Avanços na área da genômica têm propiciado a inclusão da informação genômica no melhoramento genético animal. O sucesso de sua utilização depende da extensão do desequilíbrio de ligação (DL) entre marcadores e QTL, do número de animais genotipados no grupo de treinamento (GT) e da h2 da característica. O conhecimento de parâmetros de diversidade genética tais como endogamia e tamanho efetivo da população (Ne), associados ao aumento dos níveis de DL, são úteis no estudo da viabilidade da seleção genômica. Com o objetivo de estimar estes parâmetros em uma população de gado de corte, bovinos Nelore foram estudados através de uma análise de pedigree. O Ne estimado foi de 114, 245 e 101 para os anos de 95-99, 99-03 e 03-07, respectivamente. Para estimar a acurácia do valor genômico direto (VGD) foram simuladas duas populações com estrutura de DL semelhante àquela em gado de corte com 40k (POP1) e 800k (POP2) marcadores SNP. O DL entre os SNP adjacentes, medido pelo r2, foi de 0,25 e 0,32 e o Ne foi de 250 e 120 para POP1 e POP2, respectivamente. Para POP1, GT foram formados por 1920, 960 e 480 touros com acurácia média do valor genético estimado (VGE) de 0,79, 0,90 e 0,94 para h2 0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente, e para POP2, 480 touros com a mesma acurácia média dos VGE. Outros dois GT (7680 e 1920 para POP1 e POP2) foram formados por animais com fenótipo disponível para estimar os efeitos dos marcadores ao invés do VGE. A acurácia do VGD aumentou significativamente (p<0,05) com o aumento do número de touros no GT, h2 e densidade dos marcadores. O número de animais no GT teve um efeito quadrático sobre as acurácias do VGD para todas as h2(p<0,0001). Para a POP1, a acurácia mais alta (0,64) foi observada para h2=0,40 e n=1920. As acurácias do VGD na POP2 foram maiores (de 16% a 24%) do que aquelas para 40k SNP e n=480 e similares àquelas para 40k SNP e n=960. Aumentar em 4 vezes o GT e usar fenótipos para calcular os efeitos dos marcadores não foi suficiente para manter ou aumentar a acurácia do VGD para h2<0,40, tanto para POP1, como POP2. Os resultados obtidos quando o número de SNP foi aumentado de 40k para 800k SNP com n=480 indicou que o painel mais denso requer 2 vezes menos touros no GT do que 40k SNP para produzir acurácias do VGD similares. Os resultados sugerem que a seleção genômica pode trazer ganhos em acurácia na ordem de 27, 13 e 10%, considerando n=1920 e h2=0,10, 0,25 e 0,40, respectivamente e 7% para n=960 e h2=0,10 com relação aos VGE de animais jovens (média dos pais). Estes níveis de ganho foram menores do que aqueles relatados para gado de leite. Portanto, justificam-se mais trabalhos de pesquisa nesta área. / Advances in genomics have led to the inclusion of genomic information in livestock breeding. The success of its use depends mainly on the extent of linkage disequilibrium (LD) between markers and QTL, the number of genotyped animals in the training set (TS), and the heritability of the trait. The knowledge of genetic diversity parameters such as rate of inbreeding and the effective population size (Ne) which are associated with the increase in LD levels is useful for studying the feasibility of genomic selection. Aiming to estimate these parameters in beef cattle, a population of Nellore cattle was studied by pedigree analysis. The Ne was estimated to be 114, 245 and 101 for the years 95-99, 99-03 and 03-07, respectively. Aiming to estimate the accuracy of genomic selection, two populations were simulated with a LD structure similar to that in beef cattle with 40k (POP1) and 800k (POP2) SNP markers. The LD between adjacent markers, as measured by r2, was 0.25 and 0.32 and Ne was 250 and 120 for POP1 and POP2, respectively. TS were formed by 1920, 960 and 480 bulls with EBV with mean accuracy of 0.79, 0.90 and 0.94 for h2 of 0.10, 0.25 and 0.40, respectively, for POP1, and 480 bulls with the same average accuracies of EBV for POP2. Two large TS (7680 and 1920 for POP1 and POP2) were composed by animals with phenotypic information to estimate the marker effects, rather than EBV. The accuracy of direct genomic EBV (DGEBV) increased significantly (p<0.05) with the increasing of number of bulls in the TS, h2 and density of the markers. The number of animals in the TS showed a quadratic effect on the accuracy of DGEBV (p<0.0001) for all h2. For POP1, the highest accuracy (0.64) was observed for h2 of 0.40 and 1920 bulls in TS. The accuracies of DGEBV in POP2 were higher (from 16% to 24%) than those from 40K SNP and 480 bulls in the TS and similar to those from 40K SNP and 960 bulls in TS. Increasing the number of animals in TS by 4-fold and using phenotypes to calculate the marker effects was not enough to maintain or increase the accuracy of DGEBV estimated using EBV as response variable to estimate the marker effects, when the h2 was lower than 0.40 for both POP1 as POP2. Results of increasing the number of markers from 40k to 800k with a TS of 480 genotyped bulls indicate that the high density marker panel would require 2 times less bulls in the TS than 40K for yielding similar accuracies of DGEBV. The results suggest that genomic selection can bring gains in accuracy of 27, 13 and 10%, considering 1920 bulls in the TS for h2=0.10, 0.25 and 0.40, respectively, and 7% for TS of 960 bulls and h2=0.10 when compared to the parent average of young animals. These gains were lower than those reported in dairy cattle. Therefore, more investigations are warranted.

O objetivo deste estudo foi estimar parâmetros genéticos e fenotípicos para 21 características lineares de tipo bem como a pontuação final e as características de produção de leite (PL), gordura (PG) e proteína (PP) em rebanhos de bovinos leiteiros da raça holandesa no Brasil. Os 18,5 mil registros utilizados neste estudo foram coletados por técnicos da Associação Brasileira de Criadores de Bovinos da Raça Holandesa entre os anos 1994 e 2004. As estimativas dos componentes de (co)variância e dos parâmetros genéticos e fenotípicos das características foram realizadas pelo método da máxima verossimilhança restrita livre de derivações por meio de modelos animal multicaráter. O processamento das análises com 22 características avaliadas simultaneamente foi realizado no Centro Nacional de Processamento de Alto Desempenho, São Paulo, através do ambiente operacional SGI Altix – 1350. As estimativas de herdabilidade para as características lineares de tipo variaram de 0,09 e 0,39 e para as PL, PG e PP variaram entre 0,17 e 0,24 indicando haver variabilidade genética aditiva suficiente para que ganhos genéticos moderados possam ser obtidos por seleção. As correlações fenotípicas entre as características lineares de tipo foram em geral positivas e de magnitude moderada, entretanto, as correlações genéticas variaram entre -0,44 e 0,85. As estimativas de correlações genéticas entre as características lineares de tipo com as características produtivas (PL, PG e PP) foram em geral de baixa magnitude. O antagonismo genético indesejável entre algumas características de tipo e produtivas deverá ser levado em consideração no momento da seleção, uma vez que a seleção para características produtivas pode levar à deteriorização de algumas características conformacionais. Quando o objetivo de seleção for melhorar as características lineares de tipo, a pontuação final poderá ser utilizada como critério de seleção por estar correlacionada geneticamente e de forma moderada com a maioria das características Entretanto, ao selecionar as vacas de maior pontuação final não se deve esperar aumento significativo no volume de PL, PG e PP, sendo a utilização de índices de seleção uma ferramenta indicada para o processo de seleção genética dos animais. / The objective of this study was to estimate genetic and phenotypic parameters for 21 linear type traits over the final score and milk yield traits (MY), fat (FY) and protein (PP) in herds of Holstein dairy cattle in Brazil. The 18,500 records used in this study were collected by staff of the Brazilian Association of Cattle Breeders of Holstein between 1994 and 2004. Estimates of (co)variance and genetic and phenotypic parameters were determined by the method of maximum likelihood derivative-free restricted through multiple trait animal models. The analyses were processed in Sao Paulo through the operating environment SGI Altix - 1350 provided by the National Center for High Performance. The heritability estimates between linear type traits ranged between 0.09 and 0.39 and between PL, PG and PP between 0.17 and 0.24 indicating there sufficient genetic variability to obtain moderate genetic gains by selection. The phenotypic correlations between linear type traits were generally positive and of moderate magnitude, however, genetic correlations varied widely between -0.44 and 0.85 indicating that some could be excluded from the classification linear system currently adopted by the ABCBRH. Estimates of genetic correlations between linear type traits and yield traits (PL, PG and PP) were generally of low magnitude. The genetic antagonism between some type traits and yield should be taken into account at the time of selection, since, in many Brazilian herd, less productive cows are discarded. When the goal is to improve the selection of linear type traits the final score can be used as a selection tool to be genetically and correlated moderately with the most features, however, when the selection criterion is not the final score expect significant improvements in the characteristics of PL, PG and PP, with the use of selection indices indicated a tool for the process of genetic selection of animals.

O êxito na seleção de plantas geneticamente superiores está diretamente relacionado à existência de variabilidade genética apresentada naturalmente ou artificialmente. No entanto, o melhoramento de espécies apomíticas é dificultado pela impossibilidade de ocorrer a união de gametas com plantas deste modo de reprodução. Por outro lado, a utilização de plantas sexuais compatíveis a cruzamentos com plantas apomíticas, podem gerar novas combinações gênicas e indivíduos com alta heterose podem ser selecionados já na primeira geração para lançamento como novas cultivares. A descoberta de plantas diplóides sexuais em populações naturais de Paspalum plicatulum e a posterior duplicação das mesmas possibilitaram um grande universo no desenvolvimento de novos genótipos a partir de cruzamentos entre espécies relacionadas. O objetivo do trabalho foi de: (i) avaliar a produção de forragem de genótipos nativos superiores de espécies do gênero Paspalum; (ii) caracterizar a estabilidade e adaptabilidade de produção destes genótipos; (iii) estimar através de técnicas da genética quantitativa, a herdabilidade e a associação entre caracteres de importância forrageira; (iv) obter variabilidade genética por meio de hibridizações interespecíficas, utilizando genótipos superiores nativos de P. lepton e de P. guenoarum como genitores masculinos (apomíticos) e um genótipo de P. plicatulum como genitor feminino (sexual); (v) analisar as progênies superiores quanto ao modo de reprodução selecionando plantas estáveis reprodutivamente para lançamento como cultivares e as de reprodução sexual para novos cruzamentos. Os genótipos das espécies de P. lepton e P. guenoarum apresentam variabilidade genética em caracteres de interesse forrageiro, bem como desempenho variável de acordo com o local e o ano de cultivo. A produção de matéria seca total e de folhas são os caracteres que mais contribuem para a detecção da variabilidade genética observada, independentemente do ano de avaliação. O ganho genético na produção de folhas se mostra eficiente via seleção indireta pela matéria seca total, caráter de alta herdabilidade e de mais fácil seleção e aferição. Houve ampla variabilidade nos caracteres ligados a produção de forragem e alguns híbridos apresentaram heterose para a maioria dos caracteres analisados. A maioria das progênies selecionadas apresentaram a apomixia como modo de reprodução, o que potencializa o lançamento como cultivar. Já as plantas sexuais superiores serão usadas para recombinação com os melhores híbridos para obtenção de novas constituições genéticas. Os dendrogramas obtidos em nível de campo e de DNA foram capazes de discriminar os genótipos e podem auxiliar na orientação em novas hibridizações com plantas sexuais compatíveis. Houve pouca variabilidade na composição química entre os genótipos. Mais estudos deverão ser realizados para viabilizar o desenvolvimento de cultivares no uso em pastagens naturais, assim como no emprego como pastagens cultivadas. / The successful selection of genetically superior plants is directly related to the existence of natural or artificial genetic variability. However, the breeding of apomictic species is hampered by the inability of the union of gametes with plants of this mode of reproduction. In another hand, the use of sexual plants compatible to crosses with apomictic plants can generate new genetic combinations, and individuals with high heterosis can be selected on the first generation and releasae as new cultivars. The discovery of sexual diploid plants in natural populations of Paspalum plicatulum and their subsequent duplication to do possible the development of new genotypes from crosses between closely related species. Thus, this study aimed to: (i) evaluate the forage yield of superior genotypes of native species of Paspalum, (ii) characterize the stability and adaptability of production of these genotypes; (iii) estimate using techniques of quantitative genetics, the heritability and its association between important forage characters; (iv) get a genetic variability through interspecific hybridization, using superior genotypes of native P. lepton and P. guenoarum as male parents (apomictic) and one genotype of P. plicatulum as female parent (sexual); (v) analyze the superior progenies to reproduction, selecting plants reproductively stable for releasing as cultivars and, of sexual reproduction for new crossings. The genotypes of the species P. lepton and P. guenoarum take a genetic variation in their traits of interest forage; furthermore, their performance depend of location and year of cultivation. The total dry matter production and leaf are the traits that most contribute to the detection of genetic variability, independent of the year of evaluation. The genetic gain in leaf production is efficient to indirect selection for total dry matter; this character present high heritability and, easier selection and estimation. There was wide variability in characters linked to forage production and some hybrids showed heterosis for most traits analyzed. Moreover, most of the selected progenies showed apomixis as reproductive mode, which enhances the release as cultivar. The sexual plants should be used for recombination with the best hybrids to get new genetic constitutions. The dendrograms obtained through field and DNA characteristics were able to discriminate genotypes and could help to get new sexual hybridizations with compatible plants. A little variability in chemical composition between genotypes was observed. Thus, more studies should be conducted to enable the development of cultivars to use on native rangelands, even as the employment as pastures.

Foi desenvolvido um modelo bioeconômico para calcular valores econômicos para caracteres dos objetivos de seleção em sistemas de produção de ciclo completo e propor índices de seleção econômicos com base nos critérios de seleção utilizado no programa de melhoramento da raça Aberdeen Angus no estado do Rio Grande do Sul. As informações de parâmetros biológicos e econômicos utilizados nos cálculos são provenientes das propriedades, de outros estudos e do programa de melhoramento da raça - PROMEBO. Foram usadas planilhas Excel para o desenvolvimento do modelo. Os valores econômicos foram estimados para os objetivos de seleção de sistemas de produção de ciclo completo, sendo estes o número de bezerros desmamados (NBD) e peso ao abate (PA). Para avaliar o impacto das mudanças no desempenho dos caracteres sobre o lucro total do sistema de produção, os valores iniciais dos caracteres foram aumentados em 1%. Os caracteres são expressos em reais por unidade de mudança no caráter e foram calculados na base vaca/ano. Os valores econômicos para NBD e PA foram respectivamente R$ 6,65 e R$ 1,43. A partir das matrizes de (co)variância genética entre os objetivos e os critérios de seleção foram calculados ponderadores econômicos para os critérios de seleção utilizados no PROMEBO, estes são os seguintes: peso (P) a desmama (D) e ao sobreano (S), conformação (C), precocidade (G) e musculatura (M) a desmama e ao sobreano e perímetro escrotal (PE). Os ponderadores econômicos para PD, CD, GD e MS foram positivos e variarem de 2,61 a 0,62 reais. Para PS, CS, GS, MS e PE os ponderadores variaram de 1,40 a 0,004 reais. O índice de seleção a desmama alocaria 44,77% de ênfase para PD, 14,24% para CD, 30,36% para GD e 10,63% para MD. O índice de sobreano daria ênfase de 77,61% para PS, 4,99% para CS, 11,09% para GS, 6,10% para MD e 0,22% para PE. O caráter que mais impactou economicamente o sistema de produção de ciclo completo usando pastagem foi o reprodutivo, NBD, já o PA teve importância econômica positiva no sistema de produção, indicando que a seleção para esses caracteres aumentará a lucratividade do sistema. Os ponderadores econômicos para os caracteres ponderais e escores visuais de C, P e M e PE foram positivos indicando que esses caracteres podem ser usados na seleção dos animais que irão contribuir para incrementar a lucratividade do sistema de produção. / We developed a bio-economic model to estimate economic values for traits of breeding goals in production systems and propose full cycle economic selection indexes based on the criteria selection used in the breeding program Aberdeen Angus breed in the state of Rio Grande do Sul. Biological and economics information parameters used in the calculations are derived from the properties of other studies and the breeding program of the breed - PROMEBO. Excel spreadsheets were used for model development. Economic values were estimated for the purposes of selection of complete cycle systems production, the number of weaned calves (NCW) and slaughter weight (SW). In order to assess the impact of changes in the performance of the characters on the overall profitability of the production system, the initial values of the characters were increased by 1%. The characters are expressed in Real(R$) per unit change in character, and were based on cow / year. The economic values for NCW and SW were respectively R$ 6,65 and R$ 1,43. From the matrix of (co)variance components, between the objectives and the criteria of selection, we have calculated economic weights for selection criteria used in PROMEBO as the following: weight (W) weaning (W) and yearling (Y), conformation (C), precocity (P) and muscle (M) and weaning and yearling scrotal circumference (SC). The economic weights for WW, CW, PW and MW were positive and ranged from 2,61 to 0,62 reais. PY, CY, GY, MY and SC the weight ranged from 1,40 to 0,004 reais. The weaning selection index allocates 44.77% of emphasis for PW, 14.24% for CW, 30.36% to 10.63% for GW and MW. The index for yearling give emphasis 77.61% for PY, 4.99% for CY, 11.09% for GY, 6.10% to 0.22% for MY and SC. The character that most impacted economically production system complete cycle using grazing was the reproductive NCW. The SW had positive economic importance in the production system, indicating that selection for these characters increase the profitability of the system. The economic weights for traits and visual scores by weight for C, P and M and SC were positive, indicating that these characters can be used in the selection of animals that will contribute to increase the profitability of the production system.

Orientador: Sandra Helena Unêda Trevisoli / Coorientador: Antonio Orlando Di Mauro / Banca: Gustavo Vitti Moro / Banca: Everton Luis Finoto / Resumo: No melhoramento genético da cultura da soja, o processo de seleção é complexo e altamente influenciado pelo ambiente. Uma das alternativas para facilitar esse processo é a utilização de índices de seleção, possibilitando a seleção de genótipos desejáveis em gerações iniciais de programas de melhoramento. O objetivo do presente trabalho consistiu em comparar diferentes índices de seleção em populações segregantes de soja, indicando os métodos superiores em várias situações e pesos econômicos propostos, visando maiores ganhos. Foi utilizada a seleção direta e indireta, índice clássico de Smith e Hazel, índice baseado em soma de "ranks" de Mulamba e Mock, índice base de Willians, índice baseado nos ganhos desejados de Pesek e Baker e índice da distância genótipo-ideótipo. O material genético consistiu de sete populações de soja em geração F5, totalizando 386 progênies no delineamento de blocos aumentados de Federer, sendo avaliados os caracteres número de dias para maturidade, altura de planta na maturidade, altura de inserção da primeira vagem, acamamento, valor agronômico, número de vagens por planta, teor de óleo e produtividade de grãos. O índice clássico e índice base foram os que apresentaram menores variações quanto aos ganhos obtidos nas diferentes situações e pesos econômicos estudados. O índice baseado na soma de "ranks" utilizando os caracteres valor agronômico e produtividade de grãos como caracteres principais, além do peso econômico 1 (um) proporcionou os ganhos mais favoráveis no presente estudo / Abstract: In soybean breeding, the selection process is complex and highly influenced by the environment. An alternative to facilitate this process is the use of selection indexes, thus making possible the selection of desirable genotypes in early generations of breeding programs. The main this work was to compare different selection indexes in segregating soybean populations, indicating the superior methods in some situations and proposed economic weights, aiming higher gains. Were used the indexes direct and indirect selection, classical index of Smith and Hazel, index based sum of "ranks" of Mulamba and Mock, index base of Williams, index based desired gains of Pesek and Baker and index of genotype-idiotype distance. The genetic material consisted of seven soybean populations in the F5 generation, totaling 386 progenies in randomized block Federer, for traits number of days to maturity, plant height at maturity, height of the first pod, lodging, agronomic value, number of pods per plant, oil content and yield grain. The classic and base indexes presented lower variations in relation to the gains obtained in different situations and studied economic weights. The index based on the sum of "ranks" with the characters agronomic value and grain yield as a major economic burden beyond one (1) provided the most favorable gains in the present study / Mestre

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-20T21:17:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 198542.pdf: 176332 bytes, checksum: c8e942795d6238ccd39b348930536c88 (MD5) / O Passiflora alata é uma planta frutífera que vem despertando interesse econômico por suas características estéticas, medicinais, organolépticas e nutricionais. Contudo, precisam ser superados alguns entraves tecnológicos em relação ao seu cultivo, tais como: a ausência de cultivares que apresentem frutos com alto rendimento de polpa, casca fina e elevado grau Brix. Neste trabalho, objetivou-se analisar as bases genéticas das características do fruto do maracujazeiro doce, avaliando-se a capacidade combinatória em plantas e a herdabilidade de características do fruto, estimando-se, ainda, o progresso genético esperado. Verificaram-se, também, os fatores que afetam a conservação e viabilidade do grão-de-pólen, bem como as metodologias de armazenamento e superação de dormência de sementes e métodos para produção de mudas. A conservação do grão-de-pólen foi feita em diferentes condições de temperaturas (ambiente, 5oC e -10oC) e de tempo (24 h e 48 h). Sua viabilidade foi testada em diferentes concentrações de ácido bórico e sacarose. A melhor conservação deu-se à temperatura ambiente por um período máximo de 24 horas e a maior taxa de germinação (80,3%) deu-se em ausência de ácido bórico e 50 g/L de sacarose. Foram testadas metodologia de armazenamento de sementes em diferentes temperaturas (5o C, -10o C e temperatura ambiente) e tempo (30, 60, 90, 120 e 240 dias). O armazenamento em geladeira, porporcionou a porcentagem de germinação média de 72,2%, o valor mais alto em relação aos demais tratamentos. Para superação da dormência das sementes testaram-se condições de frio (5o C, -10o C), calor (38o C) e a punctura. Os resultados obtidos mostraram que sementes aquecidas superam melhor a dormência, que as demais condições, apresentando o maior percentual de germinação (86,6%). Para produção de mudas através de estacas, foram testadas diferentes concentrações de AIB (0, 500, 1000, 1500 e 2000 ppm) e substratos (industrializado e composto). As maiores taxas de enraizamento foram observadas em soluções de AIB na concentração de 1500 ppm e 2000 ppm, com uma porcentagem média de enraizamento de 87,5% e 90,5%, respectivamente, podendo ser utilizados substratos industrializados ou composto, pois não houve diferença, estatisticamente significativas entre eles. O dialelo desse trabalho foi parcial, envolvendo F1s e os genitores. Foram estimadas a CGC, a CEC, a herdabilidade e progresso genético esperado para as características: peso do fruto, peso da polpa, espessura da casca, grau Brix e rendimento de polpa. Não foram encontradas diferenças, estatisticamente, significativas para CGC nas características: peso do fruto, peso da polpa e grau Brix. Em relação à CEC, não encontraram-se diferenças estatisticamente significativas, para todas as características analisadas, o que demonstra haver a predominância de variabilidade para efeitos gênicos aditivos, devendo-se, por isso, fazer seleção para características com maior herdabilidade. Dos genitores destacaram-se a mãe 2, a mãe 6 e o pai 5, por exibirem a melhor média do ranking, sendo plantas promissoras para possíveis cruzamentos dirigidos, visando a obtenção de progênies superiores para as características avaliadas.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. / Made available in DSpace on 2012-10-18T11:51:45Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O arroz (Oryza sativa L.) é um dos alimentos mais importantes no mundo, consumido diariamente por mais da metade da população humana. A estreita base genética dos programas de melhoramento e o uso inadequado da variabilidade genética são alguns dos principais fatores que impedem as novas variedades de ultrapassar os atuais patamares de produtividade. A exploração do vigor híbrido em arroz tem potencial para ultrapassar os patamares de produtividade na maioria dos programas de melhoramento. Isto é limitado pela inerente dificuldade em obter e testar as novas combinações híbridas, devido ao hábito de autogamia da espécie. O presente usou marcadores moleculares para avaliar recursos genéticos de arroz (acessos, linhagens e variedades) conservadas pelo Banco Brasileiro de Germoplasma de Arroz, bem como linhagens do Programa de Produção de Híbridos de Arroz através do sistema de macho-esterilidade citoplasmática (CMS) estabelecido pela EMBRAPA. Novas ferramentas para análise molecular foram desenvolvidas durante o trabalho, gerando dados para análise genética do germoplasma de arroz e para estudar a correlação entre heterose e distância genética (DG) de parentais. Marcadores RAPD e SSR foram usados na avaliação de 108 acessos de arroz de sequeiro e irrigado representando a base do melhoramento de arroz no Brasil ('coleção referência' de arroz - CR), incluindo 21 progenitores da população de seleção recorrente CNA-5, dois acessos de O. glumaepatula e um de O. rufipogon. As amostras de O. sativa foram classificadas nas subespécies indica ou japonica usando (1) estimativas de similaridade genética e análise de agrupamento baseada em marcadores RAPD e SSR polimórficos, (2) descritores morfológicos e botânicos, (3) sistema de cultivo (sequeiro ou irrigado) e (4) marcadores RAPD específicos para indica ou japonica. Treze marcadores SSR previamente mapeados nos cromossomos de arroz foram selecionados e caracterizados quanto ao número de alelos, amplitude alélica e diversidade genética nos 108 acessos de O. sativa da CR. As freqüências alélicas foram computadas em cada loco e podem agora ser usadas como um banco de dados referência para acuradas análises de vínculo genético em arroz, como requerida para testes de paternidade de híbridos, análises de contaminação de amostras e proteção de cultivares. Dois sistemas multiplex foram desenvolvidos permitindo genotipagem rápida e fiel de 11 locos SSR através de detecção fluorescente em seqüenciadores automáticos de DNA. O polimorfismo destes locos foi utilizado em estimativas de DG entre quatro linhagens macho-estéreis e suas mantenedoras. DG par-a-par de quatro linhagens macho-estéreis, 45 mantenedoras e 224 linhagens restauradoras foram estimadas com marcadores RAPD. As linhagens restauradoras foram classificadas em três categorias de acordo com sua similaridade genética (alto, intermediário e baixo) em relação às quatro linhagens macho-estéreis. Um total de 70 híbridos foram formados, baseados nos níveis de similaridade genética entre as linhagens macho-estéreis e restauradoras. Os híbridos foram avaliados para produtividade, componentes de produtividade, características agronômicas em experimento de campo e estudo de correlação entre DG e heterose foi realizado. Análises de agrupamento baseados em 114 marcadores RAPD e 13 locos SSR detectaram forte estruturação genética da CR em dois grupos correspondentes às subespécies indica (36 % dos acessos) e japonica (64 % dos acessos). Os dados indicaram que alguns acessos são, provavelmente derivados de cruzamento inter-subespecífico indica x japonica (I/J). A classificação dos acessos de arroz nas subespécies indica e japonica foi consistente entre os diferentes métodos empregados, com exceção do sistema de cultivo (irrigado e de sequeiro). Das 267 linhagens CMS analisadas com os quatro marcadores RAPD específicos, nove foram classificadas como japonica, 104 como indica e 158 como possíveis intercruzamentos (I/J) entre as duas subespécies. Os dados revelaram que algumas mantenedoras tem background genético (japonica) diferente do observado nas linhagens macho-estéreis (indica). Polimorfismo entre linhagens macho-estéreis e suas mantenedoras, detectadas com os 11 locos SSR dos sistemas multiplex confirmaram estas diferenças. Os novos híbridos apresentaram produtividade maior que as variedades usadas como controle, chegando a 9,8 t/ha. Diferença estatisticamente significativa entre híbridos formados de cruzamentos indica x indica e indica x japonica foram detectadas em algumas variáveis. Correlação entre DG e heterose foi observada em algumas combinações genotípicas específicas. Entretanto, os dados não permitem uma clara relação entre DG e heterose no germoplasma estudado.

Made available in DSpace on 2015-12-10T14:22:36Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-08-21. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-10T14:28:44Z : No. of bitstreams: 1 000855250.pdf: 2535486 bytes, checksum: 5d8b7cecfb97546d917816b7cc767217 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A descoberta da heterose proporcionou o desenvolvimento de híbridos de milho altamente produtivos. Entretanto, questionamentos são levantados com relação à eficiência de testadores para a seleção de linhagens superiores. Assim, este trabalho teve por objetivo estimar a capacidade de combinação de genótipos utilizando testadores de diferentes origens e a aplicação dessa informação para seleção de genótipos superiores. O ensaio foi conduzido na safra 2012/2013 na área experimental da Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) da Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da UNESP, câmpus de Jaboticabal - SP. O experimento constou de seis testadores que foram cruzados em esquema topcross com uma população de 39 genótipos de milho. Esses topcrosses foram avaliados, para a produtividade de grãos (kg·ha-1), em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições para cada tratamento. Os dados obtidos foram submetidos à análise de variância e estimadas as capacidades de combinação dos 39 genótipos. Em seguida, realizou-se a correlação para verificar o nível de semelhança entre os topcrosses dos diferentes testadores. Também foi utilizado o método REML/BLUP, para comparação com os dados das capacidades de combinação. Concluiu-se que as informações da capacidade de combinação e REML/BLUP podem ser utilizadas para a seleção de genótipos de milho. A associação entre as informações das capacidades de combinação e dos BLUPs variou em função do testador utilizado, mas, de forma geral, apresentaram valores elevados. As metodologias de capacidade de combinação e REML/BLUP podem ser utilizadas de forma alternativa para comparar um testador, mas, serão complementares quando o objetivo for comparar mais de um testador. Embora correlações significativas tenham sido encontradas entre os testadores, as estimativas são de baixa magnitude, não sendo suficientes para descartar... / The heterosis discovery enabled the development of highly productive corn hybrids. However, some questions about the efficiency of testers for selection of superior lines are found. This work aims to study the combining ability of testers from different genetic structures with a population of inbred lines. The trial was conducted in 2012/2013 in the experimental area of Fazenda de Ensino, Pesquisa e Extensão (FEPE) of Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias da UNESP, Jaboticabal - SP. The experiment consisted of six different testers that were crossed in topcross scheme with a population of 39 maize genotypes. These topcrosses were evaluated in experimental design of randomized blocks with two replications for each treatment. The agronomic trait evaluated was grain yield obtained by the average grain weight of the portions of each topcross. Data were subjected to variance analysis. With the averages for the different testers, the combining abilities of the 39 genotypes were estimated. Then the data were subjected to correlation analysis to check the level of similarity between the testers. Data were also subjected to analysis by REML/BLUP method and compared with data from the combining abilities. It was concluded that the combination ability information and REML/BLUP can be used for selecting maize genotypes. The association between the information of the combining ability and BLUP varied depending on the tester used, but, in general, showed high values. The combining ability and REML/BLUP can be used alternatively to compare a tester, but, they will be complementary when the objective is to compare more than one tester. Significant correlations were found between the testers, but the estimates are low magnitude, thus, this is not sufficient to exclude the combining ability, even with related testers. The testers classified differently the genotypes and could be necessary to use more than one tester for greater efficiency ...

Made available in DSpace on 2015-06-17T19:34:42Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-13. Added 1 bitstream(s) on 2015-06-18T12:47:13Z : No. of bitstreams: 1 000830376.pdf: 303358 bytes, checksum: 682ad4fac9fb38aa52a89d4c21148b47 (MD5) / Em programas de melhoramento florestal a seleção de espécies e procedências dentro das melhores espécies são os dois mais importantes passos, pois são nestas fases que os maiores ganhos genético são capitalizados. Isso é feito utilizando-se teste de espécies e procedências, estabelecidos nos locais de interesse e avaliando-se caracteres de crescimento e sobrevivência. Este trabalho teve como por objetivo a seleção de espécies e procedências de Pinus para a região de Assis, estado de São Paulo. O teste de espécie e procedências foi instalado na Floresta Estadual de Assis, na região oeste do estado de São Paulo. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três tratamentos representado as espécies (Pinus oocarpa, P. maximinoi e P. tecunumanii) e duas a três procedências, quatro repetições (blocos) e parcelas quadradas com 49 plantas (7 x 7), obedecendo o espaçamento de 3 x 2,5 m. Aos 21 anos após o plantio foram mensurados os caracteres diâmetro a altura do peito (DAP), altura total (ALT), volume real individual (VOL) e a taxa de sobrevivência (SOB). Diferenças significativas entre as espécies foram detectadas apenas para o caractere SOB, indicando a possibilidade de seleção entre espécies. A divergência genética entre espécies variou entre os caracteres de zero a 0,4326, indicando que a maior parte da variabilidade genética para os caracteres se encontra distribuída dentro das espécies e que as diferenças genéticas entre as espécies para ALT, VOL e SOB são maiores do que as diferenças entre as procedências estudadas. Embora não há diferenças significativas, comparando a média dos caracteres entre as espécies, P. oocarpa apresentou os maiores valores para os caracteres ALT, VOL e SOBRE e P. maximinoi o maior crescimento em DAP. Foram observadas correlações fenotípicas significativas, positivas e altas entre os caracteres ... / In forest breeding programs the selection of species and provenances of the best species are the two most important steps because in these steps the largest genetic gains are capitalized . This is done by using species and provenance test established in the sites of interest and evaluating growth and survival traits. This work aimed the selection of species and provenances of Pinus species for the region of Assis, state of São Paulo. The test was installed in Assis State Forest, in the western region of São Paulo. The experimental design was a randomized complete block design with three treatments represented species (Pinus oocarpa, P. maximinoi and P; tecunumanii) and two to three provenances, represented the provenances within species, four replications (blocks) and square plots with 49 plants (7 x 7), in a spacing of 3 x 2.5 m. After 21 years of planting, were measured the diameter at breast height (DBH), total height (ALT), individual real volume (VOL) and the survival rate (SOB) in the trial. Significant differences among species were detected only for SOB, indicating the possibility of selection among species. The genetic divergence between species varied between zero to 0.4326, which indicates that most of genetic variability for the traits is distributed within species and that the genetic differences between species for ALT, VOL and SOBRE are more salient than the difference between the provenances studied. Although no significant differences comparing the average of traits among species, P. oocarpa showed the highest values for ALT; VOL and SOB and P. maximinoi the highest growth in DBH. Significant positive correlations were observed between the DAPxALT (0,403; p<0,05), DAPxVOL (0,792; p<0,01), ALTxVOL (0,874; p<0,01). Thus, there is the possibility to select individuals of three species based on phenotypic observations in a trait and indirectly change the average phenotypic of other ...

Made available in DSpace on 2015-08-20T17:09:52Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2015-02-27. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-20T17:26:15Z : No. of bitstreams: 1 000842962.pdf: 965678 bytes, checksum: 6c1d0244aa6bb2af45e10fed095e5a30 (MD5) / Os objetivos deste trabalho foram determinar o número ideal de repetições, de plantas por parcela e de avaliações para características de crescimento e a viabilidade do uso da seleção precoce em testes clonais de eucalipto, com vistas a inferir de maneira fidedigna sobre o valor real do indivíduo no ambiente que o mesmo se encontra, permitindo assim, precisão nas estimativas de parâmetros genéticos e ganhos com a seleção precoce. Foram utilizados dados de três testes clonais de híbridos de eucalipto, avaliando-se o diâmetro à altura do peito (DAP), altura e volume comercial sem casca. O delineamento experimental utilizado para os três testes clonais foi o de blocos casualizados com seis repetições, dois testes com 30 clones e um com dez clones, com parcelas de seis ou 10 plantas. Para todas as características foram estimados o coeficiente de repetibilidade, o número ideal de repetições, de plantas por parcela e avaliações para inferir sobre o valor real do indivíduo e ganhos genéticos para a característica volume na idade adulta (72 meses) com a seleção precoce de indivíduos. Testes clonais de eucalipto, visando o melhoramento no curto prazo, cujo objetivo da seleção é maximizar o ganho na geração atual para as três características avaliadas neste trabalho (diâmetro, altura e volume) simultaneamente, necessitam de 3 repetições com 6 plantas por parcela e avaliada em três idades para uma acurácia seletiva em torno de 90%. A seleção de indivíduos superiores nas idades juvenis (acima de dois anos), em testes clonais de eucalipto, possibilita ganhos genéticos na idade adulta, sendo vantajoso principalmente a seleção para o caráter diâmetro a altura do peito (DAP), para se obter ganhos futura e indiretamente para o caráter volume / The objectives of this study were to determine the optimal number of replications of plants per plot and the number of evaluations for growth traits and the viability of early selection in eucalyptus clonal tests, in order to infer reliably on the actual value of the individual the environment that it is, thus allowing precision in estimates of genetic parameters and selection gains. The data of three eucalyptus hybrid clonal tests, evaluating the diameter at breast height (DBH), height and wood commercial volume. The experimental design for the three clonal tests was randomized blocks with six replications, two tests with 30 clones and one with ten clones, with six or ten plants per plot. For full features were estimated the repeatability coefficient, the optimal number of replications of plants per plot and evaluations to infer about the real value of the individual and genetic gains for the characteristic volume in adulthood (72 months) with the early selection of individuals. Eucalyptus clonal tests, intended to improve in the short term, the objective of selection is to maximize the gain in the current generation for both traits in this work (diameter, height and volume) both require 3 replications with 6 plants per plot and evaluated in three ages for a selective accuracy around 90%. The selection of superior individuals in juvenile ages (over two years) in eucalypt clonal tests allows genetic gain in rotation age, being advantageous especially selection for diameter at breast height (DBH) to obtain future gains and indirectly to the volume character