma ferramenta útil é a utilização de marcadores moleculares, e os microssatélites são indicados para esse tipo de estudo. Diante disso, objetivou-se avaliar a diversidade genética por meio de marcadores moleculares SSR de acessos de Bourbon, além de variedades antigas e cultivadas, da coleção do BAG de café da Epamig. Esses acessos e variedades antigas e cultivadas foram denominados de populações, totalizado 14. Para as análises de variância molecular (AMOVA), discriminantes e de redes de correlação foram utilizados seis primers microssatélites (SSR), por apresentarem polimorfismo. Com base na AMOVA, observou-se maior variação genética dentro da população (64,88%) do que entre as populações (35,12%). Esses resultados sugerem que pode ter ocorrido polinização cruzada no local de coleta. Quanto à classificação das populações por análise discriminante observou-se que as populações tiveram similaridade com mais de uma população e algumas não tiveram similaridade com sua própria população. As populações caracterizadas pelo BAG como Bourbons foram analisados e, por similaridade, nenhum foi identificado como Bourbon, e sim como Sumatra, Catuaí Amarelo e alguns não foram bem distintos. Além disso, foram comparadas três características morfoagronômicas das quatro populações de possíveis Bourbons com as populações já identificadas como Bourbon Vermelho e Bourbon Amarelo. Observou-se variação para cor de broto nos indivíduos para as três populações caracterizadas como Bourbon Vermelho, e variação de porte na população caracterizada como Bourbon Amarelo. Pelos resultados obtidos, concluiu-se que existe uma maior variabilidade genética dentro das populações, e as quatro com classificação duvidosa de Bourbon apresentam similaridade com outras variedades. / Coffea arabica species is an autogamous with a narrow genetic base originating in southwestern Ethiopia. The most representative botanical varieties of coffee trees introduced in Brazil were Tipica and Bourbon, which gave rise to other cultivars. The Bourbon variety is internationally renowned for its high cup quality. Therefore, it is valued in the specialty coffee market. As a result, it is essential for breeding programs that this species be conserved in Germplasm Banks. The Agricultural Germplasm Bank (BAG) of the Agricultural Research Organization of Minas Gerais (EPAMIG), located in the municipality of Patrocínio, Minas Gerais, supports coffee breeding programs and has 1596 coffee accessions, of which 140 (like Bourbon) have been registered. The Epamig coffee BAG receives the support of the BAG of the Universidade Federal de Viçosa (UFV), located in the experimental area of the UFV, no municipality of Viçosa, Minas Gerais. Although they have a wide availability of characteristics, these banks have not yet been adequately characterized, as is the case of the Bourbon group, in which still there are many doubts about their accesses, which makes difficult to use in breeding and marketing. To help characterize these accesses, a useful tool is the use of molecular markers among which microsatellites are indicated for this type of study. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity through SSR molecular markers of Bourbon accesses, as well as old and cultivated varieties, from EPAMIG's coffee BAG collection. These ancient and cultivated accesses and varieties were called populations, totaling 14 polymorphisms. For analysis of molecular variance (AMOVA), discriminant and correlation networks, six microsatellite primers (SSR) were used. Based on AMOVA, there was greater genetic variation within the population (64.88%) than among populations (35.12%). These results suggest that cross-pollination may have occurred at the collection site. As for the classification of populations by discriminant analysis, it was observed that the populations had similarity with more than one population and some did not have similarity with their own population. Populations characterized by BAG as Bourbons were analyzed and, by similarity, none were identified as Bourbon, but as Sumatra, Catuaí Amarelo and some were not very distinct. In addition, three morphoagronomic characteristics of the four populations of possible Bourbons were compared to populations already identified as Red Bourbon and Yellow Bourbon. Variation to bud color was observed in the individuals for the three populations characterized as Red Bourbon and variation of size in the population characterized as Yellow Bourbon. From the results obtained, it was concluded that there is a greater genetic variability within the populations and the four with uncertain classification of Bourbon presented similarity with other varieties.
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Avaliação do desempenho agronômico e culinário de genótipos de mandioca (Manihot esculenta Crantz) em Pelotas, RS e Cruz das Almas, BA / Evaluation of agronomic and culinary performance of cassava genotypes (Manihot esculenta Crantz) in Pelotas, RS and Cruz das Almas, BA.Morales, Cinara Fernanda Garcia 17 September 2015 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-09-14T13:25:59Z
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Previous issue date: 2015-09-17 / Sem bolsa / O cultivo de mandioca é explorado em muitos países para obtenção do amido, que é
matéria-prima para variadas indústrias e, principalmente, por ser alimento básico
para pessoas e animais. No Brasil a cultura também tem esta importância, sendo
explorada em todos os estados, tanto como alternativa de consumo e renda para
agricultores familiares, quanto para a indústria amilácea. Este trabalho teve por
objetivo avaliar genótipos quanto às suas características agronômicas e cozimento.
Na Embrapa Clima Temperado, Pelotas, RS, foram avaliados os acessos do banco
ativo de germoplasma (etnovariedades e cultivares) e genótipos resultantes do
programa de melhoramento da Embrapa, nas safras 2010/2011; 2011/2012;
2012/2013; 2013/2014, plantados com espaçamento de 1,00m x 0,80m, em
delineamento de blocos ao acaso e três repetições. Na Embrapa Mandioca e
Fruticultura, Cruz das Almas, BA, foram avaliados 21 genótipos, no período
2013/2014, com espaçamento de 1,00m x 0,70m, em parcelas subdivididas, 20
plantas por parcela e quatro repetições, colhidas aos 8, 10 e 12 meses para
avaliação das características agronômicas e cozimento, aos 8, 9, 10, 11 e 12 meses.
Nas avaliações realizadas na Embrapa Clima Temperado, os acessos Aceguá,
Aipim de Caxias, Aipim do Sítio, Alta, Frita e Paulista, os genótipos 2005 27-02,
497/08 e o cultivar BRS Dourada apresentaram desempenho satisfatório quanto às
características agronômicas e de cozimento, demonstrando haver variabilidade
genética para mandioca de mesa, o que é de interesse para a agricultura familiar.
Nas avaliações realizadas na Embrapa Mandioca e Fruticultura, apesar das
características agronômicas satisfatórias, nenhum dos genótipos apresentou tempo
de cozimento comparável ao das testemunhas. / Cassava crops are exploited in many countries for starch obtainment, which is a raw
material for various industries, and mostly for being essential food for many people
and animal feed. In Brazil, the culture is widely cultivated and is an important
consumption and income alternative for small farmers and to starchy industry. This
work aimed to evaluate cassava genotypes for agronomic and cooking purpouses. At
Embrapa Clima Temperado, Pelotas, RS, accessions from the active germplasm
bank (etnovarietes and, cultivars) and promising cultivars from Embrapa plant
breeding program were evaluated for four consecutive years 2011 to 2014, planted
with spacing of 1.00m x 0.80m in a randomized block design and three replications.
At Embrapa Mandioca e Fruticultura, Cruz das Almas, BA, 21 genotypes were
evaluated in one-year period, 2013 to 2014. Plants were spaced 1.00m x 0.70m,
under split plot experimental design, 20 plants per plot and four replications,
harvested at 8, 10 and 12 months to evaluate the agronomic characteristics and
cooking time at 8, 9, 10, 11 and 12 months. Accessions Aceguá, Aipim de Caxias,
Aipim do Sítio, Alta, Frita, Paulista, 2005 27-02, 497/08 and BRS Dourada showed
satisfactory performance for agronomic and cooking characteristics in the evaluations
performed at Embrapa Clima Temperado. These results suggest that there are
genetic variability for table use of cassava and this is interesting for minor crop
farming. Despite satisfactory agronomic characteristics, none of the genotypes
evaluated at Embrapa Mandioca e Fruticultura presented cooking time comparable to
the controls.
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Vulnerabilidade genética e relação dos germoplasmas comerciais de milho no Brasil entre si e com os genitores da população Nested Association Mapping / Genetic vulnerability and relationship between commercials germplasms of maize in Brazil and progenitors of nested association mapping populationAndrade, Luciano Rogério Braatz de 20 February 2015 (has links)
Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2015-11-20T09:24:41Z
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Previous issue date: 2015-02-20 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O germoplasma comercial de milho é oriundo de apenas sete linhagens endogâmicas, o que pode levar a vulnerabilidade genética deste a estresses abióticos e bióticos, e limitar os ganhos com a seleção no Brasil. A vulnerabilidade genética ocorre em culturas melhoradas de baixa variabilidade genética, presentes em grandes áreas. Por exemplo, a infestação de helmintosporiose em 1970 causou preocupação entre os melhoristas Norte- Americanos com a diversidade genética de seus híbridos. No Brasil, o mercado de sementes é dominado por poucas empresas: Monsanto® (35%), DuPont Pioneer® (30%), Dow Agrosciences® (15%), Syngenta® (10%) e Helix Sementes (4%). Assim é importante o monitoramento da diversidade genética que está sendo utilizada, pois as práticas de melhoramento, registro e marketing de novos cultivares podem conduzir a vulnerabilidade genética. Diante do exposto, o objetivo foi avaliar o risco de vulnerabilidade genética e as relações entre os germoplasmas comerciais brasileiros de milho e destes com os genitores da população Nested Association Mapping (NAM). Visando atender a esses objetivos foram utilizados os genótipos dos híbridos elite das empresas de maiores market-share no Brasil e os genitores da população NAM. Os híbridos foram genotipados para 700 marcadores do tipo SNP, por meio da plataforma Illumina GoldenGate®. Já os dados genômicos dos genitores da NAM foram obtidos no banco de dados do Panzea, os quais foram genotipados para 1536 SNP’s. Os dados dos marcadores para os genótipos foram submetidos às análises de correlação entre as frequências alélicas, estruturação populacional e diversidade genotípica. Pelo tamanho efetivo populacional evidenciou-se baixo risco de vulnerabilidade genética para o germoplasma comercial brasileiro. A distância genética entre o germoplasma comercial brasileiro é menor que a encontrada na NAM, sendo menor ainda entre os híbridos de mesma empresa. O germoplasma comercial brasileiro não apresentou relações estreitas com as linhagens genitoras da população NAM, com exceção da linhagem Norte-Americana B73, esta que pertenceu a mesma população pela estruturação populacional. Isto evidencia que a linhagem B73 ou seu grupo grupo heterótico (Iowa Stiff Stalk Synthetic) tiveram grande influência na formação do germoplasma comercial brasileiro. / The limited genetic variability of the Brazilian commercial maize germplasm, originated from only seven inbreed lines, could result in genetic vulnerability to abiotic and biotic stress, and also to limited selection gain. The genetic vulnerability happens to situations with low genetic variability, in large areas. The infection of Southern corn leaf blight in 70’s, concerned the North-American breeders about their hybrids genetic diversity. In Brazil, Monsanto®, DuPont Pioneer®, Dow Agrosciences® and Syngenta® have the largest seed market share. Therefore, it’s important to monitor the genetic diversity available in the country, because breeding practices, registration and marketing of new varieties could result in genetic vulnerability. Thus, the objectives of this study were to evaluate the risk of genetic vulnerability and the relationships between the Brazilian commercial maize germplasm and the Nested Association Mapping (NAM) genitors. Aiming to achieve these objectives, it was include in this work the elite hybrids of the largest market share companies in Brazil and the NAM genitors. The hybrids were genotyped by Illumina GoldenGate® platform, while the genomic data of NAM genitors were obtained in Panzea. The genotypes were subjected to linear correlation analysis, population structure and genetic diversity analysis. It was shown lower risk of genetic vulnerability with the Brazilian commercial germplasm. There is a narrow relationship within the Brazilian commercial germplasm, being closer between the hybrids of same company. The Brazilian commercial germplasm did not show close relationship with the NAM genitors, with exception of North-American line B73, which belonged to the same population of the population structure analysis. This showed that the line B73 or its heterotic group (Iowa Stiff Stalk Synthetic) had great influence at the Brazilian commercial germplasm formation.
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Caracterização molecular de cafeeiros do germoplasma Bourbon / Molecular characterization of Bourbon germplasmPestana, Rosa Karla Nogueira 09 March 2015 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2015-11-27T13:12:12Z
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Previous issue date: 2015-03-09 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Com a crescente demanda do mercado mundial de cafés especiais, os produtores brasileiros têm demonstrado interesse em retomar o cultivo do Bourbon, principalmente devido a seu potencial para produzir cafés de qualidade superior de bebida. Dessa forma, os melhoristas têm buscado incorporar acessos de Bourbon nos programas de melhoramento, a fim de obter cultivares para a produção de cafés especiais. Visando dar suporte aos programas de melhoramento da Empresa de Pesquisa Agropecuária de Minas Gerais (Epamig), foi instalado em Patrocínio, MG, um Banco Ativo de Germoplasma (BAG) com 1594 acessos, destes, 140 correspondem a Bourbon. Entretanto, a coleção de germoplasma de Bourbon ainda não foi devidamente caracterizada, fato que interfere no seu aproveitamento para fins comerciais e uso no melhoramento. Deste modo, a caracterização molecular desses genótipos é essencial para ampliar o conhecimento dos materiais genéticos disponíveis e, assim, incorporar os mais adequados nos programas de melhoramento genético do cafeeiro. Nesse sentido, o presente trabalho teve como objetivo caracterizar, por meio de marcadores SSR e AFLP, a coleção de Bourbon da Epamig, como uma ferramenta auxiliar na identificação dos acessos, avaliação da diversidade genética e do perfil molecular (Fingerprinting) dos genótipos. Na identificação dos acessos, apresentado no capítulo 1, os marcadores SSR foram utilizados para discriminar os genótipos de Bourbon juntamente com as técnicas de analise discriminante e redes neurais artificiais. Os locos SSR analisados foram adequados para diferenciar os acessos. Observou-se que as redes neurais artificiais apresentaram maior eficiência na classificação dos acessos de Bourbon do que a análise discriminante e foi possível identificar acessos que apresentaram misturas ou problemas na identificação inicial. Na avaliação da diversidade genética e do perfil molecular (Fingerprinting) dos acessos, apresentados no capítulo 2, os marcadores SSR e AFLP utilizados permitiram separar a maioria dos indivíduos analisados. Esses dados moleculares sugerem que, apesar da reconhecida base genética estreita de C. arabica, o germoplasma de Bourbon pertencente a Epamig apresenta variabilidade genética que pode ser explorada nos programas de melhoramento. A análise de fingerprinting permitiu identificar os perfis moleculares de cada acesso de Bourbon avaliado, os quais podem ser utilizados na identificação dos cafeeiros no banco. Dessa forma, os resultados obtidos nesse estudo fornecem subsídios para a manutenção e conservação da coleção de germoplasma de Bourbon. Além disso, deve auxiliar os melhoristas na escolha de genitores para possíveis hibridações em programas de melhoramento que buscam o desenvolvimento de cultivares com potencial para qualidade de bebida. / With the increasing demand of specialty coffee in the world, the Brazilian coffee producer have demonstrated interest to retake cultivating Bourbon due to its potential of producing high cup quality. So, the breeders are working to incorporate the Bourbon in the breeding programs to develop coffee cultivars with special cup quality. To support the breeding programs, the Agricultural Research Company of Minas Gerais (Epamig) established the active germplasm bank in Patrocínio, MG. This germplasm comprises of 1594 coffee accessions, among these 140 are Bourbons. However, the collection of Bourbon is not well characterized, which interferes with its efficient use for commercial purpose and genetic improvement. This shows the importance of molecular characterization of these genotypes to increase the knowledge about the genetic materials available and incorporated adequately in the genetic improvement of coffee. Thus, the present work was done with the objective of characterizing the Bourbon collections of Epamig using SSR and AFLP molecular markers as a tool to identify the accessions, genetic diversity study and Fingerprinting of the genotypes. In chapter 1, SSR molecular marker combined with discriminant analysis and artificial neural network were used to discriminate the genotypes of Bourbon. The result showed that the artificial neural network is more efficient to classify the accessions of Bourbon than discriminant analysis. It was possible to identify accessions with mixture or with identification problem. In the genetic diversity and fingerprinting analysis presented in chapter 2, SSR and AFLP markers used permitted to separate most of the individuals analyzed. These data suggested that despite the known narrow genetic base of C. arabica, the Bourbon germplasm belonging to Epamig has enough genetic variability that can be exploited in breeding programs. The fingerprinting analysis allowed identifying molecular profile for each accession of Bourbon evaluated that can be used in identification of coffee plants of the germoplasm. Besides this, it can aid the breeders to select the parents for possible hybridization in the breeding programs to develop cultivars with high cup quality potential.
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Diversidade genética de linhagens de feijão preto e “carioca” recomendadas no Brasil nos últimos 50 anos / Multi-environmental analysis of the genetic diversity of black and “carioca” common bean lines recommended in brazil over the last 50 yearsPossobom, Micheli Thaise Della Flora 11 April 2018 (has links)
Submitted by MARCOS LEANDRO TEIXEIRA DE OLIVEIRA (marcosteixeira@ufv.br) on 2018-09-25T14:04:36Z
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Previous issue date: 2018-04-11 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de MInas Gerais / Ao longo de vários anos de melhoramento genético de feijão (Phaseolus vulgaris L.) no Brasil, inúmeras cultivares foram recomendadas, especialmente dos grupos comerciais preto e “carioca”. A cultura do feijoeiro é um dos produtos agrícolas de maior importância econômico-social, devido especialmente à mão-de-obra empregada desde o preparo para a semeadura até chegar ao produto final. O estudo da diversidade genética de linhagens de feijão preto e “carioca” é importante para facilitar o processo de conhecimento e direcionamento dos programas de melhoramento da cultura no país. Assim, os objetivos destes estudos foram: 1) avaliar a diversidade genética das linhagens de feijão preto e “carioca” recomendadas no Brasil nos últimos 50 anos, por meio de técnicas multivariadas, considerando a interação genótipos x ambientes (GxA) e 2) identificar as melhores linhagens de feijão preto e “carioca” para compor blocos de cruzamentos, com base no índice de seleção FAI, o qual se baseia na análise de fatores. Foram utilizadas 77 cultivares e três linhagens elites do programa de melhoramento da Universidade Federal de Viçosa, totalizando 40 genótipos do grupo comercial preto e 40 do “carioca”, avaliadas em sete experimentos, nos municípios de Viçosa e Coimbra-MG, no período de 2013 e 2016. Os resultados do primeiro estudo mostraram interação GxA para todos os 15 caracteres morfoagronômicos avaliados, com predominância de interação do tipo complexa, o que refletiu em diferentes dendrogramas em cada ambiente auferidos pela estatística M 2 de Procrustes. As linhagens recomendadas após a década de 90 apresentaram melhor aspecto de grão e maiores produtividade e massa de 100 grãos, número de vagens por planta, número de grãos por planta e número de grãos por vagem. As linhagens de feijão preto apresentaram arquitetura de planta mais ereta e maior diâmetro do hipocótilo comparadas às de grãos carioca. O número de vagens por planta e aspecto de grãos foram os caracteres que mais contribuíram para a diversidade genética. Há variabilidade genética entre as linhagens dos dois grupos comerciais, bem como entre as linhagens oriundas de diferentes instituições de pesquisa e décadas de recomendação. Linhagens de feijão preto e “carioca” apresentam entre si elevada variabilidade genética, com maior diversidade entre as linhagens de feijão do grupo “carioca” do que as do preto. A estratégia de soma das matrizes de dissimilaridade genética se mostrou eficiente para quantificar a diversidade multiambientes. O segundo estudo baseou-se em oito caracteres morfoagronômicos avaliados em sete ambientes, totalizando 56 caracteres analisadas. Os resultados obtidos a partir do índice FAI, o qual se baseia na análise de fatores, identificaram as linhagens de maior potencial para rendimento de grãos, independente de grupo comercial que são: IPR Campos Gerais, IPR Tiziu, BRS Expedito, IAC Ybaté, Iapar 65, IPR Uirapurú, BRSMG Majestoso, IPR Andorinha, VC 15 e IPR Tuiuiú. As linhagens BRS Valente, IPR Graúna, IPR Uirapurú, BRS Supremo, BRS Esplendor, IPR Tuiuiú, IPR Tiziu, VP 22, IPR Gralha (grupo comercial preto) e BRS Cometa (grupo comercial “carioca”) devem ser consideradas em blocos de cruzamento quando o objetivo for melhorar a arquitetura de planta. As linhagens do grupo comercial “carioca”: VC 15, IAC Alvorada, IPR 139, IAC Formoso, Pérola, IPR Tangará, BRS Estilo, IPR Campos Gerais, IPR Andorinha e IAC Imperador devem ser consideradas em blocos de cruzamento quando o objetivo for melhorar aspectos de grão. O desempenho de linhagens em ambientes favoráveis e desfavoráveis contribui para a escolha de genitores divergentes e deve ser consideradana formação dos blocos de cruzamentos. / Over several years of genetic improvement of common beans (Phaseolus vulgaris L.) in Brazil, numerous cultivars were recommended, especially from the black and "carioca" commercial groups. The common bean crop is one of the agricultural products of major economic and social importance, especially due to the workforce employed from the preparation for sowing to the final product. The study of the genetic diversity of common beans black and "carioca" lines is important to facilitate the process of knowledge and direction of the breeding programs of the culture in the country. Thus, the objectives of these studies were: 1) to evaluate the genetic diversity of black and "carioca" common bean lines recommended in Brazil in the last 50 years, using multivariate techniques and considering genotypes x environments interaction and 2) to recommend the best crosses of lines of black and "carioca" groups based on the FAI selection index, which is based on factor analysis. A total of 77 cultivars and three elite lines of the breeding program of the Federal University of Viçosa were used, totaling 40 genotypes of the commercial black group and 40 of the "carioca" group, evaluated in seven experiments in the municipalities of Viçosa and Coimbra-MG in the period of 2013 and 2016. The results of the first study showed interaction GxE for all 15 morphoagronomic characters evaluated, with a predominance of complex type interaction, which reflected in different dendrograms in each environment obtained by the Procrustes M 2 statistic. The recommended lines after the 90s presented better grain appearance and higher yield and mass of 100 grains, number of pods per plant, number of grains per plant and number of grains per pod. The black common bean lines presented a more erect plant architecture and a larger hypocotyl diameter compared to those of carioca grains. The number of pods per plant and grain aspect were the main contributors to genetic diversity. There is genetic variability between the lines of the two commercial groups, as well as between the lines coming from different research institutions and decades of recommendation. Black and "carioca" common bean lines have high genetic variability among them, with greater diversity among the common bean lines of the carioca group than those of black. The sum strategy of the genetic dissimilarity matrices was shown to be efficient in quantifying the multienvironmental diversity. The second study was based on eight morphoagronomic characters evaluated in seven environments, totaling 56 analyzed variables. The results obtained from the FAI index, which is based on the analysis of factors, identified the 10 lines of greatest potential for grain yield, independent of commercial group: IPR Campos Gerais, IPR Tiziu, BRS Expedito, IAC Ybaté, Iapar 65, IPR Uirapurú, BRSMG Majestoso, IPR Andorinha, VC 15 e IPR Tuiuiú. The lines BRS Valente, IPR Graúna, IPR Uirapurú, BRS Supremo, BRS Esplendor, IPR Tuiuiú, IPR Tiziu, VP 22, IPR Gralha (black commercial group) and BRS Cometa ("carioca" commercial group) should be considered in crossing blocks when the aim is to improve plant architecture. The lines of the "carioca" commercial group: VC 15, IAC Alvorada, IPR 139, IAC Formoso, Pérola, IPR Tangará, BRS Estilo, IPR Campos Gerais, IPR Formoso and IAC Imperador should be considered in crossing blocks when the objective is to improve aspects of grain. The performance of lines in favorable and unfavorable environments contributes to the choice of divergent parents and should be considered as the formation of crossing blocks.
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